INFORMAZIONI PERSONALI Rossano Atzeni - CRS4 | … Antonella Mulas, Piras M., Lobina M., mara...

Curriculum Vitae

INFORMAZIONI PERSONALI Rossano Atzeni

Via Picciau 29, 09028 Sestu - CAGLIARI (Italia)

3382245334

[email protected]

Sesso Maschile | Data di nascita 1 FEB. 74 | Nazionalità Italiana

ESPERIENZA PROFESSIONALE

01 giugno 2013–31 gennaio 2014 Programmatore - Senior Back End DevelopperJobyourlife srlVia Nazario Sauro, Cagliari (Italia) https://www.jobyourlife.com

Attività o settore Risorse Umane & Recruiting

15 GEN. 11–13 GEN. 13 Programmatore SeniorCRS4 SRLPolaris Edificio 1 – Località Piscina Manna IT-09010 Pula (Italia)

SVILUPPATORE PER APPLICAZIONI E TRATTAMENTO DATI DI GENOMICA PRESSO IL PROGRAMMA ADVANCED GENOMICS COMPUTING TECHNOLOGY

Attività o settore BIOINFORMATICA

1 APR. 10–30 NOV. 10 Programmatore Senior (Developer/System integrator)Consorzio Cybersarc/o Complesso Universitario di Monserrato - Dipartimento di Fisica - SP Monserrato- Sestu km 0,700 09042 Monserrato (Italy)

Realizzazione dell'applicazione web di front-end per l'accesso a un sistema di Document Repository mediante attività di configurazione e sviluppo di codice su CMS/Framework Drupal (php) e LMS Moodle (php). Configurazione e adattamento della piattaforma Fedora Repository (www.fedora-commons.org) per accogliere specifiche collezioni di oggetti digitali e relativi metadati. Sviluppo moduli Drupal di integrazione applicativa basati sull'invocazione di web service REST/SOAP.

Attività o settore Cyberinfrastructure per la ricerca scientifica e tecnologica in Sardegna

13 OTT. 08–31 MAR. 10 Programmatore SeniorHosteras spaVia Nazario Sauro, 8/10 Italy-09123 Cagliari (undefined)

Sviluppo portale per booking online, gestione db, sviluppo applicazioni php/ajax, sviluppo Server Rest/Soap

Attività o settore Tour Operator online

1 GIU. 07–10 OTT. 08 Programmatore - Software DeveloperSharDNA spac/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 3, località Piscinamanna IT-09010 Pula (Italia)

Sviluppo software e applicazioni web-based per la gestione del DataBase e l’analisi dei dati.

Sviluppo del portale LOTO per l’elaborazione dei dati derivanti dall’uso degli SNPs (50k e 500k chip dell’Affimetrix): codifica secondo il formato HAPMAP (.hap), filtraggio informazioni in base a range di

13/2/14 © Unione europea, 2002-2013 | http://europass.cedefop.europa.eu Pagina 1 / 6

Curriculum Vitae Rossano Atzeni

posizioni, di SNPs e di campioni, selezione dei dati significativi, secondo soglie minime definite dall'utente: soglia minima di genotipizzazione, livello minimo di MAF, SNPs "omozigoti", conversione dal formato HAPMAP al formato pre-makehap (.ped), calcolo di frequenze alleliche in un file .hap.

Restyling e ampliamento del framework Workbench per la gestione (inserimento, modifica, cancellazione, ricerca & visualizzazione) di

- Dati anagrafici e genealogici;

- Prelievi del sangue, sierologiche ed emocromi;

- Visite mediche generali (abitudini di vita, anamnesi patologica e farmacologica, ipertensione, calvizie) e specialistiche (cardiologiche,cefalea, obesità, oculistica, allergologiche)

- Estrazione di Pedigree

Attività o settore SVILUPPO & BIOINFORMATICA

1 NOV. 06–31 MAG. 07 Programmatore - Software DeveloperSharDNA spac/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 3, località Piscinamanna 09010 Pula (SharDNA spa,c/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNAEdificio 3, località Piscinamanna09010 Pula (Cagliari), Italytel. +39 070 4606100fax +39 070 4606151)

Sviluppo di un'interfaccia “user-friendly” per il framework di gestione del DataBase

Attività o settore SVILUPPO & BIOINFORMATICA

01 novembre 2005–31 maggio 2006

HW & SW DeveloperXENTAS SYSTEM srlc/o PARCO SCIENTIFICO & TECNOLOGICO DELLA SARDEGNA Edificio 2, località Piscinamanna IT-09010 Pula (Cagliari) (Italia)

Sviluppo di applicazioni HW & SW per sistemi basati su tecnologia RFID:

