Eta’ di insorgenza e geni modificatori - Prof.ssa Marina Frontali
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Eta’ di insorgenza e geni modificatori Marina Frontali –Ist. di Farmacologia Traslazionale del CNR AICH – 12 Dicembre 2015
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Eta’ di insorgenza e geni modificatori
Marina Frontali –Ist. di Farmacologia Traslazionale del CNR
AICH – 12 Dicembre 2015
STRADE SEGUITE PER LA TERAPIA
EffettiHTT anomala
Gene mutato
Variabilita’ della malattia
Fattori che modificanoIl decorso della malattia
genetici ambientali
http://www.ijbs.com/v10p1024.htm
Cromosoma 4 Gene IT-15
GCTGCCGGGACGGGTCCAAGATGGACGGCCGCTCAGGTTCTGCTTTTACCTGCGGCCCAGAGCCCCATTCATTGCCCCGGTGCTGAGCGGCGCCGCGAGTCGGCCCGAGGCCTCCGGGGACTGCCGTGCCGGGCGGGAGACCGCCATGGCGACCCTGGAAAAGCTGATGAAGGCCTTCGAGTCCCTCAAGTCCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACACAGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCTCAGCTTCCTCAGCCGCCGCCGCAGGCACAGCCG……
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huntingtina
INSTABILITA’+ CORRELAZIONE CON ETA’ ALL’ESORDIO = ANTICIPAZIONE
65 anni15/40
40 anni17/45
36 anni17/44
40 anni17/44
?
12 anni18/7035 40 45 50 55 60 65 70 75
0
10
20
30
40
50
60
70
CAG
ETA
DI IN
SORG
ENZA
ETA ALL’ESORDIO E NUMERO DI TRIPETTE CAG (Gusella et al 2014)
VARIAZIONE DELL’ETA ALL’INIZIO NON DOVUTA A CAG
NUMERO CAG
ANNI INIZIO ANNI ATTESI DA CAG
DIFFERENZA (ANNI RESIDUI)
45 42 42 0
45 53 42 +11
45 39 42 -3
45 30 42 -12
45 49 42 +7
40 50 60 -10
40 62 60 +2
Come faccio a sapere quali geni influiscono sui processi che ritardano o anticipano l’eta all’inizio?
STUDI DI ASSOCIAZIONE SU TUTTO IL GENOMA
LE VARIANTI DI SINGOLO NUCLEOTIDE O SNP
10 milioni di SNPs nel genoma umano
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Pazienti con eta di insorgenzaminore del numero di triplette
Pazienti con eta di insorgenzamaggiore del numero di triplette
LA STRUTTURA DI UNO STUDIO DI ASSOCIAZIONE
HELM A.Illumina’s GWAS Roadmap
Fornisce genotipo per - 2.338.671 SNP o altri marcatori + altri 200.000 a scelta per ogni DNA
- 8 DNA in 10min circa 1,067 DNA circa in 1 settimana
Richiede - 200 ng DNA per persona- (200 miliardesimi di grammo)
Alexandra Dur, Adam Rosenblatt Luigi Frati, Susan Perlman Patrick M. Conneally, Mary Lou KlimMelissa Diggin,Tiffany Hadzi,, Ayana Duckett Anwar Ahmed, Paul Allen, David Ames,, Christine Anderson,, Karla Anderson Karen Anderson,,Thomasin Andrews, John AshburnerEric Axelson,, Elizabeth Aylward, Roger A. rker Katrin rth, RN, Stacey rton,, Kathleen ynes, Alexandra Bea, Erik Beall, Mirza Faisal Beg, Leigh J. Beglinger, Kevin Biglan, Kristine Bjork,, Steve Blanchard, Jeremy Bockholt,, Sudharshan Reddy BommuBradley Brossman, Maggie Burrows, Vince Calhoun, Noelle Carlozzi, Amy Chesire,, Edmond Chiu, Phyllis Chua, J. Connell, armela Connor, Jody Corey-Bloom, David