Ricerca di informazione per la produzione di documentazione EBM (1)

Corso ECM Revisioni sistematiche metanalisi lineeguida Le risorse informative per la medicina basata

sulle prove scientifiche Roma 16-17 settembre 2015 (I ed) 7-8 ottobre 2015 (II ed)

Gaetana Cognetti cognettibibifoit

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Utilizzare solo i termini del tesauro MESH

Utilizzare solo termini liberi con ricerca sul titolo e sugli abstract

Utilizzare solo termini contenuti nel testo intero degli articoli

Utilizzare solo le parole chiave indicate dallrsquoautore dei documenti

Utilizzare i comandi di troncamento

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Per ogni archivio occorre mettere a punto una specifica strategia con uso di termini liberi (sinonimi e termini correlati) e di termini estratti da tesauro se la base dati ha un tesauro

I tesauri sono diversi per ogni archivio es MESH per PubMed Emtree per Embase hellip

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Neoplasms[Mesh] OR Cancer OR Tumor OR Tumour OR Neoplas

OR va usato con il termine del tesauro se presente nella base dati e i

possibili sinonimi per consentire un maggior recupero dellrsquo

informazione

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tumore not animali

tumore animali

NOT mi esclude dalla ricerca le informazioni in cui compare il termine ldquoanimalerdquo

ma anche quelle che contengono informazioni su animali e uomini

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Utilizzo il troncamento

Utilizzo lrsquo adiacenza

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ldquoLe informazioni-che-non-ci-sono se ne stavano zitte e ben nascoste alla vista degli studiosi cosiccheacute quel luogo dava lrsquoimpressione di un deserto ove regnava un silenzio mortale che gelava il sangue nelle vene

Ma ecco che esse apparendo allrsquo improvviso si precipitavano con molto rumore tutte insieme come pipistrelli o vampiri addosso ad un malcapitato studioso e lo sommergevano soffocandolo

In realtagrave come succede anche a molti uomini esse divenivano selvagge e cattive quando erano in branco da sole infatti erano educate e di buon cuorerdquo

G Cognetti ndash La Biblioteca che-non-crsquoegrave

(racconto inedito)

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Per avere risposte cliniche attendibili egrave sufficiente disporre anche di un solo documento una rassegna sistematica o una linee guida

La ricerca informativa deve essere precisa e limitarsi a pochi documenti validi

Per produrre una rassegna sistematica occorre fare una ricerca molto ampia e con molto rumore per non rischiare di perdere informazione essenziale

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Precisione (specifity ndashnarrow search)

La precisione (specificity) egrave la

proporzione di documenti pertinenti fra quelli recuperati

P = numero di documenti

pertinenti recuperati _________________________

numero di documenti recuperati

Richiamo (sensitivity -broad search)

Il richiamo (in inglese recall) egrave

la proporzione fra il numero di documenti rilevanti recuperati e il numero di tutti i documenti rilevanti disponibili nella collezione considerata

R = numero di documenti

rilevanti recuperati ___________________________ numero di documenti

rilevanti disponibili nellrsquo archivio

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si lavora sul richiamo per non perdere alcun documento valido quindi la precisione della ricerca egrave minore e maggiore egrave il rumore

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Utilizzando diversi archivi vi sono sovrapposizioni di articoli ritrovati come fare per pulire la ricerca

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

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ldquogopubmedrdquo mette a disposizione un sistema di ricerca terminologico per fare ldquodata miningrdquo con utilizzo del sistema UMLS - data mining significa estrazione automatica di conoscenze da grandi archivi di dati in questo caso conoscenze terminologiche

httpgopubmedorgwebgopubmed

Utilizzare solo i termini del tesauro MESH

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Utilizzare solo le parole chiave indicate dallrsquoautore dei documenti

Utilizzare i comandi di troncamento

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Per ogni archivio occorre mettere a punto una specifica strategia con uso di termini liberi (sinonimi e termini correlati) e di termini estratti da tesauro se la base dati ha un tesauro

