MALATTIE GENETICHE causate da un’ alterazione del DNAzollo/4.Lezione.GeneticaMedica.2009.pdf ·...
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MALATTIE GENETICHEcausate
da un’ alterazione del DNA
CLASSIFICAZIONE DELLEMALATTIE GENETICHE
- Malattie Monogeniche (Mendeliane)A.D., A.R., X-L.
- Malattie Cromosomiche (Anomalie dinumero e di struttura)
- Malattie Multifattoriali (o Poligeniche)
- Malattie da Mutazioni delle Cellule Somatiche
- Malattie da Mutazioni nel Genoma Mitocondriale
MALATTIE MONOGENICHE (MENDELIANE)
- Dovute alla mutazione in un singolo gene
- Rare (se prese individualmente)
- Alto rischio di ricorrenza familiare
- Pattern di ereditarietà (modalità di trasmissione)facilmente riconoscibile
- ~ 7000 entità riconosciute
- ~ 2000 con difetto biochimico conosciuto
- Diagnosi molecolare e prenatale disponibileper molte (30-40%)
ESEMPI DI MALATTIE MONOGENICHE
- Talassemia- Emofilia A- Fibrosi Cistica- Distrofia Muscolare Duchenne- Deficit di G6PD (Favismo)- Fenilchetonuria- Neurofibromatosi
- Anemia a Cellule Falciformi
Struttura del gene Fenil-alanina-idrossilasi, mutazioni identificate origine del malfunzionamentodell’enzima.
Mutazioni “leaky”Mutazioni “null”
MALATTIE CROMOSOMICHE- Dovute alla deficienza o all’eccesso di interi cromosomi
o frammenti di cromosoma (non un singolo gene ma moltigeni)
- Rare (trisomia 21 frequente) se prese individualmentema frequenti come gruppo
- Rischio di ricorrenza familiare molto variabile, secondoil tipo (da 1:2 a 1:1000)
- Sintomi frequenti : ritardo mentale, bassa statura, segnidismorfici
- Frequente causa di aborto
- Frequenza: ~ 7/1000 neonati
ESEMPI DI MALATTIE CROMOSOMICHE
- Sindrome di Down (Trisomia 21)(Frequenza: ~ 1:800)
- Trisomia 18 (Frequenza ~ 1:8000)
- Trisomia 13(Frequenza ~ 1:25000)
- Sindrome di Klinefelter XXY (Frequenza: ~1:1000 maschi)
- Sindrome di Turner XO (Frequenza: ~ 1:5000 femmine)
MALATTIE MULTIFATTORIALI
- Dovute al coinvolgimento di più geni (Poligeniche)
- Molto frequenti- Comprendono vari tipi di malformazioni congenite e
malattie frequenti dell’adulto
- Modalità di trasmissione difficilmente riconoscibile
- Interazione con l’ambiente
- Basi molecolari e meccanismo patogenetico sconosciutinella maggioranza dei casi
- Predisposizione a sviluppare determinate patologie
ESEMPI DI MALATTIE MULTIFATTORIALI
- Diabete Mellito- Ipertensione- Labbro Leporino- Malattia Coronarica
MALATTIE GENETICHE DA DIFETTODELLE CELLULE SOMATICHE
- Colpiscono di solito un unico tipo cellulare
- Sono dovute in molti casi a una mutazione ereditata attraverso le cellule germinali (predisposizione) + una mutazione nelle cellule somatiche (“second hit”)
ESEMPI : - Vari tipi di cancro
MALATTIE MITOCONDRIALI
- Sono dovute a mutazioni del genomaMitocondriale
-Sono trasmesse esclusivamente per via materna
ESEMPI : - Atrofia Ottica di Leber- Epilessia Mioclonica
Modelli di eredità a singolo gene.
-Possono essere recessivi, dominanti e legati all’ X.
-Sono detti “mendeliani”: occorrono in proporzioni fisse negli incroci (vedi Mendel).
