CV Francesco Iannelli - dbm.unisi.it · 5 patogenicità dello Streptococcus pneumoniae. Studio...

CURRICULUM

DI

FRANCESCO IANNELLI

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INDICE

POSIZIONE ATTUALE …………………………………………………… p. 3

INSEGNAMENTI ATTUALI …………………………………. p. 3

INDIRIZZO ATTUALE …………………………………………. p. 3

ISTRUZIONE …………………………………………. p. 4

POSIZIONI …………………………………………. p. 4

ATTIVITÀ DI RICERCA CORRENTE ……………………………………… p. 6

ATTIVITÀ DIDATTICA …………………………………………………… p. 8

PARTECIPAZIONI A PROGETTI …………………………………………… p. 16

ATTIVITA’ EDITORIALE ……………………………………………. …… p. 18

PREMI …………………………………………………………………… p. 18

BREVETTI …………………………………………………………………… p. 19

PUBBLICAZIONI …………………………………………………………… p. 19

ARTICOLI IN EXTENSO …………………………………………... p. 19

CAPITOLI DI LIBRI ………………………………………………… p. 24

RIASSUNTI ………………………………………………………. p. 25

SEQUENZE .……………………………………………………………. p. 38

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POSIZIONE ATTUALE

• Professore associato (II° fascia) nel settore scientifico disciplinare BIO/19 Microbiologia

Generale, presso il Dipartimento di Biotecnologie Mediche dell’Università degli Studi di

Siena

INSEGNAMENTI ATTUALI:

• Modulo Molecular Mircobiolgy, corso integrato Advanced Microbiology, corso di laurea

Medical Biotechnologies - Biotecnologie Mediche, Dipartimento di Biotecnologie Mediche

• Modulo Genetica Microbica, scuola di specializzazione Microbiologia e Virologia,

Dipartimento di Biotecnologie Mediche

• Modulo Genomica Strutturale e Funzionale, scuola di specializzazione Microbiologia e

Virologia, Dipartimento di Biotecnologie Mediche

• Modulo Fondamenti di Genetica, scuola di specializzazione Microbiologia e Virologia,


• Membro del Collegio dei Docenti del dottorato di ricerca in Biotecnologie Mediche,


INDIRIZZO ATTUALE:

LAMMB (Laboratorio di Microbiologia Molecolare e Biotecnologia)

Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di Siena

Policlinico Le Scotte (lotto V, piano I) Viale Bracci 53100 Siena

Tel: 0577-233156, Fax: 0577-233334, cell. 347-2290520

e-mail: [email protected]

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ISTRUZIONE

• Luglio-1988 - Conseguimento del Diploma di Maturità Scientifica

• 14-Marzo-1994 - Conseguimento della Laurea in Scienze Biologiche con la votazione di

110/110 e lode presso l'Università degli Studi di Siena; titolo della tesi: ''Monitoraggio

molecolare di soggetti HIV-1-infetti in corso di trattamento con azidotimidina''

• Prima sessione 1995 - Abilitazione alla Professione di Biologo presso l'Università degli

Studi di Siena

• 20-Dicembre-2001 - Conseguimento del Dottorato di Ricerca in Biotecnologia presso

l’Università degli Studi di Siena; titolo della Tesi: ''Genetica molecolare, Virulenza e

Chemioresistenza nello Streptococcus pneumoniae''

• 10-Giugno-2009 - Conseguimento della Specializzazione in Microbiologia e Virologia

presso l’Università degli Studi di Siena con la votazione di 70/70 e lode; titolo della Tesi: ''Il

trasposone coniugativo Tn5253 veicolante i geni di resistenza antibiotica tet(M) e cat nello

Streptococcus pneumoniae''

POSIZIONI

• Giugno-1992/Marzo-1994 - Studente interno presso la sezione di Microbiologia del

Dipartimento di Biologia Molecolare dell’Università degli Studi di Siena

• Marzo-1994/Settembre-1994 - Tirocinante presso la sezione di Biochimica del Dipartimento

di Biologia Molecolare dell’Università degli Studi di Siena

• Settembre-1994/Marzo-1995 - Tirocinante presso la sezione di Microbiologia del

Dipartimento di Biologia Molecolare dell’Università degli Studi di Siena

• Febbraio-1996/Gennaio-1998 - Borsa di Studio, messa a concorso dalla GlaxoWellcome

S.p.A., titolo della ricerca: "Ricerca e caratterizzazione di mutanti acapsulati", presso la

Sezione di Microbiologia del Dipartimento di Scienze Chirurgiche dell'Università degli

Studi di Cagliari

• Marzo-2001 - Guest Scientist, Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires,

CNRS-Université Paul Sabatier, Toulouse Cedex, France, sotto la supervisione del Dr. J.P.

Claverys.

• Marzo-2002/Febbraio-2003 - Borsa di Studio, messa a concorso dalla Fondazione MPS

della durata di un anno, titolo della ricerca: "Ruolo delle proteine di superficie nella

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patogenicità dello Streptococcus pneumoniae. Studio delle varianti alleliche di PspC.",

presso il Dipartimento di Biologia Molecolare dell'Università degli Studi di Siena

• 31-Dicembre-2002 - Assunzione come Tecnico di Laboratorio Universitario categoria D,

presso il Dipartimento di Biologia Molecolare, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università

degli Studi di Siena

• Giugno-2003 - Guest Scientist, Dipartimento di Biochimica Università degli Studi di Pavia

sotto la supervisione del Prof. P. Speziale

• 31-Dicembre-2008 - Nomina in ruolo a Ricercatore Universitario non Confermato nel

settore scientifico-disciplinare MED/07 Microbiologia e Microbiologia Clinica, presso il

Dipartimento di Biologia Molecolare, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli

Studi di Siena

• 31-Dicembre-2011 - Nomina in ruolo a Ricercatore Universitario Confermato nel settore

scientifico-disciplinare MED/07 Microbiologia e Microbiologia Clinica, presso il

Dipartimento di Biotecnologie, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di