I tesauri sono diversi per ogni archivio es MESH per PubMed Emtree per Embase hellip

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tumore not animali

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NOT mi esclude dalla ricerca le informazioni in cui compare il termine ldquoanimalerdquo

ma anche quelle che contengono informazioni su animali e uomini

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Utilizzo il troncamento

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ldquoLe informazioni-che-non-ci-sono se ne stavano zitte e ben nascoste alla vista degli studiosi cosiccheacute quel luogo dava lrsquoimpressione di un deserto ove regnava un silenzio mortale che gelava il sangue nelle vene

Ma ecco che esse apparendo allrsquo improvviso si precipitavano con molto rumore tutte insieme come pipistrelli o vampiri addosso ad un malcapitato studioso e lo sommergevano soffocandolo

In realtagrave come succede anche a molti uomini esse divenivano selvagge e cattive quando erano in branco da sole infatti erano educate e di buon cuorerdquo

G Cognetti ndash La Biblioteca che-non-crsquoegrave

(racconto inedito)

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Per avere risposte cliniche attendibili egrave sufficiente disporre anche di un solo documento una rassegna sistematica o una linee guida

La ricerca informativa deve essere precisa e limitarsi a pochi documenti validi

Per produrre una rassegna sistematica occorre fare una ricerca molto ampia e con molto rumore per non rischiare di perdere informazione essenziale

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Precisione (specifity ndashnarrow search)

La precisione (specificity) egrave la

proporzione di documenti pertinenti fra quelli recuperati

P = numero di documenti

pertinenti recuperati _________________________

numero di documenti recuperati

Richiamo (sensitivity -broad search)

Il richiamo (in inglese recall) egrave

la proporzione fra il numero di documenti rilevanti recuperati e il numero di tutti i documenti rilevanti disponibili nella collezione considerata

R = numero di documenti

rilevanti recuperati ___________________________ numero di documenti

rilevanti disponibili nellrsquo archivio

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si lavora sul richiamo per non perdere alcun documento valido quindi la precisione della ricerca egrave minore e maggiore egrave il rumore

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Utilizzando diversi archivi vi sono sovrapposizioni di articoli ritrovati come fare per pulire la ricerca

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

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ldquogopubmedrdquo mette a disposizione un sistema di ricerca terminologico per fare ldquodata miningrdquo con utilizzo del sistema UMLS - data mining significa estrazione automatica di conoscenze da grandi archivi di dati in questo caso conoscenze terminologiche

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Ma ecco che esse apparendo allrsquo improvviso si precipitavano con molto rumore tutte insieme come pipistrelli o vampiri addosso ad un malcapitato studioso e lo sommergevano soffocandolo

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R = numero di documenti

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

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ldquogopubmedrdquo mette a disposizione un sistema di ricerca terminologico per fare ldquodata miningrdquo con utilizzo del sistema UMLS - data mining significa estrazione automatica di conoscenze da grandi archivi di dati in questo caso conoscenze terminologiche

httpgopubmedorgwebgopubmed

si lavora sul richiamo per non perdere alcun documento valido quindi la precisione della ricerca egrave minore e maggiore egrave il rumore

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Utilizzando diversi archivi vi sono sovrapposizioni di articoli ritrovati come fare per pulire la ricerca

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

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I programmi di gestione dei riferimenti bibliografici sono fondamentali

Endnote Refwork Reference Manager ecc

Questi software permettono di ripulire i doppi documenti Endnote ha la funzione anche di ldquodata miningrdquo permettere di raccogliere le ldquooccorrenzerdquo di termini sinonimi utili per le nostre ricerche

Inoltre permettono di recuperare tutti i metadata e gli abstract e di organizzare le citazioni aggiungendo campi cartelle ecc

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ldquogopubmedrdquo mette a disposizione un sistema di ricerca terminologico per fare ldquodata miningrdquo con utilizzo del sistema UMLS - data mining significa estrazione automatica di conoscenze da grandi archivi di dati in questo caso conoscenze terminologiche

