Relazione Tecnica Vera Omnia Complete - Centro Ames

M

Relazione Tecnica

Complete

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NUMERO VERDE

800 586 368ORGANIZZAZIONE CON SISTEMA DI GESTIONE PER LA QUALITÀ CERTIFICATO

edizione norma: 2015

02

TEST DI SCREENING PRENATALE NON INVASIVO DI MALATTIE GENETICHE ASSOCIATO ALL’ANALISI DELLO STATO DI PORTATORE DELLA COPPIA

Il Vera Omnia Complete rappresenta un'evoluzione del Vera Omnia in quanto permette l’analisi di molte più patologie �nora non rilevabili con altre modalità di indagine prenatale non invasiva.Il Vera Omnia Complete, si distingue da tutti gli altri test �no ad oggi proposti, in quanto si avvale dell’uti-lizzo di più tecnologie di biologia molecolare quali il Sequenziamento massivo parallelo (NGS), che riesce ad analizzare mutazioni in oltre 850 geni associati a più di 500 patologie, e altre speci�che tecniche, MLPA e TP-PCR, che permettono lo studio di patologie ad elevata incidenza, con eziologia complessa quali la Sindrome dell'X-Fragile, l’Atro�a Muscolo Spinale e la Distro�a Muscolare di Duchenne/Becker.Pertanto, il Vera Omnia Complete permette di rilevare patologie de novo sul DNA fetale, causate da muta-zioni non ereditate dai genitori e, contemporaneamente, permette un'accurata analisi dello stato di portatore della coppia.

CHI PUÒ EFFETTUTARE IL TEST E COME FUNZIONAIl test può essere eseguito:da tutte le donne a partire dalla 10a settimana di gravidanza;gravidanze singole o gemellari;concepimento naturale o con tecniche di procreazione medicalmente assistita (omologhe o etero-loghe).

La diagnosi prenatale delle malattie monogeniche e delle aneuploidie si esegue tradizionalmente sucampioni fetali prelevati nel I-II trimestre di gravidanza attraverso procedure di prelievo invasive (DPI), quali la villocentesi e l’amniocentesi, associate ad un rischio di perdita fetale stimato intornoallo 0,4-1%. Da alcuni decenni, sono state portate avanti diverse linee di ricerca �nalizzate allo sviluppo di procedure non invasive, con l’intento di ridurre i rischi per il feto e di anticipare i tempi della diagnosi prenatale.Sin dalle prime settimane di gravidanza è possibile rilevare nel circolo ematico materno la presenza di cellule fetali intatte e di DNA libero di origine fetale (c�DNA, cell-free fetal DNA) e questa fonte di materia-le genetico fetale può essere utilizzata per la diagnosi prenatale non invasiva (NIPD, Non Invasive Prenatal Diagnosis o NIPT Non Invasive Prenatal Testing). Tale DNA è rilevabile a partire dalla 5a settimana di gesta-zione; la sua concentrazione aumenta nelle settimane successive e scompare subito dopo il parto. La quantità di c�DNA dalla 10a settimana di gestazione è su�ciente per garantire l’elevata speci�cità e sensibilità del test.

LE MALATTIE INVESTIGATEIl Vera OMNIA® COMPLETE permette di individuare mutazioni genetiche responsabili di oltre 500 patolo-gie a trasmissione autosomica recessiva ad alta e bassa incidenza e patologie a trasmissione autosomica dominante e de novo. Le patologie a trasmissione autosomica recessiva ad alta incidenza analizzate sono: - sul DNA fetale e sul DNA della coppia: • Fibrosi Cistica, Anemia Falciforme, Beta Talassemia, Sordità Ereditaria (sia di tipo 1A che 1B) e Fenilchetonuria (Tabella 1) .

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NUMERO VERDE



03

Il VERA OMNIA® COMPLETE è, inoltre, in grado di rilevare patologie genetiche a trasmissione ereditaria, autosomica recessiva o autosomica dominante a più bassa incidenza, e de novo, non trasmesse cioè dai genitori (Tabella 3).Queste patologie spesso non sono rilevabili dalle ecogra�e del primo trimestre (alcune sono rilevabili ecogra�camente solo al secondo o al terzo trimestre). Inoltre, a di�erenza dei NIPT tradizionali, il VERA OMNIA® COMPLETE identi�ca malattie genetiche indipendenti dall’età materna. In particolare questo test è in grado di identi�care alcune patologie associate ad età paterna avanzata (es. Acondroplasia, sindrome di Pfei�er, di Apert, di Crouzon, Osteogenesi Imperfecta, etc.), causate da errori genetici che insorgono durante il processo di spermatogenesi, fornendo alle coppie meno giovani la possibilità di utilizzare un test di screening più completo.

- Solo sul DNA della coppia per lo studio del portatore: • Sindrome dell’X-Fragile, Atro�a Muscolo Spinale e Distro�a Muscolare di Duchenne/ Becker (Tabella 2).

Malattie ad elevata incidenza rilevate con Vera Omnia® Complete

Fibrosi Cistica CFTR

Sordità ereditaria tipo 1A CX26 (GJB2)

Sordità ereditaria tipo 1B CX30 (GJB6)

Beta Talassemia HBB

Anemia falciforme HBB

Fenilchetonuria PAH

GENE

Tabella 1. Lista dei geni indagati dal test VERA OMNIA® COMPLETE associati alle patologie ad elevata incidenza.

Malattie ad elevata incidenza rilevate con Vera Omnia® Complete

Sindrome dell’X-Fragile FMR1

Atrofia muscolo spinale SMN1

Distrofia muscolare di Duchenne/Becker DMD/BMD

GENE

Tabella 2. Lista dei geni indagati dal test VERA OMNIA® COMPLETE associati alle patologie ad elevata incidenza per cui viene eseguito lo studio del portatore per la coppia.

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04

Malattie a bassa incidenza e/o adinsorgenza DE NOVO

GENE

Sindrome di Gaucher GBA

Sindrome Dubowitz LIG4-NSUN2

Sindrome di Richner-Hanhart TAT

Sindrome di Sjögren-Larsson ALDH3A2

Malattie Sindromiche GENE

Sindrome di Costello HRAS

Sindrome di Tay-Sachs HEXA

Sindrome di PKAN PANK2

Sindrome della Tripla-H SLC25A15

Sindrome di Coffin-Lowry RPS6KA3

Sindrome di Alagille JAG1

Sindrome di CHARGE CHD7

Sindrome di Cornelia de Lange tipo 5 HDAC8

Sindrome di Cornelia de Lange tipo 1 NIPBL

Sindrome di Rett MECP2

Sindrome di Sotos tipo1 NSD1

Sindrome di Bohring - Opitz ASXL1

Sindrome di Noonan

Sindrome Cardio facio cutanea (CFS) tipo 1 BRAF

Sindrome di Noonan - simile con o senza leucemia mielomonocitica giovanile

CBL

Sindrome di Noonan /cancers KRAS

Sindrome Cardio facio cutanea (CFS) tipo 4 MAP2K2

NRASSindrome di Noonan 6/cancers

PTPN11Sindrome di Noonan 1/Sindrome di LEOPARD/cancers

Sindrome Cardio facio cutanea (CFS) tipo e 3 MAP2K1

Leucemia mielomonocitica giovanile (JMML) PTPN11

RIT1Sindrome di Noonan 8

SHOC2Sindrome Noonan - simile con capelli caduchi in fase anagen

RAF1Sindrome di Noonan 5/Sindrome di LEOPARD 2

GENE

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05

FGFR3

AcondroplasiaSindrome CATSHLSindrome di Crouzon con acanthosis nigricansIpocondroplasiaSindrome di MuenkeDisplasia tanatafora, tipo IDisplasia tanatafora, tipo II

Patologie scheletriche GENE

COL1A1Sindrome di Ehlers - Danlos, classicaSindrome di Ehlers - Danlos, tipo VIIA

COL2A1Acondrogenosi tipo 2

SOS1Sindrome di Noonan 4

Sindrome di Schinzel - GiedionS OloprosencefaliaNiemann-Pick

SETBP1SIX3SMPD1

Craniosinostosi GENE

FGFR2

Sindrome di Antley - Bixler senzaanomalie genitali o disordini dellasteroidognesiSindrome di Apert Sindrome di CrouzonSindromedi Jackson - WeissSindrome di Pfeiffer, tipo 1Sindrome di Pfeiffer, tipo 2Sindrome di Pfeiffer, tipo 3

COL1A2Sindrome di Ehlers - Danlos, formacardiaco - valvolare

Osteogenesi imperfetta, tipo IISindrome di Ehlers - Danlos, tipo VIIB

Osteogenesi imperfetta, tipo IIIOsteogenesi imperfetta, tipo IV

Osteogenesi imperfetta, tipo IOsteogenesi imperfetta, tipo IIOsteogenesi imperfetta, tipo III

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NUMERO VERDE



06

Tabella 3. Lista dei geni indagati dal VERA OMNIA® COMPLETE e delle patologie associate a carattere autosomico recessivo o dominante e ad insorgenza de novo.