Siena

• 23-Gennaio-2014 - Abilitazione a Professore Associato (II fascia) nel settore concorsuale

05/I1 (corrispondente ai s.s.d. BIO/18 - Genetica e BIO/19 - Microbiologia) tornata 2012

• 11-aprile-2015 - Passaggio dal settore scientifico-disciplinare MED/07 Microbiologia e

Microbiologia Clinica al settore scientifico-disciplinare BIO/19 Microbiologia mediante

mobilità interna al Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di Siena

• 01-Ottobre-2016 - Nomina in ruolo a Professore Associato (II fascia) nel settore scientifico-

disciplinare BIO/19 Microbiologia

• 28-Marzo-2017 - Abilitazione a Professore Ordinario (I fascia) nel settore concorsuale

06/A3 (corrispondente al s.s.d MED/07 - Microbiologia e Microbiologia Clinica) tornata

primo quadrimestre 2016

• 06-Aprile-2014 - Abilitazione a Professore Ordinario (I fascia) nel settore concorsuale 05/I1

(corrispondente al s.s.d BIO/19 - Microbiologia) ) tornata primo quadrimestre 2016

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ATTIVITA’ DI RICERCA CORRENTE

Francesco Iannelli è responsabile di un gruppo di ricerca che opera presso il LAMMB (Laboratorio

di Microbiologia Molecolare e Biotecnologia) del Dipartimento di Biotecnologie Mediche

dell’Università degli Studi di Siena.

Il gruppo si occupa delle seguenti attività di ricerca:

• Caratterizzazione degli elementi genetici mobili nei genomi batterici

• Studio della patogenicità batterica

• Studio delle basi genetiche della resistenza agli antibiotici

• Studio di antigeni vaccinali

• Studio del genoma, microbioma

Il gruppo ha sviluppato le seguenti competenze:

- Sequenziamento di genomi batterici

La sequenza di interi genoma batterici viene determinata con NGS (Next Generation Sequencing)

tramite gli strumenti MinION e Illumina MySeq. L’assemblaggio viene effettuato tramite il

software Ray su sequenze genomiche di riferimento e i polimorfismi, le delezioni e le inserzioni

vengono mappate con i software Mosaik Assembler e VarScan. Inoltre con il sequenziamento

genomico viene condotta l’analisi del mobiloma batterico.

- Profiling del Microbioma

La composizione del microbioma orale, vaginale e intestinale umano e murino viene determinata

mediante sequenziamento del gene per l’RNA ribosomiale 16S tramite lo strumento Illumina

MySeq e analizzata con i software QIIME e USEARCH/UCLUST.

- Costruzione di vettori batterici per il delivery vaccinale

Un sistema di espressione (host-vector) inducibile tramite nisina viene utilizzato in Streptococcus

pneumoniae per l’espressione sulla superficie batterica di proteine eterologhe (antigeni vaccinali). Il

sistema risiede sull’ICE Tn5253 e viene trasferito per coniugazione dallo S. pneumoniae a ceppi di

streptococco (S. gordonii, S. pyogenes, S. agalactiae) e di Enterococcus faecalis. I ceppi

ricombinanti verranno usati in saggi di infezione murina.

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- Manipolazione genetica di ceppi batterici patogeni.

Ceppi virulenti (e quindi capsulati) di Streptococcus pneumoniae vengono mutagenizzati mediante

PCR e trasformazione. I costrutti genetici per la delezione, la sostituzione (anche singoli nucleotidi)

e la fusione genica vengono prodotti per PCR gene SOEing (gene splicing by overlap extension).

Cellule pre-competenti, stimolate con CSP (competence stimulating peptide) sintetici, vengono

trasformate in vitro con i DNA lineari così ottenuti. La selezione dei ceppi ricombinanti viene

effettuata per PCR.

- Modelli di infezione murina.

Ceppi di Streptococcus pneumoniae e i relativi mutanti isogenici vengono inoculati in topi outbred

MF1 e inbred CBA/Jico. L’inoculo viene effettuato per via intravenosa (modello di sepsi), per via

intracranica (modello di meningite), per via intranasale (modello di polmonite). Vengono valutati il

quadro clinico, la situazione istopatologica e la conta batterica negli organi infettati.

- Real Time PCR quantitativa.

La presenza e il livello di mRNA di geni di interesse viene determinato tramite RT-PCR "Real-

Time" con gli strumenti LightCycler e VIA7 utilizzando PCR array home-made o commerciali.

L’RNA batterico totale viene purificato da cellule batteriche cresciute in diverse condizioni in vitro

o recuperate da organi di topo dopo infezione. L’RNA messaggero viene purificato dal cellule di

linea umane dopo stimolazione con farmaci o da tessuti umani. La quantificazione dell’RNA viene

effettuata tramite elettroforesi capillare con lo strumento Agilent 2100 BioAnalyzer. Inoltre con

PCR "Real-Time"viene valutata la presenza e la quantità di DNA degli elementi genetici presenti

nelle cellule batteriche e delle varie strutture genetiche che essi producono (i.e. circoli intermedi di

coniugazione).

- Caratterizzazione di elementi genetici.

Elementi genetici, veicolanti geni di resistenza antibiotica, vengono caratterizzati tramite

sequenziamento e i loro siti di integrazione nel cromosoma batterico tramite PCR inversa e

LMPCR. La trasferibilità degli elementi viene studiata tramite esperimenti di trasformazione e

coniugazione in vitro. Gli elementi genetici vengono mutagenizzati previo trasferimento in

Streptococcus pneumoniae. I meccanismi di resistenza antibiotica vengono indagati mediante studio

dell’inducibilità e saggi di efflusso.

- Analisi mediante Microarray.

L’epidemiologia molecolare dei geni di resistenza antibiotica viene realizzata tramite Microarray.

