Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

19
Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica Mario De Marchi Alfredo Brusco Silvia Saviozzi Alessandro Saluto Nicola Migone Via Santena 19, 10126 Torino (Tel. 011.6706662)

description

Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica. Mario De Marchi. Alfredo Brusco. Silvia Saviozzi. Alessandro Saluto. Nicola Migone. Via Santena 19, 10126 Torino (Tel. 011.6706662). Torta Margherita. 200 g fecola di patate 200 g zucchero 4 uova - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Page 1: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Università degli Studi di TorinoDipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Mario De Marchi Alfredo Brusco Silvia Saviozzi

Alessandro Saluto Nicola Migone

Via Santena 19, 10126 Torino (Tel. 011.6706662)

Page 2: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Torta Margherita

200 g fecola di patate 200 g zucchero 4 uovasucco di mezzo limone 1 bustina zucchero vanigliato 1 bustina lievito 1 pizzico sale

Sbattere bene i tuorli d'uovo con lo zucchero e, sempre mescolando piano piano, aggiungere gradatamente la fecola di patate, il limone, lo zucchero vanigliato, gli albumi montati a neve e, da ultimo, il lievito. Disporre l'impasto in una teglia imburrata e passare in forno appena acceso per circa 25 minuti a temperatura moderata.

Page 3: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Il DNA è un codice per la sintesi di proteine

