Materiale Convegno Cesena parteII - Legacoop Agroalimentare · 2015-09-07 · Microsoft PowerPoint...
14
Genoma Cromosoma Gene Mappa molecolare Gene Marcatore concatenato
Transcript of Materiale Convegno Cesena parteII - Legacoop Agroalimentare · 2015-09-07 · Microsoft PowerPoint...
Genoma
Cromosoma
Gene
Mappa
molecolare
Gene
Marcatore concatenato
Microsatelliti (SSR markers)Ripetizioni di sequenze semplici
AGAGAGAGAGAGAG
TCTCTCTCTCTCTC
ATATATATATATAT
TATATATATATATA
TGTGTGTGTGTGTG
ACACACACACACAC
Variablità di lunghezza dei frammenti
Dati di analisi di marcatori•Nomi degli alleli di lunghezza
157 183 224 273 317 355
157 183 224 273 333 370
155 183 218 270 317 355
157 181 218 273 333 355
A A B B B B
A A B B A A
B A A A B B
A B A B B B
Marcatori funzionali
La individuazione di SNPs ( polimorfismi di singoli nucleotidi), INDELS (
Inserzioni e delezioni), riarrangiamenti di singole sequenze dovute anche
a trasposoni aprono la strada per la identificazione di “marcatori
funzionali” e cioé mdificazioni di sequenza in geni di cui é nota la
funzione .
I marcatori funzionali possono essere in sequenze codificanti ma anche
non codificanti:
a) Nelle sequenze codificanti una mutazione può o no portare a proteine
con diversi livelli di attività
b) Nelle sequenze non codificanti le mmutazioni possono portare a
modificazioni della regolazione dei geni
ABG704dRpg1iPgd1aiEst5ABC151adRcs5
ABC158
ABC179a
ABC465
ABC151bMWG2031
1 (7H)
KgE35M54.243
BCD175MWG655a
MWG655e
CDO064
B15cABC162HVBKASI
2 (2H)
cMWG691
ABC171aABC171b
ABG471
ABG462
PSR156a
ABG453ABG499KgE33M51.316
3 (3H)
MWG634
KgE39M59.M06
mInt-c
HVM40
Phy2
ABG003a
MWG058HVM068
4 (4H)
MWG938ABC801
CDO099
Ica1
ABG452
KgE33M59.222MWG943KgE39M59.354
KgE33M51.88
5 (1H)
KgE33M61.399cMWG652AKgE33M51.85
ABG458ABC169bABC175Amy1
KgE39M48-M002KgE39M48.258MWG934
ABG461b
6 (6H)
ABG705aMWG635d
ABC302a
mSrh
ABC717
mRaw1
Dhn2aABG003bABC159b
7 (5H)
0
10
20
30
40
50
60
70
80
Una mappa In orzo
ABC310b
VAtp67
ABG461aiAcp1
Cat3
mVrs1
MWG503
ABC180
ABC177
MWG655b
ABC157
ABC165a
Pcr1
MWG949a
KgE33M51.316
KgE35M54.104
ABC161MWG902ABC174ABG495bABC166iEst4ABC172
ABG472
cMWG655C
iAco2ABG366
KgE33M59.190ABC802
KgE33M61.95
KgE33M51.88
cMWG706A
ABG702a
ABC159c
MWG912
ABG461b
M354493iAco1PSR156bMWG798a
ABC159b
ABG712
ABG495a
ABC170c
ABG463
MWG851b
90
100
110
120
130
140
150
160
170
Stem cells(SC) are in the hatched area
CZ=central zone
PZ=peripheral zone
L1: epidermis
L2: sub-epidermal
Pn= primordia
From I.Baurle, 2003
R.Poethig,1987R.Poethig,1987
