BASI MOLECOLARI DELLA PATOLOGIA

PROGNOSI

COUNSELING GENETICO

CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE

DNA PROTEINE

Met Val Trp Ala Phe Lue Phe Cys Gly Gln Glu Trp ……..

SEQUENZIAMENTO DIRETTO DNA

ACGTGTGCGTCGACTGCTAAAAACTGACTGATTCGAGTACTGTGTCATCGTATATAGGGGGAGA

GENE

X

X X

Difetti del metabolismo eritrocitario

Difetti di membrana del globulo rosso

PNH

Malattie mieloproliferative

Anemie diseritropoietiche congenite

Esochinasi

Glcosio fosfato isomerasi

Fosfofrutto chinasi

Aldolasi

Triosofosfato isomerasi

Gliceraldeide fosfato isomerasi Gliceraldeide 3 fosfato isomerasi

Fosfoglicerato chinasi

Fosfoglicerato mutasi

Enolasi

Piruvato chinasi

GLICOLISI

30 (1)

500 (125)

20

40 (6)

30 (1)

40 (6)

Paris, 02-02- 2012

82 1

1

2

13

11

1 1 1

Direct/recent contacts

8

Caratterizzazione molecolare deficit di piruvato chinasi eritrocitaria

PKLR

Zanella et al , 2007

Wang et al, 2001; Valentini et al, 2002 Zanella et al , 2007

Correlazione genotipo fenotipo

Diagnosi prenatale: deficit di trioso fosfato isomerasi

Fermo et al, 2011

InsG cod 10/Glu104Asp 2008

Phe240Ser/wt 2012

Glu104Asp/wt 2009

Gene responsabile della CDAII

1997

CDAN2

locus

candidate genes

exclusion

2008

RBC

Preoteome

Mycro array

SNPs

2009

SEC23B

Crom 20

Hb

98%

Proteoma «nascosto» (Low-abundance proteome)

2008 -Studio del proteoma del globulo rosso

N° spots: 950 (640 g) N° spots: 80 (1300 g)

Untreated

Proteomica del globulo rosso

1578 proteine identificate

unknown

other tissues

apoptosis

ion binding

cell cycle

cytokine/immunity

cytoskeleton

DNA/RNA

Golgi

Hemoglobin

erythroid precursors

metabolism

intracell transports

oxidative stress

1578 proteine identificate

Metabolism

Intracellular transports

DNA/RNA Cytoskeleton

Cytokine/Immunity

Golgi

20pter-q12 eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 b

20cen-q13.1 S-adenosylhomocysteine hydrolase

20q11.22 acyl-CoA synthetase short-chain family member 2

20q11.2 glutathione synthetase

20q12 eukaryotic translation initiation factor 6

20q11.22 copine I

20q11.2-q12 erythrocyte membrane protein band 4.1-like 1

20q11.21-q12 chromosome 20 open reading frame 77

20q12 transglutaminase 2 (C polypeptide,

protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase)

20q11.22 Chromatin modifying protein 4B

20q11.1-q11.23 Microtubule-associated protein, RP/EB family,

20q11.21 BCL2-like 1

20p11.21 GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog)

20p11.23 N-acetyltransferase 5

20p11.23 D-tyrosyl-tRNA deacylase 1 homolog (S. cerevisiae)

20p11.23 Sec23 homolog B (S. cerevisiae) SEC23B

DTD1

NAT5

GINS1

BCL2L1

MAPRE1

CHMP4B

EIF2S2

AHCY

ACSS2

GSS

EIF6

CPNE1

EPB41L1

C20orf77

TGM2

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

Arg14Trp Glu109Lys Arg497Cys Ser603Leu Arg701Cys Asp348Ala

Arg554STOP

c.1821delT c.428A>CG

Arg190STOP

IVS6+1 g>a

Arg217STOP

SEC23B: CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE CDAII

Bianchi et al, 2009

UNIVERSITA’ PAVIA

UNIVERSITA’

DI ULM

UNIVERSITA’ DI UTRECHT

UNIVERSITA’ DI BRISTOL

CHILDREN MEDICAL

Center Boston

ROCKFELLER UNIVERSITY

New York

Progetto Ministero

2013-2016

Progetto europeo

2013-2016

BORSE DI STUDIO

APPARECCHI PER IL LABORATORIO

- AMPLIFICATORE DNA

- CELLA ELETTROFORESI

SUPPORTO VIAGGI PER CONGRESSI

SUPPORTO SPESE DI VIAGGIO PAZIENTI

SPESE SPEDIZIONE CAMPIONI AD ALTRI CENTRI

SUPPORTO ALLA RICERCA DELL’ASSOCIAZIONE