Oxi/FermPluri – Test · 2013-09-04 · Oxi/FermPluri – Test MANUALE DEI CODICI Indice Pag....

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Oxi/FermPluri – Test Sistema per l’identificazione di batteri Gram negativi, ossidasi positivi. MANUALE DEI CODICI Ref. 71708 © Liofilchem ® S.r.l. - Microbiology Products

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Oxi/FermPluri – Test

Sistema per l’identificazione di batteriGram negativi, ossidasi positivi.

MANUALE DEI CODICIRef. 71708

© Liofilchem® S.r.l. - Microbiology Products

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Rev.0/20.12.2012

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Oxi/FermPluri – Test

MANUALE DEI CODICI

Indice Pag.

Archivio Biocodici 1

Appendice 1: Elenco delle abbreviazioni usate nell'Archivio Biocodici. 17

Appendice 2: Procedure raccomandate per i test di conferma. 18

Appendice 3: Disponibilità dei terreni e reagenti necessari perl'esecuzione dei test di conferma.

20

Note Importanti

Prima di utilizzare il sistema Oxi/FermPluri-Test, leggere le istruzioni per l'uso.

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

00000 Acinetobacter lwoffiiKingella denitrificansEmpedobacter brevisOligella urethralisSphingomonas paucimobilis

LLLL

Cat+-+++

Ypig--+-+

DNA

+

-

00001 Pasteurella multocidaMoraxella spp.Pseudomonas spp.Alcaligenes faecalis

45%42%

*L

Mot

--

+/(-)+

Plumpcocci

-+

00002 Acinetobacter lwoffiiPseudomonas alcaligenes

LMot

-+

00003 Pseudomonas spp.Pseudomonas alcaligenesAlcaligenes faecalis

*LL

Flagellapol/-polperi

00004 Acinetobacter lwoffii

00005 Moraxella spp.Pseudomonas alcaligenesRhizobium (Agrobacterium) radiobacterBordetella bronchisepticaOligella urethralis

44%34%19%

LL

Mot-+++-

DNA-+---

TOBSSRSS

00006 Acinetobacter lwoffiiStenotrophomonas maltophilia

82%16%

Mot-+

00007 Bordetella bronchisepticaMyroides odoratusMoraxella spp.Alcaligenes spp.Delftia acidovoransOchrobactrum anthropi

27%24%18%

LLL

Flagellaperi

--

peripolperi

Ypig-+---

-/(+)

00011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularis

83%13%

Ypig-+

00012 Stenotrophomonas maltophilia

00013 Brevundimonas diminutaFlavobacterium spp.Shewanella putrefaciens

56%34%10%

Mot+-+

DNA-v+

00015 Shewanella putrefaciens

1

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

00016 Stenotrophomonas maltophilia

00017 Shewanella putrefaciens

00042 Stenotrophomonas maltophilia

00046 Stenotrophomonas maltophilia

00103 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas fluorescens

39%25%9%

Cet-++

Gel--+

AKSRS

00107 Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.Myroides odoratus

45%26%13%

Mot-+-

McC-++

DNA--+

00113 Pseudomonas putidaFlavobacterium spp.Brevundimonas diminuta

42%38%19%

Mot+-+

McC+--

DNARRS

00115 Flavobacterium spp.

00117 Pseudomonas putidaFlavobacterium spp.

86%14%

Mot+-

00123 Chryseobacterium meningosepticum

00141 Flavobacterium spp.

00147 Sphingobacterium multivorum

00161 Chryseobacterium meningosepticum

00165 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter

00202 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

00203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas stutzeri

64%31%

Cet--

00207 Achromobacter spp.Ralstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

56%23%20%

Rur+--

Cet--+

PBSRS

00247 Achromobacter spp.Brevundimonas diminuta

89%16%

RUr+-

00301 Pseudomonas stutzeriBrevundimonas diminuta

84%16%

NO3+-

00302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusPseudomonas oryzihabitans L

Ypig-+

2

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

00303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putidaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

47%25%12%

Gel+--

AKSSR

TOBRSR

00305 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter

00306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusPseudomonas oryzihabitans L

