ISTITUTI 03 000 Frontespizio agroalimentare - cnr.it · Pipitone Carlo III Pipitone Vito III...

AGROALIMENTARE Istituti di prevista afferenza

• Biologia e Biotecnologia Agraria • Biometeorologia • Genetica Vegetale • Protezione delle Piante • Scienze dell'Alimentazione • Scienze delle Produzioni Alimentari • Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo • Virologia Vegetale

INDICE Dati Generali

Missione

Risorse umane

Elenco del Personale

Personale esterno partecipante

Risorse finanziarie

Prodotti della ricerca

Elenco prodotti scientifici indicati per la valutazione del CIVR

Principali collaborazioni

Elenco dei Contratti

Contratti attivi

Contratti passivi

Elenco delle principali attrezzature scientifiche

Istituti con i quali si collabora

Istituti CNR esecutori di moduli di attività di commessa coordinata dall’Istituto

Istituti CNR coordinatori di commesse di cui l’Istituto è esecutore di moduli di attività

Commesse 2005

Commesse 2006

Proposte di attività di ricerca spontanea a tema libero presentate

Scheda di autovalutazione (attività 2005)

ISTITUTI Dati generali e Attività Agroalimentare

ISTITUTO DI BIOLOGIA E BIOTECNOLOGIA AGRARIA Missione

Aumentare le conoscenze sulle basi molecolari che regolano il funzionamento dei sistemi biologici di interesse agrario (piante, animali), a diverso livello di organizzazione (cellula, organismo), come base per programmi indirizzati ad un loro migliore e diversificato utilizzo e per un aumento della qualità delle produzioni. Direttore: Dott Alcide Bertani Sede principale: Via Edoardo Bassini, 15 - 20133 Milano MI Lombardia Superficie immobile: XX mq

Articolazione territoriale: c/o Facoltà di Agraria- via del Borghetto 80 Via del Borghetto, 80 - 56124 Pisa PI Toscana

Superficie immobile: XX mq c/o CNR -Viale Marx 15/43 - Roma RM Lazio Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.ibba.cnr.it Risorse umane

Risorse umane ricercatori tecnologi* associati di ricerca tecnici amministrativi totale personale anno

A B C D E=A+B+C+D 2003 33 5 17 6 61 2004 33 5 17 6 61 2005

* Età media dei ricercatori :

1


Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Crisafi Ermanno I Marsella Ennio I Mazzola Salvatore I Vallerga Silvana I Badalamenti Fabio II Cardellicchio Nicola II Di Bitetto Massimiliano II Domenici Paolo II Genovese Lucrezia II La Ferla Rosabruna II Pastore Michele II Pernice Giuseppe II Ragonese Sergio II Rinelli Paola II Zaccone Renata II Aiello Gemma III Alabiso Giorgio III Azzaro Filippo III Bergamasco Alessandro III Bonanno Angelo III Bono Gioacchino III Budillon Francesca III Buonocunto Francesco Paolo III Cannizzaro Leonardo III Caroppo Carmela III Caruso Gabriella III Cavallo Rosa Anna III Cecere Ester III Cucco Andrea III D'Anna Giovanni III De Alteriis Giovanni III Decembrini Franco III Di Leo Antonella III Esposito Eliana III Fanelli Giovanni III Ferraro Luciana III Fiorentino Fabio III Garofalo Germana III

liv.Giacobbe Maria III Giordano Daniela III Giuliano Laura III Gristina Michele III Iakimov Mikhail III Iorio Marina III Leonardi Marcella III Lirer Fabrizio III Micale Valeria III Milia Alfonsa III Molisso Flavia III Monticelli Luis Salvador III Narracci Marcella III Patti Bernardo III Pelosi Nicola III Perilli Angelo III Petrocelli Antonella III Pipitone Carlo III Pipitone Vito III Porfido Sabina III Prato Ermelinda III Raspini Arturo III Rubino Fernando III Sacchi Marco III Saracino Orestina III Stabili Loredana III Tonielli Renato III Violante Crescenzo III Zappala' Giuseppe III Frisone Giovanni IV Milillo Matteo IV Montanaro Pasquale IV Balestrieri Filippo V Campanella Nicola V Filippi Maria Iolanda V Giacalone Giacoma Rita V Irrera Gaetana V Maimone Giovanna V

liv.Perdichizzi Francesco V Rizzo Pietro V Termine Giuseppa V Acquaviva Maria Immacolata VI Angelino Antimo VI Azzaro Maurizio VI Badalucco Cinzia Vita VI Cosenza Alessandro VI Cusumano Salvatore VI Di Stefano Giuseppe VI Furnari Michele VI Gancitano Salvatore VI Giacovazzo Giuseppe VI Giandomenico Santina VI Giusto Giovan Battista VI Ingrande Giovanna VI Macripo' Cosimo Damiano VI Milazzo Antonino VI Norrito Giacomo VI Pietropaolo Aniello VI Rizzo Francesco VI Sclafani Patricia VI Scotto Di Vettimo Paolo VI Sinacori Giuseppe VI Annicchiarico Cristina VII Armato Vincenzo VII Coppola Marilena VII De Martino Rosaria VII Pinna Monica VII Corseri Giuseppe VIIIDe Francesco Paolo VIIIFama' Marcella VIIIIavarone Michele VIIIMusella Stefania VIIIPalmisano Maurizio VIIISoraci Francesco VIIIDe Palmis Vincenzo IX

2



Risorse umane che collaborano alla realizzazione delle attività

anno ricercatori associati

operanti al cnr assegnisti di ricerca dottorandi borsisti laureandi totale

2003 3 14 2 2 20 41 2004 3 13 2 1 22 41 2005

ASSEGNISTI

Marco Archinti Alessandra Barbante

Paola Cremonesi Maddalena De Virgilio

Pietro Argeo Della CristinaEva Maria Klein

Alessio Lombardi Stefano Morandi

BORSISTI

Maria Cristina Stacchezzini

DOTTORANDI

Elena Baldoni Marzia Fileppi Elena Ponzoni

SPECIALIZZANDI

Chiara Vimercati

3


Risorse finanziarie

Risorse utilizzate (full cost) attività coperte da fonti

interne attività coperte da fonti

esterne totale

preventivo consuntivo preventivo consuntivo preventivo consuntivo anno

A B C D E F G = F +risorse da

esercizi precedenti 2003 - 3.913 - 713 - 4.626 5.183 2004 3.248 3.755 739 903 3.987 4.658 5.322 2005

valori in migliaia di euro

Risorse gestite direttamente trasferimenti dal centro entrate da terzi totale

nell’esercizio da esercizi precedenti preventivo consuntivo preventivo consuntivo

anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 663 - 544 - - 2004 534 710 739 622 670 2.002 2005


Indicatori finanziari anno Fondi Interni

per ricercatore Fondi Totali

per ricercatore Risorse esterne per ricercatore

Fattore di amplificazione

2003 2004 113,8 161,3 47,5 1,417 2005 valori in migliaia di euro

4



anno Articolo su rivista

Capitolo di libro Libro Brevetto

Risultato di valutazione applicativa

Progetto, composizione,disegno e design

Performance, mostra ed

esposizione

Manufatto ed opera d'arte

2003 33 - 6 3 - 1 2004 34 - 5 4 - 4 4 2005

Elenco prodotti scientifici indicati dall’Istituto per la valutazione del CIVR

ARTICOLI ISI

Giovannetti M. 1, Sbrana C. 1, Strani P. 2, Agnolucci M. 2, Rinaudo V. 2, Avio L.1 Genetic diversity of isolates of Glomus mosseae from different geographical areas detected by vegetative compatibility testing and biochemical and molecular analysis. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Loreti E. 1, Yamaguchi J. 2, Alpi A. 3, Perata P. 4 Sugar modulation of a-amylase genes under anoxia ANNALS OF BOTANY

Orsi A. 1, Sparvoli F. 1, Ceriotti A. 1 Role of individual disulfide bonds in the structural maturation of a low JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY

Borgese N. 1, Colombo S. 2, Pedrazzini E. 3 The tale of tail-anchored proteins: coming from the cytosol and looking for a membrane JOURNAL OF CELL BIOLOGY

Frugis G. 1, Giannino D. 1, Mele G. 1, Nicolodi C. 1, Chiappetta A. 2, Bitonti MB. 2, Innocenti AM. 2, Dewitte W. 3, Van Onckelen H. 3 , Mariotti D. 1 Overexpression of KNAT1 in Lettuce Shifts Leaf Determinate Growth to a Shoot-like Indeterminate Growth Associated to an Accumulation of Isopentenyl-Type Cytokinins PLANT PHYSIOLOGY

Frugis G 1, Chua NH. 2 Ubiquitin-mediated proteolysis in plant hormone signal transduction. TRENDS IN CELL BIOLOGY

Giannino D. 1, Mele G. 1, Cozza R. 2, Bruno L. 2, Testone G. 1, Ticconi C. 1, Frugis G. 1, Bitonti MB. 2, Innocenti AM. 2, Mariotti D. 1 Isolation and characterization of a maintenance DNA-methyltransferase gene from peach (Prunus persica [L.] Batsch): transcript localization in vegetative and reproductive meristems of triple buds. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY

Foresti O.1, Frigerio L.2, Holkeri H.1, de Virgilio M.1, Vavassori S.1, and Vitale A.1 A phaseolin domain directly involved in trimer assembly is a BiP binding determinant PLANT CELL

Della Croce C 1., Bronzetti G.,1 Cini M.,1 Caltavuturo L.,1 Poi G

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Protective effect of lipoic acid against hydrogen peroxide in yeast cells TOXICOLOGY IN VITRO

Locatelli F. 1, Manzocchi L.A. 1, Viotti A. 1, Genga A. 1 The nitrogen-induced recovery of a-zein gene expression in in vitro cultured opaque2 maize endosperms depends on the genetic background PHYSIOLOGIA PLANTARUM

Cerolini S. 1, Maldjian A. 2, Pizzi F. 3 and Gliozzi T.M. 3 Changes in sperm quality and lipid composition during cryopreservation of boar semen. REPRODUCTION

Gliozzi T.M. 1, Luzi F. 2 and Cerolini S. 2 Assessment of sperm viability in boar, rabbit and rooster: a modification of the fluorometric ethidium bromide exclusion procedure. THERIOGENOLOGY

Lioi L. 1, Sparvoli F. 2, Galasso I. 2, Lanave C. 3, Bollini R. 2 Lectin-related resistance factors against bruchids evolved through a number of duplication events. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Gianì S. 1, Campanoni P. 1, and Breviario D. 1 A dual response on protein synthesis and degradation modulates tubulin level in rice cells treated with oryzalin. PLANTA

Morello L.1, Bardini M.2, Sala F.2, and Breviario D.1 A long leader intron of the Ostub16 rice beta-tubulin gene is required for high level gene expression and can autonomously promote transcription both in vivo and in vitro. PLANT JOURNAL

Locatelli F.1, Magnani E.1, Vighi C.1, Lanzanova C.1, Coraggio I.1 Inhibitory effect of myb7 uORF on downstream gene expression in homologous (rice) and heterologous (tobacco) systems PLANT MOLECULAR BIOLOGY

Vitale A. 1 Physical methods PLANT MOLECULAR BIOLOGY

Vitale A. 1 Uncovering secretory secrets: inhibition of endoplasmic reticulum (ER) glucosidases suggests a critical role for ER quality control in plant growth and development PLANT CELL

Lord M.J. 1, Ceriotti A. 2, Roberts L.M. 1 ER Dislocation: Cdc48p/p97 Gets Into the AAAct CURRENT BIOLOGY

Sturaro M. 1, Viotti A. 1

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Methylation of the Opaque2 box in zein genes is parent dependent and affects O2 DNA binding activity, in vitro PLANT MOLECULAR BIOLOGY

Sbrana C. 1, Agnolucci M. 2, Bedini S. 2, Lepera A. 2, Toffanin A. 3, Giovannetti M. 3, Nuti M. P. 3 Diversity of culturable bacterial populations associated to Tuber borchi ectomycorrhizas and their activity on T. borchii micelial growth. FEMS MICROBIOLOGY LETTERS

Loreti E. 1,Vernieri P. 2, Alpi A. 2, Perata P.3 Repression of a-amylase activity by anoxia in grains of barley is independent of ethanol toxicity or action of abscissic acid PLANT BIOLOGY

Reggiani R. 1, Laoreti P. 1 Lithium alters phosphoinositide signaling in rice roots under anoxia JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY

Mapelli, S. 1, Brambilla, I.1, Bertani, A.1 Free amino acids in walnut kernels and young seedlings TREE PHYSIOLOGY

Boettcher, P.J. 1, Jairath, L. K. 2, VanRaden,P.M. 3 Evaluation of sire predicted transmitting abilities for evidence of x-chromosomal inheritance for dairy production traits. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE

Boettcher P.J.1 2020 Vision: The future of dairy cattle breeding from the academic perspective JOURNAL OF DAIRY SCIENCE

Bordoni R. 1, Consolandi C. 1, Castiglioni B. 2, Busti E. 3, Bernardi LR. 3, Battaglia C. 3, De Bellis G. 1 Investigation of the multiple anchors approach in oligonucleotide microarray preparation using linear and stem-loop structured probes. NUCLEIC ACIDS RESEARCH

Galasso I. 1. Distribution of highly repeated DNA sequences in species of the genus Lens Miller. GENOME

BREVETTI

Coraggio I. 1, Locatelli F. 1, Bracale M. 2, Vannini C. 2 Use of specific Myb genes for the manufacture of transgenic plants tolerant to biotic and abiotic stresses

Zuo J.R. 1, Niu Q.W. 1, Frugis G. 2, Chua N.-H 1 Promotion of Somatic Embryogenesis in Plants by Wuschel Gene Expression

Sturaro M. 1, Viotti A. 1, Mistrello G. 2, Falagiani P. 2, Roncarolo A. 2, Zanotta S. 2

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Varianti di proteine allergeniche di Phleum pratense

Sturaro M. 1, Viotti A. 1, Mistrello G. 2, Falagiani P. 2, Roncarolo A. 2, Zanotta S. 2 Varianti di proteine allergeniche del gruppo 2 di Dermatophagoides

Sturaro M. 1, Viotti A. 1, Genga A. 1, Mistrello G. 2, Falagiani P. 2, Roncarolo A. 2 VARIANTI DELL’ALLERGENE MAGGIORE Par j 2 di Parietaria judaica

Nick Peter 1; Breviario Diego 2 HERBICIDE RESISTANT TRANSGENIC PLANTS WITH MUTATED ALPHA-TUBULIN

RAPPORTI

Cannata, F., Malvolti, M. E., Mapelli, S., Bertani A. Valutazione per la valorizzazione di "varietà-popolazioni" italiane di noce comune

Bertani, A. Mapelli, S., Cannata, F., Malvolti, M. E. Aspetti di agrobiologia e sostenibilità dei sistemi produttivi di specie da legno pregiato: il modello della Juglans regia L.

Breviario D Carte di identità genetico-molecolari a tutela della tipicità dei prodotti agricoli e di nicchia

Breviario D EcoTUb : an ecologically safe selection system for transgenic crops based on modified plant-tubulin genes

Breviario Diego; Giovanetti Alessandro TBP : un nuovo strumento per la rilevazione della diversità genetica nelle piante basata su sequenze funzionalmente rilevanti

Breviario Diego La vigilanza genetica

Breviario Diego Nuove tecniche di Ingegneria genetica

Breviario Diego Sono l'artigiano delle molecole

Giovannetti M., Avio L., Bedini S., Turrini A., Filippi C. Organizzazione di una collezione in situ di funghi micorrizici degli ecosistemi dunali finalizzata alla conservazione della loro diversitÃ genetica

Nuti M.P., Sbrana C., Turrini A., Giovannetti M. Monitoraggio degli effetti di piante transgeniche sui microorganismi simbionti radicali

L. Giorgetti, G. Martini, G. Luccarini, Nuti Ronchi V., C. Geri Cyto-histological and molecular study of how cell variants arising in oil palm cultures may affect regenerated plants

Dutto M., Sala C.

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Base di dati bibliografica delle monografie della Biblioteca dell'Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria - Sezione di Milano

Reggiani R., Dutto M., Sala C., Sala E.,Bertani A. Banca dati bibliografica: Ibba pubblicazioni 2002-2003 e IBV pubblicazioni 1974-2001

Bertani A., Dutto M. Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria

Bertani A., Dutto M. Brevetti sviluppati presso l'Istituto Biosintesi Vegetali e l'Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria, periodo 1998-2002

Bertani A., Dutto M. Patents 1998-2002

RISULTATI PROGETTUALI

Breviario D. 1, Gianì S. 1 Sequenze di DNA e geni di pianta depositati in banche dati internazionali

Stefanini R. 2, De Vita P. 2, Sala C. 1 Ipertesto Documentazione Cerealicola. Ricerca, formazione e divulgazione: un sistema di conoscenze in agricoltura.

RISULTATI VAL. APPLI.

Pizzi F.1 , Gandini G.2 Banca del seme delle razze suine locali italiane

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Altri Ministeri: : MIPAF (Legge 449/97); MiPAF progetto Rifafert

Consorzi: Consorzi internazionale PHASEOMICS

Enti pubblici: Associazione Regionale Allevatori della Lombardia; Provincia Autonoma di Trento; Regione Lombardia

EPR italiane: Istituti Sperimentali del MiPAF; Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte Liguria e Valle d'Aosta; Istituto Sperimentale Italiano Lazzaro Spallanzani; convenzione CNR/Regioni per progetto Tuber

EPR straniere: Institute Plant Biotechnology for Developing Countries (IPBO)

MIUR: MIUR

Privati: Lofarma s.p.a.; Resindion s.r.l.; Hutsman Tioxide s.p.a.; Elpzoo; Parco Tecnologico Padano; CARIPLO; Anafi

UE: Reconbinant Pharmaceuticals from Plants for Human Health (Pharmaplant); Biosensors for Effective Environmental Protection (BEEP); Malaysian Palm Oil Board (MPOB)

Università: Università degli Studi di Milano; Università della Tuscia; Università di Pavia; Università degli Studi “Magna Graecia” di Catanzaro; Università di Varese; Scuola Superiore di Studi Universitari e Perfezionamento Sant'Anna di Pisa; Università di Pisa; Università Sacro Cuore di Piacenza; University of Science and Technology, Korea; University of Warwick, UK; University of Leeds, UK; University of Cambridge, Glasgow University; Agricultural University of Norway ; Università di Losanne (Svizzera); University of Wisconsin (USA)

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Elenco dei Contratti Contratti attivi

LOFARMA S.P.A. • Accertamento da contratto tra C.N.R.-I.B.B.A. e LOFARMA S.p.A. • Ricerche riguardanti il clonaggio e la mutagenesi sito-specifica di geni codificanti per proteine

allergeniche di interesse farmacologico - II° rata

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • Accertamento per l'incasso della prima rendicontazione del progetto con il Ministero delle

Politiche Agricole e Forestali denominato "R.I.F.A.F.E.R.T." il cui responsabile è il Dr. Paolo Leone

EUROPEAN COMMUNITY • Accertamento per incasso prima rata (40%) progetto con European Community denominato

"Biochemical and genetic approaches to study biomolecular interactions in plants" il cui responsabile è il Dr. Alessandro Vitale

• Accertamento per incasso prima rata progetto con European Community denominato "Recombinant Pharmaceuticals from Plants for Human Health" il cui responsabile è il Dr. Alessandro Vitale

• Accertamento per entrata derivante da contratto ECOTUB stipulato con la Ccommissione Europea

Fondazione Parco Tecnologico Padano • Accertamento per convenzione tra C.N.R. - I.B.B.A. Sez. G.A. e F.P.T.P. (Anno 2003)

Malaysian Palm Oil Board • Accertamento per documenti amministrativi attivi

Contratti passivi

CLARA MARIA DELLA CROCE • Contratto d'opera per "Studio degli effetti genotossici degli estratti di foglie e di olii essenziali di

Citrus sp. e della variazione del pattern proteico indotti da stress abiotici e biotici"

LABOSYSTEM S.r.l. • Fornitura di Mobili da Laboratorio (banchi, cappe, armadi aspirati) per la nuova sede del

C.N.R.-I.B.B.A. di Via Corti, 10 - Milano • Smontaggio arredi tecnici da laboratorio del 5° e 6° piano di Via Bassini del C.N.R.-I.B.B.A. e

trasferimento ai nuovi locali del 1° e 2° piano di Via Corti del C.N.R.-I.B.B.A.

MANERBA S.p.A. • Fornitura di mobili e arredi per l'ufficio

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PIARDI TECNOLOGIE DEL FREDDO S.r.l. • ORD.N.14/A3/04 DEL 23.11.04 PIARDI TECNOLOGIE DEL FREDDO SRL -

CASTENEDOLO -BS

AHSI SPA • ORD.N.10/A3/2002 DEL 7.11.2002 AHSI SPA- CORNATE D'ADDA -MI

CAVALLO s.r.l. • N. 1 Autoclave Systec V-75 Cod. 54.1075C - N. 1 Cestello cieco rifiuti C/Fori mm. 365H - N. 1

Raffredamento rapid cooling coil cod. 54 6057-V - N. 1 Kit vuoto cod. 54.9603-V N. 1 Stampante integrata cod. 54.8011V

C.N.T. CONSORZIO NAZIONALE TRASLOCATORI • Trasferimento dal V° e VI° piano di Via Bassini - Mialno, al piano interrato, I° e II° di Via Corti -

Milano di strumenti, apparecchiature scientifiche, banchi lavoro, mobili ed arredi in genere, apparecchiature informatiche, vetrerie, reagenti, attrezzature varie ecc.

APPLERA ITALIA • ORD.N.16/A3/2004 DEL 12.12.2004 APPLIED BIOSYSTEMS - FIL..APPLERA EUROPE -

MONZA-

SCIENZE E TECNOLOGIE VETERINARIE PER LA SICUREZZA ALIMENTARE • Trasferimento fondi in merito al Progetto di ricerca RIFAFERT di cui il Dr. Leone ne è il

coordinatore incaricato del ricevimento e del versamento delle quote spettanti agli altri partners. Quota Parte a favore de "Dip. di Scienze e Tecnol. Veterinarie per la Sicurezza Alimen. - Univ. di Milano".

SIEMENS FINANAZIARIA S.P.A. • ORD.N.020/BIS/FIRB DAMIANI/05 DEL 22.03.05 SIEMENS FINANZIARIA SPA - MILANO

(PER RATA CONTR.LOCAZIONE N4 03 7775) • ORD.N.33/FIRB DAMIANI/04/BC/bis del 02.09.04 SIEMENS FINANZIARIA SPA - MI - PER

3A RATA 2004 CANONE NOLEGGIO • Ordine n. 008/BIS/ FIRBDANMIANI/02/03 del 16.07.03 - Siemens Fiananziaria S.p.A. • ORD.N.010/BIS/FIRB DAMIANI/04 DEL 23.02.2004 SIEMENS FINANZIARIA SPA-MI

CAVALLO Comm.GIUSEPPE S.N.C. di FELICE CAVALLO & C. • ORD.N.02/FIRB/CORAGGIO 02-03/INV del 13.5.2003 CAVALLO COMM.G.-BUCCINASCO-

MI

Baldoni Elena • II° rinnovo contratto d'opera per "Analisi genomica e funzionale di pathways attivati dal fattore

trascrizionali Osmyb4 di riso ed in risposta a stress abiotici". • Rinnovo contratto d'opera per "Analisi genomica e funzionale di pathways attivati dal fattore

trascrizionali Osmyb4 di riso ed in risposta a stress abiotici". • Contratto d'opera per "Analisi genomica e funzionale di pathways attivati dal fattore

trascrizionali Osmyb4 di riso ed in risposta a stress abiotici".

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Ponzoni Elena • II° rinnovo contratto d'opera per "Identificazione di nuove componenti attivate nel reticolo

endoplasmico della cellula vegetale in risposta a stress da accumulo di proteine non correttamente ripiegate".

BIO S&T Inc. • ORD.N.117/04A/RESINDION/03 DEL 19.06.2003 BIO S&T Inc., 5020 Fairway suite 220

Montreal Quebec H8T 188 Canada

Klein Eva Maria • Rinnovo contratto d'opera per "Interazioni con recettori e chaperones nella via di secrezione

proteica delle cellule vegetali".

EDIPLAN di Edi Cecchini • EDIPLAN ORD. 90/B DEL 30/09/04

Università di Udine - Dipartimento di Scienze Agrarie e Ambientali • Trasferimento fondi in merito al Progetto di ricerca RIFAFERT di cui il Dr. Leone ne è il

coordinatore incaricato del ricevimento e del versamento delle quote spettanti agli altri partners. Quota Parte a favore de "Dip. di Scienze Agrarie e Ambientali - Università di Udine".

ISTITUTO SPERIMENTALE PER LA NUTRIZIONE DELLE PIANTE • Trasferimento fondi in merito al Progetto di ricerca RIFAFERT di cui il Dr. Leone ne è il

coordinatore incaricato del ricevimento e del versamento delle quote spettanti agli altri partners. Quota Parte a favore de "Istituto Sperimentale per la Nutrizione delle Piante - Gorizia".

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Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Biophotometer Eppendorf - Camera temostatica KW - Centrifuga refrigerata Eppendorf - Citofotometro Leitz - Concentratore Eppendorf 5301 System - Imagemaster system VDS - Micromanipolatore Nicon - Microscopio - Microscopio Polyvar (Reichert-Jung)ottico, con fluorescenza e analisi di immagine - Microscopio ZEISS - Microscopio a fluorescenza Zeiss - Spettrofotometro - Thermocycler Eppendorf - Videocamera Leica - Videocamera Sony - apparati elettroforetici per proteomica - contatori a scintillazione per radioisotopi - depositore-lettore per microarrays - fitotroni per piante wt e transgeniche con sistemi di misura funzionalità delle piante - microscopi, rilevazione ed elaborazioni immagini - sistemi di separazione e quantificazione metaboliti (HPLC; FPLC; HPTLC; GC) - sistemi di trasformazione cellule vegetali e crescita in condizioni controllate - ultracentrifughe beckman e servall Istituti con i quali si collabora

Istituti CNR esecutori di moduli di attività di commessa coordinata dall'Istituto

- Istituto di cristallografia

Istituti CNR coordinatori di commesse di cui l'Istituto è esecutore di moduli di attività

- Istituto di cristallografia

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Commesse 2005: Piano annuale 2005

Proteomica e microscopia subcellulare per lo studio dell'architettura e del funzionamento della cellula vegetale.

Temi

Tematiche di ricerca:

Analisi confocale della struttura del reticolo endoplasmatico di transgenici per una proteina di membrana di tipo IV e per glutenine di frumento fuse alla green fluorescent protein. Analisi dei microtubuli e proteomica di: linee cellulari resistenti a composti antimitotici; comparti subcellulari e M. truncatula in risposta a sovraespressione di geni esogeni e/o stress. Studio delle modificazioni e localizzazioni subcellulari di proteine normali e mutate coinvolte nella regolazione trascrizionale e di proteine ad alta affinità di legame per chaperones molecolari.

Stato dell'arte:

Lo sviluppo di approcci high throughput per la caratterizzazione degli organismi ha consentito di acquisire conoscenze prima impensabili. In particolare, l�analisi del proteoma sta assumendo sempre più una dimensione funzionale, soprattutto per la possibilità di focalizzarsi su specifici tessuti e comparti cellulari. Un altro straordinario strumento di indagine per comprendere e conoscere le dinamiche strutturali e funzionali della cellula è oggi disponibile grazie agli enormi sviluppi delle tecniche di microscopia, in particolare la microscopia confocale.

Azioni

Attività in corso:

I partecipanti hanno un�esperienza consolidata nello studio della biologia cellulare, con particolare attenzione alla sintesi delle proteine del sistema di endomembrane, alla biogenesi degli organelli, all�organizzazione del citoscheletro, e nello studio dei meccanismi che presiedono alla modulazione dell�espressione genica (regolazione trascrizionale e post-traduzionale). Nell�ambito di queste attività sono state acquisite competenze di biochimica, biologia cellulare e molecolare e microscopia che con il presente progetto si intende rafforzare e implementare.

Azioni da svolgere e punti critici:

Il presente progetto si propone di sviluppare e potenziare le nostre peculiari competenze di proteomica e microscopia. Per il conseguimento degli obiettivi proposti vi è l�acquisto di strumentazione adeguata che consenta l'analisi delle diverse molecole e strutture di interesse. E� altresì necessario il potenziamento dell�attrezzatura per la separazione di proteine e l�acquisto di software dedicati per l'analisi proteomica. L�acquisizione di una unità di personale è altresì auspicabile.

Collaborazioni e committenti:

IGV-CNR-Perugia; IGB-CNR-Napoli; ITB-CNRMilano, Università degli Studi di Firenze; Università degli Studi di Padova; Università degli Studi di Verona, CRA-Sezione di Bergamo; Università degli Studi di Milano: Istituto di scienze farmacologiche, DISMA; University of Warwick; Università di

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Karlsruhe; Gruppo Europeo di lavoro sul citoscheletro; Università di Barcellona; Università di Marsiglia.

Finalità

Obiettivi:

Obiettivi: sviluppo di proteomica e analisi confocale per lo studio di: architettura e composizione del reticolo endoplasmatico, basi molecolari e strutturali della resistenza ai composti antimitotici legate al citoscheletro, localizzazione subcellulare di proteine specifiche, effetto della sovraespressione in piante transgeniche di proteine a localizzazione nota o di un fattore trascrizionale implicato nell'aumentata tolleranza a stress. Competenze: microscopia confocale, biochimica delle proteine, biologia cellulare, trasformazioni genetiche.

Risultati attesi nell'anno:

Identificazione e caratterizzazione strutturale di componenti chiave per l�architettura e il funzionamento di comparti subcellulari in condizioni normali e in risposta a situazioni di stress. Individuazione di proteine la cui modulazione è implicata in risposte fisiologiche e regolative, in particolare identificazione di mutanti del citoscheletro e di domini regolativi di fattori trascrizionali e proteine del complesso trascrizionale. Lo sviluppo temporale sarà specifico delle varie attività, tuttavia le varie azioni si inquadreranno in progetti di valenza pluriennale.

Potenziale impiego:

- per processi produttivi - per risposte a bisogni individuali e collettivi

Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni

Temi


Espressione genica per la qualità del latte e della carne suina Diagnosi aplotipo caseinico e associazione con fenotipi di significato economico nel bovino Diagnosi molecolare per identificazione di S. aureus nel latte Miglioramento qualità e conservazione del seme Studio fertilità in campo seme bovino Applicazione di �finite mixture models� a dati zootecnici transmission disequilibrium test in pedigree complessi Effetto inbreeding su caratteri riproduttivi in bovini Jersey EADGENE NoE

Stato dell'arte:

Il gruppo ha un�attiva serie di interazioni tecniche e scientifiche basate su forti connessioni con studiosi universitari con i quali da anni sono in corso ricerche estremamente produttive e scientificamente qualificate. Le interazioni col mondo della ricerca universitaria sono estese a obiettivi diversi e coinvolgono anche altre istituzioni. Il gruppo ha infatti strette relazioni scientifiche anche con associazioni di allevatori attive sul campo e nell�agroalimentare (Parco Tecnologico Padano).

Azioni

Attività in corso:

Genoma animale e fenotipi di significato economico, in cui vengono esplorate le caratteristiche del genoma delle specie zootecniche. Riproduzione e conservazione genetica, in cui vengono studiati caratteri riproduttivi, l�ottimizzazione della funzionalità del materiale seminale e modellizzazioni di criobanche di materiale genetico Bioinformatica, in cui vengono analizzati dati molecolari e

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quantitativi scaturiti dalle sperimentazioni in corso ed elaborate nuove modellizzazioni di gestione genetica


Vista l�interdisciplinarità e la complessità dei problemi affrontati sarà necessario mantenere e aumentare un costante scambio di informazioni tra i ricercatori coinvolti aventi competenze complementari nella produzione ed analisi di dati riguardanti il settore zootecnico. Di cruciale importanza per gli sviluppi futuri sarà l�acquisizione di una unità di personale tecnico e ricercatore specializzato.


Dipartimento di Sicurezza Alimentare Università di Milano (VSA) Parco Tecnologico Padano (CERSA) Ente Lombardo Potenziamento Zootecnico Dipartimento di Patologia Animale, Igiene e Sanità Pubblica Veterinaria, Università degli Studi di Milano Università di Piacenza Università della Tuscia University of Wisconsin Agricultural University of Norway ITB � CNR ISPA - CNR EADGENE (Network of excellence)

Finalità

Obiettivi:

Diagnostica molecolare per la qualità, tipicità e sicurezza dei prodotti Genetica delle caratteristiche qualitative delle carni destinate a trasformazione Genetica delle lattoproteine (proprietà nutrizionali) Valutazione della funzionalità degli spermatozoi Progettazione, ottimizzazione e gestione di criobanche del germoplasma animale Sviluppo di schemi di gestione della variabilità genetica Sistemi informativi per la valorizzazione delle risorse genetiche animali Competenze: genetica, biologia molecolare e cellulare, bioinformatica


Metodi molecolari per il riconoscimento di geni e marcatori per la qualità del latte e della carne. Strumenti diagnostici basati sull�utilizzo di DNA chip. Creazione di banche delle risorse genetiche, metodiche di valutazione del materiale seminale, ottimizzazione delle tecniche riproduttive. Software per l�analisi filogenetica con utilizzo ottimale di informazioni eterogenee. Modelli e software per co-espressione di geni sotto l�influenza di fattori esogeni.

Potenziale impiego:


Biotecnologie agro-industriali per il miglioramento genetico, il rispetto dell'ambiente e la tutela dei prodotti, la produzione di proteine e metaboliti di interesse alimentare, salutistico e farmacologico.

Temi


Approcci genetici e citogenetici per lo sviluppo di linee di fagiolo migliorate nutrizionalmente. Ottimizzazione della stabilità di vaccini in piante. Individuazione ed utilizzo di meccanismi di localizzazione subcellulare. Sviluppo di kits per la tipizzazione genetica. Trasformazione genetica con nuovi promotori e geni per la resistenza a stress. Cambiamenti metabolici indotti dalla transfezione del gene Myb4. Mutagenesi e produzione di proteine ipoallergeniche. Sviluppo di sistemi di espressione per la sintesi di immunotossine ricombinanti.

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Stato dell'arte:

Le attuali tecniche d�analisi genomica e biochimica permettono di accelerare e rendere più sicuri i processi di miglioramento genetico tradizionale e di caratterizzazione e tutela di genotipi vegetali. Le tecnologie di trasformazione genetica possono essere utilizzate per migliorare la qualità della produzione agricola e le sue interazioni con l�ambiente e per la produzione di molecole per uso industriale e biomedico, in modo economico, efficiente, sicuro e rispettose dell�ambiente.

Azioni

Attività in corso:

A fini : nutrizionale (N), agronomico (A), metodologico (M), nutriceutico (NC), medico (MD). Miglioramento del fagiolo per proprietà nutrizionali dei semi (N). Produzione di nuove proteine vegetali più nutrienti (N). Produzione di piante più tolleranti agli stress e ai patogeni (A). Nuovi sistemi per il monitoraggio di varietà vegetali e isolamento nuovi promotori (M). Modulazione dell�accumulo di metaboliti secondari bioattivi (NC). Ingegneria cellulare per la produzione vaccini in piante (MD). Espressione di proteine di interesse farmacologico in sistemi eterologhi (MD).


I progetti potrebbero risultare ancor più competitivi qualora venisse acquisita strumentazione tecnologicamente più avanzata e si potesse contare su una realistica integrazione di personale ricercatore con esperienza in genetica e biotecnologia agraria e personale tecnico. Alcuni progetti ( produzione di vaccini, produzione di immunotossine a scopo farmacologico, sviluppo di kit diagnostici) incontreranno difficoltà tipiche della messa a punto di prototipi, per altro già sviluppati


A livello nazionale con 7 Istituti CNR, 6 Istituti sperimentali o Enti di ricerca , 10 Università e 2 Industrie; da aggiungere 20 laboratori coinvolti in un progetto MIUR per la caratterizzazione delle risorse genetiche. A livello Internazionale con 10 Istituti di Ricerca o Università; 6 laboratori del progetto EU Biointeractions (www.unine.ch/bota/bioch/biointer.html) ; 30 laboratori del progetto EU Pharma-Planta (www.Pharma-Planta.org). Da aggiungere la presenza nel consorzio internazionale Phaseomics e nel gruppo di lavoro Internazionale sul citoscheletro.

Finalità

Obiettivi:

Obiettivi : Migliorare la qualità del prodotto agricolo attraverso il breeding assistito e la produzione di piante transgeniche. Garantire un�analisi più accurata delle filiere utilizzando tecniche molecolari e caratterizzare le risorse genetiche. Utilizzare le piante geneticamente modificate per la produzione di proteine e altre molecole d�interesse agro- farmaceutico. Competenze : Genetica, citogenetica, biochimica, fisiologia, biologia cellulare e molecolare applicata alle piante, incroci e trasformazioni genetiche, coltivazioni in vitro e mutagenesi.


Dal 1° anno, con progressivo completamento alla fine del triennio, si prevedono: piante con maggiore resistenza agli stress; proteine da utilizzare come farmaci e vaccini ; metaboliti ad attività farmacologica Metodi per l�accumulo di proteine eterologhe in piante transgeniche. Sistemi innovativi per la trasformazione a ridotto rischio genetico Nuove varietà di piante coltivate con ridotto accumulo di fattori antinutrizionali Proteine nutrizionalmente più favorevoli per gli animali monogastrici Nuovi marker e kit diagnostici per l'analisi di varietà

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Potenziale impiego:


Basi Genetiche, Fisiologiche e Molecolari dello Sviluppo e Differenziamento di Specie Modello e di Interesse Agro-Alimentare in Risposta a Fattori Endogeni e Ambientali

Temi


Caratterizzazione dei fattori di trascrizione KNOX in specie modello e di interesse agrario � Risposta a stress da metalli pesanti � Studio dei meccanismi di sviluppo, differenziamento e stadi meiotici � Controllo della variabilità somaclonale durante la rigenerazione in vitro - Acquisizione e analisi dei parametri di sviluppo embrione/seme � Studio della mutagenesi e dell'antimutagenesi con applicazione dei test più avanzati e costituzione di un servizio per la certificazione

Stato dell'arte:

La conoscenza dei determinanti genetici, fisiologici e ambientali che regolano l�accrescimento e lo sviluppo di specie vegetali è diventato un tema di indagine importante per prevedere, controllare e modulare l�architettura della pianta a scopi produttivi. Poco è stato fatto su specie di interesse agrario per la incompleta, o assente, conoscenza dei genomi vegetali complessi. Il gruppo di Pisa è leader nazionale nello studio della mutagenesi di cellule eucariotiche.

Azioni

Attività in corso:

Genomica e post-genomica di fattori di trascrizione importanti per lo sviluppo vegetale - Biotecnologie applicate per modificare la crescita, l�architettura e la produttività di specie di interesse agrario � Sviluppo e stress: fattori biochimici e molecolari - Dinamica dei processi di sviluppo delle piante in vivo e in vitro in funzione di problematiche agroalimentari e ambientali - Valutazione dell'attività genotossica ed antimutagena di composti di interesse alimentare e ambientale


Reperimento di una sede adeguata per la sezione di Roma. Implementazione della strumentazione. Reperimento fondi per dottorati e contratti per personale giovane qualificato compreso il rientro dall�estero di Post-doc con esperienza pluriennale nel settore.


(Collaborazioni scientifiche in corso) Cons. Int. di Genom. Funz. e Proteom. (GFP), Università Roma1; Laboratoire de Biologie Cellulaire, INRA (F); Laboratory of Plant Molecular Biology, Rockefeller University, NY (US); Plant Gene Expression Center, USDA-UCLA, Albany, (US); Centro Interun. ESTree, Milano; Università della Calabria, Cosenza; Biochemistry and Genetics Dpt, University of Clemson, SC, US; Station de Recherches Agronomiques SRA � INRA S Giuliano (Corsica), Cons. Istituto Nazionale Biostrutture e Biosintesi, Sassari.

Finalità

Obiettivi:

Caratterizzazione funzionale e strutturale di fattori di trascrizione coinvolti nello sviluppo e differenziamento di organi vegetali in specie modello e di interesse agrario per il miglioramento della

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produttività - Risposte adattative a stress in cellule eucariotiche: valutazione della tossicità di xenobiotici e selezione somaclonale in vitro di genotipi superiori non OGM � Competenze: biologia molecolare, biochimica, fisiologia, colture in vitro, citologia ed istologia, genetica, mutagenesi.


Isolamento e studio funzionale-comparativo di fattori di trascrizione KNOX in erbacee e arboree in relazione all�architettura della pianta e la produttività - Produzione, selezione e valorizzazione di genotipi superiori di erbacee e arboree mediante variazione somaclonale e ibridazione somatica interspecifica � Determinazione dei meccanismi di mutagenesi e antimutagenesi in cellule eucariotiche - Servizio di analisi di mutagenesi per il monitoraggio dei prodotti agro-alimentarie e dell�ambiente

Potenziale impiego:


Basi molecolari, fisiologiche e cellulari delle produzioni vegetali.

Temi


Analisi del ruolo di introni, di fattori epigenetici e di specifici fattori trascrizionali nella espressione genica e/o nella regolazione del metabolismo. Analisi della risposta a stress abiotici, biotici e alla perturbazione delle maturazione strutturale delle proteine. Analisi dei fenomeni di ripiegamento, assemblaggio e degradazione delle proteine e dei meccanismi del loro smistamento alle membrane intracellulari e al vacuolo. Analisi molecolare, biologica e funzionale delle micorrize.

Stato dell'arte:

Negli ultimi decenni gli sviluppi della genetica molecolare, della fisiologia e della biologia cellulare hanno contribuito a definire i meccanismi molecolari che controllano le caratteristiche agronomiche e nutrizionali delle piante coltivate. Diversi centri di ricerca hanno avviato un'opera di integrazione fra il lavoro di caratterizzazione biochimica/fisiologica/cellulare e quello di miglioramento genetico delle piante coltivate.

Azioni

Attività in corso:

I gruppi partecipanti hanno raggiunto una posizione di valenza internazionale in diversi settori fra i quali lo studio della espressione genica (struttura dei geni, analisi di regolatori trascrizionali e di determinanti epigenetici), della risposta agli stress (stress biotici, anossia ed altri stress abiotici, perturbazione del ripiegamento delle proteine), della maturazione strutturale e dello smistamento delle proteine nella via di secrezione e della interazioni pianta -rizosfera.


Gran parte delle competenze necessarie sono già state acquisite, ma l�introduzione di nuove tecnologie di analisi e di nuove strumentazioni potrebbe notevolmente incrementare le potenzialità del progetto. Sarà inoltre necessario garantire la disponibilità di opportune celle climatiche per la crescita delle piante. Per quanto riguarda le risorse umane ci preme rilevare la carenza di personale tecnico e la necessità di provvedere all�acquisizione di nuove competenze, soprattutto nel settore della bioinformatica.

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Le attività si svolgeranno all�interno di una ampia rete di collaborazioni, coinvolgenti più di dieci diverse istituzioni italiane e straniere (dipartimenti universitari e enti di ricerca) e saranno in parte inquadrate nell�ambito di progetti nazionali e internazionali.

Finalità

Obiettivi:

Obiettivi: i) caratterizzazione di fattori trascrizionali ed epigenetici che regolano l�espressione genica ii) caratterizzazione del metabolismo e di fenomeni di trasduzione del segnale in piante sottoposte a stress iii) caratterizzazione dei meccanismi di maturazione strutturale e di smistamento delle proteine iv) caratterizzazione di funghi micorrizici in relazione ai processi di nutrizione delle piante. Competenze: genetica molecolare, analisi biochimica, espressione in sistemi eterologhi.


I risultati consisteranno principalmente nella caratterizzazione strutturale e funzionale di geni e di fattori proteici implicati nei cammini metabolici che influenzano le caratteristiche agronomiche delle piante o delle produzioni vegetali e nella caratterizzazione genetica e funzionale dei funghi micorrizici. Lo sviluppo temporale sarà specifico delle varie attività, ma in generale le varie azioni si inquadreranno in progetti di valenza pluriennale.

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005


Aggiornamento commento sui punti critici

La situazione delle celle climatiche presso la sede di Milano è rimasta critica, ed è chiaro che l’acquisizione di nuove celle richiederà uno sforzo economico notevole. La precarietà delle condizioni di crescita delle piante (scarsa superficie disponibile, frequente malfunzionamento chiaramente dovuto alla età delle strutture) ha creato grandi difficoltà. Il proseguimento di alcune attività potrebbe essere compromesso dalla mancanza di celle climatiche capaci di mantenere opportune condizioni di crescita per piante transgeniche e non transgeniche. Anche alcune attrezzature di base di laboratorio (es. ultracentrifuga) dovrebbero esser sostituite al più presto. Un altro fattore fortemente limitante le attività di ricerca è costituito dalla carenza di personale tecnico sia per la gestione dei servizi di base che per la organizzazione e gestione dei diversi laboratori coinvolti nello svolgimento delle attività che contribuiscono alla commessa. Il periodo di inattività legato al trasloco della sede di Milano ha inoltre influenzato negativamente lo sviluppo delle attività e ritardato l’ottenimento di alcuni dei risultati previsti.

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Collaborazioni

Le attività sono state svolte nell’ambito di un’ampia rete di collaborazioni nazionali e internazionali: Ente Nazionale Risi; Istituto Agrario S. Michele all'Adige; C.R.A. Sanremo, Fiorenzuola D'Arda, Acireale; CNR: IVV Milano, IGV Napoli, ITB Milano, ICRM Milano, IBAF Porano; Scuola di Perfezionamento Sant’Anna, Pisa; Dip. di Botanica, Università di Karlsruhe, Germania; Dept. of Biological Sciences, University of Warwick, U.K.; Russian Academy of Sciences, Inst. of Plant Physiology, Mosca, Russia; Bulgarian Academy of Sciences, Inst. of Plant Physiology, Sofia, Bulgaria; Dept. of Biology, University of California, San Diego, USA; Dip. di Agrobiologia e Agrochimica, Università della Tuscia, Viterbo; Dip. di Biologia delle Piante Agrarie, Univ. di Pisa; Dip. Ambiente Salute Sicurezza, Univ. dell'Insubria; Dip. Scientifico e Tecnologico, Univ. di Verona; Dip. di Scienze Farmaceutiche, Univ. di Salerno; Dip. di Scienze e Tecnologie Agroambientali, Univ. di Bologna; Dip. di Ortoflorofrutticoltura, Univ. di Firenze; Univ. di Milano: Dip. di Biologia, Dip. di Scienze Precliniche, Dip. di Scienze Molecolari Agro-alimentari.

Commento su eventuali scostamenti

Lo sviluppo temporale di alcune attività è stato influenzato dal trasloco della sede di Milano ed alcune attività sono state rallentate da problemi tecnici alle attrezzature.

Confronto tra risultati attesi e risultati conseguiti

La commessa si proponeva di svolgere le seguenti attività: i) analisi del ruolo di introni, di fattori epigenetici e di specifici fattori trascrizionali nella espressione genica e/o nella regolazione del metabolismo ii) analisi della risposta a stress abiotici, biotici e alla perturbazione della maturazione strutturale delle proteine iii) analisi biochimica dei fenomeni di ripiegamento, assemblaggio e degradazione delle proteine e dei meccanismi del loro smistamento alle membrane intracellulari e al vacuolo. iv) analisi molecolare, biologica e funzionale delle simbiosi micorriziche. Come esposto in maggior dettaglio all'interno del modulo, le attività previste sono state generalmente svolte con successo conseguendo una serie di risultati che coprono nel loro complesso i seguenti settori: •1. Caratterizzazione di geni e di fattori proteici. 1A. Espressione genica 1B. Accumulo delle proteine 1C. Fisiologia dello stress • 2. Biologia dei funghi micorrizici. Si ritiene quindi di poter affermare che, nei limiti posti delle incertezze intrinseche ad ogni attività sperimentale, non ci sono stati scostamenti significativi fra risultati previsti e conseguiti.



Il progetto si propone di sviluppare e potenziare preesistenti competenze di proteomica, di microscopia e di produrre strumenti biologici per indagini molecolari. La recente acquisizione del microscopio a fluorescenza darà un impulso agli studi sulla localizzazione di molte delle proteine oggetto di indagine, consentendo inoltre di effettuare analisi più dettagliate, mentre resta la necessità di potenziare la strumentazione per l'analisi proteomica.

Collaborazioni

Sono confermate le collaborazioni previste, si aggiunge una collaborazione col Laboratory of Plant Physiology and Biophysics University of Glasgow, UK

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Un cambiamento di strategia consentirà di risolvere in modo adeguato le problematiche di clonaggio riscontrate nella produzione di vettori per la trasformazione mediata da agrobatterio (finalizzati a analisi della ruolo della polimerizzazione nella localizzazione subcellulare delle glutenine di frumento). Il parziale finanziamento ricevuto ha consentito solo l’acquisizione del microscopio a fluorescenza, per altro non ancora consegnato all’Istituto e i risultati conseguiti sono stati limitati anche dalla mancanza di adeguata strumentazione per proteomica e relativo software di analisi.


Sono state avviate le analisi proteomiche e di microscopia a livello cellulare e subcellulare. Si sono avuti parziali scostamenti rispetto ai risultati attesi. Per quanto concerne l’analisi del ruolo della polimerizzazione nella localizzazione subcellulare delle glutenine di frumento si sono incontrate problematiche di clonaggio nella produzioni di vettori per la trasformazione mediata da agrobatterio. Non è ancora stata avviata l’analisi del proteoma di piante wt o trasformate (con geni di riso codificanti per fattori trascrizionali di tipo Myb implicati nei meccanismi di tolleranza agli stress), nè è stata effettuata la comparazione fine dei profili 2D di proteine totali da reticoli endoplasmatici ottenuti da cotiledoni sottoposti o non a stress.



Grazie al costante scambio di informazioni tra i ricercatori coinvolti nella commessa sono stati superati brillantemente i punti critici inizialmente identificati, in particolare per quanto riguarda l'interdisciplinarietà delle metodiche affrontate. Rimane tuttavia cruciale l'acquisizione di personale tecnico e ricercatore per potenziare l'attività della commessa.

Collaborazioni

Le collaborazioni avviate sono state consolidate nel corso del 2005 ed hanno portato alla presentazione congiunta di domande di finanziamento per futuri progetti. Inoltre durante l'anno sono state attivate collaborazioni con altre Istituzioni. Tra queste l'Istituto di Ingegneria Agraria e il Dipartimento di Scienze Cliniche Veterinarie dell'Università degli Studi di Milano, ARAL Associazione Regionale Allevatori Lombardia, Associazione Italiana Allevatori Frisona Italiana - ANAFI, Istituto Sperimentale Italiano Lazzaro Spallanzani - Milano, Istituto di Chimica del riconoscimento molecolare - CNR


Nel complesso sono stati conseguiti tutti i risultati attesi; in aggiunta sono stati ottenuti altri risultati non previsti. Nel caso degli studi relativi ad Espressione genica per la qualità della carne suina ad esempio altri risultati sono stati: collezioni di tessuti (muscolo, fegato e pancreas), DNA e RNA da suini di diverse razze-Dati relativi a caratteri qualitativi della carne in suini di diverse razze-Messa a punto di protocolli di analisi dell'espressione differenziale. Inoltre prodotti collaterali conseguiti durante gli studi su Diagnosi molecolare per l’identificazione di patogeni nel latte sono stati lo screening per la presenza di S.aureus in allevamenti delle principali province produttive lombarde e lo screening per la presenza di ceppi di S.aureus produttori di tossine e delle tossine stesse nei prodotti finiti pronti per il commercio. Nel 2005 il ricercatore Paul Boettcher ha iniziato un periodo di mobilità presso una prestigiosa organizzazione internazionale(IAEA/FAO-Vienna).Il ricercatore,che ha qualificate competenze nel settore della bioinformatica,ha comunque mantenuto stretti contatti con gli altri ricercatori consentendo la prosecuzione dei progetti avviati

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Risultati ottenuti: Realizzazione di microarray per l'analisi dell'espressione genica nel suino per la qualità della carne-DNA chip diagnostico per l'identificazione simultanea di 18 tra i principali polimorfismi lattoproteici bovini-Diagnosi molecolare per l'identificazione di patogeni nel latte: i) messa a punto di metodi standardizzati per l'estrazione del DNA di S. aureus da latte ii) messa a punto di strumenti molecolari diagnostici per l'identificazione di S. aureus e di tossine stafilococciche nel latte-Messa a punto di un software per valutare l'uso combinato di seme e embrioni per la creazione di banche delle risorse genetiche-Valutazione della qualità del seme in razze suine locali-Ottimizzazione di metodi per valutare stato dell'acrosoma e integrità del DNA di spermatozoi nel bufalo-Studio delle variazioni stagionali dello stato dell'acrosoma, dell'integrità di membrana e del DNA in spermatozoi di bufalo-Definizione della concentrazione critica di spermatozoi nella dose di seme suino refrigerato-Software per l'analisi filogenetica con utilizzo ottimale di informazioni eterogenee-Modelli e software per coespressione di geni sotto l'influenza di fattori esogeni



Per quanto riguarda il reperimento di una sede adeguata per l’Unità Organizzativa di Roma, il Direttore Generale e il Dott. Fiordiponti si sono personalmente impegnati a risolvere il nostro disagio entro pochi mesi mediante il trasferimento di un prefabbricato presso il CNR di Montelibretti, area di ricerca dove ci troviamo purtroppo ospiti in spazi sottodimensionati. La UO di Roma è inoltre in attesa di un’implementazione della strumentazione. Per quanto riguarda il personale, abbiamo trovato fondi Europei per l’assunzione di un ricercatore a tempo determinato (due anni) che sta rientrando dall’estero ma continua ad essere necessario il reperimento di dottorati e borsisti e di personale da assumere per ripristinare un organico sufficiente. Presso l’Unità Organizzativa di Pisa una unità di personale amministrativo è andata in pensione e un ricercatore di Pisa è venuto a mancare.

Collaborazioni

Consorzio Interdipartimentale di Genomica Funzionale e Proteomica (GFP), Università Roma1; Laboratoire de Biologie Cellulaire, INRA (F); Laboratory of Plant Molecular Biology, Rockefeller University, NY (US); Plant Gene Expression Center, USDA-UCLA, Albany, (US); Centro Interun. ESTree, Milano; Università della Calabria, Cosenza; Biochemistry and Genetics Dpt, University of Clemson, SC, US; Station de Recherches Agronomiques SRA – INRA S Giuliano (Corsica), Cons. Istituto Nazionale Biostrutture e Biosintesi, Sassari. Le collaborazioni che riguardano la specie modello Arabidopsis thaliana dell’UO di Roma con la Rockefeller University (US) sono state temporaneamente interrotte per l’assenza di strutture adeguate (i.e. camere di crescita per le piante) e spazi per dottorandi e studenti.


Non ci sono stati scostamenti dalla pianificazione.


E' stata caratterizzata l’espressione di cinque nuovi geni KNOX di Medicago truncatula. In arboree, sono stati clonati frammenti parziali e integrali dei trascritti di cinque geni KNOX di classe I e II in pesco, effettuata la mappatura genetica di due di essi e analizzata l’espressione in meristemi e tessuti differenziati. Sono state identificate sequenze conservate, specifiche per la classe I e II dei KNOX, sia

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all'interno dell'omeodominio che del dominio MEINOX. Sono stati descritti processi di acquisizione di totipotenza e processi differenziativi in piante di notevole interesse agrario. Sono stati messi a punto test di mutagenesi a breve termine su campioni di agrumi e valutata la genotossicità di alcuni sali dello zinco. E' stato messo a punto un protocollo di separazione di proteine in foglie di Citrus mediante elettroforesi bidimensionale per evidenziare le proteine coinvolte nella risposta agli stress biotici ed abiotici.



L'inadeguatezza e la scarsa affidabilità di sistemi obsoleti di coltivazione controllata delle piante (celle climatiche) si traduce in difficoltà operative e di affidabile riproducibilità dei risultati ottenuti obbligando a ripetere un lavoro lungo e gravoso. kit diagnostici di varietà e kit di trasformazione a ridotto rischio genetico sono da ottimizzare. Aiuterebbe molto l'acquisizione di moderna strumentazione per il sequenziamento e la separazione di piccoli frammenti di DNA con annesso software, sopratutto per l'analisi varietale dei polimorfismi genetici. Il lavoro è stato reso in parte più difficile per la mancanza di adeguati strumenti informatici.Parte dell'attrezzatura del laboratorio di microbiologia dovrebbe essere rinnovata, ampliata. I livelli di produzione della proteina saporina ottenuta in lievito hanno evidenziato la necessità di ottimizzare il sistema con l'uso futuro di fermentatori su scala pilota.Produttività buona nonostante queste difficoltà.

Collaborazioni

LoFarma S.p.A. (Dr. Mistrello) NIAB-National Institute of Agriculuture and Biology, Cambridge UK (Dr.D.Lee) Department of Horticulture,Clemson University, South Carolina USA (Dr. V. Baird)Deparment of Biology, Virginia Polytechnic Institute, Virginia USA (Dr.K.Hilu)Department of Botany, University of Karlsruhe, Germania (Dr. P. Nick)Fraunhofer Institute,Schallemberg, Germany ( Dr. P. Christou) Università degli studi della Basilicata, Potenza (Dr. Spagnoletti) ENEA, Casaccia, Roma (Dr. Giuliano). Confermate tutte quelle previste.


Lo sviluppo dei kit di trasformazione del riso basati su sequenze promotrici e mutate di tubulina,concepiti come sistemi innovativi a ridotto rischio genetico, sta incontrando difficoltà legate alla reale identità della mutazione che dovrebbe conferire il vantaggio selettivo : necessita di studi supplementari. Alcune specie come il pomodoro risultano ostiche all'analisi con il Kit di varietà sviluppato:necessitano studi supplementari. La produzione di vaccini, pur in corso, è legata al perfezionamento degli approcci che mirano a garantire livelli elevati e stabili delle proteine antigeniche nelle piante.


Ottenute varianti proteiche degli allergeni 5A e 5b di Phleum pratense e p1 di Dermatophagoides pterunyssinus con loro espressione in sistemi eterologhi per saggi ipoallergenicità. Ottenute piante transgeniche esprimenti il gene di riso Osmyb4 per migliorare la tolleranza a stress e/o la produzione di metaboliti secondari di interesse farmacologico. Assemblati promotori e forme mutate di tubulina in vettori per la trasformazione del riso. E' stato sviluppato e validato su molte specie un kit diagnostico di varietà di specie vegetali basato su sequenze di tubulina. Elaborate diverse strategie molecolari che mirano a accumulare e stabilizzare alti livelli di proteine eterologhe in piante

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transgeniche.Caratterizzata la myo-inositolo 1P sintasi e il relativo promotore. Prodotti fagioli mutati con basso contenuto in acido fitico(lpa).Caratterizzate varianti alleliche delle lectine di fagiolo.Prodotte breeding lines di fagiolo con quadro diversificato di proteine di riserva. Prodotti ceppi di lievito secernenti una proteina inattivatrice dei ribosomi di saponaria officinalis (saporina).I risultati conseguiti sono coerenti con gli attesi.

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Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: ALDO CERIOTTI Elenco dei partecipanti liv. Allevi Antonia VII Avio Luciano III Banfi Flavia IV Bertani Alcide I Bollini Roberto I Brambilla Ida Melania V Breviario Diego II Carlessi Giovanni VII Castelli De Sannazzaro Silvana III Ceriotti Aldo II Cipullo Angela VIII

liv.Coraggio Immacolata III Daminati Maria Gloria V Galasso Incoronata III Gavazzi Floriana VI Genga Annamaria III Giani' Silvia III Guercio Alessandro VII Lombardi Luciano V Loreti Elena III Mapelli Sergio IV Mattana Monica III

liv.Morello Laura Emma Maria III Pedrazzini Emanuela III Pompa Andrea VI Prandi Ambrogina IV Reggiani Remo II Sbrana Cristiana III Sparvoli Francesca III Spinelli Carla IV Viotti Angelo I Vitale Alessandro II

Temi

Tematiche di ricerca Analisi del ruolo di introni, di fattori epigenetici e di specifici fattori trascrizionali nella espressione genica e/o nella regolazione del metabolismo. Analisi della risposta a stress abiotici, biotici e alla perturbazione della maturazione strutturale delle proteine. Analisi biochimica dei fenomeni di ripiegamento, assemblaggio e degradazione delle proteine e dei meccanismi del loro smistamento alle membrane intracellulari e al vacuolo. Analisi molecolare, biologica e funzionale delle simbiosi micorriziche.

Stato dell'arte Negli ultimi decenni gli sviluppi della genetica molecolare, della fisiologia e della biologia cellulare hanno contribuito a definire i meccanismi molecolari che controllano le caratteristiche agronomiche e nutrizionali delle piante coltivate. Diversi centri di ricerca hanno avviato un'opera d'integrazione fra il lavoro di caratterizzazione biochimica/fisiologica/cellulare e quello di miglioramento genetico delle piante coltivate.