Craufurd, Stephen Cross,, Lucette Cysique, Rachelle Dar Santos,, Jennifer Davis, oji Decolongon,, Anna DiPietro, Nicholas Doucette, Nancy Downing, Ann Dudler, Steve Dunn, Daniel Ecker, Eric A. Epping,, Diane Erickson, Cheryl Erwin,, Ken EvansStewart A. Factor,, Sarah Farias, Marta Fatas,, Jess Fiedorowicz, Ruth Fullam, Sarah Furtado, Monica scunana Garde, Carissa Gehl, Michael D. Geschwind, Anita Goh, Jon Gooblar, Anna Goodman, Jane Griffith, Mark Groves, Mark Guttman, Joanne Hamilton, Deborah Harrington, Greg Harris, Robert K. Heaton, Karl Helmer, Machelle Henneberry, Tamara Hershey, Kelly HerwigS, Elizabeth HowardChristine Hunter, Joseph Jankovic, Hans Johnson, Arik Johnson, PsyD, Kathy Jones, Andrew Juhl, Eun Young Kim, Mycah Kimble, Pamela King, Mary Lou Klimek, Stefan Klöppel, Katherine Koenig, Angela Komiti, MA, Rajeev Kumar, Douglas Langbehn, Blair Leavitt, Anne Leserman, Kelvin Lim, Hillary Lipe, Mark Lowe, Vincent A. Magnotta, William M. Mallonee, Nicole Mans, Jacquie Marietta, Frederick Marshall, Wayne Martin, Sarah Mason, C, Kirsty Matheson, Wayne Matson,Pietro Mazzoni,, William McDowell, AA, Zosia Miedzybrodzka, Michael Miller, James Mills, MEd, Dawn Miracle, Kelsey Montross, David Moore, Sasumu Mori, David J. Moser, Carol Moskowitz, Emily Newman, Peg Nopoulos, Marianne Novak, Justin O'Rourke, MA, David Oakes, William Ondo, Michael Orth, Peter Panegyres, Karen Pease, Susan Perlman, Joel Perlmutter, Asa Peterson, Michael Phillips, Ron Pierson, Steve Potkin, Joy Preston, Kimberly Quaid, Dawn Radtke, Daniela Rae, Stephen Rao, Lynn Raymond,Sarah Reading, Rebecca Ready, Christine Reece, Ralf Reilmann, Norm Reynolds, Kylie Richardson, Hugh Rickards, Eunyoe Ro, Robert Robinson, Robert Rodnitzky, Ben Rogers, Adam Rosenblatt, Elisabeth Rosser, Anne Rosser, Kathy Price Kathy Price Pat Ryan, David Salmon, Ali Samii, Jamy Schumacher, Jessica Schumacher, Jose Luis Lópenz Sendon, Paula Shear, Alanna Sheinberg, rnett Shp, Karen Siedlecki, Sheila A. Simpson, Adam Singer, Jim Smith Megan Smith, Glenn Smith, Pete Snyder, Allen Song, Satwinder Sran, Klaas Stephan, Janice Stober, W,Sigurd Sü?muth, RN, Greg Suter, Sarah Tabrizi, Terry Tempkin,Claudia Testa,Sean Thompson, Teri Thoen, Kelli Thumma, Arthur Toga, Sonja Trautmann, RN, Geoff Tremont, Jessica Turner, Ergun Uc, Anthony Vaccarino, Eric van Duijn, Marleen Van Walsem, Stacie Vik, Jean Paul Vonsattel, Elizabeth Vuletich, Tom Warner, Paula Wasserman, MA, Thomas Wassink, Elijah Waterman, Kurt Weaver, David Weir, c, Claire Welsh, Chris Werling-Witkoske, Melissa Wesson, Holly Westervelt, Patrick Weydt, Vicki Wheelock, Kent Willia, Janet Willia, Mary Wodarski, Joanne Wojcieszek, Jessica Wood, Cathy Wood-Siverio, Shuhua Wu, Olga Yastrubetskaya, Justo Garcia de Yebenes, Yong Qiang Zhao, Janice Zimbelman, PT, Roland Zschiegner, Olaf Aaserud, Giovanni