Protocolli clinici: come scriverli? XML presupposto per l’interoperabilità delle conoscenze...

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Protocolli clinici: come scriverli? XML presupposto per l’interoperabilità delle conoscenze cliniche Daniela Luzi, Fabrizio L. Ricci CNR-IRPPS, Roma Laura Collada Alì, Paola Fazi, Marco Vignetti Dip. Ematologia, Università La Sapienza, Roma

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Protocolli clinici: come scriverli? XML presupposto per l’interoperabilità delle

conoscenze cliniche

Daniela Luzi, Fabrizio L. RicciCNR-IRPPS, Roma

Laura Collada Alì, Paola Fazi, Marco VignettiDip. Ematologia, Università La Sapienza, Roma

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Definizione di un sperimentazione clinica (clinical trial)

“ qualsiasi studio sull’uomo finalizzato a scoprire o verificare

• gli effetti clinici, farmacologi e/o altri effetti farmacodinamici di uno o più medicinali sperimentali, • e/o individuare qualsiasi reazione avversa ad uno o più medicinali sperimentali• e/o a studiarne l’assorbimento, la distribuzione, il metabolismo e l’eliminazione

con l’obiettivo di accertarne la sicurezza e/o l’efficacia. “

D.L. 24 giugno 2003, n. 211

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Definizione di protocollo

“il documento in cui vengono descritti l’obiettivo o gli obiettivi, la progettazione, la metodologia, gli aspetti statistici e l’organizzazione della sperimentazione, il termine “protocollo” comprende il protocollo, le versioni successive e le modifiche delle stesse”

D.L. 24 giugno 2003, n. 211

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Normativa di riferimento

The European Agency for the Evaluation of Medical ProductsGuideline for Good Medical Practice, 1996

Direttiva 2001/20/CE del Parlamento Europeo e del Consiglio del 4 aprile 2001 concernente il ravvicinamento delle disposizioni legislative, regolamentari e amministrative degli Stati membri relativi all’applicazione della buona pratica clinica nell’esecuzione della sperimentazione clinica di medicinali ad uso umano

DL nr. 211 del 24 giugno 2003: Attuazione della direttiva europea

Requisiti in campo etico e scientifico

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Fasi della sperimentazione

Sperimentazionepreclinica

Animale

Sperimentazione clinica

Fase 1

Genere umano

Fase 2 Fase 3

Studi postregistrativi

Registrazione

Fase 4

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• l’adozione di stesse procedure di cura

• per gruppi di pazienti affetti da una determinata patologia• trattati dai diversi centri che partecipano alla sperimentazione

• l’adozione di stesse procedure di valutazione dei risultati, predefinite a priori

IMPORTANZA DEL PROTOCOLLO

Pianificazione e descrizione del processo terapeutico e diagnostico

Corretta valutazione della sperimentazione dipende da:

Pianificazione e descrizione di procedure di rilevazione dei dati

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Elaborazione del protocollo

• coinvolge più attori, centri e competenze (sperimentatore, statistico, writing committee, etc...)• soggetto a ripetute revisioni sia in fase di scrittura, che in fase di approvazione (ad es. comitati etici)• può avere più versioni• importante anche lo stato del protocollo (arruolamento, in corso, chiuso) • collegamento con altri documenti (CRF e allegati)

Dal punto di vista della diffusione

• disponibilità per i centri che partecipano alla sperimentazione

• “viste” diverse del protocollo per altri potenziali utenti (medico generico, pazienti)

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Outline proposal definition

Outline proposal evaluation

Definition of writing planning of clinical trial proposal

Full definition of clinical trial proposal

Evaluation of clinical trial proposal

acceptance

refusal

change

change

send

planning definition

send

ready

Writing of single section Revision of single section

Final version of singe section

discussion

acceptance

change

Writing of single section

Ciclo di scrittura del protocollo

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Perché un sistema di aiuto alla scrittura?

• Migliorare la qualità della sperimentazione clinica:

• correttezza formale e rispetto degli standard• coerenza tra il protocollo e il processo di sperimentazione• coerenza tra le sperimentazioni dei singoli centri

• Riduzione dei tempi di scrittura del protocollo

• Migliorare la diffusione e il trasferimento dei risultati • Ottenere un quadro aggiornato delle sperimentazioni

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• Permettere cambiamenti nella struttura del testo

• Garantire l’uniformità e la consistenza del testo

• Modello delle connessioni tra le diverse sezioni

Requisiti del sistema

Analisi delle sezioni

• Facilitare la co-operazioneDefinizione delle

strategie di scrittura• Riuso del testo• Gestione delle informazioni

collegate al altre fonti (i.e. cartella clinica)

• Definizione delle diverse “viste” del protocollo

Definizione di aiuti alla scrittura

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Metodologia• analisi della struttura di protocolli clinici

• identificazione della struttura “tipo” e di quella collegata alla fase dello studio• suddivisione in paragrafi e sottoparagrafi

• analisi semantica • individuazione del contenuto informativo di ciascun paragrafo• individuazione dei collegamenti logico- semantici, (dipendenze, congruenze, ...)• collegamenti logico-temporali• Analisi del processo come verifica delle

informazioni contenute nel protocollo

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1 2 3

4

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9

5

10 11 12 1413

protocols

references

WF library

list of addresss

uses

equivalence

equivalenceequivalence

equivalence

equivalence

knowsknows

standarddescription

standarddescription

library

standarddescription

library

standarddescription

library

standarddescription

library

15

bound

boundbound

uses

uses

usesuses

uses

uses uses

uses

uses

knows

knows

knowsknows

knows

step1

step2

La rete semantica semplificata

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write § 2,7,8,13

write § 1

write § 3,4

write § 5

write § 6

write § 10

write § 5

write § 9

write § 11

write § 14

write § 15

write § 16

write § 22

write § 17

write § 21

write § 20

write § 18

write § 12

Time scheduling di scrittura del protocollo

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Implementazione del sistema WITH

Integrazione di:

RDBMSXML

• strutturazione del testo• rete semantica• interoperabilità• diffusione

• archivio di protocolli• ricerca• riuso• viste utente

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Alcuni esempi XML

<ElementType name="ProtocolTitle" content="mixed">  <attribute type="macros" default="PatologyAcronym,PatologyName,FarmacusName" /> ………  </ElementType>

<ElementType name="PatientRegistration" content="eltOnly">………  <element type="text" />   <element type="nestedpara" minOccurs="0" maxOccurs="*" />   </ElementType> <ElementType name="nestedpara" content="eltOnly">………  <element type="title" />   <element type="text" />   <element type="nestedpara" minOccurs="0" maxOccurs="*" />   </ElementType>

Suddivisione in paragrafi

Titolo

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Modulo di ricerca

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Inserimento dei farmaci

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Inserimento delle informazioni chiave

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Modulo di inserimento

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ConclusioniIl sistema WITH garantisce:

• la standardizzazione del processo

• la gestione del processo • l’efficiente diffusione delle informazioni necessarie alle varie fasi componenti il ciclo di vita della sperimentazione clinica

La scrittura collaborativa