Azioni

Attività da svolgere Espressione genica. Saranno studiate le basi molecolari del fenomeno IME (Intron-Mediated Enhancement of gene expression) mediante mutagenesi e analisi funzionale di un introne di tubulina di riso. Sarà analizzata l’espressione di geni modificati e di fattori trascrizionali in endospermi immaturi di mais. Metabolismo. Saranno analizzati l’assimilazione e metabolismo dell’azoto in risposta a concimazione con farine animali e la composizione lipidica in ecotipi di noce. 3. Risposta a stress. Si confronteranno gli effetti della espressione del gene Osmyb4 di riso in diverse specie. Si

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analizzeranno gli effetti dello stress su metabolismo e fotosintesi e l’espressione genica differenziale in riso in condizioni normossiche ed atossiche. Si studierà la risposta a stress che alterano il ripiegamento proteico nel reticolo endoplasmatico. Proteine: si continueranno gli studi per incrementare l’accumulo di antigeni in tabacco transgenico e per caratterizzare i meccanismi di assemblaggio delle glutenine e di smistamento di proteine ”tail-anchored”. Micorrize: saranno caratterizzati a livello molecolare, strutturale e funzionale diversi isolati di Glomus mosseae e G. intraradices.

Punti critici e azioni da svolgere La carenza di spazi di crescita delle piante continua ad essere uno dei principali fattori limitanti le attività sperimentali e progettuali. A questo deve essere aggiunta la necessità di provvedere i) al rinnovo di alcune attrezzature ii) all’acquisizione di strumentazioni che permettano di introdurre innovazioni nei protocolli sperimentali. Problematiche scientifiche: i) IME: non essendo questo effetto presumibilmente determinato solo da sequenze di DNA presenti negli introni, i dati raccolti serviranno a definire motivi per il legame di proteine del complesso di splicing e/o trascrizionale ii) espressione di proteine eterologhe: la sovraespressione di chaperones molecolari al di sopra di un certo livello non è facile da ottenere, probabilmente per una pressione selettiva contraria iii) gli studi sullo smistamento delle proteine “tail anchored” potranno essere rallentati dal fatto che mentre è già acquisita l’esperienza e la strumentazione necessaria per il cross- linking, la fasi successive dovranno essere effettuate utilizzando strumentazioni esterne iv) risposta a stress da proteine non ripiegate: dovrà essere verificato il coinvolgimento di un potenziale omologo di XBP1.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenze dei gruppi che partecipano alle attività della commessa comprendono la genetica molecolare, la biochimica delle proteine, la biologia cellulare delle piante, la biologia delle interazione tra pianta e ambiente con particolare riferimento agli stress abiotici, la biologia delle interazioni fra pianta e rizosfera. Fra le tecnologie utilizzate, ricordiamo le tecnologie del DNA ricombinante, l’analisi della espressione genica differenziale mediante Macroarrays, Gene-Chips e Real- Time PCR, l’immunoprecipitazione della cromatina, l’espressione transiente in protoplasti, la produzione di proteine eterologhe, la trasformazione di diverse specie vegetali, la microscopia a fluorescenza, l’analisi di metaboliti mediante HPLC, numerose tecniche di purificazione ed analisi biochimica delle proteine, le colture in vitro di materiale vegetale. Le tecniche di indagine includono l’analisi genetica, l’analisi di materiale vegetale sottoposto a specifici trattamenti e la espressione di geni eterologhi in protoplasti o piante transgeniche seguita da analisi dell’espressione genica, dei fenotipi indotti o dei prodotti sintetizzati.

Collaborazioni (partner e committenti) Le attività saranno svolte nell’ambito di un’ampia rete di collaborazioni nazionali e internazionali, comprendente l’ Ente Nazionale Risi, l’ Istituto Agrario S. Michele all'Adige, diversi istituti del C.R.A e del CNR, la Scuola di Perfezionamento Sant’Anna di Pisa, la Russian Academy of Sciences, la Bulgarian Academy of Sciences e diversi dipartimenti afferenti ad università italiane (Bologna, Firenze, Insubria, Milano, Pisa, Salerno, Verona, Viterbo) e straniere (University of California, San Diego; University of Karlsruhe, Germania; University of Warwick, UK). I committenti includono il Ministero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca e l’Unione Europea.

Finalità

Obiettivi Obiettivi: i) caratterizzazione di sequenze non codificanti e di fattori trascrizionali ed epigenetici che regolano l’espressione genica ii) caratterizzazione del metabolismo e di fenomeni di trasduzione del segnale in piante sottoposte a stress iii) caratterizzazione dei meccanismi di maturazione strutturale e

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di smistamento delle proteine iv) caratterizzazione di isolati diversi di funghi micorrizici in relazione ai processi di nutrizione delle piante.

Risultati attesi nell'anno Espressione genica: identificazione di domini o sequenze nucleotidiche coinvolte nell’IME, loro caratterizzazione funzionale nel sistema omologo e in sistemi eterologhi. Ruolo di modificazioni geniche e stato di fattori trascrizionali nell’espressione tessuto specifica e uniparentale. Metabolismo: definizione di quadri di riferimento e comparazione tra diverse condizioni di crescita e specie vegetali. Risposta a stress: piante di riso esprimenti i geni Osmyb4 e Osmyb7, o il gene GUS sotto i promotori di questi geni. Identificazione di geni della sintesi dei fenilpropanoidi attivati da Osmyb4 e di geni differenzialmente espressi in riso in condizioni normossiche e anossiche. Analisi dei meccanismi di risposta a stress da proteine non ripiegate e identificazione di geni differenzialmente espressi. Proteine: tabacco transgenico sovraesprimente endoplasmina. Analisi dell’accumulo di antigeni fusi a frammenti di zeina, dei meccanismi di assemblaggio delle glutenine di frumento e dello smistamento delle proteine tail anchored. Micorrize: verifica in campo dei risultati ottenuti in laboratorio ed validazione di parametri predittivi dell’efficienza fungina. Sequenze di geni ribosomali.

Potenziale impiego - per processi produttivi I prodotti delle attività svolte all’interno della commessa potranno trovare impiego nel miglioramento genetico delle piante coltivate e quindi nel campo della produzione vegetale. In particolare, i prodotti potranno contribuire alla concezione ed all’allestimento di kit innovativi per la trasformazione genetica delle piante, al miglioramento della qualità delle proteine di riserva dei semi e alla creazione di piante resistenti a vari tipi di stress. I prodotti potranno inoltre trovare impiego nella realizzazione di metodiche d’analisi per il tracciamento di inoculi micorrizici arbuscolari nel terreno e di modelli per la selezione di isolati fungini efficienti. Le ricadute nel campo della produzione vegetale potranno a loro volta contribuire al soddisfacimento delle richieste tecnologiche dell’industria di trasformazione.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Le ricadute nel campo della produzione vegetale potranno contribuire al soddisfacimento di una serie di bisogni individuali e collettivi, come il miglioramento delle condizioni ambientali e della qualità degli alimenti.

Moduli

Modulo: Basi molecolari, fisiologiche e cellulari delle produzioni vegetali. Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto

Risorse commessa 2006

Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne

Spese per Infrastrutt.

tecn.-scient. a gestione accentrata

Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9704 354 90 0 1148 251 695 105 N.D. 1504


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Unità di personale di ruolo* Ricercatori Totale

10 15 *equivalente tempo pieno

Unità di personale non di ruolo

Associato Dottorando Borsista Assegnista Specializzando Incaricato di ricerca

Professore visitatore

Collaboratore professionale

Altro Totale

0 2 0 2 0 0 0 0 2 6

Richiesta nuove unità di personale Tempo determinato Tempo indet. Non di ruolo* Totale

0 4 3 7 *dottorati, borse d i studio, assegni di ricerca


Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti di sviluppo competenze Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FRANCESCA SPARVOLI Elenco dei partecipanti liv. Allevi Antonia VII Banfi Flavia IV Bertani Alcide I Bollini Roberto I Brambilla Ida Melania V Breviario Diego II Carlessi Giovanni VII Ceriotti Aldo II Cipullo Angela VIII

liv.Coraggio Immacolata III Daminati Maria Gloria V Galasso Incoronata III Gavazzi Floriana VI Genga Annamaria III Giani' Silvia III Guercio Alessandro VII Lombardi Luciano V Mattana Monica III

liv.Morello Laura Emma Maria III Pedrazzini Emanuela III Pompa Andrea VI Prandi Ambrogina IV Sparvoli Francesca III Spinelli Carla IV Viotti Angelo I Vitale Alessandro II

Temi

Tematiche di ricerca Analisi confocale della struttura del reticolo endoplasmatico di transgenici per una proteina di membrana di tipo IV e per glutenine di frumento fuse alla green fluorescent protein. Analisi dei microtubuli e proteomica di: linee cellulari resistenti a composti antimitotici; comparti subcellulari e M. truncatula in risposta a sovraespressione di geni esogeni e/o stress. Studio delle modificazioni e localizzazioni subcellulari di proteine normali e mutate coinvolte nella regolazione trascrizionale e di proteine ad alta affinità di legame per chaperones molecolari.

Stato dell'arte Lo sviluppo di approcci high throughput per la caratterizzazione degli organismi ha consentito di acquisire conoscenze prima impensabili. In particolare, l'analisi del proteoma sta assumendo sempre più una dimensione funzionale, soprattutto per la possibilità di focalizzarsi su specifici tessuti e

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comparti cellulari. Un altro straordinario strumento di indagine per comprendere e conoscere le dinamiche strutturali e funzionali della cellula è oggi disponibile grazie agli enormi sviluppi delle tecniche di microscopia, in particolare la microscopia confocale.

Azioni

Attività da svolgere Si rafforzerà lo sviluppo di competenze per lo studio delle funzioni e delle strutture della cellula vegetale. Il nuovo microscopio a fluorescenza permetterà di ottenere dati sulla localizzazione cellulare e subcellulare delle proteine allo studio (es. Osmyb7, MIPS) e sul ruolo di regioni proteiche e modificazioni posttraduzionali (gluteline) nella localizzazione subcellulare. Si studierà la formazione di strutture di RE (Organized Smooth ER) quando proteine TA sono sovraespresse. Sarà definita la struttura dei microtubuli in risposta a orizalina e EPC (N- phenyl carbammato), anche in un mutante EPC-resistente. Si studierà la composizione di tubulina nei microtubuli di cellule sensibili o resistenti all’EPC. Si produrranno anticorpi mono-specifici per l’analisi della localizzazione subnucleare di proteine istoniche modificate. Si cercherà di ottenere piante trangeniche di M. truncatula per individuare proteine della via di secrezione e saranno analizzati i profili proteici di semi da piante con inserzioni di T-DNA. Verrà condotta un’analisi proteomica delle proteine di riserva, in particolare di tipo lectinico, in specifici genotipi di fagiolo.

Punti critici e azioni da svolgere Il presente progetto si propone di sviluppare e potenziare le nostre peculiari competenze di proteomica e microscopia. E’ stato acquisito un microscopio a fluorescenza che consentirà l'analisi delle molecole e strutture d'interesse.Resta necessario il potenziamento dell'attrezzatura e software dedicati per l'analisi proteomica. Nel dettaglio delle singole attività occorre segnalare che la preparazione di vettori binari contenenti fusioni YFP/GFP e glutenine competenti e non competenti per l’assemblaggio è finora risultata problematica. Sarà inoltre necessario verificare l’effetto di GFP/YFP sulla capacità di assemblaggio delle glutenine ed acquisire le competenze di agroinfiltraziione e analisi microscopica di cellule epiteliali. L'attività da svolgere sui microtubuli dipenderà anche dalla capacità di disporre e/o produrre anticorpi specifici per il riconoscimento di isoforme specifiche di tubulina. Alcuni si possono acquistare, alcuni sono in via di produzione, per altri ci si appoggerà su collaborazioni con laboratori internazionali. Infine,la trasformazione di M. truncatula ha continuato a presentare difficoltà e si stanno quindi provando approcci alternativi

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine

Collaborazioni (partner e committenti) IGV-CNR-Perugia; IGB-CNR-Napoli; ITB-CNRMilano, Università degli Studi di Firenze; Università degli Studi di Padova; Università degli Studi di Verona, CRA-Sezione di Bergamo; Università degli Studi di Milano: Istituto di scienze farmacologiche, DISMA; University of Warwick; Università di Karlsruhe; Gruppo Europeo di lavoro sul citoscheletro; Università di Barcellona; Università di Marsiglia.

Finalità

Obiettivi Obiettivi: sviluppo di proteomica e analisi confocale per lo studio di: architettura e composizione del reticolo endoplasmatico, basi molecolari e strutturali della resistenza ai composti antimitotici legate al citoscheletro, localizzazione subcellulare di proteine specifiche, effetto della sovraespressione in piante transgeniche di proteine a localizzazione nota o di un fattore trascrizionale implicato

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nell'aumentata tolleranza a stress. Competenze: microscopia confocale, biochimica delle proteine, biologia cellulare, trasformazioni genetiche.

Risultati attesi nell'anno Messa a punto di protocolli sperimentali per l’identificazione e caratterizzazione strutturale di componenti chiave per l'architettura e il funzionamento di comparti subcellulari in condizioni normali e in risposta a situazioni di stress. Individuazione delle relazioni fra molecole coinvolte nel rimodellamento del RE e delle modifiche nei microtubuli prodotte in modo differenziale da orizalina ed EPC. Individuazione della composizione in tubulina associata alla resistenza all’EPC. Produzione di piante transgeniche di M. truncatula esprimenti proteine con diversi destini lungo la via di secrezione e identificazione dei profili proteici in semi portanti inserzioni di T-DNA. Localizzazione a livello subnucleare di proteine istoniche modificate. Localizzazione cellulare di MIPS e delle proteine codificate dal gene Osmyb7. Identificazione delle componenti delle proteine di riserva in genotipi di fagiolo. Acquisizione di competenze nel settore della agroinfiltrazione finalizzata allo studio della localizzazione di fusioni con proteine fluorescenti a livello delle cellule epiteliali.

Potenziale impiego - per processi produttivi

- per risposte a bisogni individuali e collettivi

Moduli

Modulo: Proteomica e microscopia subcellulare per lo studio dell'architettura e del funzionamento della cellula vegetale.

Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9244 91 20 0 355 15 126 34 N.D. 404








Altro Totale

0 0 0 1 0 0 0 0 2 3

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Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FLAVIA PIZZI Elenco dei partecipanti liv. Allevi Antonia VII Banfi Flavia IV Bertani Alcide I Brambilla Ida Melania V Breviario Diego II Carlessi Giovanni VII

liv.Castiglioni Bianca Maria Elisabetta III Cipullo Angela VIIIGiani' Silvia III Gliozzi Teresa Maria III Guercio Alessandro VII Leone Paolo Alberto III

liv.Lombardi Luciano V Pizzi Flavia III Prandi Ambrogina IV Sala Cesare III Spinelli Carla IV

Temi

Tematiche di ricerca Le ricerche afferenti a questa commessa affrontano la problematica della gestione e conservazione delle risorse genetiche animali attraverso la combinazione di metodiche tradizionali di valutazione fenotipica, tecniche molecolari per la tipizzazione dei riproduttori e per la valutazione della qualità e tipicità dei prodotti con le più avanzate biotecnologie riproduttive. In particolare la commessa affronta le seguenti tematiche: - Espressione genica per caratteri produttivi nelle specie zootecniche - Diagnosi aplotipo caseinico e associazione con fenotipi di significato economico nel bovino - Diagnosi molecolare per identificazione di S. aureus nel latte - Creazione e gestione di banche delle risorse genetiche animali - Valutazione della funzionalità degli spermatozoi mediante tecniche innovative - Studio fertilità in campo seme bovino - Applicazione di 'finite mixture models' a dati zootecnici - Transmission disequilibrium test in pedigree complessi - Effetto inbreeding su caratteri riproduttivi in bovini Jersey

Stato dell'arte La caratterizzazione e la conservazione delle risorse genetiche tramite biotecnologie analitiche e riproduttive sono fondamentali per la sostenibilità delle produzioni zootecniche in un sistema in cui qualità e tipicità dei prodotti sono strettamente dipendenti dalla disponibilità di biodiversità. L’interesse dei consumatori per prodotti di qualità derivati sia da produzioni di nicchia che da produzioni industriali ha portato allo sviluppo di tecniche innovative per la valutazione della sicurezza e della tipicità dei prodotti e per la gestione della biodiversità.

Azioni

Attività da svolgere •Riproduzione e conservazione delle risorse genetiche:a)valutazione economica di criobanche di seme o embrioni b)schemi di selezione per popolazioni di poche migliaia di femmine c)nuove

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tecniche di conservazione degli spermatozoi epididimali d) approfondimento di tecniche innovative per la valutazione funzionale del seme e)prosecuzione studi sulla qualità del seme nel bufalo•Diagnostica molecolare:a)identificazione di microrganismi patogeni nel latte e derivati b)tracciabilità del latte e derivati c)trasferimento a PMI di strumenti molecolari per l'individuazione di tossine stafilococciche nei prodotti finiti •Identificazione e analisi dell'espressione dei geni nel suino:a) utilizzo di microarray per analisi espressione genica b)ricerca polimorfismi sui geni candidati per profilo di espressione, mappaggio geni candidati e sviluppo di test molecolari per studi di associazione c)sviluppo di metodi di analisi statistica di meccanismi di interazione di geni espressi in modo differenziale•Diagnosi aplotipo caseinico con DNA chip: estesa tipizzazione dei bovini•Sistemi informativi sulle innovazioni biotecnologiche e tracciatura di filiere agroalimentari

Punti critici e azioni da svolgere Nel 2005 un tecnico di V livello afferente alla commessa ha ottenuto il trasferimento presso altra Amministrazione, si richiede pertanto la rapida reintegrazione con un unità di personale tecnico a tempo indeterminato. Il Direttore dell'IBBA ha inoltre inviato al Presidente diverse lettere nelle quali veniva proposto il trasferimento a Lodi, in locali messi a disposizione dal Parco Tecnologico Padano, del nucleo operativo, corrispondente a questa commessa, che opera attualmente al LITA. Come illustrato dal Direttore il possibile trasferiemento a Lodi richiederebbe 200.000 euro per gli arredi tecnico-scientifici ed il trasloco. I costi per la gestione dei circa 430 mq dovrebbero essere pari a circa 50.000 euro/anno. Di cruciale importanza per gli sviluppi futuri della commessa, sia nel caso mantenga la sede attuale ed a maggior ragione nel caso di trasferimento a Lodi, sarà l'acquisizione di personale tecnico e ricercatore.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenze dei ricercatori partecipanti alla commessa sono principalmente di: genetica, biologia molecolare e cellulare, bioinformatica.Competenze specifiche di biologia cellulare: valutazione di parametri strutturali e funzionali dello spermatozoo mediante tecnologie avanzate.Tecnologie e tecniche di indagine: determinazione microscopica della vitalità degli spermatozoi mediante colorazione con Eosina/Nigrosina e colorazione in fluorescenza con SYBR-14/PI; valutazione della morfologia degli spermatozoi (E/N); valutazione della motilità degli spermatozoi mediante CASA; determinazione dello stato dell'acrosoma (microscopia in fluorescenza con FITC-PNA/PI); valutazione dell'integrità del DNA degli spermatozoi mediante SCGE (comet).Competenze specifiche di biologia molecolare: Estrazione e purificazione di DNA e RNA, clonaggio del DNA, PCR, elettroforesi su gel d'agarosio, elettroforesi in campo pulsato (PGFE), DNA microarrays. Le competenze della commessa riguardano anche la creazione di sistemi informativi sulla ricerca biotecnologia in agricultura.

Collaborazioni (partner e committenti) Dipartimento di Sicurezza Alimentare; Dipartimento di Patologia Animale, Igiene e Sanità Pubblica Veterinaria dell'Università degli Studi di Milano - Università Cattolica di Piacenza - Università della Tuscia - University of Wisconsin - Agricultural University of Norway - ITB CNR - ISPA CNR - EADGENE (Network of excellence)- Parco Tecnologico Padano (CERSA) - Ente Lombardo Potenziamento Zootecnico -

Finalità

Obiettivi Gli obiettivi delle ricerche svolte sono: Sviluppo di schemi di gestione della variabilità genetica - Progettazione, ottimizzazione e gestione di criobanche del germoplasma animale - Ottimizzazione delle tecniche riproduttive - Miglioramento qualità e conservazione del seme - Diagnostica molecolare per la qualità, tipicità e sicurezza dei prodotti - Genetica delle caratteristiche qualitative delle carni

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destinate a trasformazione - Genetica delle lattoproteine (proprietà nutrizionali) - Sistemi informativi per la valorizzazione delle risorse genetiche animali

Risultati attesi nell'anno •Riproduzione e conservazione risorse genetiche:a)strumenti innovativi per crioconservazione di razze locali b)schemi di selezione in razze ad effettivo ridotto c)utilizzo di spermatozoi epididimali per creazione di criobanche d)nuovi metodi per la valutazione della funzionalità del seme e)criteri per il miglioramento dell’efficienza riproduttiva nel bufalo•Diagnostica molecolare: a)individuazione di biotipi indicatori della qualità del latte b)definizione di quadri di identità genetica del latte c)sviluppo e trasferimento a PMI di strumenti diagnostici molecolari per lo studio della contaminazione batterica in prodotti lattiero-caseari•Diagnosi aplotipo caseinico con DNA chip:deposito di brevetto provvisoriamente denominato “Microarray probes per la diagnosi delle lattoproteine bovine”•Identificazione e analisi dell'espressione di geni nel suino:a)realizzazione di microarray per l'identificazione di geni candidati per la qualità della carne b)metodi più efficienti per il miglioramento della qualità della carne mediante selezione genotipica c)pagina WEB del progetto•Sistema di modellazione filiera agroalimentare•Portale per innovazioni biotecnologiche

Potenziale impiego - per processi produttivi -Diagnostica molecolare della qualità, tipicità e sicurezza dei prodotti di origine animale -Identificazione simultanea dei principali polimorfismi lattoproteici nei bovini utilizzando Kit diagnostico basato su DNA chip -Analisi microbiologica delle materie prime e dei prodotti derivati del latte -Valutazioni innovative del materiale seminale per l’ottimizzazione delle biotecnologie riproduttive -Modellizzazioni per la conservazione delle risorse genetiche animali -Disponibilità di materiale genetico di razze locali -Applicazione della bioinformatica per l’analisi di dati molecolari e quantitativi

- per risposte a bisogni individuali e collettivi -Tecnologia microarray e utilizzo di sonde oligonucleotidiche per l’estesa tipizzazione dei polimorfismi lattoproteici nei bovini a supporto della selezione -Sicurezza alimentare della filiera latte per produttori e consumatori -Conservazione di risorse genetiche animali di valore socio economico e culturale

Moduli

Modulo: Conservazione delle risorse genetiche animali e valorizzazione delle loro produzioni



Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9352 295 260 0 907 163 718 67 N.D. 1137


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Altro Totale

0 0 1 2 1 0 0 0 0 4




Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Sede principale svolgimento: Roma Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIOVANNA FRUGIS Elenco dei partecipanti liv. Bertani Alcide I Breviario Diego II Caltavuturo Leonardo VII Cini Marco VII Cionini Giuliano VI Frassinetti Stefania III Frugis Giovanna III

liv.Geri Chiara II Giani' Silvia III Giannino Donato III Guercio Alessandro VII Iannelli Maria Adelaide III Luccarini Gualtiero V Mariotti Domenico I

liv.Mirandi Sandro V Nicolodi Chiara III Patitucci Licia VIIIPochetti Giorgio III Quinto Cataldo VII Rea Giuseppina III

Temi

Tematiche di ricerca Isolamento, caratterizzazione funzionale e utilizzo biotecnologico di geni homeobox vegetali che controllano la formazione, l’identità e l’attività di meristemi (plant stem cells) in specie modello e di interesse agrario per il miglioramento genetico e la salute umana. Stress e sviluppo: identificazione dei meccanismi di regolazione che utilizzano vie di trasduzione del segnale comuni nella risposta a stress e nei processi di sviluppo. Basi molecolari e citofisiologiche della competenza meristematica ed embriogenetica, processi epigenetici, variazione somaclonale e meiosi per la selezione in vitro di genotipi superiori di specie di interesse agronomico. Sviluppo di nuove metodologie per la trasformazione di piante di interesse agrario e biotecnologico che utilizzano la totipotenza cellulare e la risposta adattativa allo stress. Utilizzo di sistemi di lievito come supporto alla post-genomica vegetale e per studi di mutagenesi e antimutagenesi di cellule eucariotiche.

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Stato dell'arte La principale differenza tra lo sviluppo animale e quello di una pianta superiore è che gli organi presenti nella pianta adulta non vengono formati nell’embrione vegetale. Durante l’embriogenesi infatti si forma una struttura molto semplice che contiene due popolazioni di cellule meristematiche (plant stem cells): il meristema apicale vegetativo (SAM) e il meristema radicale. Lo sviluppo post-embrionale di questi meristemi è interamente responsabile della morfologia della pianta adulta e dipende fortemente dai segnali interni e ambientali che vengono percepiti e integrati in maniera dinamica durante l’intera vita della pianta. Nonostante il notevole sforzo della comunità scientifica per identificare i determinanti genetici e i pathway ormonali e metabolici coinvolti nell’attività dei meristemi, molto rimane da elucidare. La maggior parte dei dati acquisiti riguardano soltanto la specie modello Arabidopsis e non sono stati validati ed estesi a specie di interesse agrario, il cui sviluppo è spesso molto più complesso. I meristemi vegetali variano infatti per struttura e attività tra specie vegetali determinando la grande diversità di forma e architettura presenti in natura.

Azioni

Attività da svolgere Isolamento e caratterizzazione funzionale di geni homeobox in specie vegetali erbacee e arboree mediante: analisi dell’espressione genica in risposta a segnali endogeni e ambientali, localizzazione intracellulare, studio e produzione di piante con alterati livelli di espressione, identificazione dei geni target e dei partner proteici, cristallizzazione e risoluzione della struttura tridimensionale di domini di proteine homeobox e dei loro complessi di attivazione/repressione della trascrizione. Applicazioni biotecnologiche dei geni homeobox per la propagazione in vitro, il miglioramento genetico assistito e per la salute umana. Definizione e controllo della competenza meristematica ed embriogenetica, dei processi epigenetici e della variazione somaclonale. Identificazione dei meccanismi di regolazione che utilizzano vie di trasduzione del segnale comuni nella risposta a stress e nei processi di sviluppo. Sviluppo di nuove metodologie per la trasformazione di piante di interesse agrario e biotecnologico. Messa a punto di sistemi di lievito per la post-genomica vegetale e per la mutagenesi e antimutagenesi di cellule eucariotiche.

Punti critici e azioni da svolgere Trasferimento della UO di Roma in una sede adeguata in costruzione presso l'Area della Ricerca di Roma 1 con ripresa di attività di formazione di studenti universitari momentaneamente interrotta per problemi di spazio. Assunzione di personale a tempo indeterminato con le competenze necessarie per svolgere i programmi in corso. Reperimento fondi per dottorati e contratti per personale giovane qualificato. Implementazione e sostituzione di strumentazione obsoleta, acquisizione di software specifici. Necessità di stabilire nuove collaborazioni esterne per il reperimento di fondi e materiali sulle tematiche più recenti e innovative della commessa.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze: genomica funzionale di proteine coinvolte nella morfogenesi e differenziamento delle piante superiori, caratterizzazione di fattori di trascrizione, genetica di specie modello e di interesse agrario, selezione e produzione di piante transgeniche, fisiologia vegetale classica e molecolare, biochimica del sistema ossidativo, bioinformatica, citologia, istologia e immunocitochimica, localizzazione intracellulare di proteine, mutagenesi e antimutagenesi in lievito, determinazione della struttura tridimensionale di complessi proteici Tecnologie e tecniche di indagine: crescita di materiale vegetale, colture di tessuti e cellule vegetali in vitro, elettroforesi, clonaggio di sequenze geniche, espressione genica mediante RT-PCR, Northern, ibridazione in situ e analisi microarray, trasformazione genetica di specie modello e recalcitranti, analisi di marcatori molecolari GUS e GFP, RNA-interference, VIGS (Virus Induced Genetic Silencing), ChIP (Chromatin Immuno Precipitation),

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espressione e purificazione di proteine, , spettrofotometria, HPLC, citologia e istologia, test di mutagenesi, cristallografia a raggi X, modellistica molecolare

Collaborazioni (partner e committenti) Committenti: MIPAF, MIUR, EC, MPOB, Interreg 3A Partner FIRB-MIUR: IGV-CNR Perugia, Università di Padova, Università di Verona, IBBA-CNR Milano, MIPAF Firenze, CNR Napoli Partner MIPAF-EuMORFO: Istituto Frutticoltura CRA-Roma, Università La Sapienza - Roma, Istituto sperimentale per la Floricoltura-Sanremo Partner Interreg 3A: INRA S Giuliano (Corsica), Cons. Istituto Nazionale Biostrutture e Biosintesi, Sassari. NMR-GM: CNR-Roma Collaborazioni: Istituto di Frutticoltura del CRA-MIPAF-Ciampino; Centro Interuniversitario EST-Tree, Lodi; Università della Calabria, Cosenza; Facoltà d’Agraria Pisa; Istituto di Biofisica del CNR (Genova e Pisa); Consorzio Interdipartimentale di Genomica Funzionale e Proteomica (GFP), Università Roma1; Laboratoire de Biologie Cellulaire, INRA (F); Laboratory of Plant Molecular Biology, Rockefeller University, NY (US); Plant Gene Expression Center, USDA-UCLA, Albany, (US); Biochemistry and Genetics Dpt, University of Clemson, SC, US; Station de Recherches Agronomiques SRA; Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas, Universidad Politécnica de Valencia, Spain; Physiologie végétale, Université de Neuchâtel, Switzerland

Finalità

Obiettivi Geni homeobox vegetali e loro applicazioni: identificazione dei geni target e dei complessi proteici di attivazione/repressione della trascrizione di cui questi fattori fanno parte, identificazione delle vie di trasduzione dei segnali ormonali e delle vie metaboliche attraverso le quali regolano la determinazione cellulare, lo sviluppo e l’architettura della pianta, identificazione dei segnali endogeni e ambientali che ne regolano l’attività, determinazione della struttura dei domini proteici mediante cristallografia a raggi X. Totipotenza cellulare: definizione delle basi molecolari e citofisiologiche della competenza meristematica ed embriogenetica e loro applicazioni biotecnologiche. Stress e sviluppo: identificazione dei meccanismi di regolazione che utilizzano vie di trasduzione del segnale comuni nella risposta a stress e nei processi di sviluppo e loro utilizzo per la selezione di varietà migliorate. Sviluppo di sistemi: nuove metodologie per la trasformazione di piante di interesse agrario e biotecnologico, messa a punto di sistemi di lievito come supporto alla post-genomica vegetale e per studi di mutagenesi e antimutagenesi di cellule eucariotiche.

Risultati attesi nell'anno Isolamento dei cDNA completi di geni homeobox di M. truncatula (MtKNOX) e pesco. Identificazione dei tessuti e delle condizioni in cui si esprimono, ottenimento di piante transgeniche di Medicago truncatula in cui l’espressione degli MtKNOX è modulata. Produzione di anticorpi per alcuni fattori homeobox di Arabidopsis, riso e mais e messa a punto delle condizioni di ChIP per l’identificazione di geni target. Identificazione degli stimoli legati alla risposta ambientale in grado di indurre geni KNOX in Arabidopsis. Ottenimento di costrutti per l’espressione eterologa dei domini di interazione KNOX/BELL. Analisi di espressione genica e localizzazione di trascritti KNOX e BELL in tessuti meristematici di cloni di pesco in propagazione. Conoscenza dei parametri relativi alla microsporogenesi in palma e messa a punto di un protocollo di embriogenesi somatica da primordi fiorali. Messa a punto ed ottimizzazione di protocolli di trasformazione di Lemna minor. Dati di espressione genica dopo stress salino in Citrus. Determinazione della genotossicità di estratti di foglie e di olii essenziali di Citrus. Effetti dell’overespressione e del silenziamento di L1L sull’epifillia.

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Potenziale impiego - per processi produttivi Il controllo dell’attività delle “plant stem cells” dei meristemi (differenziamento versus totipotenza) può essere utilizzato per il miglioramento genetico di tratti legati alla produzione in specie di interesse agrario (rigenerazione per embriogenesi somatica e organogenesi, moltiplicazione di cloni, produzione e morfologia fogliare, durata della fase vegetativa, rapporto foglie/steli, produzione di fiori e frutti, produzione e qualità del legno, vigoria). Questo si può realizzare attraverso la selezione assistita da marcatori molecolari basati sul polimorfismo strutturale e sull’espressione di geni che regolano l’attività dei meristemi, il trasferimento di geni utili, il controllo della variabilità somaclonale e dei meccanismi epigenetici, l’identificazione dei fattori endogeni e ambientali che influenzano lo sviluppo post-embrionale e/o che inducono mutagenesi. L’alta capacità di moltiplicazione meristematica clonale di alcune specie vegetali può essere sfruttata per la produzione di proteine ricombinanti e molecole di interesse alimentare e farmacologico a basso costo.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi L’acquisizione di conoscenze sui fenomeni di differenziamento cellulare e totipotenza attraverso lo studio delle “plant stem cells” presenti nei meristemi costituisce un forte supporto allo studio delle cellule staminali umane. Le cellule vegetali potrebbero rappresentare un sistema eterologo importante dove testare ipotesi e modelli animali di determinazione del destino cellulare, considerando che esistono famiglie geniche estremamente conservate in piante e animali che codificano per gli stessi moduli strutturali (i.e. homeobox). Lo studio dei meccanismi di mutagenesi e antimutagenesi in cellule eucariotiche e la messa a punto di test di genotossicità incrementa la sicurezza alimentare e aumenta la qualità del prodotto con enorme beneficio per il produttore e il consumatore. La produzione di molecole e macromolecole per la salute umana in sistemi vegetali potrebbe portare a un abbassamento dei costi di produzione di farmaci importanti con conseguente beneficio per la comunità. L’attività di ricerca presentata incrementa la conoscenza di processi biologici fondamentali e forma nuovi scienziati in un settore ampio, innovativo e multidisciplinare.

Moduli

Modulo: Basi Genetiche, Fisiologiche e Molecolari dello Sviluppo e Differenziamento di Specie Modello e di Interesse Agro-Alimentare in Risposta a Fattori Endogeni e Ambientali

Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Luogo di svolgimento attività: Sezione di Monterotondo Modulo: Basi Genetiche, Fisiologiche e Molecolari dello Sviluppo e Differenziamento di

Specie Modello e di Interesse Agro-Alimentare in Risposta a Fattori Endogeni e Ambientali

Istituto esecutore: Istituto di cristallografia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Monterotondo


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9635 324 234 0 1193 85 643 112 N.D. 1390


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Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0




Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biologia e biotecnologia agraria Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: DIEGO BREVIARIO Elenco dei partecipanti liv. Allevi Antonia VII Banfi Flavia IV Bertani Alcide I Bollini Roberto I Brambilla Ida Melania V Breviario Diego II Carlessi Giovanni VII Ceriotti Aldo II Cipullo Angela VIII

liv.Coraggio Immacolata III Daminati Maria Gloria V Galasso Incoronata III Genga Annamaria III Giani' Silvia III Guercio Alessandro VII Locatelli Franca III Lombardi Luciano V Mattana Monica III

liv.Morello Laura Emma Maria III Pedrazzini Emanuela III Petruzzelli Luciana III Pompa Andrea VI Prandi Ambrogina IV Sparvoli Francesca III Spinelli Carla IV Viotti Angelo I Vitale Alessandro II

Temi

Tematiche di ricerca Approcci genetici e citogenetici per lo sviluppo di linee di fagiolo migliorate nutrizionalmente. Ottimizzazione della stabilità di vaccini in piante. Individuazione ed utilizzo di meccanismi di localizzazione subcellulare. Sviluppo di kits per la tipizzazione genetica. Trasformazione genetica con nuovi promotori e geni per la resistenza a stress. Cambiamenti metabolici indotti dalla transfezione del gene Myb4. Mutagenesi e produzione di proteine ipoallergeniche. Sviluppo di sistemi di espressione per la sintesi di immunotossine ricombinanti.

Stato dell'arte Le attuali tecniche d'analisi genomica e biochimica permettono di accelerare e rendere più sicuri i processi di miglioramento genetico tradizionale e di caratterizzazione e tutela di genotipi vegetali. Le

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tecnologie di trasformazione genetica possono essere utilizzate per migliorare la qualità della produzione agricola e le sue interazioni con l'ambiente e per la produzione di molecole per uso industriale e biomedico, in modo economico, efficiente, sicuro e rispettose dell'ambiente.

Azioni

Attività da svolgere Ottenimento di linee di fagiolo mediante breeding e/o mutagenesi chimica : analisi di fattori legati a caratteristiche nutrizionali (fitati, lectine, inibitori di proteasi) presenti in esse e in ecotipi locali italiani. TILLING su popolazione di semi M2 proveniente dalla mutagenesi per individuare mutanti del gene myo-inositol-3-phospate synthase. Produzione di proteine di fusione con sequenze di un frammento anticorpale e saporina. Accumulo di antigeni di interesse farmacologico in piante trangeniche di tabacco per fusione a sequenze di zeina e sovraespressione di chaperones molecolari. Analisi di tolleranza agli stress di piante transgeniche esprimenti il gene di riso Osmyb4 (mais e melo in condizioni di freddo e secco). Confronto di metaboliti secondari in tabacco ed arabidopsis sovraesprimenti il gene Osmyb4. Il kit diagnostico basato sull’uso del TBP sarà implementato con l’uso differenziale/combinato dei due introni dei geni di beta-tubulina di pianta e ne sarà verificata l’applicabilità, con modifiche, alla quota di DNA presente nel latte vaccino. Espressione della proteina allergenica p1 dell’acaro della polvere e sue varianti ipoallergeniche in P.pastoris o S.cerevisiae.

Punti critici e azioni da svolgere Scientifici :. La sovraespressione di chaperones molecolari al di sopra di un certo livello (2-5 volte il normale) per l’espressione di antigeni in pianta non è facile da ottenere. La produzione di proteine di fusione scFv-saporina in lievito potrebbe essere ostacolata da fenomeni di tossicità verso la cellula ospite. Tali problemi potranno essere affrontati utilizzando una strategia di protezione della cellula ospite e/o attraverso l'utilizzo di fermentatori su piccola scala. Se necessario, si valuterà l'opportunità di utilizzare sistemi di espressione procarioti. Si possono prevedere difficoltà nella espressione delle proteine allergeniche legate alla correttezza della loro modifica post-traduzionale e del loro processamento. Logistici e di strumentazione : Soffriamo della scarsità di spazi e attrezzature rinnovate per la crescita di piante. Non possediamo un idoneo sequenziatore di DNA con annessi programmi di elaborazione informatica dei polimorfismi individuati o prodotti per mutagenesi (tilling) Tale mancanza impone protocolli di lavoro laboriosi o ci impone di rivolgerci all’esterno. Potrebbe essere necessario potenziare le attrezzature dedicate alla crescita dei lieviti.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze : Genetica e biologia molecolare,Citogenetica, Biochimica, Biologia Cellulare,Fisiologia, Tecniche di trasformazione e biotecnologie Vegetali. Tecnologie : del DNA ricombinante, ingegneria gnetica e proteica Tecniche di indagine: molecolari, fisiologiche, biochimiche. Incroci e trasformazioni genetiche, coltivazioni in vitro e mutagenesi sito specifica legata anche all'espressione di proteine in sistemi eterologhi.

Collaborazioni (partner e committenti) A livello nazionale con 7 Istituti CNR, 6 Istituti sperimentali o Enti di ricerca , 12 Università e 2 Industrie; da aggiungere 20 laboratori coinvolti in un progetto MIUR per la caratterizzazione delle risorse genetiche. A livello Internazionale con 10 Istituti di Ricerca o Università; 6 laboratori del progetto EU Biointeractions (www.unine.ch/bota/bioch/biointer.html) ; 30 laboratori del progetto EU Pharma-Planta (www.Pharma-Planta.org). Da aggiungere la presenza nel consorzio internazionale Phaseomics e nel gruppo di lavoro Internazionale sul citoscheletro.

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Finalità

Obiettivi Obiettivi : Migliorare la qualità del prodotto agricolo attraverso il breeding assistito e la produzione di piante transgeniche. Garantire un'analisi più accurata delle filiere utilizzando tecniche molecolari e caratterizzare le risorse genetiche. Utilizzare piante e microrganismi geneticamente modificati per la produzione di proteine e altre molecole d'interesse agro-farmaceutico. Sviluppo di vaccini. Competenze : Genetica, citogenetica, biochimica, fisiologia,biologia cellulare e molecolare applicata alle piante, incroci e trasformazioni genetiche, coltivazioni in vitro e mutagenesi.

Risultati attesi nell'anno Descrizione di alcune componenti nutrizionali del seme di fagiolo. Messa a punto della tecnica TILLING. Individuazione di mutanti Prime analisi sulla struttura del gene MIPS (myo-inositol-3-phospate synthase mutato. Implementazione del metodo TBP sia per penetrabilità di analisi (un maggior numero di marcatori) che applicabilità di indagine diagnostica di polimorfismi genetici di varietà e specie vegetali di interesse commerciale e locale. Identificazione del grado ditolleranza a freddo e secco indotto in mais e melo transgenico dall’espressione del gene Osmyb4.Identificazione di metaboliti secondari la cui sintesi sia indotta dal gene Osmyb4 in arabidopsis e tabacco. Piante transgeniche di tabacco sovraesprimenti il chaperone molecolare endoplasmina. Piante transgeniche di tabacco esprimenti antigeni fusi a frammenti di zeina. Analisi dell’accumulo e localizzazione subcellulare di tali proteine chimeriche. Varianti per mutagenesi sito-specifica del sito di glicosilazione e di epitopi coinvolti nel legame IgE. Produzione di fusioni frammento anticorpo scFv-saporina in lievito o Escherichia coli.

Potenziale impiego - per processi produttivi In ambito nutriceutico e salutistico :proteine vegetali più nutrienti. In ambito medico-farmacologico : vaccini, imunotossine,ipoallergeni. In ambito agronomico: semi di fagiolo migliorati per proprietà nutrizionali, piante più tolleranti a stress e patogeni. In ambito agro-alimentare : marcatori molecolari per l'identificazione rapida preliminare e sicura dell'identità genetica delle coltivazioni e delle materie prime da esse derivate

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Collettivi : Nuovi presidi farmacologici, nuovi prodotti migliorati per le loro qualità nutrizionali,migliore controllo e caratterizzazione degli alimenti Individuali : culturali e di educazione alimentare

Moduli

Modulo: Biotecnologie agro-industriali per il miglioramento genetico, il rispetto dell'ambiente e la tutela dei prodotti, la produzione di proteine e metaboliti di interesse alimentare, salutistico e farmacologico.


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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9433 233 144 0 810 152 529 69 N.D. 1031








Altro Totale

0 2 0 3 0 0 0 0 2 7




IMMACOLATA CORAGGIO Analisi evolutiva e funzionale di famiglie multigeniche, modificazioni epigenetiche e sequenze non codificanti nelle piante.- 2° Modelling and experimental analysis for an integrated vision in plant genetic.

CHIARA GERI Analisi di funzioni specifiche nello studio dei meccanismi biologici alla base dei processi di sviluppo e differenziamento nelle piante: studio comparativo mediante approccio di citogenetica molecolare di fenomeni meiotici in piante normali e mutanti di

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione In questo documento verranno considerati i singoli componenti che all’interno dell’IBBA compongono il sistema ricerca e trasferimento dell’innovazione e della conoscenza. I singoli componenti sono interconnessi e la loro analisi singola risponde a criteri di funzionalità espositiva. Un raccordo generale tra i vari componenti del sistema costituirà il sunto del documento. Struttura, Organizzazione e Funzionalità dell’Istituto. La Direzione IBBA è a Milano in via Bassini 15 (Area Ricerca Milano 1) dove hanno sede anche i laboratori "Biosintesi Vegetali", che sono il nucleo e la componente (31 persone in organico e 11 a tempo determinato) più consistente dell'Istituto. Nell’estate del 2005 si è effettuato il trasloco di questa realtà, dall’edificio sul lato di via Bassini ad un nuovo edificio appena ultimato, sito sul lato di via Corti (sempre all’interno dell’Area Ricerca Milano 1). Abbiamo operato utilizzando tutti fondi a disposizione e gli arredi dei laboratori e uffici che erano in uno stato accettabile. E’ stata un’operazione, come tutti i traslochi di realtà complesse, onerosa in termini di energie dedicate. Ora disponiamo di una adeguata superficie di laboratori e studi. Stiamo affrontando ancora qualche problema logistico poiché il trasloco è avvenuto con immediatezza, ovverosia appena l’immobile è stato consegnato agli Istituti, poiché non era più possibile rimanere nella precedente condizione operativa. L’organizzazione e l’impegno posto in essere dal personale hanno comunque fatto si che questa operazione si sia conclusa in modo più che soddisfacente in un periodo di tempo accettabile e tale da non produrre fermate sconvolgenti all’attività di ricerca. L’organizzazione della sede mantiene la sua funzionalità. Altre Sedi operative IBBA sono a Segrate (Area Ricerca Milano 4 con 5 ricercatori), Pisa (in Area Ricerca CNR e presso la Facoltà di Agraria con 10 persone in organico), Roma (Area Montelibretti con 6 persone in organico). La funzionalità organizzativa e l’operatività della sede di Roma sono fortemente influenzate dalla carenza di spazi. Per la sede di Pisa, rimangono problemi non risolti in Area, dovuti ad una frammentazione degli spazi in uso, mentre per i ricercatori operanti in Università occorrerà ridefinire una Convenzione alla luce degli ultimi assetti organizzativi del CNR e dei Dipartimenti Universitari che li ospitano, al fine di aumentare la funzionalità e l’integrazione operativa di questo nucleo IBBA con il resto dell’Istituto. Attività di Ricerca e Produzione scientifica. Le ricerche hanno come obiettivo l’aumento delle conoscenze sulle basi molecolari che regolano il funzionamento dei sistemi biologici di interesse agrario (piante, animali), a diverso livello di organizzazione (cellula, organismo), come base per programmi indirizzati ad un loro migliore e diversificato utilizzo e per un aumento della qualità delle produzioni. Recependo i nuovi indirizzi di organizzazione scientifica CNR, l’Istituto ha chiesto di afferire totalmente al Dipartimento Agroalimentare proponendo 4 commesse a carattere strategico, una di sviluppo competenze e una di curiosity driven. Il nuovo modello scientifico-organizzativo basato tra l’altro su una presa d’atto ed analisi del full cost dell’attività di ricerca e della necessità di cofinanziamento esterno per il raggiungimento degli obiettivi delle commesse, in questo anno di attività e di transizione non ha provocato particolari cambiamenti operativi o tensioni negative all’interno dell’Istituto. Ad oggi il finanziamento 2005 da parte del CNR “dotazione ordinaria” è stato il più basso in assoluto degli ultimi anni con una decurtazione significativa rispetto all’anno precedente. In queste condizioni, l’attività scientifica è comunque proseguita con un certo successo grazie anche all’apporto di cofinanziamento esterno e grazie all’effetto “volano” dell’anno precedente. Le pubblicazioni 2005, ad oggi, sono stimate in 29 pubblicazioni su riviste ISI con un I.F. medio pari a 2,52. E’ oggettivamente un buon risultato, visto il finanziamento degli ultimi anni. Sono stati altresì sviluppati e depositati due nuovi brevetti in ambito biotecnologico. Va però preso atto che ci sono alcune aree di ricerca, soprattutto nel nostro caso, nell’ambito della biologia vegetale, che pur essendo scientificamente produttive e promettenti hanno scarse opportunità di cofinanziamento esterno poiché non legate immediatamente a programmi di innovazione bio-tecnologica. La non possibilità di un loro finanziamento, non dico adeguato, ma almeno a livello di minima funzionalità comporterà, se prosegue questo trend di scarso finanziamento, alla perdita di un prezioso contributo all’attività futura (depauperamento del serbatoio di conoscenza). Finanziamento delle attività di ricerca. Fatto salvo la scarsità di finanziamento “ordinario” va rilevato che il cofinanziamento esterno e la partecipazione a programmi di largo respiro, in collaborazione con le Università e i Centri di ricerca nazionali e internazionali, sono stati più che positivi e tra questi va sottolineato che nel corso dell’anno sono stati attivati due nuovi significativi contratti con organizzazioni internazionali in ambito biotecnologico (Malaysia Palm Oil Board e la Charity Inglese GCIR) e nuovi contratti con la Regione Lombardia, la Regione Toscana, il MiPAF. Hanno continuato ad essere attivi i progetti EC (tre), i progetti Firb (6), i progetti con le Fondazioni Cariplo e Parco Tecnologico Padano oltre ad un progetto con l’industria e con alcune organizzazioni di categoria. Nel panorama dei nostri finanziamenti esterni, le imprese italiane svolgono un

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ruolo non molto significativo. Infrastrutture( Edilizia). I problemi di spazio, l’agibilità e la disponibilità di laboratori per il nucleo di Roma, ospitato nei locali dell’IBAF-CNR in Montelibretti, sono pesanti e ne limitano l’attività. Sono in corso azioni che potrebbero fornire, si spera entro i primi mesi del 2006, una situazione temporanea più accettabile con la disponibilità di un prefabbricato da posizionare nell’Area di Montelibretti. Risorse strumentali. E’, in generale, un punto debole poiché l’attrezzatura di base (ultracentrifughe, spettrofotometri, incubatori, HPLC…) è rimasta ferma da parecchi anni. E’ necessario un ricambio-aggiornamento che nella situazione attuale non è finora stato attuato. Per l’utilizzo di componenti di piattaforme tecnologiche in campo della genomica funzionale e proteomica e di grandi apparecchiature nell’ambito della fisiologia molecolare, ci si rivolge ad altri Istituti CNR, Università, ditte private. Abbiamo nel corso degli ultimi due anni concentrato le risorse disponibili su attrezzature scientifiche (microscopia a fluorescenza integrata, PCR real time, particle gun, lettore di microarrays..) che sono indispensabili per un aggiornamento metodologico e che possano essere corollario e supporto all’uso delle piattaforme tecnologiche che troviamo all’esterno. E’ un modello organizzativo che può tenere a patto che l’attrezzatura di base venga rinnovata. Per la sede di Roma, il problema delle risorse strumentali si porrà con tutta evidenza nel momento in cui si avranno a disposizione i nuovi locali. Un discorso a parte va fatto per le celle climatiche necessarie per la crescita delle piante in ambiente controllato e in particolare per la crescita in sicurezza di alcuni tipi di piante transgeniche. Siamo fortemente carenti e in particolare non abbiamo nessuna cella climatica adatta per la crescita in sicurezza dei transgeni. E’ un problema che investe tutte le sedi in cui opera l’IBBA. E’ un punto cruciale della nostra attività ed è un vero punto di criticità e debolezza poiché non abbiamo, al momento, finanziamenti per risolvere la situazione. Risorse di personale. Sono le risorse più preziose che abbiamo. Purtroppo abbiamo perso nel corso dell’anno validi apporti, ma l’esperienza, voglia di fare, capacità scientifica e operativa della gran parte delle persone in organico, ci permettono di continuare ad operare e di essere competitivi e in qualche settore scientifico, realmente competitivi a livello internazionale. Abbiamo delle nuove “risorse”, ricercatori assunti con contratto a termine o con assegni di ricerca che si rinnovano di anno in anno. Sono, in molti casi, persone motivate e desiderose di entrare nel mondo della ricerca con tutto l’entusiasmo del caso, ma sono frenati dalla politica di assunzioni imposta dalle varie leggi finanziarie. Poiché la situazione si protrae da parecchio tempo si sta e si rischia realmente di perderne i migliori. Questo, e l’invecchiamento progressivo del personale in organico sono i fattori limitanti per la nostra attività. Conclusioni. Pur con limitazioni dovute a carenza di finanziamenti per le risorse strumentali e per ricerche di conoscenza, e pur in presenza di una carente politica di nuove assunzioni dettata dalle varie leggi finanziarie, si può dire che l’IBBA si presenta, nell’ambito del proprio campo di interesse, ancora come una struttura competitiva e peculiare in ambito nazionale dove ne è un punto di riferimento. La competizione internazionale, come dimostrato da contratti con la EC e organizzazioni internazionali e da pubblicazioni su riviste ad elevato I.F , ne premia i settori scientificamente e metodologicamente più avanzati . Vi è grande attenzione all’interno dell’Istituto per il trasferimento dell’innovazione, attenzione che è cresciuta negli anni e che si traduce in brevetti e conseguentemente in azioni per cercare di trasferirne le potenzialità al mondo produttivo. Va però detto che l’interazione fattiva con le Imprese sia per i brevetti che per il cofinanziamento dell’attività di ricerca è poco soddisfacente, riflettendo in questo la situazione generale del nostro settore.

Proposta di interventi organizzativi La logica della nuova organizzazione CNR articolata in dipartimenti-commesse richiederà di pensare ad una nuova stutturazione, e quindi visione organizzativo-logistica dei futuri istituti per una migliore articolazione e definizione degli ambiti progettuali all’interno del dipartimento. In questa fase di transizione, la presente nota si rivolge solo all’Istituto (IBBA) , così com’è costituito, e quindi da indicazioni sulle operazioni necessarie per aumentarne la potenzialità e l’efficienza anche in visione di un assetto organizzativo diverso dall’attuale. L’IBBA non ha al proprio interno complesse apparecchiature scientifiche ascrivibili a piattaforme tecnologiche nel campo della genomica funzionale, proteomica e metabolomica. Negli ultimi anni, prendendo atto di tale situazione, e cercando di trasformarla in opportunità, ci si è indirizzati, visti i finanziamenti disponibili, a perseguire una politica di oculata acquisizione di poche apparecchiature in grado di farci interagire in modo funzionale e sinergico con le piattaforme tecnologiche e con le grandi apparecchiature (NMR, confocali, microscopia elettronica) presenti in altri ambiti. In tali condizioni si è riusciti a mantenere una certa posizione di competitività. Ora è possibile pensare ad interventi organizzativi che possano migliorare tale situazione con particolare riferimento alle sedi operative esterne alla sede principale dell’Istituto. Allo scopo vi è la proposta, come previsto diversi anni fa, che una parte dell’IBBA, in pratica tutta la

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componente che opera nell’ambito della genetica molecolare e bioinformatica indirizzate alle produzioni di origine animale e alle problematiche fisiologico-molecolari della conservazione e vitalità del seme animale in produzione zootecnica, attualmente operante nei locali assegnati all’IBBA presso l’Area della Ricerca di Milano 4 (5 ricercatori), venga collocata, assieme ad altre istituzioni di ricerca pubbliche e private operanti in campo agronomico e zootecnico, in un Centro Ricerche che la Fondazione Parco Tecnologico Padano ha appena costruito e messo in funzione a Lodi. Il Centro di ricerca in oggetto è all’interno di un grande contesto che vedrà, a breve, la presenza della Facoltà di Veterinaria dell’Università di Milano, nonché un incubatore di imprese per nuove aziende del settore biotecnologico e uffici di Associazioni degli Allevatori. La possibile convenzione, già da tempo predisposta e all’esame della Direzione CNR prevede tra l’altro la concessione al CNR di circa 350mq di uffici e laboratori a titolo gratuito per un periodo di 10 anni, rinnovabili, a partire dalla data di insediamento effettivo di IBBA. Gli arredi tecnici per questi locali sono previsti a carico del CNR. In caso di accettazione della proposta, i ricercatori IBBA si troverebbero ad operare in un contesto omogeneo, di buona /ottima levatura scientifica, dotato di importanti attrezzature e strumentazioni per la genomica funzionale e la bioinformatica e ben inserito nei programmi regionali, nazionali ed europei per lo sviluppo della ricerca in genetica molecolare nel settore zootecnico. Questo scenario potrebbe configurare una situazione per l’IBBA di Milano (zona geografica) in cui la sede di Milano-via Corti (nuovo costruzione - di 2.400 mq) sita in Citta Studi, e quindi a stretto contatto con altri istituti CNR e con l’Università, ospita il nucleo più consistente dell’Istituto con indirizzo di biologia e biotecnologie vegetali, mentre la parte biotecnologica animale-zootecnico sarebbe proiettata a Lodi in un contesto che si preannuncia come ben orientato all’innovazione e al trasferimento della stessa. L’indirizzo in biologia e biotecnologie vegetali viene perseguito anche nelle altre sedi IBBA che sono a Pisa e Roma. A Pisa i pochi ricercatori (5 unità) e il personale tecnico ( 5 unità) sono dislocati in Area della Ricerca e presso l’Università (ex Centro Studi). Una possibile convenzione che potrebbe essere attivata con la Scuola Superiore di S. Anna che ha propri laboratori all’interno dell’Area della Ricerca potrebbe dare maggior enfasi e sinergia all’attività dei nostri ricercatori e quindi al polo di biologia vegetale che nell’area pisana è caratterizzato su aspetti dell’interazione piante-micorizze e sulle biotecnologie vegetali. Per la sede di Roma il problema è uno solo: disponibilità di una sede, quindi disponibilità di laboratori e uffici. Attualmente i 6 ricercatori e un amministrativo sono ospiti di un altro istituto CNR (IBAF) sito nell’area CNR di Montelibretti. Nei prossimi mesi dovrebbe essere attrezzato un pre-frabbricato che verrà dislocato all’interno dell’Area di Montelibretti. E’ sperabile che i fondi per l’acquisizione di banchi da laboratorio, cappe, camera fredda,strumentazione indispensabile…etc. siano sufficienti per far funzionare la struttura e quindi ad offrire un supporto adeguato all’attività dei ricercatori che rimane di notevole interesse.

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ISTITUTO DI BIOMETEOROLOGIA Missione

Ricerca, trasferimento tecnologico e formazione, curando il rapporto fra ricerca, territorio e sistema produttivo. Particolare attenzione viene rivolta all'impiego di metodologie innovative per la valutazione dell'impatto dei cambiamenti globali sull'agricoltura, sulle foreste e sull'uomo. Direttore: Prof Giampiero Maracchi Sede principale: Via Giovanni Caproni, 8 - 50145 Firenze FI Toscana Superficie immobile: XX mq Articolazione territoriale:

c/o Area della Ricerca di Bologna Via Gobetti, 101 - 40129 Bologna BO Emilia Romagna

Superficie immobile: XX mq c/o Via Funtana di Lu Colbu, 4/A - 7100 Sassari SS Sardegna Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.ibimet.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 57 0 20 5 82 2004 57 0 20 5 82 2005


Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Benincasa Fabrizio I Conese Claudio I Miglietta Francesco I Zipoli Gaetano I Baraldi Rita II Caggiati Paolo II Duce Pierpaolo II Genesio Lorenzo II Georgiadis Teodoro II Gioli Beniamino II Gozzini Bernardo II Massetti Luciano II Ortolani Alberto II Raschi Antonio II Rossi Federica II Sarti Danio II Arca Bachisio III Bacci Laura III Battista Piero III Bazzani Guido Maria III Bertazza Gianpaolo III Brandini Carlo III Calastrini Francesca III Camilli Francesca III Canu Annalisa III Cappugi Andrea III

liv.Cesaraccio Carla III Cherubini Lucia III Crisci Alfonso III De Filippis Tiziana Antonietta III De Vincenzi Matteo III Di Marco Stefano III Facini Osvaldo III Fibbi Luca III Grifoni Daniele III Gualtieri Giovanni III Guarnieri Paolo III Maselli Fabio III Mazza Alessandro III Melani Samantha III Meneguzzo Francesco III Pagliarino Elena III Pasi Francesco III Pasqui Massimiliano III Pellizzaro Grazia III Pieri Maurizio III Predieri Stefano III Rapparini Francesca III Rotondi Annalisa III Vaccari Francesco Primo III Ventura Andrea III Zanchi Bernardo III

liv.Lelli Maria Rosa IV Magli Massimiliano IV Vanelli Pietro IV Barazutti Maurizio V Falchi Maria Antonietta V Fasano Gianni V Gelli Carlo V Materassi Alessandro V Minghetti Robert V Pellegrino Laura V Sabatini Francesco V Tagliaferri Giacomo V Arca Angelo VI Giannozzi Elvira VI Lanini Giuseppe Mario VI Rapi Bernardo VI Trebbi Donatella VI Zaldei Alessandro VI Zara Pierpaolo VI Giannini Monica VII Liburdi Monica VII Mustacciu Barbara VII Romani Maurizio VII Valli Anna Rita VII Govoni Mafalda VIII

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2003 40 40 2004 43 1 44 2005

ASSEGNISTI

Silvia Baronti Elisabetta Bressan Danilo Marandola Chiara Screti

BORSISTI

Fabio Osti

COLLABORATORI PROFESSIONISTI

Mario Corrado Duce Matteo Mari Gian Luca Mordenti

DOTTORANDI

Tore Cocco Marco Dettori

Maurizio Laconi Alma Maccioni Michele Salis

PROFESSORI VISITATORI

Cristina Bignami Paolo De Angelis Donatella Spano Richard L. Snyder

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Risorse finanziarie



esterne totale



esercizi precedenti 2003 - 5.728 - 3.003 - 8.730 9.782 2004 3.698 4.847 3.329 2.974 7.027 7.821 8.935 2005




anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 969 - 2.755 - - 2004 637 753 3.329 2.596 1.125 4.474 2005







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esposizione


2003 16 - 22 - 6 2 - - 2004 114 21 5 - 32 14 27 7 2005


ARTICOLI ISI

Crisci A., Gozzini B., Meneguzzo F., Pagliara S., Maracchi G. Extreme Rainfall in a changing climate: regional analysis and hydrological implications in Tuscany HYDROLOGICAL PROCESSES

Costa M.J., M. Cervino, E. Cattani, F. Torricella, V. Levizzani, A.M. Silva and S. Melani Aerosol characterization and optical thickness retrievals using GOME and METEOSAT satellite data METEOROLOGY AND ATMOSPHERIC PHYSICS

Melani, S., E Cattani, V. Levizzani, M. Cervino, F. Torricella Radiative effects of simulated cirrus clouds on top of a deep convective storm in METEOSAT SECOND GENERATION SEVIRI channels METEOROLOGY AND ATMOSPHERIC PHYSICS

Chiesi M., Maselli F., Bindi M., Fibbi L., Bonora L., Raschi A., Tognetti R., Cermak J., Nadezhdina N. Calibration and application of FOREST-BGC in a Mediterranean area by use of conventional and remote sensing data ECOLOGICAL MODELLING

Melani S., Cattani E., Torricella F., Levizzani V. Characterization of plumes on top of a deep convective storm using AVHRR imagery and radiative transfer simulations ATMOSPHERIC RESEARCH

Maselli F., Romanelli S., Bottai L. and Zipoli G. Estimation of dynamic fire risk by the use of NOAA_AVHRR NDVI images REMOTE SENSING OF ENVIRONMENT

Dalu G.A., M. Baldi, R.A. Prielke, G. Leoncini Mesoscale nonhydrostatic and hydrostatic pressure gradient force-theory JOURNAL OF ATMOSPHERIC AND TERRESTRIAL PHYSICS

Nardino M. and Georgiadis T., Cloud type and cloud cover effects on the surface radiative balance at different Polar Sites THEORETICAL AND APPLIED CLIMATOLOGY

Rapparini F. Baraldi R. Facini O.