Sonde per i geni di resistenza di interesse clinico vengono spottati con l’apparecchio Affymetrix

417 arrayer. Il DNA purificato viene marcato e ibridato sui vetrini che vengono analizzati con lo

strumento Affymetrix 428 Scanner. Geni co-espressi vengono identificati ibridando l’RNA su un

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vetrino Microarray contenente sonde per i geni di interi genomi batterici e/o per interi elementi

genetici.

ATTIVITÀ DIDATTICA

• a.a.1999/2000

-Professore a contratto insegnamento TECNOLOGIE RICOMBINANTI, Area Propedeutica,

Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia,

Università degli Studi di Siena

• a.a. 2000/2001

-Professore a contratto insegnamento BIOLOGIA MOLECOLARE - Area Propedeutica, Scuola di

Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università


• a.a. 2001/2002

-Professore a contratto insegnamento BIOLOGIA MOLECOLARE - Area Propedeutica, Scuola di

Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università


-Professore a contratto insegnamento MICROBIOLOGIA, settore MED/07 – Microbiologia e

Microbiologia clinica, Corso integrato MICROBIOLOGIA, Corso di Laurea INFERMIERE – Sede

Grosseto, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Siena

• a.a. 2002/2003


Microbiologia clinica, Corso integrato MICROBIOLOGIA, Corso di Laurea INFERMIERISTICA

(Abilitante alla professione di infermiere) – Sede Grosseto, Facoltà di Medicina e Chirurgia,


• a.a. 2003/2004

-Professore a contratto insegnamento BIOLOGIA MOLECOLARE – PROTEINE, Area

Propedeutica, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina

e Chirurgia, Università degli Studi di Siena





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• a.a. 2004/2005

-Professore a contratto insegnamento BIOLOGIA MOLECOLARE – PROTEINE, Area

Propedeutica, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina

e Chirurgia, Università degli Studi di Siena





• a.a. 2005/2006





-Professore a contratto insegnamento MICROBIOLOGIA APPLICATA, settore MED/07 –

Microbiologia e Microbiologia clinica, Corso integrato MICROBIOLOGIA, Corso di Laurea

INFERMIERISTICA (Abilitante alla professione di infermiere) – Sede Grosseto, Facoltà di

Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Siena

• a.a. 2006/2007

-Professore a contratto insegnamento MICROBIOLOGIA, settore di MED/07 – Microbiologia e




-Professore a contratto insegnamento MICROBIOLOGIA APPLICATA, settore di MED/07 –




• a.a. 2007/2008





-Professore a contratto insegnamento MICROBIOLOGIA APPLICATA, settore MED/07 –


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• a.a. 2008/2009

-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA, settore MED/07 – Microbiologia e




-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA APPLICATA, settore MED/07 –




-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA CLINICA, settore MED/07 –




-Professore aggregato insegnamento GENETICA BATTERICA, settore di BIO/18 – Genetica,

Ambito Discipline Generali per la Formazione dello Specialista, Scuola di Specializzazione

MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Siena

• a.a. 2009/2010

-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA, settore MED/07 – Microbiologia e




-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA APPLICATA, settore MED/07 –




-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA CLINICA, settore MED/07 –




-Professore aggregato insegnamento GENETICA BATTERICA, settore di BIO/18 – Genetica,


MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Siena

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-Professore aggregato insegnamento GENOMICA STRUTTURALE e FUNZIONALE, Ambito

Discipline Specifiche della Tipologia della Scuola, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA

E VIROLOGIA (CL. Della Medicina Diagnostica e di Laboratorio), Facoltà di Medicina e

Chirurgia, Università degli Studi di Siena

-Professore aggregato insegnamento GENETICA BATTERICA, settore BIO/18 – Genetica, Corso

integrato BIOLOGIA e GENETICA, Corso di Laurea BIOTECNOLOGIE (L-2), Facoltà di


• a.a. 2010/2011

-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA GENERALE e CLINICA, settore

MED/07 – Microbiologia e Microbiologia clinica, Corso integrato BASI FISIOPATOLOGICHE

DELLE MALATTIE, Corso di Laurea INFERMIERISTICA (Abilitante alla professione di

infermiere) – Sede Grosseto, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Siena


integrato BIOLOGIA e GENETICA, Corso di Laurea BIOTECNOLOGIE (L-2), Facoltà di


-Professore aggregato insegnamento GENETICA BATTERICA, settore BIO/18 – Genetica,


MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università di Siena





-Professore aggregato insegnamento MICROBIOLOGIA GENERALE, Ambito Discipline

Specifiche della Tipologia della Scuola, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E

VIROLOGIA (CL. Della Medicina Diagnostica e di Laboratorio), Facoltà di Medicina e Chirurgia,


• a.a. 2011/2012




infermiere) – Sede Grosseto, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Siena


integrato GENETICA, BANCHE DATI e BIOLOGIA dei SISTEMI, Corso di Laurea

BIOTECNOLOGIE (L-2), Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Siena

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-Professore aggregato insegnamento FONDAMENTI DI GENETICA - GENETICA

BATTERICA, settore BIO/18 – Genetica, Ambito Discipline Generali per la Formazione dello

Specialista, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Facoltà di Medicina e

Chirurgia, Università di Siena

• a.a. 2012/2013




infermiere) – Sede Grosseto, Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di

Siena


integrato GENETICA, BANCHE DATI e BIOLOGIA dei SISTEMI, Corso di Laurea

BIOTECNOLOGIE (L-2), Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di Siena

-Professore aggregato insegnamento MOLECULAR MICROBIOLOGY, settore BIO/19 –

Microbiologia Generale, Corso integrato ADVANCED MICROBIOLOGY, Corso di Laurea

Magistrale in MEDICAL BIOTECHNOLOGIES - BIOTECNOLOGIE MEDICHE (In lingua

inglese), Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università degli Studi di Siena

• a.a. 2013/2014







E VIROLOGIA (CL. Della Medicina Diagnostica e di Laboratorio), Dipartimento di Biotecnologie

Mediche, Università degli Studi di Siena

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Specialista, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Dipartimento di