Abbruzzese, Thomasin Andrews, Jurgin Andrich, Jakub Antczak, Natalie Arran, Maria J. Saiz Artiga, Anne-Catherine choud-Lévi, Krysztof naszkiewicz, Monica ndettini di Poggio, Oliver ndmann, Miguel A. rbera, Roger A. rker, Francisco rrero, Katrin rth, RN, Jordi s, Antoine Beister, Anna Rita Bentivoglio, Elisabetta Bertini, Ida Biunno, Kathrine Bjørgo, Inga Bjørnevoll, Stefan Bohlen, Raphael M. Bonelli, Reineke Bos, c, Colin Bourne, Alyson Bradbury, Peter Brockie, Felicity Brown, Stefania Bruno, Anna Bryl, Andrea Buck, Sabrina Burg, Jean-Marc Burgunder, Peter Burns, Liz Burrows, Nuria Busquets,Monica Busse, Matilde Calopa, Gemma T. Carruesco, Ana Gonzalez Casado, Judit López Catena, Carol Chu, Anna Ciesielska, Jackie Clapton, Carole Clayton, Catherine Clenaghan, Miguel Coelho, Julia Connemann, David Craufurd, Jenny Crooks, Patricia Trigo Cubillo, Esther Cubo, Adrienne Curtis, Giuseppe De Michele, A. De Nicola, Jenny de Souza, A. Marit de Weert, Justo Garcia de Yébenes, M. Dekker, A. Martínez Descals, Luigi Di Maio, Anna Di Pietro, Heather Dipple, Matthias Dose, Eve M. Dumas, Stephen Dunnett,Daniel Ecker, F. Elifani, Lynda Ellison-Rose, Marina D. Elorza, Carolin Eschench, Carole Evans, Helen Fairtlough, Madelein Fannemel, Alfonso Fasano, Maria Fenollar, Giovanna Ferrandes, Jaoquim J. Ferreira, Kay Fillingham, Ana Maria Finisterra, K. Fisher, Amy Fletcher, c, Jillian Foster, Isabella Foustanos, Fernando A. Frech, Robert Fullam, Ruth Fullham, Miguel Gago, RocioGarcía-Ramos García, Socorro S. García, Carolina Garrett, Cinzia Gellera, Paul Gill, Andrea Ginestroni, Charlotte Golding, Anna Goodman, Per Gørvell, Janet Grant, A. Griguoli, Diana Gross, Leonor Guedes, Monica scuñanaGuerra, Maria Rosalia Guerra, Rosa Guerrero,Dolores B. Guia, Arianna Guiduldi, Caroline Hallam, Stephanie Hamer, Kathrin Hammer, RAEET, Olivia J. Handley,Alison Harding, Lis Hasholt, Reikha Hedge, Arvid Heiberg, Walburgis Heinicke, Christine Held, Laura Casas Hernanz,Briggitte Herranhof, Carmen Durán Herrera, Ute Hidding, Heli Hiivola, Susan Hill, Lena. E. Hjermind, Emma Hoon,Rainer Hoffmann, Anna Hödl Holl, Liz Howard, Sarah Hunt, Susan Huson, , Tamara Ialongo,Jesus Miguel R. Idiago, Torsten Illmann, Katarzyna Jachinska, Gioia Jacopini, Oda Jakoen, Stuart Jamieson, Zygmunt Jamrozik, Piotr Janik, Nicola Johns, Lesley Jones, Una Jones, Caroline K. Jurgens, c, Alain Kaelin, Anna Kalrczyk, Ann Kershaw, Hanan Khalil, Janina Kieni, Aneta Klimberg, Susana P. Koivisto, Kerstin Koppers, Christoph Michael Kosinski, Malgorzata Krawczyk, Berry Kremer, Wioletta Krysa, Hubert Kwiecinski, Nayana Lahiri,Johann Lambeck, Herwig Lange, Fiona Laver, K.L. Leenders, Jamie Levey, Gabriele Leythaeuser, Franziska Lezius,Joan Roig Llesoy, Matthias Löhle, Cristol Diez-Aja López, Fortuna Lorenza, Giovanna Loria, Markus Magnet, Paola Mandich, Roberta Marchese, Jerzy