Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja...

40
Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of lipids, lipoproteins and membranes (4 th ed.), 2002 Elsevier Science B.V. Lodish 4 th ed.: 20.6 Voet 4 th ed.: 19.4 in 25.7

Transcript of Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja...

Page 1: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Lipidi in celično signaliziranje

Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of lipids, lipoproteins and membranes (4th ed.), 2002

Elsevier Science B.V. Lodish 4th ed.: 20.6

Voet 4th ed.: 19.4 in 25.7

Page 2: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Razdelitev poglavja

• Derivati glicerola: fosfoinozitidi, diacilglicerol(DAG), lizofosfolipidi (LPA in LPC), plazmalogeni(npr. PAF)

• Derivati sfingozina: sfingozin-1-fosfat, ceramidi• Eikozanoidi• Derivati holesterola - steroidni hormoni

Page 3: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Fosfolipidi (PL) in signalizacija

Page 4: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Derivati fosfatidilinozitola

Delovanje fosfolipaze C na PIP2.

Page 5: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of
Page 6: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Biosinteza fosfoinozitidov v sesalskih celicah

Page 7: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

3D-struktura plekstrinu homologne (PH)domene PLC-δ1 v kompleksu s PIP3

Proteinske domene, ki se vežejo na različne fosfatidilinozitole v membranah

PH/PX domain

Druge PI-vezavne domene v proteinih: FYVE, ENTH, PH-GRAM,FERM, GLUE

3D-struktura phagocytic oxidase orphox (PX) domene NADH oksidaze

Page 8: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of
Page 9: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Derivati PL kot sekundarni prenašalci

Phosphoinositides

Page 10: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

13 sesalskih PLC je na osnovi strukture razvrščenih v6 skupin (β, γ, δ, ε, ζ, η).

Page 11: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Prenos signala, ki vključuje Gq, stimulira PLCβ, tako da iz PIP2 nastaneta DAG (koaktivator za PKC) in IP3 (odpre Ca2+-

kanalčke v membrani ER).

Page 12: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

PKC so udeležene pri nadzoru funkcij drugih proteinov preko fosforilacijespecifičnih Ser in Thr v teh proteinih. cPKC in nPKC se aktivirajo v enaki

signalni poti kot PLC. PKC igrajo pomembno vlogo v večih signalnih kaskadah.

Page 13: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Signalizacija preko GPCR–PIP2 sistema

Page 14: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

SIGMA-ALDRICH

Prenos signala, ki vključuje PLCγ; nastajata DAG in IP3. Iz ER se sprosti v citosol Ca2+, ta pa se veže na kalmodulin in citoskeletne proteine. Več efektov je posledica

delovanja od Ca2+/CaM-odvisnih protein kinaz (CaMK).

Signalizacija preko RTK–PIP2 sistema

Page 15: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Inzulinski receptor je protein-tirozin-kinaza, ki fosforilira substratne molekule (IRS). Te se vežejo na PI-3-kinazo, jo aktivirajo, da nastaja PIP3. PIP3 potem signal prenese na druge znotrajcelične

protein-kinaze.

Page 16: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

PI3K(transport, metabolizem)

MAPK(DNA, RNA in proteinska sinteza)

Page 17: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Inositol PhosphatesSIGMA-ALDRICH

Page 18: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Nekateri procesi, ki jih PL regulirajo kot sekundarni prenašalci

Page 19: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Derivati PL kot hormoni

Signalizacija z lizofosfatidno kislino (LPA)

LPA deluje z visoko-afinitetno vezavo na LPA (ali EDG) receptorje (1-6 in 87), ki sodijo med GPCR.

Na podoben način poteka tudi signalizacija z LPC.

Page 20: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Aktivacijski faktor za trombocite (PAF)ali tudi acetilglicerileter-fosforilholin (AGEPC)

PAF deluje z vezavo na PAF receptorje, ki sodijo med GPCR.Inaktivira ga PAF-acetil hidrolaza (PAF-AH).

PAF spada med plazmalogene

Page 21: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Nekateri procesi, ki jih PL regulirajo kot hormoni

LPA je močan mitogen (proliferativni učinek na celice).

LPC povzroča vnetne učinke (poveča sintezo endotelijskih CAM, rasnih faktorjev, aktivira

makrofage).

PAF izločajo bazofilci in mastociti v reakcijah takojšnje preobčutljivosti, makrofagi in nevtrofilci pa v

vnetnih reakcijah. Je močan bronhokonstriktor, povzroča agregacijo trombocitov, vazodilatacijo,

vnetje in anafilaksijo.

Page 22: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Sfingolipidi in signalizacija

Strukutre sfingozina (C18-aminoalkohol) in ceramida ter njunih derivatov, sfingomielina in glikosfingolipidov.

Page 23: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Sfingozin-1-fosfat (S1P)

S1P se sprošča ob aktivaciji trombocitov, kjer se tudi sintetizira (+ monociti, mastociti).Vpliva na proliferacijo, diferenciacijo, prepustnost žil, angiogenezo, apoptozo.

