Come installare R, RStudio ed il pacchetto psych (o altri pacchetti di R)

Sommario Installare R ed i pacchetti rilevanti .................................................................................................................... 1

Installare R per la prima volta ....................................................................................................................... 1

Come installare R dal sito CRAN.................................................................................................................. 2

Procedura step by step ............................................................................................................................... 2

Cos’altro scaricare nella finestra riportata in Fig. 1: ................................................................................. 4

Cosa sono R e CRAN? ...................................................................................................................................... 4

Istallare i pacchetti rilevanti .............................................................................................................................. 6

Installare R per Mac OS X ............................................................................................................................ 7

Come scaricare RStudio .................................................................................................................................... 9

Installazione di RStudio step by step ........................................................................................................... 10

Struttura dell’interfaccia di RStudio ............................................................................................................ 11

La fascia dei menù ....................................................................................................................................... 12

Installare alcuni pacchetti aggiuntivi (da R) .................................................................................................... 12

Installare una visione delle attività per avere molti pacchetti ..................................................................... 12

Come attivare il pacchetto psych ................................................................................................................. 13

Vedere quali siano i pacchetti installati ed attivi ......................................................................................... 13

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Installare R ed i pacchetti rilevanti

Per usare R ovviamente si richiede l’installazione di R sul vostro computer. Questo è molto semplice da fare

(vedi la sezione 2.1.1) e si ha bisogno di farlo una volta.

La potenza/forza di R è nei pacchetti supplementari. Ci sono almeno 8,300 pacchetti che hanno contribuito al

progetto R. Per eseguire qualsiasi analisi discussa in questa guida, avrete bisogno di installare il pacchetto

psych. Per eseguire analisi fattoriali o analisi dei principali componenti avrete anche bisogno del pacchetto

per le rotazioni fattoriali GPArotation. Se volte riuscire a fare l’analisi fattoriale confermativa, dovrete

aggiungere anche il pacchetto sem o lavaan. Se volete usare psych per creare assetti di dati simulati, avrete

anche bisogno del pacchetto mnort . Per una installazione ancora più completa di un numero di pacchetti

psicometrici, potete installare ed attivare un pacchetto, ctv, che installa un insieme di pacchetti

psicometricamente rilevanti.

Come per i pacchetti, lo stesso vale per R: basta installare il pacchetto solo una volta (nota bene: i pacchetti

installati vanno periodicamente aggiornati, così come lo stesso programma R).

Installare R per la prima volta

I vari step sono:

1. Scaricate da R CRAN l’ultima versione di R (http://cran.r-project.org/ -- vedi figura 1).

2. Scegliete il sistema operativo appropriato e scaricare il programma R compilato.

3. Installate R (dopo l’installazione comparirà uno short sul desktop cliccando sul quale si può

avviare subito R. Altrimenti usate il menù Programmi di Windows).

4. Avviate R. Notate che il comando R inizia ad ogni riga. Le righe di comando sono evidenziate

dal simbolo “>”. Questo è il modo di R per indicare la richiesta di input. Le righe di output, ossia

quelle che riportano o stampano l’esito dei calcoli, sono indicate con il simbolo “[1]”.

5. Aggiungete i pacchetti utili o che servono alle vostre analisi (avete bisogno di farlo una sola

volta) (vedi la sezione precedente).

a) O se volete fare una CFA (Confirmative Factor Analysis).

b) O se volete visualizzare elaborazioni di tipo psicometrico

6. Fate una pausa di 5 minuti mentre vengono caricati i pacchetti (sulla console vengono man

mano indicati quali pacchetti sono caricati, dove vengono installati e poi da un avviso per segnalare

se l’installazione è avvenuta correttamente o no).

7. Attivate i pacchetti che volete usare (per es. psych) con il comando “library()”:

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psych attiverà automaticamente i comandi e le funzioni di cui ha bisogno, purché essi siano

installati. Fate attenzione che psych venga aggiornato circa ogni tre-sei mesi.

Fig.1. la finestra del CRAN base vi permette di scegliere il vostro sistema operativo. Il CRAN si trova al seguente

indirizzo: http://cran.r-project.org.

