Con l’operatore NOT sono esclusi dalla ricerca le lettere ... · Canadian Agency for Drugs and...

Con l’operatore NOT sono esclusi dalla ricerca le lettere, gli articoli di quotidiani ei commenti Corso: EBM Roma,

16-17 settembre/7-8 ottobre 2015

PubMed Health

Corso: EBM Roma, 16-17 settembre/7-8 ottobre 2015

Manuali, help, guide interattive su Pubmed

Breast cancer


Esercitazione 2

Ricercare in PubMed Health documenti EBM sul tumore della mammella


Asterisco non funziona

in Pubmed HealthBreast cancer* riduce anziché ampliare la ricerca quindi

non usare*

Meglio (“breast cancer” OR “breast cancers” OR “breastneoplasm” OR “breast neoplasms” ecc)neoplasm” OR “breast neoplasms” ecc)

Adiacenza funziona

con AND maggior rumore e minore precisione..


Agenzie e basi dati da cui sono

tratte le informazioni � Agency for Health Care Research and Quality (US) (AHRQ)

� Canadian Agency for Drugs and Technologies in Health (CADTH)

� Centre for Reviews and Dissemination (CRD)

� The Cochrane Collaboration (CC)

� German Institute for Quality and Efficiency in Health Care (IQWiG)

� National Cancer Institute (NCI)

� National Institute for Health and Care Excellence guidelines program (NICE)

� National Institute for Health Research (NIHR) Health Technology Assessment Programme (NIHR HTA)

� Oregon Health and Science University's Drug Effectiveness Review Project (DERP)

� Department of Veterans Affairs' Evidence-based Synthesis Program from the Veterans Health Administration R&D (VA ESP)

� PubMed Health also includes information from the National Heart, Lung, and Blood Institute's (NHLBI) Health Topics.


DARE The Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE) contains details of

systematic reviews that evaluate the effects of healthcare interventions

Centre for Reviews and Dissemination – University of York

� The Department of Health and the National Institute for Health Research (NIHR) funded the production of DARE and NHS EED between 1994 and March 2015. DARE and NHS EED between 1994 and March 2015. Although funding has ceased and we are no longer adding new records to the databases both can be accessed via the CRD website.

� Weekly searches of MEDLINE, EMBASE, CINAHL, PsycINFO, PubMed were carried out up until the end of December 2014.


Breast cancer Radiology


Non solo articoli di riviste e citazioni EBM da Pubmedma anche monografie, linee guida a testo intero (es. NICE) , informazioni da banche dati EBM (es.


(es. NICE) , informazioni da banche dati EBM (es. Cochrane, Dare) e sullo stato dell’ arte (esempio PDQ per il trattamento dei tumori )…

BLOG di PubMed Health


Posso essere informato sugli aggiornamenti della revisione Cochranerevisione Cochrane


Indicizzazione?


Se il record ha lo status di “supplied by publisher” odi “pubmed in process” di “pubmed in process” “Pubmed” non ha i MESHsolo i record “pubmedindexed for Medline” sono completamente indicizzati


Status dei record in PubMed (1)

� Pubmed –indexed for Medline

� Articoli che hanno completato l’indicizzazione ed hanno subito

Medline

� Pubmed in process

� Pubmed as supplied bypublisher

l’indicizzazione ed hanno subito un rigoroso controllo

� Articoli di cui è in corso l’indicizzazione

� Articoli forniti elettronicamente da editori e non indicizzati


Status dei record in Pubmed(2) � PubMed OldMedline

PubMed

� Vecchi articoli su cui non si è ancora portato a termine il processo di indicizzazione MESH

� Articoli “out of scope” ; articoli � PubMed

� Articoli “out of scope” ; articoli da fascicoli precedenti all’indicizzazione

� Manoscritti di articoli di riviste (portfolio) non indicizzate in Pubmed Central

� Libri e capitoli di libri in NCBI Books database


I termini MESH appaionoappesi all’ articolo.L’asterisco indica gli argomenti/ MESH principali dell’ articolo


Sottovoci topiche

Argomento principale articolo*

La sottovoce nursinglimita la ricerca ad articoli infermieristici


Sinonimi del descrittore MESH “neoplasms”

Termini MESH correlati al Descrittore “neoplasms”


Struttura classificata ad alberoStruttura classificata ad albero(Tree structure)

Esplosione dei termini Mesh Se cerco Neoplasms io faccio una ricerca su tutti i tipi di tumore (come mettessi in OR tutte queste voci)


Nel caso di un solo terminee indifferente l’operatorebooleano

Clickando su “restrict research toMajor Topic “otteniamo solo gli articoli In cui l’argomento ricercato è principale


Che cos’è il MESH?� Il Medical Subject Headings è il tesauro della base dati

PUBMED prodotta dalla National Library of Medicine


Un dizionario controllato di termini univoci che Un dizionario controllato di termini univoci che identificano i concetti contenuti negli articoli con cui è

stata indicizzata l’informazione


Medical Subject Headings� …There are 27,149 descriptors in 2014 MeSH.

