RNA regolatore

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

miRNA (micro RNA)

siRNA (small interfering RNA)

regolazione espressione genica

degradazione mRNA

Piccolissimi RNA cellulari (20-25 nt)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Proteine

Proteine che legano l’mRNA

Amminoacil-tRNA sintetasi

Proteine ribosomaliFattori di traduzione

RNA

COMPONENTI DELLA SINTESI PROTEICA

RNA transfer(tRNA)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Il tRNA ha le proprietà di un adattatoreche riconosce sia l’amminoacidoche il codone

Il tRNA ha le proprietà di un adattatoreche riconosce sia l’amminoacidoche il codone

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Il tRNA è ripiegato in una struttura terziaria compatta a forma di L con l’amminoacido ad un estremo e l’anticodone all’altro estremo

Ansa D

Anticodone

Braccio accettore

Ansa TC 5’

3’

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

“Wobble”Tentennamento

VacillamentoOscillazione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

L’appaiamento codone-anticodone può coinvolgereun appaiamento G/U (wobble) nella terza posizione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Base modificata nellaprima posizionedell'anticodone

Basi riconosciutenella terza posizione

del codone

La modificazione di basi nell’anticodonepermette altri tipi di appaiamenti

I C / U / A

tio-U A

Le amminoacil-tRNA sintetasi

Il caricamento dei tRNA

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Il riconoscimento dell’a.a. corretto da parte della a.a.-tRNA sintetasi è verificato con un meccanismo di “correzione di bozze” innescato dal legame con il giusto tRNA:

• un cambiamento conformazionale può causare l’idrolisi dell’ a.a.-adenilato

• il trasferimento dell’a.a. sul tRNA può essere seguito da idrolisi

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

La accuratezza del caricamento del tRNAIle da parte della corrispondente sintetasi dipende da un meccanismo di controllo degli errori che agisce in due diverse fasi

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Soppressione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Mutazioni non-senso possonoessere “soppresse” da un tRNA con una mutazione nell’anticodoneche inserisce un a.a. in corrispondenza del codone mutato, producendo così una proteina completa. Nell’esempio la Leu originale è stata sostituita da una Tyr.

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

I soppressori non-senso continuano la lettura attraverso i codoni di terminazione naturali,sintetizzando proteine che sono più lunghe del normale

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

La soppressione “di senso” avvienequando l’anticodone di un tRNA è mutato in modo da “rispondere” al codone sbagliato.

Ricodifica

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006