LA VALIDAZIONE DEI METODI INTERNI PER LA RICERCA ......ISO 22118:2011 ISO 5725-2 ISO 5725-3...
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LA VALIDAZIONE DEI METODI INTERNI PER LA RICERCA DI ALLERGENI: approcci per metodiche ELISA e metodiche molecolari
Barbara BERTASI Reparto Controllo Alimenti IZSLER Brescia
I° WORKSHOP ANNUALE CRENARIA 23 Ottobre 2020
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ESPRESSIONE DEL RISULTATO
IDENTIFICAZIONE ALLERGENI
QUALITATIVA QUANTITATIVA
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SISTEMI ELISA
VALIDAZIONE QUALITATIVA
VALIDAZIONE QUANTITATIVA
Come trattiamo un sistema che fornisce un risultato qualitativo sulla base di una misura
quantitativa?
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PARAMETRI DI VALIDAZIONE METODI CHIMICI
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LINEE GUIDA PER LA VALIDAZIONE DEI SISTEMI ELISA
Gruppo di Lavoro Settori Chimici II.ZZ.SS. Linea Guida per la Validazione Intra-laboratorio di Metodi di Prova di Screening in accordo con la Decisione 2002/657/CE – Rev. 1 – 14/02/2008
I metodi di screening, oggetto di validazione secondo questa linea guida, sono utilizzabili solo per definire l’assenza o la sospetta presenza dell’analita/i sotto indagine.
……ma l’approccio utilizzato è quantitativo!
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I parametri che devono essere valutati:
PARAMETRI DI VALIDAZIONE
Specificità
Capacità di rilevazione (CC)
Robustezza Applicabilità
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10 campioni a seduta, 5 bianchi e 5 fortificati. 4 sedute
• test di normalità sui dati • Determinare quindi il segnale (cut-off) relativo al limite di decisione [SCC]
costante numerica (distribuzione t di student a una coda) fissata in funzione dell’errore alfa che si intende accettare (k = 2.33, per errore atteso 1,5% ed n =20
media del segnale dei bianchi (almeno 20)
scarto tipo dei segnali ottenuti dai bianchi (almeno 20)
(falsi positivi) 10%.
errore b (percentuale di falsi negativi) al 5%.
SPECIFICITÀ ED ERRORE
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ROBUSTEZZA
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• Anche le prove di robustezza spesso sono già eseguite dai produttori….
Approccio Youden secondo Direttiva 96/23/CE
Identificazione di fattori critici nel metodo Calcolo di:
Recupero medio (n=5)
Deviazione standard (s) Deviazione standard relativa (RSD%)
Effetto del parametro Differenza fra la media dei risultati ottenuti con la modifica e media dei risultati ottenuti nelle condizioni
invariate
Per stabilire se la differenza è significativamente diversa da zero viene applicato il t test
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Quindi…..se abbiamo già….. un LOD dichiarato Prove in matrice Prove di robustezza…..
COSA SI PUO’ VALUTARE IN FASE DI VALIDAZIONE?
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• Approccio «qualitativo» per il LOD (% di repliche positive)
• Verifica del LOD pubblicato
• Valutazione del recupero del materiale di riferimento
• Sensibilità e specificità
• Accordanza e concordanza
PARAMETRI «QUALITATIVI» DA CALCOLARE
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ACCURATEZZA Verifica veri positivi/veri negativi Classificazione corretta dei materiali di riferimento
QUALITATIVI QUANTITATIVI
PROCEDURA VALIDAZIONE METODI SIEROLOGICI
PRECISIONE Accordanza/concordanza QUALITATIVI
PRECISIONE Ripetibilità/riproducibilità QUANTITATIVI
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PROCEDURA VALIDAZIONE METODI PCR OGM
c
c
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CRITERI DI ACCETTABILITA’
QUALITATIVI QUANTITATIVI
ACCORDANZA
PROVE ESEGUITE IN DOPPIO
RIPETIBILITA’
ELISA PCR
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Accred Qual Assur (2010) 15:439-444
Peter-Th. Wilrich. The determination of precision of qualitative measurement methods by interlaboratory experiments
…..eppure è possibile calcolare la ripetibilità anche dei metodi qualitativi…….
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PROCEDURA DI VALIDAZIONE IZSLER
Cosa prevede la procedura interna IZSLER?