Il VERA OMNIA® COMPLETE in�ne, consente un accurato studio dello stato del portatore per la coppia per circa 850 geni associati ad oltre 500 patologie (tabella 4).

Gene Malattia/e

AAAS Achalasia-addisonianism-alacrimia sy ndrome

ABCA12 Ichthy osis, autosomal recessiv e 4B (harlequin)

ABCA12 Ichthy osis, congenital, autosomal recessiv e 4A

ABCA3 Surfactant metabolism dy sfunction, pulmonary , 3

ABCA4 Cone-rod dy strophy 3

ABCB11 Cholestasis, benign recurrent intrahepatic, 2

ABCB11 Cholestasis, progressiv e familial intrahepatic 2

ABCB4 Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy , 3

ABCB4 Cholestasis, progressiv e familial intrahepatic 3

ABCB4 Gallbladder disease 1

ABCC8 Diabetes mellitus, noninsulin-dependent

ABCC8 Diabetes mellitus, permanent neonatal

ABCC8 Diabetes mellitus, transient neonatal 2

ABCC8 Hy perinsulinemic hy pogly cemia, familial, 1

ABCC8 Hy pogly cemia of infancy , leucine-sensitiv e

ABCD1 Adrenoleukody strophy

ABCD4 Methy lmalonic aciduria and homocy stinuria, cblJ ty pe

ACAD9 Acy l-CoA dehy drogenase 9 de�ciency

ACADM Medium chain acy l-CoA DH de�ciency

ACADS Acy l-CoA dehy drogenase, short-chain, de�ciency of

ACADSB 2-methy lbuty ry lgly cinuria

ACADVL Long chain acy l-CoA dehy drogenase de�ciency

ACAT1 Ketoacidosis due to beta-ketothiolase de�ciency

ACOX1 Perox isomal acy l-CoA ox idase de�ciency

ACSF3 Combined malonic and methy lmalonic acidemia

ACSF4 Mental retardation, X-linked 63

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NUMERO VERDE



07

ADA adenosine deaminase de�ciency

ADAMTS13 Thrombotic thrombocy topenic purpura, familial

ADAMTSL2 Geleophy sic dy splasia 1

ADCK3 Autosomal recessiv e atax ia ubiquinone de�ciency

ADK Hy permethioninemia due to adenosine kinase de�ciency

AFF2 Mental retardation, X-linked, FRAXE ty pe

AGA Asparty lglucosaminuria

AGL Gly cogen storage disease

AGPS Rhizomelic chondrody splasia punctata ty pe 3

AGXT Hy perox aluria, primary , ty pe 1

AHCY Hy permethioninemia w ith de�ciency of S-adenosy lhomocy steine hy drolase

AHI1 Joubert sy ndrome w ith ocular defect

AIPL1 Cone-rod dy strophy , 604393 (Congenital Leber Amaurosis, 4)

AIRE Autoimmune poly endocrinopathy sy ndrome, ty pe I

ALDH3A2 Sjogren-Larsson sy ndrome

ALDH4A1 Hy perprolinemia, ty pe II

ALDH5A1 4-hy drox y buty ric aciduria

ALDH7A1 Epilepsy , py ridox ine-dependent

ALDOB Hereditary fructose intolerance

ALG1 Congenital disorder of gly cosy lation ty pe Ik

ALG12 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe Ig

ALG2 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe Ii

ALG3 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe Id

ALG6 Congenital disorder of gly cosy lation ty pe Ic

ALG8 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe Ih

ALG9 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe Il

ALMS1 Alström sy ndrome

ALPL Childhood-onset hy pophosphatasia

ALPL Infantile hy pophosphatasia

ALS2 Amy otrophic lateral sclerosis 2, juv enile

Gene Malattia/e

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NUMERO VERDE



08

Gene Malattia/e

ALS2 Primary lateral sclerosis, juv enile

ALS2 Spastic paraly sis, infantile onset ascending

AMACR Alpha-methy lacy l-Coa Racemase de�ciency

AMACR Congenital bile acid sy nthesis defect ty pe 4

AMT Gly cine encephalopathy

ANTXR2 Hy aline �bromatosis sy ndrome

AP1S2 Mental retardation, X-linked sy ndromic 5

AP3B1 Hermansky -Pudlak sy ndrome 2

APTX Atax ia - oculomotor aprax ia ty pe 1

AR Complete androgen insensitiv ity sy ndrome

AR Kennedy disease

AR Partial androgen insensitiv ity sy ndrome

AR DGUOK de�ciency 3

ARG1 Argininemia

ARHGEF6 Mental retardation, X-linked 46

ARHGEF9 Epileptic encephalopathy , early infantile, 8

ARL13B Joubert sy ndrome 8

ARSA Metachromatic leukody strophy

ARSB Mucopoly saccharidosis ty pe 6

ARSE Brachy telephalangic chondrody splasia punctata

ARSF Chondrody splasia punctata, X-linked recessiv e

ARX Early infantile epileptic encephalopathy

ASL Argininosuccinic aciduria

ASPA Canav an disease

ASS1 Citrullinemia ty pe I

ATM Atax ia-telangiectasia

ATP6V0A2 Cutis lax a, autosomal recessiv e, ty pe IIA

ATP6V0A2 Wrinkly skin sy ndrome

ATP7A Menkes disease

ATP7A Occipital horn sy ndrome

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NUMERO VERDE



09

Gene Malattia/e

ATP7A X-linked distal spinal muscular atrophy

ATP7B Wilson disease

ATP8B1 Cholestasis, benign recurrent intrahepatic

ATP8B1 Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy , 1

ATP8B1 Cholestasis, progressiv e familial intrahepatic 1

ATR Seckel sy ndrome

ATRX Alpha-thalassemia my elody splasia sy ndrome

ATRX Alpha-thalassemia/mental retardation sy ndrome

ATRX Carpenter-Waziri sy ndrome

ATRX Chudley -Low ry Sy ndrome X-linked

ATRX Mental retardation-hy potonic facies sy ndrome

ATRX Smith-Fineman-My ers Sy ndrome X linked

AUH 3-methy lglutaconic aciduria ty pe 1

B4GALT1 Congenital disorder of gly cosy lation ty pe 2d

BBS1 Bardet-Biedl sy ndrome 1



BCKDHA Maple sy rup urine disease (gene BCKDHA)

BCKDHB Maple sy rup urine disease (gene BCKDHB)

BCOR Microphthalmia, sy ndromic 2

BCS1L Björnstad sy ndrome

BCS1L GRACILE sy ndrome

BCS1L Isolated CoQ-cy tochrome C reductase de�ciency

BCS1L Leigh sy ndrome

BLM Bloom sy ndrome

BRWD3 Mental retardation, X-linked 93

BSND Bartter sy ndrome, ty pe 4a

BTD Biotinidase de�ciency

BTK Isolated grow th hormone de�ciency ty pe III

BTK X-linked agammaglobulinemia

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NUMERO VERDE



10

C10orf2 Infantile onset spinocerebellar atax ia

CA2 Osteopetrosis w ith renal tubular acidosis

CAPN3 Muscular dy strophy , limb-girdle, ty pe 2A

CASK FG sy ndrome 4

CASK Mental retardation,microcephaly

CASK Mental retardation, w ith or w ithout ny stagmus

CASP10 Autoimmune ly mphoproliferativ e sy ndrome, II

CASQ2 Ventricular tachy cardia, catecholaminergic poly morphic, 2

CBS Classical homocy stinuria

CD19 Immunode�ciency , common v ariable, 3

CD3D Immunode�ciency 19

CD3E Immunode�ciency 18, SCID v ariant

CD3G Immunode�ciency 17, CD3 gamma de�cient

CD40LG X-linked hy per-IgM sy ndrome

CDH23 AR nonsy ndromic sensorineural deafness DFNB12

CDKL5 Epileptic encephalopathy , early infantile, 2

CEP290 Joubert sy ndrome w ith oculorenal defect 5

CEP290 Senior-Loken sy ndrome

CEP290 Bardet-Biedl sy ndrome 14; Joubert sy ndrome 5; Meckel sy ndrome 4; Senior-Loken sy ndrome 6

CERKL Retinitis pigmentosa 26

CFP Properdin de�ciency , X-linked

CFTR Cy stic �brosis; mucov iscidosis

CHRNA1 Multiple ptery gium sy ndrome, lethal ty pe

CHRNA1 My asthenic sy ndrome, fast-channel congenital

CHRNA1 My asthenic sy ndrome, slow -channel congenital

CHRND Multiple ptery gium sy ndrome, lethal ty pe

CHRND My asthenic sy ndrome, fast-channel congenital

CHRND My asthenic sy ndrome, slow -channel congenital

CHRNG Escobar sy ndrome

CHRNG Multiple ptery gium sy ndrome, lethal ty pe

Gene Malattia/e

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NUMERO VERDE



11

Gene Malattia/e

CHRNG My asthenia grav is, neonatal transient

CHST6 Macular corneal dy strophy

CLCN1 My otonia congenita, dominant; recessiv e

CLCN5 Dent disease

CLCN5 Hy pophosphatemic rickets

CLCN5 Nephrolithiasis, ty pe I

CLCN5 Proteinuria, low molecular w eight.