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Posso evidenziare i termini correlati e sinonimi della mia ricerca per ricavare utile terminologia per le mie ricerche Es ldquobreast carcinomardquo

Ricavo tantissima documentazione perlopiugrave citazioni fornite di abstracthellip

A questo punto due revisori esperti nella materia decidono indipendentemente lrsquo uno dallrsquo altro quali citazioni inserire e quali escludere dalla revisione sistematica

Due abstract al minuto 120 allrsquoora circa 1000 in 8 ore Posso esaminare migliaia di citazioni in poco tempo

(forse con i ritmi americani non napoletani)

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Tutte le fonti informative utilizzate devono essere documentate nella revisione sistematica

Basi dati consultate

Nome della piattaforma (es OVID EBSCO )

Data della effettuazione della ricerca

Anni coperti dalla ricerca

Strategie di ricerca complete per ogni base dati (copiaincolla per evitare errori)

Sintesi in una o due frasi della ricerca

Eventuali restrizioni di linguaggio

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Indicare ricerche manuali atti di congressi e altro materiale LG (es fonti governative)

Ricerca manuale di titoli di riviste (quali)

Indicare anche se si proceduto a contattare studiosi per es coloro che seguono un protocollo clinico o esperti nel campo (invisible college) per ricevere ulteriore documentazione

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Non sono ben documentate mancano di informazioni essenziali

Occorrerebbe che lrsquoesperto in informazione facesse parte dei revisori (peer review) in caso di documentazione EBM

Yoshii A et al J Med Libr Assoc 97(1)200921

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Devono essere effettuate ogni due anni almeno

Ma in questo caso proponiamo la stessa ricerca

Informativa di prima

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Nuovi archivi utili

Nuovi termini nei tesauri

Nuove modalitagrave di ricerca

Nel caso di aggiornamento di una rassegna sistematica occorre anche documentare le strategie aggiuntive per recuperare errata corrige commenti ritiro di pubblicazioni ecc

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Pubmed Commons una rete sociale per i commenti

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Occorre poter verificare se la ricerca egrave stata sufficiente altrimenti anche le prove scientifiche possono essere deboli

Le strategie di ricerca devono essere ripetibili

Si possono trasferire in questo modo le conoscenze sulle strategie migliori da poter riusare

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Possiamo utilizzare le ricerche giagrave effettuate e documentate nelle revisioni sistematiche

Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

Dobbiamo valutare criticamente le ricerche da cui prendere modello

Cognetti G Grossi L Lucon A Solimini R Information retrieval for the Cochrane systematic reviews the case of breast cancer surgery

Ann Ist Super Sanita 201551(1)34-9

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Ricavo tantissima documentazione perlopiugrave citazioni fornite di abstracthellip

A questo punto due revisori esperti nella materia decidono indipendentemente lrsquo uno dallrsquo altro quali citazioni inserire e quali escludere dalla revisione sistematica

Due abstract al minuto 120 allrsquoora circa 1000 in 8 ore Posso esaminare migliaia di citazioni in poco tempo

(forse con i ritmi americani non napoletani)

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Indicare ricerche manuali atti di congressi e altro materiale LG (es fonti governative)

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Indicare anche se si proceduto a contattare studiosi per es coloro che seguono un protocollo clinico o esperti nel campo (invisible college) per ricevere ulteriore documentazione

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Occorre poter verificare se la ricerca egrave stata sufficiente altrimenti anche le prove scientifiche possono essere deboli

Le strategie di ricerca devono essere ripetibili

Si possono trasferire in questo modo le conoscenze sulle strategie migliori da poter riusare

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Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

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Le strategie di ricerca devono essere ripetibili

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Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

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Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

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Le strategie di ricerca devono essere ripetibili

Si possono trasferire in questo modo le conoscenze sulle strategie migliori da poter riusare

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Possiamo utilizzare le ricerche giagrave effettuate e documentate nelle revisioni sistematiche

Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

Dobbiamo valutare criticamente le ricerche da cui prendere modello

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Possiamo utilizzare le ricerche giagrave effettuate e documentate nelle revisioni sistematiche

