Curriculum vitæ di Stefano Alcaro - unicz.it CV 20_mar_2013.pdf · Durante il periodo di attività...

Curriculum vitæ di Stefano Alcaro

Dati anagrafici:

Età: Nato a Catanzaro il 17.02.66;

Residenza: Catanzaro, Piazza A. Serravalle 9, cap 88100; Telefono: 335-8305604

Codice Fiscale: LCRSFN66B17C352M Stato civile: Coniugato. Due figlie.

Altro indirizzo:

Dipartimento di Scienze della Salute, Università degli Studi “Magna Græcia” di Catanzaro, Campus

Universitario di Germaneto, 5° Livello corpo H, Edificio delle Bioscienze, Laboratorio di Chimica Farmaceutica,

88100 Catanzaro. Tel. 0961.3694197

E-mail: [email protected]

CV di Stefano Alcaro (aggiornato al 20 marzo 2013)

1

Studi, formazione e carriera accademica

17 lug 1990 laurea in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche (Università "La Sapienza” di Roma) con 110

e lode. Tesi sperimentale in Chimica Computazionale svolta in collaborazione tra il

Dipartimento di Chimica delle Sostanze Biologicamente Attive e Laboratorio di Chimica

Computazionale di Tecnofarmaci S.C.p.A. (Pomezia) dal titolo: "Metodi Computazionali

nello studio della ricognizione enantioselettiva mediante cromatografia liquida ad elevate

prestazioni" (Prof. L. Caglioti, Prof. F. Gasparrini, Dott. O. Incani di Tecnofarmaci).

1990-1991 Borsa di studio annuale di Tecnofarmaci S.C.p.A. sul tema "Elaborazioni e sviluppo di

programmi di intelligenza artificiale in chimica" presso il Laboratorio di Chimica

Computazionale di Tecnofarmaci.

ott-dic 1991 Frequenza del 108° Corso Allievi Ufficiali di Complemento presso la Scuola di Sanità Militare

di Firenze dal 08.10.1991 al 21.12.91, con esami finali su materie militari e tecnico-

professionali.

1992 Servizio militare come S. Ten. Chim. Farm. cpl. presso la Sezione Farmaceutica dell'Ufficio

Sanitario del Comando del Servizio Sanitario della R.M.CE. di Roma dal 03.01.92 al

07.01.93.

feb 1992 Vincitore del concorso di ammissione al Dottorato di Ricerca VII ciclo in Farmacologia,

Farmacognosia e Tossicologia presso la Facoltà di Farmacia dell'Università "La Sapienza" di

Roma, con votazione 112/120esimi.

1992-4 Triennio del Corso di Dottorato di Ricerca in Farmacologia, Farmacognosia e Tossicologia

VII ciclo presso l'Istituto di Farmacologia, occupandosi di simulazioni computerizzate di

interazioni deboli tra molecole di interesse bio-farmaceutico.

gen 1994 Dieci mesi di post-doctorate fellowship presso il Chemistry Department della Columbia

University, New York (gruppo del Prof. W. Clark Still). Durante questo periodo conduce un

progetto di studio riguardante l'elucidazione di meccanismi di ricognizione molecolare in

interazioni enantioselettive Host-Guest mediante tecniche computazionali.

18 lug 1995 Laurea in Farmacia (Università "La Sapienza" di Roma) con votazione di 110 e lode. Tesi

sperimentale in Chimica Computazionale dal titolo: "Nuovi Approcci allo studio di

Interazioni Farmaco-Recettore mediante metodi computazionali" (Prof. F. Gasparrini).

23 nov 1995 Conseguimento del titolo di Dottore di Ricerca in Farmacologia, Farmacognosia e

Tossicologia discutendo la tesi di Dottorato dal titolo "Ricognizione Molecolare e Metodi

Computazionali".

7 feb 1996 Vincitore di concorso per ricercatore area disciplinare C07X presso la Facoltà di Farmacia

dell'Università degli Studi di Catanzaro.

2 sett 1996 Presa di servizio nel ruolo di ricercatore.


2

1997-2001 Partecipa a vari cicli di stage per un totale di circa 3 mesi presso i laboratori del Prof. R. S.

Coleman della Ohio-State University di Columbus (OH), nell’ambito della collaborazione in

un progetto di ricerca supportato da un grant NATO per lo studio di agenti DNA cross-

linkanti ad azione antitumorale.

lug 2001 FIRC Short term fellowship della Federazione Italiana Ricerca sul Cancro (Prot. n.

1230/2001/CAdC del 11 luglio 2001) per un periodo di 3 settimane presso i laboratori del

Prof. R. S Coleman della Ohio-State University di Columbus (OH) dal 30 luglio al 19 agosto

2001.

6 dic 2002 Vincitore di concorso pubblico per professore associato nel settore disciplinare SSD

CHIM/08 (Chimica Farmaceutica).

24 dic 2002 Presa di servizio come professore associato presso la Facoltà di Farmacia.

14 mar 2005 Affiliazione al INFN Laboratori Nazionale di Frascati per la partecipazione al progetto

AMICO per lo sviluppo di farmaci contro il virus dell’AIDS.

24 dic 2005 Conferma in ruolo di professore associato SSD CHIM/08 (Chimica Farmaceutica).

7 lug 2010 Vincitore di concorso pubblico per professore ordinario nel settore disciplinare SSD

CHIM/08 (Chimica Farmaceutica).

17 giu 2011 Presa di servizio come professore ordinario presso l'Università degli Studi di Catanzaro.