Biotecnologie Mediche, Università di Siena

-Professore aggregato insegnamento GENETICA MICROBICA, Ambito Discipline Specifiche

della Tipologia della Scuola, Scuola di Specializzazione di MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA

(CL. Della Medicina Diagnostica e di Laboratorio), Dipartimento di Biotecnologie Mediche

dell’Università degli Studi di Siena

• a.a. 2014/2015





-Professore aggregato insegnamento NUCLEIC ACID DETECTION METHODS, settore BIO/19

– Microbiologia Generale, Corso integrato ADVANCED MICROBIOLOGY, Corso di Laurea







-Professore aggregato insegnamento FONDAMENTI DI GENETICA, settore BIO/18 – Genetica,


MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Dipartimento di Biotecnologie Mediche, Università di Siena

-Professore aggregato insegnamento GENETICA MICROBICA, Ambito Discipline Specifiche




• a.a. 2015/2016





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-Professore aggregato insegnamento NUCLEIC ACID DETECTION METHODS, settore BIO/19

– Microbiologia Generale, Corso integrato NEXT GENERATION GENOMICS, Corso di Laurea





Specialista, Scuola di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Dipartimento di

Biotecnologie Mediche, Università di Siena

-Professore aggregato insegnamento GENOMICA MICROBICA, Ambito Discipline Specifiche








• a.a. 2016/2017

-Professore associato insegnamento MOLECULAR MICROBIOLOGY, settore BIO/19 –




-Professore associato insegnamento FONDAMENTI DI GENETICA - GENETICA BATTERICA,

settore BIO/18 – Genetica, Ambito Discipline Generali per la Formazione dello Specialista, Scuola

di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Dipartimento di Biotecnologie Mediche,

Università di Siena

-Professore associato insegnamento GENOMICA MICROBICA, Ambito Discipline Specifiche




-Professore associato insegnamento GENOMICA STRUTTURALE e FUNZIONALE, Ambito




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• a.a. 2017/2018

-Professore associato insegnamento MOLECULAR MICROBIOLOGY, settore BIO/19 –




-Professore associato insegnamento FONDAMENTI DI GENETICA - GENETICA BATTERICA,

settore BIO/18 – Genetica, Ambito Discipline Generali per la Formazione dello Specialista, Scuola

di Specializzazione MICROBIOLOGIA E VIROLOGIA, Dipartimento di Biotecnologie Mediche,

Università di Siena

-Professore associato insegnamento GENOMICA MICROBICA, Ambito Discipline Specifiche




-Professore associato insegnamento GENOMICA STRUTTURALE e FUNZIONALE, Ambito




• 1997-2003

Tutor esercitazioni di Bioinformatica per gli studenti del corso di Diploma Universitario in Tecnico

Sanitario di Laboratorio Biomedico, Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università di Siena

• 2001-presente

Correlatore di tesi

o Corso di Laurea in Medical Biotechnologies - Biotecnologie Mediche, Facoltà di

Farmacia Medicina e Chirurgia, Scienze Matematiche Fisiche e Naturali, Università


o Corso di Laurea Specialistica in Biotecnologie per la Salute Umana, Interfacoltà di

Farmacia Medicina e Chirurgia, Scienze Matematiche Fisiche e Naturali, Università


o Corso di Laurea in Scienze Biologiche, Facoltà di Scienze Matematiche Fisiche e

Naturali, Università degli Studi di Siena

o Corso di Laurea Specialistica in Medicina e Chirurgia, Facoltà di Medicina e


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• 2009-presente

o Membro del Collegio dei docenti del Dottorato in Biotecnologie Mediche dell’Università di

Siena

PARTECIPAZIONE A PROGETTI INTERNAZIONALI E NAZIONALI MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRIN1999 - Scienze Mediche Titolo progetto: Basi Genetiche e Molecolari della Patogenicita' Batterica

prot. 9906183834_005. Durata 24 mesi MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRIN2000 - Scienze Mediche Titolo progetto: Resistenza ai Macrolidi negli Streptococchi. Geni, Elementi Genetici,

Epidemiologia Molecolare e Sviluppo di Nuovi Diagnostici. prot. MM06307874. Durata 24 mesi EU (European Union) FP5 - 2000 Health programme. Titolo progetto: Bacterial two-component systems: targets for the development of novel

antimicrobials and anti-infective agents (TCS TARGETS). n. QLK2-CT-2000-00543. Durata 42 mesi MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRIN2002 - Scienze Mediche Titolo progetto: Basi Genetiche e Molecolari della Patogenicita' Batterica prot. 2002068125_005. Durata 24 mesi PAR (Piano di Ateneo per la Ricerca, Università di Siena): 2002 L'Elemento Genetico che porta la Resistenza alla Meticillina in Staphylococcus aureus. Durata 12 mesi. EU (European Union) FP6 - 2003 Health programme. Titolo progetto: European Microbicides Project (EMPRO). n. 503558. Durata 60 mesi EU (European Union) FP6 - 2003 Health programme. Titolo progetto: Mucosal Vaccines for Poverty-Related diseases (MUVAPRED). n. 503240. Durata 60 mesi MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): FIRB2005 - Titolo progetto: Sviluppo di una nuova piattaforma tecnologica basata su Microarrays a DNA e su

tecnologie di Real-time PCR per lo studio dell’epidemiologia molecolare dei geni di resistenza agli

antibiotici e degli elementi genetici mobili che ne promuovono la diffusione. Durata 24 mesi EU (European Union) FP6 - 2005 Health programme. Titolo progetto: Role of Mobile Genetic Elements in the Spread of Antimicrobial Drug Resistance

(DRESP2). n. 018705. Durata 36 mesi PAR (Piano di Ateneo per la Ricerca, Università di Siena): 2006 Geni di antibiotico-resistenza emergenti in batteri patogeni di rilevanza clinica ed elementi genetici

mobili responsabili della loro diffusione. Durata 24 mesi.

