Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed · 2011-10-18 · fonti e Pubmed...

Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse,

fonti e PubmedMATERIALE DIDATTICO A CURA DI:

G. GRILLOBiblioteca “A. Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie

<[email protected]>

Didattica Integrativa Corso di Laurea triennale in DIETISTICATorino, 17 ottobre 2011

http://www.lsmolinette.unito.it/biblioteca/biblioteca.htmhttp://www.lsmolinette.unito.it/biblioteca/biblioteca.htm


Banche dati

I database: definizione

La gestione dell’informazione è lo scopo principale di un database:è un insieme di descrizioni standard, strutturate e organizzate, accessibile all'utenza attraverso interfacce che ne permettano l'interrogazione e il recupero di dati

Una tabella di database

• Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record (righe) in orizzontale

Relazione tra tabelle

• Esempio di database relazionale, in cui le tabelle sono collegate tra loro

2 tipi principali di DB

• Bibliografici (METADATI)• Fattuali o full text (DATI)• …ma: occhio all’integrazione!!

Ricercare in un database bibliografico

• Vanno distinti:– la struttura del database– il software di IR (= information

retrieval, recupero dell’informazione)

Cosa sono i database bibliografici?

• In un database bibliografico i dati sono divisi in campi e record

• I record rappresentano le citazioni bibliografiche che derivano dallo spoglio di articoli di riviste prese in considerazione dal database

• Per ogni articolo viene prodotta una citazione bibliografica che comprende una serie di elementi (metadati). Questi riferimenti bibliografici sono relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente periodici)

Le singole citazioni bibliografiche sono organizzate in campi (Autore, titolo, rivista …)

CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health

Caratteristiche della banca dati:

Prodotto dall’American Nurses Association e dalla National League for Nursing

E’ la principale banca dati per le scienze infermieristiche ed affini

Parte dal 1981

Indicizza non solo riviste (quasi 3.000), ma anche libri, materiale audiovisivo,

tesi, atti di convegni...

Ha un proprio tesauro(Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del

MEDLINE; gli altri termini sono specifici per l’infermieristica e le scienze alleate)

Dal 1 gennaio 2009 è accessibile tramite la piattaforma EBSCOhost

CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health

Le varie specialitàdell’infermieristica:

ChirurgiaChirurgia plasticaFisioterapia e riabilitazioneGastroenterologiaGinecologiaNutrizione e dieteticaOncologia

Discipline collaterali:

Assistenza medicaOptometriaPediatria Pronto soccorsoServizio socialenella cura della saluteTecnica radiologicaTerapia occupazionaleTecnica chirurgica

LA RICERCA BIBLIOGRAFICA IN DUE PASSAGGI

PROGETTAZIONE

quesito scomposizione

parole chiave PICO

operatori booleaniconcatenazione delle parole

STRATEGIA

database quale utilizzare?

i tesauri il MESH e non solo

la ricerca per voce di tesauro /termine libero

i sottodescrittori da quale punto di vista affrontare l’argomento cercato

Focus/explode le voci di soggetto principali, l’inclusione delle diramazioni secondarie di un soggettoi limiti e tipi di pubblicazione

fase preliminareFocalizzare il problemaScomporlo in termini essenzialiTradurre i termini in inglese

esecuzioneCercare i termini MESH che rappresentano i concetti e i subheadingrelativi ad ogni termine

Combinare i termini scegliendo gli operatori booleani adeguati

LA PROGETTAZIONEquesito scomposizione

Il modello PICO : Patient group(s)Intervention treatmentComparisonOutcome

In EBM viene richiesta la capacità di trasformare lo scenario o caso clinico in domande (quesiti clinici) correttamente formulate. Saranno caratterizzate dalla peculiarità di:•Essere centrate sul paziente•Generare risposte appropriate e preciseI quesiti clinici dovrebbero contenere 4 elementi:

LA PROGETTAZIONEParole chiave PICO

“TRADURRE” il PICOPatient and Problem

Come descriveresti un gruppo di pazienti simili a colui che stai trattando? Quali sono le principali caratteristiche del paziente? Considera il problema primario, ma anche condizioni correlate: età, sesso, talvolta il gruppo sociale o etnico a cui appartiene, la sua storia personale. (es: è un fumatore? è stato esposto a sostanze tossiche? etc.)

InterventionQuale intervento fondamentale stai per prendere in considerazione? Prescrizione di un farmaco? di un test diagnostico? di un intervento chirurgico? Quali altri fattori possono influenzare la prognosi del paziente (vedi sopra)?

OutcomeChe cosa vuoi ottenere, misurare, migliorare o modificare? Cosa stai cercando di fare per il tuo paziente? Ridurre il numero di eventi avversi? Migliorare i risultati funzionali?

