Registro Tumori della Regione Toscana Organizzazione e stato del lavoro 2004-2005 Pisa, 3 ottobre...
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Registro Tumori della Regione Toscana
Organizzazione e stato del lavoro 2004-2005
Pisa, 3 ottobre 2007
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Fonti disponibili a livello regionale per l’anno 2004 (2005)
– Archivio degli assistibili anno 2004 (2002-2006)– SDO. Ricoveri regionali e extraregionali (n.
737.619)– Esenzione per patologia oncologica (n. 17.827)– Certificati di morte dei residenti in Toscana (n.
39.663)– Referti di anatomia patologica inviati dai presidi
informatizzati (12 centri dei 14 pubblici) della Toscana (n. 79.996)
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Criteri di selezione SDO
CODICI DI DIMISSIONE (variabli DIADIM, DIA1, DIA2, DIA3, DIA4, DIA5)• 140-208 TUMORI MALIGNI• 223.3 T.B. DELLA VESCICA• 225 T.B. DEL S.N.C.• 227.3 T.B. IPOFISI • 227.4 T.B. EPIFISI • 230-234 TUMORI IN SITU• 235-238 TUMORI A COMPORTAMENTO INCERTO• 239 TUMORI DI NATURA NON SPECIFICATA• 284 ANEMIA APLASTICA• 273.1 PARAPROTEINEMIA MONOCLONALE• 273.2 ALTRE PARAPROTEINEMIE• 273.3 MACROGLOBULINEMIA• 287.3 TROMBOCITEMIA PRIMARIA• 289.8 MIELOFIBROSI• V10.0-10.9 ANAMNESI PERSONALE DI TUMORE MALIGNO• V55.0 TRACHEOSTOMIA• V55.1 GASTROSTOMIA• V55.2 ILEOSTOMIA• V55.3 COLOSTOMIA• V55.4 ALTRE APERTURE ARTIFICIALI DELL’APP. DIGERENTE• V58.0 SESSIONE DI RADIOTERAPIA• V58.1 CHEMIOTERAPIA DI MANTENIMENTO• V71.1 OSSERVAZIONE PER SOSPETTO DI TUMORE MALIGNO• V76 ESAMI SPECIALI PER L’INDIVIDUAZIONE DI T. MALIGNICODICI DI INTERVENTO (variabli CODCHI, CODCHI2, CODCHI3, CODCHI4, CODCHI5, CODCHI6)• 41.00 TRAPIANTO DI MIDOLLO• 41.01 TRAPIANTO DI MIDOLLO OSSEO AUTOLOGO• 41.02 TRAPIANTO DI MIDOLLO OSSEO ALLOGENICO CON PURGING• 41.03 TRAPIANTO DI MIDOLLO OSSEO ALLOGENICO SENZA PURGING• 41.31 BIOPSIE DEL MIDOLLO OSSEO• 92.2-92.29 RADIOLOGIA TERAPEUTICA E MEDICINA NUCLEARE• 99.25 INIEZIONE O INFUSIONE DI SOSTANZE CHEMIOTERAPEUTICHE PER TUMORE NON CLASSIFICATO ALTRO
CODICI SU CUI VIENE BASATA LA SELEZIONE DEI RICOVERI DI TIPO ONCOLOGICOVengono prese in considerazione anche diagnosi ed interventi che possono probabilmente
sottointendere una patologia di tipo oncologico.
