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Definizioni:

•genoma

•trascrittoma

•proteoma

Paradosso del valore C

• Eccesso di DNA rispetto alla complessità

• Variazioni di valore C per complessità simili

Struttura del genoma eucariotico

•Sequenze ripetute

•DNA non

codificanti

•Geni interrotti

Uniche(1-10 volte)circa 40%

Mediamente ripetute(da centinaia a migliaiadi volte)40-50%

Altamente ripetute(da decine di migliaiaa milioni di volte)5-10%

Maggior parte dei geni

Alcune sequenze regolative

Alcune sequenze a funzione speciale(centromeri, origini, etc.)

intersperse

in tandemGeni reiterati(rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.)

DNA satellitisequenze semplici

Sequenze ripetute nel genoma umano

geni per: rRNA (300)tRNA (1300)5S RNA (2000)istoni (20)

sequenze ripetute interspersesequenza Alu: 300 nt (x 1.000.000)

sequenze semplici o satelliti: 2-10 nt (x 2-100 copie in tandem x 1-100 blocchi interspersi)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

•Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici

•Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.

La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006

Gene per il collagene 12 di pollo

•Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA maturo

•Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006