Postaprioritaria - Borghi Autentici d'Italia · 2016. 7. 11. · tano:l’inquinamento,irifiuti,...
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RESEARCH ARTICLE Open Access Comparative transcriptome analysis of Gastrodia elata (Orchidaceae) in response to fungus symbiosis to identify gastrodin biosynthesis-related genes Chi-Chu Tsai 1,2 , Keh-Ming Wu 3† , Tzen-Yuh Chiang 4† , Chun-Yen Huang 1† , Chang-Hung Chou 5† , Shu-Ju Li 1 and Yu-Chung Chiang 6,7* Abstract Background: Gastrodia elata Blume (Orchidaceae) is an important Chinese medicine with several functional components. In the life cycle of G. elata, the orchid develops a symbiotic relationship with two compatible mycorrhizal fungi Mycena spp. and Armillaria mellea during seed germination to form vegetative propagation corm and vegetative growth to develop tubers, respectively. Gastrodin (p-hydroxymethylphenol-beta-D-glucoside) is the most important functional component in G. elata, and gastrodin significantly increases from vegetative propagation corms to tubers. To address the gene regulation mechanism in gastrodin biosynthesis in G. elata, a comparative analysis of de novo transcriptome sequencing among the vegetative propagation corms and tubers of G. elata and A. mellea was conducted using deep sequencing. Results: Transcriptome comparison between the vegetative propagation corms and juvenile tubers of G. elata revealed 703 differentially expressed unigenes, of which 298 and 405 unigenes were, respectively up-regulated (fold-change ≥ 2, q-value < 0.05, the trimmed mean of M-values (TMM)-normalized fragments per kilobase of transcript per Million mapped reads (FPKM) > 10) and down-regulated (fold-change ≤ 0.5, q-value <0.05, TMM- normalized FPKM > 10) in juvenile tubers. After Gene Ontology (GO) annotation and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis, 112 up-regulated unigenes with KEGG Ortholog identifiers (KOids) or enzyme commission (EC) numbers were assigned to 159 isogroups involved in seventy-eight different pathways, and 132 down-regulated unigenes with KOids or EC numbers were assigned to 168 isogroups, involved in eighty different pathways. The analysis of the isogroup genes from all pathways revealed that the two unigenes TRINITY_DN54282_c0_g1 (putative monooxygenases) and TRINITY_DN50323_c0_g1 (putative glycosyltransferases) might participate in hydroxylation and glucosylation in the gastrodin biosynthetic pathway. Conclusions: The gene expression of the two unique unigenes encoding monooxygenase and glycosyltransferase significantly increases from vegetative propagation corms to tubers, and the molecular basis of gastrodin biosynthesis in the tubers of G. elata is proposed. Keywords: Gastrodin, Deep sequencing, Gene regulation, Monooxygenase, Glycosyltransferase * Correspondence: [email protected] † Equal contributors 6 Department of Biological Sciences, National Sun Yat-sen University, Kaohsiung 804, Taiwan 7 Department of Biomedical Science and Environment Biology, Kaohsiung Medical University, Kaohsiung 807, Taiwan Full list of author information is available at the end of the article © 2016 Tsai et al. Open Access This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution 4.0 International License (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided you give appropriate credit to the original author(s) and the source, provide a link to the Creative Commons license, and indicate if changes were made. The Creative Commons Public Domain Dedication waiver (http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/) applies to the data made available in this article, unless otherwise stated. Tsai et al. BMC Genomics (2016) 17:212 DOI 10.1186/s12864-016-2508-6
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Caro Giordano, adesso tutti si fanno la stessadomanda: gli italiani sono razzisti? Vorrei sa-pere come risponde lei…