Attività organizzativa

Il Prof. Stefano Alcaro ha organizzato le seguenti iniziative congressuali:

“Prospettive di collaborazione scientifica tra le Facoltà di Farmacia delle Università di Reggio Calabria

e "La Sapienza" di Roma: individuazione di nuovi temi di ricerca”, Roccelletta di Borgia (CZ), 10

giugno 1997.

"Prospettive di collaborazione scientifica tra le Facoltà di Farmacia delle Università di Catanzaro

"Magna Græcia" e di Roma "La Sapienza": progetti di ricerca attivati.", Roccelletta di Borgia (CZ), 25

giugno 1998.

“1st Magna Græcia Medicinal Chemistry Workshop on New perspectives in Drug Research”,

Copanello (CZ), 10-13 giugno 2001.

“2nd Workshop on The state-of-the-art of Computational Chemistry in the Universities of Calabria and

Basilicata”, Campus Università degli Studi “Magna Græcia” di Catanzaro, località Germaneto, 5-6

febbraio 2004.

“The deMon Developers 5th Annual Workshop”, Tropea (VV), 1-5 maggio 2004.

“International Conference on Theoretical Aspect of Catalysis” Tropea (VV), 25-30 giugno 2004.

“Erbe mediche: dalla ricerca di base alle possibili applicazioni in terapia”, Parghelia (VV), 8 luglio

2005.


3

“Nuove Prospettive in Chimica Farmaceutica” secondo meeting, Campus Università degli Studi

“Magna Græcia” di Catanzaro, località Germaneto, 16-17 maggio 2008.

“La Chimica della Vita: da alimenti funzionali a principi attivi”, meeting di celebrazione dell’anno

internazionale della Chimica, Catanzaro, 29 e 30 settembre 2011.

Durante il periodo di attività presso la Facoltà di Farmacia dell’Università degli Studi “Magna Græcia” di

Catanzaro il prof. Alcaro ha ottenuto finanziamenti sui seguenti progetti di ricerca:

1997 Progetto NATO triennale dal titolo “Computer Modeling of Azinomycin / DNA Interaction”

(CRG 970160) dal 1.04.1997 al 1.04.2000. La borsa NATO ha consentito tre visite del prof.

Alcaro presso i Laboratori del prof. R. S. Coleman (Ohio-State University, Columbus, OH,

USA): 15-28 giu 1997, 7-17 dic 1997, 28 mar – 4 apr 1999.

lug 2001 Progetto annuale “Nuovi antitumorali a scheletro tassanico” presentato dall’industria

farmaceutica INDENA S.p.A. al MURST e del quale il prof. Alcaro è stato responsabile

scientifico dell’unità di ricerca di Chimica Computazionale.

ott 2001 Progetto giovani annuale dal titolo “Studio computazionale delle interazioni tra molecole

biologicamente attive ed acidi nucleici” CNRG0037AE dell’Agenzia 2000 del Consiglio

Nazionale delle Ricerche del quale il prof. Alcaro è stato responsabile scientifico.

gen 2002 Responsabile dell’unità di ricerca di chimica computazionale su “Nuovi ligandi bioattivi sul

recettore dello Stem Cell Factor” nell’ambito del Progetto CLUSTER coordinato dal Prof.

Salvatore Venuta.

nov 2002 Progetto annuale “Studio computazionale su nuovi antitumorali analoghi della

tiocolchicina”, presentato dall’industria farmaceutica INDENA S.p.A. al MURST e del quale il

prof. Alcaro è stato responsabile scientifico dell’unità di ricerca di Chimica Computazionale.

2003 Responsabile dell’unità operativa di chimica computazionale nell’ambito del progetto “Uso

di tecnologie innovative per l'identificazione di bersagli molecolari nelle patologie

neoplastiche sporadiche ed ereditarie” del Ministero della Salute.

2007 Responsabile dell’unità operativa di chimica farmaceutica di Catanzaro per Programmi di

Ricerca Scientifica di Rilevante Interesse Nazionale (PRIN 2007 codice 2007JERJPC_002)

sul tema “Progettazione, sintesi e valutazione biologica di nuovi inibitori delle

cicloossigenasi”, durata 24 mesi a partire dal 22 settembre 2008, cofinanziamento totale

pari a 57.200 Euro.

2008 Responsabile dell’unità operativa di chimica farmaceutica di Catanzaro per progetti per il

Fondo per gli Investimenti della Ricerca di Base (FIRB-IDEAS codice RBID082ATK_002) sul

tema “Nuovi farmaci per la terapia anticancro mirata”, durata 5 anni, decorrenza:

04/02/2009 - 04/02/2014, cofinanziamento totale pari a 350.000 Euro.


4

2009 Responsabile dell’unità operativa di chimica farmaceutica di Catanzaro per Programmi di

Ricerca Scientifica di Rilevante Interesse Nazionale (PRIN 2009 codice 2009MFRKZ8_002)

sul tema “Progettazione razionale e sintesi di ligandi in grado di riconoscere acidi nucleici in

conformazione a quadrupla elica”, durata 24 mesi a partire dal 17 settembre 2011,

cofinanziamento totale pari a 58.800 Euro.

Per l’Università degli Studi “Magna Græcia” di di Catanzaro ricopre i seguenti incarichi istituzionali:

dal lug 2004 Presidente della Commissione CIVR di Ateneo per l’area chimica relativa al triennio 2001-

2003.

dal dic 2004 Rappresentante per i professori di II fascia al Consiglio di Amministrazione.

dal dic 2007 Componente delle commissioni per l’Orientamento, Mobilità Internazionale, Lavoro &

Impresa.

dal mag 2008 Referente per i corsi di azzeramento dei deficit formativi organizzati dalla Regione Calabria.

Ricopre inoltre l’incarico di valutatore come professore di I fascia nella commissione per la conferma in ruolo

dei ricercatori del SSD CHIM/08 a partire dall’anno 2011 e tutt’ora in corso.