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EU (European Union) FP7 - 2007 Health programme. Titolo progetto: A comprehensive dissection of pneumococcal-host interactions (PNEUMOPHAT).

n. 222983. Durata 36 mesi

EU (European Union) FP7 - 2008 Health programme. Titolo progetto: A new platform for fast molecular detection of MDR and XDR resistant strains of

M. tuberculosis and of drug resistant malaria (TM-REST). n. 202145. Durata 36 mesi

EU (European Union) FP7 - 2008 Food programme. Titolo progetto: Confronting the clinical relevance of biocide induced antibiotic resistance (BIOHYPO). n. 227258. Durata 36 mesi EU (European Union) FP7 - 2008 People programme. Titolo progetto: Scientific Training in Antibacterial Research Strategies (STARS). n. 238490. Durata 48 mesi MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRIN2008 Exploring glycopeptide reduced susceptibility in S. aureus: an integrated approach. Durata 24 mesi. MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRIN2008 Patogenicità Batterica e sviluppo di vaccini. Durata 24 mesi. EU (European Union) FP7 - 2009 Health programme. Titolo progetto: European network for study and clinical management of TB drug resistance (TB

PAN-NET). n. 223681. Durata 60 mesi EU (European Union) FP7 - 2009 Health programme. Titolo progetto: The effects of antibiotic administration on the emergence and persistence of

antibiotic-resistant bacteria in humans and on the composition of the indigenous microbiotas at

various body sites (ANTIRESDEV). n. 241446. Durata 36 mesi EU (European Commission): FP7 - 2008 Health programme. Titolo progetto: A comprehensive dissection of pneumococcal-host interactions (PNEUMOPATH). n. 222983. Durata 36 mesi EU (European Union) FP7 - 2011 Health programme. Titolo progetto: High impact research initiative for better immunisation. (ADITEC). n. 280873. Durata 60 mesi EU (European Union) FP7 - 2012 Health programme. Titolo progetto: Microbicide Optimization Through Innovative Formulation for Vaginal and Rectal

Delivery (MOTIF). n. 305316. Responsabile Scientifico dell’unità operativa UNISI. Durata 42 mesi. MIUR (Ministero dell’Università e della Ricerca Scientifica): PRINN 2012 Modelli d'interazione tra microrganismi e ospite nelle infezioni mucosali per lo sviluppo di strategie terapeutiche innovative. n. 2012WJSX8K_010. Durata 24 mesi.

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EU (European Union) FP7 - IMI JU (Innovative Medicine Initiative Joint Undertaking) - EFPIA (Europian Federation of Pharmaceutical Industries and Associations) - 2012 - Titolo progetto: Biomarkers For Enhanced Vaccine Safety (BIOVACSAFE). n. 115308. Durata 60 mesi.

ATTIVITA’ EDITORIALE

Membro dell’Editorial Board:

• ISRN Microbiology (Hindawi Publishing Corporation) dal 2011

• Journal of Global Antimicrobial Resistance (Elsevier) dal 2017

Revisore per riviste:

• Microbial Pathogenesis

• BMC Microbiology

• Antimicrobial Agents and Chemotherapy

• Letters in Applied Microbiology

• FEMS Microbiology Letter

• Journal of Clinical Microbiology

• Annals of Microbiology

• Computational and Structural Biotechnology Journal

• Journal of Antimicrobial Chemotherapy

Revisore per progetti di ricerca:

Miur dal 2009

PREMI

• 2004 - Vincitore del Premio Chiron della Società Italiana di Microbiologia Generale e

Biotecnologie Microbiche (SIMGBM) per il miglior lavoro sul tema "Vaccini e patogenesi

microbica: identificazione di nuovi antigeni o di fattori di virulenza" con il paper

"Pneumococcal Surface Protein C (PspC) Contributes to Sepsis caused by Streptococcus

pneumoniae in Mice. Infection and Immunity, 2004, 72, 3077-3080". Consegna 2-10-2004

presso Congresso FISV, 30 settembre-2 ottobre 2004, Riva del Garda.

• 2004 - Vincitore del 44th ICAAC Program Committee Award della American Society for

Microbiology (ASM) for Outstanding Abstract Presentation in the Area of Resistance

Mechanisms and Consequences, abstract title: "Type M Resistance to Macrolides in

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Streptococci is not Due to the mef(A) Gene, but to mat(A) Encoding an ATP-Dependent

Efflux Pump". Consegna 2-11-2004 presso 44th Interscience Conference on Antimicrobial

Agents and Chemoterapy, October 30-November 2, 2004, Washington, DC. American

Society for Microbiology.

BREVETTI

• Bjorck L., Sjoholm A., Janulczyk R., Pozzi G., Iannelli F. Fh-binding protein of Streptococcus

pneumoniae Brevetto Nazionale Svedese No. SE20000002728, Pubblication date January, 31

2002

• Bjorck L., Sjoholm A., Janulczyk R., Pozzi G., Iannelli F. Proteine, Fh-binding protein of

Streptococcus pneumoniae Brevetto Nazionale Canadese No. CA2416657, Pubblication date

January, 31 2002

• Bjorck L., Sjoholm A., Janulczyk R., Pozzi G., Iannelli F. Protein. Brevetto dell’Organizzazione

mondiale della proprietà intellettuale (PCT) No. WO0208426, Pubblication date January, 31

2002.

• Bjorck L., Sjoholm A., Janulczyk R., Pozzi G., Iannelli F. Fh-binding protein of Streptococcus

pneumoniae. European Patent EP1301602, Pubblication date April, 16 2003.

• Bjorck L., Sjoholm A., Janulczyk R., Pozzi G., Iannelli F. Protein Brevetto Nazionale USA No.

US20040091495, Pubblication date May, 13 2004

PUBBLICAZIONI

Francesco Iannelli ha pubblicato 48 ARTICOLI IN EXTENSO su riviste internazionali

1. De Milito A., M. Catucci, F. Iannelli, L. Romano, M. Zazzi, and P.E. Valensin. 1995. -

Increased reliability of selective PCR by using additionally mutated primers and a commercial

taq DNA polymerase enhancer. Molecular Biotechnology, 3, 166-169.