Ma attenzione anche con riferimento alle revisioni Cochrane le ricerche dellrsquo informazione non sono sempre ldquogold standardrdquo

Dobbiamo valutare criticamente le ricerche da cui prendere modello

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Rendono disponibili delle strategie standard da utilizzare per aiutare a formulare le strategie di ricerca

Vi sono inoltre sistemi di ldquodata miningrdquo per ottenere i sinonimi dei termini di ricerca

Anche i software di gestione delle citazioni bibliografiche come Refworks o Endnote consentono di effettuare analisi dei termini (statistiche) ai fini di trovare i sinonimi

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Consulenza esterna o fa parte del gruppo di lavoro multidisciplinare

Tra gli autori della rassegna

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions

Version 510

[updated March 2011]

Editors Julian PT Higgins and Sally Green

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Il lavoro di ricerca bibliografica egrave unrsquo attivitagrave iterativa che richiede un continuo adattamento in sintonia con lo sviluppo della ricerca

Occorre che lrsquoesperto assuma la responsabilitagrave della ricerca informativa come lo statistico per la parte di elaborazione dei dati il clinico per la valutazione clinica ecchellip

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Revisione Cochrane su ldquoagopuntura per il dolore nei malati di cancro adultirdquo ricerca Medline

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Revisione Cochrane su agopuntura per il dolore nei malati di cancro adulti ricerche su vari archivi

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

Molti Gruppi Cochrane come questo sul ldquotumore della mammella forniscono strategie standard per la ricerca in alcuni archivi in particolare in Medline sugli argomenti ricercati dal Gruppo

Valutare ricerca informativa dellrsquoarticolo Is biochemical relapse-free survival after

profoundly hypofractionated radiotherapy consistent with current radiobiological models

Tree AC Khoo VS van As NJ Partridge M

Clin Oncol (R Coll Radiol) 2014 Apr26(4)216-29 doi 101016jclon201401008 Epub 2014 Feb 12

PMID 24529742

Da confrontare con Role of the technical aspects of hypofractionated radiation

therapy treatment of prostate cancer a review

Clemente S Nigro R Oliviero C Marchioni C Esposito M Giglioli FR Mancosu P Marino C Russo S Stasi M Strigari L Veronese I Landoni V

Int J Radiat Oncol Biol Phys 2015 Jan 191(1)182-95 doi 101016jijrobp201408006 Review

PMID 25835624

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Consulenza esterna o fa parte del gruppo di lavoro multidisciplinare

Tra gli autori della rassegna

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Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions

Version 510

[updated March 2011]

Editors Julian PT Higgins and Sally Green

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Il lavoro di ricerca bibliografica egrave unrsquo attivitagrave iterativa che richiede un continuo adattamento in sintonia con lo sviluppo della ricerca

Occorre che lrsquoesperto assuma la responsabilitagrave della ricerca informativa come lo statistico per la parte di elaborazione dei dati il clinico per la valutazione clinica ecchellip

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Revisione Cochrane su ldquoagopuntura per il dolore nei malati di cancro adultirdquo ricerca Medline

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Revisione Cochrane su agopuntura per il dolore nei malati di cancro adulti ricerche su vari archivi

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Molti Gruppi Cochrane come questo sul ldquotumore della mammella forniscono strategie standard per la ricerca in alcuni archivi in particolare in Medline sugli argomenti ricercati dal Gruppo

Valutare ricerca informativa dellrsquoarticolo Is biochemical relapse-free survival after

profoundly hypofractionated radiotherapy consistent with current radiobiological models

Tree AC Khoo VS van As NJ Partridge M

Clin Oncol (R Coll Radiol) 2014 Apr26(4)216-29 doi 101016jclon201401008 Epub 2014 Feb 12

PMID 24529742

Da confrontare con Role of the technical aspects of hypofractionated radiation

therapy treatment of prostate cancer a review

Clemente S Nigro R Oliviero C Marchioni C Esposito M Giglioli FR Mancosu P Marino C Russo S Stasi M Strigari L Veronese I Landoni V