CLCN7 Autosomal recessiv e malignant osteopetrosis 4

CLDN1 Ichthy osis,alopecia, and sclerosing cholangitis

CLDN19 Familial hy pomagnesemia - hy percalciuria

CLN3 Juv enile neuronal ceroid lipofuscinosis 3

CLN5 Late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis 5

CLN6 Adult neuronal ceroid lipofuscinosis 4A



CLN8 Progressiv e epilepsy , Finnish ty pe

CLRN1 Usher sy ndrome ty pe 3A

CNGA1 Retinitis pigmentosa 49

CNGB1 Retinitis pigmentosa 45

CNGB3 Achromatopsia-3

COG1 Congenital disorder of gly cosy lation, type IIg

COG7 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe IIe

COG8 Congenital disorder of gly cosy lation, ty pe IIh

COL17A1 Epidermoly sis bullosa, non-Herlitz ty pe

COL1A1 Ca�ey disease

COL1A1 Ehlers-Danlos sy ndrome, ty pe I

COL1A1 Ehlers-Danlos sy ndrome, ty pe VIIA

COL1A1 Osteogenesis imperfecta, ty pe I

COL1A1 Osteogenesis imperfecta, ty pe II

COL1A1 Osteogenesis imperfecta, ty pe III

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NUMERO VERDE



12

Gene Mala�a/e

COL1A1 Osteogenesis imperfecta, ty pe IV

COL1A2 Ehlers-Danlos sy ndrome, cardiac v alv ular ty pe

COL4A3 Alport sy ndrome autosomal recessiv e

COL4A4 Alport sy ndrome autosomal recessiv e

COL4A5 Alport sy ndrome

COL6A1 Bethlem my opathy

COL6A1 Ullrich congenital muscular dy strophy





COL7A1 Dy strophic epidermoly sis bullosa pruriginosa

COL7A1 Sev ere dy strophic epidermoly sis bullosa, AR

COQ2 Leigh sy ndrome w ith nephro�c sy ndrome

COQ9 Coenzy me Q10 deficiency , primary , 5

COX10 Leigh sy ndrome mitochondrial COX4 deficiency

COX10 Mitochondrial complex IV deficiency

COX15 Cardioencephalomy opathy cy t. c ox idase def. 2

COX15 Leigh sy ndrome cy t. c ox idase deficiency

COX6B1 Mitochondrial complex IV deficiency

CPS1 Carbamoy lphosphate sy nthetase deficiency

CPT1A Carni�ne palmitoy l transferase 1A deficiency

CPT2 Carni�ne palmitoy l transferase II def. infan�le

CPT2 Carni�ne palmitoy l transferase II def. Neonatal

CRB1 Leber congenital amaurosis 8

CRLF1 Cold-induced sw ea�ng sy ndrome

CRTAP Osteogenesis imperfecta ty pe VII

CSTB Unv erricht-Lundborg disease

CTH Cy stathioninuria

CTNS Cy s�nosis

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NUMERO VERDE



13

CTSD Adult neuronal ceroid lipofuscinosis 10

CTSK Py cnody sostosis

CUL4B Mental retarda�on, X-linked, sy ndromic 15

CYP11A1 CAH w ith 46XY sex rev ersal, par�al or complete

CYP11B1 CAH due to 11-beta-hy drox y lase deficiency

CYP11B1 Aldosteronism, glucocor�coid-remediable

CYP17A1 17-alpha-hy drox y lase/17,20-ly ase deficiency

CYP21A2 CAH due to 21-hy drox y lase deficiency

CYP27A1 Cerebrotendinous x anthomatosis

CYP27B1 Vitamin D-dependent rickets, ty pe I

DBT Classic maple sy rup urine disease

DCLRE1C Omenn sy ndrome

DCLRE1C Combined immunodeficiency DCLRE1C deficiency

DCX Lissencephaly , X-linked

DCX Subcor�cal laminal heteropia, X-linked

DDB2 Xeroderma pigmentosum complementa�on

DDC Aroma�c L-amino acid decarbox y lase deficiency

DGUOK Mitochondrial DNA deple�on sy ndrome

DHCR24 Desmosterolosis

DHCR7 Smith-Lemli-Opitz sy ndrome

DHDDS Re�ni�s pigmentosa 59

DKC1 Dy skeratosis congenita X-linked

DKC1 Hoy eraal-Hreidarsson sy ndrome

DLD Leigh sy ndrome

DLD Maple sy rup urine disease

DLG3 Mental retarda�on, X-linked 90

DLL3 Spondy locostal dy sostosis 1, AR

DMD Becker muscular dy strophy

DMD Duchenne muscular dy strophy

DMP1 Hy pophosphatemic rickets 1 AR

Gene Mala�a/e

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NUMERO VERDE



14

DNAH5 Primary ciliary dy skinesia

DNAJC19 Dilated cardiomy opathy w ith atax ia

DNMT3B Immunodeficiency anomalies sy ndrome

DOCK8 Hy per-IgE recurrent infec�on sy ndrome,AR

DOK7 Fetal akinesia deforma�on sequence

DOK7 My asthenia, limb-girdle, familial

DOLK Congenital disorder of gly cosy la�on, ty pe Im

DPAGT1 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 1j

DPM1 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 1e

DPYD Dihy dropy rimidine dehy drogenase deficiency

DSP Lethal acantholy �c epidermoly sis bullosa

DUOX2 Thry oid dy shormonogenesis 6

DUOXA2 Thy roid dy shormonogenesis 5

DYNC2H1 Short-rib thoracic dy splasia 3

DYSF limb-girdle muscular dy strophy ty pe 2B

EDA Ectodermal dy splasia 1, hy pohidro�c, X-linked

EDA Tooth agenesis, selec�v e, X-linked 1

EDN3 Waardenburg-Shah sy ndrome 4B

EDNRB ABCD sy ndrome

EDNRB Waardenburg-Shah sy ndrome 4A

EFEMP2 Cu�s lax a, autosomal recessiv e, ty pe IB

EFNB1 Craniofrontonasal dy splasia

EGR2 Charcot-Marie-Tooth disease ty pe 4E

EIF2AK3 Wolco�-Rallison sy ndrome

ENPP1 Hy pophosphatemic rickets 2, AR

EPM2A Epilepsy , progressiv e my oclonic 2A

ERBB3 Lethal congenital contractural sy ndrome 2

ERCC2 Cockay ne sy ndrome, group D

ERCC3 Cockay ne sy ndrome, group B

ERCC4 Cockay ne sy ndrome group F

Gene Mala�a/e

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NUMERO VERDE



15

Gene Mala�a/e

ERCC5 Cockay ne sy ndrome group G

ERCC6 Cockay ne sy ndrome ty pe B

ERCC6 COFS sy ndrome 1

ERCC8 Cockay ne sy ndrome ty pe A

ESCO2 Roberts sy ndrome

ETFA Glutaric acidemia ty pe 2 (gene ETFA)

ETFB Glutaric acidemia ty pe 2 (gene ETFB)

ETFDH Glutaric acidemia ty pe 2 (gene ETFDH)

ETHE1 Ethy lmalonic encephalopathy

EVC Ellis-v an Crev eld sy ndrome

EVC Wey ers acrodental dy sostosis

EVC2 Ellis-v an Crev eld sy ndrome

EYS Re�ni�s pigmentosa 25

F11 Factor XI deficiency , autosomal dominant & recessiv e

F2 Dy sprothrombinemia

F5 Factor V deficiency

F8

F9

FAH Ty rosinemia ty pe 1

FAM126A Hy pomy elina�on - congenital cataract

FAM20C Lethal osteosclero�c bone dy splasia

FANCA Fanconi anemia

FANCC Fanconi anemia complementa�on group C

FAS Autoimmune ly mphoprolifera�v e sy ndrome, ty pe IA

FASLG Autoimmune ly mphoprolifera�v e sy ndrome, ty pe IB

FASTKD2 Mitochondrial complex IV deficiency

FBLN5 Cu�s lax a, autosomal dominant 2

FBLN5 Cu�s lax a, autosomal recessiv e, ty pe IA

FBLN5 Macular degenera�on, age-related, 3

FERMT3 Leukocy te adhesion deficiency , ty pe III

Hemophilia A

Hemophilia B

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NUMERO VERDE



16

Gene Mala�a/e

FGA Congenital fibrinogen deficiency (gene FGA)

