Fonti informative di qualità e metodologia della ricerca...

Fonti informative di qualità e metodologia della ricerca di informazioni in Internet e nelle basi dati. Roma, 1 febbraio 2018

Fonti informative di qualità e metodologia della ricerca informativa in Internet e nelle basi dati(1 febbraio 2018, Roma )

Ricerca dell’ informazione in archivi strutturati:

ricerca per parole libere e con uso del tesauro in PubMed.

Filtri per la ricerca

Gaetana [email protected]

Biblioteca Digitale Centro di Conoscenza “R Maceratini” – Istituto Regina Elena

•MEDLINE copre i campi della medicina, del’ infermieristica, del’ odontoiatria, della medicina veterinaria, delle scienze precliniche

corrisponde in parte all’ International Nursing Index e all’ Index to Dental Literature . Copertura: 21 milioni di articoli di rivista dal 1949 in poi (26 milioni PUBMED) negli anni

recenti è possibile anche trovare alcuni capitoli di monografie selezionate

•Gli articoli sono tratti da circa 5006 riviste internazionali in 37 lingue

Aggiornamento quotidiano: 2000-4000 nuove citazioni al giorno;

•E’ stata resa gratuita a giugno del 1997 (conferenza stampa Gore)Nel primo anno di libero accesso via Internet le ricerche su Medline sono passate da 7 milioni a 120 milioni (30% studenti e pubblico in generale)Dal 1998 la NLM ha aggiunto alla base dati lo spoglio di riviste divulgative per pazienti/parallelamente molte importanti riviste mediche stanno sviluppando pagine per pazienti e anche traduzioni divulgative di articoli scientifici per i pazienti


A CHI È UTILE?


Un po’ di storia……• 1864 John Shaw Billings un chirurgo militare di 27 anni inizia a

costituire a Washington il primo nucleo della biblioteca che diverrà nel 1876 la National Medical Library divenuta poi National Library ofMedicine

• Nel 1879 nasce l’ Index Medicus• Nel 1964 inizia ad essere attivo il sistema Medlars (Medical Literature

Analysis and Retrieval System • Le ricerche erano molto lente: una mezz’ora per leggere il nastro

magnetico con un circa un milione di records• Nel 1971 si passa a un sistema più veloce e in linea: Medlars on line

o MEDLINE • Negli anni novanta (avvento del WEB) si sperimenta la prima

interfaccia amichevole, Internet Grateful Med per gli utenti finali (precedentemente il sistema era utilizzato da bibliotecari)

• Pubmed inizia a operare nel 1992 …..


Un paradigma essenziale prima di iniziare la ricerca

“Upon the title page of the Washington City Directory isprinted the following aphorism:

«to find a name you must know how to spell it» This has a very extensive application in medical

bibliography. To find accounts similar to your own rare case you must know what your own case is”.

Jonh Shaw Billings(1881)

Fonti informative di qualità e metodologia della ricerca di informazioni in Internet e nelle basi dati. Roma, 1 febbraio

2018

Quando fate una ricerca….• Vi è capitato di avere una enorme quantità di

informazione?

oppure:

• Vi è capitato di non avere nessuna risposta o risposte che non erano coerenti con ciò che volevate ottenere?


Il rumore e il silenzio:trovare un giusto equilibrio…..

• “Le informazioni-che-non-ci-sonose ne stavano zitte e ben nascoste alla vista degli studiosi cosicché quel luogo dava l’impressione di un deserto ove regnava un silenzio mortale che gelava il sangue nelle vene.

• Ma ecco che esse, apparendo all’ improvviso, si precipitavano con molto rumore, tutte insieme, come pipistrelli o vampiri, addosso ad un malcapitato studioso e lo sommergevano soffocandolo.

• In realtà, come succede anche a molti uomini, esse divenivano selvagge e cattive quando erano in branco, da sole infatti erano educate e di buon cuore”.