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Come sono state trattate le fonti 2 (prima dell’inserimento nel gestionale)
linkage
Versione pulita SDO
Escluso per RTT (fonte=null)
Attribuisco visto=V (info
superflue)
Va al recupero del medico o
istologico
Verifica manuale
si
no
ArchiviSDO, AP
Archivi anagraficicomuni, assistiti
Versione pulita AP
Tutti i possibili casi oncologici
Registro Mortalità regionale (RMR)
Portatore di tumore
no
siÈ in RTT
si
no
Registro Tumori Toscano (RTT)
Aggiorno data di morte in RTT
no
È già presente in
RTT
si
Aggiorno data di morte in SDO,AP
Solo AP, flag o verifica
Solo SDO, flag o verifica
SDO e AP, flag o verifica
no
Prevalente si
si
Info sufficienti alla
codifica
no
Neoplasia successiva
Possibili nuovi casi oncologici
Procedura SITE per la risoluzione
dei casi
si Caso risolto
da SITE
no
Caso da risolvere manualmente
Attribuisco codifica SITE e flag site attivo
Anagrafe CSPOArchivio delle esenzioni regionale
per patologia oncologica
no
Ha esenzione
per patologia oncologica
si
no
Ha fatto un
esame in CSPO
si
Aggiungo dati esenzione, flag esenzione attivo
Aggiungo Key CSPO, flag CSPO attivo
Esiste ed è residente
si
no
CONSOLIDATOalla codifica!
Flag codifica attivo (no quelli con visto=v
no
SoloSDO sede
concordante
si
Si codifica in automatico,
visto=v
Si codifica in automatico,
visto=v
Solo SDO causa morte
concord.
no
si
Tipi di linkage• Chiave intera:
– Codice fiscale– Codice sanitario– Cognome nome e data di nascita
• Chiave composta o parziale (link comunque deterministico, chi compie il link decide a posteriori se il mach è valido)viene applicato per approssimazioni successive, cioè si passa dalla chiave più stretta a quella più larga:
– Primi 11 codice fiscale e comune di nascita,– Cognome e nome parziale e data di nascita intera:
• Primi 15 di cognome e nome,• Primi 10 di cognome e nome,• Primi 5 e ultimi 3 di cognome e nome,• Dal 3° carattere per 5 caratteri e ultimi 2 di cognome e nome,• Ultimi 5 di cognome e nome
– Cognome e nome intero e data di nascita parziale:• Anno mese di data di nascita,• Anno giorno di data di nascita,• Giorno mese di data di nascita,• Solo anno di data di nascita
– Cognome nome parziale e data di nascita parziale:• Cognome e mese anno di data di nascita,• Cognome e giorno mese di data di nascita,• Cognome e giorno anno di data di nascita,• Cognome e anno di data di nascita,• Primi 5 del cognome e anno di data di nascita,• Ultimi 5 del cognome e anno di data di nascita.
Come sono state trattate le fonti 2 (prima dell’inserimento nel gestionale)
linkage
Versione pulita SDO
Escluso per RTT (fonte=null)
Attribuisco visto=V (info
superflue)
Va al recupero del medico o
istologico
Verifica manuale
si
no
ArchiviSDO, AP
Archivi anagraficicomuni, assistiti
Versione pulita AP
Tutti i possibili casi oncologici
Registro Mortalità regionale (RMR)
Portatore di tumore
no
siÈ in RTT
si
no
Registro Tumori Toscano (RTT)
Aggiorno data di morte in RTT
no
È già presente in
RTT
si
Aggiorno data di morte in SDO,AP
Solo AP, flag o verifica
Solo SDO, flag o verifica
SDO e AP, flag o verifica
no
Prevalente si
si
Info sufficienti alla
codifica
no
Neoplasia successiva
Possibili nuovi casi oncologici
Procedura SITE per la risoluzione
dei casi
si Caso risolto
da SITE
no
Caso da risolvere manualmente
Attribuisco codifica SITE e flag site attivo
Anagrafe CSPOArchivio delle esenzioni regionale
per patologia oncologica
no
Ha esenzione
per patologia oncologica
si
no
Ha fatto un
esame in CSPO
si
Aggiungo dati esenzione, flag esenzione attivo
Aggiungo Key CSPO, flag CSPO attivo
Esiste ed è residente
si
no
CONSOLIDATOalla codifica!
