Trascrizione e Maturazione RNA-070210 - bgbunict.it · flusso dal genotipo al fenotipo. la...
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TRASCRIZIONE E
MATURAZIONE MATURAZIONE
DELL’RNA
LA TRASCRIZIONE COME PRIMA TAPPA NEL LA TRASCRIZIONE COME PRIMA TAPPA NEL
FLUSSO DAL FLUSSO DAL GENOTIPOGENOTIPO AL AL FENOTIPOFENOTIPO
LA TRASCRIZIONE E’ IL PROCESSOLA TRASCRIZIONE E’ IL PROCESSO
ATTRAVERSO CUI SI PASSA ATTRAVERSO CUI SI PASSA DAL DAL
LINGUAGGIO DESOSSIRIBONUCLEOTIDICOLINGUAGGIO DESOSSIRIBONUCLEOTIDICOLINGUAGGIO DESOSSIRIBONUCLEOTIDICOLINGUAGGIO DESOSSIRIBONUCLEOTIDICO
DEL DNA A QUELLO RIBONUCLEOTIDICODEL DNA A QUELLO RIBONUCLEOTIDICO
DELL’RNADELL’RNA
ATTRAVERSO LA TRASCRIZIONE NON VENGONOATTRAVERSO LA TRASCRIZIONE NON VENGONO
SINTETIZZATI SOLO GLI RNA CHE CODIFICANOSINTETIZZATI SOLO GLI RNA CHE CODIFICANO
PROTEINE (PROTEINE (mRNAmRNA), MA ANCHE SVARIATI), MA ANCHE SVARIATI
ALTRI TIPI ALTRI TIPI DIDI RNA (RNA (tRNAtRNA; ; rRNArRNA; E PICCOLI; E PICCOLIALTRI TIPI ALTRI TIPI DIDI RNA (RNA (tRNAtRNA; ; rRNArRNA; E PICCOLI; E PICCOLI
RNA NON CODIFICANTI QUALI: RNA NON CODIFICANTI QUALI: snRNAsnRNA; ; snoRNAsnoRNA; ;
scRNAscRNA; ; miRNAmiRNA) CHE SVOLGONO FUNZIONI ) CHE SVOLGONO FUNZIONI
CHIAVE NELLA FISIOLOGIA DELLA CELLULA.CHIAVE NELLA FISIOLOGIA DELLA CELLULA.
IN GENERALE IL PRODOTTO (RNA) DELLA IN GENERALE IL PRODOTTO (RNA) DELLA
TRASCRIZIONE PRENDE NOME TRASCRIZIONE PRENDE NOME DIDI TRASCRITTOTRASCRITTO..
L’INSIEME L’INSIEME DIDI MOLECOLE MOLECOLE DIDI RNA RNA
(CLASSICAMENTE (CLASSICAMENTE mRNAmRNA) ALL’INTERNO ) ALL’INTERNO DIDI UN UN (CLASSICAMENTE (CLASSICAMENTE mRNAmRNA) ALL’INTERNO ) ALL’INTERNO DIDI UN UN
BEN PRECISO MOMENTO DELLA VITA BEN PRECISO MOMENTO DELLA VITA DIDI UNA UNA
SPECIFICA CELLULA, COSTITUISCONO IL SUO SPECIFICA CELLULA, COSTITUISCONO IL SUO
TRASCRITTOMA.TRASCRITTOMA.
L’APPARATO ENZIMATICO CHE OPERA VIENEL’APPARATO ENZIMATICO CHE OPERA VIENE
DEFINITODEFINITO RNA POLIMERASIRNA POLIMERASI. .
UNIONE UNIONE DIDI RIBONUCLEOSIDI RIBONUCLEOSIDI
MONOFOSFATOMONOFOSFATO PER FORMARE UNA CATENA PER FORMARE UNA CATENA MONOFOSFATOMONOFOSFATO PER FORMARE UNA CATENA PER FORMARE UNA CATENA
POLIRIBONUCLEOTIDICA.POLIRIBONUCLEOTIDICA.
