Post on 19-Jun-2019
BASI MOLECOLARI DELLA PATOLOGIA
PROGNOSI
COUNSELING GENETICO
CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE
DNA PROTEINE
Met Val Trp Ala Phe Lue Phe Cys Gly Gln Glu Trp ……..
SEQUENZIAMENTO DIRETTO DNA
ACGTGTGCGTCGACTGCTAAAAACTGACTGATTCGAGTACTGTGTCATCGTATATAGGGGGAGA
GENE
X
X X
Difetti del metabolismo eritrocitario
Difetti di membrana del globulo rosso
PNH
Malattie mieloproliferative
Anemie diseritropoietiche congenite
Esochinasi
Glcosio fosfato isomerasi
Fosfofrutto chinasi
Aldolasi
Triosofosfato isomerasi
Gliceraldeide fosfato isomerasi Gliceraldeide 3 fosfato isomerasi
Fosfoglicerato chinasi
Fosfoglicerato mutasi
Enolasi
Piruvato chinasi
GLICOLISI
30 (1)
500 (125)
20
40 (6)
30 (1)
40 (6)
Paris, 02-02- 2012
82 1
1
2
13
11
1 1 1
Direct/recent contacts
8
Caratterizzazione molecolare deficit di piruvato chinasi eritrocitaria
PKLR
Zanella et al , 2007
Wang et al, 2001; Valentini et al, 2002 Zanella et al , 2007
Correlazione genotipo fenotipo
Diagnosi prenatale: deficit di trioso fosfato isomerasi
Fermo et al, 2011
InsG cod 10/Glu104Asp 2008
Phe240Ser/wt 2012
Glu104Asp/wt 2009
Gene responsabile della CDAII
1997
CDAN2
locus
candidate genes
exclusion
2008
RBC
Preoteome
Mycro array
SNPs
2009
SEC23B
Crom 20
Hb
98%
Proteoma «nascosto» (Low-abundance proteome)
2008 -Studio del proteoma del globulo rosso
N° spots: 950 (640 g) N° spots: 80 (1300 g)
Untreated
Proteomica del globulo rosso
1578 proteine identificate
unknown
other tissues
apoptosis
ion binding
cell cycle
cytokine/immunity
cytoskeleton
DNA/RNA
Golgi
Hemoglobin
erythroid precursors
metabolism
intracell transports
oxidative stress
1578 proteine identificate
Metabolism
Intracellular transports
DNA/RNA Cytoskeleton
Cytokine/Immunity
Golgi
20pter-q12 eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 b
20cen-q13.1 S-adenosylhomocysteine hydrolase
20q11.22 acyl-CoA synthetase short-chain family member 2
20q11.2 glutathione synthetase
20q12 eukaryotic translation initiation factor 6
20q11.22 copine I
20q11.2-q12 erythrocyte membrane protein band 4.1-like 1
20q11.21-q12 chromosome 20 open reading frame 77
20q12 transglutaminase 2 (C polypeptide,
protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase)
20q11.22 Chromatin modifying protein 4B
20q11.1-q11.23 Microtubule-associated protein, RP/EB family,
20q11.21 BCL2-like 1
20p11.21 GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog)
20p11.23 N-acetyltransferase 5
20p11.23 D-tyrosyl-tRNA deacylase 1 homolog (S. cerevisiae)
20p11.23 Sec23 homolog B (S. cerevisiae) SEC23B
DTD1
NAT5
GINS1
BCL2L1
MAPRE1
CHMP4B
EIF2S2
AHCY
ACSS2
GSS
EIF6
CPNE1
EPB41L1
C20orf77
TGM2
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Arg14Trp Glu109Lys Arg497Cys Ser603Leu Arg701Cys Asp348Ala
Arg554STOP
c.1821delT c.428A>CG
Arg190STOP
IVS6+1 g>a
Arg217STOP
SEC23B: CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE CDAII
Bianchi et al, 2009
UNIVERSITA’ PAVIA
UNIVERSITA’
DI ULM
UNIVERSITA’ DI UTRECHT
UNIVERSITA’ DI BRISTOL
CHILDREN MEDICAL
Center Boston
ROCKFELLER UNIVERSITY
New York
Progetto Ministero
2013-2016
Progetto europeo
2013-2016
BORSE DI STUDIO
APPARECCHI PER IL LABORATORIO
- AMPLIFICATORE DNA
- CELLA ELETTROFORESI
SUPPORTO VIAGGI PER CONGRESSI
SUPPORTO SPESE DI VIAGGIO PAZIENTI
SPESE SPEDIZIONE CAMPIONI AD ALTRI CENTRI
SUPPORTO ALLA RICERCA DELL’ASSOCIAZIONE