Chimica Organica II Acidi nucleici: un copolimero fosfato-ribosio La differenza tra RNA e DNA sta...

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Chimica Organica II Acidi nucleici: un copolimero fosfato- ribosio La differenza tra RNA e DNA sta nell’assenza dell’ossidrile 2’ del ribosio nel secondo, che rende la macromolecola molto più stabile all’idrolisi

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Chimica Organica II

Acidi nucleici: un copolimero fosfato-ribosio

La differenza tra RNA e DNA sta nell’assenza dell’ossidrile 2’ del ribosio nel secondo, che rende la macromolecola molto più stabile all’idrolisi

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Acidi nucleiciLa minor stabilità dell’RNA è dovuta al fatto che l’ossidrile in 2’ può agire come nucleofilo intramolecolare. A pH 7 e 25 °C il tempo di semivita del’RNA è di 100 anni, quello del DNA è 100 milioni di anni

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Acidi nucleici: nuclobasi

purina pirimidina

adenina guanina citosina uracile timina

RNA DNA

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Acidi nucleici: nucleosidi

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Acidi nucleici: nucleotidi

Adenosina 5’-monofososfatoUn ribonuclotide

2’-desossicitidina 3’-monofososfatoUn desossiribonuclotide

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Acidi nucleici: base pairing

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Acidi nucleici: coppie di basi

Coppie di basi di Watson e Crick

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Acidi nucleici: doppia elica

Minor groove

Major groove

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Acidi nucleici: doppia elica

G-quadruplex

Sono note altre strutture oltre alla doppia elica B

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/9e/Parallel_telomere_quadruple.png
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Acidi nucleici: interazione con le proteine

Soppressore di trascrizione legato all’elica B nei major grooves

Enzima di restrizione EcoRV legato al DNA

http://en.wikipedia.org/wiki/File:Lambda_repressor_1LMB.png
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/dc/EcoRV_1RVA.png
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Acidi nucleici: duplicazione del DNA

Le DNA polimerasi possono estendere un DNA solo in direzione 5’ –3’

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/9f/DNA_replication.svg
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Acidi nucleici: trascrizione del DNA

Una RNA polimerasi copia la sequenza bersaglio in un RNA messaggero

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/f3/T7_RNA_polymerase_at_work.png
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Acidi nucleici: sintesi delle proteine

Il ribosoma contiene m-RNA come elemento attivo

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Nucleotidi ed energia: ATP

ATP + H20 = ADP + idrogeno fosfato - 7.3 Kcal/mol

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Nucleotidi ed energia: ATP

La reazione non avviene: il gruppo uscente è troppo povero

ATP è molto reattiva, reagisce con l’acetato fosforilandolo. Quest’ultimo derivato è sufficientemente reattivo da reagire con il tiolo.


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