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Evoluzione genomica ed antigenica del virus della West Nile e analisi dei fattori di virulenza
Alessio Lorusso
2
• WNV, Usutu• Arboviruses• Flavivirus• Uomini, cavalli, uccelli
Flavivirus: structure
E dimer M protein
Capsid protein
Genomic RNA
Structuralproteins Non structural proteins
Genome (+ssRNA, 11000 nt)
Cap 5’
5’ 3’-OHGenomic polyprotein
C M E NS1 NS2ANS2B NS3 NS4A
NS4B NS5
Single-stranded RNA
viruses, surrounded by a
protein capsid icosahedral
symmetry with envelope.
Lineage 1a
Lineage 1b
Lineage 2
Lineage 3Lineage 4
Lineage 1: global distribution: Africa Occidentale, Medio Oriente, Est e Sud Europa, America, Australia, Asia Meridionale Lineage 2: Africa (Senegal, Uganda, R.C.A., Kenya, Madagascar) Europa
Lineage 3: Repubblica Ceca (Rabensburg virus) Lineage 4: RussiaLineage 5: India Lineage 6: strains Sarawak Kunjin virusLineage 7: African Koutango virusLineage 8: sequences in Spain
West Nile Virus Lineage
4
USUV multiple lineages
EVOLUZIONE ANTIGENICAE GENOMICA
• WNV ITALIANI 2009-2015• USUTU• CEPPI REFERENZA STORICI • JEV
• VIRUS INATTIVATI• SIERI IPERIMMUNI
USUTUJEVWNV L1WNV L2
E PROTEIN
99.4-100 % aa id tra Lin199.7-100 % aa id tra Lin293.3-95.6 % aa id tra Lin1 e Lin2 (ventina di mutazioni)76.2-78 % aa id tra WNV e USUTU (più di 100 mutazioni)
3 domains
38 WNV residues specific Abs
306, 308, 330, 366, 391conserved
• Bluetongue• African Horse Sickness
• Epizootic disease of cervids• Influenza
• Morbilliviruses!
+
STANDARDIZZAZIONE MODELLO MURINO
Survival curve, LD WNV
LD, low doseHD, high dose
competent mice
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 150
102030405060708090
100WNV Lin 1 20652WNV Lin 1 15803WNV Lin 2 20168
Time post infection
Perc
ent s
urvi
val
Survival curve, HD WNV
HD, high dose
neg