Stefano Alcaro svolge attività di referee per le seguenti riviste:

Journal of American Chemical Society

Journal of Medicinal Chemistry

Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters

Currents in Medicinal Chemistry

Chemical Biology & Drug Design

Journal of Solution Chemistry

Bioinformatics

Chemie.

Ha inoltre ha ricoperto il ruolo di valutatore di progetti scientifici e attività di ricerca nel 2006 per conto dell’

International Institute of Molecular and Cell Biology of Warsaw (Polonia) e dal 2008 ad oggi per la

Fondazione Roma.

Attività didattica

L’attività di docenza del Prof. Stefano Alcaro, è stata svolta nell’ambito degli insegnamenti del SSD CHIM/08

(Chimica Farmaceutica) presso la Facoltà di Farmacia dell’ Università degli Studi “Magna Græcia” di

Catanzaro nei seguenti corsi:


5

Chimica Farmaceutica generale (CdL Specialistica in Farmacia) 6 CFU, aa 2012-13 (corso

istituzionale).

Chimica Farmaceutica e Tossicologica I (CdL Specialistica in Farmacia) 11 CFU, aa 2002-03, 2003-

04, 2004-05, 2005-06, 2006-07, 2007-08, 2008-09, 2009-2010, 2010-2011 (corso istituzionale).

Corso Integrato di Nutraceutica (CdL in Biotecnologie applicate alla nutrizione) 2 CFU, aa 2012-13

(affidamento interno).

Chimica Farmaceutica e Tossicologica II (CdL Specialistica in Farmacia) 11 CFU, aa 2007-08 e 2008-

09 e 2009-2010 (affidamento interno).

Analisi dei Medicinali II (CdL Specialistica in Farmacia) 9 CFU, aa 2002-03, 2003-04, 2004-05 e

2005-06 (affidamento interno).

Analisi Chimico-Tossicologica II (CdL Triennale in Tossicologia dell’Ambiente) 9 CFU, aa 2002-03 e

2003-04 (affidamento interno).

Laboratorio di preparazione estrattiva e sintetica dei farmaci (Diploma Universitario in Tecniche

Erboristiche) aa 2000-01 e 2001-02 (affidamento interno).

Laboratorio di preparazione estrattiva e sintetica dei farmaci (CdL Triennale in Scienze e Tecnologie

Erboristiche) 9 CFU, aa 2002-03 e 2003-04 (affidamento interno).

Laboratorio di preparazione estrattiva e sintetica dei farmaci (Corso opzionale non retribuito per Cdl

Specialistica in Farmacia) 4 CFU, aa 2007-08.

Informatica Chimico-Farmaceutica (Corso opzionale non retribuito per Cdl Specialistica in Farmacia)

6 CFU, aa 2005-06.

Chimica Farmaceutica e Tossicologica I (corso non retribuito per la Scuola di Specializzazione in

Farmacia Ospedaliera), aa 2002-03, 2003-04, 2004-05, 2005-06, 2006-07, 2007-08 e nel nuovo

ordinamento 2009-10.

Biotecnologie Farmaceutiche (corso non retribuito per la Scuola di Specializzazione in Farmacia

Ospedaliera), aa 1999-2000, 2000-01 e 2001-02.

L’attività didattica del Prof. Stefano Alcaro ha inoltre compreso quella di:

docente Erasmus presso la Freie Universitat in Belino (Germania) aa 2011-12 per il corso intensivo

dal titolo “Updates about targeting the G-quadruplex DNA as new therapeutic approach against

cancer”;

docente Erasmus presso l’Università di Porto (Portogallo) aa 2008-09 per il corso intensivo dal titolo

“Development of computational methods in drug discovery: concepts and applications to medicinal

chemistry case studies”;

docente Erasmus presso l’Università di Innsbruck (A) aa 2005-06 per il corso intensivo dal titolo

“Conformational search & docking experiments of biomolecular systems: theory and case studies”;

docente esterno presso la Open University di Milton Keynes (UK) aa 2005-06 per il corso intensivo

dal titolo “Innovative Molecular Modeling Approaches in Medicinal Chemistry”;


6

docente del Master di 2° livello in Progettazione e sviluppo dei farmaci (PSF) dell’Università degli

Studi di Pavia per gli aa 2003-04, 2004-05, 2005-06, 2006-07, 2007-08 e 2009-10;

direttore scientifico e docente del corso IFTS “Tecnico Superiore Sviluppo Software” realizzato nell’aa

2004-05 in collaborazione con la Regione Calabria e con l’ECIPA, Ente regionale di Formazione;

relatore di tesi di Laurea, sperimentali e compilative, per studenti di Farmacia, dottorandi in Scienze

Farmaceutiche e specializzandi in Farmacia Ospedaliera;

componente di commissioni di lauree triennali e specialistiche, di specializzazione in Farmacia

Ospedaliera, di dottorato in Scienze Farmaceutiche;

organizzatore di seminari didattici per studenti, specializzandi e dottorandi su temi di interesse

chimico-farmaceutico.

cientifica e cenni esplicativi sulle pubblicazionisAttività

L’attività di ricerca del prof. Stefano Alcaro sì è concentrata su vari temi di ricerca che abbracciano il settore

farmaceutico e condividono l’utilizzo di tecniche avanzate di investigazione scientifica. Tali studi sono stati

condotti nel Laboratorio di Chimica Farmaceutica Computazionale (http://cclab.unicz.it) creato nel 1998

presso il Dipartimento di Scienze Farmacobiologiche dell’Università “Magna Græcia” di Catanzaro, poi

confluito nell’attuale Dipartimento di Scienze della Salute.

