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Capitolo 15
La genetica dei batterie dei batteriofagi
Peter J Russell, Genetica © 2010 Pearson Italia S.p.A
http://web.unife.it/progetti/genetica/Guido/index.php?lng=it&p=4
Domande 14
• In che modo si è dimostrato che nei procarioti avviene ricombinazione?
• In che modo i procarioti possono scambiarsi materiale genetico?
• Com’è fatta una mappa genetica in un procariote?• Cosa determina la polarità sessuale nei batteri?• Come intervengono i fagi nella ricombinazione
batterica?
Figura 15.1
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Dove sta la variabilità intraspecifica necessaria per studiare la genetica dei batteri?
Mutanti nutrizionali
•Terreno minimo: una fonte di C organico, sali minerali•Terreno completo: terreno minimo + vitamine, tutti i nucleotidi e tutti gli amminoacidi•Prototrofo: ceppo capace di crescere su terreno minimo•Auxotrofo: ceppo che per crescere richiede uno o più amminoacidi e proteine, in aggiunta al terreno minimo
Es. di genotipo: gly+ gua+ ile- ade-
Non ha bisogno di glicina e guanina, ma cresce solo in presenza di isoleucina e adenina
Conosciamo una forma di scambio genetico (sessualità) nei batteri: trasformazione
Ceppi di pneumococco IIS trasformano ceppi IIIR
Figura 15.9
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Meccanismo della trasformazione
(avviene naturalmente in Bacillus subtilis)
Formazione di un tratto di DNA eteroduplex
Figura 15.2
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Un’altra forma di sessualità nei batteri:
coniugazione.
Dimostrazione della ricombinazione in E. coli.
Lederberg e Tatum (1946)
Figura 15.3
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Non compaiono cellule prototrofe: perché avvenga la coniugazione è necessario il contatto fisico fra i due ceppi
Fattore F, ceppi F+ ed F-
Un ceppo può trasferire parte del suo DNA (ceppo donatore, F+) se è dotato di un plasmide: fattore F. I ceppi che ne sono privi sono ceppi accettori, F-.
Il fattore F contiene i geni per la formazione di un pilo.
F+
F-
Figura 15.4
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NB: elica singola
NB: replicazione del DNA del plasmidio
Attraverso la coniugazione cambiano le caratteristiche sessuali del ceppo accettore
Attraverso la coniugazione cambiano le caratteristiche sessuali del ceppo accettore
Alcuni ceppi F+ trasferiscono, insieme al fattore di sessualità, uno o pochi geni che possono dare luogo a
ricombinazione
F+ lac+
F- lac-
F+ lac+
F- lac-
F+ lac+
F+ lac+
Figura 15.5
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Come viene trasferito il materiale genetico durante la coniugazione in E. coli
I ceppi F+ contengono un fattore F in forma di plasimidio, gli Hfr lo portano integrato nel cromosoma
Figura 15.6
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La ricombinazione avviene se, occasionalmente, il fattore F ha incorporato per crossing-over alcuni dei geni del cromosoma del ceppo donatore: ceppi lfr, low frequency of recombinationQui: F’(lac)
Altri ceppi F+ trasferiscono molti geni che danno luogo a ricombinazione, generalmente senza che venga trasferito il
fattore di sessualità
F+ trp+lac+
F- trp-lac-
F+ trp+lac+
F- trp-lac-
F+ trp+lac+
F- trp+lac+
Ceppi Hfr: High Frequency of Recombination
Ceppi in cui il fattore F è integrato nel cromosoma sono ceppi Hfr
(high frequency of recombination)
Segue ricombinazione fra il cromosoma Hfr e quello F-
Ricombinazione in Hfr x F-
Nella coniugazione fra Hfr ed F-, il fattore F è trasferito per ultimo
Si può utilizzare questa particolarità per la mappatura genetica
Ricapitolando:
F- x F- Non c’è coniugazioneF+ x F+ Non c’è coniugazioneF+ x F- Coniugazione, F- F+, ricombinazione rara
Hfr x F- Coniugazione, a volte F- Hfr, ricombinazione frequente
Figura 15.7
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Mappatura del genoma procariote per mezzo di esperimenti di coniugazione interrotta
Hfr u+ y+ z+ AbR x F- u- y- z- AbS
Figura 15.8
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Secondo me, tutte queste frecce sono invertite
Costruzione della mappa(lunghezza totale in E. coli: 100 minuti)
Figura 15.10
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Per costruire mappe genetiche si può sfruttare anche la trasformazione, stimando le distanze fra loci dalle
frequenze di cotrasformazione.
Ciclo dei batteriofagi o fagi
I ceppi batterici sono soggetti a infezione da parte di specifici fagi:Per Escherichia coli: T2, T4, T6 e λ
Ciclo litico o lisogenico dei batteriofagi
profago
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Figura 15.12
Ciclo del fago λ
Figura 15.13
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Trasduzione generalizzata fra ceppi di E. coli
Figura 15.14
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Trasduzione specializzata mediata dal fago λ
Trasduzione: trasferimento di DNA fra batteri, mediato da fagi
Mappatura di geni in E. coli sulla base della frequenza di cotrasduzione
Due loci vengono trasdotti insieme solo se sono molto vicini
leu+ thr+ aziR leu thr aziS aziR, aziS = resistente o sensibile al sodio azide
thr leu azi
Selezione per Frequenza di cotrasduzioneleu+ thr+ 0.02 aziR 0.50thr+ leu+ 0.03 aziR 0.00aziR leu+ 0.48 thr+ 0.00
Mappa genetica di E. coli
4760 genes302 essential 4455 nonessential3 unknown
Genoma di E. coli
Mappe genetiche nei batteriofagi
Il prato batterico
lisi batterica
Mappe genetiche nei batteriofagi
Il prato batterico
lisi battericastrato batterico continuo
Figura 15.17
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Fenotipi fagici: lisi rapida, lisi lenta rII r+
Placca limpida, placca torbida h h+
In un prato batterico con cellule di E. coli dei ceppi B e B/2, solo i virus di ceppo h riescono a lisarle entrambe, mentre gli h+ possono infettare solo cellule di ceppo B
Figura 15.15
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Figura 15.16
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Stima della distanza fra due loci in fago T2:Doppia infezione di E. coli con diversi ceppi fagici
Distanza fra loci = NR / (NR + NP) = N (h+ r+) + N (h r) N (h+ r+) + N (h r) + N (h+ r) + N (h r+)
Riassunto• I batteri possono scambiarsi tratti di DNA tramite
trasformazione, coniugazione e trasduzione• Trasformazione e trasduzione non richiedono un
contatto fra ceppi batterici vivi, la coniugazione sì• La sessualità nella coniugazione è determinata dalla
presenza e dalla localizzazione di un fattore F• Esperimenti di interruzione della coniugazione
permettono di mappare genomi batterici• La ricombinazione batterica può anche essere
mediata da batteriofagi: trasduzione generalizzata e specializzata
• Esperimenti in cui si infettano cellule batteriche con più ceppi di fago permettono di mappare genomi fagici
Figura 15.18
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Figura 15.19
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Figura 15.20
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Figura 15.21
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