Come installare R dal sito CRAN

Procedura step by step 1. Andate sul sito http://cran.r-project.org

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2. cliccate “Download R for Windows”

3. cliccate sul link “base”

4. cliccate su “Download R X.X.X for Windows” (dato che R viene continuamente aggiornato,

indichiamo generalmente con X.X.X I codici numerici delle versioni di R)

5. comparirà un finestra di messaggio come la seguente:

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Cliccate su “salva file”, scegliete la cartella o directory di destinazione (ricordate poi qual è).

6. Per installare R basta cliccare sul file “R-X.X.X-win-exe” e seguire tutte le indicazioni che vi

verranno fornite durante l’installazione dalle finestre di messaggio.

Cos’altro scaricare nella finestra riportata in Fig. 1:

L’ultimo rilascio di R versione X.X.X (leggete cosa vi è di nuovo nella più recente

versione).

Le fonti di R alpha e dei rilasci beta (brevi rappresentazioni, create in dati periodi prima di

un rilascio programmato).

Scatti/istantanee giornalieri di versioni recentemente sistemate e sviluppate di R e dei

pacchetti messe a disposizione sul sito. Leggete le nuove caratteristiche e le risoluzioni dei

problemi prima di compilare le corrispettive richieste o rapporti sui problemi tecnici (bug).

Il codice base delle versioni più vecchie di R.

Pacchetti di R ed estensioni di R forniti direttamente dagli sviluppatori.

Inoltre vengono fornite informazioni sulle condizioni di licenza per l’uso di R. R è una open

source, nel senso che non si viola nessun copyright se si scarica R sul proprio computer o sul

computer di altri. R è un programma completamente gratuito e accessibile a chiunque (basta

avere una connessione internet).

Cosa sono R e CRAN?

R e una GNU’S, una lingua liberamente disponibile ed un ambiente per la computazione statistica e

grafica che fornisce una ampia gamma di tecniche grafiche e statistiche: modelli lineari e non

lineari, test statistici, analisi temporali in serie, raggruppamenti, ecc. Consultate la pagina di R

project per ulteriori informazioni.

CRAN è una rete di server ftp e web (mirrors) siti in varie parti del mondo che immagazzinano

versioni identiche ed aggiornate di documenti e pacchetti di R. Utilizzate per favore il mirror CRAN

più vicino a voi per minimizzare il carico di rete.

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Fig.2 La schermata iniziale per un PC di R (senza aver installato RStudio)

Traduzione della schermata: R è un software gratuito e si trova senza alcuna autorizzazione Siete invitati a ridistribuirlo a certe condizioni. Digitate “license()” o “licence()” per i dettagli sulla distribuzione Supporta un linguaggio naturale ma solo di tipo inglese. R è un progetto collaborativo con molti contributori Digita “contributors()” per maggior informazioni e “citation()” su come citare R o i pacchetti R nelle pubblicazioni Digita “demo()” per alcune dimostrazioni o “help()” per aiuto online o “help.start()” per un’interfaccia browser HTML che fornisca aiuto Digita “q()” per uscire da R.

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Fig.3 Una schermata di RStudio come appare su un pc. Le 4 finestre sono per i vostri script, la console del programma,

i grafici e le finestre di aiuto. La scelta del colore è opzionale e personalizzabile.

Istallare i pacchetti rilevanti

Una volta installato R sulla vostra macchina/pc , avrete ancora bisogno di installare alcuni pacchetti

rilevanti o necessari per le vostre analisi. I pacchetti sono ciò che rendono R così potente, poiché

sono insiemi speciali di funzioni che sono pensate una applicazione specifica. Nel caso del

pacchetto psych, questa è una applicazione per eseguire analisi dei dati di base ed analisi

psicometriche che gli psicologi ed altri ricercatori che lavorano in ambito psicologico trovano

particolarmente utili.

Voi potrete installare un insieme minimo di pacchetti necessari per eseguire le analisi, ad esempio

per eseguire l’analisi fattoriale esplorativa (EFA) oppure l’analisi fattoriale confermativa (CFA). È

anche possibile aggiungere altri pacchetti rilevanti a livello psicometrico. Un pacchetto

particolarmente potente è il lavaan, per eseguire la CFA. Un altro pacchetto utile per la CFA è sem.