Flag codifica attivo (no quelli con visto=v
no
SoloSDO sede
concordante
si
Si codifica in automatico,
visto=v
Si codifica in automatico,
visto=v
Solo SDO causa morte
concord.
no
si
Area Vasta ASL
Totale tra maligni e benigni
Validazione
no sì
n. % di riga n. % di riga
CENTRO 103 (Pistoia) 6451 69 1,07% 6382 98,93%
104 (Prato) 5730 30 0,52% 5700 99,48%
110 (Firenze) 20362 111 0,55% 20251 99,45%
111 (Empoli) 5767 62 1,08% 5705 98,92%
CENTRO Totale 38310 272 0,71% 38038 99,29%
NORD-OVEST 101 (Massa Carrara) 5000 180 3,60% 4820 96,40%
102 (Lucca) 4249 251 5,91% 3998 94,09%
105 (Pisa) 8690 647 7,45% 8043 92,55%
106 (Livorno) 9965 436 4,38% 9529 95,62%
112 (Viareggio) 4758 138 2,90% 4620 97,10%
NORD-OVEST Totale 32662 1652 5,06% 31010 94,94%
SUD-EST 107(siena) 7730 146 1,89% 7584 98,11%
108 (Arezzo) 5656 61 1,08% 5595 98,92%
109 (Grosseto) 4190 404 9,64% 3786 90,36%
SUD-EST Totale 17576 611 3,48% 16965 96,52%
residenza incerta Totale 1058 1027 97,07% 31 2,93%
Totale complessivo 89606 3562 3,98% 86044 96,02%
n. % di riga n. % di riga
103 (Pistoia) 72 1,1% 6581 98,9% 6653
104 (Prato) 55 0,9% 5957 99,1% 6012
110 (Firenze) 430 2,0% 21052 98,0% 21482
111 (Empoli) 66 1,2% 5602 98,8% 5668
623 1,6% 39192 98,4% 39815
101 (Massa Carrara) 103 1,9% 5459 98,1% 5562
102 (Lucca) 256 6,2% 3895 93,8% 4151
105 (Pisa) 444 5,5% 7586 94,5% 8030
106 (Livorno) 287 2,9% 9597 97,1% 9884
112 (Viareggio) 121 2,4% 5026 97,6% 5147
1211 3,7% 31563 96,3% 32774
107(siena) 13 0,2% 7768 99,8% 7781
108 (Arezzo) 76 1,1% 7016 98,9% 7092
109 (Grosseto) 410 6,6% 5824 93,4% 6234
499 2,4% 20608 97,6% 21107
2333 2,5% 91363 97,5% 93696
CENTRO
NORD-OVEST
SUD-EST
CENTRO Totale
NORD-OVEST Totale
SUD-EST Totale
Totale complessivo
Area vasta ASL
Stato validazione
n. totaleno sì
Numero soggetti per stato di validazione anagrafica per Area Vasta e ASL di residenza anno 2005
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Come sono collegate le fonti ai soggetti?
Soggetti con almeno un AP, totale 49.578Soggetti con almeno un AP, totale 49.578di cui già in RTT 4.565 (9,2 %)di cui già in RTT 4.565 (9,2 %)
di cui con esenzione 7.086 (14,3 %)di cui con esenzione 7.086 (14,3 %)
Soggetti con almeno un CM,Soggetti con almeno un CM,totale 14.552totale 14.552
di cui già in RTT 2.984 (20,5 %)di cui già in RTT 2.984 (20,5 %)di cui con esenzione 621 (4,27 %)di cui con esenzione 621 (4,27 %)
Soggetti con Soggetti con almeno una SDO,almeno una SDO,totale 57.340totale 57.340di cui già in RTT 8.735 (15,2 %)di cui già in RTT 8.735 (15,2 %)di cui con esenzione 15.719 (27,4 %)di cui con esenzione 15.719 (27,4 %)
2.811
3,2 %
27.995
31,6 %
18.525
20,9 %
27.476
31 %
2.966
3,3 %
247
0,3 %
Coloro che hanno residenza accertata come si distribuiscono nelle varie fonti?