Page 4: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

La “ricetta” (=sequenza) del gene ATM

GCGAGAGGAGTCGGGATCTGCGCTGCAGCCACCGCCGCGGTTGATACTACTTTGACCTTCCGAGTGCAGTGAGGCATACATCACAATTTGGAATTATGCATTGGTTTATCAATTTACTTGTTTATTGTCACCCTGCTGCCCAGATATGACTTCATGAGGACAGTGATGTGTGTTCTGAAATTGTGAACCATGAGTCTAGTACTTAATGATCTGCTTATCTGCTGCCGTCAACTAGAACATGATAGAGCTACAGAACGAAAGAAAGAAGTTGAGAAATTTAAGCGCCTGATTCGAGATCCTGAAACAATTAAACATCTAGAATTGGGATGCTGTTTTTAGATTTTTACAGAAATATATTCAGAAAGAAACAGAATGTCTGAGAATAGCAAAACCAAATGTATCAGCCTCAACACATCGGCATTCAGATTCCAAACAAGGAAAATATTTGAAGCCTCCAGGCAGAAAAAGATGCAGGAAATCAGTAGTTTGGTCAAATACTTCATCAAATGTGCAAACAGAAGAGCACCTAGGCTAAAATGTCAAGAACTCTTAAATTATATCATGGATACAGTGAAAGATTCATCTAATGGTGCTATTTACGGAGCTGATTGTAGCAACATACTACTCAAAGACATTCTTTCTGTGAGAAAATACTGGTGTGAAATATCTCAGCAACAGTGGTTAGAATTGTTCTCTGTGTACTTCAGGCTCTATCTGAAACCTTCACAAGATGTTCATAGAGTTTTAGTGGCTAGAATAATTCATGCTGTTACCAAAGGATGCTGTTCTCAGACTGACGGATTAAATTCCAAATTTTTGGACTTTTTTTCCAAGGCTATTCAGTGTGCGAGACAAGAAAAGAGCTCTTCAGGTCTAAATCATATCTTAGCAGCTCTTACTATCTTCCTCAAGACTTTGGCTGTCAACTTTCGAATTCGAGTGTGTGAATTAGGAGATGAAATTCTTCCCACTTTGCTTTATATTTGGACTCAACATAGGCTTAATGATTCTTTAAAAGAAGTCATTATTGAATTATTTCAACTGCAAATTTATATCCATCATCCGAAAGGAGCCAAAACCCAAGAAAAAGGTGCTTATGAATCAACAAAATGGAGAAGTATTTTATACAACTTATATGATCTGCTAGTGAATGAGATAAGTCATATAGGAAGTAGAGGAAAGTATTCTTCAGGATTTCGTAATATTGCCGTCAAAGAAAATTTGATTGAATTGATGGCAGATATCTGTCACCAGGTTTTTAATGAAGATACCAGATCCTTGGAGATTTCTCAATCTTACACTACTACACAAAGAGAATCTAGTGATTACAGTGTCCCTTGCAAAAGGAAGAAAATAGAACTAGGCTGGGAAGTAATAAAAGATCACCTTCAGAAGTCACAGAATGATTTTGATCTTGTGCCTTGGCTACAGATTGCAACCCAATTAATATCAAAGTATCCTGCAAGTTTACCTAACTGTGAGCTGTCTCCATTACTGATGATACTATCTCAGCTTCTACCCCAACAGCGACATGGGGAACGTACACCATATGTGTTACGATGCCTTACGGAAGTTGCATTGTGTCAAGACAAGAGGTCAAACCTAGAAAGCTCACAAAAGTCAGATTTATTAAAACTCTGGAATAAAATTTGGTGTATTACCTTTCGTGGTATAAGTTCTGAGCAAATACAAGCTGAAAACTTTGGCTTACTTGGAGCCATAATTCAGGGTAGTTTAGTTGAGGTTGACAGAGAATTCTGGAAGTTATTTACTGGGTCAGCCTGCAGACCTTCATGTCCTGCAGTATGCTGTTTGACTTTGGCACTGACCACCAGTATAGTTCCAGGAGCGGTAAAAATGGGAATAGAGCAAAATATGTGTGAAGTAAATAGAAGCTTTTCTTTAAAGGAATCAATAATGAAATGGCTCTTATTCTATCAGTTAGAGGGTGACTTAGAAAATAGCACAGAAGTGCCTCCAATTCTTCACAGTAATTTTCCTCATCTTGTACTGGAGAAAATTCTTGTGAGTCTCACTATGAAAAACTGTAAAGCTGCAATGAATTTTTTCCAAAGCGTGCCAGAATGTGAACACCACCAAAAAGATAAAGAAGAACTTTCATTCTCAGAAGTAGAAGAACTATTTCTTCAGACAACTTTTGACAAGATGGACTTTTTAACCATTGTGAGAGAATGTGGTATAGAAAAGCACCAGTCCAGTATTGGCTTCTCTGTCCACCAGAATCTCAAGGAATCACTGGATCGCTGTCTTCTGGGATTATCAGAACAGCTTCTGAATAATTACTCATCTGAGATTACAAATTCAGAAACTCTTGTCCGGTGTTCACGTCTTTTGGTGGGTGTCCTTGGCTGCTACTGTTACATGGGTGTAATAGCTGAAGAGGAAGCATATAAGTCAGAATTATTCCAGAAAGCCAACTCTCTAATGCAATGTGCAGGAGAAAGTATCACTCTGTTTAAAAATAAGACAAATGAGGAATTCAGAATTGGTTCCTTGAGAAATATGATGCAGCTATGTACACGTTGCTTGAGCAACTGTACCAAGAAGAGTCCAAATAAGATTGCATCTGGCTTTTTCCTGCGATTGTTAACATCAAAGCTAATGAATGACATTGCAGATATTTGTAAAAGTTTAGCATCCTTCATCAAAAAGCCATTTGACCGTGGAGAAGTAGAATCAATGGAAGATGATACTAATGGAAATCTAATGGAGGTGGAGGATCAGTCATCCATGAATCTATTTAACGATTACCCTGATAGTAGTGTTAGTGATGCAAACGAACCTGGAGAGAGCCAAAGTACCATAGGTGCCATTAATCCTTTAGCTGAAGAATATCTGTCAAAGCAAGATCTACTTTTCTTAGACATGCTCAAGTTCTTGTGTTTGTGTGTAACTACTGCTCAGACCAATACTGTGTCCTTTAGGGCAGCTGATATTCGGAGGAAATTGTTAATGTTAATTGATTCTAGCACGCTAGAACCTACCAAATCCCTCCACCTGCATATGTATCTAATGCTTTTAAAGGAGCTTCCTGGAGAAGAGTACCCCTTGCCAATGGAAGATGTTCTTGAACTTCTGAAACCACTATCCAATGTGTGTTCTTTGTATCGTCGTGACCAAGATGTTTGTAAAACTATTTTAAACCATGTCCTTCATGTAGTGAAAAACCTAGGTCAAAGCAATATGGACTCTGAGAACACAAGGGATGCTCAAGGACAGTTTCTTACAGTAATTGGAGCATTTTGGCATCTAACAAAGGAGAGGAAATATATATTCTCTGTAAGAATGGCCCTAGTAAATTGCCTTAAAACTTTGCTTGAGGCTGATCCTTATTCAAAATGGGCCATTCTTAATGTAATGGGAAAAGACTTTCCTGTAAATGAAGTATTTACACAATTTCTTGCTGACAATCATCACCAAGTTCGCATGTTGGCTGCAGAGTCAATCAATAGATTGTTCCAGGACACGAAGGGAGATTCTTCCAGGTTACTGAAAGCACTTCCTTTGAAGCTTCAGCAAACAGCTTTTGAAAATGCATACTTGAAAGCTCAGGAAGGAATGAGAGAAATGTCCCATAGTGCTGAGAACCCTGAAACTTTGGATGAAATTTATAATAGAAAATCTGTTTTACTGACGTTGATAGCTGTGGTTTTATCCTGTAGCCCTATCTGCGAAAAACAGGCTTTGTTTGCCCTGTGTAAATCTGTGAAAGAGAATGGATTAGAACCTCACCTTGTGAAAAAGGTTTTAGAGAAAGTTTCTGAAACTTTTGGATATAGACGTTTAGAAGACTTTATGGCATCTCATTTAGATTATCTGGTTTTGGAATGGCTAAATCTTCAAGATACTGAATACAACTTATCTTCTTTTCCTTTTATTTTATTAAACTACACAAATATTGAGGATTTCTATAGATCTTGTTATAAGGTTTTGATTCCACATCTGGTGATTAGAAGTCATTTTGATGAGGTGAAGTCCATTGCTAATCAGATTCAAGAGGACTGGAAAAGTCTTCTAACAGACTGCTTTCCAAAGATTCTTGTAAATATTCTTCCTTATTTTGCCTATGAGGGTACCAGAGACAGTGGGATGGCACAGCAAAGAGAGACTGCTACCAAGGTCTATGATATGCTTAAAAGTGAAAACTTATTGGGAAAACAGATTGATCACTTATTCATTAGTAATTTACCAGAGATTGTGGTGGAGTTATTGATGACGTTACATGAGCCAGCAAATTCTAGTGCCAGTCAGAGCACTGACCTCTGTGACTTTTCAGGGGATTTGGATCCTGCTCCTAATCCACCTCATTTTCCATCGCATGTGATTAAAGCAACATTTGCCTATATCAGCAATTGTCATAAAACCAAGTTAAAAAGCATTTTAGAAATTCTTTCCAAAAGCCCTGATTCCTATCAGAAAATTCTTCTTGCCATATGTGAGCAAGCAGCTGAAACAAATAATGTTTATAAGAAGCACAGAATTCTTAAAATATATCACCTGTTTGTTAGTTTATTACTGAAAGATATAAAAAGTGGCTTAGGAGGAGCTTGGGCCTTTGTTCTTCGAGACGTTATTTATACTTTGATTCACTATATCAACCAAAGGCCTTCTTGTATCATGGATGTGTCATTACGTAGCTTCTCCCTTTGTTGTGACTTATTAAGTCAGGTTTGCCAGACAGCCGTGACTTACTGTAAGGATGCTCTAGAAAACCATCTTCATGTTATTGTTGGTACACTTATACCCCTTGTGTATGAGCAGGTGGAGGTTCAGAAACAGGTATTGGACTTGTTGAAATACTTAGTGATAGATAACAAGGATAATGAAAACCTCTATATCACGATTAAGCTTTTAGATCCTTTTCCTGACCATGTTGTTTTTAAGGATTTGCGTATTACTCAGCAAAAAATCAAATACAGTAGAGGACCCTTTTCACTCTTGGAGGAAATTAACCATTTTCTCTCAGTAAGTGTTTATGATGCACTTCCATTGACAAGACTTGAAGGACTAAAGGATCTTCGAAGACAACTGGAACTACATAAAGATCAGATGGTGGACATTATGAGAGCTTCTCAGGATAATCCGCAAGATGGGATTATGGTGAAACTAGTTGTCAATTTGTTGCAGTTATCCAAGATGGCAATAAACCACACTGGTGAAAAAGAAGTTCTAGAGGCTGTTGGAAGCTGCTTGGGAGAAGTGGGTCCTATAGATTTCTCTACCATAGCTATACAACATAGTAAAGATGCATCTTATACCAAGGCCCTTAAGTTATTTGAAGATAAAGAACTTCAGTGGACCTTCATAATGCTGACCTACCTGAATAACACACTGGTAGAAGATTGTGTCAAAGTTCGATCAGCAGCTGTTACCTGTTTGAAAAACATTTTAGCCACAAAGACTGGACATAGTTTCTGGGAGATTTATAAGATGACAACAGATCCAATGCTGGCCTATCTACAGCCTTTTAGAACATCAAGAAAAAAGTTTTTAGAAGTACCCAGATTTGACAAAGAAAACCCTTTTGAAGGCCTGGATGATATAAATCTGTGGATTCCTCTAAGTGAAAATCATGACATTTGGATAAAGACACTGACTTGTGCTTTTTTGGACAGTGGAGGCACAAAATGTGAAATTCTTCAATTATTAAAGCCAATGTGTGAAGTGAAAACTGACTTTTGTCAGACTGTACTTCCATACTTGATTCATGATATTTTACTCCAAGATACAAATGAATCATGGAGAAATCTGCTTTCTACACATGTTCAGGGATTTTTCACCAGCTGTCTTCGACACTTCTCGCAAACGAGCCGATCCACAACCCCTGCAAACTTGGATTCAGAGTCAGAGCACTTTTTCCGATGCTGTTTGGATAAAAAATCACAAAGAACAATGCTTGCTGTTGTGGACTACATGAGAAGACAAAAGAGACCTTCTTCAGGAACAATTTTTAATGATGCTTTCTGGCTGGATTTAAATTATCTAGAAGTTGCCAAGGTAGCTCAGTCTTGTGCTGCTCACTTTACAGCTTTACTCTATGCAGAAATCTATGCAGATAAGAAAAGTATGGATGATCAAGAGAAAAGAAGTCTTGCATTTGAAGAAGGAAGCCAGAGTACAACTATTTCTAGCTTGAGTGAAAAAAGTAAAGAAGAAACTGGAATAAGTTTACAGGATCTTCTCTTAGAAATCTACAGAAGTATAGGGGAGCCAGATAGTTTGTATGGCTGTGGTGGAGGGAAGATGTTACAACCCATTACTAGACTACGAACATATGAACACGAAGCAATGTGGGGCAAAGCCCTAGTAACATATGACCTCGAAACAGCAATCCCCTCATCAACACGCCAGGCAGGAATCATTCAGGCCTTGCAGAATTTGGGACTCTGCCATATTCTTTCCGTCTATTTAAAAGGATTGGATTATGAAAATAAAGACTGGTGTCCTGAACTAGAAGAACTTCATTACCAAGCAGCATGGAGGAATATGCAGTGGGACCATTGCACTTCCGTCAGCAAAGAAGTAGAAGGAACCAGTTACCATGAATCATTGTACAATGCTCTACAATCTCTAAGAGACAGAGAATTCTCTACATTTTATGAAAGTCTCAAATATGCCAGAGTAAAAGAAGTGGAAGAGATGTGTAAGCGCAGCCTTGAGTCTGTGTATTCGCTCTATCCCACACTTAGCAGGTTGCAGGCCATTGGAGAGCTGGAAAGCATTGGGGAGCTTTTCTCAAGATCAGTCACACATAGACAACTCTCTGAAGTATATATTAAGTGGCAGAAACACTCCCAGCTTCTCAAGGACAGTGATTTTAGTTTTCAGGAGCCTATCATGGCTCTACGCACAGTCATTTTGGAGATCCTGATGGAAAAGGAAATGGACAACTCACAAAGAGAATGTATTAAGGACATTCTCACCAAACACCTTGTAGAACTCTCTATACTGGCCAGAACTTTCAAGAACACTCAGCTCCCTGAAAGGGCAATATTTCAAATTAAACAGTACAATTCAGTTAGCTGTGGAGTCTCTGAGTGGCAGCTGGAAGAAGCACAAGTATTCTGGGCAAAAAAGGAGCAGAGTCTTGCCCTGAGTATTCTCAAGCAAATGATCAAGAAGTTGGATGCCAGCTGTGCAGCGAACAATCCCAGCCTAAAACTTACATACACAGAATGTCTGAGGGTTTGTGGCAACTGGTTAGCAGAAACGTGCTTAGAAAATCCTGCGGTCATCATGCAGACCTATCTAGAAAAGGCAGTAGAAGTTGCTGGAAATTATGATGGAGAAAGTAGTGATGAGCTAAGAAATGGAAAAATGAAGGCATTTCTCTCATTAGCCCGGTTTTCAGATACTCAATACCAAAGAATTGAAAACTACATGAAATCATCGGAATTTGAAAACAAGCAAGCTCTCCTGAAAAGAGCCAAAGAGGAAGTAGGTCTCCTTAGGGAACATAAAATTCAGACAAACAGATACACAGTAAAGGTTCAGCGAGAGCTGGAGTTGGATGAATTAGCCCTGCGTGCACTGAAAGAGGATCGTAAACGCTTCTTATGTAAAGCAGTTGAAAATTATATCAACTGCTTATTAAGTGGAGAAGAACATGATATGTGGGTATTCCGGCTTTGTTCCCTCTGGCTTGAAAATTCTGGAGTTTCTGAAGTCAATGGCATGATGAAGAGAGACGGAATGAAGATTCCAACATATAAATTTTTGCCTCTTATGTACCAATTGGCTGCTAGAATGGGGACCAAGATGATGGGAGGCCTAGGATTTCATGAAGTCCTCAATAATCTAATCTCTAGAATTTCAATGGATCACCCCCATCACACTTTGTTTATTATACTGGCCTTAGCAAATGCAAACAGAGATGAATTTCTGACTAAACCAGAGGTAGCCAGAAGAAGCAGAATAACTAAAAATGTGCCTAAACAAAGCTCTCAGCTTGATGAGGATCGAACAGAGGCTGCAAATAGAATAATATGTACTATCAGAAGTAGGAGACCTCAGATGGTCAGAAGTGTTGAGGCACTTTGTGATGCTTATATTATATTAGCAAACTTAGATGCCACTCAGTGGAAGACTCAGAGAAAAGGCATAAATATTCCAGCAGACCAGCCAATTACTAAACTTAAGAATTTAGAAGATGTTGTTGTCCCTACTATGGAAATTAAGGTGGACCACACAGGAGAATATGGAAATCTGGTGACTATACAGTCATTTAAAGCAGAATTTCGCTTAGCAGGAGGTGTAAATTTACCAAAAATAATAGATTGTGTAGGTTCCGATGGCAAGGAGAGGAGACAGCTTGTTAAGGGCCGTGATGACCTGAGACAAGATGCTGTCATGCAACAGGTCTTCCAGATGTGTAATACATTACTGCAGAGAAACACGGAAACTAGGAAGAGGAAATTAACTATCTGTACTTATAAGGTGGTTCCCCTCTCTCAGCGAAGTGGTGTTCTTGAATGGTGCACAGGAACTGTCCCCATTGGTGAATTTCTTGTTAACAATGAAGATGGTGCTCATAAAAGATACAGGCCAAATGATTTCAGTGCCTTTCAGTGCCAAAAGAAAATGATGGAGGTGCAAAAAAAGTCTTTTGAAGAGAAATATGAAGTCTTCATGGATGTTTGCCAAAATTTTCAACCAGTTTTCCGTTACTTCTGCATGGAAAAATTCTTGGATCCAGCTATTTGGTTTGAGAAGCGATTGGCTTATACGCGCAGTGTAGCTACTTCTTCTATTGTTGGTTACATACTTGGACTTGGTGATAGACATGTACAGAATATCTTGATAAATGAGCAGTCAGCAGAACTTGTACATATAGATCTAGGTGTTGCTTTTGAACAGGGCAAAATCCTTCCTACTCCTGAGACAGTTCCTTTTAGACTCACCAGAGATATTGTGGATGGCATGGGCATTACGGGTGTTGAAGGTGTCTTCAGAAGATGCTGTGAGAAAACCATGGAAGTGATGAGAAACTCTCAGGAAACTCTGTTAACCATTGTAGAGGTCCTTCTATATGATCCACTCTTTGACTGGACCATGAATCCTTTGAAAGCTTTGTATTTACAGCAGAGGCCGGAAGATGAAACTGAGCTTCACCCTACTCTGAATGCAGATGACCAAGAATGCAAACGAAATCTCAGTGATATTGACCAGAGTTTCGACAAAGTAGCTGAACGTGTCTTAATGAGACTACAAGAGAAACTGAAAGGAGTGGAAGAAGGCACTGTGCTCAGTGTTGGTGGACAGGTGAATTTGCTCATACAGCAGGCCATAGACCCCAAAAATCTCAGCCGACTTTTCCCAGGATGGAAAGCTTGGGTGTGATCTTCAGTATATGAATTACCCTTTC