FGD1 Aarskog-Sco� sy ndrome

FGD1 Mental retarda�on, X-linked sy ndromic 16

FGD4

Charcot-Marie-Tooth disease ty pe 4HFH

Fumaric aciduria

FKRP Limb-girdle muscular dy strophy ty pe 2I AR

FKRP Congenital muscular dy strophy ty pe 5B

FKRP Muscle-ey e-brain disease

FKTN Limb-girdle muscular dy strophy ty pe 2M, AR

FKTN Congenital muscular dy strophy ty pe 4B

FKTN Fukuy ama congenital muscular dy strophy

FMR1 Fragile X sy ndrome

FOLR1 Neurodegenera�on folate transport deficiency

FOXG1

Re� sy ndrome, congenital v ariantFOXN1

Sev ere T-cell immunodeficiency FOXP3

Immunody sregula�on, X-linked

FRAS1

Fraser sy ndrome (gene FRAS1)

FREM2

Fraser sy ndrome (gene FRAS2)

FTCD

Glutamate formiminotransferase deficiency

FTSJ1

Mental retarda�on, X-linked 9

FUCA1

Fucosidosis

FXN

Friedreich atax ia w ith retained reflex es

G6PC

Gly cogen storage disease ty pe 1a

G6PC3

Síndrome de Dursun

G6PD

Fav ism

G6PD

Hemoly �c anemia due to G6PD deficiencyGAA

Gly cogen storage disease acid maltase deficiencyGALC

Krabbe disease

GALE Galactose epimerase deficiency

GALK1 Galactokinase deficiency w ith cataracts

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NUMERO VERDE



17

Gene Mala�a/e

GNRHR Hy pogonadotropic hy pogonadism

GNS Mucopoly saccharidosis ty pe IIID

GPC3 Simpson-Golabi-Behmel sy ndrome, ty pe 1

GPR143 Ny stagmus 6, congenital, X-linked

GPR98 Usher sy ndrome ty pe 2C

GRIA3 Mental retarda�on, X-linked 94

GRIK2 Mental retarda�on, autosomal recessiv e, 6

GSS Glutathione sy nthetase deficiency

GTF2H5 Trichothiody strophy , complementa�on group A

GUCY2D

Leber congenital amaurosisGUSB

Mucopoly saccharidosis ty pe 7HADH

3-hy drox y acy l-CoA dehy drogenase deficiencyHADHA

Mitochondrial trifunc�onal protein deficiencyHADHB

Mitochondrial trifunc�onal protein deficiencyHAL

His�dinemia

HAMP Hemochromatosis ty pe 2

HAX1 Neutropenia, sev ere congenital 3, AR

HBA1

Alpha-thalassemiaHBA2

Thalassemias, alpha-HBB

Beta-thalassemiaHBB

Sickle cell anemiaHESX1

Combined pituitary hormone deficienciesHEXA

Tay -Sachs diseaseHEXB

Sandhoff diseaseHFE2

Hemochromatosis, ty pe 2AHGD

Alkaptonuria

HGSNAT Sanfilippo sy ndrome ty pe C

HIBCH 3-hy drox y isobuty ry l-CoA hy drolase deficiency

HLCS Holocarbox y lase sy nthetase deficiency

HMGCL 3-hy drox y -3-methy lglutaric aciduria

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NUMERO VERDE



18

Gene Mala�a/e

HOGA1 Hy perox aluria, primary , ty pe III

HPD Ty rosinemia ty pe 3

HPRT1 Kelley -Seegmiller sy ndrome

HPRT1 Lesch-Ny han sy ndrome

HSD11B2 Apparent mineralocorticoid ex cess

HSD17B10 17-beta-hy drox y steroid dehy drogenase deficiency

HSD17B3 Pseudohermaphroditism, male, w ith gy necomastia

HSD17B4 Bifunctional enzy me deficiency

HSD17B4 Perrault sy ndrome

HSD3B2 3-beta-hy drox y steroid dehy drogenase, deficiency

HSPG2 Schw artz-Jampel sy ndrome

HUWE1 Mental retardation, X-linked sy ndromic, Turner ty pe

ICOS Immunodeficiency , common v ariable, 1

IDH3B Retinitis pigmentosa 46

IDS Mucopoly saccharidosis ty pe 2

IDUA Mucopoly saccharidosis Ih

IDUA Mucopoly saccharidosis Ih/s

IDUA Mucopoly saccharidosis Is

IFNGR1 Immunodeficiency 27A, my cobacteriosis, AR

IFNGR2 Immunodeficiency 28, my cobacteriosis

IFT80 Jeune sy ndrome

IGHMBP2 Spinal muscular atrophy w ith respiratory tress

IKBKAP Familial dy sautonomia

IKBKG Ectodermal dy splasia, hy pohidrotic

IKBKG Ectodermal, dy splasia, anhidrotic, ly mphedema

IKBKG Immunodeficiency 33

IKBKG Incontinentia pigmenti, ty pe II

IL12B Immunodeficiency 29, my cobacteriosis

IL12RB1 Immunodeficiency 30

IL1RAPL1 Mental retardation, X-linked 21/34

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NUMERO VERDE



19

Gene Mala�a/e

IL1RN Interleukin 1 receptor antagonist deficiency

IL2RG T-B+ sev ere combined immunodeficiency

IL2RG TB+ sev ere combined immunodeficiency X-link

INSR Leprechaunism

INVS Nephronophthisis 2, infan�le

IQCB1 Senior-Loken sy ndrome 5

IQSEC2 Mental retarda�on, X-linked 1/78

ITGA6 Junc�onal epidermoly sis bullosa - py loric atresia

ITGB4 Junc�onal epidermoly sis bullosa piloric atresia

ITGB4 Junc�onal epidermoly sis bullosa, non-Herlitz

IVD Isov aleric acidemia

IYD Thy roid dy shormonogenesis 4

JAK3 T-B+ sev ere combined immunodeficiency JAK3

KCNJ1 Antenatal Bar�er sy ndrome

KCNJ11 Hy perinsulinemic hy pogly cemia, familial, Ty pe 2

KDM5C Mental retarda�on,sy ndromic, Claes-Jensen ty pe

L1CAM Corpus callosum hy poplasia sy ndrome

L1CAM Masa sy ndrome

LAMA2 Congenital muscular dy strophy ty pe 1A

LAMA3 Epidermoly sis bullosa, Herlitz ty pe (gene LAMA3)

LAMA3 Epidermoly sis bullosa, non-Herlitz ty pe

LAMB2 Nephro�c sy ndrome, ty pe 5

LAMB2 Pierson sy ndrome

LAMB3 Epidermoly sis bullosa, Herlitz ty pe (gene LAMB3)

LAMB3 Epidermoly sis bullosa, non-Herlitz ty pe (LAMB3)

LAMC2 Epidermoly sis bullosa, Herlitz ty pe (LAMC2)

LAMC2 Epidermoly sis bullosa, non-Herlitz ty pe (LAMC2)

LARGE Congenital muscular dy strophy ty pe 1D

LARGE Muscle-ey e-brain disease

LBR Greenberg dy splasia

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NUMERO VERDE



20

Gene Mala�a/e

LDLR Hy percholesterolemia, familial

LDLRAP1 Hy percholesterolemia, familial, autosomal recessiv e

LEPRE1 Osteogenesis imperfecta ty pe 8

LHCGR Ley dig cell adenoma, precocious puberty

LHCGR Ley dig cell hy poplasia hy pogonadism

LHCGR Ley dig cell hy poplasia pseudohermaphrodi�sm

LHCGR Luteinizing hormone resistance, female

LHCGR Precocious puberty , male

LHX3 Pituitary hormone deficiency spine abnormali�es

LIFR Stüv e-Wiedemann sy ndrome

LIG4 Immunodeficiency sensi�v ity ionizing radia�on

LIPA Wolman disease (ly sosomal acid lipase deficiency )

LMBRD1 Methy lmalonic aciduria and homocy s�nuria, cblF ty pe

LMNA Charcot-Marie-Tooth disease ax onal ty pe 2B1

LMNA Lethal restric�v e dermopathy

LMNA Mandibuloacral dy splasia ty pe A lipody strophy

LRP2 Donnai-Barrow sy ndrome

LRPPRC French-Canadian ty pe Leigh sy ndrome

LYST Chediak-Higashi sy ndrome

MAN2B1 Mannosidosis, alpha-, ty pes I and II

MAT1A Hy permethioninemia, persistent, autosomal dominant, due to methionine adenosyltransferase I/III deficiency