ComparisonQuali sono le alternative prinicipali all’intervento preso in esame? Stai per scegliere tra due farmaci, un farmaco ed un placebo, due test diagnostici?Non sempre è presente un paragone specifico

MEDLINECaratteristiche della banca dati:

Parte dal 1950, prodotto dalla National Library of Medicine

Indicizza solo articoli di riviste (5.197 riviste biomediche internazionali, 80% del contenuto in lingua inglese)

Settori: Medicine, Biology,Environmental science, Marine biology, Plant and animal, science, Biophysics, Chemistry, Nursing, Dentistry, Veterinarymedicine, Allied health, Pre-clinical sciences

Thesaurus:MESH (Medical Subject Headings della NLM)

LA STRATEGIAdatabase quale utilizzare

Le pubblicazioni specifiche di una disciplina vengono recensite o indicizzate e successivamente raccolte in un repertorio bibliografico (cartaceo: soggetti-autore; elettronico: database) che ne agevola il ritrovamento.

Il metodo più efficace per interrogare un repertorio bibliografico è l’utilizzo di parole chiave (o termini di soggetto) che formano un tesauro (o soggettario): vocabolario controllato con l’abolizione dei sinonimi in cui le varie voci sono strutturate tra loro in una rete di relazioni gerarchiche: “struttura ad albero”

Nell’ambito delle scienze mediche ed infermieristiche il repertorio principale è:

MEDLINE (due versioni: Pubmed gratuito http://www.pubmed.gov Ovid a

pagamento)

N.B. Per l’accesso al testo pieno, al catalogo e ad altri serviziricordarsi l’integrazione con

LA STRATEGIAI tesauri il MeSH e non solo

Thesaurus livello ottimale di controllo, consente univocitànei termini di ricerca

Ricerca libera sconsigliabile in genere poiché riduce il controllo. Implica una ricerca in tutti i campi [Tag] (TIAB, Text Word, MeSH Terms, etc.)

IMPORTANTE!La ricerca può anche essere effettuata tramite parole troncate,

in questo caso il sistema ricerca tutti i termini che iniziano con la stringa data, es.: inserendo: bacter*

il sistema ritrova bacteria, bacterium, bacterophage etc…

LA STRATEGIALa ricerca per voce di tesauro e/o

termine libero

Gli indicizzatori possono anche assegnare un ulteriore elemento descrittivoad un termine MeSH: i subheadings o sottodescrittori.

La loro funzione è di dettagliare ulteriormente un aspetto specifico di un termine MeSH.

Es.:DiagnosisSurgery

MetabolismPathology

LA STRATEGIAI sottodescrittori da quale punto di vista

affrontare l’argomento cercato

•Età•Specifici sottoinsiemi (subsets: systematic reviews…)•Tipo di pubblicazione•Lingua•Data•Altro…

LA STRATEGIAi limiti

Tra i vari generi di pubblicazioni utilizzati dalla National Library of Medicine per la recensione del materiale bibliografico (e utilizzabili come limiti nella ricerca) , ricordo i principali:

Clinical Trial rapporto di uno studio clinico pre-organizzato sulla sicurezza, efficacia o dosaggio ottimale di uno o più farmaci, dispositivi o tecniche diagnostiche terapeutiche o profilattiche in esseri umani selezionati in base a criteri predeterminati di idoneità e osservati per verificare l’evidenza di effetti favorevoli o sfavorevoli.

Controlled Clinical Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che implica uno o piùtrattamenti di prova, almeno un trattamento di controllo, misure specifiche dei risultati per valutare l’intervento e una metodologia priva di pregiudizi finalizzata ad assegnare i pazienti al trattamento.

Meta-Analysis lavoro che consiste in studi che utilizzano un’analisi quantitativa per combinare i risultati di studi indipendenti e riassunti e conclusioni che possono essere usati per valutare l’efficacia terapeutica.

Practice Guideline lavoro che consiste in un insieme di direttive o principi per indirizzare il personale medico in decisioni sanitarie circa le procedure diagnostiche, terapeutiche o cliniche da adottare in specifiche circostanze cliniche. Possono essere sviluppate da agenzie governative a qualunque livello, istituzioni quali società professionali o comitati governativi.

Randomized Controlled Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che include fasi specifiche e preordinate di gestione dello stesso.

Revisione sistematica differiscono dalle revisioni tradizionali della letteratura in quanto riuniscono risultati di tutti gli studi clinici condotti su un determinato argomento, ottenendo una stima basata su un numero maggiore di soggetti, quindi statisticamente più stabile e clinicamente più affidabile.