Ypig-+

00307 Ralstonia pickettiiAchromobacter spp.

63%23%

RUr-+

00313 Pseudomonas putida

00317 Pseudomonas putida

00342 Pseudomonas oryzihabitans L

00346 Achromobacter spp.Pseudomonas oryzihabitans L

Ypig-+

00347 Achromobacter spp.Ralstonia pickettiiPseudomonas putida

52%41%7%

RUr+--

Cet--+

AKSRS

00353 Pseudomonas putida

00365 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter

00366 Achromobacter spp.

00401 Flavobacterium spp.

00403 Flavobacterium spp.

00407 Flavobacterium spp.

00411 Flavobacterium spp.

00413 Flavobacterium spp.

00417 Flavobacterium spp.

00421 Chryseobacterium meningosepticum

00441 Flavobacterium spp.

00501 Flavobacterium spp.

00503 Flavobacterium spp.

00541 Chryseobacterium meningosepticum L

00543 Chryseobacterium meningosepticumChryseobacteriumindologenes

54%46%

DNA+1

3

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

01001 Brevundimonas vesicularisPasteurella multocida

67%23%

Mot+-

01003 Moraxella spp.

01005 Brevundimonas vesicularis L

01007 Moraxella spp.Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.Comamonas testosteroni/terrigena

79%11%10%

L

Mot--+

Ypig-+-

01011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularis

60%40%

Ypig-+

ßhem--

01201 Brevundimonas vesicularis

01303 Achromobacter spp.

02001 Moraxella spp.Alcaligenes faecalisPseudomonas stutzeri

51%16%15%

Mot-++

Flagella

PeriPol

02003 Pseudomonas stutzeriAlcaligenes spp.

52%35%

FlagellaPolPeri

02005 Shewanella putrefaciensMoraxella spp.Alcaligenes faecalis

46%41%10%

Mot+-+

DNA+--

02007 Myroides odoratusAlcaligenes spp.Pseudomonas spp.

51%36%12%

Mot+-+

02011 Brevundimonas diminuta

02013 Brevundimonas diminutaShewanella putrefaciens

88%12%

DNA-+

02015 Shewanella putrefaciens

02017 Shewanella putrefaciens

02103 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans

88%9%

Cet-+

02107 Ralstonia pickettiiMyroides odoratus

83%14%

Mot+-

02141 Pseudomonas stutzeri

4

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

02147 Ralstonia pickettiiMyroides odoratus

85%14%

Mot+-

02203 Pseudomonas stutzeriAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

74%24%

Cet-+

02301 Pseudomonas stutzeri

02303 Pseudomonas stutzeriRalstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

46%40%14%

Cet--+

AKSRR

PBSRS

02307 Ralstonia pickettii

03001 Brevundimonas diminuta

04001 Flavobacterium spp.Pasteurella multocida

LYpig

+-

04002 Stenotrophomonas maltophilia

04003 Flavobacterium spp.

04005 Sphingobacterium multivorumRhizobium (Agrobacterium) radiobacter

54%44%

Mot-+

04006 Stenotrophomonas maltophiliaAchromobacter spp.

83%16%

Ypig+-

04007 Bordetella bronchisepticaSphingobacterium multivorum

69%26%

Mot+-

04042 Stenotrophomonas maltophilia

04046 Stenotrophomonas maltophilia

04102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

04106 Achromobacter spp.Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

53%47%

Mot+-

04107 Sphingobacterium multivorum

04143 Chryseobacterium meningosepticumAchromobacter spp.

79%21%

Mot-+

04147 Sphingobacterium multivorum

04202 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

04203 Achromobacter spp.

04302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

04303 Pseudomonas fluorescensAchromobacter spp.

79%21%

RUr+

04306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

04323 Achromobacter spp.

04365 Rhizobium (Agrobacterium) radiobacter

04401 Pasteurella multocidaFlavobacterium spp.

48%47%

Ypig-+

04501 Flavobacterium spp.

05001 Pasteurella multocidaVibrio alginolyticus

TCBS-+

05002 Achromobacter spp.

05005 Sphingobacterium multivorum

05007 Sphingobacterium multivorumAchromobacter spp.

88%12%

Mot-+

05161 Aeromonas hydrophila

05171 Aeromonas hydrophila

05401 Pasteurella multocida

06003 Pseudomonas stutzeriAlcaligenes spp.

53%44%

FlagellaPolPeri

10000 Acinetobacter lwoffii

10001 Pseudomonas spp.Alcaligenes faecalis

61%23%

FlagellaPolPeri

10002 Stenotrophomonas maltophiliaAcinetobacter lwoffii

85%15%

Mot+-

10003 Delftia acidovoransPseudomonas alcaligenesAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans

32%20%13%

TOBRS

FlagellaPolPolPeri

10006 Stenotrophomonas maltophilia

10007 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificansDelftia acidovoransBordetella bronchiseptica