IF2015: 1,75 citazioni: 6

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Francesco Iannelli ha pubblicato 4 CAPITOLI DI LIBRI

1. Iannelli F. and G. Pozzi. - Protocol for conjugal transfer of genetic elements in

Streptococcus pneumoniae. 2007. - Hakenbeck R., S. Chhatwall. Molecular Biology of

Streptococci, Chapter 21, 525-529, Horizon Bioscience. ISBN: 978-1-904933-32-8.

2. M.R. Oggioni e Iannelli F. - Genetica batterica. 2008. Antonelli G., Clementi M., Pozzi G.,

G.M. Rossolini. Principi di Microbiologia Medica, Capitolo 4, A29-A44, Casa Editrice

Ambrosiana. ISBN 978-88-408-1392-9.

3. M.R. Oggioni e Iannelli F. - Genetica batterica. Seconda edizione. 2012. Antonelli G.,

Clementi M., Pozzi G., G.M. Rossolini. Principi di Microbiologia Medica, Capitolo 4, A39-

A56, Casa Editrice Ambrosiana. ISBN 978-88-08-18073-5.

25

4. Iannelli F. e F. Santoro - Genetica e genomica batterica. Terza edizione. 2017. Antonelli

G., Clementi M., Pozzi G., G.M. Rossolini. Principi di Microbiologia Medica, Capitolo 4,

A36-A54, Casa Editrice Ambrosiana. ISBN 978-88-08-18705-5.

Francesco Iannelli ha presentato 126 RIASSUNTI a congressi nazionali ed internazionali

1. Zazzi M., Romano L., De Milito A., Catucci M., Iannelli F., Gonnelli A., Almi P., Rubino M.,

P. E. Valensin. - Valutazione longitudinale di parametri molecolari in corso di infezione da

HIV-1. Secondo Congresso Nazionale SIMMOC, Novara, 27-28 Maggio, 1994.

2. Zazzi M., Romano L., De Milito A., Catucci M., Iannelli F., Gonnelli A., Almi P., Rubino M.,

P. E. Valensin. - Valutazione longitudinale di parametri molecolari in corso di infezione da

HIV-1. Atti della VI° Giornata di Facolta' di Medicina e Chirurgia, 19 Novembre, 1994.

3. Pozzi G., L. Masala, F. Iannelli, R. Manganelli, L. S. Havarstein, L. Piccoli, D. Simon, D. A.

Morrison. - Competence for genetic transformation in encapsulated strains of Streptococcus

pneumoniae induced by a synthetic peptide pheromone. 96th General Meeting of the American

Society for Microbiology, New Orleans, 19-23 Maggio, 1996.

4. Pozzi G., L. Masala, F. Iannelli, R. Manganelli, L. S. Havarstein, L. Piccoli, D. Simon, D.A.

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Genetica e Biologia Molecolare dei Procarioti, Cortona, 2-3 Aprile, 2001.

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competenza (CSP) e il suo recettore in Streptococcus pneumoniae. Nono Congresso Nazionale

SIMMOC, Vibo Valentia, 20-22 Giugno, 2001.

18. Oggioni M.R., Iannelli F., G. Pozzi. - Analisi genomica comparativa per l’identificazione di

sequenze clone specifiche in Streptococcus pneumoniae. Nono Congresso Nazionale SIMMOC,

Vibo Valentia, 20-22 Giugno, 2001.

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resistenza ai macrolidi isolati in Italia in Streptococcus pneumoniae. Nono Congresso Nazionale

SIMMOC, Vibo Valentia, 20-22 Giugno, 2001.

20. Santagati M., Iannelli F., Messina C., Oggioni M.R., S. Stefani S., G. Pozzi. -Caratterizzazione

di un nuovo trasposone coniugativo Tn1207.3 che veicola il gene mef(A) in Streptococcus

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27

21. Santagati M., Iannelli F., Messina C., Oggioni M.R., S. Stefani S., G. Pozzi. - The Novel

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pyogenes. 41th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Chicago,

December 16-19, 2001.

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caratterizzazione degli elementi che portano i geni mef(A) e mef(E). 29° Congresso Nazionale

della Società Italiana di Microbiologia, Genova, 7-10 Novembre, 2001.

23. Oggioni M.R., Iannelli F., G. Pozzi. - Analisi del genoma per lo studio della patogenicità dello


Genova, 7-10 Novembre, 2001.

24. Santagati M., Iannelli F., Cascone C., Campanile F., Oggioni M.R., Pozzi G., S. Stefani. -

Tn1207.3, nuovo trasposone coniugativo che veicola mef(A) in un isolato clinico di S.

pyogenes. 29° Congresso Nazionale della Società Italiana di Microbiologia, Genova, 7-10

Novembre, 2001.

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Pneumococcus, Siena, 20-23 March, 2002.

26. Iannelli F., Morrison D.A., G. Pozzi. - Genetic Variability and Specificity of the Competence

Two-Component System in Streptoccoccus pneumoniae. Sixth European Meeting on the

Molecular Biology of the Pneumococcus, Siena, 20-23 March, 2002.

27. Kadioglu A., Iannelli F., Pozzi G., P. Andrew. - Upper and lower respiratory tract infection by

Streptococcus pneumoniae is affected by deficiency of pneumolysin and by differences in

capsule type. Sixth European Meeting on the Molecular Biology of the Pneumococcus, Siena,

20-23 March 2002.

28. Del Grosso M., Iannelli F., Santagati M., Petrosillo N., Stefani S., Pozzi G., A. Pantosti. -

Streptococcus pneumoniae macrolide resistance in Italy: characterization of the elements

carrying the efflux genes mef(A) and mef(E). Sixth European Meeting on the Molecular Biology

of the Pneumococcus, Siena, 20-23 March, 2002.