1. Rivelazione e Identificazione di condotte interrate

2. Sistema di sicurezza e controllo accessi

3. Identificazione e tracciamento ovini

Attività o settore Sviluppo, elettronica digitale, sistemi embedded

1 GEN. 05–31 OTT. 05 Progettazione circuiti digitali & applicazioni softwareINFN c/o Università di Cagliari - Dipartimento di FisicaS.P. Monserrato-Sestu Km 0,700 IT-09042 Monserrato (Italia)

Sviluppo di applicazioni in logica FPGA e software di test/controllo per progetti:

1. Migrazione scheda di acquisizione PCI dalla modalità Slave alla modalità Master.

2. Implementazione in logica FPGA dell’algoritmo di ricostruzione degli hit raccolti dal Muon Arm dell’esperimento Alice, all’interno del progetto HLT (Trigger di alto livello)

1 FEB. 05–31 MAG. 05 Tutor di Fisica per corso di laurea in BiologiaUniversità di CagliariVia Università 40 IT-09124 Cagliari (Italia)

Attività o settore Insegnamento & Formazione

1 MAG. 05–31 LUG. 05 Docento corso di programmazione in CGIOCUR – Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4 - 09125 CagliariGIOCUR – Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4 - 09125 Cagliari GIOCUR – Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4 - 09125 Cagliari-GIOCUR – Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4 - 09125 Cagliari GIOCUR – Scuola Informatica (CA) Vico II XX Settembre, 4 - 09125



Cagliari (undefined)

Attività o settore Insegnamento & Formazione

10 LUG. 04–11 SET. 04 Undergraduated WorkEuropean Organization for Nuclear Research CERN CH-1211 Genève 23 SwitzerlandCH-1211 Genève 23 Ginevra (Svizzera)

Nell'ambito del lavoro di tesi:

Sviluppo del sistema di readout di un rivelatore a pixel per l’esperimento NA60 presso il CERN di Ginevra

Test sotto fascio del sistema di acquisizione sviluppato, per l’installazione del rivelatore in zona sperimentale, e per gestire l’avvio della fase di presa dati.

1 OTT. 97–30 SET. 98 ProgrammatoreComune di Monserrato (CA)Piazza San Lorenzo IT-09042 Monserrato (Italia)

Programmatore e videoterminalista c/o Uff. Elettorale e Leva.

Sviluppo di applicazioni in Access

1 NOV. 96–31 MAG. 97 VideoterminalistaComune di Selargius (CA)Piazza Istria, 1 IT-09047 Selargius (Italia)

Videoterminalista c/o Ufficio Tecnico

1 SET. 93–31 AGO. 96 "Giornalista" free-lance"Sogni"viale Trento 090100 Cagliari

Articoli e lavoro di redazione per un piccola rivista mensile locale

ISTRUZIONE E FORMAZIONE

1 NOV. 98–15 DIC. 04 Laurea in Fisica (110/110 LODE)UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI CAGLIARI,

Fisica delle particelle elementari

TESI: Sviluppo del sistema di readout di un rivelatore a pixel per l’esperimento NA60 presso il CERN di Ginevra

93 Diploma di Perito Informatico 55/60I.T.I. “Dionigi Scano” (Cagliari)Via Cesare Cabras IT-09042 Monserrato (Italia)

5 SET. 11–9 SET. 11 NGS and GWAS for Complex and Monogenic DisordersIstituto di Ricerca Genetica e Biomedica (CNR-IRGB) and the Centro di Ricerca, Sviluppo e Studi Superiori in Sardegna,

Summer School on Next Generation Sequencing and Genome Wide Association Studies.

24 SET. 12–28 SET. 12 2nd Sardinian Summer School



Genomic Analysis of Complex and Monogenic Disorders

COMPETENZE PERSONALI

Lingua madre italiano

Altre lingue COMPRENSIONE PARLATO PRODUZIONE SCRITTA

Ascolto Lettura Interazione Produzione orale

inglese B1 B2 B2 B2 B1

Livelli: A1/A2: Livello base - B1/B2: Livello intermedio - C1/C2: Livello avanzato Quadro Comune Europeo di Riferimento delle Lingue

Competenze professionali Programmazione Logiche FPGA:

1. Quartus (Altera Corporation)

2. Verilog HDL (Hardware Description Language)

Programmazione Chip Rabbit Semiconductor

Competenze informatiche Sistemi Operativi (Amministratore)

1) Windows

2) LINUX

Programmazione:

1. JAVA

2. JSP

3. HTML

4. JAVASCRIPT -JQUERY

5. PHP - AJAX

6. PERL

7. CSS

8. XML

9. Script di Shell (Bash,Korn)

10. C/C++

11. Dynamic C

12. GLADE/GTK++

13. CVI

14. Python, Pascal, Assembler, Visual Basic

15. C#

DataBase

1. ORACLE

2. MYSQL

3. MSSQL

Content Management System:

1. JOOMLA

2. MAMBO

3. CMSIMPLE

4. PLONE

5. MODX

6. DRUPAL


http://europass.cedefop.europa.eu/it/resources/european-language-levels-cefr


ULTERIORI INFORMAZIONI

Pubblicazioni

The silicon vertex tracker of NA60

Banicz, K.; Atzeni, R.; David, A.; Floris, M.; Heuser, J.; Keil, M.; Lourenco, C.; Ohnishi, H.; Radermacher, E.; Shahoyan, R.; Usai, G.;

CERN, Geneva, Switzerland

Nuclear Science Symposium Conference Record, 2005 IEEE

High differentiation among eight villages in a secluded area of Sardinia revealed by genome-wide high density SNPs analysis.

Pistis G, Piras I, Pirastu N, Persico I, Sassu A, Picciau A, Prodi D, Fraumene C, Mocci E, Manias MT, Atzeni R, Cosso M, Pirastu M, Angius A.

Istituto di Genetica delle Popolazioni, CNR, Alghero, Sassari, Italy.

PLoS One. 2009;4(2):e4654. Epub 2009 Feb 27.

Scaling with the flow: advantages of a MapReduce-based scalable and high-throughput sequencing workflow [Download PDF version]

Luca Pireddu, Simone Leo, Frederic Reinier, Riccardo Berutti, Rossano Atzeni, Gianluigi Zanetti

poster - International Conference on Human Genetics (ICHG) 2012, Montreal, Canada - october 2011

Genetic factors regulating the levels of immune system cells in health and disease

Valeria Orrú, Edoardo Fiorillo, Maristella Steri, Sole Gabriella, Francesca Virdis, Mariano Dei, Sandra Lai, Antonella Mulas, Piras M., Lobina M., mara Marongiu, Mauro Congia, Firinu D., Michael B Whalen, Sidore Carlo, Maria Francesca Urru, Fabio Busonero, Frederic Reinier, Marco Marcelli, Rossano Atzeni, Andrea Angius, Christopher M. S. Jones, David Schlessinger, Gonçalo R. Abecasis, Serena Sanna, Francesco Cucca

European Network of Immunology Institutes (ENII) - april 2012

Title: Sequencing-based and multiplatform Genome-Wide Association Study for Multiple Sclerosis and Type 1 Diabetes in Sardinians.(157) (12:00NOON-12:15PM on Thu) (Platform)

Author(s): I. Zara, E. Porcu, M. Zoledziewska, M. Pitzalis, M. Valentini, A. Mulas, F. Busonero, R. Atzeni, M. Oppo, F. Reinier, R. Berutti, R. Pilu, F. Deidda, C. Sidore, R. Piras, A. Loi, Sonia. Sanna, E. Cocco, F. Poddie, G. Farina, G. Rosati, L. Lianas, G. Cuccuru, G. Zanetti, A. Angius, M. G. Marrosu, C. M. Jones, G. R. Abecasis, Serena. Sanna, F. Cucca

ASHG Meeting - san Francisco 2012

Title: Whole Genome Sequencing of 2100 Individuals in the founder Sardinian Population.(177) (06:30PM-06:45PM on Thu) (Platform)

Author(s): C. Sidore, S. Sanna, A. Kwong, H. M. Kang, R. Cusano, M. Pitzalis, M. Zoledziewska, A. Maschio, F. Busonero, M. Lobina, A. Angius, R. Lyons, B. Terrier, C. Brennan, R. Atzeni, A. Mulas, M. Dei, M. Piras, S. Lai, F. Reinier, R. Berutti, C. Jones, M. Marcelli, M. Urru, M. Oppo, D. Schlessinger, G. Abecasis, F. Cucca


Title: Genetic factors associated with levels of immune cell types.(1516F) (3:15PM-4:15PM on Fri) (Poster)

Author(s): M. Steri, V. Orrù, E. Fiorillo, G. Sole, C. Sidore, F. Virdis, M. Dei, S. Lai, A. Mulas, M. G. Piras, M. Lobina, M. Marongiu, M. Zoledziewska, M. Congia, F. Busonero, A. Maschio, M. F. Urru, M. Marcelli, R. Atzeni, D. Firinu, M. Valentini, W. Mentzen, S. Naitza, M. B. Whalen, A. Angius, C. M. Jones, D. Schlessinger, G. Abecasis, S. Sanna, F. Cucca


Pubblicazioni Low-Pass DNA Sequencing of 1200 Sardinians Reconstructs European Y-Chromosome Phylogeny;

Science2 August 2013:Vol. 341no. 6145pp. 565-569DOI:10.1126/science.1237947


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