AnselmoGatti – via mail
Gli italianinon sono razzisti, caroGatti, an-che se stanno facendo di tutto per farli di-ventare tali. Non sono razzisti nemmenoquando si trovano i clandestini dentro ca-sa, quando devono sopportare la devasta-zione delle loro città, quando sono costret-ti ad aver paura anche solo a rientrare allasera perché qualche mente illuminata ha
pensatobenedidare il via liberaall’invasio-ne del Paese, chiamandola accoglienza.Gli italiani non sono razzisti quando subi-scono la discriminazione alla rovescia,nemmeno quando sono costretti a dormi-re in auto perché nessuno li aiuta emagarivedono vicino a loro i clandestini ospitatinegli hotel a quattro stelle che si lamenta-no perché il wi-fi non funziona bene. Nonsono razzisti nemmeno quando scopronoche, scandalosamente, ci sono personeche lavorano una vita per avere 480 euro almese di pensione e invece il primo senega-lese che sbarca sulle nostre coste vienemantenuto con oltre 900 euro al mese. Gliitaliani non sono razzisti e, se posso dire, èpiuttosto fastidiosa la campagna che è sta-ta orchestrata sul cadavere di quel giovanenigeriano ucciso dalla follia bestiale di unultrà a Fermo. Un omicidio orrendo, siachiaro,esattamentecomesonoorrendi tut-ti i delitti. Nelle stesse ore, per dire, un ra-gazzo di Vercelli ha ucciso un suo amico24enne in seguito a una lite: possiamo direcheè fruttodella campagnad’odioneicon-
fronti dei 24enni? Che gli italiani discrimi-nano i 24enni?Quella di Fermo è stata unarissa. Una drammatica, tragica, ma pur-troppobanale rissa. Tanto è vero che il gio-vanenigerianoharispostoall’insulto impu-gnando un cartello stradale e sbattendoloin testa all’ultrà, pratica per altro non pro-prio consonaalla successiva beatificazionedel soggetto. Ho sentito alcuni che per giu-stificarlo dicevano: «Poveretto, arrivavadalla Nigeria, sfuggiva al terrorismo, dove-te capirlo». Dobbiamo capirlo? No, io pen-so che dobbiamo soltanto piangerlo, per-chénonègiustomorire così.Ma lopiangia-mo senza nessun sentimento di colpa: per-ché a sferrare quel pugnomicidiale è statounultrà criminale, non «il clima d’odio». Ilclima d’odio non esiste. Il razzismo nonc’è. E se qualcuno, a cominciare dal mini-stro Alfano, pensa di far dimenticare i suoiguai familiari e le sue responsabilità nellapessima gestione dell’immigrazione, na-scondendosi dietro un cadavere, beh, que-sto sì che è vergognoso. E inaccettabile an-che per quel ragazzomorto.
SOVRAPPOPOLAZIONE
Siamotroppi
Ininterrottamente, la sovrap-popolazione mondiale è cre-sciuta,cresceecrescerà.Gliat-tuali 7,5miliardidi terrestri sa-ranno circa 11 miliardi nel2100, secondo previsioni, nonsolo dell’Onu. L’odierna scar-sa fertilità italiana(mediamen-te 1,37 figli per donna) è piùchecompensatadalla invasio-ne straniera. Il Belpaese aveva45 milioni di residenti al tem-podellaSecondaguerramon-diale. Ne ha oltre 60 milioninel 2016. La dimensione dellaTerra non aumenta. Si riducelospazioprocapite.Sicompli-cala lottacontro lamiseria.Au-mentano il sovraffollamento eiconflittiper laspartizionedel-le scarse risorse. Lo attestanoanche esperimenti scientificisu cavie animali. Si riduconole aree agricole e verdi. Siespandono l’antropizzazioneelacementificazione.Aumen-tano: l’inquinamento, i rifiuti,gli eventi climatici estremi, ildissesto idrogeologico e loscioglimento di nevai e ghiac-
ciai, con sommersione di bas-sure litoranee. Vi sarà carenzad’acquapotabile.
GianfrancoNìbalee.mail
USA
Il presidenteaccompagnatore
Saròunuomoall’anticamave-dere il presidente degli StatiUniti accompagnare HillaryClinton nella sua campagnaelettorale, partecipare ad essaemetterle a disposizione l’ae-reo presidenziale mi lascia distucco. Se anche nella purita-nademocraziaamericanasuc-cedono queste cose, possia-mo aspettarci di tutto, in que-ste sgangherate imitazioni deipiccoli statigreci.Sono lontanii tempidi Eisenhower.