34%26%17%

RUr--+

FlagellaPeriPolPeri

10012 Stenotrophomonas maltophilia

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

10013 Pseudomonas spp. *

10016 Stenotrophomonas maltophilia

10017 Shewanella putrefaciens

10041 Burkholderia cepaciaBrevundimonas diminuta

59%40%

AKRS

10042 Stenotrophomonas maltophilia

10043 Burkholderia cepaciaStenotrophomonas maltophilia

65%32%

Ypig-+

10046 Stenotrophomonas maltophilia

10047 Stenotrophomonas maltophiliaBurkholderia cepacia

84%15%

Ypig+-

10052 Stenotrophomonas maltophilia

10056 Stenotrophomonas maltophilia

10057 Stenotrophomonas maltophilia

10101 Burkholderia cepacia

10102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

10103 Burkholderia cepacia

10107 Burkholderia cepaciaPseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

37%32%22%

AKRSR

CARRSS

FlagellaPolPolPeri

10123 Burkholderia cepacia

10143 Burkholderia cepacia

10147 Burkholderia cepacia

10203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

10207 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

10302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

10303 Burkholderia cepaciaPseudomonas putidaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

30%28%25%

AKRSR

CARRSS

PBRSS

10306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

10307 Pseudomonas putidaRalstonia pickettiiAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

32%28%22%

Cet+-+

AKSRR

FlagellaPolPolPeri

10317 Pseudomonas putida

7

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

10327 Burkholderia cepacia

10343 Burkholderia cepaciaPseudomonas putida

69%31%

AKRS

10401 Vibrio parahaemolyticus

11101 Brevundimonas diminuta

11763 Vibrio cholerae L serol

12001 Alcaligenes faecalisComamonas testosteroni/terrigenaDelftia acidovorans

63%14%10%

AKvSR

FlagellaPeriPolPol

12003 Alcaligenes faecalis (odorans)Alcaligenes faecalisAchromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans

67%17%15%

Cet+--

TOBSSR

12007 Alcaligenes spp.

12013 Brevundimonas diminutaShewanella putrefaciens

81%17%

DNA-+

12017 Shewanella putrefaciens

12101 Pseudomonas stutzeri

12103 Pseudomonas mendocina

12117 Pseudomonas mendocina

12203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

12207 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansRalstonia pickettii

80%20%

Cet+-

12301 Pseudomonas stutzeri

12303 Pseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

55%37%

AKSR

12307 Ralstonia pickettiiPseudomonas mendocinaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

70%20%10%

Cet-++

AKRSR

TESSR

12347 Ralstonia pickettii

12357 Pseudomonas putida

14002 Stenotrophomonas maltophilia

14003 Stenotrophomonas maltophilia

14006 Stenotrophomonas maltophilia

8

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

14007 Bordetella bronchisepticaDelftia acidovorans L

FlagellaPeriPol

14012 Stenotrophomonas maltophilia

14042 Stenotrophomonas maltophilia

14046 Stenotrophomonas maltophilia

14047 Stenotrophomonas maltophilia

14102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

14306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

14401 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus

87%13%

Gel-+

15021 Vibrio alginolyticus

15421 Vibrio alginolyticus

20103 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescensAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

68%17%11%

Gel-+-

AKSSR

TOBSSR

20107 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescensPseudomonas aeruginosa

70%12%10%

42C--+

TOBSSR

20143 Pseudomonas putida

20203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidansPseudomonas putida

82%18%

AKRS

20303 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosaPseudomonas fluorescens

53%36%11%

42C+--

TOBSSR

20307 Pseudomonas aeruginosaPseudomonas putidaPseudomonas fluorescens

20313 Pseudomonas putida

20323 Pseudomonas aeruginosa

20327 Pseudomonas aeruginosa

22103 Pseudomonas aeruginosaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

62%33%

AKSR

22303 Pseudomonas aeruginosa

22307 Pseudomonas aeruginosa

9

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

22323 Pseudomonas aeruginosa

22327 Pseudomonas aeruginosa

24107 Pseudomonas fluorescens

24303 Pseudomonas fluorescens

24307 Pseudomonas fluorescens

30003 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificans L

30007 Pseudomonas putidaBordetella bronchisepticaAchromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

LL

AKSSR

FlagellaPolPeriPeri

30103 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putidaBurkholderia cepacia