MBTPS2 Ichthy osis follicularis - alopecia - photophobia

MCCC1 3-Methy lcrotony l-CoA carbox y lase 1 deficiency

MCCC2 3-Methy lcrotony l-CoA carbox y lase 2 deficiency

MCEE Methy lmalony l-CoA epimerase deficiency

MCOLN1 Mucolipidosis ty pe 4

MECP2 Sev ere neonatal-onset encephalopathy

MED12 X-linked intellectual deficit w ith marfanoid habitus

MEFV Familial Mediterranean fev er

MFSD8 Late infan�le neuronal ceroid lipofuscinosis

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NUMERO VERDE



21

Gene Mala�a/e

MGAT2 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 2a

MID1 Opitz GBBB sy ndrome, ty pe I

MKS1 Meckel sy ndrome ty pe 1

MLC1 Megalencephalic leukoencephalopathy

MLYCD Malony l-CoA decarbox y lase deficiency

MMAA Vitamin B12-responsiv e MMAA ty pe cblA

MMAB Vitamin B12-responsiv e MMAB ty pe cblB

MMACHC Methy lmalonic acidemia homocy s�nuria, cblC

MMACHC Methy lmalonic acidemia homocy s�nuria, cblD

MOCS1 Sulfite ox idase moly bdenum cofactor deficiency

MOCS2 Sulfite ox idase moly bdenum cofactor deficiency

MOGS Congenital disorder of gly cosy la�on, ty pe IIb

MPDU1 Congenital disorder of gly cosy la�on, ty pe If

MPI Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 1b

MPL Thrombocy themia 2

MPL Thrombocy topenia, congenital amegakary ocy �c

MPV17 Nav ajo neurohepatopathy

MPZ Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 1B

MPZ Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 2I

MPZ Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 2J

MPZ Dejerine-So�as disease

MPZ Neuropathy , congenital hy pomy elina�ng

MPZ Roussy -Lev y sy ndrome

MRPS16 Combined ox ida�v e phosphory la�on defect ty pe 2

MRPS22 Combined ox ida�v e phosphory la�on defect ty pe 5

MTM1 X-linked centronuclear my opathy

MTMR2 Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 4B1

MUT Vitamin B12-unresponsiv e methy lmalonic acidemia

MVK Mev alonic aciduria

MYD88 Macroglobulinemia, Waldenstrom

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NUMERO VERDE



22

Gene Mala�a/e

MYD88 Py ogenic bacterial infec�ons, recurrent, MYD88

MYO5A Griscelli disease ty pe 1

MYO7A Nonsy ndromic sensorineural deafness ty pe DFNB2

MYO7A Usher sy ndrome ty pe 1

NAGLU Mucopoly saccharidosis ty pe IIIB (Sanfilippo B)

NAGS Hy perammonemia NAGS deficiency

NBN Aplas�c anemia

NBN Nijmegen breakage sy ndrome

NDP Ex uda�v e v itreore�nopathy 2, X-linked

NDP Norrie disease

NDRG1 Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 4D

NDUFA1 Mitochondrial complex I deficiency

NDUFAF2 Leigh sy ndrome

NDUFAF2 Mitochondrial complex I deficiency

NDUFAF4 Mitochondrial complex I deficiency

NDUFS3 Leigh Sy ndrm mitochondrial comp I deficiency

NDUFS3 Mitochondrial complex I deficiency

NDUFS4 Leigh sy ndrome

NDUFS4 Mitochondrial complex I deficiency

NDUFS6 deficiency of Complex I mitochondrial

NDUFS7 Leigh sy ndrome

NDUFS8 Leigh Sy ndrm mitochondrial comp I deficiency

NDUFV1 Mitochondrial complex I deficiency

NEB Nemaline my opathy 2

NEU1 Sialidosis, ty pe I

NEU1 Sialidosis, ty pe II

NEUROG3 Congenital malabsorp�v e diarrhea

NHEJ1 Sev ere combined immunodeficiency

NHLRC1 Epilepsy , progressiv e my oclonic 2B (Lafora)

NHS Cataract 40, X-linked

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NUMERO VERDE



23

Gene Mala�a/e

NHS Nance-Horan sy ndrome

NLGN4X Mental retarda�on, X-linked

NPC1 Niemann-Pick disease ty pe C1

NPC2 Niemann-Pick disease ty pe C2

NPHP1 Joubert sy ndrome 4

NPHP3 Renal-hepa�c-pancrea�c dy splasia

NPHP3 Senior-Loken sy ndrome 1

NPHP4 Senior-Loken sy ndrome

NPHS1 Nephro�c sy ndrome, ty pe 1

NPHS2 Nephro�c sy ndrome, ty pe 2

NR2E3 Goldmann-Fav re sy ndrome

NR5A1 46XY sex rev ersal 3

NR5A1 Adrenocor�cal insufficiency

NSD1 Beckw ith-Wiedemann sy ndrome

NSD1 Sotos sy ndrome 1

NSUN2 Mental retarda�on, autosomal recessiv e 5

NTRK1 Sensory and autonomic neuropathy ty pe 4

NUP62 Infan�le bilateral striatal necrosis

OCRL Dent disease 2

OCRL Oculocerebrorenal sy ndrome

OFD1 Simpson-Golabi-Behmel sy ndrome ty pe 2

OPA3 3-methy lglutaconic aciduria ty pe 3

OPHN1 Mental retarda�on, cerebellar hy poplasia, facies

ORAI1 Immunodeficiency 9

ORAI1 My opathy , tubular aggregate, 2

OSTM1 Osteopetrosis, autosomal recessiv e 5

OTC Ornithine transcarbamy lase deficiency

OTOF Auditory neuropathy , autosomal recessiv e, 1

OXCT1 Ox oacid CoA transferase deficiency

P3H1 Osteogenesis imperfecta, ty pe VIII

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NUMERO VERDE



24

Gene Mala�a/e

PAH Phenylketonuria

PAK3 Mental retarda�on, X-linked 30/47

PANK2 Pantothenate kinase-ass. neurodegenera�on

PAX8 Hypothyroidism, congenital, due to thyroid dysgenesis or hypoplasia

PC Pyruvate carboxylase deficiency

PCBD1 Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, D

PCCA Propionic acidemia (gene PCCA)

PCCB Propionic acidemia (gene PCCB)

PCDH15 Deafness, autosomal recessive 23

PCDH19 Epilep�c encephalopathy, early infan�le, 9

PDE6A Re�ni�s pigmentosa 43

PDHA1 Leigh syndrome, X-linked

PDHB Pyruvate dehydrogenase E1-beta deficiency

PDHX Lac�cacidemia due to PDX1 deficiency

PDP1 Pyruvate dehydrogenase phosphatase def.

PDSS1 Deafness-encephaloneuropathy-obesity-valvul

PDSS2 Leigh syndrome with nephro�c syndrome

PEX1 Zellweger syndrome 1A

PEX10 Peroxisome biogenesis disorder 6A (Zellweger)

PEX10 Peroxisome biogenesis disorder 6B

PEX12 Neonatal adrenoleukodystrophy (gene PEX12)

PEX13 Peroxisome biogenesis disorder 11A(Zellweger)

PEX13 Peroxisome biogenesis disorder 11B


PEX26 Zellweger syndrome 7A


PEX6 Heimler syndrome, type 2

PEX7 Rhizomelic chondrodysplasia punctata type 1

PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 deficiency

PHF8 Mental retarda�on syndrome, X-linked, Siderius type

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NUMERO VERDE



25

Gene Mala�a/e

PKHD1 Autosomal recessiv e poly cy s�c kidney disease

PKLR Hemoly �c anemia red cell PK deficiency

PLA2G6 Infan�le neuroax onal dy strophy 2A

PLA2G6 Infan�le neuroax onal dy strophy 2B

PLCE1 Nephro�c sy ndrome, tupe 3

PLDN Hermansky -pudlak sy ndrome 9

PLEC Epidermoly sis bullosa simplex w ith M_D

PLEC Epidermoly sis bullosa w ith py loric atresia

PLEC Limb girdle dy strophy epidermoly sis bullosa

PLEKHG5 Distal spinal muscular atrophy ty pe C AR

PLG Plasminogen deficiency ty pe 1

PLOD1 Ehlers-Danlos sy ndrome ty pe 6

PLP1 Spas�c paraplegia ty pe 2, X-linked

PMM2 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 1a

PMP22 Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 1A

PMP22 Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 1E

PMP22 Dejerine-So�as disease

PMP22 Roussy -Lev y sy ndrome

PNPO Py ridox al phosphate-responsiv e seizures

POLG Alpers sy ndrome

POLG Progressiv e ex ternal ophthalmoplegia AR

POLG Mitcndrl Neurogastrointes�nal encephalomy opathy

POLG Sensory neuropathy -dy sarthria-ophthalmoparesis

POLR1C Treacher Collins sy ndrome 3

POMGNT1 Limb-girdle muscular dy strophy ty pe C3 AR

POMGNT1 Muscular dy strophy w ith cerebellar inv olv .