La produzione scientifica di Stefano Alcaro si è concretizzata in oltre 110 pubblicazioni su riviste

internazionali, 1 su riviste nazionali, 4 capitoli su libri, 2 volumi a diffusione internazionale, 79 poster e 30

comunicazioni orali presentati a Congressi nazionali e internazionali. Il consistente interesse per le tecniche

innovative nella progettazione di composti di interesse farmaceutico, in particolare in ambito industriale, è

stato oggetto di un’indagine pubblicata in collaborazione con la Divisione di Chimica Farmaceutica della

Società Chimica Italiana nel luglio del 2008 sulla rivista ufficiale della SCI Chimica & Industria [63].

Gli argomenti della ricerca sono riassunti in quattro principali filoni:

LINEA 1. Sviluppo ed applicazioni di nuovi algoritmi per la progettazione e sintesi di composti di

interesse chimico-farmaceutico.

In questa linea vengono considerati studi metodologici innovativi per la progettazione di composti di

interesse farmaceutico che fanno capo a tre principali approcci.

Il primo riguarda il docking mediante la metodologia MOLINE sviluppata e pubblicata nel 2000 in

collaborazione con l’Università degli Studi “La Sapienza” di Roma [3]. Nel 2007 gli aspetti metodologici,

dedicati alla stima delle funzioni di stato che governano i fenomeni di riconoscimento molecolari, sono stati

riportati in un'altra pubblicazione [45].


7

Tale metodologia ha trovato applicazioni in svariati studi ed è stata oggetto di numerose comunicazioni orali

esposte in meeting scientifici [O7, O8, O11, O12, O13, O15, O16, O17, O19, O20, O21, O22, O24, O25,

O26, O27, O28]. Le pubblicazioni in extenso e sottoforma di poster hanno riguardato i seguenti ambiti:

interazione del Paclitaxel con macromolecole di complessità crescente [10, 16, 22, 42, P22, P25,

P28, P32];

inibitori della acetilcolinesterasi di varia natura chimica [12, 19, 31, 52, P24, P35, P47, P50, P56];

inibitori selettiviti delle COX-2 di natura tiazolidinonica [11, 14, P31];

studi di inclusione molecolare di β-ciclodestrine con composti di interesse chimico-farmaceutico [16,

22, 60];

inibitori selettivi delle MAO di natura cumarinica e pirazolinica o di estrazione naturale [13, 25, 35,

37, 38, 41, 43, 49, 50, 57, 62, P12, P42, P58, P60-61];

progettazione e sintesi di inibitori della glutatione-S-transferasi [33, P39, P43];

riconoscimento molecolare enantioselettivo di farmaci su fasi stazionarie chirali [4, 9, 36, 40, 44, 66,

90, 99, P1-6, P8-10, P20-21, P53].

Il secondo metodo recentemente sviluppato è stato definito con l’acronimo GBPM (Grid Based

Pharmacophore Model). Esso consiste nella creazione di modelli farmacoforici a partire da strutture

cocristallografiche reperibili per molti complessi di interesse chimico-farmaceutico direttamente nella Protein

Data Bank. Usando il noto programma di mappatura tridimensionale GRID sviluppato dal prof. Peter

Goodford è possibile, applicando il GBPM, ottenere farmacofori non condizionati da pregiudizi ed in grado di

essere applicati per il drug discovery di nuovi farmaci selettivi per macromolecole strutturalmente

caratterizzate mediante tecniche spettroscopiche.

Tale metodologia è stata oggetto di pubblicazione su una rivista specialistica del settore bioinformatico [40]

e riportata anche in un capitolo di un libro [L1]. Inoltre, è stata oggetto di comunicazioni orali presentate a

meeting scientifici [O18, O19].

Il terzo aspetto dello sviluppo metodologico è legato alla parametrizzazione di campi di forza della meccanica

molecolare con applicazioni nel settore farmaceutico. Tale aspetto è stato oggetto di varie comunicazioni

orali [O2, O4, O5, O6, O14, O17] ed ha prodotto pubblicazioni scientifiche con approfondimenti legati a

gruppi a funzionali non usuali quali:

azabiciloesani ed epossidi di agenti cross-linkanti del DNA [2, P13-14, P26, P33], in particolare

presenti in sostanze di estrazione naturale;

amminoborani [20], utili nel design di oligonucleotidi antisenso modificati nella porzione zuccherina;

fosfotioselenoati [7, 21, P34, P36], utili per la la realizzazione di oligonuclotidi antisenso modificati

nella porzione fosforica;

boronati [34], utili per il disegno di inibitori delle betalattamasi.


8

Il quarto aspetto dello sviluppo metodologico è legato allo sviluppo della metodologia FLAP in collaborazione

con l’Università di Perugia e la software house Molecular Discovery Ltd [106].

LINEA 2. Sviluppo di farmaci interferenti con gli acidi nucleici

La prima collaborazione internazionale del Laboratorio di Chimica Farmaceutica Computazionale, stabilita con

il Prof. Robert S. Coleman della Ohio-State University di Columbus (OH-USA), ha catalizzato l’interesse

scientifico per questa linea di ricerca. Sono stati condotti studi su composti ad azione cross-linkante che

condividono il meccanismo di azione dei composti naturali noti come azinomicine. Accanto a tale linea iniziale

di ricerca, lo studio sugli acidi nucleici ha avuto estensione anche su altre categorie di composti

rispettivamente ad azione intercalante, antimetabolitica per il DNA duplex e ligante selettiva per il DNA-

quadruplex. Le pubblicazioni in extenso e sottoforma di comunicazioni orali e poster hanno riguardato i

seguenti ambiti:

DNA cross-linkanti analoghi delle azinomicine [2, 5, 8, 32, 53, O14, O17, P13, P14, P16, P26, P33,

P41, P59, P71].