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Seasonal variation of monoterpene emission from Malus domestica and Prunus avium PHYTOCHEMISTRY

Argentini S., Viola A.P., Mastrantonio G., Maurizi A., Georgiadis T., Nardino M. Characteristics of the boundary layer at Ny-Alesund in Arctic during the ARTIST Field Experiment ANNALS OF GEOPHYSICS-ITALY

Beine H.J., Dominé F., Ianniello A., Nardino M., Allegrini I., Teinilä K., Hillamo R., Fluxes of nitrates between snow surfaces and the atmosphere in the European high Arctic. ATMOSPHERIC CHEMISTRY AND PHYSICS

Rossi F., Facini O., Rotondi A., Loreti S., Georgiadis T. 2001. Optical properties of juniper and lentisk canopies in a coastal Mediterranean macchia shrubland.

Rapparini F., Y.Y. Tam, J.D. Cohen and J.P. Slovin Indole-3-acetic acid metabolism in Lemna gibba undergoes dynamic changes in response to growth temperature PLANT PHYSIOLOGY

Rossi F., Facini O., Loreti S., Nardino M., Georgiadis T., Zinoni F. Meteorological and micrometeorological applications to frost monitoring in Northern Italy orchards. PHYSICS AND CHEMISTRY OF THE EARTH/DELTA

Anconelli S., Facini O., Marletto V., Pitacco A., Rossi F., Zinoni F. Micrometeorological test of microsprinklers for frost protection of fruit orchards PHYSICS AND CHEMISTRY OF THE EARTH/DELTA

Zinoni F., Antolini G., Campisi T., Marletto V, Rossi F. Characterization of Emilia Romagna in relation with late frost risk. PHYSICS AND CHEMISTRY OF THE EARTH/DELTA

Salcido A., A.T. Celada-Murillo, R. Villegas-Martínez, H. Salas-Oviedo, R. Sozzi, T.Georgiadis A Micrometeorological Data Base for the Mexico City Metropolitan Area NUOVO CIMENTO

Predieri S. Mutation induction and tissue culture in improving fruits PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE

Predieri S., Zimmerman R.H. Pear mutagenesis: in vitro treatment with gamma-rays and in field selection for productivity and fruit traits. EUPHYTICA

Rotondi A., Magli M., Ricciolini C., Baldoni L. Morphological and molecular analyses for the characterization of a group of Italian olive cultivars EUPHYTICA

Cesaraccio C. 1, Spano D. 2, Duce P. 1, Snyder R. L. 3

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An improved model for determining degree-day values from daily temperature data INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOMETEOROLOGY

Snyder R. L. 1, Spano D. 2, Duce P. 3, Cesaraccio C. 3 Temperature data for phenological models INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOMETEOROLOGY

Ventura F. 1, Faber B. A. 2, Bali K. 2, Snyder R. L. 2, Spano D. 3, Duce P. 4, Schulbach K. F. 2 Model for estimating evaporation and transpiration from row crops JOURNAL OF IRRIGATION AND DRAINAGE ENGINEERING-ASCE

Reichstein M, Tenhunen J, Roupsard O, Ourcival JM, Rambal S, Miglietta F, Peressotti A, Pecchiari M, Tirone G, Valentini R Inverse modeling of seasonal drought effects on canopy CO2/H2O exchange in three Mediterranean ecosystems JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH-ATMOSPHERES

Marchi S, Tognetti R, Vaccari FP, Lanini M, Kaligaric M, Miglietta F, Raschi A Physiological and morphological responses of grassland species to elevated atmospheric CO2 concentrations in FACE-systems and natural CO2 springs FUNCTIONAL PLANT BIOLOGY

Reichstein M, Rey A, Freibauer A, Tenhunen J, Valentini R, Banza J, Casals P, Cheng YF, Grunzweig JM, Irvine J, Joffre R, Law BE, Loustau D, Miglietta F, Oechel W, Ourcival JM, Pereira JS, Peressotti A, Ponti F, Qi Y, Rambal S, Rayment M, Romanya J, Rossi Modeling temporal and large-scale spatial variability of soil respiration from soil water availability, temperature and vegetation productivity indices GLOBAL BIOGEOCHEMICAL CYCLES

Calfapietra C, Gielen B, Sabatti M, De Angelis P, Miglietta F, Scarascia-Mugnozza G, Ceulemans R Do above-ground growth dynamics of poplar change with time under CO2 enrichment? NEW PHYTOLOGIST

Gielen B, Liberloo M, Bogaert J, Calfapietra C, De Angelis P, Miglietta F, Scarascia-Mugnozza G, Ceulemans R Three years of free-air CO2 enrichment (POPFACE) only slightly affect profiles of light and leaf characteristics in closed canopies of Populus GLOBAL CHANGE BIOLOGY

Taylor G, Tricker PJ, Zhang FZ, Alston VJ, Miglietta F, Kuzminsky E Spatial and temporal effects of free-air CO2 enrichment (POPFACE) on leaf growth, cell expansion, and cell production in a closed canopy of poplar PLANT PHYSIOLOGY

Reichstein M, Tenhunen JD, Roupsard O, Ourcival JM, Rambal S, Miglietta F, Peressotti A, Pecchiari M, Tirone G, Valentini R Severe drought effects on ecosystem CO2 and H2O fluxes at three Mediterranean evergreen sites: revision of current hypotheses? GLOBAL CHANGE BIOLOGY

Miglietta F, Peressotti A, Vaccari FP, Zaldei A, deAngelis P, Scarascia-Mugnozza G

52


Free-air CO2 enrichment (FACE) of a poplar plantation: the POPFACE fumigation system NEW PHYTOLOGIST

Ferris R, Sabatti M, Miglietta F, Mills RF, Taylor G Leaf area is stimulated in Populus by free air CO2 enrichment (POPFACE), through increased cell expansion and production PLANT CELL AND ENVIRONMENT

Bindi M, Fibbi L, Lanini M, Miglietta F Free Air CO2 Enrichment (FACE) of grapevine (Vitis vinifera L.): I. Development and testing of the system for CO2 enrichment EUROPEAN JOURNAL OF AGRONOMY

Bindi M, Fibbi L, Miglietta F Free Air CO2 Enrichment (FACE) of grapevine (Vitis vinifera L.): II. Growth and quality of grape and wine in response to elevated CO2 concentrations EUROPEAN JOURNAL OF AGRONOMY

Miglietta F, Hoosbeek MR, Foot J, Gigon F, Hassinen A, Heijmans M, Peressotti A, Saarinen T, van Breemen N, Wallen B Spatial and temporal performance of the MiniFACE (Free Air CO2 Enrichment) system on bog ecosystems in northern and central Europe ENVIRONMENTAL MONITORING AND ASSESSMENT

Tognetti R, Raschi A, Jones MB Seasonal changes in tissue elasticity and water transport efficiency in three co-occurring Mediterranean shrubs under natural long-term CO2 enrichment FUNCTIONAL PLANT BIOLOGY

Tognetti R, Sebastiani L, Vitagliano C, Raschi A, Minnocci A Responses of two olive tree (Olea europaea L.) cultivars to elevated CO2 concentration in the field PHOTOSYNTHETICA

di Toppi LS, Marabottini R, Badiani M, Raschi A Antioxidant status in herbaceous plants growing under elevated CO2 in mini-FACE rings JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY

ARTICOLI NON ISI

Di Marco S., Osti F., Mazzullo A., Cesari A. How iron could be involved in esca fungi development Phytopathologia Mediterranea

G. FASANO, A. MATERASSI Progetto e realizzazione di uno strumento per la misura dell'assorbimento radiativo dell'acqua marina:SuMaRad Rivista di Ingegneria Agraria

G. FASANO, A. MATERASSI

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Progetto e realizzazione di uno strumento per la misura dell'assorbimento radiativo dell'acqua marina:SuMaRad Rivista di Ingegneria Agraria

Rapparini F., Predieri S. Pear Fruit Volatiles Horticultural Reviews

Bacci L., Morabito M. Urban heat island of Florence (Italy) and city park cool island: their effects on human comfort. Bollettino Geofisico

Spano D. 1, Cesaraccio C. 2, Duce P. 2, Snyder R. L. 3 An improved model for estimating degree days Acta Horticulturae

Loreto F., Centritto M., Baraldi R., Rapparini F., and S. Liu Emission of isoprenoids from natural vegetation in the Beijing region (Northern China). Plant Biosystems

F. Rapparini and A. Rotondi. Volatile Compounds Analysis in Virgin Oil by Dynamic Headspace Method: Preliminary Results Acta Horticolturae

Vaccari Fp, Bettarini I, Giuntoli A, Miglietta F, Raschi A Mediterranean grassland Community under elevated CO2: observations from a CO2 spring Journal of Mediterranean Ecology

Rotondi A., Lercker G. Influence of olive ripening degree on the composition and stability of olive oil Acta Horticulturae

LIBRI

Caggiati P., Canavari M., Easter K. W. (editors) Economic Studies on Food, Agriculture and the Environment Kluwer Academic Publishers, New York 2002.

Rossi F., Duce P., Spano D. Advanced Short Course on Agricultural, Forest and Micrometeorology. CNR Dip. Attiv. Internaz. Serv. V, 2002.

Tang M., Deane G.C., Briggs D.J., Conese C., Benvenuti M., Petrakis M. Mapping night time light emission in the E.U. using satellite observed visible-near infrared emissions as a policy tool: the MANTLE Project in Geoinformation for European-wide Integration, Millpress , Rotterdam 2003.

Barazutti M., Kajfez Bogataj L., Maracchi G., Orlandini S., Rossi F.

54


Irrigation and pest and disease models: evaluation in different environments and web-based applications EC, Brussels 2003.

F.Rossi, S.Orlandini, A .Dalla Marta, M.Magli, G.Maracchi PLASMO Project: an Internet application in Irrigation and pest and disease models: evaluation in different environments and web-based applications, EC, Brussels 2203.

F.ventura, E.Ferretti, F.Zinoni, V. Marletto, M.van Soetendal, F.Rossi SWAP asnd CRITERIA irrigation models tested in Northern Italy in Irrigation and pest and disease models: evaluation in different environments and web-based applications, EC, Brussels 2003.

F.ventura, E.Ferretti, F.Zinoni, V. Marletto, M.van Soetendal, F.Rossi SWAP asnd CRITERIA irrigation models tested in Northern Italy in Irrigation and pest and disease models: evaluation in different environments and web-based applications, EC, Brussels 2003.

F.Rossi Orchard-atmosphere exchange processes and sustainable management. in Invited contribution "Crop Management and Post-harvest Handling of Horticultural Products, Science Publisher (SP), Helsinki 2003.

Cacace, Caneva, Gallo, Georgiadis, Maggi, Valenti Measurements of environmental Physical Parameters in Cultural Heritage and Aerobiology, Kluwer Academic Publisher, Doordrecht 2003.

Sozzi, Georgiadis, Valentini Introduzione alla Turbolenza Atmosferica: concetti, stime, misure Pitagora, Bologna 2002.

. Rotondi A., Rapparini F., Bertazza G., Magli M. La qualità dell’olio di oliva dei colli riminesi: la cultivar Correggiolo La Mandragora, Bologna 2001.

18. Rotondi A., Cristoferi G., Rapparini F., Bertazza G., Magli M. Tracciabilità e caratterizzazione degli oli extravergini di oliva della Romagna La Mandragora, Bologna 2003.

Rossi F. 1, Duce P. 2, Spano D. 3 Advanced Short Course on Agricultural, Forest and Micrometeorology CNR Dip. per le Attività Internazionali, Serv. V, Roma 2002.

Spano D. 1, Snyder R. L. 2, Cesaraccio C. 3 Mediterranean Climates in Phenology: An Integrative Environmental Science, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht , The Netherlands 2003.

Snyder R. L. 1, Spano D. 2, Duce P. 3

55


Weather Station Siting in Phenology: An Integrative Environmental Science, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, The Netherlands 2003.

Baraldi R., Rapparini F., Loreto F., Pietrini F., Di Marco G. Il Progetto PianosaLab : ricerche sugli ecosistemi terrestri dell'area mediterranea. Editrice Universitaria Udinese, Udine 2001.

ARTICOLI IN ATTI DI CONV.

Colom MR. Vaccari F. Baraldi R. Cotrufo F. D'Acqui L. Struttura e funzionalità degli ecosistemi dell'isola di Pianosa "Ecologia quantitativa: metodi sperimentali, modelli teorici, applicazioni", Como 2003.

P. BATTISTA, G. FASANO, A. MATERASSI On the reliability of instruments for environmental monitoring: some practical considerations "13th European Symposium on Realibility of Electron Devices, Failure, Physics and Analysis", Rimini 2002.

Baraldi R. Rapparini F. Miglietta F. Sabatini F. Biogenic hydrocarbon fluxes from a Mediterranean macchia ecosystem "Mediterraneo e Italia nel cambiamento globale:un ponte fra scienza e società", Paestum (SA) 2002.

Loreto F., Fischbach RJ, Schnitzler JP, Ciccioli P., Calfapietra C., Baraldi R., Rapparini F. Isoprenoid emission by forest trees grown at elevated CO2 concentrations "Proceedings of the International Conference “Forest Research: a Challenge for an Integrated European Approach", Thessaloniki, Grecia 2003.

Galovic V., Navalusic J., Baraldi R., Ludwing-Muller J. Quantification of indole-3-acetic acid in hops cultivars by GC-MS analysis "INTERNATIONAL HOP GROWERS CONVENTION I.H.G.C.", CANTERBURY (Inghilterra) 2003.

M. Benvenuti, E. Chuvieco, C. Conese A new double-step satellite image processing system for forest fire mapping on the Italian territory "3rd International Workshop on Remote Sensing and GIS Application to Forest Fire Management", Parigi 2001.

Meneguzzo, F., Menduni, G., Maracchi, G.,Zipoli, G., Gozzini, B., Grifoni, D., Messeri, G.,Pasqui, M., Rossi, M., and C.J. Tremback ): Explicit forecasting of precipitation: sensitivity of model RAMS to surface features, microphysics, convection, resolution ": Mediterranean Storms. 3rd Plinius Conference 2001", Siena 2001.

Soderman, Meneguzzo, Gozzini, Grifoni, Messeri, Rossi, Montagnani, Pasqui, Orlandi, Ortolani, Todini, Menduni, and Levizzani Very high resolution precipitation forecasting on low cost high performance computer systems in support of hydrological modeling "Annual Meeting of the American Meteorological Society", Long Beach 2003.

RAPPORTI

Busillo C., Calastrini F., Gulatieri G.

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Determinazione di una metodologia per la caratterizzazione meteoclimatica di un sito. Applicazione all'area di Pisa

Meneguzzo F., Crisci A., de Chiara F., Maracchi G., Marrese F., Pasqui M., Piani F. Vezzosi T. Rianalisi e previsioni del clima sul bacino del fiume Arno

Corongiu M. Le specifiche comuni per la realizzazione di DataBase Topografici di interesse generale. La yterza dimensione

Corongiu M. Le specifiche comuni per la realizzazione di DataBase Topografici di interesse generale. La rappresentazione cortografica

Corongiu M. Le specifiche comuni per la realizzazione di DataBase Topografici di interesse generale. La viabilità, la mobilità i trasporti

Corongiu M. Le specifiche comuni per la realizzazione di DataBase Topografici di interesse generale. La vegetazione, l'idrografia le opere di regimazione e difesa

Antonini A. Definizione e implementazione prototipale di un sistema modulare per la produzione quasi-real-time di campi di precipitazione da dati satellitari multisensore (METESAT+SSM/I) sul territorio nazionale

Calastrini F., Gualtieri G. Studio meteoclimatico e valutazione d'impatto per emissioni derivanti da centrali geotermiche nell'aera dell'AMIATA. Prima parte: studio meteoclimatico

Calastrini, Gualtieri Studio meteoclimatico e valutazione d'impatto per emissioni derivanti da centrali geotermiche nell'aera dell'AMIATA. Seconda parte: studio diffusionale

Corongiu M. Realizzazione di un interfaccia tra i dati dell'archivio RAMS e il preprocessore meteo CALMET finalizzata all'applicazione dei modelli diffusioanle CALPUFF e CALGRID

Busillo C., Calastrini F., Gualtieri G., Zipoli G. Configurazione ed applicazione di un sistema di modelli meteodiffusionali nell'area di Osmannoro

Calastrini F., Gualtieri G. Simulazione della produzione e dispersione di alcuni inquinanti organici in ambiente urbano di particolare valore storico-culturale

D. Sarti, A. Truzzi La coltivazione della barbabietola produce ancora reddito

D. Sarti, G. Toffanin

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Relazione risultati economici aziende Veneto Agricoltura - anno 2002. Confronto con un significativo campione di aziende agricole di Veneto ed Emilia-Romagna

AA.VV., editor Claudio Conese Invaso di Montedoglio: Studio di fattibilità per la valutazione di impatto ambientale. voll. I° e II°

Conese C., Rapi B., Bonora L. Water Framework Directive Short Term Action "Land Cover Change and Water Quality", Demonstration Project-ESA ESRIN

AA.VV. editor Claudio Conese Mapping Night-time Light Emission in the EU using satellite observed visible-near infrared emission as a policy tool - Project E.U. MANTLE

C. Busillo, F. Calastrini e G. Gualtieri Studio climatologico nel Comune di Lucca

C. Busillo, F. Calastrini e G. Gulatieri Studio climatologico nella provincia di Prato

C. Busillo Metodologia per la ricostruzione del campo di vento a scala locale nella valle del Serchio

Calastrini, Gualtieri Realizzazione di un interfaccia fra i dati dell'archivio RAMS e il preprocessore meteo CALMET finalizzato all'applicazione dei modelli diffusionali CALPUFF e CALGRID

calastrini, Gualtieri Studio anemologico nell'area di Guasticce

calastrini, Gualtieri Studio anemologico nel comune di Greve in Chianti


F.Miglietta Mediterranean Ecosystems under increasing Drought - MIND

F. BENINCASA, G.FASANO, A. MATERASSI Progettazione e realizzazione di un LISIMETRO ELETTRONICO A PESATA

G. FASANO, A. MATERASSI SUMARAD: strumento per la misura dell'assorbimento radiativo dell'acqua marina


F.Miglietta, A.Zaldei, A.Simonti, S.Allegri HERMES: ricestramettitore satellitare per il monitoraggio della fauna marina

A.Zaldei, P.Battista

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Minimeteo 1 - SAT

F.Miglietta, C.Pasqualetti, A.Zaldei, A.Malpezzi, B.Gioli GRADFACE: a new system to expose vegetation to a gradient of CO2 concentrations

F.Miglietta, A.Zaldei, A.Peressotti SOYFACE: a dedicated FACE design for soybean and corn

F.Miglietta, FP Vaccari, B.Gioli, A.Zaldei, N.Pasotti, A.Matese DELPHI - Un sistema automatico per la previsione dei raccolti e della qualità delle produzioni nazionali di Frumento duro

F.Miglietta, A.Zaldei, A.Malpezzi, A.Peressotti TAZFACE: a MiniFACE system for Tasmanian tall grass prairies

F.Miglietta, F.Rossi, T.Georgiadis, F.Magnani, A.Zaldei, O.Facini, A.Malpezzi Rete IBIMET di stazioni di misura dei flussi biogenici

F.Miglietta, B.Gioli, A.Zaldei Sky Arrow ERA (Environmental Research Aircraft)

C.Conese, B.Rapi, F.Del Gaia, L.Bonora, P.Meazzini Invaso di Montedoglio: Studio di fattibilità per la valutazione di impatto ambientale

Conese C., Rapi B., Bonora L. 16. CECINA -WATER FRAMEWORK DIRECTIVE SHORT TERM ACTION- “LAND COVER CHANGE AND WATER QUALITY

Fibbi L., Viti M. e Gozzini B. Data Base Meteorologico

Gozzini B., Pasqui M., Calastrini F., Messeri G., Pasi F. et al. Archivio RAMS

M. Pasqui, B. Gozzini, G. Messeri, et al. BELLEROFONTE. Un cluster LINUX di pc per il calcolo parallelo

Grifoni D., Rossi M., Messeri G., Pasi F., Tei C., Gozzini B., Carreras G. UV-Forecast

Ortolani A., Orlandi A., A. Antonini, S. Melani, RAIN Una catena operativa per la stima della pioggia

Grifoni D., Sabatini F., Zipoli G. Rete stazioni UV

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Altri Ministeri: Ministero del Welfare; Ministero delle Politiche Agricole e Forestali

Consorzi: Consorzi per lo Sviluppo dei Distretti Industriali per le Osservazioni della Terra

Enti pubblici: Comune di Sant'Agostino (FE); Regione Emilia Romagna; Regione Toscana; Azienda Regionale per i settori Agricolo, Forestale e Agro-Alimentare "Veneto Agricoltura"; Ufficio Centrale di Ecologia Agraria, MIPAF, Roma; ARPAT; ARSIA, Firenze; ARPA-SMR Servizio Meteorologico Emilia Romagna; Provincie di Firenze, Livorno, Lucca, Grosseto; Autorità di Bacino del fiume ARNO; ARPA-SMR , Servizio Agrometeorologico Regionale della Sardegna; Ente Foreste della Sardegna; Food and Agriculture Organization of the United Nations

EPR italiane: CNR; ENEA; INGV; ISAC-CNR, Bologna e Roma; IFAC-CNR, Firenze; Istituto di Genetica Vegetale, sezione di Firenze; Istituto per la Genesi e l'Ecologia del Suolo, CNR; Istituto di Genetica Vegetale, CNR

EPR straniere: European Science Foundation; CEFE-CNRS-France; Max-Planck Biogeochemistry-Germany; Max-Planck Chemistry-Mainz; CNRS-LSIIT-France; CNRS-CEA-France; RISOE National Laboratory Plant Research Department; Agrohydrology Research and Training Center

Privati: Centro Interporvinciale di Sperimentazione Agroambientale "Mario Neri"; L’Altra Romagna Srl; Azienda Agricola "Vanessa Beltrami"; CISA "Mario Neri" e Brucker Strumentazione; Iniziative Industriali SpA; VITROCISET SpA; Barilla Alimentare SpA; Corial-Barilla; Iniziative Industriali Italiane; CPE-Elettronica; Società Produttori Sementi; PPSystem-UK; San Diego State-California; Bangor-Wales-UK; Bayreuth-Germany; USDA-ARS-USA; NERC-Uk; Alterra-The Netherlands; CEAM-Spain; NPL-India; Centro Sperimentale per il Vivaismo (CeSpeVi), Pistoia; Centro Interdipartimentale di Bioclimatologia, università di Firenze; FederCoPesca; Water Conservation Lab; USDA-ARS, USA; Industrie dolciarie Ferrero; Società Autostrade; AGIP; Gruppo Industriale VAPE; Datamat; Trenitalia; Vape; Assicurazioni Generali; Finmeccanica; Officine Galileo; Industrie ottiche Barberini; Fly-By srl Livorno; RAI; Center for Ecology and Hydrology; Center for Ecological Research and Forestry; Hamamatsu Photonics Italia; Thermitalia Srl; National Instruments Italy Srl

UE: PQ Ricerca UE: FLAME - studio della diffusione degli incendi boschivi e procedure di recupero delle aree percorse; PQ Ricerca UE: NITROEUROPE

Università: Università di Bologna; Università della Tuscia; Univ.Udine; Seconda Università di Napoli; Università di Pisa; Università di Potenza; Berkeley-California; Dipartimento produzioni vegetali (DiProVe) UNI-MI; Dipartimento di Scienze Agronomiche e Gestione del Territorio Agroforestale (DISAT) UNI-FI; Colorado State University, Fort Collins, USA; Università di Sassari - Dipartimento di Economia e Sistemi Arborei; Dipartimento di Scienze dell'Ambiente Forestale e delle sue Risorse; Department of Land, Air and Water Resources, University of California, Davis, USA; Università di Sassari - Nucleo Ricerca Desertificazione; Università di Sassari - Dipartimento di Ingegneria del Territorio; Università di Trento - Dipartimento di Ingegneria dei Materiali; Università di Pisa - Dipartimento di Scienze dell'Uomo e della Terra

60



CREDITORI E DEBITORI DIVERSI • Elaborazione dei documenti contabili volta alla redazione del bilancio Aziende Agricole- anni

2002-03

ASSICURAZIONI GENERALI S.P.A. - AG. 546 • PROG. ASSICURAZIONI GENERALI 2003 (PROT.N. 214 DEL 07/03/03)

REGIONE EMILIA ROMAGNA • Progetto "Il miglioramento della qualità della produzione dell'olio di oliva (Reg CE 528/99)

ciglo produttivo 2003/2004": conv. Regione Emilia Romagna

REGIONE TOSCANA • PROG. SIT DESIDERI REGIONE TOSCANA

PROVINCIA AUTONOMA DI TRENTO • Progetto "Analisi e ricerche per il sistema agri-industriale": convenzione PAT

CANTINA SOCIALE COOPERATIVA • Conferimento d'incarico per l'effettuazione di trattamenti su piante di oliva

INIZIATIVE INDUSTRIALI ITALIANE • PROG. INIZIATIVE INDUSTRIALI PER DIREZIONE REPARTO RAWAS

FERRERO S.P.A. • PROG. FERRERO 2002/2003 RATEO 2003 A SALDO PER previsioni meteorologiche • PROG. FERRERO ANNO 2003 PER CONSULENZA IN AMBITO METEOROLOGICO

MAGGIO-AGOSTO

CE.S.I.A. • PROG. PAFAGE ANNO 2003-2004 CONTRIBUTO DA PARTE DEL CESIA ACCADEMIA DEI

GEOGOFILI

REGIONE TOSCANA - Giunta Regionale • PROG. ARIA CON REGIONE TOSCANA 2003 (PROT.N. 212 DEL 7/03/03) • PROG. PM10 CON REGIONE TOSCANA ATTIVITA' COMMERCIALE • PROG. ARIA 2 CON REGIONE TOSCANA ANNO 2004 • PROG. PM10 CON REGIONE TOSCANA ATTIVITA' COMMERCIALE RATEO '05 • PROG. ARIA 2 CON REGIONE TOSCANA ANNO 05 • CONVENZIONE PER "LA REALIZZAZIONE DELL'OSSERVATORIO REGIONALE KYOTO"

DURATA FINO SETT. '06

PROVINCIA DI FIRENZE • PROG. PROVINCIA DI FIRENZE PER REALIZZAZIONE STUDIO CLIMATOLOGICO E

MODELLISTICA DIFFUSIONALE PROT. N. 395/03

61


CO.RI.AL. CONSORZIO RICERCHE ALIMENTARI SOCIETA CONSORTILE P • PROG. CORIAL FORMAZIONE DI PERSONALE QUALIFICATO ANNO 2004 • PROG. CORIAL CONTO TERZI "MODELLIZZAZIONE DI UN SISTEMA INTEGRATO PER

LA GESTIONE DELLA SICUREZZA ALIMENTARE DELLA FILIERA DEL FRUMENTO (SINSIAF) 2003 - 2005

CRPV - CENTRO RICERCHE PRODUZIONI VEGETALI • Studi su nuove fitopatologia dell'actinidia: carie del legno e ipertrofia del tronco. • II° anno convenzione con CRPV: progetto "Studi su nuove fitopatie dell'actinidia: carie del

legno e ipertrofia del tronco".

VITROCISET SPA • PROG. SESTANTE CONTRATTO DEL TOTALE DI 18.900 EURO IVA INCLUSA- DURATA 6

MESI STIPULATO IL 22/04/2004

A.R.S.I.A. • PROG. ARSIA ANNO 2004

TELESPAZIO S.P.A. • TELESPAZIO-CONTRATTO DI COLLABORAZIONE SCIENTIFICA NELL'AMBITO DEL

PROGETTO AGRIT _ 2004 • CONVENZIONE "ASI OIL SPILL" DURATA: 29/10/2004 - 30/11/2004 • TELESPAZIO-CONTRATTO DI COLLABORAZIONE SCIENTIFICA NELL'AMBITO DEL

PROGETTO AGRIT _ 2004 RATEO A SALDO

UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DELLA TUSCIA - Dipartimento di Ecologia e Sviluppo Economico Sostenibile

• PROG. CHIOTTO ANNO 2004

UNITUS - DIP. DI SCIENZE DELL'AMBIENTE FORESTALE E DELLE SUE RISORSE • PROG. TACOS CON UNIV TUSCIA 2003 (PROT.N. 215 DEL 07/03/03) • PROG CHIOTTO 2003 CON UNIVERSITA' DELLA TUSCIA DISAFRI • PROG. TACOS ANNO 2004

DIP.TO BIOLOGIA ANIMALE E GENETICA "LEO PARDI" - U.A. 20300.52400 CIA 6 • Progetto PROMAR: convenzione con Uni.Firenze Dip. Biologia Animale e Genetica.

DIPARTIMENTO DI BIOTECNOLOGIE AGRARIE • Contratto ARSIA-ATS "Il mal d'esca della vite" durata 4 anni dal 1/11/04

MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI (MIPAF) • CLIMAGRI 2° ANNO ATT.

MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • CLIMAGRI COMUNE III ANNO ATTIVITA' FIRENZE E SASSARI • PROG. CLIMAGRI II ANNO DI ATTIVITA' ANNO 2003 SALDO (TOTALE PROG. EURO

43461) • PROG. CLIMAGRI LINEA COMUNE ACC. PER SASSARI III ANNO DI ATTIVITA' A SALDO • PROG. CLIMAGRI LINEA COMUNE ACC. PER FIRENZE A SALDO CONTRATTO

62


REGIONE EMILIA ROMAGNA • Programma regionale per il miglioramento della qualità della produzione d'olio di oliva-Ciclo

produttivo 2002/2003.

MINISTERO PUBBLICA ISTRUZIONE E RICERCA • PROG. SCUOLE PER L'ACQUA CONTRIBUTO PROT.N393/03 • CONTRIBUTO MIUR PROGETTO "METEOSCHOOL: METEOROLOGIA E CLIMATOLOGIA

PER LE SCUOLE" LETTERA PROT. 2307 DEL 22/11/2004

MINISTERO AFFARI ESTERI - Dir.Generale per la promozione e la cooperazione culturale Ufficio V • PROF. SANTA FE' DA MINISTERO DEGLI ESTERI

MINISTERO DEL WELFARE • PROG. ORIENTAMENTO CON IL MINISTERO DEL LAVORO 2003-2006 • PROG. ORIENTAMENTO CON IL MINISTERO DEL LAVORO 2003-2006 • PROG. ORIENTAMENTO CON IL MINISTERO DEL LAVORO 2003-2006 QUOTA 2005

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca • CO(OT) - Sviluppo dei distretti industriali per le osservazioni della Terra • COS(OT) - Sviluppo dei distretti industriali per le Osservazioni della Terra - P.O.N. prot. 13018 • Incasso III Tranche progetto COS(OT) - Sviluppo dei distretti industriali per le Osservazioni

della Terra • INCASSO I° TRANCHE PROGETTO INCENDI "Sviluppo di un sistema integrato per il

monitoraggio del degrado ambientale connesso agli incendi boschivi in aree mediterranee"

ACCADEMIA NAZIONALE DELLE SCIENZE DETTA DEI XL • ACCADEMIA DEI 40 OSSSERVATORIO CENTRO MULTIDISCIPLINARE PER L'AMBIENTE

COSTIERO MEDITERRANEO

FAO • PROG. ERITREA FAO 2003 (PROT. N. 213 DEL 7/03/03) • CONVENZIONE FAO - CNR IBIMET DURATA: 18/10/2004 - 07/12/2004

ECONOMIA E SISTEMI ARBOREI • FUOCHI: Sviluppo, verifica e messa apunto operativa di un supporto decisionale e di

valutazione del rischio di incendi boschivi - ULTIMA TRANCHE

EUROPEAN COMMUNITY • PROGETTO GREENGRASS UNIONE EUROPEA 2003 (PROT.N. 209 DEL 7/03/03) variato

prot.n. 437 • PROG. SPREAD UNIONE EUROPEA (PROT.N. 216 DEL 7/03/03) aumentato in data

16/05/03 • PROG. EUROFACE UNIONE EUROPEA (PROT.N .230 DEL 07/03/2003) • PROG BACCHUS UNIONE EUROPEA 2003 (PROT.N. 218 DEL 7/03/03) • PROG. FIRELAB UNIONE EUROPEA (PROT. N. 220 DEL 7/03/03) • PROG. MIND CO UNIONE EUROPEA (LINEA MIND PROT.N. 221 DEL 7/03/03) • PROGETTO KARNAL BUNT UNIONE EUROPEA RATEO 2003 (PROT.N. 208 DEL 7/03/03) • PROGETTO RECAB CON UNIONE EUROPEA RATEO 2003 (PROT.N. 210 DEL 7/03/03) • PROG. ECORISK CON UE • PROG. GREENGRASS UNIONE EUROPEA ANNO 2004

63


• PROG. MIND EVK2CT200200158 RATEO 2004 • ACC. SALDO INCASSO PROG. CAMELEO • PROG. BACCHUS RATEO 2004 • PROG. SPREAD UNIONE EUROPEA (PROT. N° 591/04 DEL 12/10/2004) • PROG. ECORISK CON UE RATEO 2005 • PROG. EUROFACE RATEO 2004 • PROG. CARBOEUROPE CON UE VI PROGRAMMA QUADRO ATTIVITA' COMUNE CON

ISAFOM E ISAC ROMA DURATA 01/04/2004-31/12/2008

ARPA SERVIZIO IDROMETEOROLOGICO REGIONALE (ARPA - SIM) • Progetto DISGELO, CLIMAGRI, Produzione Integrata

CESPEVI - CENTRO SPERIMENTALE PER IL VIVAISMO • PROGETTO CESPEVI 2003

AVSI ASSOCIAZIONE VOLONTARI PER IL SERVIZIO INTERNAZIONALE • PROG. ARGENTINA CON AVSI • PROG. ARGENTINA CON AVSI ANNO 2004

ARPA - Emilia Romagna • Esecuzione delle attività previste dai progetti dell'Area Agrometeorologia e Territorio nei

settori relativi allo studio delle interazioni tra cambiamenti climatici e agricoltura e alla stima dell'effetto delle avversità atmosferiche sulle produzioni agricole. (ARPA-SIM)

EUMETSAT - ACCOUNTING OFFICER • PROG. LANDSAF CON EUMETSAT RATEO 2003 • PROG. LAND SAF CON EUMETSAT SALDO 2004

TERME S. GIOVANNI SRL • PROG. TERME DI RAPOLANO PER MAT. DI DIVULGAZIONE SCIENTIFICA

ESPERIMENTI SVOLTI AL BOSSOLETO

AGMIN-ITALY SRL • PROG. AGMIN CONTO TERZI PER FORMAZIONE E VALUTAZIONE PROGETTI 2003

Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia • PROG. COOPERAZIONE ITALIA USA SU SCIENZA TECNOLOGIA DEI CAMBIAMENTI

CLIMATICI • PROG. COOPERAZIONE ITALIA USA SU SCIENZA TECNOLOGIA DEI CAMBIAMENTI

CLIMATICI • PROG. COOPERAZIONE ITALIA USA SU SCIENZA TECNOLOGIA DEI CAMBIAMENTI

CLIMATICI

CIBA SPECIALTY CHEMICALS S.p.A. • "Applicazioni fotobiologiche alla produttività vegetale" CIBA 1/03/05-31/10/05

REGIONE TOSCANA-DIREZIONE GENERALE DELLE POLITICHE TERRITORIALI E AMBIENTALI-SERVIZIO IDROLOGICO REGIONALE

• PROG. PROTEZIONE CIVILE ANNO 2003 SERVIZIO DI PREVISIONI METEOROLOGICHE AI FINE DI PROT. CIVILE

64


• PROG. CENTRO FUNZIONALE PROTEZIONE CIVILE ANNO 2004 • FORNITURA ATTIVITA' DI SERVIZIO METEO FINALIZZATE AL SUPPORTO DEL CENTRO

FUNZIONALE E DEL SISTEMA REGIONALE DELLA PROTEZIONE CIVILE ANNO 2005

FLYBY S.R.L. • CONTRATTO DI CONSULENZA SCIENTIFICA NELL'AMBITO DEL PROGETTO TELEUV

OMM-ORGANISATION METEOROLOGIQUE MONDIALE • ORGANIZZAZIONE CORSO RMTC 2004 PER OMM-ORGANIZZAZIONE METEOROLOGICA

MONDIALE

UNCCD SEGRETARIAT OF THE CONVENTION TO COMBAT DESERTIFICATION • ORGANIZZAZIONE CORSO RMTC 2003 PER UNCCD ACC 667/03 • CONTRATTO CON UNCCD PER PROGRAMMA MTP RATEO 2005

Centro Interprovinciale di Sperimentazione Agroambientale "Mario Neri" soc.coop. • La qualità del melo e del pero attraverso l'analisi sensoriale - conllaborazione con il "Mario

Neri" • Conferimento incarico collab. progetto "La qualità del melo e del pero attraverso l'analisi

sensoriale"-2004 (CISA - Mario Neri) • Incarico di collaborazione "La qualità del melo e del pero attraverso l'analisi sensoriale" CISA

M. NERI anno 2005

REGIONE TOSCANA-AREA POLITICHE REGIONALI DELL'INNOVAZIONE E DELLA RICERCA • PROGETTO CRES GROSSETO REGIONE TOSCANA 2003 (PROT.N. 206 DEL 7/03/03) • PROG. LAMMA REGIONE TOSCANA 2002-2003 (PROT.N. 195 DEL 03/03/03) • PROG. DESERNET INTERREG IIIB CON REGIONE TOSCANA (prot. 679/03) • PROG. HYDROPTIMET INTERREG IIIB CON REGIONE TOSCANA (PROT. 680/03) • PROG. DESERTNET CON REGIONE TOSCANA • PROG. HYDROPTIMET ANNO 2004 • LAMMA COMMA MED CONTRIBUTO CON REGIONE TOSCANA 2.8.2. • PROG. DESERTNET CON REGIONE TOSCANA NUOVO ANNO 2004 • LAMMA CRES CONTRIBUTO CON REGIONE TOSCANA 2.8.2. • LAMMA SESTO CONTRIBUTO CON REGIONE TOSCANA 2.8.2.

FONDAZIONE CASSA DI RISPARMIO DI LUCCA • FONDAZIONE CASSA DI RISPARMIO DI LUCCA CONTRIBUTO PER ATTIVAZIONE ADR

ESCOSOLAR SPA • PROG. ESCOSOLAR PER CLIMA EOLICO

REGIONE TOSCANA - DIR. GEN. DELLE POLITICHE TERRITORIALI E AMBIENTALI-AREA TUTEL DELLE ACQUE INTERNE E COSTIERE

• PROG. ACQUA CON R.T. RATEO 2003 (PROT.N. 211 DEL 7/03/03)

USDA ARS REE ADMINISTRATIVE AND FINANCIAL MANAGEMENT • PROG. COLORADO CON USDA

ARPA LAZIO • Progetto "POLVERI" sul territorio della Regione Lazio. (ARPALAZIO)

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EFOP S.R.L. UNIPERSONALE • RATEO ACCERTAMENTO EFOP (16/06/2004- 16/04/2005)

L'ALTRA ROMAGNA scons. a r.l. • Prog, "Valorizzazione dell'olio e dell'olivo" Programma di iniziativa Comunitaria Leader +

(L'ALTRA ROMAGNA)

ARPO-Associazione Regionale Produttori Olivicoli • "Miglioramento della qualità della produzione dell'olio d'oliva e delle olive da tavola":

convenzione per analisi qualitative dei campioni di olive prelevati in occasione delle prove di raccolta meccanica dell'olio da esse derivato.

SARMAP S.A. • CONVENZIONE CON SARMAP S.A. NELL'AMBITO DEL PROGRAMMA "GLOBAL

MONITORING FOR FOOD SECURITY" Contratti passivi

CREDITORI E DEBITORI DIVERSI • ACCANTONAMENTO PER AREA DI RICERCA DI FIRENZE ULTIMO QUADRIMESTRE

ORDINARIA

ALATRI ROBERTO • PRESTAZ OCCASIONALE PER PRESDISPOSIZ. PROGRAMMI E ATTIVITA' PER

IMMAGINE DELL'IST. SU STAMPA NAZIONALE ED INTERNAZIONALE (ORDINARIA)

RICCARDO BENEDETTI • PRESTAZIONE PER SCRITTURA CODICE LINGUAGGIO C LANDSAF

LORENZO BOTTAI • INCARICO PROFES. BOTTAI LAMMA CONTRIBUTO 04 • BOTTAI INCARICO PARTE PER CRES 2003 (PROT. CIVILE) • INCARICO PROFES. BOTTAI (SIT DESIDERI) • PRESTAZ. PROF.LE BOTTAI (LAMMA)

ROBERTO COSTANTINI • PRESTAZ. COSTANTINI PER CRES 2003 (ASSIC. GENERALI+ FERRERO RESIDUI) • INCARICO PROFESSIONALE • ATTIVITA' PER PEROGETTO GROSSETO

ANDREA MALPEZZI • MALPEZZI CONTRATTO D'OPERA 10 MESI MIND RINNOVO 2005

MATTEO MARI • Obbligazione per compenso

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ALESSANDRO PERESSOTTI • CONSULENZA PER LA PROGETTAZIONE E REALIZZAZIONE DI UN MODELLO DI

FLUIDO DINAMICA (KB)

LORENZO ARCIDIACO • INCARICO PROF. DOTT. ARCIDIACO (SIT DESIDERI)

FABIO ROLI • INCARICO PRESTAZIONE OCCASIONALE SU STATO ARTE SISTEMI DI SUPPORTO

LOTTA INCENDI BOSCHIVI (FIRELAB) • PRESTAZ OCCASIONALE PER SISTEMA SUPPORTO LOTTA INCENDI (FIRELAB)

MASSIMO VITI • VITI CONTRATTO D'OPERA 12 MESI LAMMA TEST RINNOVO PER ESERCIZIO 2005

SINTRA CONSULTING • CONSULENZA (PROG C/TO TERZI CHIUSI 2002)

PACINI EDITORE • progettazione e impaginazione volumi e stampa (orientamento)

MASPRES MECCANICA • ASTE TELESCOPICHE (LAMMA)

HEWLETT-PACKARD ITALIANA Srl • ASSISTENZA HP- DAL 1/3/03 AL 31/12/03

INIZIATIVE INDUSTRIALI ITALIANE • CONTRATTO CON INIZ. INDUSTRIALI PER GESTIONE AEREO SKY ARROW FINO A NOV.

PER 120 ORE AEREO PROG. ITALIA USA • VEIVOLO SKY-ARROW (ITALIA-USA) • LAVORO AEREO SKY ARROW PER VOLI E MANUT. (PROG. ITALIA-USA)

LOMBARD & MAROZZINI SRL • MAT. DA LABORATORIO PER STAZIONI METEO ANEMOMETRI ECC (MAT. NON INV.

ART 49)PROG. COMMA MED • ANEMOMETRO E TRASDUTTORE (ITALIA-USA)

TD GROUP SPA • CABLAGGIO COMPLETO ISTITUTO VIA CAPRONI LINEA MANTENIMENTO

CIET • SCAVO PER CAVO TELEFONICO (LAMMA)

CE.S.I.A. • COLLABORAZIONE TRA IBIMET E CESIA PROG. TELESPAZIO DURATA 4 MESI DAL

01/11/2004 AL 28/02/2005 • SUBCONTRATTO (BACCHUS) • SUBCONTRATTO SECONDO ANNO (BACCHUS)

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LUCHSINGER srl • P63-P69: TSI Condensation Particle Counter (CPC) e pompa per vuoto

TECNO.EL S.R.L. • ATTREZZATURE SCIENTIFICHE PER PROG. COS(OT) • MATERIALI PER PROG. CO(OT)

VEM SISTEMI S.P.A. • SOFTWARE PER FIREWALL (LAMMA)

S.A.R. CONSORZIO SRL • ORD. 103/B/04 - dati agrofenologici, elaborazioni climatologiche e cartografiche

TELCOM S.R.L. • PC PORTATILI, MASTERIZZATORE, STAMPANTE (PAFAGE 2002)

ONE STEP CLOSER • CONSULENZA PER AGRITURISMO (PROG C/TO TERZI CHIUSI 2002)

ROCCHI LEANDRO -PRODUZIONE E SVILUPPO SOFTWARE • PRESTAZ PROF.LE PER REALIZZAZIONE DI DATABASE METEOROLOGICO

(ORDINARIA)

ECOSEARCH • ANALIZZATORE LICOR LI 7500 (LINEA COMMA MED LIVORNO) • ACQUISTO MAT. INVESTIMENTO MIND PER SISTEMI DI ACQUISIZIONE, DATA

LOGGERS E MISURA SUOLO (LINEA MIND) • ANALIZZATORI (KYOTO) • MATERIALE CHE VA IN CAMPO (KARNAL BUNT)

TECNO ACQUA IMPIANTI • RIPARAZIONE CON SOSTITUZIONE IMPIANTO DI CONDIZIONAMENTO E

RISCALDAMENTO (ORDINARIA)

CECCHERINI DINO • ACQUISTO ARREDI per nuovo insediamento Sesto Fiorentino e Via Caproni (LINEA

MANTENIMENTO)2002

SERVIZI TERRITORIO S.R.L. • ANEMOMETRO COMPLETO (LINEA COMMA MED LIVORNO) • ANEMOMETRO COMPLETO PROG. EUROFACE

C.P.E. • STUDIO DI FATTIBILITA' PER CENTRALINA METEO DA MONTARE SU IMBARCAZIONE

(COMMA) • MANUTENZIONE STAZIONI (LIVORNO) • TRASMETTITORI SATELLITARI PER PROGETTO LIFE

AGROS REALIZZAZIONI SRL • REDAZIONE CARTA PEDOLOGICA TERRITORIO FRASCATI DOC (BACCHUS)

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NEC ITALIA SCRL • PRESTAZ PER ANNO 2005 SEGRETERIA (PROT. CIVILE) • INDAGINE PER FORMAZ OPINIONE PUBBLICA SULL'ARTIGIANATO ARTISTICO • SUPPORTO TECNICO (ARIA) • SUPPORTO GESTIONE TECNICA E ORGANIZZAZ. LOGISTICA (ARIA)

TUTTOCOMPUTER - DI MARCO LEONCINI • ACQUISTO HARDWARE (LINEA ASS GENERALI) 2002 • PC NODO+PC MASTER DI CUI UNO COMPLETO PROG. LAMMA • COMPUTER E WORKSTATION (LAMMA)

EXPLEO INFORMATICA S.R.L. • ACQUISTO HARDWARE PER SEDE LIVORNO (LINEA COMMA MED) • CLUSTER (N. 9) (LIVORNO RESIDUI)

EUROPCAR ITALIA SPA • NOLEGGIO EASY RENT PER 3 MESI AUTO CAT. EBMR ORIENTAMENTO PROROGATO

PER ALTRI 3 MESI EANCORA PER ALTRI 3 MESI

ENVITECH • SUBCONTRACT SPREAD - ENVITECH ANNO 2003

SISTEMI AVANZATI S.R.L. • STAZ LAVORO SU MODULI ERDAS (GROSSETO)

DATATECH S.P.A. • ACQUISTO SOFTWARE (LIVORNO) • MAT. HARDWARE PER,PLOTTER E SCANNER (GROSSETO)

PBINTERNATIONAL S.p.A. • P71: Autoclave verticale "Star System" FVA3, 140lt. (Gruppi funzionali di base: generatore di

vapore elettronico GEN-VAP, compressore d'aria interno AIR-PRESS, raffreddamento spontaneo, cestello MAXI OPEN BOX)

PHOTO ANALYTICAL SRL • RIPARAZIONE E CALIBRAZIONE SPETTRORADIOMETRO PROG. ARIA

DIP.INGEGNERIA CIVILE-Univ. Studi Firenze • FINANZIAMENTO A DIP. INGEGNERIA CIVILE (ITALIA-USA)

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI FIRENZE • CONVENZIONE UNIFI PER CRES GROSSETO (RECUPERO SU PROT. CIVILE) • CONVENZIONE CON UNIFI PER COLLABORAZIONE PROG. CRES GROSSETO (LINEA

CRES=

QUI! TICKET SERVICE SPA • BUONI PASTO PRIMA PARTE (ORD WP ZIPOLI) • BUONI PASTO ANNO 2003 • BUONI MENSA ANNO 2003 (LAMMA) • BUONI PASTO N. 115 BLOCCHI (ORDINARIA)

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SISTEMI TERRITORIALI SRL • SOFTWARE ARC GIS (BACCHUS) • ARCVIEW (ASS. GENERALI) • SOFTWARE ARCVIEW E ARCVIEW SERVER (LINEA CRES GROSSETO)

DE CHIARA GIOVANNA • PRESTAZIONE OCCASIONALE PER ANALISI E VALUTAZIONE CAMBIAMENTI

CLIMATICI • PRESTAZ OCCAS.

ENEL DISTRIBUZIONE SPA - CENTRO AMMIN. TOSCANA E UMBRIA • FORNITURA ENERGIA ELETTRICA

AVIOROMA S.R.L. • SUBCONTRATTO PER FORNITURA DEL SERVIZIO DI LAVORO AEREO (LINEA RECAB)

2003

PERMAROCCHI S.A.S. • MAT. PER RICERCA 10 KM DI GRONDAIE IN LAMIERA (LINEA MIND)

CRISTOFORI SIMONE • INCARICO PROF.LE PER SVIL MODELLI, CAMPAGNE MISURA E PAGINE WEB (OIL

SPILL)

GUERRIERO ILARIA • NOTULA GUERRIERO (ASSIC. GENERALI)

MALPEZZI FRANCO • IMPIANTO CITOFONICO E ANTENNE (LIVORNO)

FREIE UNIVERSITAT BERLIN-ISTITUT FOR METEOROLOGIE • DATI METEOROLOGICI (LINEA CONCLUSI VINCOLATI)

BARTZ TECHNOLOGY CORPORATION • CAMERA SYSTEM COMPLETA DI VIDEO (LINEA GREENGRASS)

CARMIGNANI ANTONIO • ADEGUAMENTO PER CED SESTO (LAMMA)

Centro Elettrotecnico Sperimentale Italiano Giacinto Motta S.p.A. • DATI FULMINE FINO AL 31/12/2003 E IMPLEM SOFTWARE • CANONE FORNITURA DATI GENN-SETT '04 LAMMA RESIDUI

ARREDAMENTI BIANCHI • ARREDI PER SEDE LIVORNO (LINEA COMMA-MED)

TECNONET spa • LOCAL AREA NETWORKS PRESSO SESTO • REALIZZAZIONE CENTRALINO SEDE SESTO (LAMMA) • REALIZZAZIONE LOCAL AREA NETWORK SESTO (LAMMA)

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SIGECO-CSS srl • MATERIALE HARWARE PER LIVORNO E VIA CAPRONI (LIVORNO)

WEBKORNER S.R.L. • SERVER DI DOMINIO COMPLETO PROG. LAMMA • SAN (LAMMA)

LA TRIVELLAPOZZI • TRIVELLAZIONE POZZO SEMIARTESIANO (LINEA MIND)

I2T3 ente morale • CONVENZIONE I2T3 PER 24 MESI - SOLO ANNO 2003 (SAHEL) • SECONDO ANNO INCARICO I2T3 (SAHEL)

PP SYSTEMS • ACQUISTO GAS ANALYZER PROG. ITALIA USA

DIPARTIMENTO DI SCIENZE AMBIENTALI • RICERCA PER MONITORAGGIO RESPIRAZ. SUOLO DI PARTICELLE DI BOSCO SOTTO

STRESS IDRICO (MIND) • CONVENZIONE UNIV NAPOLI (ITALIA-USA)

FORUM PER I PROBLEMI DELLA GUERRA E DELLA PACE • INCARICO FORUM PROBL GUERRA E PACE ANNO 2003 (SAHEL)

OSMUNDA REGALIS scrl • MESSA IN OPERA IMPIANTO IRRIGAZIONE RECAB • MESSA IN OPERA CANALINE RACCOLTA ACQUE ORD. 444 PROG. TACOS

LEICA GEOSYSTEMS SPA • STAZIONI GPS (CRES GROSSETO RESIDUI)

DUCE MARIO CORRADO • Contratto d'opera Mario Corrado Duce - Gestione informatica dati micrometeorologici • Contratto d'opera Mario Corrado Duce - Gestione informatica di dati territoriali, meteorologici

e micrometeorologici.

Consorzio SAR s.r.l. • FORNITURA DATI ED ALABORAZIONI CLIMATOLOGICHE E CARTOGRAFICHE

(CLIMAGRI) • FORNITURA DATI METEOROLOGICI E DATI TERRITORIALI

STRACCALI FABIO • PRESTAZIONE PROFESSIONALE MONITORAGGIO RETE ASSITENZA SOFTWARE

MANUTAZIONE WEB ORDINARIA • ASSISTENZA E MANUTENZIONE SITO WEB, CONFIG E MANUT. RETE LAN ASSIST.

SOFTWARE E APPARECCHIATURE ANNO 2004 (ORDINARIA)

CORONGIU MANUELA • PRESTAZIONE PROFESSIONALE PROG. LAMMA

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• INCARICO PROFES. ING. CORONGIU (SIT DESIDERI) • COLLAB PROG. SIT PER ATTIVITA' INERENTI IL SUPPORTO ALLA DEFINIZIONE DEGLI

ARCHIVI GEOGRAFICI DELLA REGIONE TOSCANA (SIT DESIDERI)

OSTI FABIO • P94 - P51: Rinnoco c.d'opera F.Osti prog. ARSIA e CDA

ROSSI MAURO • PRESTAZ PROF.LE PER DEFINIZ. CONTENUTO DBT (LAMMA • PRESTAZ PROF.LE ROSSI (LAMMA)

COMANDO III REGIONE AEREA DIR. TERRIT. COMM.TO-UFF.AMM.NE E CASSA • RIMBORSO ONERI DATI METEOROLOGICI PERIODO 1/10/03-30/9/04 (LAMMA)

studio prof. associato S.T.C. MARTINA • PRESTAZ PROFESSIONALE (ASSIC. GENERALI)

CENTRO GEOTECNOLOGIE • CONTRATTO CON CENTRO GEOTERMIA UNISI PER REALIZZAZIONE DI ARCHIVIO

DIGITALE DATI (GROSSETO)

CENTRAL MOTORS DEPARTEMENT DE CFAO NIGER • ACCONTO PER ACQUISTO BENE PER CONTO DEL MINISTERO DEL NIGER (MATERIALE

CHE VIENE ACQUISTATO IN NIGER E RIMANE DI PROPRIATA' LORO) • SALDO ACQUISTO AUTO DI PROPRIETA' DEL MINISTERO DEL NIGER CHE NON VIENE

UTILIZZATO DA NOI PROG. PAFAGE

MARKER MICHAEL • MODELLISTICA IDRO-EROSIVA A ANALISI DI SIMULAZIONE DI PROCESSI EROSIVI

LORET EMANUELE • PRESTAZIONE PER CREAZIONE GIS DI IMMAGINI DEL SITO PILOTA DI FRASCATI

(BACCHUS)

CAMERACHIARA snc di Enrico Blasi & C. • STAMPA LIBRO "CLIMATE CHANGE" KYOTO

SMC ITALIA • VALVOLE USDA COLORADO

NISSAN FILIALE DI FIRENZE • NISSAN XTRAIL (ITALIA-USA)

ACDI - ASOCIACION CULTURAL PARA EL DESARROLLO INTEGRAL • CONVENZIONE CNR-CIOMTA GIUGNO - DIC. 2004 (SANTA FE')

MONTAGNANI SIMONE • MONTAGNANI GEN-DIC. RINNOVO PROG. LAMMA CONTRIBUTO

GEOMIND S.R.L.

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• FUSIONE DATI MULTISPETTRALI E FOTO AEREE, VISUALIZ. 3D INTERRATIVA SU INTERNET (PROG. 281)

MAC96 S.A.S. ENGINEERING CONSULTANTS • SUBCONTRATTO PROG. SPREAD ULTIMO ANNO PROG. SPREAD

STUDIO HARP SNC • GESTIONE DEL PROGRAMMA FESR-DOCUP (SIT DESIDERI 281)

TERRASYSTEM S.R.L. • CAMPAGNE SORVOLO PER ACQUISIZIONE DATI PER IL PROGETTO ITALIA-USA CON

INGV

GIUNTI PROGETTI EDITORIALI srl • STAMPA GUIDA PER INSEGNANTI SULLA METEOROLOGIA (METEOSCHOOL)

NEVINI ROBERTO • ATTIVITA' PEDOLOGICHE SU AREA CAMPIONE 7500 ETTARI FIUME ALBEGNA (SIT

DESIDERI)

ORADINI ARTURO • REALIZZAZIONE CARTA USO SUOLO DI N. 28 SEZ DELLA CRT (SIT DESIDERI)

GALETTO RICCARDO • PRESTAZ. OCCASINALE PER SPECIFICHE CAPITOLATI FOTOGRAMMETRIA PER SIT

DESIDERI

GEOIN S.R.L. • INCARICO PER REALIZZAZIONE DI COMPONENTI G.I.S. NELL'AMBITO DEL PROGETTO

BACCHUS

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Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Analizzatore H2O KH20 Campbell - Analizzatore portatile di CO2 ADC LCA3 - Anemometro sonico CA27 - Anemometro sonico CA27 Campbell - Anemometro sonico USA-1 Metek - Anemometro sonico tridimensionale CSAT3-3D - CAPPA BIOLOGICA A FLUSSO LAMINARE - Camera climatica - Camere climatizzate - Cella climatica per la somministrazione di gas - Data Logger CR5000 - Generatore di Dew point Li-610 - Infra red gas analyser ADC 2250 - Infra red gas analyser Li-7500 - Lampada calibratrice Li-1800_2 - Misuratore di area fogliare LI-2000 - Misuratore di ozono 1008 PC Dasibi - O3 Sonde system OS-G-2 - Open path infrared gas analyzer LI-7500 - Rete di stazioni di misura dei flussi biosferici - Rete meteorologica IBIMET-CORIAL - Capitanata, Puglia - Sfera integratrice Li-1800_12 - Sistema sperimentale EuroFACE - Spettroradiometro portatile Li-1800 Li-Cor - Stazione di osservazione dell'atmosfera "Terra Rossa" - Velivolo di Ricerca Sky Arrow ERA - cromatografo liquido ad alta pressione - gas cromatografo spettrometro di massa Istituti con i quali si collabora



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Sviluppo di competenze

Temi


I-Docenza XX ciclo Dottorato in Agrometeorologia, ecc. II-Pubblicazione del volume "Il Calcolo Approssimato". III-Realizzazione di un Epiradiometro e installazione di un Lisimetro a Pesata da noi realizzato. IV-Pubblicazione del 14° volume della Collana IBIMET "Il telerilevamento nel Monitoraggio degli Agroecosistemi" e relativo Seminario.

