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E’ nota a tutti la notevole diffusione che negli an-ni recenti hanno avuto i programmi cosiddetti“Open Source”, quali il sistema operativo Linux1 e ilpacchetto di applicativi Open Office2.Una loro caratteristica fondamentale è la possibi-lità di essere liberamente utilizzabili e modificabi-li dagli utenti/sviluppatori3, pur non escludendol’esistenza di versioni commerciali a pagamento.Oltre a questi, ben noti, esiste una vera galassia diprogetti analoghi, che si evolvono e miglioranograzie ad una miriade di contributi da parte degliutilizzatori.

Tra le varie raccolte indicizzate per categorie4 se nesegnalano due per le notevoli dimensioni: “SSoouurr--cceeFFoorrggee”5 (http://sourceforge.net) e “ffrreesshhmmeeaatt”(http://freshmeat.net)

Il primo è un archivio imponente, che vanta oltre100000 progetti, di cui circa 300 dedicati alla chi-mica, mentre il secondo contiene una novantina diprogrammi a carattere chimico6.In entrambi i siti vi sono le tipologie di programmipiù disparate: da programmi di visualizzazionemolecolare (dai più semplici, di pura grafica, a veriprogrammi di calcolo di strutture molecolari e pro-prietà collegate), a programmi per l’acquisizione ela gestione dati spettroscopici, per la gestione distrumentazione analitica, per il calcolo di proprie-tà quantomeccaniche, fino a “semplici” programmididattici e di simulazione.Vi sono anche “suite” di programmi per la gestio-ne di dati sperimentali in ambito di ricerca e appli-cativo. Non mancano nemmeno esempi di LIMSper la gestione del laboratorio chimico!Utilizzando questi siti è da ricordare che l’uso con-sentito dei programmi, anche nel mondo “Open”dipende dal tipo di licenza7 con la quale vengonorilasciati, e non tutti quelli elencati sono comple-tamente “Open”.

Parallelamente allo sviluppo della filosofia “OpenSource” nella programmazione, si sta diffondendoun modello di letteratura tecnico – scientifica“Open Access”8.

Si tratta di riviste strutturate apparentemente co-me quelle tradizionali, ma distribuite per lo più so-lo in rete. L’accesso è gratuito; talvolta viene ri-chiesta una registrazione. Per sostenere i costi gli editori devono quindisfruttare finanziatori istituzionali (es. Arkivoc9,Beilstein10 Analytical Sciences11, ecc.) o pubblicità (ètuttavia il caso di molte riviste a carattere tecnico– applicativo, non accademico, che esulano daquesto contesto).Un sistema che capovolge regole consolidate èquello di far pagare gli autori: una rivista afferma-ta può chiedere anche oltre 2000 € per pubblica-re un articolo12 (!) ma questo modello editorialeviene visto con crescente favore13.

Il problema dei costi14 per l’accesso all’informazio-ne scientifica è centrale nello sviluppo della filoso-fia “Open”15. L’esplosione di tante iniziative, che ca-ricano i costi sugli autori, è legato alla percezioneche lo svantaggio dei costi di abbonamento di unarivista tradizionale, che crea un ostacolo alla diffu-sione dei risultati, supera di gran lunga il vantag-gio della pubblicazione “gratuita”16.

Oltre a riviste “Open” strutturate come quelle tra-dizionali, attraverso il processo di peer-review17, visono iniziative che saltano questo tipo di filtro,configurandosi come “archivi”18. Questo va tenutopresente ma non è, di per sè, indice di scarsa qua-lità delle pubblicazioni.Un esempio degno di nota è aarrXXiivv, sostenuto dal-la Cornell University, (http://xxx.lanl.gov), dedicatoprincipalmente a fisica, matematica, informatica,ma con interessanti sottosezioni di chimica fisica ebiochimica, che vanta oltre 387000 e-prints. Nato nel 1991, arXiv è un “highly-automated elec-tronic archive and distribution server for researchpapers”...”without the editorial operations associa-ted to peer review”, ossia un sistema di “pura dis-seminazione”, a costi estremamente bassi19.In questo sistema gli stessi autori archiviano diret-tamente i propri articoli (e-prints) pronti alla con-sultazione “diretta”. Tuttavia anche in questo casovi è un filtro, legato al meccanismo di registrazio-