• G. Cognetti – La Biblioteca che-non-c’è (racconto inedito)


Ricercare: articoli sulla riabilitazione

nella sindrome di Alzheimer


Ricercare: Articoli sull’ Alzheimer


2018


Filtro lingua: selezioniamo articoli in lingua italiana


Sinonimi di Alzheimer Disease(voce MESH)


2018

Metodologia della ricerca di informazioni infermieristiche in Internet e nelle basi dati (Roma: 7,8,10 aprile 2014)

Ricerca infermieristica in archivi strutturati:

Pubmed

E-mail: [email protected]

Biblioteca Digitale Centro di Conoscenza “R Maceratini” – Istituto Regina Elena

https://www.iss.it/site/mesh/


2018

Tumore della mammellanon è tra i sinonimi vi è al plurale


2018

Modalità di ricerca La ricerca con il tesauro MESH è possibile solo nei record che hanno lo status:

Indexed for MedlineTutti gli altri record possono essere recuperati solo con la ricerca per parole libere. Se non si definisce un campo il sistema cerca nel titolo, nell’ abstract e in altri campi ricercabili. Attenzione alcuni termini non sono ricercati dal sistema: stop list o stop words


LA RICERCA PER PAROLA LIBERA È NECESSARIA PER INTERROGARE UNA PARTE DI PUBMED MA…..

Non risolve le ambiguità di significato dei termini/sinonimi

Pesca tutte le parole indistintamente ma non si sa quanto queste siano significative in un determinato contesto (es. in un abstract)


I tesauri utilizzati nella basi dati

• Sono strumenti terminologici che concettualizzano le conoscenze

• Permettono di recuperare unico termine tutte le informazioni relative ad un determinato concetto


2018

Status dei record in

• Pubmed –Indexed for Medline

• Pubmed in process (non più segnalato)

• Pubmed as supplied by publisher (non più segnalato)

• Articoli che hanno completato l’indicizzazione ed hanno subito un rigoroso controllo

• Articoli di cui è in corso l’indicizzazione

• Articoli forniti elettronicamente da editori e non indicizzati


CHE COS’ È ALLORA UN TESAURO?

Un dizionario controllato di termini univoci che identificano i concetti contenuti negli articoli con cui è stata indicizzata l’informazione


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Che cos’è il MESH?

Il Medical Subject Headings è il tesauro della base dati PUBMED prodotta dalla National Library of Medicine


2018

Il tesauro MESH nel 2016

• 27,883 descrittori• Più di 87,000 entry terms (sinonimi o quasi sinonimi) • Circa 80 sottovoci (subheading o qualifiers) • 232,000 Supplementary Concept Records (SCRs)(Generally SCR records contain specific examples of chemicals, diseases, and drug protocols). They are updated more frequently than descriptors.



2018

Il MESH è aggiornato ogni anno

Le sottovoci• Prima di cercare una seconda voce MESH verificare se il

concetto è coperto da una sottovoce (/therapy e non AND therapy)

• Le sottovoci si esplodono automaticamente

• Le sottovoci possono essere coordinate tra di loro: esempio neoplasms/drug therapy ANDcisplatin/therapeutic use


Le sottovoci (2)Leggere le note di ambito delle sottovociad esempio: “drug therapy” non comprende farmaci basati su sostanze biologiche (immunoterapia) per cui si usa “therapy”

“toxicology” riguarda solo gli aspetti di tossicità da studi sperimentali su uomini o animali o relativi all’ambiente (es. tossicità da inquinamento)


Attenzione alla differenze tra voci principali e sottovoci

Molte voci MESH hanno una sottovoce uguale

Psychology è presente sia come “voce principale” (MeshHeading) che come sottovoce (subheading)

• Qual’ è la differenza? • Come capire la differenza d’uso?