I I PRECURSORI DELLA SINTESI SONO I PRECURSORI DELLA SINTESI SONO I
NUCLEOSIDI TRIFOSFATONUCLEOSIDI TRIFOSFATO..
L’ENERGIA CHE OCCORRE PER LA L’ENERGIA CHE OCCORRE PER LA
FORMAZIONE DEL FORMAZIONE DEL LEGAME LEGAME
FOSFODIESTERICOFOSFODIESTERICO È DATA È DATA
DALL’ELIMINAZIONE DEL DALL’ELIMINAZIONE DEL
PIROFOSFATO PER IDROLISI DEL PIROFOSFATO PER IDROLISI DEL LEGAME.LEGAME.
RNARNAnn + + rnPPPrnPPP = RNA= RNA(n+1)(n+1) + + ppppii
SI INDICA COME SI INDICA COME PROMOTOREPROMOTORE
IL SITO DEL DNA OVE SI IL SITO DEL DNA OVE SI
LEGA L’RNA POLIMERASILEGA L’RNA POLIMERASI
PRIMA PRIMA DIDI INIZIARE LA INIZIARE LA
TRASCRIZIONE!TRASCRIZIONE!TRASCRIZIONE!TRASCRIZIONE!
GENERALMENTE SOLO UNA DELLE DUE ELICHE GENERALMENTE SOLO UNA DELLE DUE ELICHE DIDI DNA VIENE COPIATADNA VIENE COPIATA
COME RNA. IL FILAMENTO CHE FUNGE DA STAMPO E’ DETTO COME RNA. IL FILAMENTO CHE FUNGE DA STAMPO E’ DETTO FILAMENTOFILAMENTO
SENSOSENSO, MENTRE L’ALTRO FILAMENTO (CHE AVRA’ SEQUENZA IDENTICA, MENTRE L’ALTRO FILAMENTO (CHE AVRA’ SEQUENZA IDENTICA
ALL’RNA ALL’RNA DIDI NEOSINTESI, A MENO DELLA T IN LUOGO DELL’U), E’ DETTONEOSINTESI, A MENO DELLA T IN LUOGO DELL’U), E’ DETTO
ANTISENSO ANTISENSO ((O NON SENSOO NON SENSO). ). UNO STESSO FILAMENTO PUO’ ESSEREUNO STESSO FILAMENTO PUO’ ESSERE
SENSO IN ALCUNI TRATTI ED ANTISENSO IN ALTRI!SENSO IN ALCUNI TRATTI ED ANTISENSO IN ALTRI! LA DIREZIONELA DIREZIONE
DIDI SINTESI DELL’RNA AVVIENE SEMPRE SECONDO L’ANDAMENTO 5’SINTESI DELL’RNA AVVIENE SEMPRE SECONDO L’ANDAMENTO 5’--3’!3’!DIDI SINTESI DELL’RNA AVVIENE SEMPRE SECONDO L’ANDAMENTO 5’SINTESI DELL’RNA AVVIENE SEMPRE SECONDO L’ANDAMENTO 5’--3’!3’!
NEI BATTERI LA RNA POLIMERASINEI BATTERI LA RNA POLIMERASI
E’ COSTITUITA DA UN E’ COSTITUITA DA UN CORECORE DIDI 4 SUBUNITA’4 SUBUNITA’
(2 SUBUNITA’ (2 SUBUNITA’ αααααααα, UNA , UNA ββββββββ ED UNA ED UNA ββββββββ’) [’) [APOENZIMAAPOENZIMA],],
CUI, ALL’INIZIO DELLA TRASCRIZIONE, SI LEGA CUI, ALL’INIZIO DELLA TRASCRIZIONE, SI LEGA
UNA QUINTA SUBUNITA’ (UNA QUINTA SUBUNITA’ ( ), A FORMARE), A FORMARE
TRASCRIONE NEI BATTERITRASCRIONE NEI BATTERI
UNA QUINTA SUBUNITA’ (UNA QUINTA SUBUNITA’ (σσσσσσσσ), A FORMARE), A FORMARE
L’L’OLOENZIMAOLOENZIMA. . SETsSETs SPECIFICI SPECIFICI DIDI PROMOTORIPROMOTORI
VENGONO RICONOSCIUTI DA SPECIFICHE VENGONO RICONOSCIUTI DA SPECIFICHE
SUBUNITA’ SUBUNITA’ σσσσσσσσ!!