-I fenotipi delle malattie genetiche a singolo gene sono elencati e descritti in:
Gregor
Johann Mendel (1822-1884)prete
nel
monastero
Agostiniano
di
Brno, Cecoslovacchia, centro
di
insegnamento
teologia, filosofia
e scienze
naturali.
Caratteri dominanti e recessivi
La F2 quindi
era composta
da
caratterisia
dominanti
che
recessivi, però
legati
dal
rapporto
3:1
“un componente
di
ogni
coppia
era ereditato
dal
padre e l'altro
dalla
madre. Questa, nota anche
come prima legge
di
Mendel, è
la legge
della
segregazione”
Prima legge di Mendel
o legge della segregazione degli alleli
Durante la formazione dei gameti gli alleli segregano (si separano) in due gruppi di gameti di uguale numero.
Mendel formulò
la seconda
legge, o dell'assortimento
indipendente, che
afferma: "...quando
si
formano
i gameti, gli
alleli
di
un gene si
separano
indipendentemente
daglialleli
di
un'altro
gene".
Seconda legge di Mendel
o legge dell’assortimento indipendente
Membri di differenti coppie di alleli vengono assortiti indipendentemente uno dall’altro
ALLELE: una
di
2 o più
forme
alternative di
un singolo
locus genico.
Per un certo
locus possono
esistere
piu
forme
alleliche
(alleli
multipli)L’insieme
degli
alleli
noti
è
definito
SERIE ALLELICA
Prodotto
genicoaplo-sufficiente
Prodotto
genicoaplo-insufficiente
Dominanza
e recessività
a livello
di
prodotto
genico
Qual
è
la spiegazione
di
dominanza
e recessività
a livello
di
prodotto
genico??
aplo-sufficiente• P/P o P/p sono sufficienti a produrre il fenotipo selvatico mentre i p/p
non lo sono
aplo-insufficiente• una singola dose P/p del fenotipo selvatico non è sufficiente per
raggiungere i normali livelli funzionaliLA PERDITA DI META’DELLA ATTIVITA’ NORMALE DELLA
PROTEINA CAUSA MALATTIA
• Definizione: la recessività di un allele mutante è il risultato dell’aplosufficienza dell’allele selvatico di quel determinato gene; la dominanza di un allele mutante è il risultato dell’aploinsufficenza dell’allele selvatico.
• In Aa il prodotto dell’allele normale è sufficiente ad espletare le funzioni di quel particolare gene? se si, l’allele mutante è detto recessivo cosi il disordine associato, se no, l’allele e la malattia sono detti Dominanti
DOMINANZA INCOMPLETA
BELLA DI NOTTE
RossoRosabianco
due dosi pigmentouna dose pigmentonessuna dose
Spiegazione molecolare:
I disordini a singolo gene sono caratterizzati dai loro modelli di trasmissione nelle famiglie:
STUDIO degli ALBERI GENIALOGICI.
Posizione cromosomica di un locus
Fenotipo
Classificazione dei disordini genetici con una eredità
mendeliana classica
Fattori che inflenzano gli alberi genealogici
Eterogenità genetica:mutazioni in loci genetici diversi possono avere lo stesso effettofenotipico. Per questo fenomeno una stessa patologia geneticapuò avere origine da anomalie multiple e diverse del DNA.