2018


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Il più accanto alle categorie identifica i ramiprincipali di ogni categoria del tree structure


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Il + accanto alle categorie identifica che quel ram o haè a capo (gerarchia) di altre voci più specifiche (Tree structure)

Le basi dati strutturate

• Dispongono di propri tesauri per indicizzare le informazioni

• Ad esempio EMBASE ha come tesauro l’ EMTREE

• I termini utilizzati sono diversi ma i tesauri e le modalità di interrogazione hanno di solito le stesse o simili caratteristiche (ricerca per campi, filtri, argomento principale, organizzazione gerarchica, sottovoci ecc.)

• (In realtà EMBASE ha incorporato anche il MESH ma con esiti non sempre affidabili)


«Quick and dirty »per trovare i MESH

• La filosofia del MESH è molto complessa• Indicizzare e ricercare con i MESH non è semplice• Metodo utile il “quick and dirty” (rapido e sporco)• Faccio una ricerca con i miei termini e poi analizzo gli

articoli pertinenti per individuare i MESH che sono alla fine degli articoli


Metodologia della ricerca con i MESH (1)1. Per la ricerca su MESH scomponi la ricerca in concetti semplici e verifica se

vi è il descrittore (termine univoco) per tali concetti leggendo attentamente la Scope note (nota d’ambito).

2. Verifica se esiste un MESH specifico per la nostra ricerca (es. per l’ insulina non cercare Hormones ma Insulin). Solo se non si trova

lo specifico Mesh si può utilizzare quello più generico. (Verifica con l’uso del tree structure)

3. Dato il Mesh principale verifica se vi è una sottovoce (subheading) relativa all’ aspetto che ti interessa (es. therapy, diagnosis ecc.)

4. Per una ulteriore selezione usa i filtri (tipo di pubblicazione, età, genere, uomo animale, lingua ecc.) Se sono interessato ad una tipologia di articoli (es letter, review, clinical trial, guideline) posso inserire una publication type (es. dai limits) e non una voce MESH

principale.

5. Per selezionare solo materiale EBM, ricordarsi di usare il filtro: SystematicReviews dai Publication Type


Metodologia della ricerca con i MESH (2)

1. Combinare i MESH con gli operatori booleani appropriati

2. Se i risultati sono troppi restringere con i Limits (tipo pubblicazione, data, età, genere ecc. )

3. Se i risultati sono pochi , oltre ad aver applicato l’esplosione, eliminare sottovoci (subheading) e filtri.

Per ampliare la ricerca (ma più rumore..): Usare termini liberi sinonimi con troncamento in OR e utilizzare le funzioni «citazioni correlate»


La ricerca è un’attività pragmatica che dipende anche dal nostro obiettivo

Risposta clinica o ricerca sistematica ?

• Se si vuole ottenere una risposta ad un quesito clinico spesso è sufficiente una sola buona revisione sistematica aggiornata

• Se si fa una ricerca per produrre un lavoro di revisione sistematica, metanalisi, linea guida occorre fare una ricerca con moltissimo rumore e selezionare con una metodologia rigorosa i record utili


Unified Medical Language System

• UMLS Knowledge Sources and Software Tools

• There are three UMLS Knowledge Sources: the Metathesaurus®, the Semantic Network, and the SPECIALIST Lexicon.


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Unified Medical Language System

• The Unified Medical Language System® (UMLS®) Metathesaurus® is a large, multi-purpose, and multi-lingual thesaurus that contains millions of biomedical and health related concepts, their synonymous names, and their relationships

• the Metathesaurus contains over 150 source vocabularies, such as MeSH®, RxNorm, SNOMED CT®, ICD-9-CM, ICD-10-CM, CPT®, and LOINC®. Many of the vocabularies are designated to meet US health standards for electronic health records.

Fonti informative di qualità e metodologia della ricerca di informazioni in Internet e nelle basi dati. Roma,1 febbraio 2018

Mesh e UMLS sono standard terminologici e sistemi di conoscenza (Ontologie)

• Il Mesh e l’ UMLS sono utilizzati per varie applicazioni

• Basi dati NLM, Cinahlecc.

• Cartelle cliniche elettroniche

• Realizzazione di siti e portali con indicizzazione semantica

• ecc. ecc.



2018

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