Congreso Nacional Laboratorio Clínico 2018 · 2018. 11. 12. · 3. Cálculo Bayesiano en E....

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¿De dónde venimos?

¿A dónde vamos?

El laboratorio en la era genómica

María Orera

Hospital Gregorio Marañón

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Cambios en la asistencia sanitaria

Cambios en tres épocas clave

205019901970

Revolución

Industrial

2010

Era

Informática

Era

Genómica

Proteómica

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MISIÓN DEL LAORATORIO CLÍNICO

Aportar información y servicios Mejora labor asistencial▪ Test indicado, persona adecuada, momento

adecuado

▪ Resultados precisos

Diagnóstico correcto

Terapia adecuada

70% decisiones diagnósticas 2.5% gasto sanitario

ASCLS Position statement 2005

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Medicina genómica

• National Research Council• Términos similares• “Medicina personalizada” sugiere que cada paciente tiene un

tratamiento específico• “Medicina de Precisión” implica elegir la mejor opción de

acuerdo a las características de cada paciente.

• España 2017• Se propone el término Medicina Personalizada de Precisión

• España 2018 (Ponencia en el senado)

• Medicina genómicaCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

CARIOTIPO

Gold Standard 46 cromosomas 550 bandas

Resolución 10 Mb 100 genes

Alteraciones numéricas y estructurales

Prevalencia cromosomopatías 0.8%

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FISH

Marca CE, aprobado FDA Diagnóstico robusto y rápido Diagnóstico prenatal Detección de mosaicismos

Sondas de síndromes y alteraciones mas frecuentes Prader Willi Williams Di George Cri du chat…….. t (9;22)Congreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

ExtracciónManual Robotizada

• Múltiples muestras

• Mínima cantidad• Mucosa oral

• Restos forenses

• ADN libre• Total

• Metilado

• RNA

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CGHMetafase Array

Secuencias de ADNMetafaseBACSOligos

▪Compara ADN del paciente con control▪ “CNV”

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CLONAJE ADN PCR

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SECUENCIACIÓNMANUAL AUTOMÁTICA

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Medicina Molecular

La tecnología genómica ha hecho realidad la promesa de mejorar dramáticamente la salud.

Las nuevas tecnologías pueden: Predecir la susceptibilidad individual a enfermar

Detectar las enfermedades en un estadío precoz mas tratable

Personalizar los tratamientos para minimizar las complicaciones

Proactiva no reactiva Mantener la salud vs tratar la enfermedad

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ESPECIALIDADES MÉDICAS

• Neonatología

• Obstetricia

• Ginecología

• Hematología

• Oncología

• Cardiología

• Endocrinología

• Reproducción

• Otorrino

• Gastroenterología

• Farmacogenómica

• Neumología

• Nefrología

• Neurología

• Neuropediatría

• Oftalmología

• Identidad Humana

• Odontología

• Psiquiatría infantilCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Del tratamiento reactivo a la actuación proactiva

Cambio de paradigma

PredisposiciónDiagnóstico MonitorizaciónPrevención

• Estilo Vida

• Nutrición

• Medicación

Terapia

Dirigida

Medicina FuturaMedicina actual

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Cinco cosas que hacíamos hace cinco años

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1. Amniocentesis por edad materna

• Probabilidad > 35 años • 1/300

• Trisomía 21 en < 35 años• 75% de todos los casos

• Riesgo amniocentesis• 0.5-1%

• Outcome de realizar amniocentesis por edad• 3.000 pacientes

• 15 -30 abortos

• 10 trisomías detectadas

• 13 trisomías no detectadas

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Diagnóstico prenatal no invasivo

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ADN fetal en sangre materna

• Ofrecido a toda la población• 100.000 pacientes

• 1 caso no detectado

• 1-3 abortos post amniocentesis

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2. Cariotipo y X Frágil en Autismo

• Prevalencia autismo (TEA)> 1/100

• Prevalencia X Frágil• 1.4/10.000 varones• 0.9 /10.000 mujeres• 2% de pacientes con autismo

• Contar 5.000 metafases para encontrar un paciente con X Frágil• 1-2 días de trabajo “intenso”

• Alteraciones cromosómicas• 2-5%

• Array CGH 180 K• Alterado en 15-20% de pacientes con autismo• Guías de práctica Clínica

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3. Cálculo Bayesiano en E. Duchenne

• Caso índice generalmente no disponible

• Diagnóstico no confirmado clínicamente

• 30-40% nueva mutación

• Cálculo complejo

• Muchas mujeres a riesgo optaban por no tener hijosCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Estudio molecular E. Duchenne

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4. Tratamiento Fibrosis Quística sólo con antibióticos

• Enfermedad muy frecuente• 1/2500

• 1/27 personas portadora de mutación

• Test de sudor no valorable en portadores

• Tratamiento estándar• Antibióticos

• Esperanza de vida < 25 añosCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Terapia dirigida Fibrosis Quística

• 900 mutaciones patogénicas en CFTR• 4% G551D

• Tratamiento específico con Ivacaftor• Mejoría en función pulmonar y

ganancia ponderal

• Aprobado por FDA en 38 mutaciones “gating”

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5. Dar quimioterapia a todas las mujeres con ca de mama

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Resultados Tailor X

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Cinco cosas que no haremos dentro de cinco años

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Axilbund, J et al.

• 1990 pacientes

• Tasa de detección similar

en los que no cumplen criterios

• 50% de pacientes con mutación

NO cumplen criterios

Beitsch et al.

• 364 pacientes

• La misma tasa de detección en

pacientes que no cumplen criterios

1. Aplicar criterios de riesgopara hacer estudios ca de mama

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June 2013

• 1. Actionable disorders

• 2-Informed consent for disclosure of adult onset disorders

• 3.Identification of residual risks after testing

• 4-Only causative mutations should be included

• 5-Quality control

2. Limitar estudios preconcepcionales

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3. No revisar resultados de variantes significado incierto

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• Caso Williams

• Paciente con epilepsia, fallecido en 2006

• Estudio genético• Variante de significado incierto en SCN1A

• Tratamiento con bloqueadores canales de Sodio

• Falleció en 2008

• La familia a llevado a juicio al laboratorio

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4.Cribado prenatal bioquímico

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5. Biopsias combinadas: tumor/líquida

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¿Dónde estamos?

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Los profesionales de laboratorio tenemosun papel primordial en el desarrollo delas pruebas, la validación de las mismas,la interpretación de los resultados y lavaloración de su utilidad clínica.

El futuro es brillante, el camino es largoy los retos que se plantean sonestimulantes.

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