Stato dell'arte:

I-La collabor. IBIMET ai Dottorati è un riconoscimento dell'Univ. di SS. II-L'esigenza di nuovi testi di matematica deriva dall'insuff. conoscienza della materia dei provenienti da discipline agrobiologiche. III-Gli strumenti e gli apparati sono progettati con caratteristiche qualitative come quelle del commercio ma costi di realizzazione e impianto più contenuti. IV-La Collana IBIMET descrive strumenti e metodi che non trovano spazio nei paragrafi Materiali e Metodi delle riviste

Azioni

Attività in corso:

I Docenza nel Dottorato di Ricerca in Agrometeorologia ecc. II-Già pubblicati in riferimento all�Ingegneria Agraria e alle Scienze Ambientali i volumi: Il calcolo matematico e Esercizi di matematica; è in corso la stesura del volume Il calcolo approssimato. III�Messa a punto di camera di crescita controllata in tutti i parametri ambientali compresa la radiazione ultravioletta. IV�Nella Collana IBIMET è in preparazione il volume Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi


Unici punti critici sono l'eventuale non rinnovo del contratto al personale attualmente a tempo determinato (per il quale si è molto investito e che ha molto dato) e un inadeguato contributo finanziario da parte della Sede Centrale.


Università di Sassari, DESA per Epiradiometro Ricercatori di altri Organi CNR per la stesura del Volume "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" e relativo Seminario. Università di Firenze, DISTAF per Camere di Crescita. ERSAT, Regione Sardegna per Lisimetro

Finalità

Obiettivi:

Realizzazione: -dei Volumi "Il calcolo approssimato" e "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" -del Seminario Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi -degli strumenti: Epiradiometro (progetto), Camera di Crescita (messa a punto), Lisimetro (installazione). Le competenze sono interne all'Istituto per il forte contributo del personale a tempo determinato

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Realizzazione: -dei Volumi "Il calcolo approssimato" e "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" entro il 2005. -del Seminario Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi, entro il 2005. -degli strumenti: Epiradiometro (progetto 2005, realizzazione 2007), Camera di Crescita (messa a punto 2006), Lisimetro (installazione 2007).

Potenziale impiego:


Micrometeorologia, ecofisiologia e produttività dei sistemi naturali e antropizzati.

Temi


Sviluppo di strumentazione, applicazioni di metodi di monitoraggio micrometeorologico e ecofisiologico a diverse tipologie di sistemi naturali e antropizzati, sviluppo di modelli previsionali e indici di rischio, studio interazioni pianta-patogeno-ambiente, recupero di aree e ambienti degradati, qualificazione della produzione locale per la valorizzazione del territorio e dei processi produttivi sostenibili. Sviluppo di tecnologie per contributi all�applicazione delle politiche comunitarie.

Stato dell'arte:

Lo studio delle relazioni tra sistemi viventi e ambiente è scienza recente, a cui contribuiscono le analisi dei meccanismi di scambio superficiale, dei processi ecofisiologici, e la valutazione qualitativa e salutistica della produttività, primaria e industriale. Il contesto della commessa è fortemente orientato alla massima valorizzazione delle risposte di sistemi naturali e antropizzati alle sollecitazioni ambientali e allo sviluppo di contributi all�applicazione delle politiche comunitarie.

Azioni

Attività in corso:

Monitoraggio delle interazioni tra sistemi (bosco, macchia mediterranea, specie agrarie, verde urbano) e atmosfera, sviluppo di modelli e strumenti di misura. Caratterizzazione ecofisiologica e modellistica per la tipicizzazione del prodotto in funzione dell�ambiente. Sviluppo di strategie per salvaguardia della sanità e valorizzazione della redditività e qualità. Messa a punto di tecnologie verdi per il recupero del degrado e il miglioramento della qualità dell�ambiente naturale e antropizzato.


Le competenze e le risorse interne, unitamente ad una consolidata rete di collaborazioni sia con RTD e SMEs configurano un quadro favorevole nell�analisi delle condizioni di fattibilità. Si configurano alcune criticità tra cui si rimarca l�assenza di turn-over e la limitazione strutturale del rapporto investimento/funzionamento. Strumentazione e competenze disponibili, anche se ora adeguate, richiedono, sul lungo periodo, una politica di consolidamento per garantire competitività e risultati.


Oltre a collaborazioni documentabili con numerose istituzioni di ricerca nazionali e internazionali, Enti e Amministrazioni pubbliche, sono in atto azioni congiunte (tra cui spin-off, scouting, intenti di impresa) con numerose aziende, tra cui Hamamatsu Photonycs, Servizi Territorio., Geotema, Thermitalia, Agri-2000, National Instruments, Associazioni Produttori e Cooperative e Consorzi. Sono inoltre attive le partecipazioni in OPAG del WMO e in attività della FAO, EC e ESF.

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Finalità

Obiettivi:

Un comune obiettivo sta nella comprensione dei diversi aspetti di relazioni tra sistemi naturali e antropizzati, atmosfera e territorio per sviluppare indici di rischio, ottimizzare processi ecofisiologici e produttivi fortemente orientati verso qualità, sanità e sostenibilità. Le competenze presenti sono in linea con questi obiettivi interdisciplinari, e comprendono professionalità, know-how e expertize sui processi di monitoraggio e analisi con strumentazione ad hoc anche originale.


Tecniche di gestione dei sistemi per qualità, vocazionalità, sostenibilità, ripristino, caratterizzazione agroclimatica. Modellistica per schemi di uso del suolo, controllo del degrado, interazioni a mesoscala per l�ottimizzazione della produttività, interazioni pianta- patogeno. Sistemi e procedure di monitoraggio. Struttura temporale a follow-up dei progetti orientati a committente e a risultati di processo per cui si prevede una articolazione basata su misure, modellistica, applicazioni.

Potenziale impiego:


Sviluppo rurale, occupazione ed identità culturale

Temi


Realizzazione di indagini sulla realtà economica e ambientale e sulla identità culturale di aree campione, tramite raccolta e analisi di dati, interviste e focus groups. Sviluppo di modelli e di strumenti di supporto alla decisione, e di analisi di scenario, per una maggiore efficienza economica delle aree rurali. Messa a punto di metodologie di comunicazione per una migliore connotazione della identità territoriale. Informazione e formazione di attori coinvolti (amministrazioni, imprese).

Stato dell'arte:

Le trasformazioni socioeconomiche degli ultimi decenni, legate anche alla globalizzazione, hanno modificato profondamente identità culturale e ruolo economico delle aree rurali, con un impoverimento della cultura locale, e riduzione delle possibilità di sviluppo economico. Le iniziative LEADER, gli impegni del Fondo Sociale Europeo, la PAC mirano a rilanciare modolli di sviluppo più complessi, ponendo l'accento non solo sulla attività produttiva, ma anche sugli aspetti ambientali e sociali.

Azioni

Attività in corso:

Elaborazione di modelli di indagine e loro applicazione all�identificazione delle peculiarità territoriali. Studio e definizione di un modelli di orientamento per la comunicazione e l�informazione. Analisi economiche basate su dati territoriali e si dati contabili aziendali. Valutazione di risorse agroambientali e di agrotecnologie, per la messa a punto di modelli di sviluppo.


La fase congiunturale sfavorevole per il settore agricolo determina una situazione di particolare necessità di ricerca economica al fine di indirizzare il cambiamento, ma riduce la disponibilità privata al cofinanziamento. Inoltre le PMI hanno scarsa dimestichezza con il mondo della ricerca, e

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talvolta vedono con sospetto la collaborazione. D'altra parte, la presenza in Istituto di personale con competenze diverse offre prospettive realistiche di collaboraziione interdisciplinare.


L'attività sarà svolta di concerto con Istituzioni pubbliche locali, con il mondo della scuola, con l'associazionismo e con imprese. Fra le istituzioni, ARPA, Consorzi di Bonifica, UNIBO - Dip. DEIAGRA, UNIPD - Dip. TESAF, UNIPR, Università di York, Università di Reading, CNRS, Univ. Minnesota, Segr. di Stato per il Territorio della Rep. di San Marino, Univ. di Guadalajara, Fondazione per l'artigianato artistico, Prog. EUROACADEMY, Progetto COST E33.

Finalità

Obiettivi:

Valutare il rapporto esistente fra la popolazione e il proprio territorio. Agire sul mondo giovanile, aiutandolo ad identificare le potenzialità di sviluppo sostenibile, tramite una conoscenza più approfondita del proprio territorio. Tutelare le risorse ambientali sociali culturali e infrastrutturali. Produrre supporti metodologici e informativi per orientare i processi decisionali. Le competenze disponibili sono relative a economia e politica agraria e ambientale, modellistica, analisi dati.


Sviluppo e messa a punto di: - un modello di indagine sulle opportunità occupazionali in aree rurali. - un sistema di supporto alla gestione delle risorse idriche. - un modello di valutazione della richiesta e dell'offerta di attività turistiche in aree agroforestali. - moduli didattici per le scuole elementari finalizzati alla comprensione degli aspetti ambientali del territorio. Pubblicazione di articoli su riviste e atti di convegni. L'attività si svilupperà nel prossimo triennio.

Potenziale impiego:


Gestione delle risorse del territorio mediante tecnologie informatiche innovative

Temi


Dal 2005 al 2007 saranno sviluppate le attività in corso, con particolare attenzione all'integrazione tra GIS e sistemi per l'archiviazione di dati, ed alle più aggiornate tecnologie per la realizzazione di applicazioni GIS dedicate. Rilievo sarà dato all'uso dei dati forniti dai satelliti di nuova generazione(MODIS, MERIS) anche per la componente marina e dalle misure iperspettrali da aereo per la stima, tra gli altri,di parametri ecologici(PPN)basilari in ecosistemi agricoli e forestali.

Stato dell'arte:

L'applicazione di nuove tecnologie nello studio del territorio possono fornire validi strumenti sia nella gestione che nell'acquisizione di nuove conoscenze. In particolare l'uso integrato di G.I.S, database geografici e immagini satellitari ad alta risoluzione permette di avere una base di informazioni completa ed esaustiva per l'applicazione di modelli matematici per l'analisi di differenti aspetti del territorio e fenomeni naturali complessi.

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Azioni

Attività in corso:

Le attività di ricerca in corso possono essere, in breve, così schematizzate: -metodologie per la gestione delle risorse idriche e problematiche ad esse collegate (erosione, siccità) -monitoraggio di ecosistemi costieri (biodiversità, erosione) -metodi di ottimizzazione delle pratiche agricole e forestali -sistemi revisionali e valutazione del rischio di incendi boschivi -previsione ed analisi della vulnerabilità in PVS e sistemi di allerta -monitoraggio delle variazioni di uso suolo


La disponibilità dei dati per una certa area rappresenta il fattore condizionante del lavoro. La possibilità di disporre di un ampio dataset di partenza e di una sinergia con le realtà operanti sul territorio, permette di raggiungere un' elevata risoluzione nell'applicazione della ricerca. Il livello di dettaglio dei risultati ottenibili è direttamente proporzionale ai dati di partenza, la mancanza dei quali non rende inapplicabile la ricerca me ne condiziona i risultati.


Collaborazioni a livello nazionale ed internazionale, sono già in atto da tempo per lo svolgimento dei molteplici aspetti della ricerca. La collaborazione con Istituzioni attive nella cooperazione internazionale, con Enti locali e con Ministeri facilita il contatto con le problematiche ambientali e legate ai diversi territori. Inoltre fondamentali sono i contatti citati per il reperimento dei dati storici,la validazione dei risultati e la diffusione delle innovazioni sul territorio.

Finalità

Obiettivi:

Modellizzare relazioni ed interazioni che intercorrono tra le varie "componenti" del territorio e tra differenti sistemi naturali. L'esperienza nell'analisi dei dati ottenibili da telerilevamento, la conoscenza delle possibili applicazioni dei GIS al settore agricolo e forestale, l'integrazione in questi di modelli matematici e l�uso innovativo di avanzate tecnologie informatiche sono le competenze che la ricerca mette al servizio della gestione territoriale.


I risultati attesi nel triennio riguardano soprattutto le nuove possibilità di applicazione delle tecnologie GIS e di Osservazione delle terra nel controllo, monitoraggio e gestione del territorio. Il miglioramento delle metodologie di integrazione tra differenti strumenti informatici permetterà di migliorare le applicazioni e rendere più speditive le operazioni di aggiornamento dei dati e di analisi, aumentando l'aspetto di operatività dei sistemi implementati.

Potenziale impiego:


"Dinamica dei sistemi agro-forestali; vulnerabilità, adattamento, mitigazione"

Temi


Sviluppo di sistemi sperimentali di campo per lo studio degli effetti dei diversi fattori di cambiamento Determinazione di stati di stress delle vegetazione mediante sistemi di telerilevamento (termico e multipsettrale) da aereo Analisi dell�effetto di elevate concentrazioni di CO2 atmosferica su

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produttività di colture agrarie e qualità delle produzioni Campagne di misura a scala regionale, nazionale ed globale per la misura diretta del sequestro di CO2 nei sistemi agricoli e forestali

Stato dell'arte:

Il sistema agro-alimentare e quello forestale sono vulnerabili di fronte ai diversi e principali fattori di cambiamento. Variazioni delle caratteristiche chimiche dell�atmosfera (aumento di concentrazione di CO2, ozono troposferico, deposizioni di azoto etc.) e variazione delle caratteristiche climatiche (aumento di temperatura, variazione del regime pluviometrico, eventi estremi) espongono il sistema a rischi significativi che possono avere conseguenze sulla produttività primaria

Azioni

Attività in corso:

La commessa è costituita da una serie di progetti di rilevanza regioanle, nazionale ed internazionale che riguardano specifici aspetti relativi a: - misura di emissioni ed assorbimenti di carbonio ed altri gas traccia nel sistema agroforestale mediante tecnologie innovative - stima degli effetti di variabili ambientali sulla produttività degli ecosistemi - analisi della vulnerabilità di sistemi forestali ed agricoli - bilancio del carbonio a scale colturali, regionali e globali


La mancanza di prospettive certe per l'assunzione di personale a tempo indeterminato e per la formazione di nuovi ricercatori Difficoltà di dotarsi di strumentazione ed apparecchiature scientifiche che non possono essere di fatto finanziate dai progetti esterni Difficoltà di garantire il funzionamento a lungo termine delle infrastrutture che sono state realizzate ed acquisite negli ultimi anni con finanziamenti esterni


Le collaborazioni internazionali attive o da attivare riguardano circa una ventina di laboratori europei (Progetti UE), altri organi CNR e diverse Università italiane. Sono già attive collaborazioni consolidate con Università ed Organismi di ricerca USA nell'ambito dell'accordo bilaterale di collaborazione fra governo italiano e statunitense. La realizzazione di attività di networking delle rete internazionali prevede collaborazioni con 215 organizzazioni che sono inserite nella rete Fluxnet

Finalità

Obiettivi:

Quantificare gli effetti delle variazioni ambientali attese su produzione, qualità e sostenibilità del sistema agro-forestale mediante attività sperimentali e modellistica Definire soglie di rischio e di vulnerabilità anche mediante lo sviluppo di indici specifici Definire strategie di adattamento e proporre azioni di mitigazione inserite nel contesto delle Convenzioni Internazionali


I progetti che contribuiscono alla commessa porteranno a risultati significativi e sinergici fra loro che si inseriscono nel contesto delle Convenzioni Internazionali e nel quadro della ricerca europea sullo sviluppo sostenibile. Tali risultati comprendono pubblicazioni scientifiche su riviste internazionali, messa a punto e verifica di metodologie di misura, basi di dati di supporto per l'implementazioni di politiche regionali, nazionali e globali.

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Potenziale impiego:


Sistemi di supporto alle decisioni per una gestione sostenibile del sistema agricolo e delle filiere agro-industriali

Temi


Acquisizione dei dati fisici delle aree relativi a morfologia, geo- pedologia, climatologia, uso del suolo e loro georeferenziazione. Sviluppo e valutazione comparata di modelli meteorologici a diversa scala temporale per il loro impiego in modelli di crescita/sviluppo delle colture (per esempio frumento) e dei loro organismi patogeni (per esempio peronospora della vite) e per una spazializzazione dinamica dei dati agrometeorologici.

Stato dell'arte:

Il sistema agro-alimentare (intendendo sia le imprese che la P.A.per le produzioni vegetali ed animali) per operare in maniera più efficiente e sostenibile si avvale di metodologie innovative per la previsione, a varie scale spaziotemporali, delle produzioni agricole, sia in termini quantitativi che qualitativi. Inoltre condizione di successo di scelte sull'utilizzo delle risorse del territorio è la disponibilità di strumenti che consentano di valutare ex ante gli effetti di eventuali decisioni.

Azioni

Attività in corso:

Raccolta e studio della letteratura scientifica internazionale relativa ai SSD.Acquisizione di dati e schemi di calcolo per i vari moduli in cui è articolato il SSD. Definizione delle procedure per la valutazione dei risultati sia dei singoli moduli che dell�SSD nel suo insieme. Sviluppo e gestione di modelli agrometeorologici per la realizzazione di previsioni a diversa scala spazio-temporale. Monitoraggio di parametri agrometeo mediante reti di stazioni sperimentali. Valutazione della componen


La condizione di precarietà soprattutto dei ricercatori più giovani può paradossalmente allontanare gli elementi più capaci e intraprendenti. Ciò nonostante la proposta ha notevoli possibilità di successo perché risponde ad una domanda di ricerca del sistema produttivo del settore e perché beneficia della lunga esperienza scientifica dell�Istit. proponente e delle sue collaborazioni anche a livello internazionale. Ciò è dimostrato dal numero e dal budget dei progetti esterni che la finanziano.


UniFi, Dip scienze agromoniche e gestione del territorio agroforestale e Centro Interdip. Bioclimatologia. MAE: Ist.Agromonico per l�Oltremare. MIPAF: UCEA, Roma. INRA: Laboratoire de Bioclimatologia, Avignon. USDA: Water Conservation Lab, Phoenix. Univ of Montana, UM Numerical Terradynamic Simul.Group, Missoula. Univ Fort Collins, Colorado, USA. WMO, Commis.di Agrometeorologia. FAO, Roma. Servizi agrometeo regionali. Vitrociset, Datamat, Roma. COST Action 718.

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Finalità

Obiettivi:

Messa a punto di prototipi di SSD per la previsione dei raccolti e della qualità dei prodotti alimentari, per la gestione sostenibile delle operazioni colturali e per la previsione degli impatti sull'attività agricola portate dalle modificazioni del territorio. L�implementazione dei SSD richiede l�integrazione di competenze agrometeoclimatologiche, di modellistica numerica dei processi funzionali degli ecosistemi agroforestali, di gestione dei dati fisici del territorio tramite GIS.


Messa a punto di un prototipo di modello integrato per la previsione della produzione del frumento e della vite. Definizione delle specifiche per l�integrazione della cartografia numerica topografica nelle nuove strutture di banca dati (geodatabase).Valutazione delle prestazioni di software �open source� nell�implementazione dei GIS. Sviluppo di un SSD per la valutazione dell�andamento fenologico degli ecosistemi agroforestali per la previsioni della loro produttività.

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005



Il previsto aspetto critico dovuto alla disponibilità non omogenea dei dati si è effettivamente verificato, ma essendo stato considerato nella progettazione e messa a punto delle varie metodologie, non ha condizionato il raggiungimento metodologico dei risultati previsti, limitandone in alcuni casi l'attendibilità dei risultati operativi. L'aspetto critico più rilevante rimane la cronica mancanza di personale a tempo indeterminato. Ciò impedisce una programmazione di attività a lungo termine con un adeguato livello di stabilità e disponibilità delle competenze necessarie.

Collaborazioni

Essendo tutte le collaborazioni all'interno di progetti e/o convenzioni regolati da contratti, sono state esattamente quelle previste. Le collaborazioni e gli incarichi sono prevalentemente nell'ambito di progetti finanziati dalla U.E.(ist. di ricerca europei, JRC, INRA, CEMAGREF,VTT,CEREN,INTA), dai Ministeri (MIPAF, MIUR, Ministero Affari Esteri, Ministero dell'Industria), Agrymet e WMO per le attività di cooperazione. Nell'ambito di finanziamenti per le piccole e medie imprese per specifici comparti industriali, sono state instaurate collaborazioni per lo sviluppo e la ricerca (VITROCISET, TELESPAZIO, TD Group, D'Appolonia, Agriconsulting). Con alcuni partners ed utenti finali è stata verificata l'applicazione delle procedure di analisi del territorio (metodologie GIS e OT): Regione Toscana, Regione Sardegna, CFS, Comunità Montane, ARPAT, Protezione Civile.

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Gli obiettivi raggiunti con le attività svolte nel 2005 sono quelli previsti; le poche variazioni temporali, dovute essenzialmente a difficoltà di reperimento dati, che si sono registrate sui risultati intermedi delle varie procedure, sono state riassorbite nel corso dell'anno. Poichè tutte le attività sono svolte su committenza o nell'ambito di progetti e convenzioni, obbligatoriamente i tempi di svolgimento devono essere rispettati, così come le scadenze per la rendicontazione.


Tutti i risultati previsti sono stati raggiunti: -sistema H/S (rete di sensori di misura, data logger, server gestione dati, sw di elaborazione)basato su bilancio idrico che indica la corretta gestione risorse idriche con riferimento anche ad emergenze siccitose nei PVS; -prototipo di un sistema on-line/off-line (in serra ed all'aperto) per la programmazione dell'irrigazione in base ai fabbisogni di piante orticole ed ornamentali finalizzato alla salvaguardia delle risorse naturali; -sistema esperto sw di allerta precoce che tramite correlazione tra andamenti meteo stagionali e produttività agricola, fornisce indicazioni per le politiche di sicurezza alimentare; implementazione di moduli didattici per formazione operatori nei PVS -modello previsionale di incendi boschivi basato sull'integrazione di dati meteo, tipologie di bosco, infrastrutture sul territorio (es. viabilità) con uscita cartografica della valutazione del rischio per le sale operative e indicazioni per successivi interventi di riforestazione -fotointerpretazione e procedure RS per il monitoraggio e mappatura di variazioni uso suolo finalizzato anche al monitoraggio dei fenomeni erosivi

Dinamica dei sistemi agro-forestali; vulnerabilità, adattamento, mitigazione


Mancanza di prospettive certe per l'assunzione di personale a tempo indeterminato e per la formazione di nuovi ricercatori. Difficoltà di acquisire apparecchiature scientifiche che non possono essere di fatto finanziate dai progetti esterni. Difficoltà di funzionamento a lungo termine delle infrastrutture che sono state realizzate ed acquisite negli ultimi anni con finanziamenti esterni. Eccessiva ed inutile appesantimento burocratico delle procedure di gestione interne. Eccessiva ed inutile centralizzazione decisionale nel CNR. Forte incongruenza del modello organizzativo dell'Ente.

Collaborazioni

Di seguito, vengono elencate le collaborazioni più importanti, a cui vanno aggiunti tutti i laboratori europei (circa 70) che collaborano nell'ambito di progetti UE. Barilla Alimentare SpA, Corial-Barilla, Iniziative Industriali Italiane, CPE-Elettronica, Società Produttori Sementi, PPSystem-UK, Università Udine, Bologna, Seconda Università di Napoli, Pisa, Potenza, Tuscia-Viterbo, Enea, INGV, San Diego State-California, Berkeley-California, Anchorage-Alaska, LaPaz-Mexico, Southampton-UK, Urbana-Illinois, Copenhangen-Denmark, Bangor-Wales-UK, Amsterdam-The Netherlands, Edimburgh-UK, Lisboa-Portugal, Bayreuth-Germany, Hobart-Australia, Strasbourg-France USDA-ARS-USA, NERC-Uk, Risoe-Denmark, Alterra-The Netherlands, CEAM-Spain, NPL-India, CEFE-CNRS-France, Max-Planck Biogeochemistry-Germany, Max-Planck Chemistry-Mainz, CNRS-LSIIT-France, CNRS-CEA-France

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Nessun scostamento


L'attività svolta nel 2005 ha prodotto risultati che riguardano aspetti metodologici di misure aeree e telerilevamento, di tecnologie innovative per lo studio degli agro-ecosistemi terrestri e di avanzamento di conoscenze nel campo della ricerca ecofisiologica, con particolare riferimento agli effetti di alte concentrazioni atmosferiche di CO2. Sono stati pubblicati 7 lavori su riviste ISI. Fra le cose realizzate, si citano: campagne di misura in Italia e all'estero, realizzazione e collaudo di infrastrutture di ricerca sperimentale in Australia, USA, UK e Danimarca, installazioni sperimentali per la misura dei flussi in Toscana e in Lazio, gestione delle stazioni sperimentali di Pianosa e Nonantola, gestione dell'esperimento internazionale di Throughfall Displacement sui Monti della Tolfa, attività di ricerca negli impianti sperimentali di Tuscania (VT), partecipazione alla campagna internazionale CERES in Francia insieme ad altri 15 laboratori europei, azione di monitoraggio del bilancio del carbonio della parte occidentale dell'Italia in collaborazione con laboratori USA.



Il settore agricolo è in un periodo di transizione dovuto alla revisione delle politiche, dei mercati e della definizione del ruolo stesso dell’attività agricola. A fronte della necessità di ricerche mirate a tali problematiche, vi é lo sfasamento temporale tra i costi dell’investimento in ricerca, che sono immediati, e i benefici futuri. A ciò va aggiunta la scarsa dimestichezza delle PMI col mondo della ricerca, e la scarsa disponibilità al cofinanziamento, anche per le peculiarità dell'imprenditoria agricola. A ciò va inoltre aggiunta la scarsa conoscenza del CNR e del suo ruolo, non solo da parte delle imprese, ma anche da parte degli Enti locali. Tutto ciò tende a rallentare lo sviluppo di progetti con le realtà suaccennate. In questo contesto sarebbe opportuno offrire risposte adeguate mediante un maggior investimento e contributo pubblico, che rappresenta in questo momento una condizione di fattibilità per l’attività stessa al fine di integrare il contributo privato. Una specifica fonte di criticità deriva necessità di integrare con urgenza le risorse umane dell’Ente onde ritornare alle dimensioni critiche che sono oggi necessarie per partecipare alla ricerca internazionale

Collaborazioni

Oltre alle collaborazioni previste, altre ne sono stae attivate con la West-Pannon Regional Development Agency e l'Università di Godollo (Ungheria). Fra le Istituzioni locali, è risultata perticolarmente rilevante la collaborazione con le Comunità Montane (casentino e valtiberina, AR) e i Comprensori (Alta e Bassa Valsugana), nonchè con alcuni Comuni, primo fra tutti il Comune di San Marco dei Cavoti (BN)


Rispetto a quanto previsto, lo studio delle potenzialità turistiche e dei relativi flussi ha ricevuto una attenzione minore. Ciò é stato dovuto anche all'esigenza di calibrare il lavoro sulla specifica realtà territoriale, tenendo conto della realtà oggettiva che lo studio andava delineando. Pertanto, la messa a punto di modelli per la valutazione dei flussi turistici in aree rurali è ancora in fase di elaborazione.

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Per contro, altre opportunità di lavoro sono emerse, in seguito a richieste ricevute da parte delle singole realtà locali. In tale prospettiva si colloca una indagine svolta sulla riduzione dei costi tramite semina su sodo in aree marginali, e l'inizio di una attività relativa alle potenzialità produttive di piante da fibra. Si ritiene che le richieste ricevute debbano essere viste come un forte segno di interessamento per l'attività svolta, da parte della realtà locale, e come un segno di fiducia per il ruolo della ricerca nella soluzione dei problemi congiunturali.


Gli obiettivi sono stati perloppiù conseguiti.- In tre aree campione si è analizzata la realtà economica in base a dati statistici e a interviste ad amministratori e imprenditori, per identificare le potenzialità occupazionali. Con interviste e focus groups si è esaminata la visione socioeconomica del territorio da parte dei giovani; su tale base si sono svolte azioni di informazione e sensibilizzazione, con diversi metodi di comunicazione, proponendo settori produttivi (tra cui prodotti tipici e turismo) suscettibili di sviluppo o di rilancio.- Si sono messe a punto metodologie per la presentazione in ambito scolastico della realtà territoriale locale anche in relazione alle problematiche globali.- Si é svolto uno studio dei sistemi agro-territoriali ed agro-alimentari, con approcci "micro" e “macro”, per determinare gli impatti indotti dall'applicazione delle direttive della PAC, dai cambiamenti macroeconomici e da altri fattori sui principali indirizzi produttivi esistenti. Si è valutato dell’impatto sui sistemi agricoli irrigui italiani della Direttiva quadro sull’acqua 60/2000. Infine, il lavoro svolto è stato oggetto di pubblicazioni e presentazioni a convegni



La condizione di precarietà, soprattutto per quanto riguarda i ricercatori, rappresenta certamente un elemento di grande criticità nello sviluppo di questi sistemi. La difficoltà a interagire in modo non occasionale e superficiale con gli utenti, soprattutto le imprese, sono il secondo fattore di criticità. Permangono d’altro canto le condizioni di successo rappresentate in primis dalla multidisciplinarietà delle competenze disponibili in Istituto.

Collaborazioni


Gli scostamenti sono stati dovuti alla necessità di rivedere alcuni moduli di cui sono composti questi DSS come nel caso del modulo radiativo per il vigneto. Nel corso del 2006 si ritiene che anche questa parte possa essere completata.


E’ stato implementato un modello integrato per la previsione delle produzioni di frumento con particolare attenzione a quelle di frumento duro su cui è presente un concreto interesse di una primaria industria alimentare nazionale. Il modello integra informazioni fenologiche e di crescita in funzione delle variabili ambientali, primariamente quelle agroclimatiche. E’ in corso di implementazione quello relativo alla vite avendo dovuto riconsiderare ex-novo la componente radiativa al fine di modellizzarne quantità e qualità ai fini delle produzioni di qualità. Dall’analisi delle funzionalità di software “open source” applicati in abito GIS sono emerse indicazioni decisamente positive dal punto di vista delle prestazioni ulteriormente esaltate dall’aspetto economico. Sono state definite, infine, le specifiche per l’integrazione della cartografia numerica

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topografica per l’alimentazione dei geodatabase, elemento primario nella costruzione dei DSS. Dall’analisi delle prestazioni del modello meteorologico RAMS è emersa l’importanza di una corretta e aggiornata rappresentazione dell’uso del suolo e delle caratteristiche e stato della vegetazione nei suoi schemi di calcolo.



Durante lo svolgimento delle attività, i punti critici sono apparsi più a livello puramente pratico e operativo che scientifico, e riguardano il forte impatto sulle programmazioni e l’articolazione temporale delle spesa di ricerca relativo alla necessità di coprire elevati costi per la permanenza all’interno dell’Area di Bologna. L’utilizzo di numerosi laboratori chimici, biochimici e fisici, oltre che di camere bianche sterili e camere di crescita climatizzate rende costosa la gestione ordinaria delle attrezzature. Molti degli strumenti, anche usati in campo per monitoraggio, sono al termine del loro ciclo d’uso nominale, e necessiterebbero di sostituzione o comunque di back-up.La parte di investimento della dotazione ordinaria concessa alla commessa nel 2005 ha consentito qualche soluzione alle maggiori urgenze. Altro punto critico è la carenza di personale strutturato, che rende difficile la continuità delle ricerche e soprattutto, l’ampliamento delle tematiche, virtualmente possibile ma difficilmente praticabile allo stato attuale.

Collaborazioni

Nessuno scostamento su collaborazione scientifiche,base di conoscenza per l’update conoscitivo della commessa:in campo internazionale,Università US (Davis,SanDiego,Colorado St.,Berkley),Uni Santiago Cile,Alterra NL,INRA, MaxPlank, numerose Univ Europee, ESF, Istituzioni afferenti a azioni COST 718 e 837,Commission Agricultural Meteorology WMO),Univ Bo,Fi, Ss,To,Ud,Pi,Pa,Pd.Alcune collaborazioni aggiuntive sono state attivate nel corso dei lavori, per favorire lo sviluppo e la qualità scientifica di alcuni moduli o attività, sia per favorire la nascita di nuovi progetti orientati a committente.L’aumento di sinergia tra moduli ha aumentato l’incisività progettuale, quindi si sono mantenute le collaborazioni previste con Associazioni Produttori, Cooperative e Consorzi(CRPV, CSO, Consorzi IGP,Agri2000), con spin-off(Geotema), Assessorati (regioni ER e Sardegna,prov. Fe),imprese (Hamamatsu, Servizi Territorio, Thermitalia, NI).Si sono attivate collaborazioni attive nel settore della fotobiologia con Ciba Speciality Chemicals,e studiate tematiche di sviluppo del settore valutazione qualità con Cefla,Sacmi,Buchi Italia interlocutori per possibili progetti comuni già dal 2006.


Non sono emersi scostamenti rispetto alle attività e alle attese, avendo la commessa portato avanti, se pure con qualche difficoltà dovuta a carenze di organico,attività di monitoraggio delle interazioni tra bosco,macchia mediterranea,specie agrarie,verde urbano e atmosfera,sviluppo di modelli e strumenti di misura,determinazioni ecofisiologiche e di laboratorio.La maggioranza delle attività era orientata a committenza,quindi si sono rispettati impegni e rendicontazioni,anche sotto forma di pubblicazioni e attività di divulgazione.Crescente attenzione è stata dedicata ai metodi di tipicizzazione del prodotto in funzione dell’ambiente,in previsione di maggiori richieste esterne, data la crescente attenzione verso sostenibilità e valorizzazione di territorio, redditività e qualità in un contesto agricolo attualmente in forte crisi.Su questo settore,la commessa ha attivato nel corso dell’anno un nuovo progetto con UniPr.Si sono dedicate risorse aggiuntive alla messa a punto di

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tecnologie verdi per il recupero del degrado e il miglioramento della qualità dell’ambiente naturale e antropizzato studiando in particolare aspetti di applicabilità da proporre a diverso livello di scala


Il confronto dimostra il perseguimento pressoché totale degli obiettivi.In particolare,sono stati sviluppati:metodologie di caratterizzazione agroclimatica basate su tecniche micrometeo e misure di radiazione al suolo.Flussi di energia e gas -CO2 e H2O- su sistemi di pregio(actinidia in Romagna,vite a Montalcino),attività sink di CO2 di una Kyoto forest.Proprietà ottiche vegetazione per determinazione stress.Report WMO raccomandazioni su vocazionalità e uso sostenibile del suolo.Analisi sensibilità ai cambiamenti climatici di ecosistemi a macchia medit. e aree agricole.Indice pericolosità incendi boschivi.Tecniche monitoraggio al suolo e remote sensing di gas inquinanti e PM10.Valutazione biochimico-sensoriale di produzioni agrarie(peroIGP,olio DOP).Selezione specie minori per valorizzazione e ripristino di zone marginali.Banche germoplasma di ecotipi per recupero ambientale e controllo del degrado tramite fitorimedio.Analisi chimiche emissioni sostanze organiche volatili per applicazioni ecofisiologiche e di compensazione-mitigazioni di impatti antropici.Protocolli e strategie innovative di contenimento eco-compatibili nei confronti di malattie del legno di vite e actinidia.



I contenuti e gli obiettivi di questa Commessa richiedono una particolare attenzione nel rapporto con i fruitori finali per una maggiore definizione dei risultati delle ricerche. Dovranno inoltre essere potenziati gli attuali livelli di collaborazione con altri enti e gruppi di ricerca nazionali e internazionali, al fine di garantire una sufficiente operatività. Si conferma comunque che punti critici essenziali sono rappresentati dall'eventuale non rinnovo del contratto al personale attualmente a tempo determinato e da un inadeguato contributo finanziario da parte della Sede Centrale.

Collaborazioni

Non si devono segnalare scostamenti tra le collaborazioni previste inizialmente e quelle realizzatesi nel corso del 2005. In particolare, le collaborazioni hanno riguardato: - la realizzazione di un prototipo semplificato di epiradiatore (Dipartimento di Economia e Sistema Arborei, Università di Sassari); - la realizzazione di una camera di crescita (Dipartimento di Scienze e Tecnologie Ambientali Forestali, Università di Firenze); - la realizzazione di un lisimetro elettronico a pesata, per il quale si prevede l'installazione nel corso del 2006 (Ente Regionale di Sviluppo e Assistenza Tecnica in agricoltuta, Regione Sardegna); - l'avvio della stesura del Volume "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" e relativo Seminario (ricercatori di altri Organi CNR).


Non si devono segnalare scostamenti tra i risultati attesi e quelli conseguiti nel corso del 2005


I risultati conseguiti risultano in accordo con quanto indicato in fase previsionale: - il Volume "Il calcolo approssimato per l'ingegneria agraria e le scienze ambientali" è in corso di stesura; degli otto capitoli di cui è costituito il volume sono stati completati i capitoli 1) Elementi della teoria degli errori, 2) Serie di Taylor e Analisi di Fourier, 3) Applicazioni dell'Analisi di Fourier e gran parte dei paragrafi esemplificativi degli altri capitoli; il resto del volume, il cui completamento è previsto per il giugno 2006, è in uno stato avanzato di stesura; - è stato realizzato un prototipo semplificato di epiradiatore; -

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le camere di crescita sono state completate e il lavoro è stato descritto in due pubblicazioni; - è stato realizzato un lisimetro elettronico a pesata e si è in attesa dell'individuazione del sito sperimentale da parte dell'Ente Regionale di Sviluppo e Assistenza Tecnica in agricoltuta della Regione Sardegna per la sua installazione; - il seminario "Il telerilevamento per il monitoraggio ambientale" si è svolto il 6 aprile 2005 e il volume 14° della Collana IBIMET, che riporta gli interventi del seminario, sarà pubblicato nel corso del dicembre 2005.

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Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: CLAUDIO CONESE Elenco dei partecipanti liv. Bacci Laura III Battista Piero III Conese Claudio I De Filippis Tiziana Antonietta III

liv.Falchi Maria Antonietta V Giannini Monica VII Liburdi Monica VII Maselli Fabio III

liv.Meneguzzo Francesco III Rapi Bernardo VI Romani Maurizio VII Vaccari Francesco Primo III

Temi

Tematiche di ricerca Sviluppo di tecnologie informatiche finalizzate all'elaborazione ed interpretazione di dati territoriali, con particolare attenzione all'integrazione tra GIS e sistemi per l'archiviazione di dati ed alle più aggiornate tecnologie per la realizzazione di applicazioni GIS dedicate. Utilizzo dei dati forniti dai satelliti di nuova generazione ad alta/media risoluzione (QUICKBIRD, SPOT, ASTER, MODIS, MERIS), anche per la componente marina, a bassa risoluzione (MSG) per gli aspetti meteorologici, ed alle misure iperspettrali da aereo per la stima, tra gli altri,di parametri ecologici(PPN)basilari nello studio degli ecosistemi agricoli e forestali. I campi di applicazione delle attività di ricerca possono essere schematizzati come segue: 1)Gestione risorse idriche e salvaguardia ambientale nel settore agricolo 2)Formazione e training sulle applicazioni GIS per l'allerta precoce in campo agroalimentare 3)Gestione ecosistemi agricoli tramite GIS e DSS 4)Prevenzione e gestione del fenomeno degli incendi forestali

Stato dell'arte L'applicazione di nuove tecnologie nello studio del territorio possono fornire validi strumenti sia nella gestione che nell'acquisizione di nuove conoscenze. In particolare l'uso integrato di G.I.S, database geografici e immagini satellitari ad alta risoluzione permette di avere una base di informazioni completa ed esaustiva per l'applicazione di modelli matematici per l'analisi di differenti aspetti del territorio e fenomeni naturali complessi (tematica 4). Le nuove normative nazionali ed internazionali nel campo dell'inquinamento di origine agricola, del risparmio e ottimizzazione dell'uso delle risorse naturali,della salvaguardia di ecosistemi naturali di alto valore aggiunto (foreste) danno indicazioni sulla necessità di identificare metodologie efficaci per ottenere risultati tangibili in tempi rapidi (tematica 1). La tendenza è quella di mettere a punto, a partire dai risultati della ricerca, strumenti operativi quali DSS e Sistemi software dedicati, direttamente utilizzabili da Enti ed Amministrazioni responsabili della gestione ambientale (tematiche 2 e 3).

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Azioni

Attività da svolgere Le attività di ricerca previste possono essere, in breve, così schematizzate: -metodologie per la gestione delle risorse idriche sia in ecosistemi naturali che agricoli e problematiche ad esse collegate (erosione, siccità) -monitoraggio di ecosistemi costieri (biodiversità, erosione) -metodi di ottimizzazione delle pratiche agricole e forestali - sistemi revisionali e valutazione del rischio di incendi boschivi - previsione ed analisi della vulnerabilità in PVS e sistemi di allerta - monitoraggio delle variazioni di uso suolo Si prevede l'avviamento di una attività di ricerca volta alla valutazione e trasferimento delle tecniche di telerilevamento da satellite al settore dei beni culturali archeologici, per valutare la propensione del dato satellitare all’individuazione ed allo studio di siti archeologici.

Punti critici e azioni da svolgere Le competenze e l'esperienza consolidata del personale unita alle collaborazioni instaurate garantisce un elevato livello di conoscenze e professionalità. La disponibilità dei dati per una certa area rappresenta quindi il primo fattore condizionante del lavoro. La possibilità di disporre di un ampio dataset di partenza e di una sinergia con le realtà operanti sul territorio,permette di raggiungere un' elevata risoluzione nell'applicazione della ricerca. Il livello di dettaglio dei risultati ottenibili è direttamente proporzionale ai dati di partenza, la mancanza dei quali non rende inapplicabile la ricerca me ne condiziona i risultati. Il punto critico principale nell'organizzazione delle attività risulta sempre più essere la cronica mancanza di personale strutturato che possa garantire la basilare continuità sia nelle attività di ricerca che in quelle di promozione e ricerca di nuovi finanziamenti.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine L'insieme delle attività della Commessa richiede un ampio spettro di competenze (da quelle agronomiche a quelle ingegneristiche e software) che garantiscano un approccio interdisciplinare. Competenze e tecnologie di base possono essere così schematizzate: 1)Utilizzo tecnologie GIS e relativa programmazione per applicazioni dedicate, procedure automatiche di image processing (dati aerei e satellitari), elaborazione ed interpretazione dei dati territoriali, conoscenza degli ecosistemi agrari e forestali, tecniche di modellizzazione degli ecosistemi, tecniche di analisi, monitoraggio e studio delle dinamiche meteorologiche della zona costiera. 2) GIS, database GIS oriented, tecniche di Earth Observation, sistemi di misura dei parametri agro-meteorologici, ecosistemici e costieri, integrazione di GIS/GPS per raccolta di verità a terra . 3) Modellistica ambientale, analisi di dati di remote sensing, implementazione di DSS ed integrazione dati ambientali per la realizzazione di possibili scenari.

Collaborazioni (partner e committenti) Collaborazioni a livello nazionale ed internazionale, sono già in atto da tempo per lo svolgimento dei molteplici aspetti della ricerca. La collaborazione con Istituzioni attive nella Cooperazione Internazionale, con Enti locali e con Ministeri facilita il contatto con le problematiche ambientali e legate ai diversi territori. Inoltre fondamentali sono i contatti citati per il reperimento dei dati storici,la validazione dei risultati e la diffusione delle innovazioni sul territorio. A livello internazionale da anni è attiva la partecipazione a progetti europei. Il supporto alla ricerca viene fornito anche ad Enti privati e ditte nazionali ed estere. Per le tematiche ai punti 1), 3), e 4)sono attive collaborazioni con il, MIUR, vari Enti Regionali in Italia, U.E., Dipartimenti di varie Università italiane quali Napoli (Federico II),Torino,Tuscia, per le attività dei punti 2) e 3) le collaborazioni sono attive anche con il Ministero Affari Esteri, WMO, Agrimet e Paesi dell'area Saheliana.

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Finalità

Obiettivi Le attività svolte si propongono i seguenti obiettivi: -modellizzazione delle relazioni ed interazioni che intercorrono tra le varie "componenti" del territorio e tra differenti sistemi naturali. -analisi ed applicazioni dei dati ottenibili da telerilevamento, -studio delle possibili applicazioni dei GIS al settore agricolo e forestale ed integrazione in questi di modelli matematici -studio di metodologie innovative per l'ottimizzazione nell'uso delle risorse in campo agricolo ed orticolo.

Risultati attesi nell'anno I risultati riguardano soprattutto le nuove possibilità di applicazione delle tecnologie GIS e di Osservazione delle terra nel controllo, monitoraggio e gestione del territorio. Le metodologie di integrazione tra differenti strumenti informatici miglioreranno le applicazioni le operazioni di aggiornamento dei dati, aumentando l'operatività dei sistemi. In particolare, per i temi di ricerca indicati: 1) Realizzazione di sistemi automatici esperti (software operativo) per l'indagine del funzionamento degli ecosistemi agricoli quali strumenti operativi e gestionali. 2) Progettazione e realizzazione di corsi di formazione per operatori del settore agricolo (Europa e Paesi Terzi) basati sulle competenze maturate nel settore delle applicazioni GIS alla gestione di ecosistemi agricoli e naturali e del territorio. 3) e 4) Realizzazione di modelli ed algoritmi e loro sviluppo in ambiente software GIS, per rispondere alle diverse esigenze degli Enti preposti alla gestione ambientale. Risultati e prodotti saranno a disposizione di tutte le realtà operanti nel settore, previa stipula di accordi. Attività e risultati saranno divulgati tramite pubblicazioni e workshops.

Potenziale impiego - per processi produttivi Le attività di ricerca sono finalizzate all'implemetazione di prototipi SW e DSS in ambito agroforestale ed agrometeo che possano successivamente essere utilizzati per la realizzazione di strumenti sw operativi.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi - Prevenzione, monitoraggio e gestione dei rischi naturali. - Previsioni e proiezioni in funzione di differenti variabili ambientali. - Supporto agli Enti locali per studi scientifici relativi a particolari emergenze territoriali.

Moduli

Modulo: Gestione delle risorse del territorio mediante tecnologie informatiche innovative

Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9385 117 498 20 1020 375 990 84 N.D. 1479


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Altro Totale

0 0 0 0 0 1 0 0 0 1



Dinamica dei sistemi agro-forestali; vulnerabilità, adattamento, mitigazione

Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FRANCESCO MIGLIETTA Elenco dei partecipanti liv. Baraldi Rita II Falchi Maria Antonietta V Genesio Lorenzo II Giannini Monica VII Gioli Beniamino II

liv.Govoni Mafalda VIIILiburdi Monica VII Massetti Luciano II Meneguzzo Francesco III Miglietta Francesco I

liv.Pellegrino Laura V Sabatini Francesco V Vaccari Francesco Primo III Zaldei Alessandro VI

Temi

Tematiche di ricerca Sviluppo di sistemi sperimentali di campo per lo studio degli effetti dei diversi fattori di cambiamento Determinazione di stati di stress delle vegetazione mediante sistemi di telerilevamento (termico e multispettrale) da aereo Analisi dell'effetto di elevate concentrazioni di CO2 atmosferica su produttività di colture agrarie e qualità delle produzioni Campagne di misura a scala regionale, nazionale ed globale per la misura diretta del sequestro di CO2 nei sistemi agricoli e forestali

Stato dell'arte Il sistema agro-alimentare e quello forestale sono vulnerabili di fronte ai diversi e principali fattori di cambiamento. Variazioni delle caratteristiche chimiche dell'atmosfera (aumento di concentrazione di CO2, ozono troposferico, deposizioni di azoto etc.) e variazione delle caratteristiche climatiche (aumento di temperatura, variazione del regime pluviometrico, eventi estremi) espongono il sistema a rischi significativi che possono avere conseguenze sulla produttività primaria

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Azioni

Attività da svolgere La commessa è costituita da una serie di progetti di rilevanza regionale, nazionale ed internazionale che riguardano specifici aspetti relativi a: misura di emissioni ed assorbimenti di carbonio ed altri gas traccia nel sistema agroforestale mediante tecnologie innovative, stima degli effetti di variabili ambientali sulla produttività degli ecosistemi, analisi della vulnerabilità di sistemi forestali ed agricoli, bilancio del carbonio a scale colturali, regionali e globali. Tutte queste attività sono inquadrate nell'ambito di diversi progetti nazionali ed internazionali, soprattutto Europei. Nel 2006 potrebbero essere finanziati altri progetti che aprirebbero nuove prospettive per la ricerca in campo internazionale con particolare riferimento al bilancio del carbonio del continente africano. In questa prospettiva, verranno svolte attività sperimentali per misure in campo, soprattutto con piattaforme aeree. L'attività verrà svolta sia in Italia che al di fuori dei confini nazionali, in accordo alle precise committenze avute dai progetti nazionali ed europei finanziati.

Punti critici e azioni da svolgere La mancanza di prospettive certe per l'assunzione di personale a tempo indeterminato e per la formazione di nuovi ricercatori rimane la maggiore difficoltà ed il punto critico più importante. E' difficile poter rispondere alle esidenze di grandi progetti internazionali non potendo contare su personale motivato e con prospettive di impiego certe. Altre severe difficoltà nascono nella gestione ed operatività di strumentazione avanzata in possesso dell'Istituto, con riferimento al velivolo sperimentale Sky Arrow ERA. E' assai complesso garantire tale operatività non potendo disporre di strumenti flessibili per fare accordi preventive e di lungo termine, con società private di lavoro aereo. Non può nenache essere taciuta la oggettiva difficoltà di gestione dovuta al meccanismo delle deleghe per poter stipulare contratti ed attività conto terzi. In molti casi, il rallentamento dovuto al complesso meccanismo può causare inutili ritardi nell'attività di ricerca.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Gli aspetti tecnologici sono una componente fondamentale di questa attività di ricerca. Sia per la realizzazione di misure avanzate nel sistema agroforestale sia per realizzare sistemi innovativi di sperimentazione agrarie e forestale. L'oggetto di queste competenze tecnologiche è parte integrante del lavoro e talvolta ne rappresenta l'output più significativo. Va rilevato, in questa sede, che alcune delle attività di sviluppo tecnologico hanno già avuto importanti ricadute applicative. I sistemi FACE sviluppati da Ibimet sono in uso negli USA, Irlanda, UK, Danimarca, Olanda, Francia. Germania, Svezia, Finlandia, Svizzera, Ungheria, Italia, India ed Australia. Il velivolo sperimentale Sky Arrow ERA che è stato sviluppato in collaborazione con una nota industria aeronautica italiana è già stato commercializzato in USA, Svezia, Olanda ed Italia.

Collaborazioni (partner e committenti) Le collaborazioni internazionali attive o da attivare riguardano circa una centinaio di laboratori europei (Progetti UE), altri organi CNR e diverse Università italiane. Sono già attive collaborazioni consolidate con Università ed Organismi di ricerca USA nell'ambito dell'accordo bilaterale di collaborazione fra governo italiano e statunitense. La realizzazione di attività di networking delle rete internazionali prevede collaborazioni con 215 organizzazioni che sono inserite nella rete Fluxnet

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Finalità

Obiettivi Quantificare gli effetti delle variazioni ambientali attese su produzione, qualità e sostenibilità del sistema agro-forestale mediante attività sperimentali e modellistica Definire soglie di rischio e di vulnerabilità anche mediante lo sviluppo di indici specifici Definire strategie di adattamento e proporre azioni di mitigazione inserite nel contesto delle Convenzioni Internazionali

Risultati attesi nell'anno Pur nella loro complessa articolazione, si può dire che l'insieme dei progetti esterni che costituiscono l'ossatura di questa commessa, rientrano nell'obiettivo generale di contribuire a delucidare meccanismi e dinamiche egli ecosistemi terrestri in rapporto alle priorità stabilite dalle grandi convenzioni internazionali, ed in particolare l'UNFCCC. Nel corso del 2006 si pensa di riuscire a mettere a punto un tecnica per arrivare a misurare lo scambio complessivo di C che avviene tra superfici vegetate ed atmosfera mediante misure di flusso fatte da aereo. Questa tecnica innovativa verrà poi applicata a dati di campagne di misura già svolte o in corso di svolgimento per arrivare a ridurre le incertezze relative allo scambio di C fra vegetazione ed atmosfera a scala regionale. Fra le altre priorità, il lavoro proevisto porterà a nuove conoscenze sull'effetto delle precipitazioni sulle emissioni di protossido d'azoto in suoli forestali mediterranei (NitroEurope IP) e sul bilancio di C (MIND, STREP). I dati delle diverse stazioni Ibimet disolcate sul terriotorio nazionale contribuiranno ad aumentare le conoscenze sul ruolo degli ecosistemi terrestri nel ciclo globale del Carbonio



Moduli

Modulo: Dinamica dei sistemi agro-forestali; vulnerabilità, adattamento, mitigazione Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9387 117 477 25 1006 459 1053 85 N.D. 1550




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Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0




Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: ANTONIO RASCHI Elenco dei partecipanti liv. Barazutti Maurizio V Bazzani Guido Maria III Caggiati Paolo II Camilli Francesca III Cherubini Lucia III Crisci Alfonso III Falchi Maria Antonietta V

liv.Giannini Monica VII Guarnieri Paolo III Lanini Giuseppe Mario VI Lelli Maria Rosa IV Liburdi Monica VII Meneguzzo Francesco III

liv.Pagliarino Elena III Pasqui Massimiliano III Raschi Antonio II Sarti Danio II Tagliaferri Giacomo V Vanelli Pietro IV

Temi

Tematiche di ricerca Valutazione delle potenzialità economiche e occupazionali di aree rurali nella prospettiva di un sistema agricolo multifunzionale integrato nella realtà locale. Realizzazione di indagini sulla realtà economica e ambientale e sulla identità culturale di aree campione, tramite raccolta e analisi di dati,interviste e focus groups. Sviluppo di modelli e di strumenti di supporto alla decisione, e di analisi di scenario, per una maggiore efficienza economica delle aree rurali. Valutazione delle risorse in ottica di filiera e di ambito territoriale; analisi quali- quantitative per lo sviluppo di organismi operanti nel settore agroalimentare. Analisi dei processi produttivi e della gestione aziendale. Messa a punto di metodologie di comunicazione per una migliore connotazione della identità territoriale e per l'informazione e la formazione di attori coinvolti (amministrazioni, imprese, scuola, associazionismo).

Stato dell'arte Le trasformazioni socioeconomiche degli ultimi decenni, legate anche alla globalizzazione, hanno modificato profondamente identità culturale e ruolo economico delle aree rurali, con un impoverimento della cultura locale, della conoscenza del territorio, e riduzione delle possibilità di sviluppo economico. Le iniziative LEADER, gli impegni del Fondo Sociale Europeo, la PAC mirano a rilanciare modolli di sviluppo più complessi, ponendo l'accento non solo sulla attività produttiva, ma anche sugli aspetti ambientali e sociali. In tale quadro il mondo della ricerca può essere motore dello sviluppo locale, ove, sulla base di una analisi delle potenzialità, sia in grado di proporre strategie di

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sviluppo basate sulla diversificazione nell'uso delle risorse locali, nel quadro più generale della globalizzazione economica. Tale azione deve essere svolta in collaborazione con gli attori già presenti sul territorio (amministrazioni, imprenditoria, scuola) per favorire uno sviluppo sostenibile, che garantisca le necessità presenti preservando e incrementando il capitale ambientale, sociale, umano e infrastrutturale.

Azioni

Attività da svolgere Elaborazione e sperimentazione di modelli di indagine e loro applicazione in diverse realtà territoriali. Definizione, applicazione e validazione di modelli di orientamento, di comunicazione e di informazione. Analisi economiche basate su dati territoriali e si dati contabili aziendali. Valutazione di risorse agroambientali e di agrotecnologie, per la messa a punto di modelli di sviluppo. Messa a punto e valutazione di moduli didattici finalizzati alla comprensione della realtà territoriale. Analisi delle potenzialità produttive e commerciali di colture da fibra e di colture tintorie. Analisi di mercato relative a prodotti tipici. Produzione e fornitura di supporti metodologici e informativi a soggetti privati e pubblici per migliorare i processi decisionali e la sostenibilità economica, sociale e ambientale. Predisposizione di modelli di simulazione e loro applicazione ai sistemi aziendali, analisi quali- quantitative per la pianificazione strategica e per lo sviluppo di organismi operanti nel settore agro-alimentare.

Punti critici e azioni da svolgere - Fase congiunturale sfavorevole per il settore agricolo - Scarsa dimestichezza delle imprese con il mondo della ricerca - Scarsa disponibilità al cofinanziamento - Scarsa collaborazione fra imprese e realtà istituzionali Si prevede di affrontare tali punti critici tramite azioni volte al coinvolgimento degli attori presenti sul territorio, e tramite una capillare azione informativa da svolgersi di concerto con quelli, fra gli attori presenti sul territorio, che mostrano maggiore disponibilità alle istanze della ricerca. - Scarsità di personale con contratti a tempo indeterminato, che limita le possibilità di realizzare attività di lungo periodo. Si ritiene che l'adeguamento degli organici dell'Ente, e un sostegno alla formazione del personale, anche tramite borse di studio per l'estero, sia indispensabile per poter continuare a dare una risposta adeguata alle richieste della società.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenze disponibili sono relative a economia e politica agraria e ambientale, modellistica, analisi dati, comunicazione e divulgazione di tematiche socioeconomiche e scientifiche. Le tecniche di indagine sono: quelle della scienza economica con approcci "micro" (analisi a livello aziendale) e "macro" (studi settoriali di produzione e di mercato, analisi economica delle risorse naturali e agrarie, analisi delle preferenze dei consumatori); quelle delle scienze sociali (focus groups, questionari, interviste strutturate e semistrutturate, sviluppo di metodologie di comunicazione); quelle della ricerca agronomica, per la valutazione di agro-tecnologie; lo sviluppo di modelli di simulazione e la loro applicazione.

Collaborazioni (partner e committenti) L'attività è svolta di concerto con Istituzioni pubbliche locali, con il mondo della scuola, con l'associazionismo e con imprese. Fra le istituzioni, Ministero del Welfare, Regioni (Emilia Romagna e Toscana), Provincie (Prov. Autonoma di Trento),(Comunità Montane (Casentino, Valtiberina Toscana, Fortore, Alto Tammaro), Comprensori (Alta Valsugana, Bassa Valsugana e Tesino), Comuni, ARPA, Consorzi (Arezzo Innovazione), Consorzi di Bonifica, UNIBO - Dip. DEIAGRA, UNIPD - Dip. TESAF, UNIPR, Università di York, Università di Reading, CNRS, Univ. Minnesota, Segr. di Stato per il Territorio della Rep. di San Marino, Univ. di Guadalajara (Messico), Fondazione per l'artigianato artistico, Prog. EUROACADEMY, Progetto COST E33, Università di Godollo (Ungheria).

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Finalità

Obiettivi Contribuire alla valorizzazione delle potenzialità economiche e occupazionali di aree rurali, tramite proposte di diversificazione delle attività, anche nella prospettiva di una agricoltura multifunzionale. Valutare il rapporto esistente fra la popolazione e il proprio territorio. Agire sul mondo giovanile, aiutandolo ad identificare le potenzialità di sviluppo sostenibile, tramite una conoscenza più approfondita del proprio territorio. Proporre tecniche di divulgazione, e mettere a punto metodi e modelli per l'orientamento professionale dei giovani, basati sulla conoscenza delle risorse locali. Valutare la sostenibilità economica e ambientale di tecniche agrarie e colture. Tutelare le risorse ambientali sociali culturali e infrastrutturali. Produrre supporti metodologici e informativi per orientare i processi decisionali. Mettere a punto metodi e supporti per la gestione aziendale, attraverso la monitorizzazione di aziende agrarie.

Risultati attesi nell'anno Validazione del modello di indagine sulle opportunità occupazionali in aree rurali e dei modelli di comunicazione e orientamento. Messa a punto di un prototipo di un "Sistema di Supporto alla Gestione delle Risorse Idriche in Agricoltura". Messa a punto di software per l'ottimizzazione delle risorse a livello aziendale.Elaborazione di proposte operative per lo sviluppo del Centro Agro-alimentare di Parma. Indagini di mercato, e messa a punto di proposte innovative su prodotti tipici nel settore non alimentare. Sperimentazione di tecniche agrarie sostenibili dal punto di vista economico e ambientale. Elaborazione di modelli per la valutazione dei flussi turistici in aree rurali. Elaborazione di moduli didattici relativi alla realtà territoriale, per scuole di grado diverso. Organizzazione di incontri e convegni sui temi oggetto della ricerca. Pubblicazione di articoli su riviste e atti di convegni.

Potenziale impiego - per processi produttivi L'attività relativa alle valutazione dei processi produttivi e della gestione aziendale è svolta in stretto contatto con aziende agricole, monitorandone i dati di bilancio. Altrettanto avviene per la valutazione di tecniche agronomiche e di produzioni agrarie alternative (quali la semina su sodo e la produzione di piante da fibra o di piante tintorie), che sono analizzate a livello aziendale e non solo a livello parcellare. Uno stretto contatto con il mondo della produzione è di primaria importanza anche per ciò che riguarda l'analisi delle preferenze di mercato e l'analisi sensoriale di prodotti tramite panel test. Si ritiene pertanto che le attività svolte possano essere facilmente oggetto di impiego nel mondo della produzione.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi La situazione critica del settore agricolo è ovviamente nota agli imprenditori, e almeno in parte agli amministratori locali, dal contatto con i quali è spesso emersa l'esigenza di un supporto scientifico a innovazioni che possano favorire lo sviluppo sostenibile locale nel quadro della globalizzazione. E' inoltre evidente come tale finalità possa realizzarsi solo ove vi sia piena coscienza, da parte dei decisori e della popolazione, delle potenzialità del territorio; a questo proposito è emersa ripetutamente la necessità di iniziare azioni informative riguardo al territorio in ambiente scolastico, per far sì che la scuola non sia un organismo autoreferenziale, ma possa favorire un completo inserimento dei giovani, anche a fine lavorativi. A tale esigenza sociale risponde lo sviluppo di attività e metodologie informative previsto dalla presente commessa.