STRUTTURA DEL PROMOTER PROCARIOTICOSTRUTTURA DEL PROMOTER PROCARIOTICO
PRIBNOW BOXPRIBNOW BOX
i)i) INIZIOINIZIO: RNA: RNA--POL POL (OLOENZIMA) SI LEGA(OLOENZIMA) SI LEGA
ALLA REGIONE PROMOTERALLA REGIONE PROMOTERFACENDO SI CHE LA DOPPIA FACENDO SI CHE LA DOPPIA
ELICA SI SEPARI. ELICA SI SEPARI. AVVIENE LA FORMAZIONE AVVIENE LA FORMAZIONE DELLA PRIMA COPPIA DELLA PRIMA COPPIA DIDI
BASI TRA IL DESOSSIRIB. BASI TRA IL DESOSSIRIB. +1 DEL FILAMENTO STAMPO +1 DEL FILAMENTO STAMPO
ED IL PRIMO RIBONUCL. ED IL PRIMO RIBONUCL. DELLA CATENA DELLA CATENA DIDI RNA RNA
NASCENTE. QUESTA FASE NASCENTE. QUESTA FASE NON NECESSITA NON NECESSITA DIDI ATP (AL ATP (AL
CONTRARIO DEGLI CONTRARIO DEGLI EUCARIOTI);EUCARIOTI);EUCARIOTI);EUCARIOTI);
ii)ii) ALLUNGAMENTOALLUNGAMENTO: LA : LA SUBUNITA’ SUBUNITA’ σσσσσσσσ SI STACCA SI STACCA
DALL’OLOENZIMA E DALL’OLOENZIMA E L’OLOENZIMA CONTINUA LA L’OLOENZIMA CONTINUA LA SUA ATTIVITA’ SUA ATTIVITA’ DIDI SINTESI SINTESI
IN DIREZIONE 5’IN DIREZIONE 5’--3’;3’;
iii)iii) FINEFINE: PUO’ ESSERE : PUO’ ESSERE ρρρρρρρρ--DIPENDENTE O DIPENDENTE O ρρρρρρρρ--INDIPENDENTE.INDIPENDENTE.
SPESSO GLI RNA (SPESSO GLI RNA (mRNAmRNA; ; tRNAtRNA ed ed rRNArRNA) DEI PROCARIOTI ) DEI PROCARIOTI
SONO SONO POLICISTRONICIPOLICISTRONICI, CIOE’ ALL’INTERNO , CIOE’ ALL’INTERNO DIDI UN UNICO UN UNICO
TRASCRITTO SONO CONTENUTE INFORMAZIONI PER LA TRASCRITTO SONO CONTENUTE INFORMAZIONI PER LA
CODIFICA CODIFICA DIDI PIU’ PROTEINE (PIU’ PROTEINE (mRNAmRNA), PIU’ ), PIU’ rRNArRNA O PIU’ O PIU’ tRNAtRNA! !
L’INTERA STRUTTURA GENICA POLICISTRONICA E’ DETTA L’INTERA STRUTTURA GENICA POLICISTRONICA E’ DETTA
OPERONEOPERONE!!