Documentazione “Open” dal webContenuti “chimici” nella reteDr. Tiziano Vendrame, Ordine dei Chimici della Provincia di Treviso

1 Per gli appassionati un manuale in-troduttivo iinn iittaalliiaannoo è reperibile alsito www.codex.altervista.org.

2 http://it.openoffice.org (versione initaliano): è un ottimo punto di par-tenza per una “esplorazione” delmondo “Open Source”

3 Questi programmi devono avere un“codice sorgente” che può essere li-beramente letto, ridistribuito e mo-dificato dai programmatori. Per unadefinizione più accurata vedi “OpenSource Initiative” (OSI) inhttp://www.opensource.org/docs/de-finition.php

4 Per un elenco di siti più o menospecializzati vedi sempre il rif. 2 (TheCase for Open Source: For Hackershttp://www.opensource.org/advoca-cy/case_for_hackers.php);

5 La suddivisione per materie è nellasez. “Project/Software map/Displayall/Project topics...Vedi “Chemistry” e“Molecular sciences”

6 Una caratteristica interessante di“freshmeat” è di indicare i progetti“più vitali” e “più popolari” per cia-scuna sezione.

7 Per dettagli sulle tipologie di licenzesoftware “Open” vedihttp://www.opensource.org/index.php

8 Una definizione precisa si ha nel sitodella Budapest Open Access Initiati-ve(http://earlham.edu/~peters/fos/bo-aifaq.htm); in sostanza un giornale è“Open Access” solo se consente agliutilizzatori di “leggere, scaricare, co-piare, distribuire, stampare, ricercare,o collegare (link) il testo completo diquesti articoli”. Ricordare che un ar-ticolo può essere “Open” solo sel’autore lo consente, e in ogni caso idiritti d’autore sul materiale pubbli-cato rimangono validi.

9 “Archive for Organic Chemistry”(http://www.arkat-usa.org), finanzia-to dalla “Arkat USA Inc. “, una soci-età senza fine di lucro (“charity”) na-ta nel 2000 da una donazione per-sonale di Alan (e Linde) Katritzky,responsabile dell’omonimo gruppodi ricerca sugli eterocicli all’Univer-sità della Florida

10 “Beilstein Journal of Organic Chem-istry” (http://bjoc.beilstein-journals.org) edito dall’omonimo Isti-tuto

11 Della “Japan Society for AnalyticalChemistry”(http://www.jstage.jst.go.jp/browse/analsci)

12 Chemical & Engineering News (Vol.84, n° 26 di luglio 2006, versioneon-linehttp://pubs.acs.org/cen/news/84/i27/8427notw3.html) riporta costi di3000 $ su 36 giornali del gruppo

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ne degli autori, che garantisce una forma di auto-controllo su quanto viene pubblicato.

All’estremo opposto degli archivi automatici, un“caso limite” di controllo dei contenuti, ben oltre lapeer-review, è dato da “OOrrggaanniicc SSyynntthheessiiss”20, unaserie di volumi dedicata alla sintesi, ben nota aichimici organici, oramai disponibile in versione on-line “free” dal 1998.La peculiarità è che in questo caso la “review” av-viene tramite la ripetizione completa delle prepa-razioni proposte, da parte di sperimentatori appar-tenenti ad un laboratorio diverso da quello dell’au-tore, che aggiungono le proprie osservazioni. E’ daprecisare che lo scopo di questa serie non è tantodi pubblicare contributi nuovi ed originali, quantopiuttosto di fornire procedure di sintesi affidabili,collaudate e riproducibili21.

Nel marasma di iniziative in continua evoluzione,un ottimo catalogo di giornali Open “tradizionali”,suddiviso per categorie, è la “DDiirreeccttoorryy OOppeenn AAcccceessssJJoouurrnnaallss” (http://www.doaj.org) collegata a circa2400 riviste, che copre sia aree tecnico – scientifi-che, che applicative ed umanistico – sociali.Il progetto è sostenuto dall’Università di Lund(Svezia meridionale), ed è rivolto solamente a rivi-ste di carattere scientifico o accademico che vigi-lano sulla qualità degli articoli pubblicati, tramite ilsistema di peer-review, o attraverso controlli di ti-po editoriale. Per oltre 700 giornali è possibile ese-guire ricerche fino a livello di articolo (per parolechiave).