POMGNT1 Walker-Warburg sy ndrome (gene POMGNT1)

POMT1 Limb-girdle muscular dy strophy ty pe C1 AR

POMT1 Muscular dy strophy w ith cerebellar inv olv .

POMT1 Walker-Warburg sy ndrome (gene POMT1)

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NUMERO VERDE



26

Gene Mala�a/e

POMT2 Limb-girdle muscular dy strophy ty pe C2 AR

POMT2 Muscular dy strophy w ith cerebellar inv olv .

POMT2 Walker-Warburg sy ndrome (gene POMT2)

POR Antley -Bix ler sy ndrome,genital anomalies

POU1F1 Combined pituitary hormone deficiencies

POU3F4 Deafness, X-linked 2

PPT1 Adult neuronal ceroid lipofuscinosis

PQBP1 Renpenning sy ndrome

PRDM5 Bri�le cornea sy ndrome

PRF1Hemophagocy �c ly mphohis�ocy tosis, familial,2

PROP1Combined pituitary hormone deficiencies

PRPS1Lethal atax ia w ith deafness and op�c atrophy

PRPS1X-linked Charcot-Marie-Tooth disease ty pe 5

PRSS12Mental retarda�on, autosomal recessiv e 1

PRXCharcot-Marie-Tooth disease ty pe 4F

PSAPEncephalopathy due to prosaposin deficiency

PSAPKrabbe disease

PSAPMetachroma�c leukody strophy

PTENBannay an-Riley -Ruv alcaba sy ndrome

PTENCow den sy ndrome 1

PTENLhermi�e-Duclos sy ndrome

PTENMacrocephaly /au�sm sy ndrome

PTH1RChondrody splasia, Blomstrand ty pe

PTH1R

Eiken sy ndrome

PTH1R

Failure of tooth erup�on, primary

PTH1R

Metaphy seal chondrody splasia, Murk Jansen ty pe

PTS

Hy perpheny lalaninemia, BH4-deficient, A

PYGM muscle gly cogen phosphory lase deficiency

QDPR Hy perpheny lalaninemia, BH4-deficient, C

RAB23 Carpenter sy ndrome

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NUMERO VERDE



27

Gene Mala�a/e

RAB27A Griscelli disease ty pe 2

RAB39B Mental retarda�on, X-linked 72

RAB3GAP1 Micro sy ndrome

RAB3GAP2 Cataract - intellectual deficit - hy pogonadism

RAG1 Combined immunodeficiency w ith granulomas

RAG1 Omenn sy ndrome (gene RAG1)

RAG1 Immunodeficiency RAG1/2 deficiency

RAG2 Immunodeficiency w ith skin granulomas

RAG2 Omenn sy ndrome (gene RAG2)

RAG2 Immunodeficiency complete RAG1/2 deficiency

RAPSN Fetal akinesia deforma�on sequence

RAX Microphthalmia, isolated 3

RDH12 Leber congenital amaurosis 13

RELN Lissencephaly sy ndrome, Norman-Roberts ty pe

RFT1 Congenital disorder of gly cosy la�on, ty pe In

RMRP Anaux e�c dy splasia

RMRP Car�lage-hair hy poplasia

RMRP Metaphy seal dy splasia w ithout hy potrichosis

RNASEH2A Aicardi-Gou�eres sy ndrome 4

RNASEH2B Aicardi-Gou�eres sy ndrome 2

RNASEH2C Aicardi-Gou�eres sy ndrome 3

RP2 Re�ni�s pigmentosa 2

RPE65 Leber congenital amaurosis 2

RPGR Cone-rod dy strophy , X-linked, 1

RPGRIP1L Joubert sy ndrome w ith hepa�c defect

RPGRIP1L Meckel sy ndrome, ty pe 5

RPL10 Au�sm, suscep�bility to, X-linked 5

RPS6KA3 Coffin-Low ry sy ndrome

RPS6KA3 Mental retarda�on, X-linked 19

RRM2B Mitochondrial DNA deple�on sy ndrome 8A

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NUMERO VERDE



28

Gene Mala�a/e

RRM2B Mitochondrial DNA deple�on sy ndrome 8B

RS1 Re�noschisis

SACS Autosomal recessiv e spas�c atax ia

SAMHD1 Aicardi-Gou�eres sy ndrome 5

SAMHD1 Chilblain lupus 2

SBDS Shw achman-Diamond sy ndrome

SC5DL Lathosterolosis

SCNN1A Pseudohy poaldosteronism ty pe 1, AR (SCNN1A)

SCNN1B Pseudohy poaldosteronism ty pe 1, AR (SCNN1B)

SCNN1G Pseudohy poaldosteronism ty pe 1, AR (SCNN1G)

SCO1 Mitochondrial complex IV deficiency

SCO2 Cardioencephalomy opathy , Cy t C deficiency 1

SEPN1 Rigid spine sy ndrome

SERPINA1 Emphy sema due to AAT deficiency

SFTPB Surfactant metabolism dy sfunc�on, pulmonary , 1

SFTPC Surfactant metabolism dy sfunc�on, pulmonary , 2

SGCA Muscular dy strophy , limb-girdle, ty pe 2D

SGCB Muscular dy strophy , limb-girdle, ty pe 2E

SGSH Mucopoly saccharidosis ty pe 3A

SH2D1A X-linked ly mphoprolifera�v e disease

SH3TC2 Charcot-Marie-Tooth disease, ty pe 4C

SHROOM4 Stocco dos Santos mental retarda�on sy ndrome

SIL1 Marinesco-Sjögren sy ndrome

SLC12A1 Antenatal Bar�er sy ndrome ty pe 1

SLC12A6 Corpus callosum agenesis - neuronopathy

SLC16A2 Allan-Herndon-Dudley sy ndrome

SLC17A5 Free sialic acid storage disease, infan�le form

SLC22A5 Carni�ne deficiency , sy stemic primary

SLC25A13 Citrullinemia, adult-onset ty pe II; ty pe II, neonatal-onset

SLC25A15 Hy perornithine-hy perammonemia-homocitrullinuria

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NUMERO VERDE



29

SLC25A20 Carni�ne-acy lcarni�ne translocase deficiency

SLC25A22 Early infan�le epilep�c encephalopathy

SLC26A2 Achondrogenesis ty pe 1B

SLC26A2 Atelosteogenesis ty pe II

SLC26A2 Diastrophic dw arfism

SLC26A2 Mul�ple epiphy seal dy splasia ty pe 4

SLC26A4 Deafness, autosomal recessiv e 4, w ith enlarged v es�bular aqueduct

SLC35A1 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 2f

SLC35C1 Congenital disorder of gly cosy la�on ty pe 2c

SLC35D1 Schneckenbecken dy splasia

SLC37A4 Gly cogen storage disease G6PD deficiency ty pe b

SLC37A4 Gly cogen storage disease due to G6PD deficiency

SLC3A1 Cy s�nuria

SLC46A1 Folate malabsorp�on, hereditary

SLC4A11 Congenital hereditary endothelial dy strophy ty pe II

SLC4A11 Corneal dy strophy - percep�v e deafness

SLC5A5 Thy roid dy shormonogenesis 1

SLC6A19 Hartnup disorder

SLC6A8 X-linked crea�ne transporter deficiency

SLC7A9 Cy s�nuria

SLC9A6 Mental retarda�on, Chris�anson ty pe

SMN1 Prox imal spinal muscular atrophy ty pe 1




SMPD1 Niemann-Pick disease ty pe A

SMPD1 Niemann-Pick disease ty pe B

SMS Mental retarda�on, Sny der-Robinson ty pe

SNAP29 Cerebral dy sgenesis-neuropathy keratoderma

SOX3 Mental retarda�on isolated GH deficiency

Gene Mala�a/e

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NUMERO VERDE



30

Gene Mala�a/e

SOX3 Panhy popituitarism, X-linked

SP110 Hepa�c v enoocclusiv e immunodeficiency

SPG11 Spas�c paraplegia 11, autosomal recessiv e

SPG7 Spas�c paraplegia 7, autosomal recessiv e

SRD5A2 Pseudov aginal perineoscrotal hy pospadias

SRD5A3 Congenital disorder of gly cosy la�on, ty pe Iq

SRD5A3 Kahrizi sy ndrome

ST3GAL3 Epilep�c encephalopathy , early infan�le, 15

ST3GAL3 Mental retarda�on, autosomal recessiv e 12

ST3GAL5 Amish infan�le epilepsy sy ndrome

STAR Congenital lipoid adrenal hy perplasia

STAT1 Immunodeficiency 31A AD

STAT1 Immunodeficiency 31B AR

STAT1 Immunodeficiency 31C, AD

STIM1 Immunodeficiency 10

STIM1 My opathy , tubular aggregate, 1

STIM1 Stormorken sy ndrome

STRA6 Sy ndromic microphthalmia ty pe 9

STX11 Hemophagocy �c ly mphohis�ocy tosis, familial, 4

STXBP2 Hemophagocy �c ly mphohis�ocy tosis, familial, 5

SUCLA2 Mitochondrial DNA deple�on sy ndrome 5

SUCLG1 Fatal infan�le lac�c acidosis aciduria

SUOX Sulfocy steinuria

SURF1 Leigh sy ndrome, due to COX deficiency

SYN1 Epilepsy , X-linked, w ith v ariable learning disabili�es and behav ior disorders