8.528
9,6 %
Totale soggetti con Totale soggetti con sospetto tumore sospetto tumore 88.54888.548
Ma anche altre fonti, locali
Caso nuovo o caso prevalente?
• Incrocio fra il consolidato 2004 (2005) e le fonti informative per le quali sono disponibili archivi ‘storici’– SDO (dal 2000)– Esenzioni (da 1999)– RTT (dal 1985 e prevalenti)– AP– archivi locali (radioterapia, ematologia, ecc.)
• Confronto con le stime
Miamod 0-84 Colon-retto Mammella Polmone
M F F M F
ASL Oss%0-A Oss %0-A Oss %0-A Oss %0-A Oss %0-A
Pistoia 144 -7% 129 8% 210 -25% 159 12% 40 -3%
Prato 96 -21% 70 -11% 183 -16% 101 -12% 27 -5%
Firenze 380 -13% 323 4% 674 -17% 442 9% 144 2%
Empoli 106 11% 70 -1% 184 -4% 129 5% 21 -21%
Totale Centro 726 -10% 592 2% 1251 -16% 831 6% 232 0
Massa 94 3% 64 10% 212 15% 129 7% 40 56%
Lucca 119 9% 94 24% 195 -13% 153 29% 38 4%
Pisa 211 13% 151 8% 316 4% 194 8% 44 13%
Livorno 175 12% 172 29% 362 7% 219 13% 74 39%
Viareggio 92 -8% 62 0% 182 6% 134 30% 41 50%
Totale Nord-Ovest 691 7% 543 16% 1267 3% 829 16% 237 0
Siena 145 -1% 112 3% 228 -1% 179 49% 36 50%
Grosseto 123 -10% 81 -3% 202 0% 139 14% 35 -1%
Totale Sud-Est 268 -5% 193 0% 430 -1% 318 31% 71 20%
Totale 1685 -3% 1328 7% 2948 -7% 1978 14% 540 13%
Le classificazioni
• SDO – ICD-9, ICD-9 CM• Certificati di morte – ICD-9, ICD-10• Referti AP – SNOMED• Esenzioni
• Registro – ICDO-1, ICDO-2, ICDO-3• Utilizzo di software di transcodifica automatica
Il centro di coordinamento tecniconodo operativo CSPO
• Raccolta delle fonti informative
• Selezione
• Validazione anagrafica
• Definizione del soggetto
• Transcodifiche
• Fase automatica (il software SITE)
• Fase manuale (il gestionale RTRT)
Area Vasta ASL
Procedura di codifica automatica SITE
RTTTradizionale (manuale)
Totale ASL
AUTO
(codificati da
operatore con metodi tradizionale
CENTRO
103 (Pistoia) 1808 1592 3400
104 (Prato) 1474 934 2561 2561
110 (Firenze) 5081 4165 9566 9566
111 (Empoli) 1420 1013 2463 2463
CENTRO Totale 1808 1592 14590 17990
NORD-OVEST
101 (Massa Carrara) 969 1641 2610
102 (Lucca) 1095 1246 2341
105 (Pisa) 2093 2046 4139
106 (Livorno) 2529 2546 5075
112 (Viareggio) 1237 989 2226
NORD-OVEST Totale 7923 8468 16391
SUD-EST
107(siena) 1785 1617 3402
108 (Arezzo) 495 2785 3280
109 (Grosseto) 953 1448 2401
SUD-EST Totale 2738 3065 5803
Totale 12469 13125 ~25000
Numero casi per tipo di procedura per Area Vasta e ASL di residenza anno 2004
Le fonti informative contengono molti dati oltre quelli utilizzati per
la definizione dell’incidenzasono i dati che caratterizzano l’iter diagnostico-terapeutico
La lettura di stringhe di testo
Il sito web