Marcinkowski, Caterina Mariotti, Natividad Mariscal, Ivana Markova, Ralf Marquard, Kirsti Martikainen, Isabel Haro Martínez, Asuncion Martínez-Descals, T. Martino, Sarah Mason, Sue McKenzie, Claudia Mechi, Tiago Mendes, Tiago Mestre, Julia Middleton, Eva Milkereit, Joanne Miller, Julie Miller, Sara Minster, Jens Carsten Möller, Daniela Monza, Blas Morales, Laura V. Moreau, Jose L. López-Sendón Moreno, Alexander Münchau, Ann Murch, Jørgen E. Nielsen, Anke Niess, Anne Nørremølle,Marianne Novak, Kristy O'Donovan, Michael Orth, Daniela Otti, Michael Owen, Helene Padieu, Marco Paganini, Annamaria Painold, Markku Päivärinta, Lucy Partington-Jones, Laurent Paterski, Nicole Paterson, Dawn Patino, Michael Patton, Alexander Peinemann, Nadia Peppa, Maria Fuensanta Noguera Perea, Maria Peterson, Silvia Piacentini, Carla Piano, Regina Pons i Càrdenas, Christian Prehn, Kathleen Price, Daniela Prot, Oliver Quarrell,Purificacion Pin Quiroga, Tina Raab, Maryla Rakowicz, Ashok Raman, Lucy Raymond, Ralf Reilmann, Gema Reinante,Karin Reisinger, Lars Retterstol, Pascale Riï, Antonio V. Rillo, Guillermo G. Ris, Sven Richter, Hugh Rickards, Carlo Rinaldi, Ida Rissling, Stuart Ritchie, MB, ChB, sych, Susana Vázquez Rivera,Misericordia Floriach Robert, Elvira Roca, Silvia Romano, Anna Maria Romoli, Raymond A.C. Roos, Niini Røren,Sarah Rose, Elisabeth Rosser, Anne Rosser, Fabiana Rossi, Jean Rothery, Monika Rudzinska, Pedro J. García Ruíz, Belan Garzon Ruíz, Cinzia Valeria Russo, Danuta Ryglewicz, Carston Saft, Elena Salvatore,Vicenta Sánchez, Sigrid Botne Sando, Pavla Šašinková, Christian Sass, Monika Scheibl, Johannes Schiefer, Christiane Schlangen, Simone Schmidt, Helmut Schöggl, Caroline Schrenk, Michael Schüpch, Michele Schuierer, Ana Rojo Sestián, Amina Selimbegovic-Turkovic, Justyna Sempolowicz, Mark Silva, Emilia Sitek, Jaroslaw Slawek, Julie Snowden, Francesco Soleti, Paola Soliveri, Andrea Sollom, Witold Soltan, Sandro Sorbi, Sven Asger Sorensen, Maria Spadaro, Michael Städtler, Christiane Stamm, Tanja Steiner, Jette Stokholm, Bodil Stokke, Cheryl Stopford, Alexander Storch, Katrin Straßburger, Lars Stubbe, Anna Sulek, Andrzej Szczudlik, Sarah Tabrizi, Rachel Taylor, Santiago Duran-Sindreu Terol, Gareth Thomas, Jennifer Thompson, Aileen Thoon, Katherine Tidswell, Maria M. Antequera Torres, Jean Toscano, Jenny Townhill, Sonja Trautmann, Tecla Tucci, Katri Tuuha, Tereza Uhrova, Anabela Valadas, Monique S.E. van Hout, J.C.H. van Oostrom, Jeroen P.P. van Vugt, Walsem Marleen R. vanm, c, Wim Vandenberghe, Christine Verellen-Dumoulin, Mar Ruiz Vergara, C.C.P. Verstappen,Nichola Verstraelen, Celia Mareca Viladrich, Clara Villanueva, Jan Wahlström, Thomas Warner, ,Raghild Wehus, Adolf Weindl, Cornelius J., Werner, Leann Westmoreland, Patrick Weydt, Alexandra Wiedemann, Edward Wild, Sue Wild, Marie-Noelle Witjes-Ané, Grzegorz