DNA intercalanti a struttura fluorenonica [23, 24, 30, P54].

Analoghi nucleosidici e antisenso [7, 21, P34, P36].

Ligandi selettivi per il DNA-quadruplex [51, 76, 88, 96, 98, 100, 110, O25, O27, O30, O32, O33,

O34, O35, O38, O39, O40, O41, O44, O45, P70, P72, P79, P81, P88, P89].

LINEA 3. Studi di folding di acido ialuronico, proteine miristoilate e di macromolecole chiave

nell’infezione del virus dell’HIV.

In questa linea vengono utilizzate tecniche computazionali per lo studio di fenomeni conformazionali legati a

macromolecole di interesse chimico-farmaceutico. In particolare, studi di dinamica molecolare in ambiente

acquoso virtuale GB/SA o esplicito sono stati combinati con la mappatura tridimensionale del software GRID.

Studio del folding dell’acido ialuronico, macromolecola chiave in patologie del sistema osteoarticolare

e dotato di proprietà interessanti in chimica dei prodotti cosmetici [15].

Studio degli effetti della miristoilazione su NADH-citocromo (b5) reduttasi, enzima chiave di

patologie genetiche ereditarie in cui sono coinvolti il metabolismo di lipidi e la rigenerazione

dell’ascorbato a partire da radicali liberi [28].

Studio degli effetti conformazionali della trascrittasi inversa [54, P62], della GP41 [59] e della

integrasi [55] del virus HIV-1.

Gli studi condotti rappresentano il punto di partenza per lo sviluppo di modificazioni chimiche o di composti

che interagiscano selettivamente con macromolecole di interesse farmaceutico delle quali non si dispone di

modelli sperimentali tridimensionali.

LINEA 4. Studi 3D-QSAR e virtual screening su composti ad azione analgesica ed antitumorale.


9

In questa linea sono stati sviluppati studi con approcci computazionali più orientati alla correlazione

struttura-attività e allo screening virtuale di composti di interesse farmaceutico. Le pubblicazioni in extenso e

sottoforma di poster hanno riguardato i seguenti ambiti:

Farmaci ad attività analgesica in collaborazione con l’Università di Pavia [17, 26, 29, 36, 44, 47, 56,

P29, P37, P49, P55, P57].

Farmaci antitumorali appartenenti al gruppo delle dolastatine in collaborazione con l’Università della

Calabria (Cosenza) [18, 46, O9, P44].

Farmaci antitumorali come ligandi selettivi del Stem Cell Factor (SCF) [61, P38].


10

Prof. Stefano Alcaro

Pubblicazioni

Elenco delle pubblicazioni in extenso su riviste internazionali e nazionali con valore di impact factor considerato nell’anno di riferimento secondo il Journal of Citation Reports (web edition).

Riferimento bibliografico Impact Factor

Anno riferimento

1. Alcaro, S.; Casarini, D.; Gasparrini, G.; Lunazzi, L.; Villani, C.

Atropisomerism in hindered naphtyl sulfones. J. Org. Chem., 1995, 60, 5515-19.

3,476 2000

2. Alcaro, S.; Coleman, R. S. Molecular Modeling of the Antitumor

Agents Azinomycins A and B: Force-Field Parameterization and DNA Cross-Linking Based Filtering. J. Org. Chem., 1988, 63,

4620-4625.

3,476 2000

3. Alcaro, S.; Gasparrini, F.; Incani, O.; Mecucci, S.; Misiti, D.; Pierini, M.; Villani, C. A Quasi-flexible Automatic Docking

Processing for Studying Stereoselective Recognition Mechanisms. Part I. Protocol Validation. J. Comp. Chem., 2000, 21, 515-530.

3,357 2000

4. Ficarra, R.; Calabrò, M. L.; Alcaro, S.; Tommasini, S.; Melari, S.;

Ficarra, P. Diastereo-enantioseparation of novel gamma-lactamic derivatives on cellulose chiral stationary phases.

Chromatographia, 2000, 51, 411-416.

1,619 2000

5. Alcaro, S.; Coleman, R. S. A Molecular Model For Dna Cross-Linking By The Antitumor Azinomycin B. J. Med. Chem., 2000,

43, 2783-2788.

4,134 2000

6. Secci, D.; Chimenti, F.; Lavagna, S.M.; Bonsignore, L.; Manna, F.; Alcaro, S.; Bolasco, A. New heterocyclization mechanism of the

reaction between carbon suboxide and 2-aminobenzamidoxime. Heterocycles, 2000, 53, 2789-2793.

1,150 2000

7. Alcaro, S.; Tafi, A.; Ortuso, F.; Woźniak, L. A.; Gács-Baitz, E.;

Botta M. Conformational search of antisense nucleotides. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2001, 11, 2273-77.

1,747 2001

8. Alcaro, S.; Ortuso, F.; Coleman, R.S. DNA Cross-Linking by

Azinomycin B: Monte Carlo Simulations in the Evaluation of Sequence Selectivity. J. Med. Chem., 2002, 45, 861-70.

4,566 2002

9. Alcaro, S.; D’Acquarica, I.; Gasparrini, F.; Misiti, D.; Pierini, M.;

Villani, C. Enantioselective Semi-preparative HPLC of Two 2-Arylpropionic Acids on Glycopeptides Containing Chiral Stationary

Phases. Tetrahedron Asymmetry, 2002, 13, 69–75.