47%24%20%

AKSSR

CARSRR

30107 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida

57%29%

42C+-

30141 Burkholderia cepacia L

30203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans L

30303 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosaPseudomonas fluorescens

65%21%8%

42C-+-

TOBSSR

30307 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosa

52%40%

42C-+

30313 Pseudomonas putida

30317 Pseudomonas putidaPseudomonas aeruginosa

89%9%

42C-+

30323 Pseudomonas aeruginosa

30327 Pseudomonas aeruginosa

32007 Achromobacter xylosoxidans subsp. denitrificansAlcaligenes spp.

67%28%

32103 Pseudomonas mendocina

32107 Pseudomonas mendocina

32113 Pseudomonas mendocina

32137 Pseudomonas aeruginosa

32143 Burkholderia pseudomallei serol

32147 Burkholderia pseudomallei serol

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

32163 Burkholderia pseudomallei serol

32203 Achromobacter xylosoxidans subsp. xylosoxidans

32217 Pseudomonas aeruginosa

32303 Pseudomonas aeruginosa

32307 Pseudomonas aeruginosa

32313 Pseudomonas aeruginosa

32317 Pseudomonas aeruginosa

32323 Pseudomonas aeruginosa

32327 Pseudomonas aeruginosa

32333 Pseudomonas aeruginosa

32337 Pseudomonas aeruginosa

33307 Pseudomonas aeruginosa

34307 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens

66%34%

42C+-

34401 Plesiomonas shigelloides

34501 Plesiomonas shigelloides

34541 Plesiomonas shigelloides

36103 Pseudomonas mendocina

40001 Brevundimonas vesicularisSphingomonas paucimobilis

50%35%

40003 Sphingomonas paucimobilisFlavobacterium spp.

59%36%

Mot+-

40007 Achromobacter spp.

40011 Brevundimonas diminutaBrevundimonas vesicularisFlavobacterium spp.

56%37%7%

Mot++-

Ypig-++

40101 Flavobacterium spp.

40103 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

72%16%

Gel+-

40141 Chryseobacterium meningosepticum

40201 Brevundimonas vesicularis

40302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticusAcinetobacter haemolyticus L

ßhem-+

11

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

40303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

89%11%

Gel+-

40306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

40313 Pseudomonas putida

40347 Achromobacter spp.Pseudomonas putida

75%25%

RUr+-

40401 Flavobacterium spp.

40403 Chryseobacterium indologenes

40421 Chryseobacterium meningosepticumChryseobacterium indologenes

86%10%

DNA+-

40423 Flavobacterium spp.

40501 Flavobacterium spp.

40521 Chryseobacterium meningosepticumVibrio parahaemolyticusChryseobacterium indologenes

71%15%14%

Mot-+-

DNA+

-

40567 Chryseobacterium indologenes

41347 Achromobacter spp.

41541 Chryseobacterium indologenes

44046 Achromobacter spp.

44102 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

44107 Achromobacter spp.

44302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

44303 Pseudomonas fluorescens

44306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

44326 Achromobacter spp.

44347 Achromobacter spp.

44523 Chryseobacterium meningosepticum

44561 Flavobacterium spp.

44571 Vibrio parahaemolyticus

45141 Aeromonas hydrophila

45161 Aeromonas hydrophila

45163 Aeromonas hydrophilaAeromonas caviae

ßhem+-

45373 Aeromonas hydrophila

12

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© Liofilchem® – Oxi/FermPluri-Test – Codebook – Rev.0/20.12.2012

BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

45173 Aeromonas hydrophila

45563 Aeromonas hydrophila

45571 Aeromonas hydrophila

45573 Aeromonas hydrophila

45575 Aeromonas hydrophila

50101 Burkholderia cepacia

50103 Burkholderia cepacia

50107 Burkholderia cepaciaPseudomonas mendocinaPseudomonas putida

68%14%10%

AKRSS

CARRSR

50143 Burkholderia cepacia

50302 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

50303 Pseudomonas fluorescensBurkholderia cepaciaPseudomonas putida

50%25%24%

AKSRS

TOBRRS

50306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

50307 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

55%39%

Gel+-

50323 Burkholderia cepacia

50343 Burkholderia cepaciaPseudomonas putida

68%32%

AKRS

50347 Pseudomonas putidaBurkholderia cepacia

78%22%

AKSR

50501 Vibrio parahaemolyticus

50541 Vibrio parahaemolyticus

50543 Vibrio vulnificusVibrio cholerae

LL

Sali+- serol

50560 Vibrio parahaemolyticus

50561 Vibrio parahaemolyticus

51563 Vibrio choleraeVibrio mimicus

LL

VPvar-

PBvarS

serol

52571 Vibrio parahaemolyticus

13

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

54103 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens

68%14%

42C+-

54107 Pseudomonas mendocinaPseudomonas fluorescens

90%10%

42C+-

54160 Vibrio alginolyticus

54161 Vibrio alginolyticus

54306 Acinetobacter baumannii/calcoaceticus

54401 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus

82%18%

Gel-+

54441 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus

79%21%

Gel-+

54501 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus

72%28%

Gel-+

54523 Vibrio alginolyticus

54541 Plesiomonas shigelloidesVibrio parahaemolyticus

68%32%

Gel-+

54543 Vibrio vulnificus L

54560 Vibrio parahaemolyticus L

54561 Vibrio parahaemolyticusVibrio alginolyticus

87%13%

54563 Vibrio alginolyticus

55131 Vibrio alginolyticus

55161 Vibrio alginolyticusAeromonas hydrophila

74%26%

NOSR

55163 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticus

52%48%

NORS

55167 Aeromonas hydrophila

55173 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticus

86%14%

NORS

55523 Vibrio alginolyticus

55543 Vibrio cholerae L serol

14

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

55561 Vibrio alginolyticusAeromonas hydrophila

56%44%

NOSR

55563 Aeromonas hydrophilaVibrio alginolyticusVibrio choleraeVibrio mimicusAeromonas veronii bv. veronii

71%29%

LLL

NORS

serol

ONPG+-+

+

VP PB + + +/- - R/S + S

55573 Aeromonas hydrophila

55761 Vibrio parahaemolyticus L

56571 Vibrio parahaemolyticus

60103 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

52%48%

Gel+-

60303 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

66%34%

Gel+-

60307 Pseudomonas fluorescensPseudomonas putida

57%43%

Gel+-

60313 Pseudomonas putida

60517 Pseudomonas putida

62303 Pseudomonas putida

62307 Pseudomonas putida

64101 Chromobacterium violaceum LCol

violet

65161 Aeromonas caviae L

65163 Aeromonas hydrophila

65167 Aeromonas hydrophila L

65561 Aeromonas hydrophilaAeromonas veronii bv. veronii bv. sobria L

Sali+-

65563 Aeromonas hydrophila

65571 Aeromonas hydrophila

65573 Aeromonas hydrophila

65575 Aeromonas hydrophila L

70143 Burkholderia pseudomalleiBurkholderia cepacia

88%8%

TESR

serol

70167 Burkholderia pseudomallei serol

15

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BIOCODICE ORGANISMO % TEST DI CONFERMA

70303 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescens

65%33%

Gel-+

70307 Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescens

74%25%

Gel-+

70313 Pseudomonas putida

70317 Pseudomonas putida

70323 Burkholderia cepacia

70347 Pseudomonas putida

72003 Pseudomonas putida

72103 Pseudomonas mendocina

72303 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida

78%22%

42C+-

72307 Pseudomonas mendocinaPseudomonas putida

78%22%

42C+-

74541 Plesiomonas shigelloides

75163 Aeromonas hydrophila

75171 Aeromonas hydrophila

75366 Burkholderia cepacia L

75563 Aeromonas hydrophila

75766 Burkholderia cepacia L

16

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Appendice 1. Elenco delle abbreviazioni usate nell'Archivio Biocodici.