Installare il numero minimale di pacchetti. Questo può esser effettuato digitando nella console il

comando o usando le opzioni di menu (per es. “Install Packages...” sotto il menu Tools):

La funzione “dependencies=TRUE” serve per scaricare pacchetti che possono essere collegati con il

pacchetto “psych”.

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Fig.4 Per il Mac, vorrete scegliere l’ultima versione che include sia GUI che le versioni da 32 e 64 bit.

Installare R per Mac OS X

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La directory/cartella del sito contiene i file binari per una distribuzione di base e pacchetti da

utilizzare sul MAC OS X (rilascio/versione 10.6 e precedenti) . Mac OS 8.6 sino al 9.2 e Mac OS X

10.1 non sono più supportati ma potete trovare nel sito l’ultima versione supportata di R per questi

sistemi (che è R 1.7.1). La versione per il vecchio sistema Mac OS X (compreso Mac OS X 10.5) e

i-Mac Power-PC possono esser trovati nella vecchia directory.

Nota: CRAN non ha i sistemi Mac OS X e non possono controllare questi file binari contro le

minacce di virus. Sebbene si prendano precauzioni quando si assemblano i file binari, occorre usare

le normali precauzioni quando si scaricano i file eseguibili. Poiché il pacchetto di file binari del

1/3/2016 per le versioni R più vecchie della 2.12.0 sono solo disponibili nell’archivio CRAN, gli

utenti di questa versione dovrebbero quindi adattare l’impostazione dei siti mirror di CRAN in

modo adeguato.

Fig.5 Come installare pacchetti usando R Studio su un PC. Usate l’opzione menu “Installazione”. La finestra a destra

mostra i pacchetti installati. L’opzione menu “Installa Pacchetti” vi permette di cercare CRAN per i pacchetti

desiderati. Notate che l’opzione “Installa Dipendenze” è stata verificata.

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Fig.6. RStudio installato su un MAC. La finestra in alto a sinistra mostra il vostro file testo di comandi, la parte bassa

sinistra è la console. La parte alta a destra può essere o la vostra cronologia o può permettervi di ispezionare i vari

oggetti. La parte bassa a destra è la finestra dei grafici.

Come scaricare RStudio

Una volta installato R, probabilmente vorrete scaricare ed installare il programma RStudio. Si tratta

di un’interfaccia buona per pc e Mac (vedi fig. 3 e 4), la quale combina 4 finestre in uno schermo.

Quando si usa un pc, RStudio è molto utile (a molti utenti il programma piace anche per i computer

Mac).

RStudio è un’applicazione che consente di estendere le normali funzioni di R. Non è un programma

alternativo ad R. Pertanto prima di installare RStudio, occorre installare R da CRAN (vedi le

istruzioni precedenti). Per installare RStudio andate sul sito: https://www.rstudio.com/.

Alcune note su Rstudio: RStudio è in realtà un prodotto commerciale. Sul sito esistono diverse

versioni del programma e quella che è gratuitamente scaricabile serve solo per potenziare le

funzioni di R, mentre le altre versioni rendono possibile la programmazione condivisa via internet e

lo scambio di dati (funzioni utili per aziende o istituzioni). Il sito mette a disposizione anche

pacchetti di R utili per eseguire certi tipi di analisi o per creare rappresentazioni grafiche.

Qui di seguito è riportata step by step la procedura per installare RStudio.

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Installazione di RStudio step by step 1. Andate sul sito internet di RStudio e cliccato sul link Download RStudio (vedi Fig. 7)

Fig. 7. Home page di RStudio

2. Scegliete la versione FREE di RStudio cliccando sopra con il mouse

3. Cliccate sul link per scaricare il programma sempre in relazione al sistema operativo del PC.

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4. Una volta scaricato il programma, avviatelo e seguite tutte le istruzioni per l’installazione.