Page 24: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

EDGR: endothelial differentiationG-protein-coupled receptors

(also binds lysoPL)(S1PR)

Page 25: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

PDGF=platelet-derived growth factor

S1PR

Page 26: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

(S1PR)

Page 27: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Lipids in Cell SignalingSIGMA-ALDRICHEikozanoidi in signalizacija

Page 28: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Sproščanje arahidonske kisline s hidrolizo PL. Mesta delovanja fosfolipaz A2 (PLA2) in

fosfolipaz C (PLC) na PL.

Page 29: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Poti sproščanja arahidonske kislines hidrolizo fosfolipidov

Page 30: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

“Ciklična pot” metabolizma AASinteza prostanoidov

Page 31: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

“Linearna pot” metabolizma AA

Page 32: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Eikozanoidi delujejo kot hormoni

Trenutno je znanih 9 GPCR, na katere se vežejo eikozanoidi. Poleg tega nekateri eikozanoidi aktivirajo tudi jedrne receptorje, ki

potem z regulirajo izražanje specifičnih genov. Na ta način sodelujejo pri nadzoru razvoja, homeostaze in metabolizma organizma.

Kristalna struktura jedrnega receptorja PPAR-γ v kompleksu z DNA

Page 33: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Eico-zanoid Glavna mesta nastanka Glavne biološke aktivnosti

PGD2 mast cells inhibits platelet and leukocyte aggregation, decreases T-cell proliferation and lymphocyte migrationand secretion of IL-1α and IL-2; induces vasodilation and production of cAMP

PGE2 kidney, spleen, heart

increases vasodilation and cAMP production, enhancement of the effects of bradykinin and histamine, induction of uterine contractions and of platelet aggregation, maintaining the open passageway of the fetal ductus arteriosus; decreases T-cell proliferation and lymphocyte migrationand secretion of IL-1α and IL-2

PGF2a kidney, spleen, heart increases vasoconstriction, bronchoconstriction and smooth muscle contraction

PGH2 - precursor to thromboxanes A2 and B2, induction of platelet aggregation and vasoconstriction

PGI2 heart, vascular endothelial cells inhibits platelet and leukocyte aggregation, decreases T-cell proliferation and lymphocyte migrationand secretion of IL-1α and IL-2; induces vasodilation and production of cAMP

TXA2 Platelets induces platelet aggregation, vasoconstriction, lymphocyte proliferation and bronchoconstriction

TXB2 Platelets induces vasoconstriction

LTB4monocytes, basophils, neutrophils, eosinophils, mast cells, epithelial cells

induces leukocyte chemotaxis and aggregation, vascular permeability, T-cell proliferation and secretion of INF- γ, IL-1 and IL-2

LTC4

monocytes and alveolar macrophages, basophils, eosinophils, mast cells, epithelial cells

component of SRS-A, induces vasodilation, vascular permeability and bronchoconstriction and secretion of INF- γ

LTD4monocytes and alveolar macrophages, eosinophils, mast cells, epithelial cells

predominant component of SRS-A, induces vasodilation, vascular permeability and bronchoconstriction and secretion of INF-γ

LTE4 mast cells and basophils component of SRS-A, induces vasodilation and bronchoconstriction

Nekateri procesi, ki jih regulirajo eikozanoidi

Page 34: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Corticosteroids

Page 35: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Kristalna struktura ovčje PGH sintaze (tudi COX) v kompleksu z NSAID flurbiprofenom(nesteroidnim anti-inflamatorikom). PGHS je homodimerni monotopni membranski protein v membrani ER.

Page 36: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Inhibicija PGHS (COX-I ali COX-II) z aspirinom (NSAID).

Page 37: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Derivati holesterola in signalizacija

http://www.mmi.mcgill.ca/mmimediasampler2002/

Page 38: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Prehajanje malih hidrofobnih hormonov skozi membrane do znotrajceličnih receptorjev.

Page 39: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Nekateri procesi, ki jih regulirajo

Progestogens: maintain pregnancy (pro-gestational), also present at other phases of the estrous and menstrual cycles.

Androgens: stimulate or control the development and maintenance of male characteristics in vertebrates (activity of the male sex organs,

development of male secondary sex characteristics).

Estrogens: primary female sex hormones.

Glucocorticoids: regulate glucose metabolism, turn immune activity down(reduce inflamation, allergies, asthma, autoimmune diseases

and sepsis. Anti-cancer).

Mineralocorticoids: influence salt and water balances(active reabsorption of Na+, secretion of K+ and H+,

passive absorbtion of water).

Page 40: Lipidi in Signalizacija - bio.ijs.sibio.ijs.si/~krizaj/group/Predavanja 2011/Lipidi_in_signalizacija.pdf · Lipidi in celično signaliziranje Vance & Vance (Eds.): Biochemistry of

Seminarska naloga

KAJDIČ SAŠA

Modifikacije proteinov z lipidi in njihov fiziološki pomen