Abbreviazione Spiegazione

% Probabilità in %

42C Crescita a 42°C

AK Amicacina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

CAR Carbeniccilina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

Cat Test catalasi con H2O2, Catalase/Oxy Test

Cet Cetrimide, crescita su Pseudomonas (Cetrimide) Agar

CF Tests Test di conferma

Col Colorazione delle colonie (pigmento non diffusibile) su Tryptic Soy Agar dopo 2-3giorni di incubazione a temperatura ottimale per la crescita

DNA Test DNasi, DNase Test Agar

Flagella Tipo di distribuzione dei flagelli: pol (polare) o peri (peritrica)

Gel Gelatinasi, Nutrient Gelatin

L Numero di un profilo determinato solo con un numero limitato di ceppi

McC Crescita su MacConkey II Agar

Mot Motilità

NO3 Riduzione di nitrato a nitrito, Nitrate Test

NO Novobiocina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

ONPG Reazione ONPG, 2-nitrofenil-ß-D-galattopiranoside con ONPG supplement81032

PB Polimixina B, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

R Resistente

RUr Ureasi rapida, 18-24 ore di incubazione

S Sensibile

Sali Formazione di acido da salicina, Salicin Test

Serol Confermare l'identificazione con test sierologici

ßhem Beta emolisi su Columbia Agar (Sheep Blood 5%)

TCBS Crescita su TCBS Agar

TE Tetraciclina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

TOB Tobramicina, test mediante disco-diffusione su Mueller Hinton II Agar

Var Possibile risultato variabile (+ o -, R o S)

VP Reazione di Voges-Proskauer, VP Test Kit

Ypig Pigmento giallo su Tryptic Soy Agar

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Appendice 2. Procedure raccomandate per i test di conferma.

1. Crescita a 42°C (42C)Preparare una sospensione leggera in un terreno liquido adatto (es., Tryptic Soy Broth) con non più di 1colonia dell’isolato e incubare a 42°C (preferibilmente a bagnomaria) per 18–24 h. La crescita èindicata da un aumento della torbidità del terreno.2. Test antibiotici mediante disco-diffusioneOsservare le procedure convenzionali di disco-diffusione e i limiti dimensionali delle zonegeneralmente in uso (usare piastre Mueller Hinton II Agar). A questo scopo, considerare come sensibili(S) sia le zone “intermedie“ che quelle “sensibili“.Vengono utilizzati i seguenti dischi:Abbreviazione Antibiotico ConcentrazioneAK Amicacina 30 µgCAR Carbenicillina 100 µgNO Novobiocina 30 µgPB Polimixina B 300 UITE Tetraciclina 30 µgTOB Tobramicina 10 µg

3. Test Catalasi (Cat)Applicare su un vetrino una goccia di perossido di idrogeno (H2O2) al 3% preparato di fresco. Conun’ansa, prelevare da una piastra di 24–48 h una colonia dell’isolato e mescolarla con la goccia diperossido di idrogeno. Lo sviluppo di bolle e schiuma indica una reazione positiva. In alternativa, èpossibile applicare una goccia di perossido di idrogeno al 3% alle colonie in crescita su Tryptic SoyAgar. Non applicare il perossido di idrogeno su agar sangue in quanto potrebbe verificarsi una reazionefalsa positiva.In alternativa utilizzare Catalase Oxy/Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni. 4. Cetrimide (Cet)Strisciare l’isolato su Pseudomonas (Cetrimide) Agar. Incubare per 18–24 h alla temperatura ottimale perl’isolato. La crescita su questo terreno indica una reazione positiva.5. Colorazione delle colonie (Col)Strisciare l’isolato su Trypticase Soy Agar e incubare per 2–3 giorni alla temperatura ottimale. Esaminarela colorazione delle colonie (le colonie normali, non pigmentate si presentano di colore bianco, grigioo giallo chiaro. A seconda delle specie, le colonie pigmentate si presentano di colore giallo-brunastro ovioletto.6. Attività DNasi (DNA)Strisciare l’isolato su DNase Test Agar. Incubare per 2 giorni a 36±1°C. Irrorare la piastra con 1 N HCl easpettare circa 1 min. Attorno alle colonie DNasi positive si sviluppa una zona trasparente mentrequando il terreno è uniformemente torbido significa che la reazione è DNasi negativa.7. Colorazione di flagelliSvariati metodi sono descritti nella letteratura pertinente e tutti richiedono una certa esperienza.8. Gelatinasi (Gel)Inoculare in profondità con un inoculo di rilevante entità una provetta di Nutrient Gelatin ed incubare atemperatura ambiente. La liquefazione del terreno sulla superficie entro 18–48 h indica che il test èpositivo. Reazione negativa: nessuna liquefazione.9. Crescita su agar MacConkey II (McC)Preparare una sospensione leggera di isolato in soluzione fisiologica o in Tryptic Soy Broth e inoculareimmediatamente una piastra di MacConkey II Agar con un’ansa di questa sospensione. Incubare36±1°C per 20–24 h. Se il ceppo evidenzia una crescita scarsa su una piastra di sangue incubata a36±1°C, incubare la piastra di MacConkey II Agar ad una temperatura inferiore, ma per non oltre 48 h.