LA STRATEGIAtipi di pubblicazione

RISORSE A PAGAMENTOACCESSO DA CASA

http://proxy-medicina.unito.it

TROVA@UNITO E PUBMEDCome posso accedere ai servizi di trova@unito ?Collegarsi a Pubmed da link presenti su pc universitarioppure da casa tramite proxyhttp://proxy-medicina.unito.itinserendo le proprie credenziali SCU:

tutorial e FAQ strumenti risorse utili

La ricerca per parole “libere”inserendo le parole della ricerca, Pubmed procede con la funzione di completamento automatico, suggerendo i termini

Sulla destra della schermata trovo gli esiti della ricerca:

selezionando gli articoli, posso gestirli in vario modo, posso (cliccando su send to): mandare le citazioni in un file, mandarle in una collection virtuale all’interno di MY NCBI, mandarle nel “clipboard”=parcheggio temporaneo (max 8 ore) di citazioniinviarle via mail

Sulla sinistra della schermata trovo:

La possibilità di gestire i risultati e di filtrarli

La possibilità di capire come il sistema hainterpretato la mia ricerca

La possibilità di visualizzarele ultime ricerche effettuate

Come Pubmed ha interpretato la ricerca – tramite parole libere - di

hospital infections:

"cross infection"[MeSH Terms] OR ("cross"[All Fields] AND "infection"[All

Fields]) OR "cross infection"[All Fields] OR ("hospital"[All Fields] AND

"infections"[All Fields]) OR "hospital infections"[All Fields]

La chiave per accedere: a. all’eventuale full-textb. al catalogo d’Ateneo

Questa citazione era stata selezionata per l’invio in clipboard, resta segnalato anche nel corso di ulteriori ricerche

Fornisce informazioni importanti per l’articolo:a. Tipo di disegno di studiob. Termini MeSH correlatic. Sostanze correlate

Consente di impostare formati diversi di visualizzazione dei datiImportante: Medline, contiene tutti i tag relativi all’articolo, da utilizzare per importare i dati in un sistema di gestione della bibliografia

In Advanced Search trovo:la “search history”

cliccando sui numero di esitidi ogni ricerca, ritorno all’elenco complessivo

cliccando sul numero progressivo di ogni ricerca, posso:

combinare le ricerche con gli operatori,cancellarle,rilanciarle,vedere come il sistema ha interpretato la ricerca,salvarla in MY NCBI

In Advanced Search posso limitare una ricerca per autore,rivista, data di pubblicazione o altri campi a scelta

In Advanced Search, posso gestire ulteriori limiti

La ricerca per termini MeSH

Opzione di ricerca tramite termini MeSH

Inserimento termine “libero” Il sistema “interpreta” il termine, suggerendo il termine di vocabolario contrallato semanticamente più vicino al termine di partenza

Sottodescrittori: essenziali per capire da quale punto di vista ci interessa l’argomento cercato

2 funzioni importanti:a. Restringere la ricerca ai soli articoli aventi questo soggetto come argomento PRINCIPALEb. Non esplodere: non includere nella ricerca gli articoli soggettati con le diramazioni “figlie” di questo

termine

Nella parte sottostante della schermata, trovo:

a. Tutti i termini che, inseriti, avrebbero portato a quel termine MeSH, utili (correlandoli con OR) per ricerche per parole libere in database o altri sistemi non provvisti di tesauro

b. La ramificazione del MeSH all’interno della quale si trova il termine cercato, utile per sapere se ci interessa anche il termine “figlio” nella funzione Explode

“figlio” di “cross infection”

Selezionando da qui il termine, lo ricerco comprensivo di tutti i sottodescrittori

Possibilità di lanciare la ricerca direttamente in Pubmed

Invio della ricerca (dopo aver selezionato le opzioni desiderate) nel box di ricerca con gli operatori più opportuni

La ricerca è ora impostata all’interno del box, possibilità di verificarla e eventualmente modificarla, poi invio cliccando su

Stringa di ricerca lanciata e relativi risultati

La “carta d’identità” di un articolo

Dati bibliografici

Meshattribuiti

Non utilizzare i MeSH per:

Argomenti recenti

Argomenti poco studiati o poco consueti

Articoli inseriti nel database nel corso

delle ultime settimane

Registrazione per apertura account in Pubmed, che consente di:

Salvare le ricerche (anche in modalità alert = con avviso automatico di ulteriori pubblicazioni

inerenti la ricerca salvata)

Salvare collezioni di citazioni bibliografiche

Salvare la propria bibliografia, anche di altra letteratura non indicizzata in Pubmed

Visionare le ricerche svolte negli ultimi 6 mesi (solo se collegati nel corso di sessioni in My NCBI)

Personalizzare i filtri di ricerca

Ricerche salvate

Collezioni salvate

Bibliografia salvata

Attività recente (ultimi 6 mesi)