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Moduli

Modulo: Sviluppo rurale, occupazione ed identità culturale Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9644 117 969 20 1750 704 1790 101 N.D. 2555







Collaboratore professionale Altro Totale

0 0 0 4 0 0 0 0 0 4




Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GAETANO ZIPOLI Elenco dei partecipanti liv. Brandini Carlo III Calastrini Francesca III Cappugi Andrea III Falchi Maria Antonietta V Fibbi Luca III Giannini Monica VII Giannozzi Elvira VI

liv.Gozzini Bernardo II Grifoni Daniele III Gualtieri Giovanni III Liburdi Monica VII Mazza Alessandro III Melani Samantha III Meneguzzo Francesco III

liv.Ortolani Alberto II Pasi Francesco III Pieri Maurizio III Sabatini Francesco V Zanchi Bernardo III Zipoli Gaetano I

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Temi

Tematiche di ricerca Acquisizione dei dati fisici delle aree relativi a morfologia, geo- pedologia, climatologia, uso del suolo e loro georeferenziazione. Sviluppo e valutazione comparata di modelli meteorologici a diversa scala temporale per il loro impiego in modelli di crescita/sviluppo delle colture (per esempio frumento) e dei loro organismi patogeni (per esempio peronospora della vite) e per una spazializzazione dinamica dei dati agrometeorologici.

Stato dell'arte Il sistema agro-alimentare (intendendo sia le imprese che la P.A.per le produzioni vegetali ed animali) per operare in maniera più efficiente e sostenibile si avvale di metodologie innovative per la previsione, a varie scale spaziotemporali, delle produzioni agricole, sia in termini quantitativi che qualitativi. Inoltre condizione di successo di scelte sull'utilizzo delle risorse del territorio è la disponibilità di strumenti che consentano di valutare ex ante gli effetti di eventuali decisioni.

Azioni

Attività da svolgere Valutazione delle performances dei moduli fin’ora implementati. Prosecuzione della raccolta di dati e schemi di calcolo per i vari moduli dei DSS. Prosecuzione dell’attività di sviluppo e gestione di modelli agrometeorologici per la realizzazione di previsioni a diversa scala spazio-temporale con particolare riferimento alle problematiche della gestione della chioma nei vigneti. Monitoraggio di parametri agrometeo da reti di stazioni sperimentali. Caratterizzazione della variabilità climatica all’interno di vigneti. Monitoraggio della rad. ultravioletta biologicamente efficace mediante una rete di sensori. Analisi agroclimatiche a scala regionale anche per la valutazione della vocazionalità del territorio nei confronti di materiale genetico di diversa origine.Gestione e valutazione di un modello alla mesoscala (RAMS) anche ai fini di protezione civile. Ulteriore implementazione del modello di stima della produttività di frumento duro. Modellizzazione della distribuzione di O3 troposferico anche per la valutazione dei danni alla vegetazione. Studio di fattibilità di un progetto di rete telematica per la mobilità anche dei prodotti agro-alimentari

Punti critici e azioni da svolgere Lo sbilanciamento tra personale scientifico strutturato e quello a contratto insieme alla condizione di precarietà di quest’ultimo rimane tuttora il principale elemento di criticità interna. Vi è anche la consapevolezza della difficoltà nel coordinare molteplici attività che richiedono competenze anche assai diverse; ma proprio quest’approccio interdisciplinare appare ancora di più come condizione di successo potenziale dell’iniziativa scientifica. Continuano a pesare infine le difficoltà a interagire in modo meno occasionale e superficiale con le imprese. Ciò nonostante la proposta ha notevoli possibilità di successo perché risponde ad una domanda di ricerca del sistema produttivo del settore e perché beneficia della lunga esperienza scientifica dell'Istit. proponente e delle sue collaborazioni anche a livello internazionale. Ciò è dimostrato dal numero e dal budget dei progetti esterni che la finanziano.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Sono disponibili presso la struttura le conoscenze di modellistica relative ai processi biologici e fisici che si intende simulare: ciò non toglie che tali competenze debbano essere ampliate e approfondite. Allo stesso modo sono disponibili le tecnologie di calcolo, alcune sviluppate nell'ambito di quest'attività di ricerca, per le simulazioni dei processi bio-fisici.

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Collaborazioni (partner e committenti) Regione Toscana. UniFi, Dip scienze agromoniche e gestione del territorio agroforestale e Centro Interdip. Bioclimatologia. MAE: Ist.Agromonico per l'Oltremare. MIPAF: UCEA, Roma. INRA: Laboratoire de Bioclimatologia, Avignon. USDA: Water Conservation Lab, Phoenix. Univ of Montana, UM Numerical Terradynamic Simul.Group, Missoula. Univ Fort Collins, Colorado, USA. WMO, Commis.di Agrometeorologia. FAO, Roma. Servizi agrometeo regionali. Vitrociset, Datamat, Roma. COST Action 718.

Finalità

Obiettivi Messa a punto di prototipi di SSD per la previsione dei raccolti e della qualità dei prodotti alimentari, per la gestione sostenibile delle operazioni colturali e per la previsione degli impatti sull'attività agricola portate dalle modificazioni del territorio. L'implementazione dei SSD richiede l'integrazione di competenze agrometeoclimatologiche, di modellistica numerica dei processi funzionali degli ecosistemi agroforestali, di gestione dei dati fisici del territorio tramite GIS.

Risultati attesi nell'anno Review della letteratura scientifica relativa ai DSS. Messa a punto di un modello della distribuzione spettrale della rad. solare in colture a filare .. Descrizione della variabilità spaziale delle grandezze agrometeo in vigneti di collina in relazione alla distribuzione spaziale dei fattori di qualità dell’uva. Primi risultati degli effetti su fattori responsabili della qualità dei mosti dell’esposizione dei grappoli alla radiazione solare. Analisi dei trend storici della radiazione UV biologicamente efficace anche in relazione ai suoi effetti su salute umana e funzionalità degli ecosistemi vegetali. Pubblicazione su apposite pagine web dei dati di monitoraggio UV.. Prime uscite di mappe di ozono troposferico. Ulteriori applicazioni del modello di produttività potenziale per il frumento duro.per l’ottimizzazione delle scelte strategiche di aziende agro-alimentari. Realizzazione di ulteriori prodotti operativi relativi all’applicazione dei SIT per la valorizzazione delle risorse territoriali a scala regionale. Prototipo di una rete di “infomobilità” a scala regionale. Ampliamento del DB climatico e territoriale

Potenziale impiego - per processi produttivi I possibili impieghi dei DSS sono molto numerosi e sono riferibili prevalentemente all’ottimizzazione degli aspetti gestionali sia in azienda (quando e come intervenire con le varie operazioni colturali e non) che in più ampi comprensori dove deve essere valutata per esempio la vocazionalità di un territorio per certi usi agro-forestali ovvero i rischi a cui può essere esposto in funzione di questi.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Ovviamente i DSS rappresentano importanti strumenti a supporto delle decisioni che operatori singoli o collettivi (singoli agricoltori o associazioni/cooperative di agricoltori per esempio) devono prendere durante le varie fasi delle loro attività. Così la decisione di intervenire con irrigazione antibrina (costosa e d'impatto sulle risorse del territorio) può essere resa più efficace grazie alle conoscenze agrometeorologiche codificate in um modello operativo di previsione delle gelate tardive, che interessano prevalentemente le produzioni agricole.

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Moduli

Modulo: Sistemi di supporto alle decisioni per una gestione sostenibile del sistema agricolo e delle filiere agro-industriali

Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9672 117 504 28 1321 312 933 102 N.D. 1735








Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0




Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sezione di Bologna Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FEDERICA ROSSI

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Elenco dei partecipanti liv. Arca Angelo VI Arca Bachisio III Baraldi Rita II Barazutti Maurizio V Benincasa Fabrizio I Bertazza Gianpaolo III Canu Annalisa III Cesaraccio Carla III Di Marco Stefano III Duce Pierpaolo II

liv. Facini Osvaldo III Gelli Carlo V Georgiadis Teodoro II Govoni Mafalda VIIILelli Maria Rosa IV Magli Massimiliano IV Minghetti Robert V Mustacciu Barbara VII Pellizzaro Grazia III

liv.Predieri Stefano III Rapparini Francesca III Rossi Federica II Rotondi Annalisa III Trebbi Donatella VI Valli Anna Rita VII Vanelli Pietro IV Ventura Andrea III Zara Pierpaolo VI

Temi

Tematiche di ricerca Applicazioni di metodi di monitoraggio micrometeorologico e ecofisiologico a diverse tipologie di sistemi naturali e antropizzati. Sviluppo di strumentazione, di modelli previsionali e di indici di rischio. Applicazioni operative in agrometeorologia, studio sull’uso sostenibile delle risorse non rinnovabili e ottimizzazione dell’uso di risorse rinnovabili, analisi dei processi di interazione atmosfera-superficie per la definizione delle attività di compensazione e mitigazione ambientale operate da superfici vegetali in aree rurali, urbane e peri-urbane. Ripristino di zone e ambienti degradati, sviluppo di metodologie di sostegno allo sviluppo di aree marginali e di riconversione culturale. Supporto all’innovazione di filiere produttive tipiche (legate a marchio) e di qualità. Recupero e valorizzazione della biodiversità per mantenimento e salvaguardia di ecosistemi naturali e gestione sostenibile dei sistemi agrari. Studio delle interazioni pianta-patogeno-ambiente, dei riflessi ecofisiologici e produttivi di alcune fisiopatie, e del loro contenimento con prodotti ecocompatibili. Sviluppo di tecnologie per contributi all'applicazione delle politiche comunitarie.

Stato dell'arte I processi di interazione tra superfici e atmosfera sono in continuo studio, dato che occorre non solo comprendere i fenomeni atmosferici e biologici alla base delle loro dinamiche, ma si ricercano strumenti e indicatori affidabili, semplici o semplificabili, che possano essere usati in ricerche di tipo applicativo:a valenza agrometeorologica per l’ottimizzazione di risorse rinnovabili e non, di protezione di ecosistemi e sistemi agrari, di vocazionalità territoriale e valorizzazione delle produzioni locali. In questo senso si sviluppano sensori, modelli e indici anche a fini operativi. La quantificazione dei benefici ambientali legati all’uso della vegetazione come compensazione e mitigazione ha citazioni molto recenti, e la commessa integra tale base con osservazioni sperimentali legate a processi di deposizione di gas e particelle, di emissioni/inventari di VOCs, oltre che a tecnologie verdi. Per tracciabilità e qualificazione dei prodotti, si integrano in modo originale le metodologie analitiche di caratterizzazione qualitativa in laboratorio, diffuse in bibliografia come indicatori esclusivi di qualità, con tecniche sensoriali, di consumer science e applicazioni statistiche.

Azioni

Attività da svolgere Applicazioni di metodi di monitoraggio dei processi di scambio tra sistemi (bosco,macchia mediterranea,specie agrarie) e atmosfera.Sviluppo modelli,strumenti e indici di rischio: dinamiche della qualità dell’aria,pericolosità e propagazione incendi boschivi,erosione suolo,rischio climatico specie agrarie e forestali,fenologia.Determinazione delle attività di sink e delle emissioni di diverse specie agrarie e forestali per messa a punto di progetti di mitigazione e compensazione ambientale.Selezione e mantenimento di materiale autoctono e specie minori per l’aumento della

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biodiversità e per il recupero di aree marginali.Messa a punto di tecnologie verdi per la qualità dell'ambiente naturale e antropizzato basate su fitorimedio, fitodepurazione,mitigazione e compensazione.Predisposizione di siti web interattivi per agrometeorologia e qualità.Definizioni di metodologie di analisi sensoriale e consumer science per la valutazione della qualità “globale” del prodotto (nutrizionale,salutistico,rispetto ambientale,gradimento.Studi su alcune interazioni pianta-patogeno-ambiente,su riflessi ecofisiologici e produttivi di alcune fisiopatie,e loro contenimento con prodotti ecocompatibili.

Punti critici e azioni da svolgere Le competenze e le risorse interne, unitamente ad una consolidata rete di collaborazioni sia con RTD e SMEs configurano un quadro favorevole nell'analisi delle condizioni di fattibilità. Si configurano alcune criticità tra cui si rimarca l'assenza di turn-over e la limitazione strutturale del rapporto investimento/funzionamento, soprattutto per le attrezzature di laboratorio, alcune delle quali, essenziali per le ricerche in atto anche su commissione, ormai molto vecchie, e la sensoristica ambientale che, operando in condizioni esterne, è velocemente deperibile. Le strumentazione e le competenze disponibili, anche se per ora adeguate, richiedono quindi, sul lungo periodo, una politica di consolidamento per garantire competitività e risultati. I ricercatori afferenti alla commessa stanno svolgendo un notevole sforzo anche sulla comunicazione verso l’esterno (scuole, giornali e TV, associazioni) per costruire un quadro sulle possibilità e le esigenze di ricadute operative e mirare la propria progettualità alle reali esigenze della produzione agricola e industriale ad essa collegata.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenze sono interdisciplinari, e coinvolgono agronomia, micrometeorologia, ecofisiologia, fisiologia, biochimica, statistica, informatica. Tecnologie e tecniche di indagine principali sono: Misure micrometeorologiche di gradiente, eddy covariance, eddy accumulation, surface renewal per monitoraggio degli scambi atmosfera-superficie. Laboratori di elettronica per lo sviluppo di strumentazione meteorologica e agrometeorologica. Modellistica ambientale, meteorologica, fenologica e di crescita delle colture. Misure remote sensing da ultraleggero e elaborazione immagini da piattaforme satellitari. GIS. Sistema automatico manipolazione climatica in pieno campo. Celle climatiche. Misure ecofisiologiche (scambi gassosi, valutazione stati di stress). Tecniche, metodologie e laboratori di colture in vitro. Laboratori di biochimica e di analisi istologica. Gascromatografia e spettrometria di massa per analisi fisiologiche, biochimiche (acidi organici, carboidrati, nutraceutici). Metodologie di GC MS per l’analisi di profili di sostanze organiche volatili aromatiche. Laboratorio di analisi sensoriale. Metodologie di consumer science. Trasferimento servizi e modelli tramite web.

Collaborazioni (partner e committenti) Principali committenti: MIUR, MiPAF, Regione Emilia Romagna, Regione Sicilia, Ciba Photochemicals, UniBo, CRPV, CIV, Comunità Montana 5 Valli, Consorzio MelaPiu’, Consorzio Agrario Forli’, ATS Siqual, ATS Laria. Collaborazioni principali: Con Istituzioni e Associazioni Internazionali: WMO, ESF, EC, FAO, INSAM, ISB, AMS. Con Istituzioni di Ricerca Internazionali : Univ. California, Davis; Colorado State Uni, Fort Collins; RISOE (DK); NCAR, Boulder; Univ Barcellona, Es; Uni Chile, Santiago; HortRes NZ, numerose Univ coinvolte in azioni congiunte ESF e EC. Con Istituzioni di Ricerca Nazionali: Uni Ss; Bo; Vt; Mo-Re; To; Fi; Le, Ba, Pa, Pr, Te, Mi Bicocca; Regina Apostolorum; CNR ISAC; ISOF; IPI; Nucleo Ricerca Desertificazione. Con Organismi, Associazioni, Imprese: CRA; UCEA; Regione Sardegna; Regione Emilia-Romagna; Ente Foreste; Corpo Forestale; CSO; Coldiretti; Geotema; COSOT; GAL Appennino Bolognese; Agri2000; SACMI; CEFLA; CAMST; Agenzia Ambito Fe; ARPA ER, SAR Sardegna, Servizi Territorio; Hamamatsu Photonycs; Thermitalia; National Instruments etc.

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Finalità

Obiettivi L’obiettivo generale sta nella comprensione dei diversi aspetti di relazioni tra sistemi naturali e antropizzati,atmosfera e territorio per sviluppare indici di rischio,ottimizzare processi ecofisiologici e produttivi fortemente orientati verso qualità,sanità e sostenibilità.Nello specifico: Definire la dinamica dei processi di scambio,per lo sviluppo delle conoscenze dei meccanismi di base ma,soprattutto,per la messa a punto di metodologie operative che favoriscano una gestione sostenibile.Salvaguardare ecosistemi a rischio,sia tramite monitoraggio degli stati di stress che tramite recupero e valorizzazione della biodiversità di specie autoctone.Supportare la sostenibilità dei processi di filiera per l’ottenimento di una produzione di qualità in senso allargato,che concili la tutela dell’ambiente produttivo con l’estrinsecazione delle massime potenzialità delle diverse specie,per una valorizzazione della vocazionalità del territorio e della qualità del prodotto.In quest’ottica di supporto all’innovazione di filiera,offrire un contributo al contenimento di alcune fitopatie con tecniche ecocompatibili.Favorire l’uso di tecnologie verdi per mitigazione e compensazione ambientali.

Risultati attesi nell'anno Calibrazione e validazione di indici di rischio degli incendi boschivi (inclusa propagazione).Bilancio energetico e del carbonio in sistemi forestali (rimboschimento di Nonantola,macchia mediterranea), e agricoli in aree vocate (olivo, actinidia).Sviluppo di un modello per la previsione a breve termine del flusso evapotraspirativo.Messa a punto di modelli fenologici e di crescita.Sviluppo di un indice di rischio climatico per specie agricole in ambiente mediterraneo.Messa a punto di metodologie per definire le aree a rischio erosione, e per opere di fitorimedio.Rilevazione di indici di stress per piante agrarie utili dal punto di vista operativo per la gestione sostenibile di risorse limitate.Applicazioni di fotobiologia alla produttività.Sviluppo di una metodologie per la caratterizzazione agroclimatica basata sul bilancio di radiazione.Caratterizzazione qualitativa di prodotti a tipicità territoriale, integrando osservazioni biochimiche con valutazioni su consumatori,sia in punti-vendita che in sale sensoriali.Messa a punto portale web sulla Qualità. Sviluppo di strategie di applicazione di agenti biologici a fitopatie di deperimento del legno di vite e actinidia.

Potenziale impiego - per processi produttivi Per sviluppo di sensori, modelli, indicatori da impiegare nella gestione del territorio. Per applicazioni operative nel settore dell’agrometeorologia e per l’adozione di criteri di valorizzazione ambientale e ottimizzazione delle risorse nei processi produttivi. Per contributo ai processi produttivi della filiera agroalimentare di produzioni ortofrutticole. Per incremento della sostenibilità dei processi agricoli. Per valorizzazione produzioni agricole di pregio. Per contributo alla tracciabilità e alla qualificazione delle produzioni a denominazione di origine protetta. Per stesura di mappe di rischio (incendi, gelate). Per messa a punto di modelli di vocazionalità. Per contributo alla salvaguardia e al mantenimento di ecosistemi naturali. Per ripristino di zone degradate tramite tecnologie verdi. Per recupero e mantenimento di banche del germoplasma per la valorizzazione della biodiversità. Per contributo all’ adozione buone pratiche agricole e ad Agenda 21. Per sviluppo delle interazioni tra industria e ricerca. Per sviluppo dei collegamenti tra Istituzioni Scientifiche e Strutture Territoriali, e quindi per trasferimento delle conoscenze sulle realtà produttive locali e nazionali.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Contributo ai processi di filiera per l’ottenimento di produzioni di qualità in senso allargato, conciliando qualità dell’ambiente di coltivazione con aspettative dei consumatori,per garantire prodotti ad elevate caratteristiche nutrizionali e salutistiche,nel contempo apprezzati da un punto di vista del soddisfacimento personale, come gradimento sensoriale e estetico. Protezione e tutela del

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territorio coltivato, garanzie sulla sostenibilità d’uso di risorse limitate. Aiuto allo sviluppo e alla riconversione di aree marginali. Sviluppo di tecniche di compensazione e mitigazione dell’impatto antropico tramite vegetazione, in aree rurali e urbane. Studio e sviluppo di “buone pratiche” per la gestione e la tutela degli ecosistemi mediterranei, garantendo, a fini applicativi, lo sviluppo di interazioni con agenzie,enti di protezione e vigilanza ambientale,enti di ricerca e sperimentazione,enti e servizi di assistenza tecnica in agricoltura. Contributo alle attività di programmazione a lungo e medio termine delle amministrazioni pubbliche regionali e nazionali anche sulla base delle conoscenze rese disponibili sugli impatti dei cambiamenti climatici su sistemi agrari e naturali.

Moduli

Modulo: Monitoraggio degli ecosistemi terrestri: metodi di analisi e modelli Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari Modulo: Interazioni atmosfera-superficie:micrometeorologia e applicazioni

agrometeorologiche. Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari Modulo: Salvaguardia e valorizzazione delle risorse e delle produzioni agro-alimentari. Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari Modulo: Interazione pianta-patogeno tipo ambiente. Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari Modulo: Gestione sezione Bologna Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+91002 457 438 20 1917 129 1024 288 N.D. 2334




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Altro Totale

0 5 1 0 0 5 5 2 0 18




Dati generali Progetto: Sviluppo rurale e territorio Tipologia di ricerca: Progetti di sviluppo competenze Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Sede principale svolgimento: Sezione di Sassari Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FABRIZIO BENINCASA Elenco dei partecipanti liv. Arca Angelo VI Arca Bachisio III Benincasa Fabrizio I Canu Annalisa III

liv.Cesaraccio Carla III De Vincenzi Matteo III Fasano Gianni V Materassi Alessandro V

liv.Mustacciu Barbara VII Ventura Andrea III Zara Pierpaolo VI

Temi

Tematiche di ricerca I-Docenza XX ciclo Dottorato in Agrometeorologia, ecc. II-Pubblicazione del volume "Il Calcolo Approssimato". III-Realizzazione di un Epiradiatore, messa a punto di camere di crescita e installazione di un Lisimetro a Pesata da noi realizzato. IV-Pubblicazione del 14° volume della Collana IBIMET "Il telerilevamento nel Monitoraggio degli Agroecosistemi" e relativo Seminario.

Stato dell'arte I-La collaborazione IBIMET ai Dottorati è un riconoscimento dell'Università di Sassari. II-L'esigenza di nuovi testi di matematica deriva dall'insufficiente conoscenza della materia dei provenienti da discipline agrobiologiche. III-Gli strumenti e gli apparati sono progettati con caratteristiche qualitative come quelle del commercio ma costi di realizzazione e impianto più contenuti. IV-La Collana IBIMET descrive strumenti e metodi che non trovano spazio nei paragrafi Materiali e Metodi delle riviste.

Azioni

Attività da svolgere I) Volume "Il calcolo approssimato" (F. Benincasa, M. De Vincenzi): completamento del testo e stampa a fine anno. II) Epiradiatore: realizzazione del software di gestione del rilevamento delle immagini termiche; Lisimetro: installazione in un sito sperimentale nei pressi di Oristano. III) Simposio "Il monitoraggio costiero: problematiche e tecniche di misura", diviso in sei sessioni a) evoluzione della linea di costo b) vegetazione costiera c) fondali, coperture vegetali e qualità delle acque d) archeologia

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costiera e) incendi costieri e recupero ambientale f) antropizzazione costiera, valorizzazione socio-economica del territorio e recupero ambientale si terrà a Sassari il 4-5-6 ottobre 2006.

Punti critici e azioni da svolgere I contenuti e gli obiettivi di questa Commessa richiedono una particolare attenzione nel rapporto con i fruitori finali per una maggiore definizione dei risultati delle ricerche. Dovranno inoltre essere potenziati gli attuali livelli di collaborazione con altri enti e gruppi di ricerca nazionali e internazionali, al fine di garantire una sufficiente operatività. Si conferma comunque che punti critici essenziali sono rappresentati dall'eventuale non rinnovo del contratto al personale attualmente a tempo determinato e da un inadeguato contributo finanziario da parte della Sede Centrale.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine A causa delle difficoltà di realizzazione e dei costi eccessivi, i lisimetri a pesata di dimensioni e risoluzioni tali da consentire studi ecofisiologici e micrometeo non sono molto diffusi. Il lisimetro monoblocco da noi realizzato mostra che, con gli odierni dispositivi dell’elettronica, è possibile costruire lisimetri a pesata di 2 mc, o più, di volume, con costi contenuti e con risoluzioni pari a 0.05 mm. Inoltre, data la sua semplicità strutturale, non richiede un assemblaggio in campo e può essere realizzato completamente in fabbrica. L’epiradiatore è uno strumento non in commercio che, chi si occupa di infiammabilità, realizza in riferimento alla normativa ISO 5657 del 1997. Tale normativa non prevede la contemporaneità di diversi materiali più o meno particolati come si ha nella lettiera forestale. In questo caso, alcuni autori hanno proposto realizzazioni specifiche, ma la misura della temperatura di combustione è molto incerta perché non c’è la misura diretta della temperatura delle braci. Questo problema è stato risolto utilizzando un radiometro multi-point da 16x16 pixel che, attraverso uno specifico software in ambiente Lab-View, diventano 256x256.

Collaborazioni (partner e committenti) Università di Sassari, DESA per Epiradiatore, Ricercatori di altri Organi CNR per la stesura del Volume "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" e relativo Seminario. Università di Firenze, DISTAF per Camere di Crescita. ERSAT, Regione Sardegna per Lisimetro

Finalità

Obiettivi Realizzazione: -dei Volumi "Il calcolo approssimato" e "Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi" -del Seminario Il telerilevamento nel monitoraggio degli agroecosistemi -degli strumenti: Epiradiatore (progetto), Camera di Crescita (messa a punto), Lisimetro (installazione). Le competenze sono interne all'Istituto per il forte contributo del personale a tempo determinato

Risultati attesi nell'anno Pubblicazione di due articoli sulla Rivista di Ingegneria Agraria relativi alla realizzazione di due Camere di Crescita. Pubblicazione del volume "Il calcolo approssimato". Installazione Lisimetro a pesata. Pubblicazione degli atti del Simposio "Il monitoraggio costiero mediterraneo; problematiche e tecniche di misura".

Potenziale impiego - per processi produttivi Strumenti innovativi in ambito agroforestale e agrometeorologico

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Diffusione dei risultati per l’accrescimento dell’educazione scientifica e tecnologica nel settore degli strumenti di misura

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Moduli

Modulo: Sviluppo di competenze Istituto esecutore: Istituto di biometeorologia Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9233 20 0 9 262 24 44 25 N.D. 311








0 0 0 0 0 0 0 0 0 0



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FRANCESCO MENEGUZZO Monitoraggio dei Flussi di Carbonio in Ambienti Marini

ANTONIO RASCHI I giovani delle aree rurali: capitale sociale indispensabile per lo sviluppo sostenibile

MARINA BALDI Previsioni climatiche stagionali

GIOVANNANGELO DALU Interazioni tra biosistemi e processi fisici

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione L’Istituto ha svolto la sua attività nel settore delle applicazioni della climatologia con la finalità a) di inserirsi a pieno titolo nella comunità internazionale b) di sviluppare prodotti che possano essere di utilità di enti pubblici e privati a livello nazionale e internazionale c) di reperire risorse attraverso i prodotti sviluppati Nel 2005 IBIMET ha realizzato i seguenti prodotti: 114 articoli su riviste nazionali e internazionali, 21 capitoli su libri nazionali ed internazionali, 5 libri, 32 risultati di valutazioni applicativa, 14 progetti di composizione, 27 performances, mostre ed esposizione e 7 manufatti ad opera d’arte. La produzione scientifica in termini di pubblicazioni si è orientata equamente tra riviste nazionali ed internazionali. Nel corso del 2005 si sono consolidate le attività del LAMMA ( Laboratorio di Monitoraggio e Modellistica Ambientale per lo sviluppo sostenibile) che opera per conto della Regione Toscana e del costituendo LAMMA TEST (Tecnologie per il Sistema Tessile) di Prato, che sarà pienamente realizzato nel 2006. Le Sedi distaccate di progetto coordinate da personale interno di Ibimet, costituiscono una realtà operativa sul territorio , dove viene svolto un intenso trasferimento della ricerca di base dell’Istituto .Tali unità sono ubicate a Livorno e Grosseto. Nell’ambito del progetto del Ministero del lavoro sono attive due sedi a Benevento ed a Trento. Tra gli indicatori che riassumono l’attività dell’Istituto nel 2005 sono stati scelti: la parte finanziaria, il personale a carico di fondi esterni, il n° di pubblicazioni e prodotti e le sedi distaccate di progetto. Per quanto riguarda la parte finanziaria nel corso del 2005 l’IBIMET ha ricevuto complessivamente 5.802.000,00 � di cui: 270.000,00 � da progetti UE, 998.000,00 � da progetti nazionali, 2.658.000,00 � da trasferimento della ricerca ed infine 432.000,00 � come dotazione ordinaria dal CNR alla quale ci si deve aggiungere 1.444.000,00 � del costo del personale strutturato a carico di CNR. Da una prima analisi emerge che il 70 % dei fondi totali è di provenienza esterna a giustificazione di una intensa attività di funding rising alla quale tutto il personale dell’Istituto ha partecipato nell’assicurare continuità lavorativa e impegno nelle tematiche proprie dell’Istituto. Da una analisi incrociata, invece, delle diverse percentuali, emerge che l’attività dell’Istituto è sviluppata sia in ambito nazionale che internazionale mentre una non trascurabile porzione del budget annuale viene dal trasferimento della ricerca 46%. Quest’ultimo aspetto ha consentito di poter indirizzare le ricerche dell’Istituto, verso settori privati della piccola e media impresa per un vero e proprio trasferimento applicativo delle conoscenze di base. Si ritiene che un legame diretto verso il mondo imprenditoriale e industriale possa garantire nel futuro quella continuità lavorativa necessaria per completare lo sviluppo di strumenti ed applicativi. Se in definitiva l’analisi della parte finanziaria dell’Istituto, potrebbe far apparire una struttura completamente orientata verso la ricerca applicata, vedremo dall’analisi degli altri indici che la ricerca di base è comunque rappresentata in modo significativo. Per quanto riguarda il personale a carico di fondi esterni, a fronte di 52 unità di personale strutturato ed inquadrato tra i diversi livelli, da tecnico, fino a dirigente di ricerca, l’Istituto nel corso del 2005 ha attivato 46 contratti su fondi esterni, raggiungendo complessivamente il numero di 98 unità di personale. Il cospicuo numero di precari, se da una parte ha comportato un aggravio di carico di lavoro da parte del personale strutturato, si è reso necessario per ottemperare agli impegni dei numerosi progetti, che nel 2005 sono stati complessivamente 36. Nel complesso si può dire che l’Istituto è una realtà dinamica , distribuita sul territorio nazionale , con un numero significativo di giovani ricercatori a contratto , ben inserita nel contesto internazionale ( WMO, FAO, COST , UNCCD, V PQ , etc ) . I problemi da evidenziare sono connessi allo scarso raccordo con la realtà centrale specialmente per quanto riguarda la costituzione del Consorzio con la Regione Toscana che tarda ad essere avviato e che potrebbe costituire un problema nei riguardi del personale a contratto.

Proposta di interventi organizzativi

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ISTITUTO DI GENETICA VEGETALE Missione

Sviluppare le conoscenze necessarie per affrontare e risolvere problematiche prioritarie di interesse nazionale nel settore agrario, in funzione della domanda dell’industria alimentare, farmaceutica e chimica, utilizzando tecnologie innovative.

Direttore: Prof Luigi Monti Sede principale: Via Giovanni Amendola, 165/A - 70126 Bari BA Puglia Superficie immobile: XX mq Articolazione territoriale: c/o Via Università, 133 - 80055 Portici NA Campania

Superficie immobile: XX mq c/o Via Madonna Alta, 130 - 06128 Perugia PG Umbria Superficie immobile: XX mq c/o Via Atto Vannucci, 13 - 50134 Firenze FI Toscana Superficie immobile: XX mq c/o Corso Calatafimi, 414 - 90128 Palermo PA Sicilia Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.igv.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 48 1 35 11 95 2004 48 1 35 11 95 2005


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Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Arcioni Sergio I Perrino Pietro I Tusa Nicasio I Cardi Teodoro II Carimi Francesco II Conicella Clara II Damiani Francesco II De Pasquale Fabio II Dell'Aquila Antonio II Laghetti Gaetano II Margiotta Benedetta II Pignone Domenico II Polignano Giambattista II Vendramin Giovanni Giuseppe II Baldoni Luciana III Bisignano Venturino III Bucci Gabriele III Calderini Ornella III Capuana Maurizio III Consiglio Maria Federica III Costa Antonello III Fatta Del Bosco Sergio III Ferrante Sergio Pietro III Garfi' Giuseppe III Grandillo Silvana III Grillo Maria Stefania III Lioi Lucia III Maruca Gina III Michelozzi Marco III

liv.Paolocci Francesco III Piergiovanni Angela Rosa III Porceddu Andrea III Puglisi Stefano III Pupilli Fulvio III Rubini Andrea III Sarli Giulio III Scarano Maria Teresa III Scotti Nunzia III Sonnante Gabriella III Terzi Massimo III Tomaselli Valeria Maria Federica III Tucci Marina III Urbano Marcella III Vettori Cristina III Boccia Francesco IV Campanella Nicola IV Colaprico Giuseppe IV Cozza Corradino IV Delle Donne Gaudenzio IV Giuffre' Vincenzo IV Scarascia Italo IV Uggenti Pasquale IV Attolico Margherita V Carella Gioacchino V Cifarelli Salvatore V De Lisi Antonino V Martignano Fernando V Scarascia Marisa V

liv.Sonnante Giuseppe V Taranto Giovanni V Abbate Loredana VI Boggi Catia VI Cataldo Pasquale VI Falco Vittorio VI Guaragno Marco VI La Mantia Giulia VI Losavio Francesco Paolo VI Mallardi Lorenza VI Migliore Roberto VI Nocerino Cira VI Ranieri Giulia VI Stimolo Lucia VI Bellisario Roberto VII Bianchi Simonetta VII Carpinelli Giancarlo VII De Luca Maria Grazia VII Laino Martino VII Sampino Aldo VII Scafarto Antonio VII Scimmi Rita VII Stanzione Fulvia VII Ticconi Silvia VII Bellucci Michele VIIICampanella Giovanni VIIIMarino Vincenzo VIIIMinervini Vittoria VIIIMiano Antonio IX

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2003 1 9 19 3 26 58 2004 2 13 20 2 24 61 2005

ASSEGNISTI

Tessa Bovone Maria Cammareri Angela Carra

Anna De Carlo Francesca De Marchis Daniela Gargano

Filomena Giorno Lorna Molinari Francesco Panara

Livia Polegri Paola Taviani Vladimir Totev Valkov

ASSOCIATI DI RICERCA

Laura Bonzi Raffaello Giannini Paolo Capretti

BORSISTI

Fiammetta Alagna Rosalinda D'Amore

Rossella Fasano Enrico Ferraiolo Gelsomina Formisano


Silvia Carnevale Angela Casini Gianna Giovannoni Gianna Giovannoni

Giangiacomo Lorenzini Silvia Marsili Paolo Matteini Luca Mattiocco

Donatella Paffetti Paola Pecchia Alfonso Piccolo Anna Maria Proietti Placidi

Roser Vilatersana Lluch Daniela Vullo Letizia Zamponi

DOTTORANDI

Alessandra Busti Teresa Docimo Giovanni Emiliani

Paolo Lenzi Anna Malafronte Maura Orlando

Claudia Riccioni Pasquale Termolino

Pasquale Tripodi Fabrizio Pennacchio

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Risorse finanziarie



esterne totale







anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 810 - 1.174 - - 2004 518 661 1.869 1.465 1.051 3.177 2005







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esposizione


2003 56 5 - - - - - 2004 48 6 - - 3 - 2 - 2005


ARTICOLI ISI

Pastorelli 1,Smulders 2, Van’t Westende 3, Vosman 4, Giannini 5,Vettori 6, Vendramin 7 Characterization of microsatellite markers in Fagus sylvatica L. and Fagus orientalis Lipsky MOLECULAR ECOLOGY

Scotti I. 1, Mariani A. 2, Verona V. 3, Candolini A. 4, Cenci C.A. 5, Olivieri A.M. 6 AFLP markers and cytotaxonomic analysis reveal hybridisation in the genus Schoenus (Cyperaceae) GENOME

Labombarda P. 1, Busti A. 2, Caceres M.E. 3, Pupilli F. 4, Arcioni S. 5 An AFLP marker tightly linked to apomixis reveals hemizygosity in a portion of the apomixis controlling locus in Paspalum simplex GENOME

Scialabba A., Bellani L. M., Dell'Aquila A. Effects of ageing on peroxidase activity and localization in radish (Raphanus sativus L.) Seeds EUROPEAN JOURNAL OF HISTOCHEMISTRY

Bucci G. 1, Menozzi P. 2 Spatial autocorrelation and linkage of Mendelian RAPD markers in a population of Picea abies Karst. MOLECULAR ECOLOGY

Ribeiro M.M. 1, Mariette S. 2, Vendramin G.G. 3, Szmidt A.E. 4, Plomion C. 5, Kremer A. 6 Comparison of genetic diversity estimates within and among populations of maritime pine using cpssr and AFLP data MOLECULAR ECOLOGY

Palme A. 1, Vendramin G.G. 2 Chloroplast DNA variation, postglacial recolonisation and hybridisation in hazel, Corylus avellana MOLECULAR ECOLOGY

Contento M. 1, Ceccarelli M. 2, Gelati T. 3, Maggini F. 4, Baldoni L. 5, Cionini P.G. 6 Inter- and intraspecific variation of Olea genotypes due to alterations in the redundancy of tandem repeated DNA sequences THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Rubini A. 1, Paolocci F. 2, Granetti B. 3, Arcioni S. 4

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Morphological characterization of molecular-typed T. magnatum Pico ectomycorrhizae MYCORRHIZA

De Marchis F. 1, Bellucci M. 2, Arcioni S. 3 Measuring gene flow from two birdsfoot trefoil (Lotus corniculatus) field trials using transgenes as tracer markers MOLECULAR ECOLOGY

Pupilli F. 1, Labombarda P. 2, Caceres M.E. 3, Quarin C.L. 4, Arcioni S. 5 The chromosome segment related to apomixis in Paspalum simplex is homoeologous to the telomeric region of rice chromosome 12. MOLECULAR BREEDING

Scarano M.-T. 1, Tusa N. 2, Abbate L. 3, Lucretti S. 4, Nardi L. 5, Ferrante S. 6, Flow Cytometry, SSR and modified AFLP markers for the identification of zygotic plantlets in backcrosses between ‘Femminello’ lemon cybrids (2n and 4n) and a diploid clone of ‘Femminello’ lemon (Citrus limon L. Burm. F.) tolerant to mal secco disease PLANT SCIENCE

C. Vettori 1, D. Paffetti 2, D. Saxena 3, G. Stotzky 4, R. Giannini 5 Persistence of toxins and cells of Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY

Robbins M.P. 1, Paolocci F. 2 , Hughes J.W. 3, Turchetti V. 4, Allison G. 5, Arcioni S.6, Morris P.7 and Damiani F. 8 Sn, a maize bHLH gene, transactivates anthocyanin and condensed tannin pathways in Lotus corniculatus JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY

Pupilli F. 1, Labombarda P. 2, Arcioni S. 3 New mitochondrial genome organization in three interspecific sometic hybrids of Medicago sativa including the parent-specific amplification of substoichiometric mitochondrial DNA units THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

1. Bertini L, Leonardi L, Caporale C, Tucci M, Cascone N, Di Berardino I, Buonocore V, Caruso C Pathogen-responsive wheat PR4 genes are induced by plant activators of systemic acquired resistance and wounding PLANT SCIENCE

Caruso C, Bertini L, Tucci M, Caporale C, Nobile M, Leonardi L, Buonocore V Recombinant wheat antifungal PR4 proteins expressed in Escherichia coli PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION

Molinari L. 1, Busti A. 2, Calderini O. 3, Arcioni S. 4, Pupilli F. 5 Plant regeneration from callus of apomictic and sexual lines of Paspalum simplex and RFLP analysis of regenerated plants PLANT CELL REPORTS

Caceres M.E. 1, Matzk F. 2, Busti A. 3, Pupilli F. 4, Arcioni S. 5

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Apomixis and sexuality in Paspalum simplex: characterization of the mode of reproduction in segregating progenies by different methods SEXUAL PLANT REPRODUCTION

Bellucci M. 1, Roscini C. 2, Mariani A. 3 Cytomixis in Pollen Mother Cells of Medicago sativa L. JOURNAL OF HEREDITY

Albertini E. 1, Porceddu A. 2, Marconi G. 3, Barcaccia G. 4, Pallotini L. 5, Falcinelli M. 6 Microsatellite-AFLP for genetic mapping of complex polyploid GENOME

De la Rosa R. 1, Angiolillo A. 2, Rallo L. 3, Guerrero C. 4, Pellegrini M. 5, Besnard G. 6, Bervillé A. 7, Martin A. 8, Baldoni L. 9 A first genetic linkage map of olive (Olea europaea L.) cultivars using RAPD and AFLP markers THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Cnudde F. 1, Moretti C. 2, Porceddu A. 3, Pezzotti M. 4, Gerats T. 5 Transcript profiling on developing Petunia hybrida floral organs SEXUAL PLANT REPRODUCTION

Simoncelli F. 1, Sorbolini S. 2, Fagotti A. 3, Di Rosa I. 4, Porceddu A. 5, Pascolini R. 6 Molecular characterization and expression of a divergent alpha-tubulin in planarian Schmidtea polychroa BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA

Avesani L. 1, Falorni A. 2, Tornielli G.B. 3, Marusic C. 4, Porceddu A. 5, Polverari A. 6, Faleri C. 7, Calcinaro F. 8, Pezzotti M. 9 Improved in planta expression of the human islet autoantigen glutamic acid decarboxylase (GAD65). TRANSGENIC RESEARCH

Rallo P. 1, Tenzer I. 2, Gessler C. 3, Baldoni L. 4, Dorado G. 5, Martin A. 6 Transferability of olive microsatellite loci across the genus Olea THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Belaj A. 1, Satovic Z. 2, Cipriani G. 3, Baldoni L. 4, Testolin R. 5, Rallo L. 6, Trujillo I. 7 Comparative study of the discriminating capacity of RAPD, AFLP and SSR markers and of their effectiveness in establishing genetic relationships in olive THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Lioi L. 1, Sparvoli F. 2, Galasso I. 3, Lanave C. 4, Bollini R. 5 Lectin-related resistance factors against buchids evolved through a number of duplication events THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Sparvoli F. 1, Lanave C. 2, Santucci A. 3, Bollini R. 4, Lioi L. 5 Lectin and lectin-related proteins in Lima bean (Phaseolus lunatus L.) seeds: biochemical and evolutionary studies PLANT MOLECULAR BIOLOGY

Scotti N., Monti L., Cardi T.

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Organelle DNA variation in parental Solanum spp. genotypes and nuclear-cytoplasmic interactions in Solanum tuberosum (+) S. commersonii somatic hybrid backcross progeny THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Parducci L. 1, Szmidt A.E. 2, Madaghiele A. 3, Anzidei M. 4, Vendramin G.G. 5 Family structure in Abies nebrodensis (Lojac.) Mattei and differentiation from related Abies species using allozymes and chloroplast microsatellites. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Sperisen C. 1, Buchler U. 1, Gugerli F. 1, Matyas G. 1, Geburek T. 2, Vendramin G.G. 3 Tandem repeats in plant mitochondrial genomes: a novel molecular marker type for population genetic studies. MOLECULAR ECOLOGY

Gugerli F. 1, Senn J. 2, Anzidei M. 3, Madaghiele A. 4, Buchler U., Sperisen C. 5, Vendramin G.G. 6 Chloroplast microsatellites and mitochondrial nad1 intron2 sequences indicate congruent phylogenetic relationships of Swiss stone pine (Pinus cembra), Siberian stone pine (P. sibirica) and Siberian dwarf pine (P. pumila) MOLECULAR ECOLOGY

Petit R.J. 1 , Aguinagalde I. 2 de Beaulieu J-L. 3., Bittkau C. 4, Brewer S. 3, Cheddadi R. 3, Ennos E. 5, Fineschi S. 6, Grivet D. 1, Lascoux M. 7, Mohanty A. 2, Muller-Starck G. 4, Demesure-Musch B. 8, Palme´ A. 7, Mart1 J.P. 2, Vendramin G.G. 9 Glacial Refugia: Hotspots but Not Melting Pots of Genetic Diversity SCIENCE

Fady B. 1, Lefèvre F.2, Reynaud M.3, Vendramin G.G.4, Bou Dagher-Kharrat M.5, Anzidei M.6, Pastorelli R.7, Savouré A.8, Bariteau M.9 Gene flow among different taxonomic: evidence from nuclear and cytoplasmic markers in Cedrus plantation forests THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Maggio A., Hasegawa P.M., Bressan R.A., Consiglio M.F., Joly R.J. Unravelling the functional relationship between root anatomy and stress tolerance AUSTRALIAN JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY

Zottini M., Formentin E., Scattolin M., Carimi F., Lo Schiavo F., Terzi M. Nitric oxide affects plant mitochondrial functionality in vivo. FEBS LETTERS

Carimi F., Zottini M., Formentin E., Terzi M., Lo Schiavo F. Cytokinins: new apoptotic inducers in plants. PLANTA

Gianibelli M.C.1, Gupta R.B.2, Lafiandra D.3, Margiotta B.4, MacRitchie F.5 Polymorphism of High Mr Glutenin Subunits in Triticum tauschii: characterisation by chromatography and electrophoretic methods JOURNAL OF CEREAL SCIENCE

Pfluger L.A.1, D'Ovidio R.2, Margiotta B.3, Pena R.4, Mujeeb-kazi A.5, Lafiandra D.6

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Characterization of high and low-molecular weight glutenin subunits associated to the D genome of Aegilops tauschii in a collection of synthetic hexaploid wheats THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Bastia T., Scotti N., Cardi T Organelle DNA analysis of Solanum and Brassica somatic hybrids by PCR with ‘Universal Primers’ THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

Bettini P.1, Michelotti S.2, Bindi D.3, Giannini R.4, Capuana M.5, Buiatti M. 6 Pleiotropic effect of the insertion of Agrobacterium rhizogenes rolD gene in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

LIBRI

Maggio A. 1, Bressan A.2, Ruggiero C.3., Xiong L.4., Grillo S.5 Salt tolerance: Placing advances in molecular genetics into a physiological and agronomic context in Abiotic stress in Plants, Kluwer Academic Publisher, Dordrecht, The Netherlands 2003.

Grandillo S., Fulton T. Approaches to gene mapping in Molecular Plant Biology: A Practical Approach, Oxford University Press, 2002.

Arcioni S. 1, Pupilli F. 2 Somatic Hybridization in Encyclopedia of Applied Plant Science , Brian Thomas, Denis J Murphy, Brian G. Murray , 2003.

BREVETTI

Caruso, Bertini, Tucci, Leonardi, Caporale, Buonocore Procedimento per la rinaturazione, idrolisi e produzione di proteine PR ricombinanti, composizioni e kit utilizzabili in tali procedimenti

RAPPORTI

B. Fady, H. Semerci, G.G. Vendramin EUFORGEN Technical Guidlines for genetic conservation and use for Aleppo pine (Pinus halepensis) and Brutian pine (Pinus brutia).

Lioi L., Piergiovanni A.R. Qualità della granella. In: Il fagiolo poverello bianco dell'area del Pollino

Piergiovanni A.R. La promozione delle vecchie varietà locali come strategia per la salvaguardia del germoplsma autoctono.

Perrino Pietro, Faco Vittorio, Martignano Fernando Relazione sulle attività svolte nell'ambito del progetto "Valutazione di tre brevetti di farro, studio dell'interazione genotipo ambiente"

Perrino Pietro, Falco Vittorio, Martignano Fernando

119


Allevamento nel Salento di tre brevetti di Farro per conto dell'APROCEL di Potenza

Perrino Pietro, Cifarelli Salvatore, Laghetti Gaetano Relazione tecnica finale sul progetto: "Studio, salvaguardia e valorizzazione delle risorse genetiche agrumicole del Gargano"

Perrino Pietro, Mallardi Lorenza, Scarascia Italo Relazione sull'avanzamento dei lavori sul progetto "Valorizzazione di vecchi ecotipi autoctoni di miglio, orzo ed ortensi"

Perrino Pietro, Mallardi Lorenza, Scarascia Italo Relazione sullo stato di avanzamento del progetto carciofo: "Conservazione, caratterizzazione e v alorizzazione di germoplasma di Cynara scolymus L."

Perrino Pietro, Sarli Giulio, Terzi massimo, Tomaselli Valeria, Mallardi Lorenza, Scarascia Italo Relazione sullo stato di avanzamento del progetto: "Centro tematico per la conservazione e la difesa della biodiversità vegetale mediterranea"

Arcioni Sergio, Rubini Andrea, Francesco Paolocci, Caludia Riccioni, Fabiana Topini. Relazione dell'attività svolta dall'IGV Sez. di Perugia relativa al progetto di ricerca "Studio della variabilità genetica in Tuber melanosporum e Tuber magnatum per verificare la possibilità di predisporre un marchio di qualità o DOP.

Pupilli F., Caderini O., Arcioni S. Scientific report of the 2th year activity of the EU project QLG2-CT-2000-00603

Arcioni Sergio, Andrea Porceddu, Carla Scotti, Alessandro Vitale, Giovanna Frugis Rapporto sullo stato di avanzamento del Progetto FIRB "Post-Genomica di Leguminose Foraggere"

Francesca De Marchis, Michele Bellucci, Arcioni Sergio ANALISI DELLA DIFFUSIONE AMBIENTALE DI POLLINE TRANSGENICO DI LEGUMINOSE FORAGGERE

Baldoni L., Lucentini L., Porceddu A., Arcioni S. Banca dati di marcatori AFLP e SSR delle varietà di olivo dell'Umbria

Baldoni L. Gli Alberi di San Mariano

Baldoni L. Relazione finale del progetto 'Tutela e valorizzazione del patrimonio olivicolo locale'

G. Bucci, G.G. Vendramin Banca dati relativo a polimorfismi microsatellite plastidiali rilevati in popolazioni di specie forestali

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Altri Ministeri: Ministero della Salute; Ministero per le Politiche Agricole e Forestali

Enti pubblici: Regione Sicilia; Regione Umbria; Regione Basilicata; Regione Campania; Provincia di Lecce

EPR italiane: CNR-IBBA; CNR-ISA; ENEA –Casaccia; ENEA- Trisaia; INT Istituto Pascale- Napoli

MIUR: Finanziamento M.I.U.R. leggi 95/1995(5%), 488/997, 449/1997 (progetti strategici MIUR),204/1998 (FISR) e 388/2000 (FIRB)

Privati: Centro Istruzione Professionale Agricola Assistenza Tecnica; Stazione Zoologica Napoli

UE: VFP UE: "IP new stategies to improve grain legumes for food and Feed"; Vi FP UE UE: “Plastomics”

Università: Universita’ di Napoli Federico II; Universita’ di Salerno, Università di Bari

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CREDITORI E DEBITORI DIVERSI • Convenzione Regione e Comunità Montane Umbre trance 2003

ENEA - ENTE NAZIONALE PER LE NUOVE TECNOLOGIE, L'ENERGIA E L'AMBIENTE • CONTRATTO: "GENI E LORO FUNZIONI: UN APPROCCIO INTEGRATO (GENEFUN)

REGIONE BASILICATA • Realizzazione del Centro Tematico per la conservazione e la difesa della Biodiversità vegetale

Mediterranea • Realizzazione del Centro Tematico per la Conservazione e la Difesa della Biodiversità

Vegetale Mediterranea

REGIONE SICILIA • Progetto "Conservazione in vivo ed in vitrio di varietà minori di fruttiferi in via di estinzione

negli ambienti mediterranei"

REGIONE UMBRIA • CONVENZIONE FRA "REGIONE/CNR/UMBRAFLOR s.r.l." per ricerche sulla valorizzazione

della tartuficoltura umbra - liquidazione acconto 1° annualità

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • Inerbimenti e Tappeti erbosi per la valorizzazione agricola, ricreativa e sprotiva del territorio • Conservazione, caratterizzazione e valorizzazione di farro (Triticum dicoccon Schrank) in arre

marginali della penisola italiana • Salvaguardia della diversità genetica, caratterizzazione e valorizzazione di germoplasma di

Cynara Scolymus L. • Studio della variabilità genetica in cultivar locali di PHASEOLUS VULGARIS • Conservazione, caratterizzazione e valorizzazione del farro (Triticum dicoccon Schrank) in

aree marginali della penisola italiana • Studio della varietà genetica in cultivar locali di Phaseolus Vulgaris

ISTITUTO SPERIMENTALE OLIVICOLTURA • INDIVIDUAZIONE MARCATORI MOLECOLARI ASSOCIATI ALLA RESISTENZA IN OLIVO

(OLIBIO 87) • TRACCIABILITA' DI OLIVO MEDIANTE MARCATORI MOLECOLARI (OLIBIO47)

LA SALVIA SRL • Valorizzazione di vecchi ecotipi autoctoni di miglio, orzo ed orternsi

CONSORZIO AGRITAL RICERCHE • CONSORZIO AGRITAL RICERCHE - PNR Biotecnologie Avanzate • AGRITAL CONTRATTO PNR BIOTECNOLOGIE AVANZATE

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A.R.S.I.A. • PROGETTO ARSIA CARATTERIZZAZIONE E PRODUZIONE DI OLII ESSENZIALI E DI

ESTRATTI DI NATURA POLIFENOLICA DI ECOTIPI TOSCANI DELLA FLORA MEDITERRANEA

MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI (MIPAF) • Ricerche e Sperimentazioni nel settore dell'agricoltura Italiana • Liste di Orientamento Varietale degli Agrumi • Ricerche e Sperimentazioni nel settore dell'agricoltura Italiana • CONTRIBUTO MIPAF " MIGLIORAMENTO GENETICO DELLA PATATA" - 5° ANNO - RATA 1 • "Ricerche e sperimentazioni nel settore dell'agrumicoltura Italiana" • Contributo MIPAF progetto "Ricerche e Sperimentazioni nel settore dell'Agrumicoltaura

Italiana" • CONTRIBUTO MIPAF "TECNICHE INNOVATIVE PER L'IDENTIFICAZIONE DI

MARCATORI MOLECOLARI..." (ECOPOM) • OLIBIO • Contributo MIPAF progetto "Ricerche e Sperimentazioni nel settore dell'Agrumicoltaura

Italiana" • Programma finalizzato di ricerca "CARCIOFO" 3 anno di attività • Rimborso rendicontazione parziale progetto "MIPAF/PROMAR" I.S.P.V.

CAMERA DI COMMERCIO DI LECCE • Progetto di ricerca "Valutazione di tre brevetti di FARRO, Studio dell'interazione genotipo per

ambiente" CNRIGV Bari - C.C.I.A.A. Lecce • Convenzione CNRIGV Bari - C.C.I.A.A. Lecce "Valutazione di tre brevetti di FARRO - Farvento,

Lucanica, Forenza - Studio dell'interazione genotipo per ambiente

AZIENDA FORESTE DEMANIALI DELLA REGIONE SICILIA • CONTRATTO AZIENDA REGIONALE FORESTE DEMANIALI "VALUTAZIONE E

CONSERVAZIONE DELLA VARIABILITA' DEL GERMOPLASMA FORESTALE IN SICILIA" • CONTRATTO AZIENDA REGIONALE FORESTE DEMANIALI "VALUTAZIONE E

CONSERVAZIONE DELLA VARIABILITA' DEL GERMOPLASMA FORESTALE IN SICILIA"

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca • Progetto biennale "Risorse genetiche vegetali per la produzione di sostanze di interesse per la

salute umana

DIP. SCIENZE DEL SUOLO, DELLA PIANTA E DELL'AMBIENTE-UNIVERSITA' DI NAPOLI FEDERICO II

• CONVENZIONE PER PROGETTO: "GENOMICA STRUTTURALE E FUNZIONALE IN SOLANACEAE" (AGRONANOTECH)

COMMISSIONE EUROPEA • Natural apomixis as a novel tool in plant breeding • Natural apomixis as a novel tool in plant breeding • Natural apomixis as a novel tool in plant breeding CONTRATTO "QLG2-CT-2000-00603"

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EUROPEAN COMMUNITY • CONTRATTO UE DYNABEECH QLK5-CT1999-01210 dal titolo: Effects of silvicultural

regimes on dynamics of genetic and ecological diversity of europeean beech forests" • CONTRATTO UE DYNAMO - QLK3-CT2000-30227 dal titolo: "The dynamic nature of

introgressive hybridisation in natural and introduced polyploid plants from agricultural and riparian landscapes"

• CONTRATTO UE RESROBS QLK5-2000-00241 RATEO 2003 • Contratto n. QLK5-2001-00631 UE RAP dal titolo: "Quality of life and Management of Living

Resources" • Contratto QLK5-CT2000-00241 RESROBS • SALDO CONTRATTO UE N. EVK2-CT1999-00036 FOSSILVA • Contratto QLK5-CT2001-00631 RAP • CONTRATTO UE FAIR3-CT96-1464 • CONTRATTO UE FAIR3-CT96-1949 SALDO

UNIVERSITY OF CAMBRIDGE • CONTRATTO CEE "MECHANISM OF TRANSGENE INTEGRATION IN CROP PLANT

PLASTIDS... " (CEE-PLASTOMICS)

PROVINCIA DI LECCE • Realizzazione di "Centro di Sperimentazione e divulgazione nel settore delle risorse Agricole"

Azienda Agricola SCARCIGLIA - Minervino di Lecce: Ricerca e Formazione - Incentivazione dell'azione informativa e formativa sul territorio

CEREALS RESEARCH DEPARTMENT, JOHN INNES CENTRE, • "New strategies to Improve Grain Legumes for Food and Feed"

FONDAZIONE CASSA RISPARMIO PERUGIA • FONDAZIONE CASSA DI RISPARMIO DI PERUGIA: Tutela e valorizzazione del patrimonio

olivicolo locale Contratti passivi

GENETICA VEGETALE - Sezione di Portici • CONVENZIONE OLIBIO87 TRA IGV - SEZ. PERUGIA E IGV SEZ. PORTICI

FRANCESCA DE MARCHIS • FRANCESCA DE MARCHIS: Contratto d'opera 2005

FOSS ITALIA S.p.A. • Rapid Visco Analyzer RVA-4

VARIAN SpA • VARIAN - Fatt. N. 600078475 del 24/06/2003 • VARIAN - Fatt. N. 600078472 del 24/06/2003

COMETA S.R.L. • COMETA Pulizia 2004

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ISTITUTO VIGILANZA FARO SRL • Servizio di vigilanza ispettiva anno 2005 • Obbligazione per servizio di vigilanza sede iGV

BIOCLASS • SISTEMA PURIFICAZIONE ACQUA

S.I.C.E.L. SNC • BOX CLIMATIZZATI PER SERRA

2M STRUMENTI SRL • STRUMENTAZIONI PER PREPARATIVA AL SEM

M-MEDICAL SRL • Obbligazione per acquisto attrezzatura scientifica

ATS FAAR SPA • ARREDI DA LABORATORIO

CONSORZIO AGRITAL RICERCHE • RIACQUISTO RISULTATI P.N.R. BIOTECNOLOGIE AVANZATE II FASE TEMA 4 IV SAL • RIACQUISTO RISULTATI P.N.R. BIOTECNOLOGIE AVANZATE II FASE TEMA 4

TEKNOLAB SRL • Acquisto di strumentazione scientifica: 1) ULTRACONGELATORE VERTICALE mod. VX570E

completo di Sicurezza CO2 per VXE-S

Beckman Coulter S.p.A.-CENTRO DIREZIONALE LOMBARDO • Acquisto attrezzatura: 1) CEQ 8800 Genetic Analysis System 2) Microfuge 18 3) PHMETRO

PHI350 elettrodo e cavo • Software per eleborazione dati e CEQ starter kit

ALLIED BIO TECHNOLOGIES • ADD-ON PER GC COMPRENDENTE INIETTORE PSS E DETECTOR FID

DEMOSERVICE COOP. ARL • Servizio pulizia locali sede IGV Bari 2005 • Obbligazione per servizio pulizia locali sede IGV anno 2004

CELBIO S.p.A. • CELBIO: MJ-RESEARCH CHROMO4 CONTINUOUS FLUORESCENCE DETECTOR • CELBIO: NANODROP 1000 UV VISIBLE NANOSPECTROPHOTOMETER • Strumentazione scientifica: - NANODROP 1000-UV-Visibile Spectrophotometer completo di

software

LEICA MICROSYSTEMS S.P.A. • Acquisto Stereomicroscopio Leica MZ 16F completo di accessori

SHIMADZU ITALIA S.R.L. • Acquisto attrezzature scientifiche

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BUCHI ITALIA SRL • Acquisto di strumentazione scientifica: 1) Unità di mineralizzazione a 6 posti 2) Unità di

scrubber 3) Distillatore in corrente di vapore

FEI ITALIA S.R.L. • MISCROSCOPIO ELETTRONICO A SCANSIONE ESEM VERSIONE QUANTA COMPLETO

DI MICROANALISI A RAGGI X E CAMERA CALDA • UP-GRADING MICROSCOPIO PHILIPS/FEI XL20

APPLERA ITALIA • Acquisto sistema per PCR • UNITA' DI SEPARAZIONE ELETTROFORESI A TEMPERATURA CONTROLLATA

DIPARTIMENTO DI BIOTECNOLOGIE AGRARIE • SALDO SUBCONTRATTO PROG. UE RESROBS QLK5-CT2000-00241

QUI! TICKET SERVICE SPA • Obbligazione per servizio mensa • Acquisto Buoni Pasto periodo Gennaio-Aprile 2003 • Buoni Ristorante periodo Giugno-Settembre 2003 • Obbligazione per acquisto buoni pasto • Obbligazione per acquisto buoni pasto • Obbligazione per fornitura di buoni pasto • Obbligazione per servizio sostitutivo mensa ai dipendenti • Acquisto Buoni Pasto

CO.IN.DA coperture industriali Dalena • Obbligazione per documento amministrativo passivo

DENTAMARO Giovanni • SISTEMA DI TELEGESTIONE PER CAMERE DI CONSERVAZIONE • Obbligazione per acquisto apparecchiatura tecnica

BECKMAN COULTER • Fornitura di: 1) CEQ 8800 Genetic Analysis System 2) Microfughe 18 3) PHmetro PHI 350

elettrodo e cavo

COMAR Costruzioni sas di Zito Cosimo & C. • Manutenzione ordinaria locali az. "PANTANELLI" saldo • Obbligazione per riaddatamento locali in uso • Obbligazione per lavori di riattamento locali • Obbligazione per lavori di ristrutturazione locali

SISTO Giuseppe • Obbligazione per compenso

FRUSCIANTE ROBERTO • CAMPO SPERIMENTALE POMODORO

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PETRINI GABRIELE • DR. PETRINI - PRESTAZIONE OCCASIONALE PER CONTROLLO OSSERVAZIONI E

MISURE AUXOMETRICHE

INTERNATIONAL PBI S.p.A. • Acquisto Agitatore Termost. Refrigerato

CEREALS RESEARCH DEPARTMENT, JOHN INNES CENTRE, • GRAIN LEGUMES - Advance payment duplicated in error

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Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Abi 310 Genetic Analyzer (Applied biosystems) - Abi Prism 5700 Sequence detection systems - AlfExpress automatic sequencer - Analyzer, cyclotec - Armadi termostatici, germinatori - Autofurgone - Box climatizzati per la crescita di piante sez. Portici - Camera fredd N. 1 - Sez. Perugia - Camera termoregolata colture in vitro - Camera termoregolata per colture in vitro N.1- Sez. Perugia - Camere di conservazione di germoplasma, Bari - Camere di conservazione di germoplasma, Valenzano - Camere di deumidificazione semi, Valenzano - Camere per la crescita delle piante in condizioni controllate - sez. Portici - Cappa flusso laminare - Cappe a flusso laminare sez. Portici - Celle climatiche N. 3 - Sez. Perugia - Centrifuga refrigerata da banco sez. Portici - Centrifuga refrigerata da bancone Beckman - Sez. Perugia - Centrifughe refrigerate - Congelatore -80 °C sez. Portici - Congelatore -80°C sez. Portici - Congelatore verticale -80 Angelantoni - Contratto di assistenza per PRC 9700 Applied Biosystem - Sez. Perugia - Elettroforesi capillare - Fotocopiatrice, impianti condizionamenti, impianto elettrico, computers - Sez. Perugia - Freezer (-80°C) marca Precision - Gas Cromatografo SHIMADZU GC - 17° con rivelatore FID - Gene Amp PCR system 9700 - Gene Amp PCR System 9700 - Gene Amp PCR system 9700 (Applied biosystems) - HPLC - Impianti del freddo per conservazione germoplasma, Valenzano - Impianti del freddo per conservazione germoplasma, Bari - Impianti del freddo sede di Bari - Impianti vari della sede di Bari - Impianto telefonico sede di Bari - Incubatore termostatato - sez. Portici - Incubatore termostatico sez. Portici - Laboratorio GasCromatografia - Macchina per conservazione sottovuoto - Manutenzione armadi frigoriferi - Sez. Perugia - Manutenzione congelatori -80°C - Sez. Perugia - Megafuge 1.0 R Heraeus - Microscopio a fluorescenza Leitz - PDS-1000/He Biolistic Particle Delivery System - PDS-1000/He Biolistic Particle Delivery System sez. Portici - Rete informatica sede di Bari - Robotic Workstation Beckman 2000

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- Scanner laser "Typhoon" sez. Portici - Sequenziatore Abi Prism 310 Genetic Analyzer - Sequenziatore automatico AlfExpress Amersham - Serra climatizzata sez. Portici - Serra mq. 320 - Sez. Palermo - Serre N. 2 - Sez. Perugia - Sistema di analisi di immagini sez. Portici - Sistema di telegestione per camere di conservazione - Sistema per amplificazione del DNA sez. Portici - Spettrofluorimetro - Spettrofotometro UV. VIS. SHIMADZU mod.UV 1601 - Stereomicroscopio con accessori - Terattore Fiat Cingolato 35 cv - Sez. Palermo - Ultracentrifuga - Workstation Beckman 2000 - celle climatiche - microscopio invertito Leitz - spettrofotometro UV-Vis Istituti con i quali si collabora


- Istituto per i sistemi agricoli e forestali del mediterraneo


- Istituto di biologia agro-ambientale e forestale

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Banca del DNA Vegetale: C.A.P.R.I. (Center for Advanced Plant Resources Implements)

Temi


Isolare e conservare DNA genomico dalle specie conservate, cloni di sequenze espresse o non espresse Avviare collezioni di specie modello (Arabidopsis spp., Medicago truncatula, ecc.) e di specie selvatiche Allestimento di banche dati contenenti informazioni di passaporto di quanto conservato, di valutazione e caratterizzazione Allestimento di banche dati sulle frazioni di DNA Creazione di un'interfaccia WEB per l'accesso ad utenze esterne.