Nella sezione “chemistry” si contano22 53 riviste, dicui 2 di chimica analitica, 39 di chimica generale,3 di chimica organica, 8 di ingegneria chimica esolo 1 di chimica inorganica.

Tra le riviste di chimica analitica merita una segna-lazione la già citata “Analytical Sciences” della“Japan Society for Analytical Chemistry” 23

Per la chimica organica il “Beilstein Journal of Or-ganic Chemistry”, nato nel 2005, non ha certo bi-sogno di presentazioni. Tuttavia nello stesso settore è molto interessanteanche la rivista “Arkivoc”, nata nel 2000, ben pri-ma della precedente, che si contraddistingue tral’altro per le “Commemorative Issues”, dedicate afigure eminenti della chimica organica.Nelle riviste a carattere generale numerose sonoquelle edite da Società chimiche nazionali, spesso

di buon livello e con “fisionomie” caratteristiche. Inmerito al “carattere” può essere interessante ilconfronto tra le riviste “Acta Chimica Slovenica”,“Croatica Chemica Acta” e ”Journal of the SerbianChemical Society”.

L’utilità di tali iniziative è legata in generale, oltrealla qualità del materiale pubblicato, anche all’ef-ficienza dei motori di ricerca interni e all’indicizza-zione degli articoli. Un buon esempio è dato dalleriviste edite dalla Korean Chemical Society, (vedi“Bulletin of the Korean Chemical Society” in doaj)indicizzate in un unico “motore”.E’ da ricordare che numerose riviste di caratterechimico (es. biochimica, scienza dei materiali, chi-mica dell’ambiente) in doaj sono catalogati in areediverse (biologia, ingegneria...).A confine tra Chimica e discipline umanistiche,merita una citazione la rivista “Hyle” (InternationalJournal for Philosopy of Chemistry), periodico difilosofia applicata alla chimica24. L’argomento puòapparire esotico, ma la rivista merita comunquealmeno una visita.

Tra le “curiosità molto serie” del web chimico, lega-ta in qualche modo al “mondo Open” è da segna-lare la “MMoolleeccuullaarr DDiivveerrssiittyy PPrreesseerrvvaattiioonn IInniittiiaattiivvee”(http://www.mdpi.net).

La traduzione suona bizzarra, al contrario dell’in-tento: raccogliere e conservare in un archivio cam-pioni di composti che altrimenti, dopo la sintesi ol’isolamento, finirebbero per essere dispersi o di-strutti. Il valore dell’iniziativa, a cui hanno dato soste-gno ben sette Premi Nobel, diventa comprensibi-le se si pensa che dei milioni di composti descrit-ti in letteratura solo qualche decina di migliaia,ossia una misera frazione, è effettivamente rin-tracciabile25 su qualche scaffale da qualche par-te del mondo. Di solito è normale che dopo la sintesi e lo studioiniziale, se un nuovo composto non dimostra unulteriore interesse scientifico o commerciale, rima-ne “parcheggiato” per un certo periodo nel labora-torio d’origine, ma alla lunga finisce “disperso” oviene smaltito tra i rifiuti. Questo preclude ulteriori ricerche (e verifiche!26) sumolecole descritte anche nel recente passato: sin-tetizzare ex novo una molecola è comunqueun’operazione impegnativa, e non sempre è un la-voro alla portata di chi ne avrebbe bisogno.

Elsevier, mentre “Public Library ofSciences” (PloS), che pubblica seigiornali Open Access, richiede tra1500 e 2000 – 2500 $.

13 Il gruppo Springer consente unaversione Open (“Springer OpenChoice™”), previo pagamento di3000 $ ad articolo, una volta chequesto sia stato accettato. Interes-sante la scelta di adottare una li-cenza d’uso compatibile con la“Creative Commons Attribution Li-cence”(http://creativecommons.org/licen-ses/by-nc/2.5)

14 Nelle sezioni descrittive di “Arkivoc”si può reperire un’interessante ta-bella comparativa del costo per pa-gina delle più famose riviste di chi-mica organica.