Witkowski, Magdalena Wójcik, Martin Wolz, Annett Wolz, Jan Wright, Pam Yardumian, Shona Yates, Elizaveta YudinaJacek Zarem, Sabine W. Zaugg,Elzbieta Zdzienicka, Daniel Zielonka, Euginiusz Zielonka, Paola Zinzi, Simone Zittel, Birgrit Zucker, John Ada, Pinky Agarwal, Irina Antonijevic, Christopher Beck, Edmond Chiu, Andrew Churchyard,Amy Colcher, Jody Corey-Bloom, Ray Dorsey, Carolyn Drazinic, Richard Dubinsky, Kevin Duff, Stewart Factor, DO, Tatiana Foroud, Sarah Furtado, Joe Giuliano, N, Timothy Greenamyre, Don Higgins, Joseph Jankovic, Dana Jennings, Un Jung Kang, Sandra Kostyk, Rajeev Kumar, Blair Leavitt, Mark LeDoux, William Mallonee, Frederick Marshall, Eric Mohlo, John Morgan, David Oakes, Peter Panegyres, Michel Panisset, Susan Perlman, Joel Perlmutter, Kimberly Quaid, Lynn Raymond, Fredy Revilla, Suzanne Robertson, Bradley Robottom, Juan Sanchez-Ramos, Burton Scott, Kathleen Shannon, Ira Shoulson, Carlos Singer, Samer Tabl, Claudia Testa,, Kammen Dan van, Louise Vetter,Francis Walker, John Warner, illiam Weiner, Vicki Wheelock, Olga Yastrubetskaya, Stacey rton, W, Janice Broyles, RN, Ronda Clouse, RN, Allison Coleman, Robert Davis, Joji Decolongon, Jeanene DeLaRosa, Lisa Deuel, Susan Dietrich, Hilary Dubinsky, Ken Eaton, Diane Erickson,, Mary Jane Fitzpatrick, Steven Frucht, Maureen Gartner, RN, Jody Goldstein, Jane Griffith, RN, Charlyne Hickey, Victoria Hunt, RN, Jeana Jaglin, RN, Mary Lou Klimek, Pat Lindsay, Elan Louis, Clemet Loy, Nancy Lucarelli, Keith Malarick, Amanda Martin, Robert McInnis, Carol Moskowitz, Lisa Muratori, EDD, Frederick Nucifora, Christine O'Neill, Alicia Palao, Guerry Peavy, Monica Quesada, Amy Schmidt, Vicki Segro, Elaine Sperin, LPN, Greg Suter, Kalo Tanev, Teresa Tempkin, RNC, N, Curtis Thiede, Paula Wasserman, MA, Claire Welsh, Melissa Wesson, Elizabeth Zauber,
ITALY Bari Clinica Neurologica - Neurophysiopatology of Pain Unit UNIVERSITA' DI BARI): Claudia Cormio, Vittorio Sciruicchio, Claudia Serpino, Marina de Tommaso Bologna (DIBINEM - Alma Mater Studiorum - Università di Bologna; IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna): Sabina Capellari, Pietro Cortelli, Roberto Galassi, Rizzo Giovanni, Roberto Poda, Cesa Scaglione Florence (Dipartimento di Scienze Neurologiche e Psichiatriche Universita' degli Studi di Firenze-Azienda Ospedaliera Universitaria Careggi): Elisabetta Bertini, Elena Ghelli, Andrea Ginestroni, Francesca Massaro, Claudia Mechi, Marco Paganini, Silvia Piacentini, Silvia Pradella, Anna Maria Romoli, Sandro Sorbi Genoa (Dipartimento di Neuroscienze, Riabilitazione, Oftalmologia, Genetica e Scienze Materno-Infantili, Università di Genova): Giovanni Abbruzzese, Monica Bandettini di Poggio, Giovanna Ferrandes, Paola Mandich, Roberta Marchese Milan (Fondazione IRCCS Istituto Neurologico Carlo Besta): Alberto Albanese, Daniela Di Bella, Anna