Stato dell'arte:

Lo sviluppo delle banche di DNA sta guadagnando particolare attenzione nel mondo. Alcune istituzioni internazionali (USDA in USA, NIAB in Giappone, Royal Botanic Gardens in Gran Bretagna, Centre for Plant Conservation Genetics in Australia), si sono organizzate per creare banche dati di sequenze e DNA derivati da piante, per la loro consultazione in rete e per la distribuzione di cloni e campioni di DNA a studiosi che ne facciano richiesta.

Azioni

Attività in corso:

Nel campo della conservazione del DNA, l'IGV è l�unica Istituzione italiana che può vantare una posizione di privilegio, in quanto presso l'Istituto sono già disponibili librerie genomiche e di cDNA di oltre 35 differenti specie agrarie e forestali e migliaia di cloni di DNA sequenziati, che vengono utilizzati per lo studio e la valorizzazione delle risorse genetiche vegetali


Occorre investire risorse umane e finanziarie in un centro d'eccellenza che possa dare nuovo impulso alla conservazione ed utilizzazione delle risorse genetiche vegetali e consentire di mantenere alta la leadership culturale del CNR in questo settore, anche in ambito europeo. Inoltre occorre prevedere un approccio multidisciplinare alla questione integrando nel modello di sviluppo conoscenze di bioinformatica, di biologia molecolare, di genomica funzionale e comparata.


Tutte le sezioni dell'IGV parteciperanno all'attività. E' inoltre prevista collaborazione nell'ambito del Dipartimento L'ITB Sez. di Bari sarà coinvolto per le sue alte competenze in bioinformatica Integrazione con i progetti avanzati dell'IPGRI

Finalità

Obiettivi:

1 Allestimento di una DNA Bank, integrata con quella dei semi e con le collezioni viventi disponibili presso l'IGV 2. Riorganizzazione della banca di semi attraverso la creazione di banche specializzate,

130


con particolare attenzione alle specie modello 3. Implementazione di strumenti bioinformatici per l'integrazione e l'interrogazione delle banche dati


DNA genomico di specie che non possono essere conservate o distribuite sotto forma di semi DNA genomico di materiale genetico particolare (mutanti, anfiploidi, ibridi, ecc.) non propagabile per seme Organizzazione di collezioni attive di dimensioni contenute per un miglior management Allestimento di banche dati contenenti le informazioni raccolte Messa in rete delle banche dati

Potenziale impiego:


Funzionalita' e caratterizzazione genetica di ecosistemi forestali

Temi


Identificazione di geni, di marcatori adattativi e marcatori neutrali per il monitoraggio della variabilità genetica e per la genomica di alberi forestali Analisi dei meccanismi fisiologici e biochimici alla base della risposta a fattori di stress Individuazione di sistemi efficaci di moltiplicazione in vitro Selezione di piante di ideotipi e popolazioni.

Stato dell'arte:

La perdita di diversità biologica è preoccupazione per la sopravvivenza della popolazione umana. A ciò si associa la conservazione del germoplasma e come individuarne le migliori strategie di gestione. L�analisi della diversità genetica è considerata approccio indispensabile: le variazioni di tipo adattativo, quelle filogenetiche e gli effetti migrativi attraverso una genomica di popolazione potranno migliorare gli studi di genetica evoluzionistica da applicare alla conservazione delle specie.

Azioni

Attività in corso:

Genetica di popolazione con polimorfismi genici Studio di geni funzionali per resistenza a stress Filogenesi e filogeografia Dinamica della diversità genetica: mating system e flussi genici Genetica della conservazione: definzione di metodi di conservazione delle risorse genetiche Biochimica e fisiologia: meccanismi di risposta a fattori di stress Coltura in vitro di cellule e tessuti: moltiplicazione e conservazione del germoplasma Miglioramento genetico


Lunghi cicli di vita degli alberi forestali Difficoltà di accesso agli organi riproduttivi Scarse informazioni circa l�organizzazione e la funzionalità del genoma degli alberi forestali. Necessità di adeguare la strumentazione scientifica per aumentare la produttività e la competitività a livello internazionale Lunga esperienza nel settore Conoscenze di base di ecologia forestale robuste Collezioni di germoplasma e aree sperimentali uniche in Italia Laboratori in parte adeguati


Istituti Universitari italiani (Firenze, Udine, Pisa, Bologna, Viterbo, Napoli, Bari, Potenza, Campobasso, Milano, Palermo), Istituti CNR, MIPAF, ENEA Università di Aberdeen, Oxford, Southampton (UK), Uppsala (S), Zurigo (CH), Helsinki (F) Università del Wisconsin, Florida, NYU,

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Cornell, Stanford (USA) CSIRO (Australia) Max Plank (Germania) INRA, CNRS (Francia) VIB (Belgio) INIA (Spagna) WSL (Svizzera) USDA (USA) NISK (Norvegia)

Finalità

Obiettivi:

Identificazione di geni e marcatori molecolari Analisi della distribuzione della diversità a diverse scale geografiche Studio dell�evoluzione della diversità genetica Certificazione genetica delle foreste Analisi di meccanismi biochimici e fisiologici in risposta ai fattori di stress Protocolli per la moltiplicazione e conservazione in vitro di specie forestali Miglioramento genetico per la resistenza e caratteri di pregio Numerose pubblicazioni e progetti internazionali nel settore


Marcatori molecolari neutrali e adattativi Geni implicati nella risposta a stress Mappe di distribuzione della diversità genetica negli areali delle specie Gene-flow (seme vs polline) Metodi per la certificazione di materiale vegetale Meccanismi fisiologici e biochimici per la funzionalità dell�ecosistema Moltiplicazione vegetativa di tipi selezionati e conseguenti test colturali Database

Potenziale impiego:


Interventi biotecnologici finalizzati all'utilizzazione delle piante per l'ottenimento di nuovi prodotti per la salute, l'alimentazione e l'industria

Temi


Verranno prodotte PGM con geni per molecole ricombinanti, per proteine ad alto valore nutrizionale, per caratteri agronomici; verranno sviluppati approcci di ingegneria metabolica per la manipolazione dei pathway biosintetici di molecole naturali; verrà analizzata la variabilità genetica e biochimica per composti d�interesse in popolazioni di varie specie; verranno prodotti genotipi che accumulano alti livelli dei prodotti d�interesse; verranno sviluppati nuovi marcatori molecolari

Stato dell'arte:

Sostanze utili per varie applicazioni derivano dal metabolismo della cellula vegetale o dall�espressione di geni che codificano per prodotti di derivazione non vegetale. L�isolamento di sequenze geniche, l�identificazione di marcatori molecolari, lo sviluppo di tecniche per la trasformazione genetica delle piante, possono contribuire all�identificazione dei determinanti genetici alla base dei processi metabolici ed alla produzione di specifici metaboliti e nuove molecole nelle cellule vegetali

Azioni

Attività in corso:

Costruzione di vettori per la produzione di molecole in piante transgeniche e per la costituzione di piante con nuove caratteristiche; analisi dell�espressione genica plastidiale; �screening� di specie vegetali per la produzione di biomasse; campionamenti ed analisi biochimiche in popolazioni naturali di specie mediterranee; caratterizzazione della variabilità genetica naturale e sviluppo di colture cellulari in specie varie; identificazione di marcatori molecolari e selezione di genotipi

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Punti critici: stabilità delle proteine esogene nelle cellule vegetali; metodi per l'individuazione di molecole e genotipi interessanti; conoscenze biochimiche adeguate; protocolli di colture in vitro e di trasformazione genetica; obsolescenza della strumentazione scientifica; necessità di nuovi spazi laboratorio e studio. La fattibilità delle ricerche proposte è garantita dalle esperienze specifiche dei ricercatori coinvolti e dalle collaborazioni attive.


INT �Pascale�-Napoli; Max Planck Institute-Gölm, Germania; Rutgers Univ., USA; Univ. Cambridge, UK; Univ. Central Florida, USA; Univ. Perugia; CNR-IBBA; Univ. Molise; CRA-ISCI; Univ. Salerno; CNR-ICB; Univ. Firenze; CNR-ISPA; Cornell Univ., USA; Univ. Napoli; CRA-ICF

Finalità

Obiettivi:

Individuazione di molecole d�interesse nelle specie studiate; analisi della variabilità genetica per il tipo di molecole ed il livello di produzione; isolamento di geni e sequenze geniche coinvolti nella biosintesi delle molecole d�interesse; sviluppo di tecnologie per la sovraespressione delle molecole di origine vegetale ed esogena; produzione delle molecole d'interesse in vivo e/o in vitro. Competenze: genetica, miglioramento genetico, biologia cellulare e molecolare, biochimica


2005: vettori e protocolli per trasformazione genetica; geni per metaboliti secondari; protocolli per coltura di cellule e tessuti; popolazioni naturali caratterizzate a livello biochimico e genetico; marcatori molecolari 2006: vettori; geni; piante transgeniche; protocolli per l'ingegneria metabolica; marcatori molecolari utilizzati per la selezione; moltiplicazione di genotipi e chemotipi 2007: piante transgeniche, genotipi e chemotipi caratterizzati; saggi biologici con le molecole prodotte

Potenziale impiego:


Genomica e Proteomica per il miglioramento della produttività e della qualità delle piante

Temi


Nella maggior parte dei casi si tratta di continuare le attività di ricerca iniziate e che sembrano alquanto promettenti per il conseguimento di interessanti risultati. In altri casi le ricerche sono appena iniziate o debbono ancora iniziare perché i finaziamenti o si sono resi disponibili solo di recente o lo saranno nei primi mesi del 2005. Lo svolgimento dell'attività programmata richiede l'assunzione di giovani a tempo determinato

Stato dell'arte:

Sono in corso attività di ricerca su specie di notevole interesse agrario al fine di acquisire informazioni che possano consentire il miglioramento della qualità e della produttività delle piante, nonché la caratterizzazione molecolare delle produzioni per consentirne la rintracciabilità e, almeno, il mantenimento delle attuali quote di mercato. Le specie considerate sono largamente utilizzate nell'alimentazione umana ed animale ed alcune assicurano produzioni tipiche del paese.

133


Azioni

Attività in corso:

Allestimento di mutanti per inserzione e per tilling in M.truncatula, caratterizzazione di specie ed identificazione di aplotipi specifici di aree di produzione in Tuber e di marcatori per la selezione assistita in olivo; preparazione di una libreria BAC in citrus; identificazione dei geni responsabili dell'apomissia in graminacee; sequenziamento regioni eucromatiche di pomodoro; analisi trascrizionale del frutto, della risposta ad alte temperature e salinità in pomodoro e siccità in pata


Si incontrano difficoltà per: crescita di piante a condizioni controllate per l'obsolescenza delle camere di crescita; assenza di piattaforme tecnologiche; - reperimento di materiali biologici e assenza di specie modello in Tuber;- identificazione di geni a causa della bassa espressione e presenza di sequenze ripetute. Personale IGV Perugia:Fusco Calderini si è trasferito all�Università a partire dal 1-11-04 e Anna Mariani andrà in pensione il 1-4-04.


Le collaborazioni interesseranno: Istituti e gruppi CNR, Università italiane (Torino, Verona, Padova, Firenze, Bologna, Aquila, Roma, Napoli, Basilicata, Palermo) Istituti del MiPAF (Colture Foraggere, Olivicoltura, Selvicoltura, Cerealicoltura), ENEA, Università di Clemson (USA), Università di Uppsala (Svezia), IGER Aberystwth(Regno Unito), CSIRO (Australia), CONICET-UNSAM (Argentina), Università di Zurigo, Università di Cornell (USA), Università di California (USA), CNRS-UPR2355 (Francia).

Finalità

Obiettivi:

Acquisire informazioni molecolari per migliorare la qualità e la produttività di alcune piante agrarie determinati per l�economia nazionale; identificazione e caratterizzazione di aplotipi, genotipi e geni candidati per una agricoltura più scientifica e per ridurre le frodi di mercato. La maggior parte delle competenze necessarie sono in possesso dei ricercatori coinvolti ed altre saranno acquisite da collaborazioni già in atto con rilevanti strutture di ricerca nazionali ed intern


Le collezioni di mutanti, in parte già disponibili, saranno completate nel 2006. Per alcune specie di Tuber è prevedibile un'associazione tra aplotipi ed aree geografiche, specie per le regioni del Sud. La caratterizzazione genotipica, l'individuazione di geni candidati, QTL e la rintracciabilità degli oli darà risultati nell'arco di un triennio. Nuove informazioni sui meccanismi molecolari responsabili dell'espressione di caratteri potranno essere disponibili nel prossimo/i anno/i.

Potenziale impiego:


Caratterizzazione e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali con tecniche innovative

Temi


Missioni di esplorazione e raccolta di RGV Utilizzo di varie classi di marcatori molecolari (AFLP, microsatelliti, mtDNA, SNP, ecc.) per valutare la variabilità genetica, per il fingerprinting molecolare,

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per il riscontro di marcatori associati a caratteri di interesse e per studi di mappatura in diverse specie erbacee ed arboree. Studi sull�evoluzione di geni in specie coltivate e loro parenti selvatici.

Stato dell'arte:

Le risorse genetiche vegetali (RGV) sono il patrimonio su cui si fonda la ricerca agro-alimentare del futuro. Esse sono il fondamento per il miglioramento qualitativo e quantitativo della produzione agro-alimentare e forestale. Lo sviluppo delle conoscenze scientifiche sulle RGV è altrettanto importante che la stessa loro conservazione, in quanto garantisce il loro miglior utilizzo nei programmi di sviluppo. Questi studi possono consentire la massima valorizzazione dei prodotti tipici locali.

Azioni

Attività in corso:

Reperimento di germoplasma Studi di variabilità e identificazione varietale mediante marcatori molecolari in specie arboree (ciliegio, olivo, vite, Citrus) ed erbacee (fagiolo, fava, lenticchia, cicerchia) Studi su marcatori biochimici/molecolari associati alla qualità (carciofo, frumento, fagiolo, lenticchia,) o caratteri di pregio studi di mappatura (ciliegio) Ibridazione somatica (patata, Citrus) ed embriogenesi somatica (vite, Citrus) Relazioni dei genepool selvatici e coltivati


Punti critici: alcuni problemi di spazio (soprattutto per la sede di Bari), limitazione di risorse umane (soprattutto giovani ricercatori) e strumentali disponibili, vetustà di parte della strumentazione, limitazione di fondi Punti di forza: i ricercatori dell'IGV afferenti sono altamente qualificati, possiedono un notevole know-how ed hanno accesso ad alcune infrastrutture localmente presenti. Anche la collaborazione con le Università locali è ben sviluppata


Ministeri (MIUR, MIPAF, Ministero Ambiente) Organi afferenti alle reti CNR, Università, CRA, ENEA Università ed organizzazioni di ricerca extranazionali Enti Locali, Regioni, Aziende Regionali di Sviluppo Agricolo, Gruppi di Azione Locale, Associazioni di categoria Istituti della rete CGIAR (IPGRI, ICARDA, IITA) organi della FAO

Finalità

Obiettivi:

Reperimento di nuove RGV Studio della struttura genetica dei singoli campioni Sviluppo di marcatori associati a specifiche caratteristiche d'interesse e utili a descrivere la variabilità genetica e alla selezione assistita Studio delle caratteristiche qualitative di campioni Metodi avanzati di utilizzazione delle RGV Studi su evoluzione, domesticazione ed adattamento delle RGV L�IGV possiede competenze di genetica vegetale, miglioramento genetico, biologia molecolare e biotecnologie.


Nuovi campioni di RGV Misura della variabilità genetica entro e tra popolazioni, usando marcatori molecolari Fingerprinting di varietà locali e studi finalizzati alla valorizzazione Individuazione di marcatori per caratteristiche di pregio, o specifici pathway per sintesi di sostante utili Uso delle RGV con metodologie avanzate (ibridazione interspecifica e somatica, mutanti meiotici, ecc.) Conoscenze sull'origine di alcune specie coltivate e sulle relazioni con specie selvatiche affini

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Potenziale impiego:


Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare

Temi


Raccolte di germoplasma in aree mirate e per specifici segmenti della collezione Collezione di specie modello e gene stocks Revisione ed integrazione delle banche dati sul germoplasma conservato Prima moltiplicazione del materiale raccolto Moltiplicazione di alcuni segmenti della collezione Indagini sulla qualità fisiologica delle collezioni Studio di sistemi avanzati di conservazione (in vitro, criopreservazione, ecc.) Studio della fattibilità di una banca di DNA

Stato dell'arte:

Nell'Ente sono già presenti ampie collezioni di organismi di interesse agro-alimentare (piante, animali, lieviti, batteri, ecc.) che necessitano di una gestione costante ed avanzata per il loro mantenimento e per una catalogazione rispondente all'esigenza di renderle accessibili alla comunità scientifica, attraverso l'uso di banche dati facilmente interrogabili. Gli strumenti fisiologici aiutano a monitorare nel tempo lo stato delle collezioni e a garantirne la massima conservabilità.

Azioni

Attività in corso:

L'IGV mantiene una collezione di oltre 80000 campioni di germoplasma appartenenti a oltre 40 generi e 600 diverse specie, includendo specie erbacee coltivate e progenitori selvatici, oltre che arboreti. Oltre 13.000 di questi campioni sono stati raccolti direttamente, mentre gli altri derivano da scambi con altre istituzioni. La gran parte della collezione è duplicata per sicurezza in altri centri extranazionali. Attualmente stanno avviando collezioni di specie modello e di gene stocks


Punti critici: alcuni problemi di spazio (soprattutto per la sede di Bari), limitazione di risorse strumentali disponibili, vetustà di parte della strumentazione, limitazione di fondi. Sono inoltre aperte alcune questioni sulla gestione delle collezioni Punti di forza: l'IGV è altamente qualificato in questo settore per la oltre che trentennale attività svolta


Altri istituti CNR (ISPA, IVALSA, IBAF, IBBA, IVV, ISPAAM, IPP, ITB), CRA, Università Enti Regionali e Provinciali, Comuni, Associazioni di categoria Centri extranazionali, Università di Kassel, IPK, Jardin Botanico de Barcelona Centri del CGIAR, IPGRI, ICARDA, ICRISAT

Finalità

Obiettivi:

Mantenimento delle collezioni attualmente esistenti a breve e lungo termine in funzione della biologia della riproduzione Identificazione di tecniche di mantenimento appropriate per conservare la struttura genetica originaria dei campioni Integrazione dei singoli database in un sistema avanzato di gestione dei dati Ottenimento di lotti di campioni ad elevata qualità per la distribuzione Sviluppo di core collections rappresentative della variabilità presente in ciascuna specie

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Censimento di: collezioni, metodi di conservazione, attività di scambio Mantenimento in sicurezza delle collezioni Controllo dello status fisiologico e sanitario delle collezioni mediante sistemi avanzati e non invasivi Lotti ringiovaniti delle collezioni Sviluppo di "Material Transfer Agreement" Avvio di un "gene stock" (specie modello, ecotipi, varianti alleliche, mutanti) Modello preliminare d'integrazione dei database esistenti e prototipo di interfaccia WEB

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005



Al momento, il sequestro delle celle di conservazione appare come il più consistente punto di criticità per lo sviluppo delle attività di questa commessa.

Collaborazioni

Sono state confermate collaborazioni in atto con Enti locali (Camera di Commercio di Lecce), Regioni (Sicilia), Università (Portici, Molise) E’ in corso di definizione una collaborazione con l’IPK di Gatersleben (D) per verificare lo stato di conservazione di materiali raccolti in Italia.


Purtroppo la vicenda giudiziaria che ha portato al sequestro delle camere di conservazione di Bari, sulla quale l'Amministrazione è stata tenuta in tempestivo e continuo aggiornamento, ha fortemente limitato le capacità operative di questa commessa. Anche l'aggiornamento delle banche dati ha subito un ritardo stante l'impossibilità di accedere ai relativi registri, come comunicato all’Amministrazione. Altre attività non legate alle celle di conservazione, soprattutto quelle allocate in sedi diverse da Bari, hanno potuto comunque essere svolte.


Non tutta l’attività prevista ha potuto essere svolta, in quanto le celle di conservazione sono sottoposte a sequestro giudiziario. Tuttavia si è attivato un sito di backup per alcuni piccoli segmenti della collezione presso le strutture di Policoro. Il materiale raccolto è stato mantenuto in celle di conservazione a breve-medio termine non interessate dal sequestro per evitarne il deperimento Su lotti di semi (lenticchia, cavolo, rucola) selezionati a diverso livello di germinabilità è stato avviato uno studio per correlare parametri d’analisi d’immagine (marcatore RGB) alla performance germinativa del seme al fine di estrarre sottocampioni ad elevata qualità germinativa (http://germimaging.ba.cnr.it). E’ stato condotto il ringiovanimento della collezione “farro” consistente di circa 1200 campioni. E’ stato sviluppato un MTA (Material Transfer Agreement) basato su quello in uso presso l’IPK di Gatersleben. E’ in corso di sviluppo un prototipo di sistema di

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gestione delle banche dati, basato su un modello relazionale, che consentirà l’integrazione delle preesistenti banche di dati in formato testuale sviluppate negli anni precedenti.

Banca del DNA vegetale e sviluppo di una piattaforma per l’analisi di genomi vegetali


All’avvio della commessa non si possedeva la strumentazione per la conservazione ed analisi del DNA ed era limitato il relativo Know-How. Durante il 2005 si è acquisita una notevole quantità di strumentazione (Freezer -80°C, Sequenziatore, Mulini per l’estrazione del DNA, ecc.) e sono stati stabiliti contatti con la Banca del DNA operante a Kew Gardens (UK) e col NASC (European Arabidopsis Stock Centre) di Nottingham (UK) Resta da acquisire ulteriore strumentazione, soprattutto per l’automazione. Restano inalterati i problemi di spazio, anche se piccole modifiche alla struttura di Bari hanno leggermente ridotto la pressione demografica nei laboratori.

Collaborazioni

Sono in via di definizione collaborazioni con la Banca del DNA di Kew Gardens (UK) e col NASC (European Arabidopsis Stock Centre) di Nottingham (UK) E' in corso una collaborazione con l'Università di Napoli finalizzata all'integrazione delle banche dati prodotte con quelle già esistenti


Non ci sono scostamenti significativi.


I risultati attesi per il 2005 sono stati conseguiti: estratto DNA genomico da: 30 popolazioni di carciofo selvatico e varietà locali, 27 popolazioni di “Peperone di Senise”, 10 popolazioni di Eruca raccolte in Sud Italia (in corso), 30 ecotipi di A.thaliana raccolti in Sud Italia (in corso), da linee e gentopi diversi di carciofo, pomodoro, patata,450 varietà di olivo, 10 popolazioni di olivo selvatico e 30 piante antiche da paesi Mediterranei. I campioni estratti, quantificati e verificati, sono attualmente conservati a -80°C Allestimento e conservazione di: collezione di EST da L. corniculatus; di sequenze genomiche di tartufo; libreria genomica BAC di P. simplex apomittico; sequenze fiancheggianti retrotrasposone Tnt da mutanti di M. truncatula; libreria cDNA di pomodoro arricchita di sequenze da stress termico, durante fioritura e allegaggione Allestite banche dati preliminari in formato Excel con dati di passaporto delle accessioni raccolte e dei campioni di DNA conservati; di un database dei dati di espressione genica (collab. Univ. Napoli) E’ in via di sviluppo un prototipo di sistema di gestione delle banche dati e di una interfaccia per la messa in rete dei dati.

Gestione e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali con tecniche innovative


La strumentazione presente in istituto era obsoleta. Durante il 2005 si è acquisita una notevole quantità di nuova strumentazione (Rapid visco analyser, Analizzatore di proteine micro-Kieldal, HPLC, Analizzatore d’immagini, ecc.) oltre a miglioramenti della struttura informatica della sede di Bari. Resta da acquisire ulteriore strumentazione, soprattutto per quanto attiene all’automazione, al fine di rendere più efficace l’attività e dare maggiore appetibilità alle richieste di partecipazione a progetti a finanziamento esterno. Restano inalterati i problemi di spazio e di personale già previsti in fase di predisposizione del PdG 2005, anche se piccole modifiche alla struttura di Bari hanno leggermente ridotto la pressione demografica nei laboratori

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Collaborazioni

Una collaborazione con l’Università di Kassel è molto attiva per la organizzazione e conduzione di missioni di reccolta di germoplasma, sia in Italia che all’estero Inoltre è in corso di definizione una collaborazione col CSIC di Granada(E) Ministeri (MIUR, MIPAF, Ministero della Salute) Organi afferenti alle reti CNR (ISPA, IValSA, IBBA), Università (Bari, Portici, Potenza), CRA (Frutticoltura, Orticoltura), ENEA (Casaccia), Enti Locali (Provincia di Lecce), Regioni (Basilicata), Aziende Regionali di Sviluppo Agricolo (ALSIA),


Non ci sono scostamenti significativi dall’attività prevista per il 2005


I risultati attesi per il 2005 sono tutti stati conseguiti. In particolare: raccolte a Creta (circa 100 campioni di specie locali) ed in Italia (Campania, Isole di Gorgonia e Montecristo, Puglia e Basilicata; circa 100 camioni di materiale selvatico e coltivato); sviluppo di una varietà di farro, ora in prova nazionale; studi di diversità genetica in fagiolo, lenticchia, frumento, carciofo e specie selvatiche vicine mediante marcatori biochimici (proteine del seme) e molecolari (AFLP, SSR, ISSR); recupero dell’ecotipo “lenticchia di Altamura” scomparso dal ’70; indagini sulla struttura genetica ed identificazione di marcatori in specie di interesse economico e/o industriale (fagiolo, carciofo, frumento, ecc.); studio mediante omologia di sequenza di sistemi genici per individuare nuovi loci e/o alleli (Glutammina sintetasi, Fenil-ammonia-liase, Inibitori di proteasi); espressione differenziale a livello di diversi organi degli alleli identificati; indagine sulla origine e diffusione di cultivar locali di lenticchia, alcune sottoposte a marchi di tutela; ricerca sull’origine del carciofo e del cardo coltivato basata sulla differenziazione delle sequenze ITS ed ETS.

Ottenimento di nuovi prodotti per la salute, l'alimentazione e l'industria mediante interventi genetici e biotecnologici nelle piante


Si confermano le difficoltà per il livello di espressione e la stabilità delle proteine esogene di origine virale nelle cellule vegetali, per cui verranno testati nuovi vettori con prodotti di fusione e/o per l’espressione dei transgeni in compartimenti cellulari diversi. I protocolli di rigenerazione e trasformazione genetica sono ancora un fattore limitante in aster e carciofo, per cui saranno testati nuovi protocolli e ceppi di Agrobatterio. Nella patata è limitante il livello di espressione dei transgeni negli amiloplasti dei tuberi, per cui si cercherà di identificare sequenze regolatrici che aumentano l’espressione in questi organelli. Per lo sfruttamento delle molecole d'interesse in carciofo ed altre specie un punto critico è ancora la scarsa conoscenza dei pathway metabolici. In erba medica Aintegumenta sembra avere un effetto negativo sulla trasformazione. Per l'analisi dei profili trascrizionali e l'identificazione dei geni coinvolti nei pathway metabolici è limitante la disponibilià di apparecchiature ad alta produttività e di spazi per l'allevamento delle piante in ambienti controllati. Lo spazio per studi e laboratori nella sede di Portici è un forte punto critico.

Collaborazioni

Le collaborazioni già evidenziate sono state realizzate. Inoltre sono state attivate quelle riportate di seguito: - INMI "L. Spallanzani" (Roma) per la produzione di antigeni virali in pianta - SZN (Napoli) e Boyce Thomson Institute (Ithaca, USA) per l'analisi dei profili trascrizionali in pomodoro - ISA del CNR (Avellino) per l'analisi dei polifenoli in carciofo - Shanghai Institute of Plant Physiology and Ecology (CAS), Cina - Shanghai Institute for Biological Science /CAS), Cina, per le ricerche sul

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miglioramento della qualità e la produzione di molecole ricombinanti in erba medica - Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, Germania per le ricerche sulla senescenza delle foglie in erba medica


In genere non ci sono stati scostamenti significativi tra quanto previsto e quanto conseguito. Non è stato possibile determinare la produzione di biomassa in canapa a causa della scarsa germinabilità dei semi


Sono stati prodotti: vettori per la trasformazione plastidiale in tabacco e patata, la localizzazione subcellulare di antigeni virali (HIV, HPV), la coespressione di proteine di fusione (g-zeina-nef); protocolli per la trasformazione plastidiale in tabacco e patata, la trasformazione genetica con Agrobatterio in aster e salvia, la coltura di cellule ed "Hairy Roots" in aster e salvia, l'estrazione ed esterificazione degli acidi grassi da seme di borrago; piante transgeniche di erba medica con geni (Sag12IPT ed aintegumenta) per la senescenza delle foglie e le dimensioni del seme e di salvia con il fattore di trascrizione OsMyb4. Sono stati solati geni (pal, flavonoide 3' idrossilasi, OXA1) in carciofo ed aster. Sono stati caratterizzati i profili trascrizionali ed i geni differenzialmente espressi durante la maturazione della bacca in pomodoro. E’ stata valutata: la variabilità genetica in rucola, borrago, rosmarino, ginepro, carciofo, agrumi, per caratteri biochimici (isoprenoidi, polifenoli, flavonoidi) e morfo-fisiologici (caratteristiche del seme); le proprietà antiproliferative in vitro su cellule tumorali di succhi di agrumi; la produzione di biomassa in specie diverse.



-Diviene sempre più limitante la disponibilità di camere di crescita e/o serre climatizzate per allevare le piante in condizioni controllate. Tali difficoltà sono già state riportate nel piano di previsione. - Difficoltà di saggi di biocontrollo sulle specie selvatiche di pomodoro. - Mancanza di infrastrutture (serre, spazi coperti e scoperti) per allevare in olivo le progenie da incrocio su cui effettuare la valutazione fenotipica dei caratteri in selezione. - La complessità strutturale del locus per l’apomissia non sembra superabile mediante la mappatura comparativa con il riso, la specie modello per le graminacee. - In Tuber si hanno difficoltà nel reperimento di campioni per le indagini. Impossibilità di indurre fruttificazione in condizioni controllate. Assenza di organismi modello filogeneticamente affini da cui mutuare conoscenze scientifiche ed approcci sperimentali. - Disponibilità critica di apparecchiature ad alta produttività per analisi di genomi complessi. - Carenza di fondi per ricerche di base sul controlllo genetico ed ambientale dei flavonoidi in piante agrarie dove, a differenza di Arabidopsis, per i tannini condensati sono attivi due pathways paralleli.

Collaborazioni

In aggiunta alle collaborazioni già indicate in fase di previsione vanno aggiunte: Univ. Napoli Federico II, Dip.ti Sci. suolo, pianta e ambiente, Portici; Univ. Salerno, Dip. Sci. Farmaceutiche, Salerno; Univ. Padova, Centro CRIBI, Padova; Boyce Thomson Institute (BTI), Cornel Campus, Ithaca, NY USA; Hebriew Univ., Dept. of Field Crops, Vegetable and Genetics, Rehovot, Israel; Univ. di Pur due, Dep. Horticulture and Landscope Architecture, USA; Univ. Wageningen, Laboratory of Genetics, Olanda; Plant Research International, Wageningen, Olanda; Univ. Perugia- Dip. di Biologia Vegetale, Biotecnologie Agro-Ambientali, Perugia; Univ. Tuscia, Dip. di Produzione Vegetale, Viterbo; Centre National de la Research Scientific, Institut des Sciences Végétales, Parigi, Francia; CNR-IBBA,

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Milano; ENEA Centro Ricerche Trisaia, Rotondella, Matera; Stages di ricercatori: BTI, IGER di Aberystwth (UK) e Institute of Plant Biology, Zurich (CH)


Nella maggior parte dei casi non si è avuto scostamento tra attività svolte e risultati conseguiti. In olivo, invece, non è stato possibile mappare i QTL per difficoltà nella valutazione fenotipica di popolazioni segreganti. Inoltre, lo studio della funzione dei due geni responsabili della sintesi di catechina ed epicatechina non è stato possibile a causa di un accidentale incremento di temperatura che ha determinato la morte delle relative piante transgeniche.


Nella maggior parte dei casi non si è avuto scostamento tra attività svolte e risultati conseguiti. In pomodoro sono state sviluppate nuove risorse genetiche, metodologie FISH e marcatori molecolari per la selezione di cloni BAC e condotte analisi dell’interazione pianta/patogeni in vista dell’identificazione di QTL. In pomodoro ed in patata sono stati identificati geni indotti da stress abiotici. In M.truncatula è in allestimento una collezione di mutanti per genetica diretta ed inversa. In olivo loci SSR e marcatori SNP hanno consentito la caratterizzazione di genotipi, la rintracciabilità di oli e fornito informazioni per la selezione assistita. Il sequenziamento di un BAC dell’apomissia in Paspalum ha mostrato molti trasposoni e rari geni. In Arabidopsis è stata ottenuta una linea per inserzione con alta espressione di GUS in meiosi. In fagiolo sono stati individuati geni per proteine di tipo lectinico, è stata condotta un’analisi evolutiva del locus. Per i tannini condensati sono stati valutati i geni responsabili di catechina ed epicatechina. In Tuber marcatori SSR hanno consentito di conoscere la struttura genetica e filogeografica ed il sistema riproduttivo.



Vengono confermate le difficoltà già accennate: lunghi cicli di vita degli alberi forestali Difficoltà di accesso agli organi riproduttivi Scarse informazioni circa l’organizzazione e la funzionalità del genoma degli alberi forestali. Necessità di adeguare la strumentazione scientifica per aumentare la produttività e la competitività a livello internazionale. Si evidenzia inoltre la mancanza di personale laureato e tecnico non solo di laboratorio, ma anche quello adatto (da addestrare) ai lavori di campagna indispensabile per la predisposizione del materiale oggetto di studio (l'ecosistema bosco non si può, attualmente, ricostruire in laboratorio!).

Collaborazioni

Istituti Universitari italiani (Firenze, Udine, Pisa, Bologna, Viterbo, Napoli, Bari, Potenza, Campobasso, Milano, Palermo), Istituti CNR, MIPAF, ENEA Università di Aberdeen, Oxford, Southampton (UK), Uppsala (S), Zurigo (CH), Helsinki (F) Università del Wisconsin, Florida, NYU, Cornell, Stanford (USA) CSIRO (Australia) Max Plank (Germania) INRA, CNRS (Francia) VIB (Belgio) INIA (Spagna) WSL (Svizzera) USDA (USA) NISK (Norvegia)


Nessun scostamento.


Marcatori molecolari neutrali e adattativi. Geni implicati nella risposta a stress. Mappe di distribuzione della diversità genetica negli areali delle specie Gene-flow (seme vs polline). Metodi per

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la certificazione di materiale vegetale. Meccanismi fisiologici e biochimici per la funzionalità dell’ecosistema. Moltiplicazione vegetativa di tipi selezionati e conseguenti test colturali Database.

Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: LUIGI MONTI Elenco dei partecipanti

Temi

Tematiche di ricerca Raccolte di germoplasma in aree mirate e per specifici segmenti della collezione Collezione di specie modello e gene stocks Revisione ed integrazione delle banche dati sul germoplasma conservato Prima moltiplicazione del materiale raccolto Moltiplicazione di alcuni segmenti della collezione Indagini sulla qualità fisiologica delle collezioni Studio di sistemi avanzati di conservazione (in vitro, criopreservazione, ecc.) Studio della fattibilità di una banca di DNA

Stato dell'arte Nell'Ente sono già presenti ampie collezioni di organismi di interesse agro-alimentare (piante, animali, lieviti, batteri, ecc.) che necessitano di una gestione costante ed avanzata per il loro mantenimento e per una catalogazione rispondente all'esigenza di renderle accessibili alla comunità scientifica, attraverso l'uso di banche dati facilmente interrogabili. Gli strumenti fisiologici aiutano a monitorare nel tempo lo stato delle collezioni e a garantirne la massima conservabilità.

Azioni

Attività da svolgere A seguito dei suggerimenti del Comitato Ordinatore, nel 2006 questa commessa viene inserita come modulo della commessa AG.P02.005 (AG-P02-IGV-C5) "Caratterizzazione e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali con tecniche innovative" Occorre quindi fare riferimento al modulo AG.P02.005.003 "Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare"

Punti critici e azioni da svolgere fare riferimento al modulo AG.P02.005.003 "Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare"

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Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Da oltre 30 anni l'IGV mantiene una collezione di oltre 80000 campioni di germoplasma appartenenti a oltre 40 generi e 600 diverse specie, includendo specie erbacee coltivate e progenitori selvatici, oltre che arboreti. Oltre 13.000 di questi campioni sono stati raccolti direttamente, mentre gli altri derivano da scambi con altre istituzioni. La gran parte della collezione è duplicata per sicurezza in altri centri extranazionali. Sono inoltre presenti collezioni di specie coltivate e selvatiche di agrumi, patata (soprattutto in vitro) e pomodoro Attualmente stanno avviando collezioni di specie modello e di gene stocks

Collaborazioni (partner e committenti) Altri istituti CNR,Università, Enti Regionali e Provinciali, Comuni, Associazioni di categoria Centri extranazionali, Università di Kassel, IPK, Jardin Botanico de Barcelona Centri del CGIAR, IPGRI, ICARDA, ICRISAT

Finalità

Obiettivi Mantenimento delle collezioni attualmente esistenti a breve e lungo termine in funzione della biologia della riproduzione Identificazione di tecniche di mantenimento appropriate per conservare la struttura genetica originaria dei campioni Integrazione dei singoli database in un sistema avanzato di gestione dei dati Ottenimento di lotti di campioni ad elevata qualità per la distribuzione Sviluppo di core collections rappresentative della variabilità presente in ciascuna specie

Risultati attesi nell'anno fare riferimento al modulo AG.P02.005.003 "Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare"

Potenziale impiego - per processi produttivi Il mantenimento del germoplasma è la base per la costituzione di nuove varietà o per l’identificazione di quelle più adatte a nuovi processi produttivi che cambiano nel tempo Lo sviluppo di un metodo non distruttivo e tecnicamente semplice per determinare la qualità germinativa dei semi (marcatore RGB) consente lo sviluppo di tecnologie semplici e poco costose per la selezione di lotti di seme d’elevata qualità per l’industria sementiera I gene stock conservati consentono lo sviluppo di nuove tecniche di miglioramento genetico e/o di nuovi prodotti

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Conservare il germoplasma di una comunità aiuta a conservare l’identità culturale della stessa anche quando le varietà originali fossero perdute definitivamente L’accessibilità via WEB a servizi informativi consente l’accesso alle informazioni conservate a studiosi e a studenti, nonché ad amministratori pubblici

Moduli

Modulo: Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+90 0 0 0 0 0 0 0 N.D. 0








Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0



Banca del DNA vegetale e sviluppo di una piattaforma per l’analisi di genomi vegetali

Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti di sviluppo competenze Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: LUIGI MONTI Elenco dei partecipanti liv. Arcioni Sergio I Baldoni Luciana III Calderini Ornella III Campanella Giovanni VIII Campanella Nicola IV Carpinelli Giancarlo VII Cataldo Pasquale VI Cifarelli Salvatore V Colaprico Giuseppe IV Consiglio Maria Federica III

liv.Damiani Francesco II De Luca Maria Grazia VII Grillo Maria Stefania III Laghetti Gaetano II Laino Martino VII Margiotta Benedetta II Paolocci Francesco III Pignone Domenico II Porceddu Andrea III

liv.Pupilli Fulvio III Ranieri Giulia VI Rubini Andrea III Scarascia Marisa V Scimmi Rita VII Sonnante Gabriella III Sonnante Giuseppe V Stimolo Lucia VI Urbano Marcella III

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Temi

Tematiche di ricerca Isolare e conservare DNA genomico dalle specie conservate, cloni di sequenze espresse o non espresse Avviare collezioni di specie modello (Arabidopsis spp., Medicago truncatula, ecc.) e di specie selvatiche Allestimento di banche dati contenenti informazioni di passaporto di quanto conservato, di valutazione e caratterizzazione Allestimento di banche dati sulle frazioni di DNA Creazione di un'interfaccia WEB per l'accesso ad utenze esterne Sviluppare strumenti per l'elaborazione informatica e gestione dei dati prodotti dalle attività delle varie commesse strategiche dell'IGV

Stato dell'arte Lo sviluppo delle banche di DNA sta guadagnando particolare attenzione nel mondo. Alcune istituzioni internazionali (USDA in USA, NIAB in Giappone, Royal Botanic Gardens in Gran Bretagna, Centre for Plant Conservation Genetics in Australia), si sono organizzate per creare banche dati di sequenze e DNA derivati da piante, per la loro consultazione in rete e per la distribuzione di cloni e campioni di DNA a studiosi che ne facciano richiesta Nel 2005 è stato creato un primo nucleo di banca di DNA presso la sede di Bari dell'IGV, acquisendo le necessarie strumentazioni ed avviando l'attività su specifici segmenti delle collezioni. Tutte le Unità Organizzative dell'IGV hanno partecipato a tale sviluppo

Azioni

Attività da svolgere Presso la sede e le UO si prevede: Isolare e conservare DNA genomico da specifici segmenti delle collezioni presenti presso l’IGV e cloni di sequenze espresse o no: - collezione di EST di L. corniculatus. - collezione di sequenze genomiche di tartufo e di sequenze conservate contenenti SNPs diagnostici - collezione di DNA di olivo da varietà coltivate, popolazioni selvatiche e piante plurisecolari - libreria genomica BAC di P. simplex apomittico - collezione di sequenze fiancheggianti il retrotrasposone Tnt da linee mutagenizzate di M. truncatula - DNA da linee e genotipi diversi di carciofo, pomodoro, patata. - librerie cDNA arrichite di sequenze specifiche; Incrementare collezioni di specie modello (Arabidopsis, M. truncatula,ecc.) e specie selvatiche Sviluppo di chip a DNA per la certificazione e tracciabilita’ dei prodotti agroalimentari Allestire banche dati integrate con informazioni di passaporto e caratterizzazione, sulle frazioni di DNA, e creazione di un'interfaccia WEB per l'accesso ad utenze esterne. Allestire una banca dati di espressione genica ottenuti con microarray e link a dati di sequenza e altre caratteristiche note (pathway metabololico,ecc.)

Punti critici e azioni da svolgere Sono in corso di definizione collaborazioni con la Banca del DNA operante a Kew Gardens (UK) e col NASC (European Arabidopsis Stock Centre) di Nottingham (UK) soprattutto per quanto riguarda l’attività relativa alla collezione di ecotipi mediterranei di Arabidopsis, e con l’IPGRI (Internationa Plant Genetic Resources Institute) di Roma. E' in corso una collaborazione con l'Università' di Napoli per l’integrazione delle banche dati prodotte e di quelle già presenti in rete. Resta da acquisire ulteriore strumentazione, soprattutto per l’automazione. Restano inalterati i problemi di spazio, anche se piccole modifiche alla struttura di Bari hanno leggermente ridotto la pressione demografica nei laboratori. Occorre, infine, investire in risorse umane e partecipare alla formazione di nuove figure professionali attraverso l’attivazione di borse di dottorato o attraverso brevi stage formativi.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine L'IGV ha sviluppato competenze nello studio dei genomi vegetali utilizzando tecnologie di genomica strutturale e funzionale ed integrato tali competenze con quelle sulle risorse genetiche vegetali già presenti nell’IGV Isolamento e conservazione a -80°C di DNA genomico, sequenze specifiche,

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marcatori molecolari, EST, ecc. Ottenimento di librerie di cDNA arrichite di sequenze specifiche Messa a punto di chip a DNA diagnostici Collezioni di specie modello (Arabidopsis spp., Medicago truncatula, ecc.) e di specie selvatiche Individuazione di nuovi geni mediante omologia di sequenza da DNA genomico e cDNA 5' e 3' RACE Analisi dell'espessione mediante RT-PCR e chips Creazione, gestione e integrazione di banche dati

Collaborazioni (partner e committenti) Tutte le UO dell'IGV partecipano all'attività. E' inoltre prevista una collaborazione con l'Università di Napoli per lo sviluppo di banche dati integrate sulla genomica del pomodoro Sono in corso di definizione collaborazioni con la Banca di DNA di Kew Gardens (Inghilterra), con l'Arabidopsis Stock Center di Nottingham (Inghilterra) e con l'IPK (Institut fur Pflanzengenetik un Kulturpflanzenforschung)di Gatersleben (Germania) Sono, inoltre in via di definizione contatti con l'IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute, Roma) per lo0 sviluppo di progetti avanzati Partner del progetto FIRB Post-Genoma Partner del consorzio SOL Gene per il sequenziamento del pomodoro

Finalità

Obiettivi Allestimento di una DNA Bank, integrata con quella dei semi e con le collezioni viventi disponibili presso l'IGV Riorganizzazione della banca di semi attraverso la creazione di banche specializzate, con particolare attenzione alle specie modello Implementazione di strumenti bioinformatici per l'integrazione e l'interrogazione delle banche dati Sviluppare una piattaforma ad alte competenze per fornire servizi e strumenti alle commesse a carattere strategico presenti nell'IGV Facilitare lo sviluppo di nuove alte competenze in giovani ricercatori

Risultati attesi nell'anno DNA genomico di specie che non possono essere conservate o distribuite sotto forma di semi DNA genomico di materiale genetico particolare (mutanti, anfiploidi, ibridi, ecc.) non propagabile per seme Collezioni di DNA di di landraces italiane a scopi di certificazione e verifica nel tempo della struttura genetica Librerie cDNA arrichite di sequenze specifiche Sviluppo di chip a DNA Messa in rete delle banche dati

Potenziale impiego - per processi produttivi La banca di DNA può fornire un supporto all'identificazione di nuovi geni che codificano per prodotti potenzialmente utili all'industria agraria, farmaceutica e chimica. Lo studio della funzionalità dei genomi può dare impulso a nuove utilizzazioni delle specie vegetali coltivate al fine di produrre specifiche molecole d'interesse industriale Infine la possibilità di individuare marcatori molecolari utilizzabili nella certificazione e rintracciabilità delle filiere agroalimentari fornisce un valido strumento di supporto alle aspettative dei produttori di landraces protette da marchi di tutela (Peperone di Senise, Fagioli di Sarconi, ecc.) fornendo al contempo strumenti per la protezione da frodi

- per risposte a bisogni individuali e collettivi La banca di DNA consente di mantenere inalterato il patrimonio genetico di un ecotipo, landrace, clone, ecc., su un lungo arco di tempo senza la necessità di conservare gli individui che lo possedevano. Questo consente di comparare nel tempo i cambiamenti cui la struttura genetica di un ecotipo, landrace, clone, ecc. è soggetta in conseguenza dell'adattamento. Ciò è particolarmente valido in tempi di cambiamento climatico globale e consente di individuare le frazioni del genoma coinvolte nell'adattamento, permettendo così di rispondere alle esigenze degli agricoltori.

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Moduli

Modulo: Banca del DNA vegetale e sviluppo di una piattaforma per l’analisi di genomi vegetali

Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9108 44 0 0 152 25 69 25 N.D. 202








Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0



Gestione e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali con tecniche innovative

Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: DOMENICO PIGNONE

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Elenco dei partecipanti liv. Abbate Loredana VI Attolico Margherita V Baldoni Luciana III Bisignano Venturino III Campanella Giovanni VIII Campanella Nicola IV Carella Gioacchino V Carimi Francesco II Cataldo Pasquale VI Cifarelli Salvatore V Colaprico Giuseppe IV Damiani Francesco II De Lisi Antonino V De Luca Maria Grazia VII De Pasquale Fabio II Dell'Aquila Antonio II Falco Vittorio VI Fatta Del Bosco Sergio III

liv.Ferrante Sergio Pietro III Garfi' Giuseppe III Giuffre' Vincenzo IV La Mantia Giulia VI Laghetti Gaetano II Laino Martino VII Lioi Lucia III Losavio Francesco Paolo VI Mallardi Lorenza VI Margiotta Benedetta II Marino Vincenzo VIIIMartignano Fernando V Maruca Gina III Miano Antonio IX Migliore Roberto VI Perrino Pietro I Piergiovanni Angela Rosa III Pignone Domenico II

liv.Polignano Giambattista II Puglisi Stefano III Ranieri Giulia VI Sampino Aldo VII Sarli Giulio III Scarano Maria Teresa III Scarascia Italo IV Scarascia Marisa V Scimmi Rita VII Sonnante Gabriella III Sonnante Giuseppe V Stimolo Lucia VI Taranto Giovanni V Terzi Massimo III Tomaselli Valeria Maria Federica III Tusa Nicasio I Uggenti Pasquale IV Urbano Marcella III

Temi

Tematiche di ricerca Missioni di esplorazione e raccolta di nuovi segmenti di RGV Gestione delle collezioni e studi su metodi avanzati di conservazione Utilizzo di varie classi di marcatori molecolari per valutare la variabilità genetica, per il fingerprinting molecolare, per il riscontro di marcatori associati a caratteri di interesse e per studi di mappatura in diverse specie erbacee ed arboree. Studi sull'evoluzione di geni in specie coltivate e loro parenti selvatici. Studi sull'espressione di specifici membri di famiglie geniche in diversi tessuti della pianta, fasi fenologiche ed in condizioni normali e di stress Indagini sulla qualità fisiologica delle collezioni e studio di tecniche avanzate non distruttive per la sua valutazione Revisione, integrazione e gestione di banche dati relative alle collezioni ed alle attività

Stato dell'arte Le risorse genetiche vegetali (RGV) sono il patrimonio su cui si fonda la ricerca agro-alimentare del futuro. Esse sono il fondamento per il miglioramento qualitativo e quantitativo della produzione agro-alimentare e forestale. Lo sviluppo delle conoscenze scientifiche sulle RGV è altrettanto importante che la stessa loro conservazione, in quanto garantisce il loro miglior utilizzo nei programmi di sviluppo. Questi studi possono consentire la massima valorizzazione dei prodotti tipici locali. Con la presente commessa, l'IGV è l'unico istituto del CNR ad essere stato inserito nella rete del Consiglio della Ricerca in Agricoltura per l'implementazione nazionale della convenzione internazionale sulle risorse fitogenetiche.

Azioni

Attività da svolgere Reperimento di germoplasma di specie selvatiche (Eruca, Arabidopsis, ecc.) e coltivate (cereali, leguminose, ecc.) Mantenimento delle collezioni di germoplasma Studi di variabilità e identificazione varietale mediante marcatori molecolari in specie arboree (ciliegio,olivo, vite, Citrus) ed erbacee (fagiolo, fava, lenticchia, cicerchia) Studi su marcatori biochimici/molecolari associati alla qualità o caratteri di pregio (antinutrizionali, proteine, antossidanti, microelementi,ecc) in carciofo, frumenti, fagiolo, lenticchia Studi di mappatura in ciliegio Ibridazione somatica (patata, Citrus) ed embriogenesi somatica (vite, Citrus) Relazioni dei genepool selvatici e coltivati Identificazione di geni

148


(PAL, inibitori di proteinasi) mediante omologia di sequenza in carciofo e leguminose e loro espressione

Punti critici e azioni da svolgere Punti critici: alcuni problemi di spazio (soprattutto per la sede di Bari), limitazione di risorse umane (soprattutto giovani ricercatori) e strumentali disponibili, vetustà di parte della strumentazione, limitazione di fondi Punti di forza: i ricercatori dell'IGV afferenti sono altamente qualificati, possiedono un notevole know-how ed hanno accesso ad alcune infrastrutture localmente presenti. Anche la collaborazione con le Università locali è ben sviluppata

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine L'IGV ha sviluppato competenze nello studio avanzato delle RGV utilizzando approcci di genetica avanzata ed integrando tali competenze con quelle sulle risorse genetiche vegetali già presenti Isolamento di DNA genomico, sequenze specifiche, marcatori molecolari, microsatelliti, ecc. Uso di marcatori molecolari per lo studio della struttura genetica di popolazioni, landraces, prodotti tipici; fingerprinting molecolare per l'identificazione varietale, la tracciabilità e la certificabilità. Individuazione di nuovi geni mediante omologia di sequenza da DNA genomico e cDNA. 5' e 3' RACE Analisi dell'espessione mediante RT-PCR Analisi di proteine di riserva del seme e peptidi mediante elettroforesi mono- e bi-dimensionale, reverse phase HPLC, elettroforesi capillare Tecniche analitiche cromatografiche per composti secondari Srumenti fisiologici per il monitoraggio della vitalità del seme Creazione, gestione e integrazione di banche dati

Collaborazioni (partner e committenti) Ministeri (MIUR, MIPAF, Ministero della Salute) Organi afferenti alle reti CNR (ISPA, IValSA, IBBA), Università (Bari, Portici, Potenza), CRA (Frutticoltura, Orticoltura), ENEA (Casaccia), Università ed organizzazioni di ricerca extranazionali (IPK, D, Universidad Politecnica Madrid, E, CSIC Barcellona, E; Kew Garden, UK, in corso di definizione) Enti Locali (Provincia di Lecce), Regioni (Basilicata), Aziende Regionali di Sviluppo Agricolo (ALSIA), Gruppi di Azione Locale (GAL Capo di Leuca), Associazioni di categoria (APROL) Istituti della rete CGIAR (IPGRI, ICARDA, IITA) organi della FAO Sono, inoltre in via di definizione contatti con l'IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute, Roma) per lo sviluppo di progetti avanzati e di alta formazione

Finalità

Obiettivi Reperimento di nuove RGV Studio della struttura genetica dei singoli campioni Sviluppo di marcatori associati a specifiche caratteristiche d'interesse e utili a descrivere la variabilità genetica e alla selezione assistita Studio delle caratteristiche qualitative di campioni Metodi avanzati di utilizzazione delle RGV Studi su evoluzione, domesticazione ed adattamento delle RGV

Risultati attesi nell'anno Nuovi campioni di RGV Misura della variabilità genetica entro e tra popolazioni, usando marcatori molecolari Fingerprinting di varietà locali e studi finalizzati alla valorizzazione Individuazione di marcatori per caratteristiche di pregio, o specifici pathway per sintesi di sostante utili Uso delle RGV con metodologie avanzate (ibridazione interspecifica e somatica, mutanti meiotici, ecc.) Sviluppo di marcatori non distruttivi e non invasivi per lo studio della qualità fisiologica del seme Conoscenze sull'origine di alcune specie coltivate e sulle relazioni con specie selvatiche affini

149


Potenziale impiego - per processi produttivi Migliore gestione delle RGV e identificazione di nuovi geni che codificano per prodotti potenzialmente utili all'industria agraria, farmaceutica e chimica. La disponibilità di germoplasma di piante agrarie consente ai miglioratori genetici di avere nuove fonti di variabilità a cui attingere per la realizzazione di nuove varietà Lo studio della funzionalità dei genomi può dare impulso a nuove utilizzazioni delle specie vegetali coltivate al fine di produrre specifiche molecole d'interesse industriale (farmacologicamente attive o utili nello sviluppo di biopesticidi a basso o nullo impatto ambientale) e quindi offrire nuove soluzioni all'imprenditoria agricola Semplici marcatori della qualità del seme (marcatore RGB) possono servire alle industrie sementiere la selezione di semi di alta qualità Infine la possibilità di individuare marcatori molecolari utilizzabili nella certificazione e rintracciabilità delle filiere agroalimentari fornisce un valido strumento di supporto alle aspettative dei produttori di landraces protette da marchi di tutela (Peperone di Senise, Fagioli di Sarconi, ecc.) fornendo al contempo strumenti per la protezione da frodi

- per risposte a bisogni individuali e collettivi La varietà di farro selezionata ed il recupero della “lenticchia di Altamura” possono consentire lo sviluppo di aree marginali o protette (Parco Nazionale dell’Alta Murgia) attraverso la coltivazione di entità tipiche tutelate da marchio Le conoscenze sull’origine delle varietà tipiche consente di rafforzare il senso di identità delle comunità locali, fornendo al contempo prodotti certificabili in grado di fornire maggior reddito, soprattutto in aree marginali o depresse Le banche dati sulle collezioni sono utili agli studiosi di genetica e miglioramento genetico vegetale, oltre che a comunità locali a fini di promozione

Moduli

Modulo: Caratterizzazione e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali con tecniche innovative

Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Palermo Modulo: Caratterizzazione di composti secondari in specie mediterranee Istituto esecutore: Istituto per i sistemi agricoli e forestali del mediterraneo Luogo di svolgimento attività: Sezione di Palermo Modulo: Conservazione della biodiversità d'interesse agro-alimentare Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Palermo Modulo: Miglioramento genetico e valorizzazione delle specie arboree Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Palermo

150



Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+92033 1031 357 155 3576 239 1627 452 N.D. 4267








Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0



Ottenimento di nuovi prodotti per la salute, l'alimentazione e l'industria mediante interventi genetici e biotecnologici nelle piante

Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sezione di Portici Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: TEODORO CARDI

151


Elenco dei partecipanti liv. Abbate Loredana VI Arcioni Sergio I Baldoni Luciana III Bellisario Roberto VII Bellucci Michele VIII Boccia Francesco IV Calderini Ornella III Campanella Giovanni VIII Campanella Nicola IV Capuana Maurizio III Cardi Teodoro II Carpinelli Giancarlo VII Cifarelli Salvatore V Conicella Clara II Consiglio Maria Federica III

liv.Costa Antonello III Cozza Corradino IV Damiani Francesco II De Lisi Antonino V Dell'Aquila Antonio II Delle Donne Gaudenzio IV Grandillo Silvana III Grillo Maria Stefania III Guaragno Marco VI Laghetti Gaetano II Michelozzi Marco III Minervini Vittoria VIIINocerino Cira VI Paolocci Francesco III Piergiovanni Angela Rosa III

liv.Pignone Domenico II Porceddu Andrea III Pupilli Fulvio III Ranieri Giulia VI Rubini Andrea III Scafarto Antonio VII Scimmi Rita VII Scotti Nunzia III Sonnante Gabriella III Sonnante Giuseppe V Stanzione Fulvia VII Ticconi Silvia VII Tucci Marina III Tusa Nicasio I Vettori Cristina III

Temi

Tematiche di ricerca Verranno prodotte PGM con geni per molecole ricombinanti, per proteine ad alto valore nutrizionale, per caratteri agronomici; verranno sviluppati approcci di ingegneria metabolica per la manipolazione dei pathway biosintetici di molecole naturali; verrà analizzata la variabilità genetica e biochimica per composti d'interesse in popolazioni di varie specie; verranno prodotti genotipi che accumulano alti livelli dei prodotti d'interesse; verranno sviluppati nuovi marcatori molecolari

Stato dell'arte Sostanze utili per varie applicazioni derivano dal metabolismo della cellula vegetale o dall'espressione di geni che codificano per prodotti di derivazione non vegetale. L'isolamento di sequenze geniche, l'identificazione di marcatori molecolari, lo sviluppo di tecniche per la trasformazione genetica delle piante, possono contribuire all'identificazione dei determinanti genetici alla base dei processi metabolici ed alla produzione di specifici metaboliti e nuove molecole nelle cellule vegetali

Azioni

Attività da svolgere Tabacco, altre specie: costruzione vettori, trasformazione genetica e valutazione produzione antigeni virali e batterici; co-espressione zeine e chaperoni del RE nel cloroplasto. Borago, Eruca: ampliamento collezione genotipi; valutazione variabilità genetica, qualità semi ed acidi grassi. Pomodoro: produzione e valutazione popolazioni da incrocio interspecifico per molecole correlate alla qualità della bacca; clonaggio geni pathway a-tomatina e studio attività antibatterica-fungina. Salvia: caratterizzazione molecolare e biochimica Hairy Roots e calli transgenici per Osmyb4; sviluppo protocolli di rigenerazione da calli. Carciofo: valutazione variabilità genetica ed isolamento geni sintesi polifenoli; caratterizzazione espressione geni per enzima PAL. Rosmarino, ginepro: studio variabilità terpeni oli essenziali. Citrus: caratterizzazione flavonoidi ed acidi organici in varietà ed ibridi sessuali e somatici; valutazione attività antiproliferativa in vitro flavonoidi dei succhi. Aster: costruzione vettori per espressione costitutiva gene OXA1 e trasformazione genetica; implementazione collezione specie spontanee. Specie varie: valutazione attitudine produzione energia.

