Congreso Nacional Laboratorio Clínico 2018 · 2018. 11. 12. · 3. Cálculo Bayesiano en E....

¿De dónde venimos?

¿A dónde vamos?

El laboratorio en la era genómica

María Orera

Hospital Gregorio Marañón

Congreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Cambios en la asistencia sanitaria

Cambios en tres épocas clave

205019901970

Revolución

Industrial

2010

Era

Informática

Era

Genómica

Proteómica


MISIÓN DEL LAORATORIO CLÍNICO

Aportar información y servicios Mejora labor asistencial▪ Test indicado, persona adecuada, momento

adecuado

▪ Resultados precisos

Diagnóstico correcto

Terapia adecuada

70% decisiones diagnósticas 2.5% gasto sanitario

ASCLS Position statement 2005


Medicina genómica

• National Research Council• Términos similares• “Medicina personalizada” sugiere que cada paciente tiene un

tratamiento específico• “Medicina de Precisión” implica elegir la mejor opción de

acuerdo a las características de cada paciente.

• España 2017• Se propone el término Medicina Personalizada de Precisión

• España 2018 (Ponencia en el senado)

• Medicina genómicaCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

CARIOTIPO

Gold Standard 46 cromosomas 550 bandas

Resolución 10 Mb 100 genes

Alteraciones numéricas y estructurales

Prevalencia cromosomopatías 0.8%


FISH

Marca CE, aprobado FDA Diagnóstico robusto y rápido Diagnóstico prenatal Detección de mosaicismos

Sondas de síndromes y alteraciones mas frecuentes Prader Willi Williams Di George Cri du chat…….. t (9;22)Congreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

ExtracciónManual Robotizada

• Múltiples muestras

• Mínima cantidad• Mucosa oral

• Restos forenses

• ADN libre• Total

• Metilado

• RNA


CGHMetafase Array

Secuencias de ADNMetafaseBACSOligos

▪Compara ADN del paciente con control▪ “CNV”


CLONAJE ADN PCR


SECUENCIACIÓNMANUAL AUTOMÁTICA


Medicina Molecular

La tecnología genómica ha hecho realidad la promesa de mejorar dramáticamente la salud.

Las nuevas tecnologías pueden: Predecir la susceptibilidad individual a enfermar

Detectar las enfermedades en un estadío precoz mas tratable

Personalizar los tratamientos para minimizar las complicaciones

Proactiva no reactiva Mantener la salud vs tratar la enfermedad


ESPECIALIDADES MÉDICAS

• Neonatología

• Obstetricia

• Ginecología

• Hematología

• Oncología

• Cardiología

• Endocrinología

• Reproducción

• Otorrino

• Gastroenterología

• Farmacogenómica

• Neumología

• Nefrología

• Neurología

• Neuropediatría

• Oftalmología

• Identidad Humana

• Odontología

• Psiquiatría infantilCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

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http://images.google.pt/imgres?imgurl=http://clinifamoes.com/Oftalmologia.jpg&imgrefurl=http://clinifamoes.com/MedicinaGeral.html&usg=__27nfbQzBlBHGO5liuwSjXz24Rt8=&h=480&w=640&sz=294&hl=pt-PT&start=2&tbnid=GUrP91mazJhCvM:&tbnh=103&tbnw=137&prev=/images?q=Oftalmologia&gbv=2&hl=pt-PT

Del tratamiento reactivo a la actuación proactiva

Cambio de paradigma

PredisposiciónDiagnóstico MonitorizaciónPrevención

• Estilo Vida

• Nutrición

• Medicación

Terapia

Dirigida

Medicina FuturaMedicina actual


Cinco cosas que hacíamos hace cinco años


1. Amniocentesis por edad materna

• Probabilidad > 35 años • 1/300

• Trisomía 21 en < 35 años• 75% de todos los casos

• Riesgo amniocentesis• 0.5-1%

• Outcome de realizar amniocentesis por edad• 3.000 pacientes

• 15 -30 abortos

• 10 trisomías detectadas

• 13 trisomías no detectadas


Diagnóstico prenatal no invasivo


ADN fetal en sangre materna

• Ofrecido a toda la población• 100.000 pacientes

• 1 caso no detectado

• 1-3 abortos post amniocentesis


2. Cariotipo y X Frágil en Autismo

• Prevalencia autismo (TEA)> 1/100

• Prevalencia X Frágil• 1.4/10.000 varones• 0.9 /10.000 mujeres• 2% de pacientes con autismo

• Contar 5.000 metafases para encontrar un paciente con X Frágil• 1-2 días de trabajo “intenso”

• Alteraciones cromosómicas• 2-5%

• Array CGH 180 K• Alterado en 15-20% de pacientes con autismo• Guías de práctica Clínica


3. Cálculo Bayesiano en E. Duchenne

• Caso índice generalmente no disponible

• Diagnóstico no confirmado clínicamente

• 30-40% nueva mutación

• Cálculo complejo

• Muchas mujeres a riesgo optaban por no tener hijosCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Estudio molecular E. Duchenne


4. Tratamiento Fibrosis Quística sólo con antibióticos

• Enfermedad muy frecuente• 1/2500

• 1/27 personas portadora de mutación

• Test de sudor no valorable en portadores

• Tratamiento estándar• Antibióticos

• Esperanza de vida < 25 añosCongreso Nacional Laboratorio Clínico 2018

Terapia dirigida Fibrosis Quística

• 900 mutaciones patogénicas en CFTR• 4% G551D

• Tratamiento específico con Ivacaftor• Mejoría en función pulmonar y

ganancia ponderal

• Aprobado por FDA en 38 mutaciones “gating”


5. Dar quimioterapia a todas las mujeres con ca de mama


Resultados Tailor X


Cinco cosas que no haremos dentro de cinco años


Axilbund, J et al.

• 1990 pacientes

• Tasa de detección similar

en los que no cumplen criterios

• 50% de pacientes con mutación

NO cumplen criterios

Beitsch et al.

• 364 pacientes

• La misma tasa de detección en

pacientes que no cumplen criterios

1. Aplicar criterios de riesgopara hacer estudios ca de mama


June 2013

• 1. Actionable disorders

• 2-Informed consent for disclosure of adult onset disorders

• 3.Identification of residual risks after testing

• 4-Only causative mutations should be included

• 5-Quality control

2. Limitar estudios preconcepcionales


3. No revisar resultados de variantes significado incierto


• Caso Williams

• Paciente con epilepsia, fallecido en 2006

• Estudio genético• Variante de significado incierto en SCN1A

• Tratamiento con bloqueadores canales de Sodio

• Falleció en 2008

• La familia a llevado a juicio al laboratorio


4.Cribado prenatal bioquímico


5. Biopsias combinadas: tumor/líquida


¿Dónde estamos?


Los profesionales de laboratorio tenemosun papel primordial en el desarrollo delas pruebas, la validación de las mismas,la interpretación de los resultados y lavaloración de su utilidad clínica.

El futuro es brillante, el camino es largoy los retos que se plantean sonestimulantes.


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