rr--proteineproteine proteine ribosomialiproteine ribosomiali

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Risposta StringenteRisposta Stringente: capacità di un batterio di bloccare : capacità di un batterio di bloccare la sintesi (trascrizione) di tRNA e componenti la sintesi (trascrizione) di tRNA e componenti ( ) p( ) p

ribosomiali in condizioni di crescita sfavorevoli.ribosomiali in condizioni di crescita sfavorevoli.

AlarmoneAlarmone: piccola molecola : piccola molecola utilizzata dai batteri per regolare utilizzata dai batteri per regolare l’espressione genical’espressione genica

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Tubulin is one of several members of a small family ofsmall family of globular proteins. The most commonmost common members of the tubulin family

t b liare α-tubulin and β-tubulin, the proteins that make up microtubules.

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R l i d ll d iR l i d ll d iRegolazione della traduzioneRegolazione della traduzione

G lG l•• GeneraleGenerale

•• SpecificaSpecifica

Initiation Factors Activityprokaryotes eukaryotesp y yIF3 eIF-1 Fidelity of AUG codon recognition

IF1 eIF-1A Facilitate Met-tRNAiMet binding to small s b nitIF1 eIF 1A subunit

eIF-2 Ternary complex formation

eIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF-2 recyclingeIF-2B (GEF) GTP/GDP exchange during eIF 2 recycling

eIF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40S

eIF-4F (4E 4A 4G) mRNA binding to 40S RNA helicase activityeIF-4F (4E, 4A, 4G) mRNA binding to 40S, RNA helicase activity

eIF-4A ATPase-dependent RNA helicase

eIF-4E 5' cap recognitioneIF-4E 5 cap recognition

eIF-4G Scaffold for of eIF-4E and -4A

eIF-4B Stimulates helicase, binds with eIF-4F,

eIF-4H Similar to eIF4B

eIF-5 Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase

IF2 eIF5B Subunit joining

eIF-6 Ribosome subunit antiassociation

eIF2eIF2eIF2eIF23 subunità: α, β, γ

Subunità β aiuta attività di GTPasi e modula il legame tRNAi-eIF2 γSubunità α è un regolatore della traduzione. E’ fosforilata (ser 51) da diverse chinasi in i t trisposta a stress.

eIF4FeIF4F

Composto da 3 subunità

eIF4A: elicasi, aiutato da eIF4BeIF4A: elicasi, aiutato da eIF4B

eIF4E: cap binding protein, regolata da fosforilazione e interazione con eIF4E BPfosforilazione e interazione con eIF4E-BP

eIF4G: adattatore, interagisce con diversi fattori

eIF4F

R l i d ll d iR l i d ll d iRegolazione della traduzioneRegolazione della traduzione

G lG l•• GeneraleGenerale

•• SpecificaSpecifica

linlin--1414 encodes a encodes a protein whose protein whose activity is required activity is required for specifying the for specifying the division timings of division timings of gga specific group of a specific group of cells during cells during postembryonicpostembryonicpostembryonic postembryonic development in the development in the nematode nematode CaenorhabditisCaenorhabditisCaenorhabditis Caenorhabditis eleganselegans..

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Silenziamento da RNASilenziamento da RNA(silenziamento genico post(silenziamento genico post--trascrizionale)trascrizionale)(silenziamento genico post(silenziamento genico post--trascrizionale)trascrizionale)

La fonte più La fonte più comune di dsRNA comune di dsRNA è un virus a RNAè un virus a RNAè un virus a RNA è un virus a RNA in replicazione.in replicazione.La presenza di La presenza di d RNA h ff ttid RNA h ff ttidsRNA ha effetti dsRNA ha effetti sia generali (blocco sia generali (blocco della traduzione e della traduzione e degradazione di degradazione di tutto l’ mRNA) che tutto l’ mRNA) che specifici basati specifici basati ppsulla sequenza.sulla sequenza.

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Controllo traduzionale della sintesiControllo traduzionale della sintesidella ferritina in cellule animalidella ferritina in cellule animalidella ferritina in cellule animalidella ferritina in cellule animali

Fe

IRP IRP = IRF = IRE-BP

Fe

AUG

IRE

stop5' 3'AUG stop5' 3

ferritina mRNA Legame di IRP blocca traduzione

Ferritin is a globular protein complex consisting of 24 protein subunits and is Ferritin is a globular protein complex consisting of 24 protein subunits and is g p p g pg p p g pthe main the main intracellular iron storage proteinintracellular iron storage protein in both prokaryotes and eukaryotes, in both prokaryotes and eukaryotes, keeping it in a soluble and nonkeeping it in a soluble and non--toxic form. toxic form.

Indicazione di controllo traduzionaleIndicazione di controllo traduzionaleIndicazione di controllo traduzionaleIndicazione di controllo traduzionale

Northern blotNorthern blot Western blotWestern blot

Fe +Fe-Fe +Fe -Fe +Fe

mRNA ferritina ferritina

timRNA actina

actina

Trasporto nucleoTrasporto nucleo--citoplasmacitoplasma

C i l RNA iC i l RNA i•• Coinvolge RNA e proteineCoinvolge RNA e proteine•• E’ bidirezionaleE’ bidirezionale•• Utilizza i pori nucleariUtilizza i pori nucleari

T t lT t l it lit lTrasporto nucleoTrasporto nucleo--citoplasmacitoplasma

NLSNLS•• NLSNLS (nuclear(nuclear localizationlocalization sequence)sequence) == sequenzasequenza amminoacidicaamminoacidica

necessarianecessaria perper ilil trasportotrasporto versoverso ilil nucleonucleo

•• NESNES (nuclear(nuclear exportexport sequence)sequence) == sequenzasequenza amminoacidicaamminoacidica

necessarianecessaria perper ilil trasportotrasporto versoverso ilil citoplasmacitoplasma

Substrato Carrier