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10. Motilità (Mot)Dispensare su una piastra una goccia di brodocoltura dell’isolato che è stato incubato per 6–8 h a 25°C.Applicare un vetrino coprioggetti sulla piastra e osservare con un microscopio a contrasto di fase(immersione in olio) alla ricerca di batteri mobili. Nei casi in cui è possibile scurire il campomicroscopico, si può usare anche un regolare obiettivo ad immersione in olio. La motilità effettiva èevidenziata da un rapido cambiamento di posizione delle cellule batteriche individuali in relazione allealtre cellule.11. Riduzione del nitrato (NO3)Inoculare una provetta di Nitrate Broth con un’ansata di microrganismi prelevati da una coltura pura.Incubare a 32–36°C per 18–48 h, con il tappo leggermente allentato. Valutare il test aggiungendo 0,5mL di ciascuno dei due reagenti nitrati per individuare la formazione di nitrito dal nitrato (colorazionerossa). Se la reazione è negativa (incolore), aggiungere della polvere di zinco per rilevare il nitrato nonutilizzato. Se il colore vira al rosso dopo l'aggiunta di polvere di zinco, significa che il nitrato non èstato utilizzato (la reazione è negativa); se invece il contenuto della provetta resta incolore, significa cheil nitrato è stato ridotto a nitrito (denitrificazione ovvero reazione positiva).In alternativa utilizzare Nitrate Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni.12. ONPGPer testare l’idrolisi di ONGP (2-nitrofenil-beta-D-galattopiranoside) è possibile utilizzare un ONPGDisc. Lo sviluppo di una colorazione gialla indica una reazione positiva.13. Ureasi rapida (RUr)Una forte reazione positiva nel settore Urea dell'Oxi/FermPluri-Test dopo 18–24 h di incubazione,evidenziata da una colorazione rosa intensa è indice di positività.14. Formazione di acido da salicina (Sali)Alcuni batteri producono acidi dalla salicina Per questo test, usare CTA Medium with Salicin e seguirele istruzioni fornite per questo terreno.In alternativa utilizzare Salicin Test secondo la procedura riportata nel foglio istruzioni.15. Sierologia (serol)L’identificazione dei risultati di Vibrio cholerae e Pseudomonas pseudomallei deve essere confermatamediante test sierologici. 16. Beta-emolisi (ßhem)Strisciare l’isolato su una piastra di Columbia Agar (Sheep Blood 5%). Incubare alla temperaturaottimale per l’isolato, per non oltre 48 h. La comparsa di zone trasparenti attorno alle colonie è indicedi beta-emolisi.17. Crescita su TCBS Agar (TCBS)Strisciare l’isolato su una piastra di TCBS Agar. La temperatura ottimale per l'incubazione è 30–36°C.TCBS Agar è un terreno selettivo e differenziale per Vibrio spp.18. Reazione di Voges-Proskauer (VP)Alcune specie batteriche producono acetoina (acetilmetilcarbinolo) dal glucosio. È possibile eseguire iltest utilizzando il VP Test Kit e seguendo le istruzioni riportate nel foglio istruzioni.

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Appendice 3. Disponibilità dei terreni e reagenti necessari per l’esecuzione dei test di conferma.

Numero della procedura come per Appendice 2 Nome del terreno o del reagente Ref.

1, 9 Tryptic Soy Broth 24444

2 Mueller Hinton II Agar 10031

2 AK 30 9004

2 CAR 100 9009

2 NO 30 9063

2 PB 300 9120

2 TE 30 9043

2 TOB 10 9044

3 Catalase Oxy/Test 88023

3, 5 Tryptic Soy Agar 10037

4 Pseudomonas (Cetrimide) Agar 10033

6 DNase Test Agar 10013

8 Nutrient Gelatin 24153

9 MacConkey II Agar 10603

11 Nitrate Broth 610322

11 Nitrate Test 88009

12 ONPG Disc 88105

14 Salicin Test 88217

16 Columbia Agar (Sheep Blood 5%) 10025

17 TCBS Agar 11195

18 VP Test Kit 88035

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