TRASCRIONE NEGLI EUCARIOTITRASCRIONE NEGLI EUCARIOTI
3 RNA3 RNA--POLIMERASIPOLIMERASI,, COSTITUITE DA UN COSTITUITE DA UN CORECOREENZIMATICO E DAENZIMATICO E DA FATTORI GENERALI FATTORI GENERALI DIDI
TRASCRIZIONETRASCRIZIONE OO GTFGTF. I . I GTFsGTFs DELLA POLIIDELLA POLII
SONO ALMENO 7: SONO ALMENO 7: TFIIATFIIA; ; TFIIBTFIIB; ; TFIIDTFIID; ; TFIIETFIIE; ;
TFIIFTFIIF; ; TFIIHTFIIH; ; TFIIJTFIIJ..TFIIFTFIIF; ; TFIIHTFIIH; ; TFIIJTFIIJ..
NOMENOME LOCAL. CELL.LOCAL. CELL. TIPO RNATIPO RNA SENSIBILITA’ SENSIBILITA’ αααααααα--AMANITINAAMANITINA
RNA POL IRNA POL I NucleoloNucleolo 45S (28S; 18S; 45S (28S; 18S; 5.8S 5.8S rRNArRNA))
--
RNARNA POL IIPOL II NucleoplasmaNucleoplasma mRNAmRNA;; snRNAsnRNA; ; snoRNAsnoRNA; ; miRNAmiRNA
++++++
RNARNA POL IIIPOL III NucleoplasmaNucleoplasma tRNAtRNA; 5S ; 5S rRNArRNA; ; scRNAscRNA;; alcuni alcuni snRNAsnRNA
++
PromotorePromotoregeni codificantigeni codificanti
proteine!proteine!
GENE EUCARIOTICOGENE EUCARIOTICO
proteine!proteine!
STRUTTURA DEL PROMOTER DEI GENI STRUTTURA DEL PROMOTER DEI GENI
EUCARIOTICI CODIFICANTI PROTEINEEUCARIOTICI CODIFICANTI PROTEINE
NOTANOTA: ESISTONO: ESISTONO
ANCHE PROMOTERSANCHE PROMOTERS
TATA LESSTATA LESS
TBP
Saddle-likedomain
TATA BOX BINDING PROTEIN
TATA BOX
DNABINDING
TAF1: Acetyl TAF1: Acetyl transferase transferase
TAF5 TAF5 stabilizesstabilizesTAFsTAFs interactioninteraction, , speciallyspecially histonehistone--likelike onesones (TAF6, (TAF6,
TAF9)TAF9)
TAF3TAF3
TAF10TAF10
TAF6TAF6TAF11TAF11
TAF12TAF12
TAF4TAF4
TATA BOXTATA BOX
TBPTBPTAF5TAF5
TAF10TAF10
TAF8TAF8
TAF5TAF5TAF4TAF4
TAF12TAF12TAF13TAF13TAF9TAF9 TAF3
TAF3TAF11TAF11
TAF6TAF6TAF13TAF13 TAF9TAF9
TAF8TAF8
TAF7TAF7
TAF1: Acetyl TAF1: Acetyl transferase transferase
activityactivityInteraction with Interaction with
TFIIFTFIIF
DNA BENDINGDNA BENDING
TFIIDTFIIDTFIIDTFIID
TFIIDTFIIDTFIIATFIIA
TFIIBTFIIB
DABDAB
TFIIFTFIIF
TFIIETFIIE
TFIIHTFIIH
HETEROTRIMERHETEROTRIMER(A, B, C SUBUNITS)(A, B, C SUBUNITS)BINDS PROMOTER BINDS PROMOTER REGION WITH TFIIDREGION WITH TFIID
TFIIE MODULATES TFIIE MODULATES THE HELICASE AND THE HELICASE AND
HETEROTETRAMERHETEROTETRAMER(RAP30)(RAP30)2 2 (RAP74) (RAP74) 2 2
(RAP30)(RAP30)2 2 BINDS RNA POL II BINDS RNA POL II AND TFIIB. RAP74 INTERACTS AND TFIIB. RAP74 INTERACTS
WITH DNA. TFIIF WITH DNA. TFIIF STABILIZES THE STABILIZES THE INTERACTION OF INTERACTION OF RNA POLII WITH RNA POLII WITH