Page 5: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

e la proteina ATM

ATM

• E’ presente in tutti i tessuti nei soggetti sani• E’ assente o fortemente ridotta nei malati

Page 6: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Che cos’è una mutazione:un cambiamento nella sequenza del

DNA

•Le mutazioni sono alla base della variabilità genetica, ad es. l’altezza, la pressione sanguigna, il colore della pelle.

• In alcuni casi la variabilità genetica porta ad una malattia genetica

Page 7: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Tipi di mutazione

Cambia il senso

Interrompe il codice

ATMATM

20-40%20-40%

60-80%60-80%

Page 8: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Il gene ATM è uno dei più grandi geni noti

ATM

Gene medio2500 basi2500 basi

10.000 basi10.000 basi

Page 9: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Come si cercano le mutazioni

• Prelievo di sangue

• Estrazione del DNA

• Analisi con tecniche di biologia

molecolare (individuano la regione colpita)

• Lettura della “sequenza” del DNA

• Prelievo di sangue

• Estrazione del DNA

• Analisi con tecniche di biologia

molecolare (individuano la regione colpita)

• Lettura della “sequenza” del DNA

Page 10: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Perché si cercano le mutazioni

• Diagnosi certa

• Identificazione dei portatori

• Diagnosi prenatale

• Scopi di ricerca

Page 11: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Registro italiano pazienti A-T

(RIAT)- Roma-Prof. L.Chessa

Pazienti analizzati: 29

I nostri risultatiI nostri risultati

Page 12: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Analisi di mutazioni di ATM mediante PTTAnalisi di mutazioni di ATM mediante PTT