� There are also over 218,000 entry terms that assist in finding the most appropriate MeSH Heading, for example, "Vitamin C" is an entry term to "Ascorbic example, "Vitamin C" is an entry term to "Ascorbic Acid.“

� In addition to these headings, there are more than 219,000 headings called Supplementary Concept Records (formerly Supplementary Chemical Records)


Metodologia della ricerca di informazioni infermieristiche in

Internet e nelle basi dati

(Roma: 7,8,10 aprile 2014)

Ricerca infermieristica in archivi strutturati:

Pubmed


E-mail: [email protected]

Biblioteca Digitale Centro di Conoscenza “R Maceratini” – Istituto Regina Elena

Tumore della mammellanon è tra i sinonimi vi è al plurale vi è al plurale


Non risolve le ambiguità di significato dei termini

•Rende necessario l’uso di tantissimi sinonimisinonimi

•Pesca tutte le parole indistintamente ma non si sa quanto queste siano significative in un determinato contesto (es. abstract)


Unified Medical Language System

� UMLS Knowledge Sources and Software Tools

� There are three UMLS Knowledge Sources: the Metathesaurus®, the Semantic Network, and the Metathesaurus®, the Semantic Network, and the SPECIALIST Lexicon.


Unified Medical Language System� The Unified Medical Language System® (UMLS®)

Metathesaurus® is a large, multi-purpose, and multi-lingual thesaurus that contains millions of biomedical and health related concepts, their synonymous names, and health related concepts, their synonymous names, and their relationships

� the Metathesaurus contains over 150 source vocabularies, such as MeSH®, RxNorm, SNOMED CT®, ICD-9-CM, ICD-10-CM, CPT®, and LOINC®. Many of the vocabularies are designated to meet US health standards for electronic health records.


Mesh e UMLS sono standard terminologici e sistemi di

conoscenza (Ontologie)

� Il Mesh e l’ UMLS sono utilizzati per varie

� Basi dati NLM, Cinahlecc.

� Cartelle cliniche elettronicheutilizzati per varie

applicazioni

elettroniche

� Realizzazione di siti e portali con indicizzazione semantica

� ecc. ecc.


Le sottovoci� Prima di cercare una seconda voce MESH verificare se

il concetto è coperto da una sottovoce (neoplasms/therapy e non neoplasms AND therapy)

� Le sottovoci si esplodono automaticamente� Le sottovoci si esplodono automaticamente

� Le sottovoci possono essere coordinate tra di loro: esempio neoplasms/ drug therapy

cisplatin/therapeutic use


Le basi dati strutturate � Dispongono di propri tesauri per indicizzare le

informazioni

� Ad esempio EMBASE ha come tesauro l’ EMTREE

� I termini utilizzati sono diversi ma i tesauri e le � I termini utilizzati sono diversi ma i tesauri e le modalità di interrogazione hanno di solito le stesse o simili caratteristiche (ricerca per campi, filtri, argomento principale, organizzazione gerarchica, sottovoci, esplosione ecc.)


Metodologia della ricerca con i

MESH (1)1. Per la ricerca su MESH scomponi la ricerca in concetti semplici e

verifica se vi è il descrittore (termine univoco) per tali concetti leggendo attentamente la Scope note .

2. Verifica se esiste un MESH specifico per la nostra ricerca (es. per l’ insulina non cercare Hormones ma Insulin). Solo se non

si trova lo specifico Mesh si può utilizzare quello più generico. (Verifica con l’uso del tree structure) (Verifica con l’uso del tree structure)

3. Dato il Mesh principale verifica se vi è una sottovoce (subheading) relativo all’ aspetto che ti interessa (es. therapy, diagnosis ecc.)

4. Se sono interessato ad una tipologia di articoli (es letter, review, clinical trial, guideline) posso inserire un publication type (es. dai limits) e non una voce MESH principale . Per selezionare solo materiale EBM, ricordarsi di usare il filtro: SystematicReviews dai Publication Type


Metodologia della ricerca con i

MESH (2)1. Combinare i MESH con gli operatori booleani

appropriati

2. Se i risultati sono troppi restringere con i Limits(tipo pubblicazione, data, età, genere ecc. )(tipo pubblicazione, data, età, genere ecc. )

3. Se i risultati sono pochi, oltre ad aver applicato l’esplosione, eliminare sottovoci (subheading) e filtri.

4. Usare anche termini liberi con troncamento, utilizzare funzione “ citazioni correlate”


Quick and dirty

per trovare i MESH� La filosofia del MESH è molto complessa

� Indicizzare e ricercare con i MESH non è semplice

� Metodo utile il “quick and dirty” (rapido e sporco)Metodo utile il “quick and dirty” (rapido e sporco)

� Faccio una ricerca con i miei termini e poi analizzo gli articoli pertinenti per individuare i MESH che sono alla fine degli articoli


La ricerca è un’attività pragmatica che dipende anche dal

nostro obiettivo

� risposta clinica o ricerca sistematica?


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