Da qui posso salvare la ricerca in My NCBI

Da qui, dopo averli selezionati, invio gli articoli nelle “Collections”

Esempio di comunicazione dell’avvenuto inserimento di nuova citazioneall’interno di una ricerca salvata in Pubmed con funzione di “alert”

Le collections possono essere rese “pubbliche”, in questo modo posso comunicare il link a dei colleghi o inserire l’URL all’interno di blog, pagine web…

http://www.cochrane.org/

LA COCHRANE COLLABORATION

La Cochrane Collaboration è una iniziativa internazionale no-profitnata con lo scopo di raccogliere, valutare criticamente e diffondere le informazioni relative alla efficacia degli interventi sanitari. Produce - utilizzando una metodologia scientifica comune - sintesi (revisioni sistematiche) sulla efficacia e sicurezza degli interventi sanitari di tipo preventivo, terapeutico e riabilitativo. Questi rapporti vengono diffusi attraverso un database elettronico denominato "Cochrane Library“. (Da Centro Cochrane Italiano http://www.cochrane.it/it/)

L’Università di Torino offre il database elettronico della Cochraneall’interno della piattaforma Wiley

Banche dati di studi secondari:Cochrane Library

Da novembre 2009 accessibile da:http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/mrwhome/106568753/HOME

La Cochrane Library è un insieme di database

all’interno dei quali è reperibile letteratura

indipendente e di qualità elevata creata per

migliorare l’assistenza e fornire prove sulle quali

basare le scelte in ambito clinico e sanitario.

Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR; Cochrane Reviews)

Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE; Other Reviews)

Cochrane Central Register of ControlledTrials (CENTRAL; Clinical Trials)

Cochrane Methodology Register (CMR; Methods Studies)

Health Technology Assessment Database (HTA; Technology Assessments)

NHS Economic Evaluation Database (NHSEED; Economic Evaluations)

I DATABASE

Il principale database Cochrane: contiene le revisioni sistematiche

Contiene abstract di revisioni sistematiche validate qualitativamente. Ogni abstact contiene un riassunto e un commento critico sulla qualitàcomplessiva.

Include dettagli di articoli (trialcontrollati) pubblicati ricavati dalle principali BD bibliografiche e da altre fonti altre pubblicate e non

E’ una bibliografia di pubblicazioni che dettagliano i metodi utilizzati nella conduzione di trial controllati

Raccoglie studi (completati e in corso)di valutazioni (mediche,sociali, etiche,

economiche) in ambito sanitario

Contiene abstract di valutazioni economiche basate su criteri di qualità, evidenziandone i punti di forza e di debolezza

LE LINEE GUIDA

Sono raccomandazioni di comportamento clinico, elaborate mediante un processo di revisione sistematica della letteratura,

con lo scopo di aiutare i medici e i pazienti a decidere le modalità assistenziali più appropriate in specifiche situazioni

cliniche1

1Field MJ, Lohr KN eds (1992). Guidelines for Clinical Practice: From Development to Use, Washington, DC: National Academy Press.

Dove reperire le LG?

• In Medline o altro DB bibliografico, se pubblicate suriviste censite

limitazione applicata alla stringa di ricerca:Publication Types [Practice Guideline]

• Su risorse specifiche liberamente accessibili in rete.

DATABASE DI LGEs. NGC o GuidelinesFinder

SITI DI AGENZIE PRODUTTRICI DI LGEs. NICE o SIGN

Altri siti su cui reperire LG• ANAES - www.has-sante.fr/ - Agence Nationale d’Accréditation et d’Evaluation en Santé –

Francia• CDC - Centers for Disease Control and Prevention – Atlanta (USA)

http://www.cdc.gov/hiv/resources/guidelines/

• CMA Infobase - Clinical Practice Guidelines - http://mdm.ca/cpgsnew/cpgs/index.asp -Canada

• CPO - http://www.cpo.it/lineeguida - Centro di riferimento regionale per l’Epidemiologia e la Prevenzione Oncologica - ASO S. Giovanni Battista Torino

• MJA - http://www.mja.com.au/public/guides/guides.html - Clinical Guidelines - Australia

• New Zeland Guidelines Group - http://www.nzgg.org.nz/ - Nuova Zelanda

• PRODIGY - http://www.prodigy.nhs.uk/guidance/list.htm - NHS Dept of Health –Inghilterra

• ICSI - http://www.icsi.org/guidelines_and_more/ - Institute for Clinical Systems Improvement – USA

• SNLG - http://www.pnlg.it/ - Sistema Nazionale Linee Guida– Isituto Superiore di Sanità - Italia

Tecniche della ricerca nelle banche dati online

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