2,178 2003

10. Alcaro, S.; Ventura, C. A.; Paolino, D.; Battaglia, D.; Ortuso, F.;

Cattel, F.; Puglisi, G.; Fresta, M. Preparation, Characterization,

Molecular Modeling and In Vitro Activity of Paclitaxel Cyclodextrin Complexes. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2002, 12, 1637-41.

2,051 2002

11. Ottanà, R.; Mazzon, E.; Dugo, L.; Monforte, F.; Maccari, R.;

Sautebin, L.; De Luca, G.; Vigorita, M. G.; Alcaro, S.; Ortuso, F.; Caputi, A. P.; Cuzzocrea, S. Modeling and biological evaluation of

3,3’-(1,2-ethanediyl)bis[2-(4-methoxyphenyl)-thiazolidin-4-one], a new synthetic cyclooxygenase-2 inhibitor. Eur J. Pharmacol., 2002, 448, 71-80.

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New insight into the central benzodiazepine receptor-ligand interactions: design, synthesis, biological evaluation, and

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Gaspari, M.; Gaudio, E.; Mangone, G.; Carotenuto, A.; Bilotta, A.; Narciso, D.; Palmieri, C.; Agosti, V.; Artese, A.; Gomez-Monterrey,

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G.; Alcaro, S.; Croce, C.M.; Novellino, E.; Fusco, A.; Trapasso, F. Isolation and Functional Characterization of Peptide Agonists of

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Musella, S.; Bertamino, A.; Scognamiglio, I.; Alcaro, S.; Artese,

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Journal of Amino Acids, 2013, Article ID 606282, in press

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113. Artese, A.; Alcaro, S.; Moraca, F.; Reina, R.; Ventura, M.;

Costantino, G.; Beccari, A.R.; Ortuso, F. State-of-the-art and

diffusion of Computational Tools for Drug Design Purposes: a Survey among Italian Academic and Industrial Institutions. Future Med Chem, 2013, in press

2,522 2011

TOTALE Impact Factor 370,55

Impact Factor Medio 3,279

Capitoli su libri:

L1. Ortuso, F.; Alcaro, S.; Langer, T. GRID-based Pharmacophore Models: Concept and Application Examples Pharmacophores and Pharmacophore Searches (Methods and Principles in Medicinal

Chemistry) 2006, vol 33, p 151-69, Edited by Wiley-VCH (Editors T.Langer & R.D. Hoffmann).

L2. Alcaro, S.; Artese, A.; Ortuso, F. Rational approaches to anticancer Drug Design / in silico Drug Development (Anticancer Therapeutics) 2008, 7 nov Edited by Wiley (Editor Sotiris Missailidis, The

Open University, UK) ISBN 9780470723036 L3. Marino, T.; Russo, N.; Alcaro, S.; Ortuso, F. Role of copper ion in the structural and dynamic

properties of prion protein (Computational Proteomics) 2008, ISBN 978-81-7895-318-2, edited by

Transworld Research Network (Editor Maria J. Ramos, University of Porto, Portugal). L4. Alcaro, S.; Artese, A. Conformational analysis of bioactive conformations in the drug discovery

process (New Perspectives in Medicinal Chemistry) 2009, ISBN 978-81-308-0321-0, edited by Transworld Research Network (Editor Stefano Alcaro, Università “Magna Græcia” di Catanzaro).


21

Attività editoriale:

E1. Alcaro, S. “New Perspectives in Medicinal Chemistry” 2009, ISBN 978-81-308-0321-0, edited by

Transworld Research Network E2. Artese, A.; Alcaro, S.; Perno, C.F. “Molecular models of HIV-1 targets/drugs”, 2009, ISBN 978-3-

639-18326-9, edited by VDM-Verlag

Comunicazioni orali:

O1. Alcaro S. : “Metodi computazionali nello studio di farmaci antitumorali.” Workshop " Prospettive di collaborazione scientifica tra le Facoltà di Farmacia delle Università di Reggio Calabria e "La

Sapienza" di Roma: Individuazione di nuovi temi di ricerca”, Catanzaro, 10 giugno 1997. O2. Alcaro S. : “Modellistica molecolare nella progettazione di nuovi farmaci”, seminario su invito del

Dipartimento di Farmacologia, Chemioterapia e Tossicologia Medica dell’Università degli Studi di

Milano, 13 novermbre 1997. O3. Alcaro S. : "Modeling della farmacocinetica e della farmacodinamica di derivati lipofili della colina",

Workshop "Prospettive di collaborazione scientifica tra le Facoltà di Farmacia delle Università di Catanzaro "Magna Græcia" e di Roma "La Sapienza": progetti di ricerca attivati.", Catanzaro, 25

giugno 1998. O4. Alcaro S., Coleman R. S.: "Studio modellistico molecolare sulle interazioni tra Azinomicine e DNA:

parametrizzazione, ricerca ed analisi conformazionale", XX Congresso Nazionale della Società

Chimica Italiana, Rimini, 6 giugno 2000. O5. Alcaro S., Ortuso F., Coleman R. S. “Monte Carlo simulation of DNA - azinomycin B interaction: case

study of CPU intensive calculations distributed on UNIX platforms.” 5° Workshop sul Calcolo ad Alte Prestazioni in Italia 2001, Milano, 17 ottobre 2001.

O6. Alcaro S.; Ortuso F.; Coleman R. S. “Rational drug design of Azinomycin analogs” 23 rd IUPAC- International Symposium on the Chemistry of natural products – Florence – Italy- 28 luglio-2 agosto 2002 – O38.

O7. Alcaro S. ”Development and applications of algorithms for molecular recognition” 1st Workshop on “The state-of-the-art of Computational Chemistry in the Universities of Calabria and Basilicata”,

Cosenza, 19 febbraio 2003. O8. Alcaro S., Ortuso F., Gallelli A, Battaglia D. “Medicinal Chemistry Application of new docking

methodology for Molecular Recognition studies.” 14th Camerino-Noordwijkerhout Symposium “Ongoing Progress in the Receptor Chemistry”, Camerino, 7-11 settembre 2003.