A) eterogenità allelica ->mut differenti in uno stesso locus.Ad esempio: RET syndrome, no gangli del colon (Hyrschsprung) e/o cancro alla tiroide e/o neoplasie endocrine multiple MEN
B)eterogenità di locus->mut in loci diversi
EREDITA’ autosomica recessiva
Rischio di due figli da due eterozigoti di avere un allele recessivo è 1/2 e quindi da due genitore è 1/2X1/2 =1/4 in genere un altro affetto e solo tra i fratelli, tranne che non ci siano stato molti matrimoni tra consanguinei nella famiglia. Vediamo i tre tip di incrocio….prossima diapositiva
Eterozigoti portatori sani
R allele dominante, r allele recessivoFibrosi Cistica, Malattia rara in Asia, ma nel cauca-caso frequenza alta; 1:2000 hanno entrambi gli alleliMutati.Alta Frequenza tra i portatori sani (Aa) 1/22
Esempi di incroci tra consangunei
La consanguineità è stata comune in Giappone, India orientale e Medio OrienteXeroderma pigmentoso, difetto enzima riparo del DNA, 20 % casi sono dovuti ad matrimoni tra cugini di primo gradoIncrocio tra Cugini di primo grado, rischio=3-5% progenie anormale, incrocio tra famiglie non imparentate, rischio =2%
Esempio molecolare
a B c D
a b c d
a B c D
a b c d
N volte……incroci, a e c in omozigosi e letali
Matrimonio tra cugini per calcolare il coeffficiente di imbreeding F del probando
la proporzione di loci per i quali un soggetto è omozigote o identico alla discendenza
F=1/16 oppure 0,0625
Coefficente di imbreeding FÈ la probabilità che un omozigote abbia ricevuto entrambi gli alleli di un locus dalla stessa fonte ancestrale.
Coefficiente di imbreeding (F)È la probabilità che un omozigote abbia ricevuto entrambi gli alleli di un locusdalla stessa fonte ancestrale, oppure la proporzione di loci per i quali un soggettoè omizigote o identico alla discendenza, negli isolati genetici i valori cambiano…
FREQUENZA FENOTIPICA
Proporzione relativadi un dato fenotipo in una popolazione
popolazione
977 fenotipo A
5 fenotipo a
FREQUENZA GENOTIPICA
Proporzione relativadi un dato genotipo in una popolazione
popolazione
913 genotipo AA
64 genotipo Aa
5 genotipo aa
Le frequenze alleliche
si possono calcolare direttamenta
da quelle genotipiche
ƒ(A) = ƒ(AA) + 1/2ƒ(Aa) �
ƒ(A) =2 (AA) + 1 (Aa) 2 (individui)
2 (AA)2 (individui)
(Aa)2 (individui) ƒ(A) = +
ƒ(A)= p ƒ(a)= q
p+
q = 1 q = 1-p
In genere le frequenze alleliche sono indicate con le lettere
“p”
e “q”
La genetica
è
il
risultato
di
probabilità
discrete:un individuo
ha
una
certà
probabilità
di
ereditare
un allele invece
di
un altrooppure
una
certa
probabilità
di
sviluppare
un fenotipo
o un altro.
I genetisti
si
basano
su
una
formula matematicache
spesso
viene
usata
per descrivere
tali
processi:
il teorema binomiale
Teorema Binomialep= probabilità successoq= probabilità insuccesso
p+q=1q=1-p tutto questo per un solo esperimento---------------------------------------------------------------In due esperimentipxp=p2 per due successiqxq=q2 per due insuccessi2xpxq= Di un successo e di un insuccessoIn tre esperimentipxpxp=p3 per tre successiqxqxq=q3 per tre insuccessi3xpq2 o 3xp2q due insuccessi ed un successo o Viceversa
(p+q)n esperimenti
Assumendo una ereditarietà recessiva, quale proporzione di famiglie con tre bambini avrà 0,1,2,3 bambini affetti?p= bambino normale 3/4q= bambino affetto 1/4n=3 (p+q)3
p 3 + q 3 +3p2q+3pq2
q= ………..p= ………..svolgete……a casa……
27 saranno a rischio , delle 37 rimanenti i……..
Caratteristiche dell’ eredità Autosomica Recessiva
1. Un fenotipo autosomico recessivo si manifesta in più di un membro di una famiglia, tipicamente si osserva solo nella fratria del probando, non nei genitori, discendenti o altri consanguinei.