PROMOTER AND STIMULATES PROMOTER AND STIMULATES ELONGATION RATEELONGATION RATE
TWO DOMAIN:TWO DOMAIN:
NN--TERMINAL TERMINAL
ZnZn--RIBBON RIBBON ANDAND
CORE DOMAINCORE DOMAIN
TFIIB INTERACTS WITH TFIIB INTERACTS WITH SADDLESADDLE--LIKE DOMAIN OF LIKE DOMAIN OF TBP AND WITH BENDED DNA TBP AND WITH BENDED DNA ON SIDES OF TATA BOX.ON SIDES OF TATA BOX.TBP/TFIIB COMPLEX TBP/TFIIB COMPLEX RECRUITS RNA POLII AND RECRUITS RNA POLII AND OTHER GTFOTHER GTF
KINASE KINASE ACTIVITIESOF TFIIHACTIVITIESOF TFIIHBY STIMULATING CTD BY STIMULATING CTD DOMAIN RNA POLII DOMAIN RNA POLII PHOSPHORYLATIONPHOSPHORYLATION
TFIIH TFIIH STIMULATES STIMULATES PROMOTER PROMOTER
MELTING AND IT MELTING AND IT HAS KINASE HAS KINASE ACTIVITY ACTIVITY
AGAINST RNA AGAINST RNA POL IIPOL II
PP
PHOSPHORYLATION OF PHOSPHORYLATION OF RNA POLII CTD RNA POLII CTD
STIMULATES PROMOTER STIMULATES PROMOTER MELTING AND MELTING AND
TRANSCRIPTION STARTTRANSCRIPTION START
ENHANCERENHANCER È IL TERMINE USATO PER DEFINIRE È IL TERMINE USATO PER DEFINIRE SPECIFICHE SEQUENZE SPECIFICHE SEQUENZE DIDI DNA IN GRADO DNA IN GRADO DIDIAUMENTARE L'EFFICACIA DEI PROMOTORI AUMENTARE L'EFFICACIA DEI PROMOTORI
NELL'ATTIVAZIONE DELLA TRASCRIZIONENELL'ATTIVAZIONE DELLA TRASCRIZIONE. GLI . GLI ENHANCER SVOLGONO IL LORO RUOLO ATTRAVERSO ENHANCER SVOLGONO IL LORO RUOLO ATTRAVERSO L'ASSOCIAZIONE CON DIVERSE PROTEINE, TRA CUI L'ASSOCIAZIONE CON DIVERSE PROTEINE, TRA CUI DIVERSI FATTORI COINVOLTI NELL'AVVIO DELLA DIVERSI FATTORI COINVOLTI NELL'AVVIO DELLA
TRASCRIZIONE STESSA.TRASCRIZIONE STESSA.
NEI GENI DEGLI EUCARIOTI GLI NEI GENI DEGLI EUCARIOTI GLI ENHANCERS ENHANCERS POSSONO DISTARE DALLA REGIONE CODIFICANTE POSSONO DISTARE DALLA REGIONE CODIFICANTE
ANCHE PIÙ DI 50 KBANCHE PIÙ DI 50 KB..
IL IL SILENCERSILENCER È UNA SEQUENZA DI DNA IN GRADO DI È UNA SEQUENZA DI DNA IN GRADO DI
LEGARE DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE DETTI LEGARE DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE DETTI
REPRESSORI. QUANDO IL SILENCER È LEGATO DAL REPRESSORI. QUANDO IL SILENCER È LEGATO DAL
REPRESSORE, L’RNA POLIMERASI NON È IN GRADO DI REPRESSORE, L’RNA POLIMERASI NON È IN GRADO DI REPRESSORE, L’RNA POLIMERASI NON È IN GRADO DI REPRESSORE, L’RNA POLIMERASI NON È IN GRADO DI
INIZIARE LA TRASCRIZIONE. INIZIARE LA TRASCRIZIONE.