15 Vale la pena di ricordare che nel2004 ben 17 atenei italiani hannoaderito alla “Dichiarazione di Berli-no” (Berlin Declaration on Open Ac-cess to Knowledge in the Sciencesand Humanities), a sostegno del-l’accesso aperto alla letteraturascientifica. Tale Dichiarazione si ri-collega alla già citata “BudapestOpen Access Initiative”

16 Una interessante discussione suiccoossttii (e i gguuaaddaaggnnii) dell’editoriascientifica si ha nella sezione“blurb” di arXiv (in “About arXiv”); inparticolare l’articolo di Paul Gin-sparg (dei Los Alamos National La-boratory) “Creating a global kno-wledge network”, reperibile diretta-mente al sitohttp://people.ccmr.cornell.edu/~gin-sparg/blurb/pg01unesco.html

17 “revisione tra pari”, ossia attraversol’esame preliminare degli articoli daparte dei “referee”, esperti del set-tore che valutano l’idoneità di unarticolo alla pubblicazione, in ter-mini di correttezza scientifica e diaderenza alle linee editoriali; e que-sto incide notevolmente sui costi.

18 Per informazioni sui protocolli digestione di archivi “Open” vedere la“Open Archives Initiative” (OAI)http://www.openarchives.org

19 Per una descrizione più estesa dellevedi gli articoli del già citato “blurb”di arXiv in http://people.ccmr.cor-nell.edu/~ginsparg/blurb/

20 http://www.orgsyn.org la serie èiniziata a cavallo della 1° guerramondiale

21 Meriterebbero un accenno alcuni si-ti “amatoriali” dedicati alla sintesiorganica (e non), spesso splendida-mente documentata anche dalpunto di vista fotografico (es. Lam-bda Syn, Sciencemadness ecc.), main questi casi l’identità e l’affidabili-tà degli autori di solito non è verifi-

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L’archivio dei composti (che guarda caso è situatoa Basilea) offre, in quest’ottica, un servizio di pre-stito/consegna dei campioni depositati che, a cer-te condizioni, può essere reso anche gratuitamen-te. Di fatto si tratta di una biblioteca, che non pre-sta libri ma “molecole”. Il paragone è molto stretto,se si pensa che dopo tutto una molecola contienein sé più informazioni di qualsiasi descrizione chepuò esserne data.

A questa “Iniziativa” sono collegate alcune interes-santi riviste27 on-line: “Molecules”, “InternationalJournal of Molecular Sciences”, Sensors”, “Entro-py”, “Marine Drugs”, “Molbank”, “ECSOC 28” ecc.Non tutte queste riviste sono indicizzate in doaj, inquanto alcune prevedono accesso “immediato” apagamento e accesso “Open” differito29.Rispetto a quanto già illustrato, la pubblicazione diun articolo sulle riviste principali di questo gruppo(soggette a peer-review) costa 500 €.

Una rivista “minore” (ma piuttosto interessante)del gruppo è “Molbank”, che si caratterizza per lafilosofia “una molecola – un articolo” 30, destinataquindi a raccogliere materiale molto eterogeneo.La pubblicazione di un articolo su questa rivista(pure soggetta a peer-review) costa solo 50 €. Danotare che in quest’ultimo caso, la fornitura di al-meno due campioni dei composti oggetto degliarticoli esonera dalle spese di pubblicazione. Uninsolito caso di “pagamento in natura”! (“in kind”).

Oltre alle riviste, vi sono numerose banche dati “OpenAccess”. Sicuramente degna di nota è “Oaister” 31, unprogetto dell’Università del Michigan. Lo scopo è dicreare una raccolta di “risorse digitali” di carattere ac-cademico, in precedenza di difficile accesso.

Oaister raccoglie oltre nove milioni di documenti,tra articoli, tesi di laurea, materiale fotografico e dialtre tipologie, che si possono selezionare con leusuali ricerche per parole chiave, ed “aprire” o “sca-ricare” direttamente dall’interfaccia utente.In campo chimico su Oaister si rintracciano nume-rosissimi documenti, sia “antichi” che recentissimi,dei temi e formati più vari.