Castaldo, Stefano Di Donato, Cinzia Gellera, Silvia Genitrini, Caterina Mariotti, Daniela Monza, Lorenzo Nanetti, Dominga Paridi, Paola Soliveri, Chiara Tomasello S8 Naples (Dipartimento di Neuroscienze, Scienze Riproduttive e Odontostomatologiche, Università Federico II): Giuseppe De Michele, Luigi Di Maio, Marco Massarelli, Silvio Peluso, Alessandro Roca, Cinzia Valeria Russo, Elena Salvatore, Pierpaolo Sorrentino Pozzilli (IS) (Centro di Neurogenetica e Malattie Rare - IRCCS Neuromed): Enrico Amico, Mariagrazia Favellato, Annamaria Griguoli, Irene Mazzante, Martina Petrollini, Ferdinando Squitieri and Rome (Lega Italiana Ricerca Huntington e malattie correlate - onlus / www.LIRH.it): Barbara D'Alessio, Chiara Esposito Rome (Istituto di Farmacologia Traslazionale & Istituto di Scienze e Tecnologie della Cognizione /CNR, Istituto di Neurologia Università Cattolica del Sacro Cuore): Anna Rita Bentivoglio, Marina Frontali, Arianna Guidubaldi, Tamara Ialongo, Gioia Jacopini, Carla Piano, Silvia Romano, Francesco Soleti, Maria Spadaro, Paola Zinzi
4.080 pazienti con triplette tra 40 e 53 CAG
GENI NELLE REGIONI INDICATE DAGLI SNPs
MLH1 FAN1 RRM2B
RIPARO DEL DNA
MTMR10 UBR5
MITOCONDRI
RRM2B
MECCANISMI DI RIPARO DEL DNA
Durante replicazione : 1 errore / 10.000 basi
In tutto il nostro corpo ogni giorno un miliardo di miliardi di errori
http://biobook.nerinxhs.org/bb/special_topics/replication.htm
POSSIBILI VIE ATTRAVERSO LE QUALI I GENI DEL RIPARO AGISCONO SULL’INSORGENZA
Errori che si accumulano col tempo sono causa di: - malfunzionamento cellulare - invecchiamento e morte cellulare - processi tumorali
Effetto tossico sulle cellule della HTT mutata
Anticipazione della eta’ di insorgenza
CONCLUSIONIVarianti nella sequenza del DNA dei geni coinvolti nei meccanismi di riparo del DNA sembrano anticipare (anche di 6 anni) o ritardare ( di 2 anni circa) l’eta di insorgenza rispetto a quella attesa in base alle sole triplette CAG
le proteine del riparo possono influenzare l’eta’ di insorgenza della malattia perche’:- cellule con molti errori del DNA muoiono piu facilmente
Queste varianti potrebbero produrre diverse attivita delle proteine del riparo e quindi il riparo del DNA puo’ avvenire con un maggiore o minore numero di errori
Questo studio dimostra che l’eta’ di insorgenza puo’ essere modificata: se riusciamo a attivare o disattivare proteine del riparo o I loro effetti a livello cellulare questo puo’ modificare il corso della malattia
Questo studio e stato possibile grazie al contributo di migliaia di pazienti che hanno donato il loro sangue per poter essere analizzato
RIPARO DI DEFORMAZIONI DEL DNAhtt
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eb-b
ooks
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/MoB
io/F
ree/
Ch7F
3.ht
m
LE CELLULE HANNO DIVERSO GRADO DI ESPANSIONE DELLE CAG A SECONDA DELLA ATTIVITA’ DEL GENE MLH3