TERMINAZIONE DELLA TRASCRIZIONETERMINAZIONE DELLA TRASCRIZIONE
NEI GENI EUCARIOTICINEI GENI EUCARIOTICI
MATURAZIONE DELL’MATURAZIONE DELL’mRNAmRNA
i)i) CAPPINGCAPPING
ii)ii) METILAZIONEMETILAZIONE
iii)iii) POLIADENILAZIONEPOLIADENILAZIONEiii)iii) POLIADENILAZIONEPOLIADENILAZIONE
iv)iv) SPLICINGSPLICING
v)v) EDITINGEDITING
5’ capping
7’methyl guanylate
i) 5’i) 5’-- CAPPINGCAPPING
Legame 5’ – 5’
Metilazione del 2’C
PROTEZIONE E STABILIZZAZIONE DEGLI PROTEZIONE E STABILIZZAZIONE DEGLI
mRNA, TRASPORTO DAL NUCLEO AL mRNA, TRASPORTO DAL NUCLEO AL
PRINCIPALI FUNZIONI DEL 5’PRINCIPALI FUNZIONI DEL 5’-- CAPPINGCAPPING
CITOSOL, INIZIO DELLA TRADUZIONE.CITOSOL, INIZIO DELLA TRADUZIONE.
iiii) POLIADENILAZIONE) POLIADENILAZIONE
NOTANOTA: ALCUNI : ALCUNI hnRNAhnRNA (Es.:(Es.:
QUELLI DEI GENI CODIFICANTIQUELLI DEI GENI CODIFICANTI
QUESTA SEQUENZA SI TROVA A QUESTA SEQUENZA SI TROVA A CACA. . --10/10/--35 RISPETTO AL SITO 35 RISPETTO AL SITO DIDI POLIADENILAZIONEPOLIADENILAZIONE
QUELLI DEI GENI CODIFICANTIQUELLI DEI GENI CODIFICANTI
GLI ISTONI) NON HANNO UNAGLI ISTONI) NON HANNO UNA
CODA CODA DIDI POLIPOLI--A!A!
DAPPRIMA I CLEAVAGE FACTORSDAPPRIMA I CLEAVAGE FACTORS
TAGLIANO A 10/35 NT. A VALLE DELLATAGLIANO A 10/35 NT. A VALLE DELLA
SEQUENZA AAUAAA, QUINDI I CPF (CLEAVAGE AND POLYADENILATION FACTORS)SEQUENZA AAUAAA, QUINDI I CPF (CLEAVAGE AND POLYADENILATION FACTORS)
CONSENTONO ALLA POLI(A) POLIMERASI CONSENTONO ALLA POLI(A) POLIMERASI DIDI RICONOSCERE LA RICONOSCERE LA SEQSEQ. AAUAAA E . AAUAAA E DIDI ADD. LE “A” !ADD. LE “A” !
PRINCIPALI FUNZIONI DELLAPRINCIPALI FUNZIONI DELLA
POLIADENILAZIONEPOLIADENILAZIONE
LA CODA DI POLI A CONTRIBUISCELA CODA DI POLI A CONTRIBUISCE
IN MODO MOLTO IMPORTANTE ALLA IN MODO MOLTO IMPORTANTE ALLA
STABILITA’ DEGLI STABILITA’ DEGLI mRNAmRNA ED ED
ALL’INCREMENTO DELLA EFFICIENZAALL’INCREMENTO DELLA EFFICIENZA
TRADUZIONALE!TRADUZIONALE!
iiiiii) SPLICING) SPLICING
PROCESSO ATTRAVERSO CUI VENGONO ELIMINATI GLI INTRONI.PROCESSO ATTRAVERSO CUI VENGONO ELIMINATI GLI INTRONI.