Punti critici e azioni da svolgere

152


Produzione proteine ricombinanti: espressione transgeni e stabilità proteine prodotte / uso della trasformazione plastidiale e di vettori per l’espressione di proteine di fusione e/o l’accumulo delle proteine in compartimenti subcellulari diversi. Sfruttamento sostanze d’interesse in carciofo, aster, pomodoro e salvia con approcci biotecnologici: limitata conoscenza dei pathway metabolici, mancanza in banca dati di sequenze omologhe ai geni d’interesse, scarsa efficienza dei protocolli di rigenerazione in vitro / utilizzazione di genotipi di carciofo con elevata vs. bassa produzione dei polifenoli; sovraespressione del gene Myb4 anche in tabacco; utilizzazione di colture cellulari di aster. Produzione di biomasse: individuazione di colture a rapido accrescimento con buone caratteristiche di conversione energetica. Valutazione popolazioni di pomodoro: aumento dello spazio camere di crescita e serre per allevamento piante in condizioni controllate. Attività su Borago, Eruca, rosmarino e ginepro: carenza risorse di personale ed economiche. Spazi laboratorio e studio nella sede di Portici punto critico per ricerche lì in corso.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Sono disponibili competenze di genetica, miglioramento genetico, biologia cellulare e molecolare, biochimica, per l'analisi e la manipolazione in vivo ed in vitro di specie vegetali appartenenti a famiglie diverse (Solanacee, Leguminose, Asteracee, Brassicacee, Labiate, Rutacee, e altre). Le tecnologie e le tecniche di indagine includono: uso di marcatori molecolari basati su PCR o ibridazione; coltura e rigenerazione in vitro di cellule, tessuti, protoplasti; costruzione di vettori per il clonaggio genico e l'espressione di transgeni nelle piante; trasformazione genetica sia del genoma nucleare che plastidiale con metodo biolistico, PEG, Agrobatterio; sequenziamento del DNA e analisi bioinformatica di sequenze nucleotidiche e proteiche; analisi dell'espressione genica a livello di RNA (analisi Northern, RT-PCR, micro/macro array) e proteine (analisi western); analisi biochimiche basate su HPLC, NMR, LC-MS, GC e altre; tecniche non invasive di analisi di immagini.

Collaborazioni (partner e committenti) INT 'Pascale'-Napoli; Max Planck Institute-Gölm, Germania; Rutgers Univ., USA; Univ. Cambridge, UK; Univ. Central Florida, USA; Univ. Perugia; CNR-IBBA; Univ. Molise; CRA-ISCI; Univ. Salerno; CNR-ICB; Univ. Firenze; CNR-ISPA; Cornell Univ., USA; Univ. Napoli; CRA-ICF; INMI "L. Spallanzani", Roma; SZN, Napoli; Boyce Thomson Institute, USA; CNR-ISA, Avellino; Shanghai Institute of Plant Physiology and Ecology (CAS), Cina; Shanghai Institute for Biological Science /CAS), Cina; Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Germania.

Finalità

Obiettivi Individuazione di molecole d'interesse nelle specie studiate; analisi della variabilità genetica per il tipo di molecole ed il livello di produzione; isolamento di geni e sequenze geniche coinvolti nella biosintesi delle molecole d'interesse; sviluppo di tecnologie per la sovraespressione delle molecole di origine vegetale ed esogena; produzione delle molecole d'interesse in vivo e/o in vitro.

Risultati attesi nell'anno Vettori e piante con geni per proteine ricombinanti (zeine; antigeni HIV, HPV, Virus Vaccinia, tubercolosi). Marcatori per ancorare popolazioni di IL alla mappa del pomodoro. Geni per l’a-tomatina in pomodoro e informazioni sull’attività biologica. In salvia piante transgeniche per Osmyb4; profilo metabolico del materiale transgenico. In borrago dati quali-quantitativi sul profilo degli acidi grassi. In borrago ed eruca campioni, marcatori per la variabilità genetica, lotti di semi di qualità. In carciofo sequenza e profilo di espressione dei geni pal; verifica della funzionalità in un sistema eterologo del gene codificante la flavonoide 3’ idrossilasi; parziale isolamento del gene per la flavone sintasi II (FNSII); informazioni sulla variabilità del contenuto di polifenoli. Chemotipi di rosmarino e ginepro d’interesse agro-alimentare e farmacologico. in Citrus identificazione di nuove

153


molecole; verifica delle proprietà antiproliferative su cellule umane di componenti chimiche dei frutti. In aster materiali transgenici CaMV35S::OXA1; genotipi da saggiare per l'ottenimento di nuove biomolecole. Determinazione importanza diverse colture per ottenimento energia

Potenziale impiego - per processi produttivi I vettori ed i protocolli per trasformazione genetica verranno impiegati per la produzione di piante transgeniche e transplastomiche per l'accumulo di antigeni e proteine ad alto valore nutrizionale. I geni per metaboliti secondari che verranno isolati saranno impiegati per la manipolazione di “pathway” biosintetici (isoprenoidi, flavonoidi) in colture cellulari e/o piante. I protocolli per la coltura di cellule e tessuti verranno impiegati per la produzione di metaboliti secondari e la rigenerazione di piante transgeniche/transplastomiche. Le popolazioni naturali caratterizzate a livello biochimico, fisiologico e genetico verranno impiegate per la selezione di genotipi con caratteristiche qualitative migliorate e l'isolamento di composti naturali utili. I marcatori molecolari verranno impiegati per la caratterizzazione e la selezione di genotipi con caratteristiche qualitative migliorate e l'isolamento di geni utili.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Lo sviluppo di tecnologie per la produzione di nuovi prodotti nelle piante consentirà di diversificare la produzione agricola con prodotti ad alto valore aggiunto, di trovare nuovi impieghi per colture tradizionali (es. tabacco), di utilizzare specie finora neglette o sottoutilizzate. La produzione di sostanze farmaceutiche o con alto valore nutrizionale migliorerà la competitività dei prodotti agricoli nazionali, andando incontro alle moderne esigenze dei consumatori. Inoltre, l'ottimizzazione nelle piante di biotecnologie avanzate con alto input multidisciplinare potranno portare allo sviluppo di imprese biotecnologiche con ripercussioni favorevoli sull'occupazione.

Moduli

Modulo: Ottenimento di nuovi prodotti per la salute, l'alimentazione e l'industria mediante interventi genetici e biotecnologici nelle piante

Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Portici


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9623 433 497 52 1605 189 1119 145 N.D. 1939




154






Altro Totale

0 3 4 4 0 0 0 2 4 17




Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sezione di Perugia Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: SERGIO ARCIONI Elenco dei partecipanti liv. Arcioni Sergio I Baldoni Luciana III Bellisario Roberto VII Bellucci Michele VIII Boccia Francesco IV Calderini Ornella III Carpinelli Giancarlo VII Conicella Clara II Consiglio Maria Federica III Costa Antonello III

liv.Damiani Francesco II Delle Donne Gaudenzio IV Ferrante Sergio Pietro III Grandillo Silvana III Grillo Maria Stefania III Guaragno Marco VI Minervini Vittoria VIIINocerino Cira VI Paolocci Francesco III Pignone Domenico II

liv.Porceddu Andrea III Pupilli Fulvio III Rubini Andrea III Scafarto Antonio VII Scimmi Rita VII Sonnante Gabriella III Sonnante Giuseppe V Stanzione Fulvia VII Ticconi Silvia VII Tucci Marina III

Temi

Tematiche di ricerca Approcci genetici e molecolari per risalire ai geni che controllano la qualità, la produzione e la sintesi di tannini condensati in leguminose foraggere. Allestimento in M.truncatula di una collezione di mutanti per studi di genetica diretta ed inversa. Identificazione dei meccanismi molecolari responsabili della riproduzione apomittica in Paspalum e genomica funzionale del processo meiotico in Arabidopsis. Sequenziamento di regioni cromosomiche ed analisi del genoma per migliorare la qualità dei frutti, analisi del trascrittoma in risposta a stress abiotici e valutazione dell'interazione pianta/patogeni, in pomodoro. Impiego di marcatori molecolari per risalire alla struttura genetica ed al sistema riproduttivo in Tuber spp.. Selezione assistita in olivo e rintracciabilità degli oli. Allestimento di una libreria BAC in citrus.

Stato dell'arte Sono in corso attività di ricerca su specie di notevole interesse agrario al fine di acquisire informazioni che possano consentire il miglioramento della qualità e della produttività delle piante,

155


nonché la caratterizzazione molecolare delle produzioni per consentirne la rintracciabilità e, almeno, il mantenimento delle attuali quote di mercato. Le specie considerate sono largamente utilizzate nell'alimentazione umana ed animale ed alcune assicurano produzioni tipiche del paese.

Azioni

Attività da svolgere M.truncatula:allestimento di mutanti per indagini di genetica diretta ed inversa ed analisi molecolare. Patata e pomodoro:analisi funzionale di geni per tolleranza a stress abiotici, selezione mutanti in Arabidopsis,database. Pomodoro:studio funzionale di geni per lo sviluppo di pianta e bacca,posizionamento di BAC sul cromosoma 12 e sequenziamento;attività biopesticida/biofertilizzante di Tricoderma e trascrizione genica. Meiosi in Arabidopsis:trasformazione del mutante con alta espressione di GUS. Apomissia:controllo epigenetico via effetto della metilazione del DNA. Basi molecolari eterosi in medica. Olivo:identificazione di SSR da EST, SNP di geni candidati, marcatori per la mosca, espressione genica alla maturazione. Piante forestali: SNP e stress idrico, studio linkage disequilibrium Analisi di fattori trascrizionali di geni per la sintesi di tannini ed antociani in Lotus e specie alternative al tabacco. Tuber:indagini sul sistema riproduttivo, ciclo biologico e variabilità genetica in relazione alla distribuzione geografica. Screening BAC di Citrus; Contenimento di polline transgenico in Beta vulgaris Ricerca di alleli per stress biotici.

Punti critici e azioni da svolgere Genomica Tuber Difficoltà nel reperimento di campioni per le analisi dovute all’aleatorietà delle produzioni e al breve periodo di raccolta; assenza di fruttificazione in condizioni controllate e di organismi modello filogeneticamente vicini. Meccanismi molecolari responsabili dell’apomissia, mutanti di M.truncatula e genomica pomodoro. Ristrettezze di ambienti a condizioni di luce, temperatura ed umidità controllate per la crescita di piante in numero sufficiente per le indagini. Genomica funzionale della risposta a stress ambientali in Solanacee Assenza di apparecchiature ad alta produttività per analisi di genomi complessi Interazione pianta/patogeni funghi di biocontrollo. Limitata disponibilità di camere di crescita e difficoltà nell’evidenziare differenze tra accessioni Genomica olivo Limitata disponibilità di infrastrutture per l’allevamento delle progenie e valutazione di caratteri in selezione. Analisi fattori trascrizionali per l’espressione di tannini ed antociani Messa a punto dei parametri ambientali per l’induzione +/- del pathway degli antociani. Apirenia in citrus: impiego di sonde eterologhe

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Si dispone di competenze di genetica, biologia, biologia molecolare, biochimica, citogenetica, biotecnologie (cultura in vitro di organi della pianta, di cellule e protoplasti e rigenerazione della pianta, trasformazione genetica) , miglioramento genetico ed agronomia. Le tecnologie d’indagine riguardano la produzione di mutanti per inserzione (T-DNA tagging e trasposoni), mutagenesi chimica (EMS) e RNAi; allestimento e screening di librerie genomiche e a cDNA, di mappe genetiche; identificazione, isolamento e clonazione di sequenze geniche anche differenzialmente espresse; utilizzazione di marcatori molecolari per filogenesi, caratterizzazione di varietà, tracciabilità, breeding assistito, predisposizione di marchi di origine, sequenziamento di acidi nucleici; analisi del trascrittoma mediante macro e microarray, real time RT/PCR. Isolamento ed analisi di loci SSR e di SNPs anche mediante DHPLC. Analisi HPLC,. Southern, northern e western blotting. Espressione di proteine eterologhe in eucarioti e procarioti . Analisi funzionale di geni e promotori.Produzione di piante micorrizate con le specie di Tuber più pregiate e loro certificazione morfologica e molecolare.

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Collaborazioni (partner e committenti) Univ. Padova – Dip. di Biologia, Via Colombo 3 Univ. Verona – Dip. Scientifico e Tecnologico, Strada Le Grazie, Cà Vignal. Univ. Firenze- Dip. di Biologia Animale e Genetica “Leo Pardi”via Romana 17. CNR - IBBA, Via Salaria Km 29.300, 00016 – Monterotondo Scalo, Roma Univ. Basilicata. Dip. di Biol. Difesa e Biote. Agrof. Via N. Sauro, 85 Potenza. CNR IGB, via P. Castellino 111, Napoli C.R.A. – Istituto Sper. per le Colture Foraggere, Viale Piacenza 29, 26900 – Lodi C.R.A – Istituto Sper. per l’Olivicoltura, Rende, Cosenza ENEA-Centro Ricerche Casaccia, via Anguillarese Roma. Un. di Clemson, Department of Genetics & Biochemistry,100 Jordan Hall, Clemson, SC 29364, USA Museum of Evolution, Norbyv16,SE-752 30 Uppsala, Svezia Institute of Grassland and Environmental Research, Aberystwyth (Regno Unito), CSIRO, Plant Industry, Canberra, Australia, Univ. del Nordeste: Casilla de Correo 209 - 3400 Corrientes, Argentina Institute of Plant Biology University of Zurich Zollikerstrasse 107 CH-8008 Zurich Svizzera Univ. di Cornell, Ithaca, N.Y. USA CNRS-UPR2355. ISV, Bat 23- 1 avenue de la Terrasse, GIF SUR Yvette, 9 Francia

Finalità

Obiettivi Acquisire informazioni molecolari per migliorare la qualità e la produttività di alcune piante agrarie determinati per l'economia nazionale; identificazione e caratterizzazione di aplotipi, genotipi e geni candidati per una agricoltura più scientifica e per ridurre le frodi di mercato. La maggior parte delle competenze necessarie sono in possesso dei ricercatori coinvolti ed altre saranno acquisite da collaborazioni già in atto con rilevanti strutture di ricerca nazionali ed internazionali.

Risultati attesi nell'anno M. truncatula:termine allestimento di mutanti Patata e pomodoro:trasgenici con espressione +/- dei geni coinvolti nella risposta a stress abiotici; messa a punto protocolli per RNA induced gene silencing (RNAi) sistematica, analisi mutanti di arabidopsis con alterata risposta a stress abiotico,database Pomodoro:verifica e sequenziamento di 4 BAC del cromosoma 12;valutazione interazione tra isolati di Trichoderma e accessioni di pomodoro e ricerca di parametri per giungere a geni/QTL associati Meiosi in Arabidopsis:mutanti inserzionali meiosi specifici Apomissia:individuazione della componente a controllo epigenetico Eterosi in medica:allestimento materiali Olivo: mappa di associazione satura, caratterizzazione di pool genici espressi nel frutto, tracciabilità olio Piante forestali:stime di differenziazione genetica e linkage disequilibrium Individuazione di fattori trascrizionali del pathway di antociani e tannini Tuber: genotipizzazione per aree geografiche, nuove conoscenze sul sistema riproduttivo e ciclo biologico Selezione di linee rigenerative di Beta vulgaris Isolamento di alleli più tolleranti Nuove conoscenze apirenia

Potenziale impiego - per processi produttivi In M.truncatula i mutanti per inserzion e tilling consentono di risalire a geni. Tra i mutanti, quello privo di saponine emolitiche sembra particolarmente interessante I marcatori molecolari:in tartufo servono per la predisposizione di marchi D.O.P. in relazione alle aree di raccolta e per indagini sul sistema riproduttivo metre in olivo.per la caratterizzate di cultivar. In particolare, gli SNP sono impiegati per la sintesi di PNA cultivar specifici che poi consentono la tracciabilità degli oli. L’identificazione dei geni per la sintesi dei tannini condensati, oltre che migliorare la qualità dei foraggi, potrebbe trovare applicazioni in ambito farmaceutico. La genomica funzionale della meiosi e l’apomissia, in particolare, sono indagini di estrema importanza in agricoltura e la conoscenza dei relativi meccanismi molecolari che potrebbe promuovere una nuova rivoluzione verde. In pomodoro, l’identificazione dei geni responsabili della qualità del frutto della tolleranza a stress biotici ed abiotici, possono migliorare la qualità delle produzioni agricole e dei prodotti tipici, in particolare, rendendoli più attrattivi e competitivi nei mercati internazionali.

157


- per risposte a bisogni individuali e collettivi Il miglioramento della qualità delle produzioni agrarie oltre che influenzare positivamente la competitività dei prodotti nazionale e rallentare le importazioni da paesi in via di sviluppo, ha effetti benefici sulla salute dei consumatori. In tal senso le indagini per la messa a punto di sistemi di tracciabilità e rintracciabilità a livello molecolare sono particolarmente interessanti. Degne di nota sono anche le ricerche per incrementare l'assimilazione delle proteine nei ruminanti. Gli interventi genetici atti a fissare il vigore ibrido attraverso l'apomissia potrebbero elevare le produzioni ed il livello di vita dei paesi emergenti evitando di ricorrere ogni anno all'acquisto di sementi ibride.

Moduli

Modulo: Genomica e Proteomica per il miglioramento della produttività e della qualità delle piante

Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Perugia


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9616 349 208 90 1263 439 996 141 N.D. 1843








0 3 1 7 0 0 0 1 9 21



158



Dati generali

Progetto: Il sistema terra: interazioni tra terra solida, mare, acque interne, atmosfera e biosfera

Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento:

Sezione di Firenze

Dip. di prevista afferenza: Terra e Ambiente Responsabile indicato: RAFFAELLO GIANNINI Elenco dei partecipanti liv. Bianchi Simonetta VII Boggi Catia VI

liv.Capuana Maurizio III Michelozzi Marco III

liv.Vettori Cristina III

Temi

Tematiche di ricerca Identificazione di geni, di marcatori adattativi e marcatori neutrali per il monitoraggio della variabilità genetica e per la genomica di alberi forestali. Analisi dei meccanismi fisiologici e biochimici alla base della risposta a fattori di stress Individuazione di sistemi efficaci di moltiplicazione in vitro. Selezione di piante di ideotipi e popolazioni.

Stato dell'arte La perdita di diversità biologica è preoccupazione per la sopravvivenza della popolazione umana. A ciò si associa la conservazione del germoplasma e come individuarne le migliori strategie di gestione. L'analisi della diversità genetica è considerata approccio indispensabile: le variazioni di tipo adattativo, quelle filogenetiche e gli effetti migrativi attraverso una genomica di popolazione potranno migliorare gli studi di genetica evoluzionistica da applicare alla conservazione delle specie.

Azioni

Attività da svolgere Genetica di popolazione con polimorfismi genici. Studio di geni funzionali per resistenza a stress. Filogenesi e filogeografia. Dinamica della diversità genetica: mating system e flussi genici. Genetica della conservazione: definzione di metodi di conservazione delle risorse genetiche. Studi di transgenosi in alberi forestali. Biochimica e fisiologia: meccanismi di risposta a fattori di stress. Coltura in vitro di cellule e tessuti: moltiplicazione e conservazione del germoplasma. Miglioramento genetico.

Punti critici e azioni da svolgere Lunghi cicli di vita degli alberi forestali Difficoltà di accesso agli organi riproduttivi Scarse informazioni circa l'organizzazione e la funzionalità del genoma degli alberi forestali. Necessità di adeguare la strumentazione scientifica per aumentare la produttività e la competitività a livello internazionale.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine I partecipanti alla Commessa svolgono da anni ricerche nel settore della genetica di popolazione (effetto dei fattori evolutivi) della genetica molecolare (individuazione e caratterizzazione di marcatori e geni), nella coltura in vitro di cellule e tessuti (micropropagazione, embriogenesi, croconservazione), nella biochimica e fisiologia di alberi forestali. Ciò è stato è stato possibile anche perchè sono

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disponibili le attrezzature più significative (PCR, PCR quantitativa, sequenziamento, stazione robotica, gas cromatografia - Centro di Eccellenza Perkin- Elmer), camere di crescita ecc. La dimostrazione di quanto sopra è garantita da oltre 100 lavori a stampa su riviste nazionali ed internazionali con referee.

Collaborazioni (partner e committenti) Istituti Universitari italiani (Firenze, Udine, Pisa, Bologna, Viterbo, Napoli, Bari, Potenza, Campobasso, Milano, Palermo), Istituti CNR, MIPAF, ENEA Università di Aberdeen, Oxford, Southampton (UK), Uppsala (S), Zurigo (CH), Helsinki (F) Università del Wisconsin, Florida, NYU, Cornell, Stanford (USA) CSIRO (Australia) Max Plank (Germania) INRA, CNRS (Francia) VIB (Belgio) INIA (Spagna) WSL (Svizzera) USDA (USA) NISK (Norvegia)

Finalità

Obiettivi Identificazione di geni e marcatori molecolari. Analisi della distribuzione della diversità a diverse scale geografiche Studio dell'evoluzione della diversità genetica. Certificazione genetica delle foreste. Analisi di meccanismi biochimici e fisiologici in risposta ai fattori di stress. Protocolli per la moltiplicazione e conservazione in vitro di specie forestali. Miglioramento genetico per la resistenza e caratteri di pregio. Numerose pubblicazioni e progetti internazionali nel settore.

Risultati attesi nell'anno Marcatori molecolari neutrali e adattativi. Geni implicati nella risposta a stress. Mappe di distribuzione della diversità genetica negli areali delle specie. Gene-flow (seme vs polline). Metodi per la certificazione di materiale vegetale. Messa a punto della transgenosi in alberi forestali. Meccanismi fisiologici e biochimici per la funzionalità dell'ecosistema. Moltiplicazione vegetativa di tipi selezionati e conseguenti test colturali. Database.

Potenziale impiego - per processi produttivi Informazioni indispensabili per una gestione sostenibile delle foreste finalizzata alla loro conservazione ed al loro uso compreso il prelievo di legno.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Il mantenimento di un'alta funzionalità produttiva degli ecosistemi forestali (diversità genetica, potenzialità)soddisfa pienamente esigenze diffuse nel settore della conservazione dell'ambiente la cui integrità è punto di riferimento per il benessere della vita umana.

Moduli

Modulo: Funzionalita' e caratterizzazione genetica di ecosistemi forestali Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Firenze

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9143 221 59 0 423 40 320 36 N.D. 499








Altro Totale

1 1 0 1 0 0 0 8 3 14



EVOLUZIONE E ANALISI DELLA DIVERSITA’ GENETICA IN PIANTE FORESTALI

Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Sede principale svolgimento: Sezione di Firenze Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIOVANNI GIUSEPPE VENDRAMIN Elenco dei partecipanti liv.Bucci Gabriele III Lioi Lucia III

liv.Miano Antonio IX Puglisi Stefano III

liv.Vendramin Giovanni Giuseppe II

Temi

Tematiche di ricerca - Identificazione di marcatori adattativi e neutrali; - Studio della struttura ed evoluzione della diversità genetica in popolazioni naturali; - Analisi di polimorfismi in geni candidati coinvolti nell’espressione di caratteri adattativi (resistenza a stress idrico e fenologia); - Analisi di polimorfismi neutrali (genoma nucleare e organellari) e filogeografia (dinamica passata); - Studio della dinamica della diversità genetica presente e futura: flussi genici; - Genetica della conservazione: definizione di metodi di conservazione in situ delle risorse genetiche

Stato dell'arte

161


La conoscenza della diversità assume un ruolo strategico in programmi volti a preservare il potenziale adattativo delle popolazioni rispetto ai cambiamenti ambientali. Recentemente, molta attenzione è stata rivolta alle potenzialità dell’analisi di associazione (association analysis) e di altri approcci di genetica delle popolazioni per la dissezione di caratteri adattativi. Questi approcci potrebbero permettere di rilevare fino alla singola sostituzione nucleotidica responsabile della variazione fenotipica ma al contenpo richiedono una preliminare conoscenza di parametri genetici di popolazione, quali diversità e differenziazione genetica, entità del linkage disequilibrium, e come questi variano nel genoma. I lunghi cicli vitali della maggior parte delle piante arboree rappresentano un importante limite nello studio delle basi genetiche di caratteri complessi, e per questo approcci basati su i) linkage disequilibrium mapping e ii) identificazione di regioni soggette a selective sweeps potrebbero essere particolarmente promettenti in questi organismi.

Azioni

Attività da svolgere Analisi della diversità nucleotidica e Linkage Disequilibrium (LD) mapping. Analisi condotte su popolazioni di varie specie caratterizzate da storie demografiche diverse hanno mostrato un’ampia variabilità nel tasso di decadimento del linkage disequilibrium. Questo comportamento indica che l’analisi dell’associazione tra marcatori in popolazioni naturali potrebbe portare all’individuazione di risorse genetiche altamente differenziate e quindi risultare molto vantaggioso per studi di mappaggio di associazione. Selective Sweeps. Studi di genetica di popolazioni molecolare verranno realizzate allo scopo di comprendere, a livello nucleotidico, le basi genetiche della variabilità adattativa regolata dalla selezione naturale. Situazioni nelle quali si suppone che il ruolo della selezione sia predominante, rispetto alla deriva genetica ed alla stratificazione della popolazione, potrebbero consentire l’identificazione di loci che contribuiscono alla variazione adattativa.

Punti critici e azioni da svolgere 1) identificazione e caratterizzazione di marcatori funzionali di geni coinvolti nella risposta allo stress idrico e alla fenologia 2) analisi della diversità nucleotidica di marcatori neutrali ed adattativi tra ed entro popolazioni; 3) stima del linkage disequilibrium (LD) e del decadimento del LD tra ed entro popolazioni e loci. Analisi delle associazioni tra marcatori e caratteri adattativi. Questo lavoro prevede lo studio di una specie modello (model species=Pinus halepensis), e quindi il trasferimento a specie correlate di importanza agraria e forestale (target species=P. pinea e P. pinaster). Punti critici: la carenza di personale.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Tutte le competenze necessarie per sviluppare con successo il programma di ricerca possono essere fornite dai partecipanti, ed attraverso le già solide collaborazioni stabilite con vari gruppi di ricerca internazionali, ed in particolare con l'International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI). Grazie a queste collaborazioni, sarà possibile utilizzare strumentazione ad alta efficienza e processività. In particolare, attraverso la collaborazione con il Laboratorio Genexpress del Dipartimento di Biotecnologie Agrarie dell’Università di Firenze, e con il corso internazionale di Dottorato di Ricerche in “Risorse genetiche delle piante agrarie e forestali” della Scuola Superiore S.Anna di Pisa (a cui collabora anche l’IPGRI) sono disponibili: sequenziatori automatici a 96 e 24 capillari e a gel, stazioni robotiche, thermal cyclers, scanner Thyphoon, real time PCR, colony picker per la gestione automatizzata di librerie; inoltre, piattaforme informatiche e competenze nella gestione di dati genetici e nella creazione di data base.

Collaborazioni (partner e committenti) L’attività proposta verrà svolta in stretta collaborazione con il Dipartimento di Biotecnologie Agrarie (Laboratorio Genexpress) dell’Università di Firenze (Dr. F. Sebastiani, Prof. M.L. Racchi, Prof. A.

162


Camussi), e con i Dr. C. Plomion, Dr. R. Petit e Dr. A. Kremer (INRA, France), Dr. S. Gonzales-Martinez (INIA, Spain), Dr. D. Neale (University of California, USA), Prof. G. Binelli (Università di Varese) e Prof. M. Morgante (Università di Udine) tutti esperti di fama internazionale nel settore, e con i partecipanti al Network of Excellence Europeo sulla genomica degli alberi (EVOLTREE: Evolution of Trees as Drivers of Terrestrial Biodiversity), recentemente approvato e in cui il proponente è coinvolto (24 gruppi di 14 paesi europei). Sono stati inoltre approvati due progetti EU: 1) “Developing best practice for seed sourcing of planted and natural regeneration in the neotropics” (SEEDSOURCE). 2) “Evolution of Trees as Drivers of Terrestrial Biodiversity” (EVOLTREE).

Finalità

Obiettivi -Identificazione di marcatori molecolari a potenziale valore adattativo. I geni candidati per i caratteri di interesse verranno trasferiti da geni ortologhi di specie modello. I geni selezionati verranno identificati mediante la costruzione di librerie cDNA e librerie genomiche arricchite della componente non metilata (genica). E’ prevista la costruzione di una libreria BAC come supporto per l’analisi dell’organizzazione del genoma e dell’estensione del linkage disequilibrium nella specie modello. - Caratterizzazione di nuovi marcatori molecolari neutrali dei genomi nucleare, plastidiale e mitocondriale. Si prevede la costruzione di librerie arricchite in microsatelliti nucleari e il sequenziamento del genoma plastidiale della specie modello. Analisi della distribuzione della diversità nucleotidica, a diverse scale geografiche. Il ruolo dei diversi fattori evolutivi che governano la distribuzione della variazione genetica verrà verificato attraverso una meta-analisi. - Studio dell’evoluzione della diversità genetica. Metodi molecolari per studiare la dinamica della diversità genetica, l’estensione del linkage disequilibrium e sua variazione nel genoma della specie modello.

Risultati attesi nell'anno 1) Creazione di un data base di marcatori neutrali e sequenze di EST e geni candidati già disponibili per la specie modello e le specie correlate; 2) Disponibilità di librerie c-DNA, librerie arricchite in SSRs e in componenti non metilate, di una libreria BAC, e di sequenze (specie modello); 3) Nuovi marcatori molecolari neutrali del genoma nucleare e organellare; 4) Stime della diversità nucleotidica e della differenziazione genetica (e confronto con quelle ottenute con marcatori neutrali). 5) Stime di linkage disequilibrium entro popolazioni ed entro loci nella specie modello.

Potenziale impiego - per processi produttivi La commessa si propone di accrescere le conoscenze relative alla diversità genetica di caratteri adattativi e quindi di fornire metodi innovativi per la conservazione, il miglioramento e l'utilizzazione delle risorse genetiche forestali e, più in particolare, per l'acquisizione di nuovi standards per la certificazione di aree ad alto valore conservazionistico. I metodi sviluppati e le conoscenze acquisite verranno utilizzati per monitorare i processi produttivi legati alla utilizzazione del legno, attraverso la tracciabilità (traceability of wood products) e l'ecocertificazione come base di un'utilizzazione sostenibile dei prodotti forestali e come strumento per combattere la deforestazione e il commercio illegale del legno. Conoscenze relative alla dinamica della diversità in ecosistemi forestali potranno essere utili per ottimizzare gli interventi selvicolturali (utilizzo dei prodotti e mantenimento della diversità genetica).

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Le conoscenze acquisite nell'ambito di questa commessa consentiranno di ottimizzare la gestione di aree forestali e di aree protette, comprese le riserve naturali, e di fornire guide tecniche per accrescere la fruibilità di ambienti ad alto valore paesaggistico e biologico nell'interesse della collettività. Inoltre sarà possibile un maggiore controllo sull'origine del materiale di propagazione,

163


riducendo il rischio legato all'utilizzazione di materiale non locale, e quindi potenzialmente non adatto alle condizioni dell'area di destinazione.

Moduli

Modulo: EVOLUZIONE E ANALISI DELLA DIVERSITA’ GENETICA IN PIANTE FORESTALI

Istituto esecutore: Istituto di genetica vegetale Luogo di svolgimento attività: Sezione di Firenze


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9197 105 77 0 379 38 220 42 N.D. 459








Altro Totale

N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D. N.D.



164



FULVIO PUPILLI Identificazione di geni differenzialmente espressi in linee apomittiche e sessuali di Paspalum simplex

MARINA TUCCI Studio dell'espressione genica nelle interazioni positive tra pianta, microorganismi antagonisti e patogeni tramite analisi cDNA-Microarray

RAFFAELLO GIANNINI Evoluzione ed adattamento dei complessi genici in sistemi vegetali

FULVIO PUPILLI Nuovi strumenti bio-molecolari per la comprensione dei sistemi riproduttivi delle piante

FRANCESCO PAOLOCCI Universalità o specificità di funzione di fattori trascrizionali MYB regolatori di processi di patterning cellulare in Arabidopsis?

GIOVANNI GIUSEPPE VENDRAMIN DIVERSITA' NUCLEOTIDICA E LINKAGE DISEQUILIBRIUM IN POPOLAZIONI DI SPECIE ARBOREE

MASSIMO TERZI Conservazione della biodiversità nei sistemi agro-pastorali mediterranei

CLARA CONICELLA Laser Capture Microdissection (LCM) di meiociti per l�identificazione di geni meiotici in pianta

ORNELLA CALDERINI La via di trasduzione del segnale Ntf6/MEK1 in pianta: elementi comuni tra controllo del ciclo cellulare e risposta ai patogeni

FRANCESCO DAMIANI Il ruolo della sequenza codificante sul livello d'espressione genica

SERGIO FATTA DEL BOSCO Studio della presenza e degli effetti sulla salute umana di costituenti fitochimici bioattivi di Citrus

SILVANA GRANDILLO "Studio del pathway biosintetico delle saponine steroidali in pomodoro e valutazione della loro attività biologica ed anti-colesterolemica"

ANDREA RUBINI Il sesso dei tartufi ed un probabile caso di misunderstanding biologico

NUNZIA SCOTTI Manipolazione genetica del "pathway" plastidiale degli isoprenoidi nelle piante per il miglioramento del rapporto qualita� alimentare e salute umana

165


FRANCESCO CARIMI L'impiego degli oligogalatturonidi nel potenziamento dei sistemi naturali di difesa della vite e nell�incremento di metaboliti secondari utili per la salute umana

MARIA STEFANIA GRILLO Metabolismo della cellula vegetale: adattamento a segnali esogeni ed endogeni

PIETRO PERRINO Tutela e valorizzazione delle risorse genetiche vegetali e sviluppo di strategie integrate a sostegno dell'agrobiodiversità e della salvaguardia ambientale

166


Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione Al suo interno (Sede di Bari e unita’ territoriali di Firenze, Perugia, Portici e Palermo), l’IGV presenta un pool di expertise in aree disciplinari diverse complementari tra loro e finalizzate a studi di genetica e miglioramento genetico delle principali specie di interesse per l’agricoltura italiana, utilizzando biotecnologie e analisi genetiche avanzate (genomica, proteomica) per scopi che di volta in volta vanno adeguati ai cambiamenti in corso nel settore agricolo ed alimentare italiano. Nel 2005 le attivita’ di ricerca dell’IGV sono state indirizzate a soddisfare le esigenze del consumatore, dell’industria e dell’ambiente, utilizzando le notevoli competenze esistenti in campi specifici come la gestione di una Banca del germoplasma vegetale, l’isolamento e la caratterizzazione di geni vegetali, lo studio della diversità genetica, l’uso di marcatori molecolari, la tecnologia di trasformazione genetica e l’espressione in pianta di geni eterologhi. Nell’ambito del Dipartim. Agroalimentare, l’attività dell’IGV è stata strutturata in cinque commesse che sono derivate dalle potenzialità e dalle competenze descritte e dalla loro capacità di promuovere offerte di ricerca alla comunità scientifica nazionale ed internazionale e ai soggetti privati del settore agro-alimentare. Una sesta commessa afferisce al Dipartimento Terra ed Ambiente. L’attività scientifica dell’IGV e’ contraddistinta da discreto equilibrio tra la ricerca di base e applicata. Elevato permane anche il numero di pubblicazioni su riviste anche di alto impatto. Di fondamentale importanza in questo contesto è l’acquisizione di fondi dall’esterno e in tal senso i finanziamenti ottenuti sono stati superiori al previsto il che ha permesso di aumentare il fattore di amplificazione dell’IGV. Ancora più importante sembra presentarsi il 2006 per la notevole quantità di proposte di ricerca presentate dall’IGV in risposta alle diverse chiamate nazionali ed internazionali. Rilevante è poi la capacità di dell’IGV di inserimento nei programmi finanziati dalle Regioni: come effetto della struttura decentrata dell’Istituto stesso, sono molti i contratti già stipulati o in corso di definizione con diversi Organismi Regionali o locali. Delle sei commesse, 5 sono di tipo strategico ed una di sviluppo di competenza. Nel 2005 sono state svolte attività scientifica anche su tre Ricerche a tema libero (RTL). Di seguito si riportano le autovalutazioni delle attività e dei risultati conseguiti nell’ambito di ciascuna commessa. AG.P02.005 - CARATTERIZZAZIONE E VALORIZZAZIONE DELLE RISORSE GENETICHE VEGETALI CON TECNICHE INNOVATIVE Le attivita’ svolte hanno riguardato le raccolte a Creta ed in Italia; lo sviluppo di una varietà di farro; studi di diversità genetica in fagiolo, lenticchia, frumento, carciofo mediante marcatori biochimici e molecolari; il recupero dell’ecotipo “lenticchia di Altamura”; studio di omologia di sequenze geniche per individuare nuovi loci e/o alleli e studi di espressione degli alleli identificati; ricerca sull’origine del carciofo e del cardo coltivato basata sulla differenziazione delle sequenze ITS ed ETS. Sono proseguite le attività di miglioramento genetico per l’ottenimento di cultivar triploidi di agrumi e gli studi di embriogenesi somatica in vite. I risultati conseguiti nel 2005 sono in linea con quanto atteso. Nel 2005 e’ stata acquisita la necessaria strumentazione per sostituire anche quella obsoleta esistente. Sono stati effettuati miglioramenti della struttura informatica della sede di Bari. Restano, purtroppo, inalterati i problemi di spazio già previsti in fase di predisposizione del PdG 2005, anche se piccole modifiche a Bari hanno leggermente ridotto la pressione demografica nei laboratori. Una collaborazione con l’Università di Kassel è stata molto attiva per la organizzazione e conduzione di missioni di raccolta di germoplasma, sia in Italia che all’estero; inoltre è in corso di definizione una collaborazione col CSIC (E) ed una con l’IPK di Gatersleben (D). La commessa ha avuto la capacità di attrarre nuove entrate non previste nel PdG 05 per oltre 260.000 euro, grazie alla partecipazione a progetti finanziati da Ministeri ed Enti Locali. Ciò ha fatto di gran lunga aumentare il fattore di amplificazione della commessa. AG.P02.003 - CONSERVAZIONE DELLA BIODIVERSITÀ D’INTERESSE AGRO-ALIMENTARE: Non tutta l’attività prevista per il 2005 ha potuto essere svolta, in quanto le celle di conservazione sono sottoposte a sequestro giudiziario. Tuttavia si è attivato un sito di backup presso le strutture di Policoro dove il materiale raccolto è stato mantenuto in celle di conservazione a breve-medio termine non interessate dal sequestro, per evitarne il deperimento. Purtroppo questa vicenda giudiziaria, sulla quale l'Amministrazione è stata tenuta in tempestivo e continuo aggiornamento, ha fortemente limitato le capacità operative di questa commessa. Anche l'aggiornamento delle banche dati ha subito un ritardo stante l'impossibilità di accedere ai relativi registri, come comunicato all’Amministrazione centrale dell’Ente. Nonostante ciò una parte dell’attività, principalmente quella svolta nelle ex Sezioni al di fuori della sede principale, non ha subito eccessivi rallentamenti. In particolare: su lotti di semi selezionati è stato avviato uno studio per correlare parametri d’analisi d’immagine (marcatore RGB) alla performance germinativa del seme (http://germimaging.ba.cnr.it).Sono state svolte ricerche nel settore del reperimento, monitoraggio e caratterizzazione identificando marcatori molecolari in specie di interesse strategico (vite, agrumi e diverse

167


specie fruttifere). E’ stato sviluppato un MTA basato su quello in uso presso l’IPK di Gatersleben (D).E’ in corso di sviluppo un prototipo per la gestione delle banche dati, basato su un modello relazionale, che consentirà l’integrazione delle preesistenti banche di dati. AG.P01.006 - INTERVENTI BIOTECNOLOGICI FINALIZZATI ALL’UTILIZZAZIONE DELLE PIANTE PER L’OTTENIMENTO DI NUOVI PRODOTTI PER LA SALUTE,L’ALIMENTAZIONE E L’INDUSTRIA Nel 2005 le attivita’ sono state volte a produrre vettori e protocolli per la trasformazione genetica delle piante, isolare i geni principali di alcuni pathway metabolici, caratterizzare a livello biochimico e genetico genotipi di popolazioni naturali ed artificiali di specie ed origini diverse, identificare marcatori molecolari associati all'espressione di caratteri d'interesse. I risultati conseguiti sono in linea con quanto atteso o. Alcuni punti critici sono stati superati, mentre le ricerche in corso dovrebbero consentire il superamento di altri. La disponibilità di spazi per laboratori e studi, non risolvibile con le risorse ordinarie, resta un punto critico in alcuni casi (es. per la sede di Portici), così come evidenziato nelle schede della commessa. AG.P01.007 - GENOMICA E PROTEOMICA PER IL MIGLIORAMENTO DELLA PRODUTTIVITÀ E DELLA QUALITÀ DELLE PIANTE L’attività scientifica risulta abbastanza equilibrata tra ricerca di base e ricerca applicata. Le attivita’ svolte hanno riguardato l’isolamento di geni e l’analisi genomica strutturale e funzionale di specie modello (Medicago truncatula, Arabidopsis thaliana) e importanti specie agrarie (olivo, tuber, pomodoro, patata) numerose pubblicazioni, sono apparse su riviste internazionali con elevato fattore d’impatto. La presenza nel sistema di ricerca internazionale è buona e sono in corso collaborazioni con laboratori esteri, USA, Australia e Cina inclusi. Buona è anche la partecipazione a programmi di ricerca finanziati dalla UE. Negli ultimi tempi si sta avviando una collaborazione con aziende produttive private nell’ambito del vivaismo e dell’agroalimentare. AG.P02.004 - BANCA DEL DNA VEGETALE Le attivita’ svolte in tale ambito includono l’estrazione di DNA da popolazioni di peperone, carciofo , Eruca, Arabidopsis thaliana raccolte nel Sud Italia, di genotipi di carciofo, pomodoro, patata e di varieta’ , popolazioni e vecchi genotipi di Olivo. Sono state allestite librerie EST e BAC e cDNA di diverse specie. Inoltre sono state allestite banche dati preliminari in formato Excel con dati di passaporto delle accessioni raccolte e dei campioni di DNA conservati e un database dei dati di espressione genica (in collaborazione Univ. Napoli). E’ in via di sviluppo un prototipo di sistema di gestione delle banche dati e di una interfaccia per la messa in rete dei dati. Sono stati conseguiti i risultati attesi e fondamentale è stato l’investimento in strumentazione, quasi completamente assente al momento dell’avvio della commessa. Sono state attivate importanti collaborazioni con prestigiose istituzioni internazionali (Kew Gardens di Richmond, UK e NASC - Arabidopsis Stock Centre di Nottingham, UK) già attive in questo campo da alcuni anni. La commessa consente quindi di colmare un gap coi Paesi europei più avanzati del campo. TA.P01.007 - FUNZIONALITA' E CARATTERIZZAZIONE GENETICA DI ECOSISTEMI FORESTALI L’attività di ricerca è stata intensa nell’ambito di tutte le strutture dell’IGV coinvolte ed è stato dedicata al rispetto del raggiungimento degli obiettivi prefissati tra cui l’applicazione di marcatori molecolari nello studio della strutturazione spazio/tempo della variabilità genetica a livello di specie ed entità sotto-specifiche (Fagus, Fraxinus, Quercus, Cupressus, Abies, Picea, Pinus, Juniperus e Larix). L’intensa collaborazione con partner italiani e stranieri ha portato ad una chiara valorizzazione scientifica e di immagine all’IGV. Prova ne è il riconoscimento della partecipazione a programmi finanziati dalla U. E. e da fonti italiane. Le pubblicazioni scientifiche, numerose, compaiono su prestigiose riviste internazionali con alto valore di impact factor. Infine, la commessa partecipa direttamente nella gestione del centro di Microscopia Elettronica, centro di eccellenza di ricerca e di servizi del CNR

Proposta di interventi organizzativi Allo scopo di migliorare e sviluppare le competenze acquisite e stimolare la piena potenzialità dell’IGV in seno alla domanda esterna di ricerca scientifica nel settore agro-alimentare, vengono presentate alcune possibili proposte per una migliore organizzazione sia interna che esterna all’IGV. - Caratterizzare l’IGV in seno al CNR per una specifica competenza finalizzata all’analisi dei genomi vegetali, mediante lo sviluppo di una piattaforma di eccellenza in cui siano presenti le necessarie infrastrutture per la conservazione della variabilità genetica vegetale in vitro ed in vivo (piante e DNA) e per il suo studio e la sua utilizzazione per specifici obiettivi. - Stimolare le possibili sinergie nell’ambito del Dipartimento per costituire una massa critica secondo standard internazionali, capace di accedere più facilmente alle fonti di finanziamento in atto a livello nazionale e internazionale. - Stimolare la domanda di ricerca da parte dell’impresa privata con iniziative di divulgazione delle attivita’

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scientifiche - Individuare e potenziare i servizi in comune, come le grandi apparecchiature e un servizio bibliografico on line, sfruttando al massimo gli accordi già esistenti tra CNR e le Università. - Dare supporto al Centro di Microscopie Elettroniche dell’Area di Ricerca CNR di Firenze alla cui gestione e sviluppo partecipa la ex sezione di Firenze dell’IGV e che sta acquisendo competenze sempre più ampia nell’ambito del mondo scientifico italiano. - Adeguare i laboratori alla mole di attività scientifica e di personale impegnati nella ricerca e che in alcuni casi come in quello di Bari e di Portici costituisce un fattore limitante per la crescita. - Promuovere un continuo aggiornamento delle competenze già esistenti - Cercare di dare maggiore importanza al fattore umano ricordando che il ricercatore è il primo attore di una qualsiasi attività di progresso nel campo della ricerca scientifica - Portare avanti i concorsi previsti nell’ambito dell’accordo CNR-Mezzogiorno - Provvedere a creare nuovi posti di lavoro per fare fronte alle nuove richieste di ricerca e rimanere competitivi a livello internazionale. - Ricevere maggiore attenzione da parte degli Uffici Centrali del CNR, che non hanno ritenuto di prendere posizione su fatti ed atteggiamenti conflittuali tenuti dall’ex Direttore dell’Istituto del Germoplasma e da un Collaboratore Tecnico sempre della Sede. C’è da tener presente che l’attuale struttura dell’IGV, dislocata su cinque Regioni e con un patrimonio di competenze notevole, richiede un notevole sforzo gestionale. Tuttavia vanno messi in evidenza i vantaggi di questa struttura che permette tra l’altro un ancoraggio agli Enti locali ed in particolare alle Regioni, i cui Assessorati all’Agricoltura ed all’Ambiente rimangono gli interlocutori naturali sia per l’identificazione degli obiettivi delle ricerche da effettuare che per il trasferimento dei relativi risultati, secondo l’attuale visione del pensare globalmente ed agire localmente. Per sfruttare al meglio questa situazione vanno evitate al massimo le continue ipotesi di un’altra ristrutturazione del CNR che preveda una diminuzione di importanza delle ex sedi territorialmente distinte ed una loro perdita di identità . Lo scenario prospettato dalle ipotesi in circolazione rischiano di vanificare gli sforzi attualmente in corso per agganciare le risorse disponibili presso gli Enti Locali,che hanno bisogno di interlocutori che garantiscano la continuita’.

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170


ISTITUTO PER LA PROTEZIONE DELLE PIANTE Missione

Incrementare le attività di ricerca e di studio dei meccanismi biologici che controllano le complesse relazioni tra pianta e fattori di stress biotici e abiotici. Sviluppare modelli previsionali di lotta rispettosi dell'ambiente e della salute del consumatore. Direttore: Dott Paolo Raddi Sede principale: Via Madonna del Piano 10 - 50019 Sesto Fiorentino FI Toscana Superficie immobile: XX mq Articolazione territoriale: c/o Via Amendola, 122/D - 70126 Bari BA Puglia

Superficie immobile: XX mq c/o Via Università, 133 - 80055 Portici NA Campania Superficie immobile: XX mq

c/o Dipartimento Biologia vegetale Università Torino Viale Mattioli, 25 - 10125 Torino TO Piemonte

Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.ipp.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 38 12 25 7 82 2004 38 12 25 7 82 2005


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Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Raddi Paolo DIRE Di Vito Mauro I Greco Nicola I Vovlas Nicola I Basile Martino II Bleve Teresa II Ciancio Aurelio II Fineschi Silvia II Intini Marcello II Molinari Sergio II Panconesi Alberto II Roca Francesco Italo II Turchetti Tullio II Balestrini Raffaella Maria III Bernardo Umberto III Bianciotto Valeria III D'Addabbo Trifone III Danti Roberto III De Luca Francesca III Giorgini Massimo III

liv.Guerrieri Emilio III Leonetti Paola III Lo Bue Giovanni III Melillo Maria Teresa III Mello Antonietta III Monti Maurilia Maria III Paoletti Elena III Parrella Giuseppe III Pedata Paolo Alfonso III Raio Aida III Ruocco Michelina III Santini Alberto III Sasanelli Nicola III Troccoli Alberto III Veronico Pasqua III Agostinelli Augusta IV Brandonisio Antonio IV Cantisani Anna Maria IV Carella Antonio IV Della Valle Irene IV

liv.Di Lonardo Vincenzo IV Elia Francesco IV Ferrini Fabio IV Livorti Donato IV Basile Angela Carmela V Faccio Antonella V Fagnani Alberto V Nappo Anna Giulia V Radicci Vincenzo V Ranieri Walter V Romagnoli Anna V Catalano Fabio VI Cristadoro Salvatore VI Magaldi Ettore VI Torraca Giovanni VI Allione Lucia VII Falco Clementina VII Pesciolini Francesca VII De Cosmis Pasquale VIIILerario Roberto VIII

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2003 13 6 6 2 10 37 2004 14 8 8 2 12 44 2005

ASSEGNISTI

Alitukiriza Balijja Elena Fanelli

Luisa Ghelardini Stefano Ghignone

Claude Murat Marta Vallino

Paola Zinno


Paola Bonfante Paolo Capretti Stefano Colazza Carla De Giorgi

Andrea Genre Mariangela Girlanda Luisa Lanfranco Matteo Lorito

Silvia Perotto Alessandro Ragazzi Giuseppe Russo

Giuseppe Surico Gennaro Viggiani Astolfo Zoina

BORSISTI

Maria Aguacil Gianni Della Rocca Erica Lumini Laura Cristina Rosso


Marino Binetti Lucia Cozzolino

Luigi Iodice Ida Soriente Sara Torrielli

DOTTORANDI

Simona Abba Iulia Anca

Chiara Napoli Gerardo Puopolo

Luigi Scassillo Richard Splivallo

Valeria Siciliano Lugo Zunilde

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Risorse finanziarie



esterne totale



esercizi precedenti 2003 - 4.618 - 918 - 5.536 6.203 2004 3.761 4.485 500 1.448 4.261 5.933 6.778 2005




anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 556 - 707 - - 2004 311 391 500 1.071 853 2.315 2005







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esposizione


2003 37 - 10 - 1 - - - 2004 68 31 8 2 2 - - - 2005


ARTICOLI ISI

Castillo P., Vovlas N., Subbotin S., Troccoli A. A New Root-Knot Nematode, Meloidogyne baetica n. sp. (Nematoda: Heteroderidae), parasitizing wild olive in southern Spain PHYTOPATHOLOGY

Amorini E. 1, Manetti M.C. 2, Turchetti T. 3, Sansotta A. 4, Villani F. 5 Impact of silvicultural system on Cryphonectria parasitica incidence and on genetic variability in a chestnut coppice in Central Italy FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT

Calamassi R. 1, Della Rocca G. 2, Falusi M. 3, Paoletti E. 4, Strati S. 5 Resistance to water stress in seedlings of eight European provenances of Pinus halepensis Mill. ANNALS OF FOREST SCIENCE

Castillo P., Navas-Cortés J. A., Gomar-Tinoco D., Di Vito M., Jiménez-Díaz R. M. Interactions between Meloidogyne artiellia, the cereal and legume root-knot nematode, and Fusarium oxysporum f. sp. ciceris race 5 in chickpea PHYTOPATHOLOGY

Moricca S. 1, Ragazzi A. 2, Mitchelson K.R. 3, Assante G. 4 Antagonism of the two-needle pine stem rust fungi Cronartium flaccidum and Peridermium pini by Cladosporium tenuissimum in vitro and in planta. PHYTOPATHOLOGY

Intini M. First report of Inonotus rickii causing canker rot on boxelder in Europe. PLANT DISEASE

Santini A. 1, Barzanti P. 2, Capretti P. 3 Susceptibility of some mesophilic hardwoods to alder Phytophthora. JOURNAL OF PHYTOPATHOLOGY

Crozzoli, R. and Lamberti, F.

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Species of Criconema Hofmänner & Menzel, 1914 and Ogma Southern, 1914 occurring in Venezuela, with description of Ogma araguaensis sp. n. (Nematoda: Criconematidae) RUSSIAN JOURNAL OF NEMATOLOGY

Pichot C. 1, El Maataoui M. 2, Raddi S. 3, Raddi P. 4 Surrogate mother for endangered Cupressus NATURE

Malhotra R. S., Singh K. B., Di Vito M., Greco N., Saxena M. C. Registration of ILC10765 and ILC 10766 chickpea germplasm lines resistant to cyst nematodes CROP SCIENCE

Fineschi S. 1, Taurchini D. 2, Grossoni P. 3, Vendramin G.G. 4 Chloroplast DNA variation of white oaks in Italy FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT

Troccoli A., Vovlas N., Inserra R. N. Parasitism of timber bamboo by Gracilacus latescens Raski, 1976 and morpho-biological notes on mature and immature life stages NEMATROPICA

Liskova M., Troccoli A., Vovlas N., Sasanelli N. On the occurrence of Rotylenchulus borealis in the Slovak Republic HELMINTHOLOGIA

Mello A., Cantisani A., Vizzini A., Bonfante P. Genetic variability of Tuber uncinatum and its relatedness to other black truffles ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Guerrieri E., Poppy G.M., Powell W., Rao R., Pennacchio F. Plant to plant communication mediating in-flight orientation of Aphidius ervi. JOURNAL OF CHEMICAL ECOLOGY

De Luca F., Reyes A., Veronico P., Di Vito M., Lamberti F., De Giorgi C. Characterizaation of the (GAAA) microsatellite region in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia GENE

E. Soragni1, A. Bolchi1, R. Balestrini2, C. Gambaretto1, R. Percudani1, P. Bonfante2, S. Ottonello1 A nutrient-regulated, dual localization phospholipase A2 in the symbiotic fungus Tuber borchii EMBO JOURNAL

Peluso R., Raio A., Morra F., Zoina A. Physiological, biochemical and molecular analyses of an Italian collection of Agrobacterium tumefaciens strains EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY

Molinaro A., De Castro C., Lanzetta R., Parrilli M., Raio A., Zoina A.

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Structural elucidation of a novel core oligosaccharide backbone of the lipopolysaccharide from the new bacterial species Agrobacterium larrymoorei CARBOHYDRATE RESEARCH

Molinari S. Effect of plant defence elicitors and cations on reproduction of RKN on tomato. NEMATOLOGY

De Giorgi C., Veronico P., De Luca F., Natilla A., Lanave C., Pesole G. Structural and evolutionary analysis of the ribosomal genes of the parasitic nematode Meloidogyne artiellia suggests its ancient origin MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY

Leone A. , Melillo M.T. , Bleve-Zacheo T. Lipoxygenase in pea roots subjected to biotic stress PLANT SCIENCE

Pedata P.A., Giorgini M., Guerrieri E. Interspecific host discrimination and within-host competition between Encarsia formosa and Encarsia pergandiella (Hymenoptera: Aphelinidae), two endoparasitoids of whiteflies (Hemiptera: Aleyrodidae) BULLETIN OF ENTOMOLOGICAL RESEARCH

Pedata P.A. 1, Garonna A.P. 2, Zabatta A. 3, Zeppa P. 3, Romani R. 4, Isidoro N. 5 Development and morphology of teratocytes in Encarsia berlesei and Encarsia citrina: first record for Chalcidoidea. JOURNAL OF INSECT PHYSIOLOGY

Andres M.F., Melillo M.T., Delibes A., Romero M.R., Bleve-Zacheo T. Changes in wheat root enzymes correlated with resistance to cereal cyst nematode NEW PHYTOLOGIST

Parrella G., Ruffel S., Palloix A., Moreti A., Caranta C. Recessive resistance gene against potyviruses are localized in colinear genomic region of the tomato (Lycopersicon spp.) and pepper (Capsicum spp.) genomes THEORETICAL AND APPLIED GENETICS

BianciottoV. 1, Lumini E. 2, Bonfante P. 1,2, Vandamme P. 2 ‘Candidatus Glomeribacter gigasporarum’, an Endosymbiont of Arbuscular Mycorrhizal Fungi INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY

Bianciotto V.1, Andreotti S. 2,Balestrini R. 1,Bonfante P. 1,2,Perotto S. 1,2 Mucoid Mutants of the Biocontrol Strain Pseudomonas fluorescens CHA0 Show Increased Ability in Biofilm Formation on Mycorrhizal and Nonmycorrhizal Carrot Roots MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS

ARTICOLI NON ISI

Basile M., T. D’Addabbo, Sasanelli N., Basile A.C.