29. Santagati M., Iannelli F., Cascone C., Campanile F., Oggioni M.R., S. Stefani S., G. Pozzi -

The Novel Conjugative Transposon, Tn1207.3 carries the Macrolide Efflux gene mef(A) in

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28

30. Santagati M., Iannelli F., Cascone C., Campanile F., Oggioni M.R., Pozzi G., S. Stefani. -

Caratterizzazione di un nuovo trasposone coniugativo, Tn1207.3, che veicola il gene mef(A) in

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31. Iannelli F., Gianfaldoni C., Santagati M., Oggioni M.R., Stefani S., G. Pozzi. Il sito di

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Microbiologia, Milano, 26-29 Settembre, 2004.


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from planktonic to sessile life; a major event in pneumococcal pathogenesis. ASM Conference

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Pneumococcal pathogenesis is characterised by a biofilm in acute pneumonia and meningitis

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Congresso FISV, 20-30 Settembre 2016, Roma.

38

124. Stincarelli M., Iodice D., Santoro F., Pozzi G., Iannelli F. Construction of a nisin inducible

host-vector system for foreign gene expression in Gram-positive bacteria. 4nd Italian Experience

in Biomedical Research: Young Minds at Work, Desenzano del Garda, 18-19 Novembre, 2016.

125. Santoro F., Pastore G., Gianni Pozzi G., Iannelli F. Immunoassays targeting the major capsid

protein for detection of phage φ1207.3 in Streptococcus pneumoniae. Microbiology 2017, 32°

Meeting of SIMGBM Palermo, 17-20 September, 2017.

126. Pastore G., Santoro F., Gianni Pozzi G., Iannelli F. Detection of phage φ1207.3 in

Streptococcus pneumoniae by immunoassays targeting the major capsid protein. 45° Congresso

Nazionale della Società Italiana di Microbiologia, Genova, 27-30 Settembre, 2017.

Francesco Iannelli ha depositato presso la Genbank 77 SEQUENZE NUCLEOTIDICHE

1. Iannelli F. 1996. Streptococcus pneumoniae comC2 gene. 139 bp. GenBank Accession no.

X95385.

2. Iannelli F. 1997. Streptococcus pneumoniae DexB (dexB) gene, partial cds; putative

transposase gene, complete cds; type 2 capsular polysaccharide biosynthesis operon,

complete sequence; and AliA (aliA) gene, partial cds. 21.709 bp. GenBank Accession no.

AF076471.

3. Iannelli F. 1997. Streptococcus pneumoniae rough mutant strain R36A truncated cps2A and

cps2H genes, partial sequence; and cps2I gene, partial cds. 1.914 bp. GenBank Accession

no. AF029368.

4. Iannelli F. 1998. Streptococcus pneumoniae tRNA-Arg gene, complete sequence;

competence stimulating peptide precursor (comC2), histidine protein kinase (comD2), and

response regulator (comE2) genes, complete cds; tRNA-Glu gene, complete sequence; and

unknown gene. 2.788 bp. GenBank Accession no. AF067659.

5. Iannelli F. 1998. Streptococcus pneumoniae plasmid pSMB1, complete sequence. 3.162 bp.

GenBank Accession no. AF047385.

6. Iannelli F. 1998. Streptococcus pneumoniae plasmid pDP1, complete sequence. 3.161 bp.


7. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain ATCC6302 surface protein PspC (pspC)

gene, pspC-3.11 allele, complete cds. 3.001 bp. GenBank Accession no. AF154006.

8. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain ATCC6303 surface protein PspC (pspC)

gene, pspC-8.4 allele, complete cds. 2.565 bp. GenBank Accession no. AF154007.

39

9. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae ATCC6305 surface protein PspC (pspC) gene,

pspC-3.12 allele, complete cds. 2.494 bp. GenBank Accession no. AF154008.

10. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae surface ATCC6307 surface protein PspC

(pspC) gene, pspC-3.13 allele, complete cds. 3.052 bp. GenBank Accession no. AF154009.

11. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain 8R1 surface protein PspC (pspC) gene,


12. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain A60-11 surface protein PspC (pspC)

gene, pspC-6.12 allele, complete cds. 3001 bp. GenBank Accession no. AF154011.

13. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain D39 surface protein PspC (pspC) gene,


14. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain g363 surface protein PspC (pspC) gene,



pspC-6.5 allele, complete cds; and surface protein PspC (pspC) gene, pspC-9.2 allele,

complete cds. 6.581 bp. GenBank Accession no. AF154014.












pspC-6.9 allele, complete cds. 6.917 bp. GenBank Accession no. AF154020..








40















32. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain g48s surface protein PspC (pspC) gene,




34. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain G100 surface protein PspC (pspC) gene,

pspC-4.1 allele, complete cds; and surface protein PspC (pspC) gene, pspC-10.1

allele,complete cds. 7.656 bp. GenBank Accession no. AF154033.


pspC-7.1 allele, complete cds; and IS3-Spn1 putative transposase and hypothetical protein

genes, complete cds. 6.108 bp. GenBank Accession no. AF154034.





38. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain srf10 surface protein PspC (pspC) gene,






41











pspC-6.1 allele, complete cds; surface protein PspC (pspC) gene, pspC-9.1 allele, complete

cds; and unknown genes. 9.015 bp. GenBank Accession no. AF154044.

46. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae g383 surface protein PspC (pspC) gene, pspC-

6.8 allele, complete cds; IS1380-Spn1 putative transposase gene, complete cds; surface

protein PcpC (pcpC) gene, pcpC-9.3 allele, complete cds; and unknown genes. 10.511 bp.


47. Iannelli F. 1999. Kanamycin cassette for deletion of the capsule locus in Streptococcus

pneumoniae (synthetic PCR construct). 3.307 bp. GenBank Accession no. AF160759.

