Banca Nazionale Microrganismi

La Banca Nazionale Microrganismi è un centro di ricer-ca biologica finalizzato all’isolamento, autenticazione, conservazione, studio e distribuzione di microorgani-smi provenienti da ambienti acquatici; il centro è una risorsa di ceppi caratterizzati di microrganismi per istituzioni di ricerca e privati.

Referente Scientifico | Prof. Pietro AlifanoReferente Tecnico | Dott. Maurizio Tredici

Strumentazione & Servizi

Caratterizzazione fenotipica e genotipica di batteri di origine marina da campioni di acqua, sedimento ed organismi marini;

Isolamento e caratterizzazione dei microrganismi mediante test morfologici e colturali;

Identificazione biochimica dei batteri mediante test miniaturizzati;

Identificazione molecolare mediante PCR del gene codificante per l’RNA 16S e successivo sequenziamen-to e analisi filogenetica MLST;

Identificazione di marker genetici mediante RT-PCR;-

lati sono confrontati con quelli di riferimento, custoditi e messi a disposizione della comunità scientifica;

Sviluppo di know-how sulle associazioni microrgani-smi-alghe e microrganismi-macrorganismi nell’ambien-te marino: - Determinazione della Concentrazione minima ini-bente (MIC); - Test di resistenza; - Test per determinare una preservazione sufficiente;

Metodiche per l’utilizzo di batteri in campo biotecno-logico;

Metodologie per la ricerca e caratterizzazione di fagi dall’ambiente acquatico.

Opportunità di collaborazione

La Banca Nazionale Microrganismi, così come le altre facility di BIOforIU, è aperta all’uso esterno da parte di soggetti pubblici e privati. Volete proporre una colla-borazione scientifica, un progetto o semplicemente usufruire della strumentazione e dei servizi disponibili? Contattate i referenti per informazioni sulle condizioni d’uso. | pietro.alifano@unisalento.it | maurizio.tredici@unisalento.it

BIOforIU- Il Valore aggiunto della rete

La Banca Nazionale Microrganismi si inserisce in BIOforIU, infrastruttura finalizzata allo studio degli or-ganismi viventi e dei meccanismi alla base del funzio-namento della biodiversità. BIOforIU presenta un va-lore aggiunto in termini di sinergia, complementarietà di competenze e risorse, e rappresenta un modello di cooperazione che fa dell’interdisciplinarietà nell’ap-proccio la risposta alle sfide della crescente comples-sità dei fenomeni studiati. BIOforIU è articolato in 5 nodi: Centro Sperimentale di Ricerca su Biodiversità e Funzionamento degli Ecosistemi (Lecce), Infrastruttura Avanzata per lo Studio della Biodiversità Molecolare (Bari), Infrastruttura di Bioimaging Avanzato e di Ri-cerca per lo Studio degli Organismi Marini (Napoli) ed Osservatorio per la Biodiversità Marina (Capo Granito-la). BIOforIU lavora in rete con infrastrutture di ricerca europee quali ELIXIR, LifeWatch, EMBRC ed EuroBioImaging.

Cosa possiamo fare

La Banca Nazionale Microrganismi costituisce un’im-portante risorsa e un punto di riferimento per tutti i gruppi di ricerca impegnati: 1) nello studio dell’ecologia marina e biodiversità, 2) in progetti di biorisanamento, 3) nella ricerca di nuovi indicatori dello stato di salute delle acque e dell’ambiente costiero, 4) in progetti di acquacoltura e pescicoltura, 5) nella ricerca di com-posti naturali di interesse medico e biotecnologico (biopolimeri, sostanze adesive, colloidi, neurotossine, enzimi termostabili, anticoagulanti, immunostimolan-ti, prodotti di vie metaboliche alternative). Inoltre, la raccolta di microrganismi marini è una preziosa risorsa per tutti i ricercatori, pubblici e dell’industria privata, impegnati in progetti di screening di nuove molecole bioattive, enzimi e metaboliti secondari quali antibio-tici, antivirali, antitumorali, antinfiammatori, ma anche enzimi e molecole utili nel campo agroalimentare.

It

BIODIVERSITY ORGANISATION & ECOSYSTEM FUNCTIONING

http://bioforiu.unisalento.it

The National Microorganisms Bank

The National Microorganisms Bank is a biological re-search centre working on the isolation, authentication, conservation, study and distribution of microorganisms from aquatic environments. The centre is a source of characterised strains of microorganisms for research institutions and private enterprise.

Scientific Referent | Prof Pietro AlifanoTechnical Referent | Dr Maurizio Tredici

Equipment & Services

Phenotypic and genotypic characterisation of bacte-ria of marine origin from water samples, sediment and marine organisms;

Isolation and characterisation of microorganisms by means of morphological testing and cultures;

Biochemical identification of bacteria by means of miniaturised tests;

Molecular identification by PCR of the gene encod-ing RNA 16S followed by Multi-locus Sequence Typing (MLST) and phylogenetic analysis;

Identification of genetic markers by RT-PCR; Creation of a bank in which the isolated bacterial

strains are compared with those of reference, stored and made available to the scientific community;

Development of know-how on microorganism-alga and microorganism-macroorganism associations in the marine environment: - Determination of the Minimum Inhibitory Concentra-tion (MIC); - Resistance tests; - Tests to determine sufficient preservation;

Methods for the use of bacteria in biotechnology; Approaches to the search for and characterisation of

phages in aquatic environments.

Opportunities for Cooperation

Just like the other BIOforIU facilities, the National Microorganisms Bank is available for external use by public and private organisations and individuals. Would you like to propose a form of scientific cooperation, a joint project or simply make use of the equipment and services available? Contact our scientific and technical staff to obtain complete information on the conditions of use and access. | pietro.alifano@unisalento.it | maurizio.tredici@unisalento.it

BIOforIU – The Benefits Of The Network

The National Microorganisms Bank is provided by BIOforIU, an infrastructure designed to study living organisms and the mechanisms that underlie the functioning of biodiversity. BIOforIU draws its strength from synergism and the complementarity of skills and resources. It represents a model of cooperation whose interdisciplinary approach provides responses to the challenges arising from the growing complexity of the studied phenomena. BIOforIU is organised into 5 units: an experimental centre for biodiversity and ecosystem functioning research (Lecce), an advanced centre for the study of molecular biodiversity (Bari), an advanced centre for bioimaging and research into marine organ-isms (Naples) and the observatory for marine biodiver-sity (Capo Granitola). BIOforIU forms part of a network of European research bodies including ELIXIR, LifeWatch and EMBRC.

What We Can Do

The National Microorganisms Bank constitutes an important resource on the local, national and inter-national level, a useful point of reference for all re-search groups interested in: 1) the study of marine ecology and biodiversity, 2) bioremediation projects, 3) research into new indicators of the state of health of waters and coastal environments, 4) aquaculture and fish-farming projects, 5) research into natural compounds of medical and biotechnological interest (biopolymers, adhesives, colloids, neurotoxins, ther-mostable enzymes, anticoagulants, immunostimulants, alternative metabolic pathway products). In addition, the collection of marine microorganisms is a valuable and unique resource for all public and private sector researchers involved in the screening of new bioactive molecules, enzymes and secondary metabolites for use as antibiotics, antivirals, antitumorals and anti-inflam-matory agents, but also enzymes and molecules useful in the field of agriculture and food processing.

En

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