2. Per la maggior parte delle malattie autosomiche recessive, maschi e femmine hanno la stessa probabilità di essere affetti;
3. I genitori di un bambino affetto sono portatori asintomatici degli alleli mutati;
4. I parenti della persona affetta possono essere, in alcuni casi, consangunei. Ciò è particolarmente propabile se il gene responsabile per la condizione è raro nella popolazione;
5. La propabilità di ricorrenza della malattia per ogni fratello del probando è di ¼.
Autosomica dominanteA) Piu di metà delle malattie mendeliane sono autosomiche dominantiB) In specifiche aree geografiche l’incidenza è alta =1:500 ipercolesterolemiaJP, EuropaC) Hungtinton Corea 1:2500 nord europaD) neurofibromatosi, e rene policistico= alta incidenza
Autosomica dominante sordità senso neuronale progressiva-DFNA1
Ogni bambino ha il 50% di probabilità di ricevere l’allele anormale dal genitore affettoed il 50% di ricevere quello sano (1:1) esempio : Aa X aa
Nuove mutazioni nei disordini da autosomiche dominanti
• Nuovi mutazioni sorgono e vengono mantenuti o rimossi dalla selezione
• La sopravvivenza di una mutazione dipende dalla Fitness della persona che lo porta rispetto ad altri individui che hanno altri alleli in quel locus
• Fitness= n. individui discendenti che raggiunge l’età riproduttiva rispetto ad un gruppo controllo
• Esiste un rapporto tra Fitness ed Autosomica Dominante, e corrisponde a pazienti con quella patologia che hanno nuovi geni mutati e mantenuti
Variabilità nella manifestazione fenotipica
• Penetranza è la probabilità che un gene abbia una qualsiasi espressione fenotipica completa.
• Espressività è la severità di espressione del fenotipo
• Pleiotropia: un gene ha un difetto primario ma puo’ guidare l‘effetto su altri geni ed avere conseguenze molteplici con una malattia piu’ complessa.
Intensità
di
un pigmento, esempio
penetranza
ed espressività
Espressività variabile, 10 diverse gradazioni di pezzatura
Neurofibromatosi tipo 1
Crescita tumori benigni neurofibromi, pigmentazioni a macchia di caffè latte tumorinell’occhio benigni, ritardo mentale, tumori sistema nervoso centrale. I segnisi sviluppano nell’infanzia, VARIABILITA’ della malattia, rischio 50% come AutosomicaDominante, ma puo’ essere confusa come mutazione DENOVO, test molecolari presenti,Ridotta penetranza
Malformazione “chele d’aragosta”Penetranza ridotta 70%…Tipo di ecterodattilia…Compare alla sesta/settimasettimana di sviluppo
Incrocio due eterozigoti
L’ acondroplasia
un tipo di disordine genetico autosomico dominante, letale allo stato omozigote. Una forma di nanismo che colpisce solo gli arti, braccia e gambe che crescono notevolmente meno rispetto al resto del corpo.La malattia dovuta ad un cambiamento del gene FGFR3 situato al livello del cromosoma 4, mappatura (4p16.3). L'allele responsabile letale allo stato dominante. Nella maggioranza dei casi le persone che diventano affetta da tale malattia nasce in famiglie dove non si riscontrano precedenti casi di anomalie simili, mentre le nuove mutazioni del gene sono collegate con l'aumento dell'eta’ paterna
ipercolesterolemia
Degenerazione della pelle di colore giallastro, dovuto ad accumulo di lipidi.Gli xantomi sono sempre l'espressione di un alterato metabolismo dei lipidi(iperlipoproteinemie) e sono caratterizzati da un notevole aumento di incidenzadi arteriosclerosi e delle malattie cardiovascolari ad esse associate.
Pubertà precoce “testocossicosi”
Fenotipi limitati al sesso nelle malattieautosomiche dominanti
Pazienti a 4 anni di vita con sviluppo maturodegli organi sessuali