IL COMPLESSO RIBONUCLEOPROTEICO (FATTO DA IL COMPLESSO RIBONUCLEOPROTEICO (FATTO DA snRNAsnRNA + PROTEINE,+ PROTEINE,
A FORMARE LE A FORMARE LE snRNPssnRNPs) ADIBITO AL CONTROLLO DELLO SPLICING) ADIBITO AL CONTROLLO DELLO SPLICING
PRENDE NOME PRENDE NOME DIDI SPLICEOSOMASPLICEOSOMA!!
LA RIMOZIONE LA RIMOZIONE DIDI UN INTRONE AVVIENE UN INTRONE AVVIENE
ATTRAVERSO DUE REAZIONI ATTRAVERSO DUE REAZIONI
SEQUENZIALI SEQUENZIALI DIDI TRASFERIMENTO TRASFERIMENTO DIDI
FOSFATO, NOTE COME FOSFATO, NOTE COME
TRANSESTERIFICAZIONI.TRANSESTERIFICAZIONI.
QUESTE UNISCONO DUE ESONI QUESTE UNISCONO DUE ESONI
RIMUOVENDO L’INTRONE COME UN RIMUOVENDO L’INTRONE COME UN
“CAPPIO”“CAPPIO”
L’ELIMINAZIONE DEGLIL’ELIMINAZIONE DEGLI
INTRONI PREVEDE LA FORMAZIONEINTRONI PREVEDE LA FORMAZIONE
DIDI UNA STRUTTURA A CAPPIOUNA STRUTTURA A CAPPIO
DETTA “DETTA “LARIATLARIAT”.”.
Lo Lo splicingsplicing avvieneavviene ad opera ad opera dellodello spliceosomaspliceosoma, , costituitocostituito dada snRNPssnRNPs ((small nuclear small nuclear
ribonucleoproteinribonucleoprotein particlesparticles) ) formatiformati dada snRNAsnRNAe e proteineproteine..
SPLICING ALTERNATIVOSPLICING ALTERNATIVO
(4 (4 exonsexons))
PERMETTE LA FORMAZIONE PERMETTE LA FORMAZIONE DIDI TRASCRITTI MATURI DIVERSITRASCRITTI MATURI DIVERSI
A PARTIRE DA UNO STESSO A PARTIRE DA UNO STESSO hnRNAhnRNA
cell
1ce
ll 1
cell
2ce
ll 2
tissue specifictissue specific
ALTRI MECCANISMI CHE PRODUCONO FORMEALTRI MECCANISMI CHE PRODUCONO FORME
ALTERNATIVE ALTERNATIVE DIDI TRASCRITTI, PARTENDO TRASCRITTI, PARTENDO
DALL’INFORMAZIONE CONTENUTA IN UNO STESSO DALL’INFORMAZIONE CONTENUTA IN UNO STESSO
GENE SONO:GENE SONO:
i) i) RICONOSCIMENTO RICONOSCIMENTO DIDI SITI SITI DIDI INIZIO DELLA INIZIO DELLA i) i) RICONOSCIMENTO RICONOSCIMENTO DIDI SITI SITI DIDI INIZIO DELLA INIZIO DELLA TRASCRIZIONE ALTERNATIVA TRASCRIZIONE ALTERNATIVA (Es.: GENE PER IL (Es.: GENE PER IL GnRHGnRH-- GonadotropinGonadotropin Releasing HormoneReleasing Hormone-- CHE PRESENTA DUECHE PRESENTA DUETRASCRITTI DIVERSI, UNO A LIVELLO IPOTALAMICOTRASCRITTI DIVERSI, UNO A LIVELLO IPOTALAMICO