17-43 17-45
17-41
17-4617-43
17-43 17-43
17-43 17-45
17-41
17-4617-49
17-44 17-50
Pinto et al 2013
WEXLER 2004
Pazienti con eta di insorgenzamaggiore del numero di triplette
Pazienti con eta di insorgenzaminore del numero di triplette
VARIE STIME DELL’ETA’ ALL’ESORDIO BASATE SOLO SU TRIPLETTE CAG
WEXLER 2004Familial pairs Gender Number of pairs Correlation (SE)
Sibling 441 0.40 (0.09)Same sex 220 0.34 (0.16)Brother-brother 108 0.18 (0.20)
Sister-sister 113 0.49 (0.13)Different sex 220 0.40 (0.11)
Parent-offspring 202 0.10 (0.11)
Same sex 93 0.15 (0.15)Different sex 109 0.06 (0.19)
Avuncular 729 0.07 (0.11)Cousin 1,319 0.15 (0.10)Great-avuncular 213 0.14 (0.15)
First cousin once-removed 2,615 0.06 (0.08)
First half-cousin once-removed
305 0.04 (0.09)
Second cousin 3,443 0.17 (0.06)Second half-cousin 1,282 -0.08 (0.13)
First cousin twice-removed 749 0.06 (0.08)
Second cousin once-removed 5,970 0.09 (0.04)
Second half-cousin once-removed
2,340 0.03 (0.11)
Third cousin 6,160 0.08 (0.04)Third half-cousin 654 -0.08 (0.12)
SNP
Chromosome
Base pair (hg19)
Reference allele Alternative Allele Minor allele
Minor allele frequency (%) Slope (years/minor allele) P-value
rs146353869 15 31126401C A A 1.654 -5.855946 4.30E-20rs143219583 15 31090934G A A 1.458 -6.13348 2.10E-19rs150393409 15 31202961G A A 1.605 -5.545726 9.34E-18rs182848624 15 31300677T C C 1.482 -5.69031 3.21E-17rs10851464 15 31149268T C T 1.984 -4.94186 3.29E-17rs183073833 15 31247852G T T 1.568 -5.483588 4.33E-17rs139725050 15 31276406T C C 1.568 -5.483588 4.33E-17rs146344029 15 31276476A C C 1.69 -5.13212 3.24E-16rs2140736 15 31159212A G A 2.144 -4.544395 7.06E-16rs141762740 15 31195968A G G 1.85 -4.856156 8.49E-16rs114136100 15 31197976C T T 1.85 -4.856156 8.49E-16rs148265312 15 31199046A G G 1.85 -4.856156 8.49E-16rs150534354 15 31199698G A A 1.85 -4.856156 8.49E-16
15:31199900 15 31199900TAGGG T T 1.85 -4.856156 8.49E-16rs148577234 15 31200602T C C 1.85 -4.856156 8.49E-16rs151268531 15 31201839C T T 1.85 -4.856156 8.49E-16rs150864828 15 31211335G A A 1.85 -4.856156 8.49E-16rs148716222 15 31224851G C C 1.85 -4.856156 8.49E-16rs12916460 15 31188438C G C 1.972 -4.71763 1.99E-15rs12148389 15 31192750G C G 1.984 -4.642082 3.89E-15rs8035438 15 31174519A G A 2.131 -4.445105 6.43E-1515:31185110 15 31185110AC A AC 2.046 -4.468439 1.59E-14rs2103151 15 31185126G T G 2.046 -4.468439 1.59E-14rs192500039 15 31224948G A A 2.07 -4.314665 5.14E-14rs2140734 15 31243792T G G 30.37 1.35901 7.15E-14rs7180337 15 31190367G T G 2.131 -4.279109 7.49E-14rs35811129 15 31241346G A A 27.24 1.377128 1.16E-13
ETA RESIDUA E’ PIU’ SIMILE QUANDO MAGGIORE E’ LA SOMIGLIANZA GENETICA (da Wexler et al 2004)
Genoma in comune
Somiglianza eta residua
Tra fratelli 50% 40%
Tra cugini 1 grado 16% 15%
Tra cugini 2 grado 0.8% 17%
Tra cugini 3 grado 0.2% 8%