48. Iannelli F. 1999. Streptococcus pneumoniae strain G376 competence stimulating peptide

precursor (comC) gene, complete cds; and histidine protein kinase (comD3) gene, partial

cds. 423 bp. GenBank Accession no. AF181270.

49. Iannelli F. 2000. Streptococcus pneumoniae factor H-binding inhibitor of complement

(Hic). 2.793 bp. GenBank Accession no. AF252857.





52. Iannelli F. 2000. Streptococcus pneumoniae strain 3496 surface protein PspC (pspC) gene,


53. Santagati, M., Iannelli, F., Oggioni, M.R., Stefani, S. and Pozzi, G. 2000. Streptococcus

pneumoniae macrolide-efflux protein A (mefA), ABC-transporter, and UmuC-MucB-like

protein genes, complete cds; and unknown genes. 7.244 bp. GenBank Accession no.

AF227520.

42

54. Santagati, M., Iannelli, F., Oggioni, M.R., Stefani, S. and Pozzi, G. 2000. Streptococcus

pyogenes macrolide-efflux protein A (mefA), ABC-transporter, and UmuC-MucB-like

protein genes, complete cds; and unknown genes. 8.140 bp. GenBank Accession no.

AF227521.

55. Del Grosso, M., Iannelli, F., Messina, C., Santagati, M.,Petrosillo, N., Stefani, S., Pozzi,G.

and Pantosti,A. 2001. Streptococcus pneumoniae transposon Tn2009, partial sequence.

7.820 bp. GenBank Accession no. AF376746.

56. Bjorck, L., Sjoholm, A., Janulczyk, R., Pozzi, G. and Iannelli, F. 2002. Fh-binding protein

of Streptococcus pneumoniae. Sequence 2 from Patent WO0208426. 27 bp. GenBank

Accession no. AX376604.


of Streptococcus pneumoniae. Sequence 3 from Patent WO0208426. 20 bp. GenBank



of Streptococcus pneumoniae. Sequence 4 from Patent WO0208426. 1.839 bp. GenBank








61. Del Grosso, M., Iannelli, F., Messina, C., Santagati, M.,Petrosillo, N., Stefani, S., Pozzi, G.

and Pantosti, A. 2003. Streptococcus pneumoniae strain PN34 TetM (tetM) gene, complete

cds. 1.994 bp. GenBank Accession no. AY466395.


and Pantosti, A. 2003. Transposon Tn2009, partial sequenze. 174 bp. GenBank Accession

no. AY466609.


and Pantosti, A. 2003. Transposon Tn2009, partial sequenze. 583 bp. GenBank Accession

no. AY466610.

64. Iannelli F. 2003. Streptococcus pneumoniae strain G398 competence-stimulating peptide

precursor (comC) gene, complete cds; and histidine protein kinase (comD4) gene, partial

cds. 423 bp. GenBank Accession no. AY471867.

43

65. Santagati M., Santoro F. and Iannelli F. 2004. Streptococcus phage phi1207.3, complete

genome, 52.491 bp. GenBank Accession no. AY657002.

66. Santagati, M., Iannelli, F., Cascone, C., Campanile, F., Oggioni, M.R.,Stefani, S. and Pozzi,

G. 2004. Streptococcus pyogenes disrupted comEC gene, partial sequence; and transposon

Tn1206, complete sequence. 6.569 bp. GenBank Accession no. AY657003.

67. Arsenijevic, S. and Iannelli, F. 2005. Lactobacillus crispatus DNA gyrase B subunit (gyrB)

gene, partial cds. 1.448 bp. GenBank Accession no. AY943085.

68. Arsenijevic, S. and Iannelli, F. 2005. Lactobacillus crispatus SlpA (slpA), SlpB (slpB),

LytA (lytA), and LytB (lytB) genes, complete cds; and unknown genes. 11.533 bp. GenBank

Accession no. AY941197.

69. Del Grosso, M., Camilli, R., Iannelli, F., Pozzi, G. and Pantosti, A. 2006. Streptococcus

pneumoniae strain PGX1416 transposon Tn2010, partial sequenze. 229 bp. GenBank

Accession no. DQ426906.


pneumoniae strain PGX1416 transposon Tn2010, partial sequence. 442 bp. GenBank



pneumoniae strain AP104 transposon Tn2010, partial sequence. 383 bp. GenBank


72. Camilli, R., Del Grosso, M., Iannelli, F. and Pantosti, A. 2007. Streptococcus pneumoniae

strain AP200 Tn1806 left junction; transposon Tn1806, partial sequence; and Tn1806 right

junction. 11.604 bp. GenBank Accession no. EF469826.

73. Iannelli, F. and Santoro, F. 2007. Streptococcus pneumoniae strain DP1322 conjugative

transposon Tn5253, complete sequence. 66.192 bp. GenBank Accession no. EU351020.

74. Mulas, L., Trappetti, C., Iannelli, F., Pozzi, G., Davidsen, T.M., Tettelin, H. and Oggioni,

M.R. 2008. Streptococcus pneumoniae G54, complete genome. 2.078.953 bp. GenBank

Accession no. CP001015

75. Iannelli, F. and Santoro, F. 2009. Streptococcus pneumoniae transposon Tn5251, complete

sequence. 18.033 bp. GenBank Accession no. FJ711160.

76. Iannelli, F. and Santoro, F. 2010. Streptococcus pneumoniae strain DP1322 Ωcat(pC194)

chromosomal ectopic integrated form. 12.315 bp. GenBank Accession no. GU808561.

77. Camilli, R., Bonnal, R. J. P., Iacono, M., Corti, G., Rizzi, E., Del Grosso, M., Mulas, L.,

Marchetti, M., Iannelli, F., Superti, F., De Bellis, G., Oggioni, M. R. and Pantosti, A. 2010.

44

Streptococcus pneumoniae AP200 chromosome, complete genome. 2.130.580 bp. GenBank

Accession no. NC_014494.

CV Francesco Iannelli - dbm.unisi.it · 5 patogenicità dello Streptococcus pneumoniae. Studio...

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