SYP Mental retarda�on, X-linked 96

TAT Ty rosinemia ty pe 2

TAZ Barth sy ndrome

TBCE Hy poparathy roidism-intellectual deficit

TCF4 Pi�-Hopkins sy ndrome

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NUMERO VERDE



31

Gene Mala�a/e

TCIRG1 Autosomal recessiv e malignant osteopetrosis 1

TFR2 Hemochromatosis, ty pe 3

TG Thy roid dy shormonogenesis 3

TGM1 Ichthy osis, congenital, autosomal recessiv e 1

TH Autosomal recessiv e dopa-responsiv e dy stonia

THOC2 Mental retarda�on, X-linked 12/35

THRB Thy roid hormone resistance

TIMM8A Mohr-Tranebjaerg sy ndrome

TK2 Mitochondrial DNA deple�on,my opathic form

TMEM216 Joubert sy ndrome 2

TMEM67 COACH sy ndrome

TMEM67 Joubert sy ndrome 6

TNFRSF11B Paget disease, juv enile

TPO Thy roid dy shormonogenesis 2A

TPP1 Neuronal ceroid lipofuscinosis 2

TRAPPC9 Mental retarda�on, autosomal recessiv e 13

TRDN Ventricular tachy cardia, catecholaminergic poly morphic, 5, w ith or w ithout muscle w eakness

TREX1 Aicardi-Gou�ères sy ndrome

TRIM37 MULIBREY nanism

TSEN54 Pontocerebellar hy poplasia ty pe 2A

TSEN54 Pontocerebellar hy poplasia ty pe 4

TSFM Fatal mitochondrial disease 3

TSHB Isolated thy roid-s�mula�ng hormone deficiency

TSHR Hy perthy roidism, familial gesta�onal; Hy pothy roidism, congenital, nongoitrous, 1

TSPAN7 Mental retarda�on, X-linked 58

TSPYL1 Sudden infant death dy sgenesis testes sy ndrome

TTPA Atax ia w ith v itamin E deficiency

TUBA1A Lissencephaly 3

TUFM Combined ox ida�v e phosphory la�on deficiency 4

TUSC3 Mental retarda�on, autosomal recessiv e 7

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NUMERO VERDE



32

Gene Mala�a/e

TYK2 Immunodeficiency 35

TYMP Mitochondrial DNA depletion sy ndrome 1

UBA1 X-linked spinal muscular atrophy ty pe 2

UBE2A Mental retardation, Nascimento-ty pe

UBE3A Angelman sy ndrome point mutation

UBR1 Johanson-Blizzard sy ndrome

UNC13D Hemophagocy tic ly mphohistiocy tosis, familial, 3

UPF3B Mental retardation, X-linked, sy ndromic 14

UQCRB Mitochondrial respiratory chain C III deficiency

UQCRQ Mitochondrial respiratory chain C III deficiency

UROS Porphy ria, congenital ery thropoietic

USH1C Nonsy ndromic sensorineural deafness ty pe AR

USH1C Usher sy ndrome ty pe 1C

USH1G Usher sy ndrome ty pe 1G

USH2A Usher sy ndrome ty pe 2A

USP9X Mental retardation, X-linked 99

VDR Vitamin D-dependent rickets ty pe 2A

VIPAR Arthrogry posis, renal dy sfunction, cholestasis 2

VLDLR Cerebellar atax ia - intellectual deficit -

VPS13B Cohen Sy ndrome ty pe 1

VPS33B Arthrogry posis - renal dy sfunction - cholestasis

WAS Wiskott-Aldrich sy ndrome

WHRN Usher sy ndrome, ty pe 2D / Deafness, autosomal recessiv e 31

WNT10A Odontoony chodermal dy splasia

WNT3 Tetra-amelia, autosomal recessiv e

WNT7A Aplasia/hy poplasia of limbs and pelv is

WNT7A Fibular hy poplasia or aplasia - femoral bow ing

XIAP Ly mphoproliferativ e sy ndrome, X-linked, 2

XPA Xeroderma pigmentosum complementation group A

XPC Xeroderma pigmentosum, group C

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NUMERO VERDE



33

Il VERA OMNIA® COMPLETE se abbinato allo studio non invasivo del cario�po fetale, VERA PLUS + Micro-delezioni, perme�e di raggiungere il più alto livello d’informazione possibile, mediante tecniche prenatali non invasive, ad oggi disponibile.

INDICAZIONI AL TESTIl VERA OMNIA® COMPLETE è ada�o ad ogni �po di gravidanza, ma in par�colare: • Gravidanze in cui è controindicata la diagnosi prenatale invasiva (es. rischio di aborto spontaneo); • Quadro ecografico di anomalie fetali sugges�ve di mala�a gene�ca; • Coppie con età paterna avanzata; • U�le per le gestan� che desiderano ridurre il rischio di mala�a gene�ca del feto.

PROCEDURA DEL TEST • Prelievo di sangue a donne in gravidanza con un età gestazionale di almeno 10 se�mane e al part- ner. • Separazione del DNA fetale libero circolante presente nel sangue materno, originatosi dai citotrofo blas� della placenta in apoptosi. • Analisi di sequenziamento massivo mediante tecnologia di nuova generazione (tecnologia NGS Illumina) per rilevare le mutazioni dei geni delle patologie inves�gate sul DNA fetale (elenca� nelle tabelle 1 e 3) e sul DNA della coppia (tabelle 1,3 e 4). • Analisi dei da� mediante un’accurata analisi bioinforma�ca che si avvale di algoritmi e database priva� e pubblici (riporta� nella sezione rela�va all’interpretazione dei risulta�). • Analisi di MLPA per il gene SMN1 per la coppia (tabella 4). • TP-PCR per la determinazione del numero di triple�e CGG nel gene FMR1 per la donna (tabella 4). • Analisi di MLPA per il gene DMD per la donna (tabella 4).

Gene Mala�a/e

ZDHHC9 Mental retarda�on, Ray mond ty pe

ZEB2 Mow at-Wilson sy ndrome

ZIC3 Congenital heart defects, nonsy ndromic, 1, X-linked

ZIC3 Heterotax y , v isceral, 1, X-linked

ZMPSTE24 Lethal restric�v e dermopathy

ZMPSTE24 Mandibuloacral dy splasia w ith ty pe B lipody strophy

ZNF469 Bri�le cornea sy ndrome

ZNF711 Mental retarda�on, X-linked 97

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34

RISULTATI OTTENIBILI CON IL VERA OMNIA® COMPLETE“ALTO RISCHIO”: indica che il test ha rilevato una o più mutazioni a livello di uno (o più) geni. Tale risultato indica che il feto presenta un elevato rischio per la specifica mala�a indicata, ma non assicura che il feto abbia tale condizione.In par�colare vengono indicate come alto rischio: • la presenza di almeno due varian� patogene�che nei geni associa� a patologie autosomiche recessive ad alta o bassa incidenza. • la presenza di una variante patogene�ca nei geni associa� a patologie autosomiche dominan�, X-linked o ad insorgenza de novo.

La/e mutazione/i ritrovate vanno confermate mediante un test di diagnosi nei genitori ed eventualmente con diagnosi prenatale invasiva, come il prelievo dei villi coriali (Villocentesi) o l'Amniocentesi. In nessun modo è possibile avvalersi della Legge 194/78 sull’interruzione volontaria della gravidanza senza prima aver confermato il risultato del test mediante amniocentesi o villocentesi.Per l’analisi dei risulta� si considerano esclusivamente mutazioni per le quali vi è univocità di risultato pato-logico. Quindi, il test non ricerca varian� con significato benigno e varian� con significato clinico incerto, cioè quelle non ancora cara�erizzate da un punto di vista patogene�co.

Sangue Materno

Placenta

Il c�DNA è isolato dallacomponenete plasmatica

del sangue materno.

Il DNA viene sequenziatomassivamente mediante l’innovativa tecnologia

denominata Next GenerationSequencing (NGS).