Int J Radiat Oncol Biol Phys 2015 Jan 191(1)182-95 doi 101016jijrobp201408006 Review

PMID 25835624

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Version 510

[updated March 2011]

Editors Julian PT Higgins and Sally Green

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Il lavoro di ricerca bibliografica egrave unrsquo attivitagrave iterativa che richiede un continuo adattamento in sintonia con lo sviluppo della ricerca

Occorre che lrsquoesperto assuma la responsabilitagrave della ricerca informativa come lo statistico per la parte di elaborazione dei dati il clinico per la valutazione clinica ecchellip

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Revisione Cochrane su ldquoagopuntura per il dolore nei malati di cancro adultirdquo ricerca Medline

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Revisione Cochrane su agopuntura per il dolore nei malati di cancro adulti ricerche su vari archivi

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Molti Gruppi Cochrane come questo sul ldquotumore della mammella forniscono strategie standard per la ricerca in alcuni archivi in particolare in Medline sugli argomenti ricercati dal Gruppo

Valutare ricerca informativa dellrsquoarticolo Is biochemical relapse-free survival after

profoundly hypofractionated radiotherapy consistent with current radiobiological models

Tree AC Khoo VS van As NJ Partridge M

Clin Oncol (R Coll Radiol) 2014 Apr26(4)216-29 doi 101016jclon201401008 Epub 2014 Feb 12

PMID 24529742

Da confrontare con Role of the technical aspects of hypofractionated radiation

therapy treatment of prostate cancer a review

Clemente S Nigro R Oliviero C Marchioni C Esposito M Giglioli FR Mancosu P Marino C Russo S Stasi M Strigari L Veronese I Landoni V

Int J Radiat Oncol Biol Phys 2015 Jan 191(1)182-95 doi 101016jijrobp201408006 Review

PMID 25835624

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Il lavoro di ricerca bibliografica egrave unrsquo attivitagrave iterativa che richiede un continuo adattamento in sintonia con lo sviluppo della ricerca

Occorre che lrsquoesperto assuma la responsabilitagrave della ricerca informativa come lo statistico per la parte di elaborazione dei dati il clinico per la valutazione clinica ecchellip

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Revisione Cochrane su ldquoagopuntura per il dolore nei malati di cancro adultirdquo ricerca Medline

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Revisione Cochrane su agopuntura per il dolore nei malati di cancro adulti ricerche su vari archivi

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Molti Gruppi Cochrane come questo sul ldquotumore della mammella forniscono strategie standard per la ricerca in alcuni archivi in particolare in Medline sugli argomenti ricercati dal Gruppo

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profoundly hypofractionated radiotherapy consistent with current radiobiological models

Tree AC Khoo VS van As NJ Partridge M

Clin Oncol (R Coll Radiol) 2014 Apr26(4)216-29 doi 101016jclon201401008 Epub 2014 Feb 12

PMID 24529742

Da confrontare con Role of the technical aspects of hypofractionated radiation

therapy treatment of prostate cancer a review

Clemente S Nigro R Oliviero C Marchioni C Esposito M Giglioli FR Mancosu P Marino C Russo S Stasi M Strigari L Veronese I Landoni V

Int J Radiat Oncol Biol Phys 2015 Jan 191(1)182-95 doi 101016jijrobp201408006 Review

PMID 25835624

Corso EBM Roma 16-17 settembre7-8 ottobre

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Revisione Cochrane su ldquoagopuntura per il dolore nei malati di cancro adultirdquo ricerca Medline

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profoundly hypofractionated radiotherapy consistent with current radiobiological models

Tree AC Khoo VS van As NJ Partridge M

Clin Oncol (R Coll Radiol) 2014 Apr26(4)216-29 doi 101016jclon201401008 Epub 2014 Feb 12

PMID 24529742

Da confrontare con Role of the technical aspects of hypofractionated radiation

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