Gianni Onetoe.mail
CALCIO
Tristezzain tv
Noto che, dopo l’eliminazio-ne dell’Italia dai Campionatieuropei,avvenutaairigoricon-
tro al Germania, i nostri con-duttori televisivi, prima parti-colarmente loquaci e brillanti,sono diventati tristi e poco lo-quaci.Mi rendoconto chean-che loro si sonodispiaciutiperla sconfitta degli Azzurri, forseanche per il modo in cui l’eli-minazione stessa è avvenuta,ovvero con il terno a lotto deirigori. Ma è bene sottolinearechestiamoparlandodiprofes-sionisti che non dovrebberofarsi condizionare dagli umoripersonali e non dovrebberopartecipareaglieventicon i lo-ro sentimenti. Vi immaginatese un cronista, che raccontaunastrage,partecipasseperso-nalmente al lutto? Solo lacri-me in tv?Ovviochenonsipuòsorridereraccontando funera-li o cose del genere.Ma a tuttodeve esserci un limite.
Gianni Augustoe.mail
SPORT
Ci rifaremocon leOlimpiadi
Sconfitta l’Italia agli Europei,le trasmissioni sportive hannoperso gran parte del loro inte-
resse,èovvio.Comunque,nes-suna preoccupazione: prestoci rifaremo con le Olimpiadi.Oppureno?
Aurelio Di Luglioe.mail
LAPRECISAZIONE
BorghiAutentici d’Italiaper l’integrazione
In risposta all’articolo “Uccisodibotteperchéènero”, l’Asso-ciazioneBorghiAutenticid’Ita-lia vuole precisare che il Co-mune nel quale è stato com-messo l’omicidio non appar-tiene alla sua rete, come sem-bra intendere l’estensore del-l’articolo. Indipendentemen-tedal luogo,però, ciòchecon-ta è il lavoro quotidiano chel’Associazione svolge insiemeallesuecomunitàperl’integra-zione e l’accoglienza, comeemerge già dal suoManifesto,chesuquestivaloridi inclusio-ne, fratellanza e integrazione,si fondae, ancordipiù, l’Asso-ciazione deplora l’uso dellaviolenza verso gli esseri uma-ni.
Ass. Borghi Autentici d’ItaliaSalsomaggiore Terme (Pr)
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NORD: Tempo stabile e in prevalenza soleggiato su tutte le regioni, sal-
vo in serata un moderato aumento delle nubi sulle Alpi occidentali.
Temperature in aumento.
CENTRO: Si confermano condizioni di tempo stabile e soleggiato, con
qualche velatura in Sardegna. Temperature in ulteriore lieve aumento.
Mari calmi o poco mossi.
SUD: Tempo stabile e soleggiato su tutte le regioni con cieli sereni o al
più poco nuvolosi. Temperature in lieve aumento. Mari generalmente
calmi o poco mossi.
NORD: Alta pressione subtropicale protagonista su tutti i settori con am-
pi spazi di cielo sereno. Qualche disturbo pomeridiano su Alpi e Prealpi
dove non escludiamo isolati temporali.
CENTRO: Sole ovunque grazie ad un campo di alta pressione subtropi-
cale, con poche nubi pomeridiane sulle zone interne e occasionali spun-
ti temporaleschi sui rilievi sardi e l'Appennino.
SUD: Alta pressione e stabilità su tutte le regioni con difuso soleggia-
mento; scarsa l'attività nuvolosa anche sui monti durante il pomeriggio.
Clima molto caldo sulle zone interne.
NORD: Qualche isolato disturbo pomeridiano sui monti con brevi tempo-
rali. Decisamente meglio in pianura con ampio soleggiamento. Tempe-
rature stabili
CENTRO: Alta pressione e stabilità ovunque con ampi spazi soleggiati.
Isolati temporali diurni sui monti. Clima caldo, temperature stabili o
senza grosse variazioni.
SUD: Bel tempo prevalente con ampio soleggiamento; isolati tempora-
li sui monti. Temperature in lieve aumento, clima caldo. Mari calmi o
localmente poco mossi.
21__Sabato 9 luglio 2016__
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09/07/2016Pag. 21
diffusione:46194tiratura:92212
