Esperimento che dimostra che U1 snRNA riconosce il sito di splicing al 5’ mediante appaiamento di basi

1) Mutazioni al 5’ ss inibiscono lo splicing2) Mutazioni complementari su U1 snRNA ripristinano lo splicing

1 2

3

QuickTime™ e undecompressore TIFF (LZW)

sono necessari per visualizzare quest'immagine.

Esistono introni che fanno splicing in assenza di proteine e snRNA

AUTOSPLICING oSPLICING AUTOCATALITICO(introni di gruppo I e II)

Gli introni nucleari sono originati da quelli autocatalitici - conservazione della chimica della reazione e delle strutture

Il nucleo catalitico dello “spliceosome” è formato dall’interazione di tre diversi RNA: U2-U6 e il pre-mRNA.

Questa struttura è perfettamente conservata in cis negli introniautocatalitici di gruppo II

U2

U6

Spliceosomal Group II

Exon 1

Exon 2

Exon 2

Exon 1

Da cis a trans- splicing

Lo splicing degli introni autocatalitici dipende da una struttura molto complessa (ogni mutazione al loro

interno sarebbe di danno al gene ospite)

Per questo motivo nel corso dell’evoluzione le sequenze richieste in cis sono state messe in trans -

splicing degli introni nucleari

gli snRNA sono sequenze che negli introni autocatalitici stavano all’interno dell’introne stesso

Ge

ne

nu

mb

er

Tra

ns

cri

pt

nu

mb

er

~25k~15k

~20k

~6,5k

~31k

~30k

~25k

Come giustificare il considerevole aumento di complessità degli eucarioti superiori con un aumento così limitato nel numero di geni?

Lo splicing alternativo aumenta la codogenicità del genoma