Si procede con l’analisi bioinformaticaper rilevare mutazioni causa di una

speci�ca malattia genetica

Mutazione rilevata

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NUMERO VERDE



35

“RISCHIO MODERATO”: indica che il test ha rilevato una mutazione a livello di uno o più geni associa� a patologie autosomiche recessive ad alta o bassa incidenza.Tale risultato va confermato inizialmente eseguendo l’analisi gene�ca nei genitori, per valutare la segrega-zione delle mutazioni rilevate. Successivamente è possibile valutare la necessità di eseguire un test di diagnosi prenatale invasiva, come il prelievo dei villi coriali (Villocentesi) o l'Amniocentesi. In nessun modo è possibile avvalersi della Legge 194/78 sull’interruzione volontaria della gravidanza senza prima aver confermato il risultato del test mediante amniocentesi o villocentesi.Per l’analisi dei risulta� si considerano esclusivamente mutazioni per le quali vi è univocità di risultato pato-logico. Quindi, il test non ricerca varian� con significato benigno e varian� con significato clinico incerto, cioè quelle non ancora cara�erizzate da un punto di vista patogene�co.

“BASSO RISCHIO”: indica che il test non ha rilevato alcuna mutazione a significato patologico noto nei geni esamina�. Tale risultato riduce notevolmente le possibilità che il feto abbia le mala�e gene�che esaminate. Tu�avia, il test non può garan�re che il feto sia sano.

In alcuni casi, inoltre, (circa l’l%) il test potrebbe produrre un risultato non o�male o non conclusivo. In questo caso verrà richiesto alla gestante il prelievo di un nuovo campione ema�co al fine di ripetere l’esame e/o un campione ema�co paterno.

PARAMETRI RIPORTATI NEL REFERTO:Varian� gene�che riportateL’analisi è mirata esclusivamente ai geni elenca� in Tabella 1, 2, 3 e 4. In par�colare vengono analizzate le porzioni codifican� dei geni, quelle cioè che comunemente sono associate a mala�a (vedi anche LIMITI DEL TEST). Verranno riportate nel referto solo le mutazioni classificate a significato patogene�co noto, sulla base dei da� della le�eratura scien�fica e la classificazione presente nei database di riferimento interroga�: ClinVar (NCBI), aggiorna� alla data del prelievo.

Target CoverageSi intende per Target Coverage, il numero medio di le�ure (reads) o�enute dal sequenziamento per ciascu-na base nucleo�dica cos�tuente il gene. Il Target Coverage del test è >600X. Il disegno della libreria per i geni indaga� è stato fa�o in modo tale da avere una copertura o�male e com-pleta per tu� i geni analizza�. Si riduce quindi la possibilità che ci siano delle porzioni dei geni non analizza-te.

Accuratezza del testL’esame ha dimostrato, in studi di validazione preclinica, una sensibilità >99% nel rilevare le mutazioni nei geni inves�ga�, con percentuali di falsi posi�vi <0.1%. Sebbene l’errore del test sia basso, tu�avia non è escludibile.

LIMITI DEL TESTQuesto esame valuta solo le mala�e gene�che ed i geni elenca� in Tabella 1, 2, 3 e 4. Quindi, il test non valuta altre mala�e gene�che o geni non specificamente indica�.

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L’esame inoltre non è in grado di evidenziare:

• mutazioni localizzate nelle regioni introniche oltre ± 5 nucleo�di dalle giunzioni esone-introne; • delezioni o duplicazioni maggiori di 5 bp;• inversioni;• mosaicismi.

Per i campioni con FF minore del 4%, verrà richiesta la ripe�zione dell'esame con un nuovo prelievo (gratui-tamente).Infine è importante so�olineare che questo test non è consigliato alle coppie che sono già a conoscenza di essere portatrici di patologie gene�che, ad esempio Fibrosi Cis�ca, Talassemia, Sordità Congenita etc., in quanto essendo un test di screening verranno rilevate le mutazioni familiari ma, non sarà possibile defi-nire con certezza se il feto è affe�o, portatore o non portatore della patologia, di conseguenza per una diagnosi defini�va si rimanderà ad amniocentesi.

Il VERA OMNIA® COMPLETE è un test di screening, non è un test diagnos�co. Benché molto accurato, i risulta� del test non sono diagnos�ci (forniscono un rischio alto, moderato o basso) e devono essere valu-ta� da un gene�sta medico nel contesto del quadro clinico della gestante e dell’anamnesi familiare. I risulta-� devono essere conferma� in quanto il test non è sos�tu�vo della diagnosi prenatale invasiva (Villocentesi o Amniocentesi). Il test è stato validato su gravidanze singole o gemellari, monozigo�che o dizigo�che, con almeno 10 se�mane di gestazione. Nelle gravidanze gemellari non è possibile dis�nguere la condizione del singolo feto, quindi in caso di risultato posi�vo, bisogna confermare con villocentesi o amniocentesi.Nelle gravidanze che sono iniziate come gemellari o plurime, seguite dall’aborto spontaneo di uno o più fe� con riassorbimento della camera gestazionale (vanishing twin), potrebbe essere presente nel sangue mater-no anche il DNA fetale libero del feto abor�to. Ciò potrebbe interferire nella qualità dei risulta�, determi-nando falsi posi�vi.L’esistenza di un tumore (metastasi) nella gestante potrebbe determinare risulta� del test falsi posi�vi dovu� a mutazioni del DNA tumorale circolante (ctDNA) a livello di geni coinvol� nel processo di canceroge-nesi (es. BRAF, HRAS, NRAS, KRAS). Il DNA tumorale si ritrova nella frazione del sangue materno da cui viene isolato il DNA fetale, per cui una mutazione rilevata in ques� geni (oncogeni) potrebbe dare un falso posi�-vo. In ques� casi bisogna effe�uare villocentesi o amniocentesi per confermare il risultato.Il test iden�fica esclusivamente mutazioni con significato patologico noto. Non vengono riportate varian� con significato benigno e varian� con significato clinico incerto, cioè quelle ancora non note o cara�erizzate. L’interpretazione delle varian� gene�che si basa sull’u�lizzo di diversi database aggiorna� alla data del prelievo. Ciò consente di lavorare con da� il più possibile recen� al momento dell’analisi. È importante so�olineare che, grazie ai rapidi progressi nel campo del sequenziamento di nuova generazione, tale inter-pretazione potrebbe cambiare in futuro con l’acquisizione di nuove informazioni scien�fiche e mediche sulla stru�ura del genoma ed influire sulla valutazione stessa delle varian�.Per i limi� sopra riporta�, in caso di risultato posi�vo si raccomanda di eseguire un colloquio con un gene�-sta e la conferma del risultato a�raverso l’analisi gene�ca su liquido amnio�co o villi coriali.

TEMPI DI REFERTAZIONEI tempi s�ma� di refertazione sono di circa 20/30 giorni lavora�vi. I tempi di refertazione, tu�avia, potreb-bero prolungarsi in caso di ripe�zioni dell’esame, risulta� non o�mali, approfondimen� dell’esame o dubbi interpreta�vi.

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Il VERA OMNIA COMPLETE ® come integrazione al VERA TEST PLUS ®Il VERA OMNIA COMPLETE® fornisce informazioni in merito al rischio di mala�e gene�che riscontrabili nel feto, ma non fornisce alcuna informazione rispe�o alle aneuploidie fetali, né rispe�o alle anomalie cromo-somiche stru�urali. Quindi, per avere una visione più completa della salute del feto è u�le abbinare al VERA OMNIA COMPLETE ® il VERA TEST PLUS ®, in grado di individuare aneuploidie e anomalie stru�urali cromo-somiche su tu�o il cario�po fetale.

ALTERNATIVE DIAGNOSTICHE PRENATALIIl VERA OMNIA COMPLETE ® è solo una delle opzioni a disposizione della gestante per determinare il rischio di patologie gene�che durante la gravidanza. Esistono anche altri test di screening effe�uabili in questo periodo. In par�colare, un’indagine gene�ca molecolare più approfondita può essere o�enuta mediante “diagnosi prenatale invasiva”, che può essere eseguita su villi coriali o liquido amnio�co. Il prelievo dei villi coriali (tessuto placentare che, pur essendo separato dal feto, ne con�ene lo stesso DNA) è effe�uato tra la 11^ e la 12^ se�mana di gestazione e consiste nel prelievo, so�o controllo ecografico, di un piccolo campione di villi coriali mediante una puntura a�raverso l’addome materno. Tale prelievo com-porta un rischio di aborto inferiore al 2%. Il prelievo del liquido amnio�co o amniocentesi viene eseguito mediante puntura transaddominale tra la 16^ e la 18^ se�mana di gravidanza e comporta un rischio di aborto inferiore all’1%.

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Relazione Tecnica Vera Omnia Complete - Centro Ames

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