ED UNO A LIVELLO ED UNO A LIVELLO DIDI PLACENTA ED ALTRI TESSUTI. ILPLACENTA ED ALTRI TESSUTI. ILSECONDO SITO SECONDO SITO DIDI INIZIO SI TROVA A INIZIO SI TROVA A --579 E DIPENDE 579 E DIPENDE
DA UN SECONDO PROMOTORE);DA UN SECONDO PROMOTORE);
iiii) ) SEGNALI SEGNALI DIDI TERMINAZIONE DELLA TRASCRIZIONE TERMINAZIONE DELLA TRASCRIZIONE ALTERNATIVIALTERNATIVI
STRUTTURA DELL’ STRUTTURA DELL’ hnRNAhnRNA
7mGppp7mGpppCapCap
5’5’ 5’ untranslated region5’ untranslated region AUGAUGinitiationinitiation
translated regiontranslated region
3’ untranslated region
UGA
termination
(A)~200poly(A) tail
3’ untranslated region termination
3’AAUAAAAAUAAA
polyadenylation signal
• all mRNAs have a 5’ cap and all mRNAs (with the exceptionof the histone mRNAs) contain a poly(A) tail
• the 5’ cap and 3’ poly(A) tail prevent mRNA degradation• loss of the cap and poly(A) tail results in mRNA degradation
MATURAZIONE DEGLI MATURAZIONE DEGLI rRNArRNA E E tRNAtRNA
I GENI PER GLI I GENI PER GLI rRNArRNA 18S, 5.8S E 28S IN H. sapiens SONO 18S, 5.8S E 28S IN H. sapiens SONO RAGGRUPPATI IN CLUSTER. TALI UNITA’ SONO RIPETUTE RAGGRUPPATI IN CLUSTER. TALI UNITA’ SONO RIPETUTE IN TANDEM CIRCA 250 VOLTE E DISTRIBUITE SU 10 ANSE IN TANDEM CIRCA 250 VOLTE E DISTRIBUITE SU 10 ANSE CROMOSOMICHE LOCALIZZATE SUI BRACCI CORTI DEI CHR.CROMOSOMICHE LOCALIZZATE SUI BRACCI CORTI DEI CHR.
ACROCENTRICI 13, 14, 15, 21 E 22.ACROCENTRICI 13, 14, 15, 21 E 22.
I GENI PER I I GENI PER I tRNAtRNA SONO ORGANIZZATI IN GRUPPISONO ORGANIZZATI IN GRUPPI
E, IN CIASCUN CLUSTER, CIASCUN GENE E’ SEPARATOE, IN CIASCUN CLUSTER, CIASCUN GENE E’ SEPARATO
DAI GENI VICINI DA SPAZIATORI INTERGENICI.DAI GENI VICINI DA SPAZIATORI INTERGENICI.
IL IL PREPRE--tRNAtRNA DEVE PERDERE ALCUNE DEVE PERDERE ALCUNE SEQSEQ. AL 5’ E 3’ E,. AL 5’ E 3’ E,
IN ALCUNE SPECIE DEVE AVVENIRE ANCHE UN SELFIN ALCUNE SPECIE DEVE AVVENIRE ANCHE UN SELF--
SPLICING SPLICING DIDI UN INTRONE.UN INTRONE.
ALTRI EVENTI MATURATIVI RIGUARDANO ESSENZIALMENTEALTRI EVENTI MATURATIVI RIGUARDANO ESSENZIALMENTE
LA MODIFICA LA MODIFICA DIDI ALCUNE BASI E L’AGGIUNTA AL 3’ DELLAALCUNE BASI E L’AGGIUNTA AL 3’ DELLA
SEQUENZA 5’SEQUENZA 5’--CCACCA--3’ 3’ AD OPERA DELLA AD OPERA DELLA tRNAtRNA NUCLEOTIDIL NUCLEOTIDIL
TRANSFERASI.TRANSFERASI.