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Features Of Dolastatins 11 And 12 Antineoplastic Depsipeptides”, Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources, (CMTPI-2003), September 17-19, 2003 Thessaloniki, Greece.

O10. Alcaro S., Ortuso F., Gallelli A, Battaglia D. “MOLecular INteraction Evaluation: an original docking methodology applied to drug design.” 7° Workshop sul Calcolo ad Alte Prestazioni in Italia, Milano,

13 Novembre 2003. O11. Alcaro S., Ortuso F., Gallelli A, Battaglia D. “Development, Validation and Application of the

“MOLINE” Docking Program for Drug Design and Molecular Recognition studies.” V Congresso Nazionale di Chimica Computazionale, Siena, 18-19 dicembre 2003.

O12. Alcaro S. “Computational Chemistry research at the Department of Pharmacobiological Sciences” 2nd Workshop on “The state-of-the-art of Computational Chemistry in the Universities of Calabria and Basilicata”, Catanzaro, 5-6 febbraio 2004.

O13. Alcaro S., Ortuso F., Gallelli A, Battaglia D. “MOLINE docking experiments of enzyme-ligand complexes.” X International Conference on Theoretical Aspect of Catalysis, Tropea, 25 -29 giugno

2004.

O14. Alcaro S., Ortuso F., Gallelli A, Artese A., Procopio A., Coleman R. S. “Progettazione razionale di agenti bisalchilanti del DNA analoghi delle azinomicine.” XVII Convegno Nazionale della Divisione di Chimica Farmaceutica della Società Chimica Italiana, Pisa, 10 settembre 2004.

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Certosa di Pontignano (SI). O18. Alcaro S. “GRID Based Pharmacophore Model: un nuovo approccio computazionale per

l'identificazione e la progettazione di nuovi farmaci”, Seminario su invito presso l’industria

Farmaceutica Dompè, L’Aquila, 7 giugno 2005. O19. Alcaro S., Ortuso F., Artese A. “Docking e Virtual Screening su composti naturali: esempi su

quercitina e cucurbitacina.” Convegno su “Erbe mediche: dalla ricerca di base alle possibili applicazioni in terapia”, Parghelia (VV), 8 luglio 2005.

O20. Alcaro S., Ortuso F., Perricelli P., Chimenti F., Bolasco A., Secci D. “Studio computazionale su inibitori

selettivi delle monoamminoossidasi.” Convegno Congiunto delle Sezioni SCI Calabria e Sicilia, Catania, 5-6 dicembre 2005.

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O22. Alcaro S. “Innovative Molecular Modeling Approaches in Medicinal Chemistry” invited lectures 2-3 settembre 2006, Open University, Milton Keynes (United Kingdom).

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O26. Alcaro S. “Sviluppo e applicazione di nuovi strumenti chimico-computazionali” seminario su invito presso l’Università di Cagliari, 4 settembre 2007.

O27. Alcaro S. “Progettazione razionale di ligandi selettivi per DNA G-quadruplex”, XVIII Convegno Nazionale della Divisione di Chimica Farmaceutica della Società Chimica Italiana, Chieti, 16-20

Settembre 2007.

O28. Alcaro S. “Sviluppo e applicazioni chimico-farmaceutiche di una nuova tecnica di docking”, seminario su invito presso l’Università di Bari, 6 marzo 2008.

O29. Alcaro, S.; Artese, A.; Ortuso, F.; Perno, C. F.; Sing, T.; Svicher, V. “Dinamica molecolare di complessi della proteasi di HIV-1: influenza di mutazioni associate a resistenza sulla ricognizione

molecolare.” Convegno Congiunto delle Sezioni SCI Calabria e Sicilia, Cosenza, 2-3 dicembre 2008.

O30. Alcaro, S.; Artese, A.; Costa, G.; Ortuso, F.; Parrotta L. “Computational study on DNA G-quadruplex binding compounds”, XXIII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Sorrento, 5-10 luglio

2009 (FAR-OR-1) O31. Alcaro, S.; Artese, A.; Ortuso, F. “Studi computazionali su ligandi innovativi per le cicloossigenasi”,

Convegno Congiunto delle Sezioni Calabria e Sicilia 2009, Catania, 1-2 Dicembre 2009

O32. Alcaro, S. G-quadruplex: target innovativo nello sviluppo di agenti antitumorali, seminario su invito della Facoltà di Farmacia dell’Universita di Messina, 11 marzo 2010

O33. Alcaro, S.; Artese, A.; Costa, G.; Distinto, S.; Ortuso, F.; Parrotta L. “Rational drug design of DNA G-quadruplex binders using in silico approaches”, 1st International Conference Early Cancer Detection:

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2010, University of Coimbra (Portogallo).

O35. Alcaro, S.; Artese, A.; Costa, G.; Distinto, S.; Ortuso, F.; Parrotta, L. “Molecular Recognition Of Dna G-Quadruplex Ligands By Different Docking Methods”, XX National Meeting on Medicinal Chemistry,

Abano Terme (Padova), 12-16 Settembre 2010 (SC6). O36. Alcaro, S. “Simulazioni di docking e dinamica molecolare di processi enantioselettivi ad alta

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O38. Alcaro, S.; Artese, A.; Distinto, S.; Moraca, F.; Ortuso, F. “Rational drug design of DNA G-quadruplex binders using structure-based computational approaches.” V Meeting -workshop: Nuove prospettive

in Chimica Farmaceutica, Trieste, 28-30 marzo 2011. O39. Alcaro, S. “The DNA G-quadruplex fold as an attractive targeting structure against cancer.” 8th

European Workshop in Drug Design, Siena, 22 – 28 maggio, 2011 Certosa di Pontignano (SI).

