ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare...

22

Transcript of ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare...

Page 1: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 2: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 3: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 4: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 5: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 6: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 7: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 8: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

ISTRUZIONI PER L’USO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO

Utilizzare controlli appropriatiVerificare l’inibizione dell’espressione del bersaglioUtilizzare le minime concentrazioni necessarie a inibire il bersaglioNon utilizzare oligonucleotidi contenenti 4 residui di guanina contiguiNon utilizzare oligonucleotidi contenenti un motivo CpG non modificato (negli esperimenti con gli animali)

Page 9: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

PROBLEMI LEGATI ALL’USO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO

Stabilità biologicaTargeting cellulareUptake cellulareEfflusso dagli endosomi

Page 10: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 11: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

APTAMERI

• Sequenze oligonucleotidiche (ssDNA o ssRNA) o peptidiche relativamente brevi (12-30 nucleotidi o aminoacidi)

• In vivo assumono strutture tridimensionali specifiche in grado di legarsi con elevata affinità (range nM/pM) alle proteine bersaglio

Page 12: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

SELEX systematic evolution of ligands by exponential enrichment

Page 13: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 14: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

APTAMERI vs. ANTICORPI

• Maggiore stabilità• Non immunogenici• Ridotta variabilità da un lotto all’altro• Piccole dimensioni migliore penetrazione clearance più rapida• possibilità di modificarne la struttura, p.e.

per migliorare la stabilità o alterarne le proprietà PK

Page 15: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

MACUGEN® (pegaptanib sodio)

• Primo aptamero approvato, nel dicembre 2004, per l’uso clinico nella degenerazione maculare senile (AMD)

• ssRNA costituito da 28 nucleotidi, specifico per una delle 6 isoforme di VEGF

• Modificato a livello dello zucchero per aumentare la resistenza alle nucleasi

• aggiunta covalente di due molecole di PEG (20 kD ca.) per aumentare t½

Page 16: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.
Page 17: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

MACUGEN® (pegaptanib sodio)

Page 18: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

APTAMERI nella terapia dei tumori

• GB10: DNA aptamero che si lega alla tenascina C

• aptameri peptidici diretti vs. le regioni di dimerizzazione e di legame al DNA di STAT3

• AS1411: ssDNA 26-mero ricco di guanosina, forma un complesso con la nucleolina e il fattore modulatore essenziale di NFκB (NEMO)

Page 19: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

Copyright ©2006 American Association for Cancer Research

Page 20: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

Effetto in vitro di AS1411

IC50

~1.1

Page 21: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

Effetto in vivo di AS1411

Page 22: ISTRUZIONI PER LUSO DEGLI OLIGONUCLEOTIDI ANTISENSO Utilizzare controlli appropriati Verificare linibizione dellespressione del bersaglio.

AS1411

• Studi tossicologici pre-clinici:nessuna tossicità nel ratto e nel cane

• Studi clinici (fase I) in NSCLC e carcinomi renali