Altre utilissime banche dati, spesso dimenticate,ma generalmente di libero accesso, sono quellebrevettuali. Può sembrare strano citare i brevetti come fonte diinformazione in un contesto “Open”, ma una filo-

sofia del brevetto è quella di ottenere l’esclusiva diciò che viene descritto.Pur dovendo diffidare del testo dei brevetti, persua natura ambiguo e fuorviante32, l’esame anchesommario della letteratura brevettuale è moltoutile per farsi un’idea delle linee di sviluppo o deifiloni applicativi relativi ad una determinata areatecnologica33.Non è poi raro riconoscere, in brevetti vecchi o ad-dirittura già abbondantemente scaduti, idee o pro-dotti che vengono ancora spacciati come “nuovi”o “novità”.

Una delle banche dati più importanti dedicate aquesto settore è quella dell’Ufficio europeo deibrevetti (EEuurrooppeeaann PPaatteenntt OOffffiiccee: http://www.eu-ropean-patent-office.org) dal quale si può accede-re al sito nazionale preferito34, ed eseguire ricerchesu 50 milioni di documenti on-line. La ricerca èconfigurata in modo da essere abbastanza sempli-ce anche per un neofita. Nel sito vi è poi parecchiomateriale didattico per chi vuole approfondire letematiche brevettuali.

Oltre ai siti europei va senz’altro considerato l’Uf-ficio brevetti statunitense (UUnniitteedd SSttaatteess PPaatteennttaanndd TTrraaddeemmaarrkk OOffffiiccee: http://www.uspto.gov) conmodalità di consultazione analoghe ai precedenti.Anche questo è ricco di documentazione su legi-slazione e tecnica brevettuale. Una funzione ap-prezzabile è quella “Text only”, che accelera il tra-sferimento dei documenti.

Concludendo con un accenno alla manualistica“free”, un sito interessante è “FFrreeee SScciieennccee”35

(http://www.freescience.info) su cui sono reperibilinumerosi testi dedicati a chimica, fisica, matema-tica e una selezione di programmi “Open” di inte-resse scientifico.

Ringraziamenti:una menzione particolare merita il libro “Il sapereliberato” del “Gruppo Laser36”, uscito nel settembre2005 e pubblicato nella “Nuova serie Feltrinelli”,che mi ha dato lo spunto per questo articolo ed èun’ottima introduzione alle tematiche trattate(brevetti e accesso all’informazione), indipenden-temente dagli orientamenti del lettore.

cabile22 Al momento della stesura dell’arti-

colo...23 Pubblica anche il “Bunseki Kagaku”

(per lo più in giapponese) e “X-rayStructure Analysis Online” vantatocome “l’unico giornale elettronicoper reports di strutture cristalline”

24 “Hyle” (http://www.hyle.org) è an-che un ottimo punto di partenzaper i numerosi link a riviste di storiae filosofia della scienza.

25 Spesso con notevoli difficoltà, cer-cando di contattare i singoli ricer-catori

26 La cosa può essere molto importan-te in campo brevettuale, ma nonsolo

27 Accessibili dalla pagina principaledella già citata “mdpi.net”

28 “International Electronic Conferenceon Synthetic Organic Chemistry”,una raccolta annuale di “atti” cheparte dal 1997 con numerosissimicontributi su temi attuali della chi-mica organica.

29 La politica di doaj è di non indiciz-zare riviste con accesso differito

30 “one-compound-per-paper shortnotes and communications on syn-thetic compounds and natural pro-ducts”

31 http://oaister.umdl.umich.edu/o/oai-ster (basta cercare “oaister” suGoogle...) La sigla suona come“ostrica” (oyster), cui allude il logodel sito

32 La descrizione “giusta” è di solito“annegata” in un mare di dettaglisuperflui e di indicazioni fallimentari

33 La replica dei risultati di un brevet-to è tutt’altra questione: mi è capi-tato personalmente di parteciparead una duplicazione riuscita al tre-dicesimo tentativo! (eppure il testosembrava chiaro, e la reazione sem-brava semplice...)

34 oppure rapidamente tramite la se-zione “esp@cenet” http://ep.espa-cenet.com

35 NB: freescience non contiene alcunlibro ma solo i link alle pagine per-sonali degli autori che hanno decisodi mettere online i loro testi.

36 http://www.e-laser.org

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