O40. Alcaro, S.; Maccioni, E. “The G-quadruplex fold of nucleic acids: a challenging target in anti-cancer drug design” 2nd Iberic Meeting on Medicinal Chemistry, 13 giugno 2011, Porto (Pt)

O41. Alcaro, S. “Targeting the G-quadruplexfold of Nucleic Acids by Different Computational Drug Design Approaches”, 23 giugno 2011, Consorzio Sardegna Ricerca, Pula (CA)

O42. Alcaro, S. “Identificazione di agenti bioattivi attraverso lo screening virtuale di librerie di composti

naturali”, Convegno SCI Congiunto delle Sezioni Calabria e Sicilia 2011 Messina SCI 1-2 dicembre 2011

O43. Alcaro, S. “Hit identification of bioactive natural compounds by virtual screening.” IV EWDSy Fourth European Workshop in Drug Syenthesis, Siena , 27– 31 maggio 2012

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Betti L., Anzini M.: Probing the inverse agonist/antagonist interaction at CBR: drug design,

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2001. P31. Ottanà R., Monforte F., Alcaro S., De Luca G., Maccari R., Ortuso F., Vigorita M.G.: Evaluation of

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P38. Alcaro S., Gontrani L., Grieco M., Incani O., Ortuso F., Rotiroti D., Venuta S.: Screening virtuale di inibitori selettivi dell’SCF. XVI Convegno della Divisione di Chimica Farmaceutica, Sorrento, 18-22

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2004. P48. Alcaro S., Battaglia D., Ortuso F.: Molecular Modeling and Docking of ligands with β-cyclodextrin.

2nd Workshop on “The state-of-the-art of Computational Chemistry in the Universities of Calabria and Basilicata”, Catanzaro 5-6 febbraio, 2004.

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per il sottotipo recettoriale sigma-1. XVII Convegno Nazionale della Divisione di Chimica Farmaceutica della Società Chimica Italiana, Pisa, 6-10 settembre 2004.

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sintesi di inibitori della acetilcolinesterasi a scheletro chinolinico. Itinerari della Chimica in Calabria Convegno SCI, Cosenza, 21 ottobre 2004.

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F., Birilli R., La Torre F., Maccioni E., Cardia M.C., Distinto S. :Synthesis, molecular modeling studies and selective inhibitory activity against MAO of 1-thiocarbamoyl-3,5-diaryl-4,5-dihydro-

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Comparison of molecular dynamics simulations carried out on wild type and mutants of HIV-1 reverse transcriptase. 16th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships & Molecular Modelling, Civitavecchia, 10-17 settembre 2006.

P63. Chimenti F., Carradori S., Bolasco A., Secci D., Chimenti P., Alcaro S., Cirilli R., La Torre F., Turini P., Maccioni E.: Sintesi, molecular modeling e inibizione selettiva sulle MAO di 1- tiocarbamoil-3,5-

diaril-4,5-diidro-(1H) pirazoli. FAR-P-024. XXII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Firenze, 10-15 settembre 2006.

P64. Chimenti F., Manna F., Fioravanti R., Bolasco A., Chimenti P., Secci D., Bizzarri B., Granese A.,

Turini P., Scambia G., Alcaro S. :Sintesi di N-fenil ed N-propanoil 3,5 difenil 2-pirazoline e attività inibitoria nei confronti delle MAO e della P-gp. FAR-P-085. XXII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Firenze, 10-15 settembre 2006.

P65. Chimenti F., Bolasco A., Secci D., Chimenti P., Granese A., Alcaro S., Cirilli R., La Torre F., Turini

P., Maccioni E.: Synthesis, molecular modeling studies and selective inhibitory activity against MAO of benzylidene-hydrazino-1,3-thiazole derivatives. FAR-P-108. XXII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Firenze, 10-15 settembre 2006.

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Synthesis of New Acethylcholinesterase Inhibitors. XVIII Convegno Nazionale della Divisione di Chimica Farmaceutica della SCI, Chieti, 16-20 Settembre 2007.

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delle monoamminossidasi. XVIII Convegno Nazionale della Divisione di Chimica Farmaceutica della SCI, Chieti, 16-20 Settembre 2007.

P69. Vigo S., Sanna M.L., Cardia M. C., Alcaro S., Ortuso F., Maccioni E., Distinto S.:Progettazione e

sintesi di 4-(5-ariliden-3-metil-4-ossotiazolidin-2-ilidenamino)benzensulfonamidi e 4-(5-alchiliden-3-metil-4-ossotiazolidin-2-ilidenammino) benzensulfonamidi quali potenziali inibitori selettivi della

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Monoamine Oxidases Inhibitors XXIII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Sorrento,

5-10 luglio 2009 (FAR-PO-11) P85. Maccioni E., Alcaro S., Orallo F., Cardia M.C., Distinto S., Sanna M. L., Vigo S., Meleddu R., Ortuso

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Chimica Italiana, Sorrento, 5-10 luglio 2009 (FAR-PO-81) P87. Chimenti F., Secci D., Bolasco A., Chimenti P., Fioravanti R., Granese A., Carradori S., Alcaro S.,

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MAO-B of 3-methyl cyclohexylidene-(4-arylthiazol- 2-yl)hydrazones derivatives XXIII Congresso Nazionale della Società Chimica Italiana, Sorrento, 5-10 luglio 2009 (FAR-PO-99)

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Catanzaro, 20 marzo 2013 Prof. Stefano Alcaro

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