Struttura dell’interfaccia di RStudio

La figura 8 visualizza l’interfaccia di RStudio. L’interfaccia è composta da una finestra che si

suddivide sostanzialmente in 4 riquadri, ognuno dei quali assolve a specifiche funzioni. Il fatto di

disporre di più finestre con diverse funzioni facilita l’uso di R, soprattutto quando si tratta di

effettuare molte operazioni statistiche. L’analisi statistica prevede sostanzialmente tre fasi:

l’inserimento dati (solitamente da un database già creato oppure occorre creare ex-novo il database)

con il controllo e la verifica che i dati inseriti siano corretti e completi, l’analisi statistica vera e

propria (composta da analisi descrittiva e inferenziale) ed, infine, la stampa dell’output sulla

console o su un file ed, eventualmente, la creazione di grafici. Il programma R, invece, ha solo la

finestra della console.

Fig. 8. Interfaccia di RStudio come appare sul pc una volta installato.

La singola finestra può essere sufficiente per analisi semplici, ma diventa poi un problema se si

devono fare tutta una serie di analisi in sequenza, ognuna della quali genera un output (es.: tabella

di ANOVA) oppure un grafico (istogramma o grafico delle medie). Un altro grande vantaggio di

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RStudio è che consente di creare un ambiente in cui non solo si memorizzano la operazioni

eseguite, ma anche dati temporanei, ossia dati che non vengono poi pubblicati ma necessari per

passare da un’operazione statistica all’altra (es.: trasformazione di una serie di dati grezzi in

punteggi standardizzati). Questo permette di interrompere le analisi statistiche e di riprenderle

successivamente esattamente dal punto in cui ci si era fermati.

Fig. 9. Interfaccia di RStudio. La finestra di RStudio è composta da quattro parti o riguardi che esemplificati nello

schema sottostante e che sono il riquadro degli script, il riquadro della console, il riquadro d’ambiente o di storia, il

riquadro delle finestre di servizio.

La fascia dei menù

La fascia dei menù contiene i comandi classici per aprire i file, salvare i file, per stampare oppure

per modificare le visualizzazioni dei riquadri. Quello che preme sottolineare è soprattutto il menù

Tools che consente di installare i pacchetti

Per una descrizione più accurata dei comandi e delle funzioni disponibili nei vari riquadri, si

rimanda il lettore al file “Uso di RStudio”.

Installare alcuni pacchetti aggiuntivi (da R)

Se volete più funzionalità per alcune delle procedure statistiche più avanzate (per es. omegaSem)

avrete bisogno di installare alcuni pacchetti in più

Installare una visione delle attività per avere molti pacchetti

Se sapete che ci sono un certo numero di pacchetti che voi volete usare, è possibile che essi siano

indicati come un “task view” (finestra di attività). Per esempio circa 50 pacchetti saranno installati

tutti in una volta se installate il task view di “Psychometrics”.

Riquadro degli script Riquadro dell’ambiente e della storia

Riquadro della console

Riquadro delle finestre di servizio

Fascia dei menù

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Potete installare tutti i pacchetti psicometrici per le funzioni di Psicometria installando per primo un

pacchetto ctv che a sua volta installa differenti finestre di attività. Per vedere la lista delle possibili

task view, andate al sito https://cran.r-project.org/web/views/.

Occorre attendere 5 minuti per installare circa 50 pacchetti.

Come attivare il pacchetto psych

Per eseguire la maggior parte delle analisi statistiche avete bisogno di attivare il pacchetto psych.

L’attivazione manuale avviene nel seguente modo:

Se volete fare in automatico questo ultimo passo, cioè evitare di avviare sempre ogni volta

manualmente il pacchetto, potete creare un comando speciale per avviare automaticamente il

pacchetto. Per l’attivazione automatica usate il comando “.First”, come nel seguente modo:

Fate questo subito dopo aver avviato R. Lasciate da parte l’opzione salvataggio e chiudete R. Poi

riavviate il programma di nuovo. Vedrete che ora psych risulta caricato automaticamente ed il

pacchetto verrà caricato ogni volta che riavviate R.

Vedere quali siano i pacchetti installati ed attivi

Per vedere quali pacchetti siano attivi (un modo per dire quale versione di R si abbia, e quale

versione di pacchetti rilevanti siano stati caricati) usate il comando “sessionInfo()” come si vede nel

seguente esempio:

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Il comando fa vedere sia i pacchetti di base (“attached base package”) che quelli caricati

successivamente (“other attached packages”).