VALIDAZIONE/VERIFICA DI PERFORMANCE DEI METODI DI PROVA QUALITATIVI DI BIOLOGIA MOLECOLARE APPLICATI AGLI ALIMENTI, ALLE ACQUE ED AI CAMPIONI AMBIENTALI
Metodi qualitativi
assenza di metodo di riferimento
LOD
% falsi positivi e negativi
Selettività
robustezza
ISO 16140 – ISO 22118
PROCEDURA CONDIVISA DA TRE ISTITUTI IZSLER - IZSVE- IZSTO
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DETERMINAZIONE DEL LOD
Categoria matrice Ceppo 1
L0
L1
L2
L0 = controllo negativo
L1 = concentrazione 1
L2 = concentrazione 2
Replica 1
Replica 2
LOD x 60 ripetizioni x matrice
L ….
L3 = concentrazione ……
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VALUTAZIONE PRELIMINARE DEL LOD
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VALUTAZIONE LOD
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DETERMINAZIONE DEI FALSI POSITIVI E FALSI NEGATIVI
Frutta
Mela
Prugna
Mix frutta
10 campioni 5 +
5 -
Contaminazione? Di poco superiore al LOD….
% risultati falsi positivi
numero di campioni falsi negativi
Numero totale risultati negativi (compresi i falsi negativi)
% risultati falsi negativi
numero di campioni falsi positivi
Numero totale risultati positivi (compresi i falsi positivi)
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CATEGORIA 1:
matrice/i
1 matrice 2 matrici 3 matrici campioni atteso Operatore A Operatore A Operatore A Operatore B Operatore B Operatore B falsi positivi A falsi negativi A falsi positivi B falsi negativi B Somma falsi positivi A+B Somma falsi negativi A+B
replica 1 replica 2 risultato replica 1 replica 2 risultato 0 0
1 1 1 1 positivo positivo positivo 0 0
2 2 2 2 positivo positivo positivo 0 0 tot negativi (compresi falsi -) tot positivi (compresi falsi +)
3 3 3 3 positivo positivo positivo 0 0 30 30
4 4 4 4 positivo positivo positivo 0 0
5 5 5 5 positivo positivo positivo 0 0 % falsi positivi % falsi negativi
6 6 6 6 positivo positivo positivo 0 0 0 0
7 7 7 7 positivo positivo positivo 0 0
8 8 8 8 positivo positivo positivo 0 0
9 9 9 9 positivo positivo positivo 0 0
10 10 10 10 positivo positivo positivo 0 0
11 11 11 11 positivo positivo positivo 0 0
12 12 12 12 positivo positivo positivo 0 0
13 13 13 13 positivo positivo positivo 0 0
14 14 14 14 positivo positivo positivo 0 0
15 15 15 15 positivo positivo positivo 0 0
16 16 16 16 negativo negativo negativo 0 0
17 17 17 17 negativo negativo negativo 0 0
18 18 18 18 negativo negativo negativo 0 0
19 19 19 19 negativo negativo negativo 0 0
20 20 20 20 negativo negativo negativo 0 0
21 21 21 21 negativo negativo negativo 0 0
22 22 22 22 negativo negativo negativo 0 0
23 23 23 23 negativo negativo negativo 0 0
24 24 24 24 negativo negativo negativo 0 0
25 25 25 25 negativo negativo negativo 0 0
26 26 26 26 negativo negativo negativo 0 0
27 27 27 27 negativo negativo negativo 0 0
28 28 28 28 negativo negativo negativo 0 0
29 29 29 29 negativo negativo negativo 0 0
30 30 30 30 negativo negativo negativo 0 0
15 15 0 0
15 15
compilazione f oglio in base al n. di matrici
Utilizzare questo schema per inserire i
risultati a seconda del n. di matrici a
disposizione
DETERMINAZIONE FALSI POSITIVI E NEGATIVI
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OGM
ISO 22118:2011 ISO 5725-2 ISO 5725-3
VALIDAZIONE DI METODI QUANTITATIVI PCR
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LAVORO DI COLLABORAZIONE SULLE VALIDAZIONI
STESURA DI PROTOCOLLI COMUNI
CONCLUSIONI
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GRAZIE PER
L’ATTENZIONE