4-1312-24

22-32

31-4441-53

52-66

mRNA

cDNA

PCR fragments

protein

in vitro transcription

in vitro translation

T7-eu-ATG

CCc 1 2 3

PAGE-SDS

cDNAcDNA

Reverse transcription and

nested PCR

Page 13: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Interrompono il codice1240 C 1240 C T Q414X Gilad 1996T Q414X Gilad 19962413 C 2413 C T R805XT R805X5229 A 5229 A T K1743X Gatti T K1743X Gatti 5574 A 5574 A T W1858XGilad 1998T W1858XGilad 19986913 C 6913 C T Q2304XT Q2304X7327 C 7327 C T R245XT R245X7792 C 7792 C T R2598X Wright 1996T R2598X Wright 19968545 C 8545 C T K2848X Gatti el al.T K2848X Gatti el al.8977 C 8977 C T R2993XT R2993X9139 C 9139 C T R3065X Gilad 1998T R3065X Gilad 1998

1240 C 1240 C T Q414X Gilad 1996T Q414X Gilad 19962413 C 2413 C T R805XT R805X5229 A 5229 A T K1743X Gatti T K1743X Gatti 5574 A 5574 A T W1858XGilad 1998T W1858XGilad 19986913 C 6913 C T Q2304XT Q2304X7327 C 7327 C T R245XT R245X7792 C 7792 C T R2598X Wright 1996T R2598X Wright 19968545 C 8545 C T K2848X Gatti el al.T K2848X Gatti el al.8977 C 8977 C T R2993XT R2993X9139 C 9139 C T R3065X Gilad 1998T R3065X Gilad 1998

Exon 1 10 20 30 40 50 60

Alcune mutazioni di ATM

Cambiano il sensoCambiano il senso128 T 128 T C L43P ShilohC L43P Shiloh7408 T7408 TG Y2470D G Y2470D 8708 C 8708 C T P2903LT P2903L8711 A 8711 A G E2904G GiladG E2904G Gilad

Page 14: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Exon 1 10 20 30 40 50 60

Non senso

DelezioniDelezioni

InserzioniInserzioni

Distribuzione delle mutazioni ATM

Distribuzione delle mutazioni ATM

Difetti di splicingDifetti di splicing

**

* Mutazioni presenti in più famiglie

Interrompono il codice

Cambiano il senso

Page 15: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

ConclusioniConclusioni

• Sono state individuate il 70% delle mutazioni

• La proteina può essere colpita in qualunque posizione

• Sono rare le mutazioni che ricorrono in più famiglie

• Non è possibile predire l’andamento della patologia sulla base delle mutazioni

• Sono state individuate il 70% delle mutazioni

• La proteina può essere colpita in qualunque posizione

• Sono rare le mutazioni che ricorrono in più famiglie

• Non è possibile predire l’andamento della patologia sulla base delle mutazioni

Page 16: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Nuovo progetto

Messa a punto di sistemi di analisi di mutazioni mediante DHPLC

Messa a punto di sistemi di analisi di mutazioni mediante DHPLC

Page 17: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Analisi di ATM mediante DHPLCPer ogni paziente si eseguono 66 reazioni indipendenti che la macchina analizza in automatico.

Se in una reazione si ottiene una possibile mutazione si sequenzia il DNA corrispondente

Per ogni paziente si eseguono 66 reazioni indipendenti che la macchina analizza in automatico.

Se in una reazione si ottiene una possibile mutazione si sequenzia il DNA corrispondente

Page 18: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

Prospettive

• Sistema rapido per analisi di mutazioni

• Ricerca di tutti i tipi di mutazione

• Fornire un test per le famiglie che lo richiedano

• Sistema rapido per analisi di mutazioni

• Ricerca di tutti i tipi di mutazione

• Fornire un test per le famiglie che lo richiedano

Page 19: Università degli Studi di Torino Dipartimento di Genetica Biologia e Biochimica

RingraziamentiRingraziamenti

Associazione ONLUS

Gli Amici di ValentinaAssociazione ONLUS

Gli Amici di Valentina