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Fumiganti e nematocidi sistemici in vivaio Italus Hortus

Ciancio A., Leonetti P., Alba G. Indagini sull’applicazione in pieno campo dell’ifomicete Verticillium chlamydosporium per il controllo biologico di nematodi galligeni Nematologia mediterranea

Coiro M.I., Lamberti F., Sasanelli N., Duncan L.W., Agostinelli A. Reproduction and longevity of Xiphinema vulgare (Nematoda) Nematologia mediterranea

Bravo M. A., Roca F., Mota M. M. Observations on Xiphinema coxi europaeum Sturhan from Portugal and description of the male of X. lusitanicum Sturhan (Nematoda: Longidoridae) with multivariate analysis of juveniles International Journal of Nematology

Molinari Sergio INHIBITION OF H2O2-DEGRADING ENZYMES IN THE RESPONSE OF MI-BEARING TOMATO TO ROOT-KNOT NEMATODES AND SALICYLIC ACID TREATMENT Nematologia Mediterranea

LIBRI

Ceruti A.1, Fontana A.2, Nosenzo C.3. Le illustrazioni sono di Meotto F.4 Le specie europee del genere Tuber: una revisione storica in Monografie XXXVII, Regione Piemonte, Torino 2003.

RAPPORTI

Panconesi A., Dellavalle I., Danti R. Il cipresso tra Europa e Mediterraneo: un caso di studio e riflessione per garantire il futuro della cipresseta degli Zappini

Raddi P., Frontera C., Giuntini M., Serra R., Intini M., Danti R., Panconesi A., Tognotti M., Di Loreto G. I cipressi di Bolgheri. Riqualificazione paesaggistica del viale di Bolgheri. Studio progettuale per il suo recupero e gestione

Raddi P., Montoro A., Fusco M., Intini M., Panconesi A., Danti R. Il bosco degli Zappini, Fontegreca

Danti R., Panconesi A., Raddi P., Di Lonardo V., Nembi V., Della Rocca G. Iniziative per la tutela del cipresso a Bolgheri e in Toscana. In: I cipressi di Bolgheri. Riqualificazione paesaggistica del viale di Bolgheri, Studio progettuale per il suo recupero e gestione

Raddi P., Caetano F., Danti R., Intini M., Panconesi A., Ramos P., Varela J. O cipreste em Portugal. Panorama actual e prospectivas futuras

Panconesi A., Danti R., Raddi P., Intini M., Di Lonardo V., Nembi V., Della Rocca G., Torraca G.

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Mètodos de controlo do cancro cortical dos ciprestes

Danti R., Panconesi A., Raddi P., Di Lonardo V., Nembi V., Della Rocca G., Torraca G. O melhoramento genético do cipreste para resisténcia ao cancro cortical

Intini M. O Cipreste na arte entre o Occidente e o Oriente

Intini M. La cipresseta di Fontegreca: Storia, Natura e Ambiente

Intini M. La cornice botanico-micologica del viale di Bolgheri inserita nella Maremma Carducciana

Raddi P., Di Lonardo V. Relazione sulla visita alle aree naturali a Creta

P. Bonfante, V. Bianciotto, L. Lanfranco Isolation from AM fungi of strong promoters and genes involved in P nutrizion, N metabolism and HM tolerance; Potential of endosymbiotic Glomeribacter for providing genes of agronomic interest to AM fungi

P. Bonfante, V. Bianciotto, L. Lanfranco Isolation from AM fungi of strong promoters and genes involved in P nutrizion, N metabolism and HM tolerance; Potential of endosymbiotic Glomeribacter for providing genes of agronomic interest to AM fungi


Panconesi A. 1, Raddi P. 2 CYPRALL UE-CRAFT, QLK4-2002-71661

Danti R. 1, Panconesi A. 2 Recupero e valorizzazione del Viale monumentale di Bolgheri


Ciancio A. Pochart

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Altri Ministeri: Ministero Infrastrutture e Trasporti

Enti pubblici: Regione Campania; Regione Sicilia; Regione Piemonte; Regione Puglia ; Regione Toscana Province di Livorno; Regione di Caserta; Regione di Siena Comunità montane( 8) in Piemonte; Regione Toscana; Regione Sardegna; Regione Campania; Regione Umbria; Regione Puglia; Regione Sicilia

EPR italiane: CNR IBBA; CNR IGV; CNR IBAF; CNR IVV

EPR straniere: Institute of Ecology (Olanda); CSIC (E); Laboratoire de Biologie (f); John Innes Centre (UK); CNRS Centre d’Ecologie functionelle et evolutive (F); INRA Unité de Recherche Integrée en Horticulture(F); Privati:; UTL (P); UMR 5546 (F); Central Laboratory of Ecology (Bg); Natural History Museum London (UK); Iasma ( S.Michele all’Adige); Cemgraf (F) ; UCLM (E); Icardia (Siria); Plant Insect Ecology (UK); Nagref (Gr); Elep; Lofarma; Anallergo; Aziende Vivaistiche “Il Terzo” e “Umbraflor”; Du Pont de Nemours; Agrifutur; Syngenta; Dow agrosciences; Certis; Basf Agro; Sariaf; Isagro; Cassa di Risparmio di Firenze; Compagnia San Paolo

Università: UniTo(Cebiovem); UniFi (Diba); UniNa; UniBa; Univ. Of Melbourne; Univ. of Coimbra; Univ.of Illinois; Univ. of Tucson; Dept. of Nematology (Riverside, USA)

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REGIONE CAMPANIA • Finanziamento 2002 L.R. 28/05/2002 n. 5 (RUOCCO) • Sviluppo di un sistema di rilevamento di infezioni latenti di Agrobacterium tumefaciens in

piante din pesco (Raio) Legge Regionale 28/5/02 n. 5 Reg. Campania • Valutazione dell'impatto di patata transegenica su organismi non bersaglio (Guerrieri Legge

Reginale 28/5/02 n. 5 Regione Campania

ENTE CASSA RIPARMIO FIRENZE • Prog. Ente Cassa di Risparmio di Firenze

COMPAGNIA DI SAN PAOLO PRESSO SAN PAOLO • Contributo Compagnia di San Paolo - Assegno di Ricerca biennale

Università degli studi di Napoli "Federico II" Centro Musei Scienze Naturali • Progetto speciale Triennale Mipaf Biosistematica di Hymenoptera ecc. • Progetto speciale Mipaf Caratterizzazione ed applicazione di antagonistibatterici ecc. • Prgetto Mipaf dell'Università di Napoli "Resp. Pedata" • Progetto Mipaf dell'Università di Napoli (Resp. RAio)

ISTITUTO AGRARIO DI SAN MICHELE ADIGE • contratto Ecocypre (IASMA) Provincia Trento 2003 • Contratto Prov. Trento rateo 2004

UMBRAFLOR S.R.L. • Contratto Umbraflor srl 2003

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI TORINO • Contratto di ricerca su: Indagini sugli effetti di formulati di dimetile sulla popolazione di

nematodi galligeni del genere Meloidogyne su colture di pomodoro allevate in serra.

PROVINCIA REGIONALE DI RAGUSA • Contratto di ricerca con la Provicia di Ragusa sulla Lotta nematocida con metodi

ecocompatibili Prof. F.Lamberti

MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI (MIPAF) • Contratto Mipaf RiSelvItalia II anno di attivita' saldo 2004 • Contratto Mipaf saldo rateo 2002

PROVINCIA DI LIVORNO • Contratto Prov. Livorno rateo 2004 • Contratto Provincia Livorno per ratei 2000/2002/2003)

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca

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• Accertamento per contributo Miur (Guerrieri) Valutazione impastto sul pomodoro transgenico ecc

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • Contratto di ricerca Miglioramento genetico della patata 5° anno di attività • Contratto di ricerca Miglioramento genetico della patata 4° anno di attività

COMUNITA' EUROPEA • Contratto UE OAKFLOW rateo 2004 • Contratto Manchest rateo 2004 • Contratto QLK5-CT-2000-00960 RATEO 2003 • Contratto Cyprall Craft 2003 • Contratto UE Cyprall - Craft rateo 2004 • Contratto EU MANCHEST 2003

DIPARTIMENTO AGROCHIMICA E AGROBIOLOGIA UNIVERSITA' DI REGGIO CALABRIA • PROGETTO POM " Tecniche di sterilizzazione suolo alternative al Bromuro di Metile" dott.

Nicola Greco

DIPARTIMENTO DI BIOLOGIA VEGETALE - UNIVERSITA' LA SAPIENZA DI ROMA • Contratto DBV (rinnovo) • Contratto con D.B.V. - Univ. di Roma La Sapienza 2003

EUROPEAN COMMISSION - RESEARCH DIRECTORATE GENERAL • Accertamento per documenti amministrativi attivi

INRA - INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE • PROGETTO CEE/INRA N. QLK5 CT-199901501 (NONEME) D.ssa BLEVE • Contratto CEE FAIR6-CT98-4139 Alternative to methyl Bromide dott. Di Vito

ELEP S.p.A. • Contratto Elep 2005

ROTHAMSTED EXPERIMENTAL STATION • Progetto di ricerca CEE FAIR CT97-3444

REGIONE PIEMONTE - Direz. Reg. Economia Montana e Foreste - Settore Politiche Forestali • REGIONE PIEMONTE (Interreg 2002/2003 Paoletti Elena) • contratto Regione Piemonte Interreg (Paoletti) rateo 2004

Stazione Sperimentale del Sughero - Regione Sardegna • Stazione Sperimentale del Sughero-Reg.Sardegna 1° rata Convenzione 2003 • Convenzione Stazione Sperimentale Sughero 2003 2° rata • Convenzione Stazione Sperimentale Sughero 2003 3° rata • Convenzione per programma di ricerca sui funghi simbionti della Sardegna

MINISTERO DELL'ECONOMIA E DELLE FINANZE - DIP. DELLA RAGIONERIA GENERALE DELLO STATO - IGRUE UFF.9

• Progetto CypMed Interreg Medoc III (Raddi) • Progetto CYPMED INTERREG III - B MEDOC

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Fondazione Cassa di Risparmio di Cuneo • Fondazione Cassa di Risparmio di Cuneo 2004

Contratti passivi

GUERRIERI EMILIO • Acquisto di microscopio

FRANCESCO MARGIOTTA • Acquisto digital microscope Leica per l'IPP DI BARI

Bio-Rad Laboratories S.r.l. • Obbligazione per documento amministrativo passivo Noleggio Icycler System (1°rata) Tuber

2002

LABOSYSTEM S.r.l. • Obbligazione per documento amministrativo passivo Attrezzature da lab. 626/2002

LAB SERVICE ANALYTICA • Acquisto HPLC Pump Smartline 1000

LABOZETA SRL • arredi da laboratorio • arredi per laboratorio

M-MEDICAL SRL • Acquisto Q-PCR SYSTEM MX300P PERSONAL

UMBRAFLOR S.R.L. • Trasferimento quota parte prog. Interreg Feder I° rimb.

RE.CO.T. • Obbligazione per documento amministrativo passivo Camera climatica 626/2003

BIO-OPTICA MILANO S.p.a. • CRIOSTATO MICRON HM 550 OVP

FEI ITALIA S.R.L. • smontaggio imballo trasporto rimontaggio SEM 505 nuova sede Sesto F.no

APPLERA ITALIA • assistanza tecnica per ABI Prism 377 DNA dal 01/01/04 al 31/12/04 • Acquisto sequenziometro per labor.

UNIVERSITA' STUDI BASILICATA DIP. BIOLOGIA, DIFESA E BIOTECNOLOGIE AGRO-FORESTALI

• Restituzione dei fondi non utilizzati sul progetto POM a 30

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QUI! TICKET SERVICE SPA • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo

BIOLOGIA DI BASE ED APPLICATA • contratto di ricerca "Induzione della maschiosterilità mediata......"2004/2006

enea (anguillarese roma) • Trasferimento Fondi Miur all'Enea

Cozzolino Lucia • Contratto d'opera per Lucia Cozzolino

Linea Ambiente srl • progettazione rilevamento reporting di campagna rilevazione sintomi di azoto

CEHM - Région Languedoc-Roussillon • Trasferimento quota parte prog. Interreg Feder I° rimb.

COSTRUZIONI GENERALI CAMPAGNA VINCENZO • LAVORI DI DEMOLIZIONE SERRETTE CON COSTRUZIONE DI UN NUOVO MASSETTO

ACOTEC s.r.l. • Obbligazione parziale per costruzione di una serra di mq.100 ca. • Impianto di climatizzazione a pompe di calore ambiente dei singoli compartimenti della serra

Dip.Bioteconologie Agrarie-Patologia Vegetale • studio degli agenti responsabili delle più devastanti manifestazioni patologiche, comprese

quelle da fattori abiotici, e relativi metodi di lotta.

SORIENTE IDA • Contratto d'opera per Ida Soriente

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Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Apparecchiature per elettroforesi di DNA (FI) - Apparecchiature per elettroforesi di DNA (NA) - Apparecchiature per elettroforesi di DNA e proteine (TO) - Apparecchiature per elettroforesi di DNA e proteine (TO) - Autoclave verticale 140 lt. (IPP-NA) - CAPPA CHIMICA (IPP-BA) - CAPPA MICROBIOLOGICA (IPP-BA) - CELLA FREDDA (IPP-BA) - CELLA TERMOSTATATA (IPP-BA) - CELLE CLIMATIZZATE PER ALLEVAMENTO VEGETALE (IPP-BA) - CENTRIFUGA REFRIGERATA (IPP-BA) - CENTRIGUGA DA BANCO (IPP-BA) - Cappa a flusso laminare (FI) - Cappa a flusso laminare (IPP-NA) - Cappa flusso laminare (FI) - Cella termostatica (FI) - Celle per elettroforesi orizzontale (IPP-NA) - Centrifuga refrigerata (FI) - Congelatore verticale -10 -40 °C (IPP-NA) - Congelatore verticale -18 °C (IPP-NA) - Elettrophoresis Submarina mini gel (FI) - FRIGORIFERO -20 (IPP-BA) - FRIGORIFERO -80 (IPP-BA) - Forno per ibridazione (IPP-NA) - Frigocongelatore (IPP-NA) - Gel Doc (Image System) Bio Rad (NA) - Gel Doc (Image System) BioRad (FI) - Gel Doc 2000 (FI) - Gene Amp PCR System 9700 (FI) - GeneAmp PCR System 9700 - GeneAmp PCR System 9700 (TO) - Incubatore/agitatore per funghi e cella-frigo per batteri (TO) - MICROSCOPIO AFM/STM (IPP-BA) - MICROSCOPIO OTTICO (IPP-BA) - MIllipore elix 3 (IPP-NA) - Microcentrifuga da banco (IPP-NA) - Microcentrifughe (NA) - Microcentrifughe e centrifuga refrigerata (TO) - Microscopio Axioskop (FI) - Microscopio Elettronico a Trasmissione Philips CM10 (acquisto Univ. di Torino) - Microscopio Elettronico a Scansione Philips (FI) - Microscopio confocale (Fluoview-Olympus) (TO) - Microscopio confocale BIORAD View Scan (TO) - Microscopio stereoscopico Wild M3 - Microtomo (HM325) per campioni inclusi in paraffina (TO) - PCR System (FI) - PCR System (Perkin Elmer) (NA) - PHmetro da banco (IPP-NA) - Pompa rotativa Edwards (IPP-NA)

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- SERRA (IPP-BA) - SISTEMA ACQUISIZIONE IMMAGINI E CCD (IPP-BA) - SISTEMA DI FILTRAZIONE ACQUA ULTRAPURA (IPP-BA) - STEREOSCOPIO (IPP-BA) - Serra sperimentale - Serra sperimentale (FI) - Sistema UHQ II per produzione di acqua ultrapura (TO) - Spettrofotometro (IPP-NA) - Spettrofotometro DU530 (Beckman) (TO) - Strumento vibratomo (TO) - THERMAL CYCLER (IPP-BA) - Termostato incubatore (IPP-NA) - Thermal cycler (IPP-NA) - Ultramicrotomo Ultracut E - Reichert-Jung (TO) - apparecchiatura BioRad per elettroforesi bidimensionale (isoelettrofocalizzazione e SDS-PAGE) - camera climatica per colture vegetali (TO) - camera climatica per colture vegetali e fungine (TO) - cappa a flusso laminare (FI) - cappa chimica e a flusso laminare (TO) - criostato (TO) - freezer verticale -80°C (TO) - galleria del vento - iCycler Biorad Real-time PCR (TO) - microscopi ottici Nikon a campo chiaro e campo scuro (TO) - serre di moltiplicazione (FI) - termostato (FI) Istituti con i quali si collabora

Istituti CNR esecutori di moduli di attività di commessa coordinata dall’Istituto Istituti CNR coordinatori di commesse di cui l’Istituto è esecutore di moduli di attività

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Impatto economico e/o ambientale di fattori di stress su piante ed ecosistemi produttivi.

Temi


L'attività di ricerca si evolve con l'approvazione di nuovi progetti. Nel 2005 riguardo alle ricerche vincolate e conto terzi, sarà effettuata l'attività prevista dai progetti e basata su indagini dei patosistemi: cipresso-cancro, castagno-mal dell'inchiostro e cancro, alberi forestali e fattori abiotici di danno, micologia del tartufo. L'IPP intende sviluppare anche modelli per valutare l'impatto economico e ambientale degli interventi utilizzando i risultati da impianti dimostrativi.

Stato dell'arte:

Vi è una richiesta crescente di interventi sanitari ecocompatibili basati principalmente sulla lotta biologica e sul miglioramento genetico per la resistenza. Altri Istituti di Plant Protection in Europa stanno sviluppando metodi di protezione delle piante ecologicamente validi ed economici. Lo scopo principale dell'IPP è di acquisire conoscenze scientifiche per una protezione integrata delle piante e di fornire presupposti per il trasferimento di queste nella pratica agroforestale.

Azioni

Attività in corso:

L'attività di ricerca dei progetti vincolati e conto terzi riguarda: 1)effetti dell'ozono sulla vegetazione di alberi forestali; 2)recupero ambientale e del paesaggio mediterraneo; 3)miglioramento genetico del cipresso, olmo e platano per la resistenza a malattie e per la tolleranza al freddo del cipresso; 4)difesa biologica contro le malattie del castagno. L'attività scientifica è svolta in laboratorio e in campi sperimentali; quella dimostrativa interessa impianti in vari Paesi.


Le ricerche vincolate e conto terzi richiedono consistente impegno da parte del personale. Le attuali attrezzature di laboratorio sono inadeguate. Il costo a 'uomo fermo' per l'Area di Firenze assorbe gran parte delle risorse limitando lo sviluppo di ricerche innovative. Per l'attività della commessa occorre una compartecipazione del CNR di 150.000� per il 2005. Lo scostamento dall'indicazione del 21/11/04 per l'IPP è dovuto a maggiori accertamenti e obbligazioni per le 4 commesse


UNIONE EUROPEA: Cypmed, Manchest,Ozone. MINISTERI: Ambiente, Politiche Agrarie e Forestali. PROVINCE: Livorno, Trento. INDUSTRIE: Lofarma, Anallergo, Sariaf, Elep, Umbraflor, Vivaio il Terzo. UNIVERSITA': UniFI, UniTO, UniTUSCIA, UniNA. ISTITUTI CNR: IVALSA, IGV, IBBA, IBAF, IVV. ISTITUZIONI INTERNAZIONALI: Nagref, CNRs,Inra, Isa,Csic, Utad, Aro, Tubitak, Uni Freising, Wsl, Inrgref, Cemagref, F.R.Hellis Holt, Usda, F.I. Zvolen.

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Finalità

Obiettivi:

Studi sul: biologia ed ecologia dei componenti dei patosistemi; valutazione degli effetti di fattori abiotici di stress sulla fisiologia di piante agroforestali;effetti di pesticidi;controllo biologico dei parassiti;messa a punto di tecniche molecolari per definire le piante sintomatiche;variazione della patogenicita dei parassiti in relazione alle condizioni ambientali ed alla variabilità dell'ospite;recupero ambientale e paesaggistico con materiale geneticamente superiore.


Nuovi metodi di controllo per garantire la produzione economica delle piante. Costituzione di materiale genetico tollerante alle condizioni ambientali e resistente a parassiti limitanti la produttività. Metodi di diagnosi precoce per produrre piante 'sane' nei vivai ed individuare parassiti. Ipovirulenza e metodi agronomici contro il cancro e il mal dell'inchiostro del castagno. Valutazione degli effetti di fattori di stress sulle piante. Brevetti di cipresso e olmo resistenti al cancro e DED.

Potenziale impiego:


Interazione ospite-organismo-ambientale: biologia, epidemiologia e genomica funzionale.

Temi


L'attività di ricerca varierà in funzione dell'approvazione di progetti che saranno finanziati nel 2005. Per i progetti vincolati l'attività seguirà gli schemi previsti per il raggiungimento degli obiettivi prefissati nei sistemi: pomodoro-afidi,aleirodidi, nematodi, funghi, batteri-insetti predatori e parassitoidi,funghi antagonisti;leguminose- funghi simbionti;cetriolo-funghi simbionti; caratterizzazione cloni di Tuber borchii

Stato dell'arte:

Il controllo degli organismi dannosi alle piante coltivate è uno dei principali fattori in grado di influenzare sia la qualità finale del prodotto che quella dell'ambiente. Negli ultimi anni c'è stata una crescente richiesta di prodotti ecocompatibili, in grado di salvaguardare sia la salute umana che quella dell'ambiente. In questo contesto si inseriscono le ricerche riguardanti le interazioni multitrofiche che si instaurano tra pianta, simbionti,agenti di danno e loro antagonisti.

Azioni

Attività in corso:

I progetti su fondi ordinari e quelli vincolati riguardano:i meccanismi costitutivi ed inducibili della resistenza diretta ed indiretta vegetale agli agenti di danno in solanacee e leguminose; l'effetto di transgeni su organismi non bersaglio ed il trasferimento dei transgeni attraverso il polline ed i microorganismi del suolo;la simbiosi micorrizica.


Il livello di attuazione degli obiettivi della commessa è funzione anche dei finanziamenti disponibili e di quelli richiesti. Si richiede pertanto al CNR una compartecipazione per 175.000 euro, fondi per l'acquisizione di 2 nuove grandi attrezzature (serra a contenimento, microscopio a trasmissione) e

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fondi per la copertura di n. 2 assegnisti di ricerca *Lo scostamento dalla VS indicazione del 21/11/04 per l'IPP è dovuto a maggiori accertamenti e obbligazioni per le 4 commesse*


Università italiane: UNINA Federico II, UNITO, UNIPARMA, UNIPADOVA,UNIPM Istituzioni Italiane: ENEA Trisaia; ISCI (MIPAF) Istituti CNR: IGV Istituzioni Internazionali: IACR Rothamsted (UK); University of Arizona, Tucson (USA); INRA (France), The Sainsbury Laboratory John Innes Centre Norwich (UK); Pennsylvania State University, University Park (USA; CSIC (Espana); Universidad de Toledo (Espana) Privati: Idrocons srl

Finalità

Obiettivi:

Obiettivo generale di questa commessa è la caratterizzazione biologica, genetica, chimica e molecolare dei fenomeni di parassitismo, antagonismo e simbiosi mutualistica,in piante di importanza agraria (principalmente Solanacee e Leguminose) seguendo un approccio multidisciplinare che include esperienze in biologia cellulare, genetica,caratterizzazione molecolare,chimica ecologica ed etologia, maturate nei campi dell�entomologia,della micologia e della patologia vegetale.


Individuazione di fonti di resistenza ai principali stress biotici e caratterizzazione di semiochimici vegetali regolanti l�attività riproduttiva degli antagonisti di insetti fitofagi in germoplasma di pomodoro ed identificazione dei geni coinvolti nella loro produzione; identificazione di geni espressi in modo differenziale durante l'interazione con funghi simbionti in leguminose e cetriolo;ampliamento biblioteche cDNA di Tuber borchii

Potenziale impiego:


Biodiversità di ospiti, patogeni, vettori, organismi nocivi e funghi simbionti della rizosfera.

Temi


Analisi della diversità genetica di funghi parassiti in cipresso,olmo e castagno e della diversità genetica e funzionale di funghi simbionti arbuscolari e endobatteri,di Tuber e di endofiti radicali in ecosistemi naturali ed agrari;flusso genico nelle querce.Identificazione di agenti di controllo biologico di insetti dannosi e di nematodi, sistematica di parassitoidi di fitofagi di interesse agrario.Caratterizzazione di antagonisti batterici e fungini come potenziali agenti di biocontrollo

Stato dell'arte:

Gli investimenti tecnologici per aumentare la produttività hanno portato a pratiche agronomiche basate sui fertilizzanti, pesticidi e selezione di varietà ad alta resa. Questo ha causato effetti sulla salute delle piante, sulla qualità dell'ambiente e dei prodotti alimentari influenzando la variabilità genetica degli organismi del sistema agro-forestale che ne controllano l'equilibrio. E' cruciale sviluppare una politica agraria che meglio sostenga la biodiversità.

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Azioni

Attività in corso:

Per utilizzare la biodiversità come risorsa strategica nella protezione delle piante, attualmente si sta realizzando un�azione di monitoraggio della biodiversità degli organismi che agiscono come determinanti positivi e negativi della salute delle piante. Grazie alle competenze presenti nei diversi settori, l'attività considera funghi patogeni, simbionti, antagonisti, nematodi e insetti.


I risultati sarebbero significativamente più rilevanti se fossero a disposizione 3 assegnisti per due anni, fondi per sequenziamento, nuove attrezzature (microscopi confocali di nuova generazione per analisi FISH, sistemi di letture di microarray *sono stati erroneamente attribuiti � 20.000 relativi ad economie inspendibili per la sez.di Torino* *Lo scostamento dalla VS indicazione del 21/11/04 per l'IPP è dovuto a maggiori accertertamenti e obbligazioni per le 4 commesse*


CRA, CFS, MIPAF (ISCI);CEBIOVEM e dip Biologia Vegetale UniTO, UniBARI, UniTuscia, UniTO, UniFI, UniNA "Federico II", UniPAVIA;ICBM (E), ICA (P), ISA (P), CSIC (E), Università di Toledo (E), INRA (F), Neiker (E), BFH (D), OFS (A), FSI (UK), WSL (CH), Ist Valenciano Investig Agr (E), Natural History Museum (UK), Univ Paul Sabatier/CNRS-Castanet-Tolosan (F); IBAF, IGV, Ist Genetica Vegetale-CNR- FI; Az Marani Lofarma, Leti (E), Rey (F), Veneto agricoltura, Umbraflor, Ist Sper tabacco-Scafati.

Finalità

Obiettivi:

Identificazione -attraverso una caratterizzazione morfo-fisiologica- degli organismi che interagiscono con le piante nei sistemi naturali e agricoli: patogeni, vettori, funghi simbionti e saprotrofi. Riconoscimento della biodiversità genetica con tecniche molecolari e tecnologie innovative dell�Environmental Microbiology e dell'Environmental genomics. Analisi della variabilità dell�ospite e degli organismi Studi dei flussi genici attraverso analisi biomolecolari e filogeografiche.


Grazie alla varietà di esperti competenti in diversi settori (piante, nematodi, insetti, funghi patogeni, simbionti, antagonisti), i risultati configurano una originale azione di monitoraggio della biodiversità degli organismi che agiscono come determinanti positivi e negativi della salute delle piante e offrono inesplorate risorse genetiche per il miglioramento di specie di interesse agro-forestale e agro-alimentare.

Potenziale impiego:


Studio e sviluppo di strategie innovative di lotta per la protezione delle piante.

Temi


Collezione, identificazione, sequenziamento e selezione di antagonisti. Sviluppo di modelli rappresentativi delle interazioni ospite- antagonista. Sequenziamento di geni per: epidemiologia molecolare di funghi e batteri utili (Pochonia e Pasteuria spp.), identificazione di fitopatogeni con

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sonde molecolari. Sviluppo di tecnologie a basso impatto ambientale per prodotti di sintesi. Studio di prodotti d'origine naturale ad azione nematocida e silenziamento genico.

Stato dell'arte:

L�uso di pesticidi nella protezione delle piante pone problemi ambientali (inquinamento, residui). La richiesta di alimenti più sani promuove le imprese a basso impatto ambientale. Il mercato richiede nuovi fattori di produzione basati su microrganismi o artropodi utili da usare in lotta biologica. La ricerca riflette la domanda di prodotti e processi per nuovi settori e attività industriali, o piccole e medie imprese collegate a produzione ed uso di antiparassitari biologici.

Azioni

Attività in corso:

Innovazione tecnologica e sviluppo di prodotti e processi per risolvere i problemi fitosanitari di ecosistemi agrari mediterranei. Messa a punto di mezzi di lotta caratterizzati da: costi economici e ambientali contenuti, uso di antagonisti naturali, tecniche di prevenzione attraverso diagnostica molecolare, epidemiologia e modellistica delle interazioni ospite-antagonista; valutazione in campo di prodotti biologici o di sintesi dal basso impatto ambientale.


Punti critici: raccolta e conservazione dei microrganismi. Identificazione con sonde molecolari previa estrazione di DNA da terreno. Specificità di modelli non lineari. Efficacia delle tecnologie di sensoristica e sonde. Fattibilità legata alla selezione di microrganismi/antagonisti adatti agli ambienti mediterranei. Persistenza e longevità di prodotti e formulati. Lo scostamento dall'indicazione del 21/11/04 per l'IPP è dovuto a maggiori accertamenti e obbligazioni per le 4 commesse


ELEP srl, Cornaredo, Milano Dip. di Genetica, Biologia Generale e Molecolare, Università di Napoli Dept. of Crop Sciences, Univ. of Illinois, Urbana, IL,USA Dept. of Nematology, Univ. of California, Riverside, CA,USA INRA, Agadir, MAROCCO Dep. de Ciencias Maritimas y Biologia Aplicada, Univ. Alicante, SPAGNA IRTA, Barcelona, SPAGNA UPC, Barcelona, SPAGNA IACR, Rothamsted, UK Depto de Zoologia, Univ. de Maracay, VENEZUELA

Finalità

Obiettivi:

Sviluppo di prodotti industriali per il settore della lotta biologica. Riduzione d'impatto ambientale nell'uso di prodotti tradizionali di sintesi. Identificazione di nuove molecole d'origine naturale ad azione nematocida. Competenze: biologia molecolare, silenziamento genico, microbiologia, modellistica, statistica, epidemiologia, ecologia e biologia di nematodi e insetti.


I Anno. Sequenze geniche per Pasteuria, Pochonia e altri batteri utili. Dati di campo con prodotti di sintesi e naturali. Modelli e sonde molecolari. Microrganismi in collezione. II Anno. Sequenze geniche per Pasteuria, Pochonia e altri batteri utili. Epidemiologia molecolare e sonde per riconoscimento degli antagonisti in campo. Selezione di antagonisti. III Anno. Sviluppo di formulati fitoiatrici a basso impatto ambientale e prototipi di prodotti e processi in lotta biologica.

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Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005



Sebbene siano stati identificati numerosi microrganismi interessanti, si rendono necessarie ulteriori indagini epidemiologiche, in particolare per l’isolamento di specie del gruppo Monacrosporium ellipsosporum, non ancora rinvenute in Italia, e per gli artropodi utili. Per l’identificazione di batteri e funghi con sonde molecolari previa estrazione del DNA da terreno resta da definire il protocollo necessario per l’amplificazione con PCR in presenza d’inibitori (polifenoli, sostanza organica), per la verifica delle previsioni ottenute dai modelli. L’efficacia delle sonde molecolari richiede un'indagine sulla variabilità delle regioni prescelte per l’identificazione. La fattibilità di alcuni biopesticidi è legata alla selezione di microrganismi/antagonisti adatti agli ambienti mediterranei, e alla persistenza e longevità dei formulati. Sono attese interessanti ricadute applicative dalla scoperta di un batterio G- parassita di nematodi, nuovo per la scienza, e dall’uso di sostanze nematocide di origine naturale (xantine, saponine).

Collaborazioni

Lo sviluppo delle attività ed il contemporaneo orientamento verso ricerche con valenze applicative hanno tratto beneficio dal patrimonio di collaborazioni nazionali ed internazionali realizzate con Istituzioni di ricerca che tradizionalmente svolgono attività congiunte con personale afferente alla Commessa. Inoltre, si sono avviate e sono attualmente in corso nuove collaborazioni tecnologiche di supporto alla produzione industriale (ELEP srl, Cornaredo, Milano; Agrifutur srl, Alfianello, Brescia) e collaborazioni su basi formative e tecniche, come il protocollo d’intesa su ricerca e formazione nel campo della diagnostica fitopatologica stabilito con il SAG (Servicio Agricola y Ganadero) di Santiago del Cile.


Progetto MicoSpa: è stato ottenuto un prolungamento di sei mesi del progetto da parte del'UE. Cio' al fine di completare le prove di campo degli altri partners e procedere all'applicazione dei modelli elaborati presso l'IPP. Le prove di campo in corso con prodotti biologici (ELEP) o tradizionali riflettono problematiche stagionali e termineranno nel corso del 2006. Sono riscontrate difficoltà di programmazione delle attività, per via dei ritardi nel reclutamento di nuovi collaboratori. La scoperta di xanthine ad azione nematocida non era stata realizzata al momento della previsione 2006.


Sono stati raggiunti gli obiettivi attesi, con produzione di sequenze (16S-18S rDNA) per microrganismi (Pasteuria spp. Pochonia, batteri G-) usati in lotta biologica, e di dati di campo relativi a metodi di lotta innovativi basati su antagonisti naturali e uso più razionale di pesticidi. Sono state prodotte inoltre sonde molecolari per la diagnostica di GFLV da Xiphinema index, Meloidoyne spp. e Pochonia chlamydosporia var chlamydosporia. Sono stati messi a punto modelli non lineari per

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l'epidemiologia e modellistica delle interazioni nematodi-antagonisti (progetto Micospa) e solarizzazione. E' in corso la produzione e valutazione in campo di prodotti biologici o di sostanze di origine naturale per conto delle ditte committenti (ELEP, AGRIFUTUR). Sono in collezione nuovi microrganismi utili (Pasteuria, Pochonia e Trichoderma). Sono attesi avanzamenti per quanto concerne l’identificazione di geni per la produzione massale di microrganismi fastidiosi(Pasteuria penetrans o altri batteri G- parassiti di nematodi), o per migliorare le rese di microrganismi già oggetto di fermentazione e produzione industriali. E' in corso il brevetto di una nuova sostanza naturale ad azione nematocida.

Impatto economico e ambientale di fattori di stress su piante ed ecosistemi produttivi.


I punti critici incontrati nella gestione della commessa non sono numerosi, ma diversi e qualificanti: a. la ricerca di autofinanziamento, anche se per questa commessa non è un problema, indirizza l’attività verso linee vincolate o conto terzi con obiettivi talvolta distanti da quelli della commessa; b. è spesso difficile coniugare l’interesse scientifico del personale CNR con le esigenze di enti pubblici, che spesso presentano bandi con scarse risorse; c. anche se il finanziamento con bandi europei ha un tasso di successo oscillante tra il 5 ed il 10% in Europa, la commessa può contare su 3 progetti europei (MedCypre, Manchest, Ozone) che richiedono impegni di personale consistenti e aggiuntivi. Nel 2005 è stato presentato un nuovo progetto Interreg III B ChatEco; d. per l’attività della commessa è necessario disporre di campi sperimentali (circa 70 Ha), personale tecnico specializzato e della collaborazione attiva con aziende vivaistiche e con amministrazioni locali. E’ essenziale una sostituzione con una programmazione anche pluriennale del personale tecnico per il recupero delle vacanze organiche; e. le spese di gestione delle aree di ricerca sono esageratamente onerose.

Collaborazioni

Le collaborazioni indicate in preventivo sono continuate nel 2005 con reciproca soddisfazione: Unione Europea: i progetti Interreg III B MedCypre e Ozone; il progetto Manchest per il VPQ hanno favorito collaborazioni europee e con paesi Meda; Ministeri:Ambiente per ricerche sull’ozono e Mipa per indagini sull’olmo; Regioni Toscana, Umbria, Campania, Sardegna, Sicilia (costituzione di barriere con cloni selezionati di cipresso contro gli incendi e l’erosione del suolo); Province di Siena, Livorno e Grosseto per ricerche sul cipresso nel paesaggio toscano; Università: UniFI, UniTO, UniTuscia, UniNA, UniBA. Con “Genexpress”, Centro di genomica e proteomica dell’UniFI, è stata stipulata una convenzione; Istituti CNR: IVALSA, IGV, IBBA, IVV; Imprese: Lofarma e Anallergo (potere allergenico del polline), Sariaf (produzione su ns brevetto di mastici per ferite), Elep (produzione industriale di ceppi ipovirulenti di C. parasitica e test su vaste superfici in bosco), Umbraflor e Vivaio “Il Terzo” (sfruttamento di ns brevetti di cipresso e di olmo); Istituzioni internazionali: Nagref, CNRs, INRA, ISA, CSIC, UTAD, HUJ, Tubitak, Uni Freising,INRGREF,Cemagref,Alice Holt Res.Sta.,USDA


Non vi sono stati scostamenti significativi tra i risultati attesi e quelli ottenuti. Questa aderenza è forse dovuta all’organizzazione della commessa, che è stata splittata in 2 aree tematiche. 1. “Impatto di fattori biotici ed abiotici sulla produzione qualitativa e quantitativa nel settore forestale e relativa valutazione dei danni” che va a coprire l’obiettivo 1 (incremento delle conoscenze sull’interazione ospite-organismo-ambiente basato su studi di biologia, patologia e genetica) e l’obiettivo 2 (messa a punto di modelli per definire in modo oggettivo il funzionamento della pianta sottoposta a stress). L’attività di questa area ha permesso di ottenere risultati superiori a quelli attesi. 2. “Metodi di controllo basati sulla lotta biologica, integrata e miglioramento genetico per resistenze e tolleranze”,

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che soddisfa pienamente l’obiettivo 3 (selezione di cloni di cipresso resistenti al cancro e di olmo resistenti alla grafiosi) e l’obiettivo 4 (messa a punto di metodi di lotta biologica e loro applicazione commerciale). Questa area tematica opera a stretto contatto con imprese industriali (farmaceutiche, agrochimiche,di agrofarmaci) e Amministrazioni pubbliche.


I risultati attesi sono stati completamente raggiunti nel 2005 nei tempi e nei modi. I principali risultati del 2005 possono essere brevemente così indicati. Obiettivo 1. Valutazione della diversità genetica in popolazioni arboree forestali; nuovi approcci di biologia molecolare (cipresso, quercia) ed in popolazioni di patogeni (Seiridium, Ophiostoma, Chryphonectria) Obiettivo 2. I nostri dati sui livelli remoti di O3 in Italia indicano che i carichi critici standard europei sono sempre superati in tutti i siti monitorati. Tuttavia gli effetti dell’O3 in bosco non sono così negativi come atteso per l’alta concentrazione. Obiettivo 3. Ottimi risultati sono stati ottenuti nel miglioramento genetico del cipresso e dell’olmo per la resistenza a S.cardinale e O.ulmi rispettivamente. Per due selezioni resistenti di olmo verrà richiesto un brevetto europeo. Obiettivo 4. Sono stati prodotti additivi biologici a base di microorganismi utili per applicazioni industriali. Sono state applicate in campo strategie innovative per il contenimento del mal dell’inchiostro e del cancro del castagno in collaborazione con la Regione Sardegna e l’industria Elep.



Problemi tecnici: sono emerse difficoltà nel reperimento di alcuni materiali biologici. Problemi attrezzature: Risultati ottenuti con un nuovo microscopio confocale sono stati accettati in tempi molto stretti su PLANT CELL prestigiosa rivista nel settore del Plant Biology. La pubblicazione prevista nel Dicembre 2005 avrà un Commentary. Per proseguire tali ricerche, nuovi investimenti sono richiesti per sistemi letture di microarray, e per la manutenzione dei microscopi. Problemi economici: lo sviluppo di progetti di sequenziamento è un punto cruciale e di impatto della commessa. Gli studi in questo senso richiedono analisi basate sulla Comparative genomics (si vedano le più recenti review su Nature Microbiology) e richiedono disponibilità finanziarie che dovrebbero essere considerate dalla Dirigenza. Si suggerisce un programma ad hoc, come in altri paesi europei (Genoscope in Francia). I lavori in campo richiedono risorse finanziarie aggiuntive. Problemi di personale: la situazione del personale è critica; è vitale avere posizioni di ricercatore (2 a tempo indeterminato ) 1 di amministrativo a tempo indeterminato e un nuovo tecnico.

Collaborazioni

Si sono rafforzate le collaborazioni nazionali e internazionali con Istituzioni di ricerca con cui i gruppi già collaborano. In questo periodo sono stati attivi scambi con: Universitade Coimbra. Departamento Zoologia, Portugal; Chinese Academy Agricultural Sciences. Plant Protection , Beijing, China Division of Plant Industry Nematology Bureau, Gainesville, Florida, USA Central Laboratory General Ecology. Sofia, Bulgaria Faculty Science, Department Biology and Ecology, Novi Sad, Serbia] Dept Veterinary Science, University Melbourne, Victoria, Australia] CRAS, Centro Regionale Agrario Sperimentale, Cagliari INRA Avignone, Francia Department Entomology, University Arizona, Tucson Department Entomology, Natural History Museum, London Bavarian State Collection of Zoology, Monaco, INRA, Pierroton, Francia; IASMA San Michele allAdige, TN; CEMGRAF Nogent-sur- Vernisson, Francia. Department of Plant-Microorganism Interactions, Heteren, The Netherlands; UMR INRA/UHP "Interactions Arbres/Micro-Organismes", INRA Champenoux, France; Ente Nazionale Risi, Castello D’Agogna (PV) Departamento de Conservacion suelos y agua CSICS Murcia, Spain; UMR 5546 CNRS/Université/INRA CASTANET

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Non si sono verificati scostamenti apprezzabili.


Nel 2005 non si sono registrati scostamenti tra risultati attesi e conseguiti. Si è dimostrata una variabilità intra- inter-popolazionale in nematodi Xiphinema, Longidorus e Pratylenchus, e in profili elettroforetici di isoenzimi di superossido dismutasi, ottenuti con “miniaturized Native page”. Si sono caratterizzati insetti fitofagi (Pnigalio, Encarsia) anche tramite il gene COI di Bemisia tabaci. Si sono selezionati 100 ceppi batterici Gram+ e Gram- di origine rizosferica. Si è sviluppato un set di primer per regioni microsatellitari nucleari in Cupressus e cloropolastici in Quercus suber. Si è effettuata una revisione tassonomica di esemplari di olmo nelle collezioni dell’IPP. L'utilizzo della LSU rDNA come marker filogenetico di Gigaspora (fungo AM) ha portato a nuovi alberi tassonomici. Si è individuata una struttura genetica in popolazioni di Tuber magnatum, che ne permetterà la rintracciabilità e l’origine. cDNA macroarrays e 2000 sequenze EST di T. borchii rivelano un' espressione differenziale di geni codificanti per il metabolismo lipidico e terpenico. Si è dimostrata una nuovo struttura di infezione mai prima descritta nelle AM: Prepenetration Appararatus.

Interazione ospite-organismo-ambiente: biologia, epidemiologia e genomica funzionale.


L'attuazione degli obiettivi della commessa è funzione anche dei finanziamenti disponibili e di quelli richiesti.Si richiede pertanto al CNR una compartecipazione per 385.000 euro per acquisizione di 2 nuove grandi attrezzature (serra a contenimento, microscopio a trasmissione-vedi di seguito) e per manutenzione TEM.Si è ancora in attesa di conoscere l'esito della presentazione di RTL inerenti a questa commessa ed i cui fondi consentirebbero un ulteriore ampliamento dei risultati.Stallo nell'indagine immunocitochimica di alcuni enzimi nelle interazioni pianta-nematodi determinato dall’impossibilità di utilizzo del microscopio elettronico.La mancanza di spazi adeguati per le prove con materiale geneticamente modificato per la quale è stato richiesto un ulteriore contributo a favore di laboratori siti in regioni obietttivo 1.La ormai cronica mancanza di personale tecnico per la preparazione del materiale biologico da utilizzare nei biosaggi che determina un dispendioso impegno da parte dei singoli ricercatori.Si richiedono pertanto bandi per personale tecnico a tempo indeterminato e personale di ricerca a tempo indeterminato e determinato (assegnisti)

Collaborazioni

IACR-Rothamsted-PIE,UK, Univ.Palermo, SENFIMIZO e Idrocons srl(AL): caratterizzazione semiochimici;Natural History Museum,Dep.Entomology,London:ecologia parassitoidi;Univ.of Arizona,Dep.Entomology,Tucson e Univ.California, Riverside,Dep.Entomology:simbionti parassitoidi;Univ.Basilicata,BIDIBAF:veleno parassitoidi;Arterra Bioscience-Napoli:omologhi di GPCR;INRA,UMR 1064,Francia:Sequencing M.incognita,stress ossidativi;INRA:caratterizzazione virus e nematodi;Dip.Medio-Ambiente,UCLM,Univ.Toledo,Spagna,Univ.Coimbra Portogallo e Scottish Crop Research Inst.,Dundee,Scozia,Univ.Cile:interazioni nematodi;Univ.Bari,Dip.Chimica:biopolimeri;Dip.Protezione Piante:interazioni virus;Univ.Napoli,ARBOPAVE:biocontrollo patogeni;;Dip.Medicina Clinica e Sperimentale:allergie;DISSPA,DEZA e CNR-IGV:resistenza a fitofagi;ICARDA Siriae e MIPAF,ISCI:resistenza vegetale; Univ.Parma,Dip.Biochimica Biol.Molecolare:simbiosi T. borchii;Pennsylvania State Univ.,(USA)Dep.of Biology:espansine;Univ.Verona,Dip.Scientifico e Tecnologico:espressione geni parete cellulare vegetale;CRAS-Sardegna:resistenza a

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virus;Univ.Piemonte Orientale,DISTA e Univ.Torino,CEBIOVEM:simbiosi micorrizica;ENEA,Trisaia:impatto transgeni


Non si sono verificati scostamenti apprezzabili ma si sottolinea la carenza di personale tecnico e la necessità di grandi attrezzature (vedi scheda punti critici).


Nel 2005 non si sono registrati scostamenti tra risultati attesi e conseguiti.Nelle interazioni con nematodi si è dimostrato il ruolo e dell’ espressione temporale di molecole segnale (ROS-ossido nitrico) e di enzima NOS-like in interazione incompatibile,sono state individuate bande peculiari di genotipo resistente di pisello e le razze italiane di nematodi patogeni;nelle simbiosi micorriziche c'è stata la prima individuazione di espansine sulla parete cellulare della pianta e la sovra-espressione di fosfolipasi A2(TbSP1);sono state prodotte le prime mappe proteiche relative a pomodoro-Trichoderma harzianum;si è evidenziato il ruolo del veleno di Pnigalio soemius ed quello di batteri Cardinium simbionti di Encarsia;è stato prodotto un anticorpo policlonale specifico per virus della screziatura di Parietaria e verificata la resistenza ai ceppi italiani di TYLCV e TYLCSV in pomodoro;sono state individute fonti di resistenza a virus in pomodoro selvatico e si è accertato l'effetto del gene systemin su Pseudomonas syringae pv.tomato e Ralstonia solanacearum;sono stati individuati 5 composti attrattivi per Aphidius ervi.

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Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Sede principale svolgimento: Sezione di Bari Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: AURELIO CIANCIO Elenco dei partecipanti liv. Agostinelli Augusta IV Basile Angela Carmela V Basile Martino II Bernardo Umberto III Brandonisio Antonio IV Carella Antonio IV Ciancio Aurelio II Cristadoro Salvatore VI

liv.D'Addabbo Trifone III De Cosmis Pasquale VIIIDe Luca Francesca III Elia Francesco IV Greco Nicola I Leonetti Paola III Lerario Roberto VIIILivorti Donato IV

liv.Molinari Sergio II Radicci Vincenzo V Raio Aida III Ranieri Walter V Roca Francesco Italo II Ruocco Michelina III Sasanelli Nicola III Vovlas Nicola I

Temi

Tematiche di ricerca Lotta biologica e a basso impatto ambientale attraverso la raccolta, identificazione, sequenziamento e selezione di antagonisti naturali di nematodi, funghi e insetti. Sviluppo di modelli rappresentativi delle interazioni ospite-antagonista. Sequenziamento di geni per: epidemiologia molecolare di funghi e batteri utili (Pochonia e Pasteuria spp.) o per l'identificazione di fitopatogeni con sonde molecolari. Sviluppo di tecnologie a basso impatto ambientale per l'applicazione di prodotti tradizionali di sintesi. Studio di prodotti e molecole d'origine naturale ad azione nematocida. Monitoraggio e analisi fitopatologiche per vite e pomodoro.

Stato dell'arte L'uso di pesticidi nella protezione delle piante pone problemi ambientali (inquinamento, residui) di grande portata, sia per le implicazioni di tipo ambientale generale, che per i fattori legati alla salute dei consumatori e degli operatori agricoli. La richiesta di alimenti più sani promuove pertanto le produzioni e imprese agrarie a basso impatto ambientale ed in generale il settore dei prodotti biologici, che in Italia riguarda un'estensione dell'ordine di un milione di ettari. Il mercato richiede nuovi fattori di produzione basati su microrganismi o artropodi utili da usare in lotta biologica. La ricerca riflette quindi la domanda di prodotti e processi per nuovi settori produttivi e attività industriali, da parte di piccole e medie imprese collegate alla produzione o uso di antiparassitari biologici, suscettibili d'impiego anche in agricoltura tradizionale.

Azioni

Attività da svolgere Innovazione tecnologica e sviluppo di prodotti e processi per i problemi fitosanitari di ecosistemi agrari mediterranei, in particolare su colture intensive come vite e pomodoro. Messa a punto di mezzi di lotta contro nematodi, funghi e insetti, caratterizzati da: costi economici e ambientali contenuti,

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uso di antagonisti naturali e piante resistenti, tecniche di prevenzione attraverso diagnostica molecolare, epidemiologia e modellistica delle interazioni ospite-antagonista. Valutazione in campo e in condizioni controllate di prodotti biologici e/o di sintesi a basso impatto ambientale.

Punti critici e azioni da svolgere Punti critici: raccolta e conservazione dei microrganismi; applicazione dei protocolli d'estrazione diretta del DNA a diverse tipologie di terreno. Specificità dei modelli previsionali e descrittivi non lineari. Efficacia delle tecnologie d'applicazione delle sonde e longevità delle stesse. Reclutamento di personale a diverso grado di specialzzazione. Azioni: valutazione della fattibilità legata alla selezione di microrganismi/antagonisti adatti agli ambienti mediterranei e dei fattori responsabili della persistenza e longevità di prodotti e formulati. Verifica di specificità di primer per amplificazione e riconoscimento dei microrganismi bersaglio con le sonde e funzionalità delle stesse. Formazione di personale a contratto e borsisti.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze: biologia molecolare, microbiologia, micologia, modellistica, statistica, epidemiologia, fitoiatria, ecologia, nematologia, entomologia, tassonomia, agronomia. Tecnologie: modellistica, microarrays, polymerase chain reaction, atomic force microscopy, scanning e transmission electron microscopy, cromatografia HPLC. Tecniche d'indagine: analisi del DNA, amplificazione con PCR, clonaggio e sequenziamento di geni di funghi, nematodi e batteri; prove di lotta in condizioni agronomiche controllate; microscopia ottica ed elettronica; metodologie di simulazione previsionale e modellistica delle relazioni ospite-antagonista basate su modelli non lineari; analisi delle interazioni e dei fattori di virulenza nell'interazione ospite-parassita. Riconoscimento e diagnostica in real-time attraverso sonde molecolari (molecular beacons, Scorpions).

Collaborazioni (partner e committenti) Committenti: ELEP srl, Cornaredo, MI AGRIFUTUR srl, Alfianello, BS DOW DUPONT BASF CERTIS Partners: Dip. di Genetica, Biologia Generale e Molecolare, Università di Napoli; Dept. of Crop Sciences, Univ. of Illinois, Urbana, IL,USA Dep. de Ciencias Maritimas y Biologia Aplicada, Univ. Alicante, SPAGNA IRTA, Barcelona, SPAGNA; UPC, Barcelona, SPAGNA; IACR, Rothamsted, UK Depto de Zoologia, Univ. de Maracay, VENEZUELA

Finalità

Obiettivi Sviluppo di prodotti e processi industriali per il settore della lotta biologica basati su microrganismi (funghi e batteri selezionati ma non modificati geneticamente) o su insetti utili. Identificazione dei fattori chiave legati all'efficacia dei biopesticidi e delle loro formulazioni. Riduzione d'impatto ambientale nell'uso di prodotti tradizionali di sintesi. Identificazione di nuove molecole d'origine naturale ad azione nematocida e antiparassitaria.

Risultati attesi nell'anno Sequenze geniche per Pasteuria e altri batteri utili, ottenute attraverso l'uso di microarrays, per l'identificazone dei geni attivi nelle fasi di parassitismo e la loro potenziale applicazione per lo sviluppo di substrati di crescita. Dati di campo con prodotti di sintesi e naturali nella lotta contro nematodi galligeni e insetti. Modelli e sonde molecolari per applicazioni previsionali sui meccanismi di regolazione dei patogeni in natura. Disponibilità di microrganismi utili in collezione. Sequenze geniche per Pochonia e altri funghi utili. Dati da test epidemiologici ottenuti con metodi molecolari e disegno di sonde per il riconoscimento degli antagonisti in campo. Selezione di antagonisti. Sviluppo di formulati fitoiatrici a basso impatto ambientale e prototipi di prodotti e processi in lotta biologica.

198


Potenziale impiego - per processi produttivi Prodotti e processi per la protezione integrata o biologica delle coltivazioni, da funghi, insetti o nematodi fitoparassiti. Sviluppo di nuovi protocolli di applicazione per nematocidi e altri prodotti di sintesi. Sfruttamento di microrganismi utili (funghi e batteri) per la protezione delle piante in agricoltura biologica. Applicazione per lo sviluppo di formulati in settori industriali collegati. Caratterizzazione genica d'isolati e collezioni di microrganismi suscettibilii di trasferimento industriale. Sviluppo di biopesticidi e metodologie industriali per il settore "biologico" o tradizionale. Sviluppo di know-how per la produzione di formulati e mezzi di coltura per microrganismi e antagonisti da usarsi in lotta biologica.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Disponibilità di biopesticidi e di processi innovativi di protezione delle piante in agricoltura biologica; identificazione di microrganismi attraverso sonde molecolari per la certificazione di piante esenti da malattie o per l'identificazione di microrganismi utili, dopo la loro introduzione nell'ambiente agrario. Utilizzazione di prodotti di origine naturale in processi produttivi agrari esenti dall'uso di prodotti di sintesi. Riduzione d'impatto ambientale per le procedure di protezione delle colture. Riduzione dell'immissione di gas serra nell'atmosfera. Applicazione di sonde molecolari specifiche per la diagnostica microbiologica e ambientale.

Moduli

Modulo: Studio e sviluppo di strategie innovative di lotta per la protezione delle piante. Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Luogo di svolgimento attività: Sezione di Bari


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9834 402 29 92 1357 83 514 118 N.D. 1558








0 0 1 0 0 0 0 1 0 2



199


Impatto economico e ambientale di fattori di stress su piante ed ecosistemi produttivi.

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: TULLIO TURCHETTI Elenco dei partecipanti liv. Danti Roberto III Della Valle Irene IV Di Lonardo Vincenzo IV Falco Clementina VII Ferrini Fabio IV Fineschi Silvia II

liv.Intini Marcello II Lo Bue Giovanni III Panconesi Alberto II Paoletti Elena III Pesciolini Francesca VII

liv. Raddi Paolo DIRE Romagnoli Anna V Santini Alberto III Torraca Giovanni VI Turchetti Tullio II

Temi

Tematiche di ricerca L’attività di ricerca dipende sempre dall’approvazione di nuovi progetti. In particolare: ª Studi di biologia ed ecologia dei componenti dei patosistemi, valutazione di effetti di fattori abiotici di stress (specialmente ozono, aridità e basse temperature) sulla funzionalità delle piante; protezione di piante agroforestali; effetti di prodotti pesticidi sulla qualità del prodotto; controllo biologico dei parassiti; modelli per definire le piante ammalate/stressate con tecniche molecolari; variazione della patogenicità dei parassiti in relazione alle condizioni ambientali ed alla variabilità dell'ospite; recupero ambientale e paesaggistico con materiale geneticamente selezionato. ª promuovere decisioni gestionali da parte di Enti Pubblici e di Associazioni produttive; cercare di stabilire interazioni permanenti tra istituzioni di ricerca, industrie e utilizzatori per diffondere nuove strategie di controllo; favorire la mobilità di ricercatori e tecnici utilizzando al massimo le attrezzature e il personale di istituzioni nazionali di ricerca, pubbliche e private per ottenere una soluzione economica ed ecologica di gravi problemi fitosanitari.

Stato dell'arte Nei paesi EU già operano istituzioni leader in diversi settori della protezione delle piante con ricerche di base nell'ecologia, biologia dell'ospite e del parassita, interazione ospite-organismo-ambiente, genetica del parassita. In Europa gli indirizzi di ricerca nel settore hanno come obiettivo principale di ridurre l'impiego di prodotti chimici per la protezione delle piante (lotta biologica, lotta integrata, miglioramento genetico dell'ospite per resistenze, tecniche colturali idonee, ecc.).In Italia non operano istituzioni di ricerca che considerino nella loro complessità gli effetti di agenti biotici ed abiotici sulla vegetazione e dei relativi metodi di controllo sulla produzione soprattutto di piante forestali, sulla funzionalità di ecosistemi, sull'economia rurale e sulla qualità dell'ambiente. Si intende mettere a punto strategie di controllo a salvaguardia delle colture utilizzando tecnologie innovative in modo da assicurare che i risultati ottenuti siano anche trasferiti in pratica, operando in stretta collaborazione con Istituti europei di Plant Protection e partecipando alla presentazione di NoE europei come Endure e Emerisks.

200


Azioni

Attività da svolgere Obiettivo principale: “Turning science into practice”. Costituzione di materiale genetico tollerante alle condizioni ambientali e resistente a parassiti; identificazione e caratterizzazione di patogeni e di insetti presenti attualmente o di futura introduzione; individuazione di meccanismi di resistenza nell'ospite e di patogenicità nel parassita; caratterizzazione di isolati del patogeno con marcatori genetici e degli ibridi con paternity test; messa a punto di "integrating cropping systems" (controllo biologico, pratiche agronomiche e miglioramento genetico). Ricerche su "bio-interactions and plant health" e su diagnosi precoce molecolare per produrre piante "sane" e per evitare l'introduzione di parassiti in aree incontaminate. Studi sull'individuazione di cipressi che producono polline con ridotto impatto allergenico in collaborazione con industrie farmaceutiche; sull'impiego di ceppi ipovirulenti di Cryphonectria parasitica sul cancro del castagno e di metodi agronomici contro il mal dell'inchiostro; sugli effetti di fattori abiotici (O3, aridità, freddo) sulla funzionalità della pianta; sul recupero di monumenti storici "verdi".

Punti critici e azioni da svolgere Lo svolgimento dell’attività della Commessa è sempre in relazione ai finanziamenti ordinari e a quelli ottenuti da fonti esterne al CNR. Nel 2005 il finanziamento ordinario ha avuto un incremento considerevole ed è servito soprattutto per l’acquisto di attrezzature da laboratorio e per l’assunzione di 2 assegnisti. Questa Commessa necessita di operare in campi sperimentali e quindi con investimenti finanziari e di personale tecnico considerevoli. Per questo motivo e per le vacanze di personale tecnico verificatesi nel 2005 è opportuno provvedere all’assunzione di personale tecnico specializzato (almeno 2 unità) e di 1 ricercatore. Inoltre per completare i laboratori di patologia e di genetica occorrono almeno 115.000,00 Euro. Per provvedere alla gestione amministrativa dell’IPP, essendo a Firenze la sede amministrativa, e dei numerosi progetti europei e nazionali sarebbe opportuno contare su 2 amministrativi a tempo indeterminato. Altro punto di crisi è la spesa per la gestione dell’Area di ricerca, che è “esagerata”.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine La commessa usufruisce di tutte le competenze e conoscenze disponibili nell'IPP, in questa prima fase, e poi, nell'ambito di 1-2 anni su progetti CNR e su quelli esterni al CNR intende chiedere la collaborazione attiva ad istituzioni universitarie italiane, al CRA e a quelle pubbliche e private nel settore. Il desiderio finale relativo alle competenze-collaborazioni resta quello di poter costituire un network europeo, che guardi con interesse anche verso paesi INCO e MEDA, in modo da poter raggiungere una leadership almeno nel settore della protezione delle piante arboree forestali indicando strategie economicamente accettabili e sostenibili. Le tecnologie impiegate nelle indagini sulla funzionalità delle piante e nel miglioramento genetico per resistenze e tolleranze sono in genere innovative ed ecocompatibili ed utilizzano conoscenze patologia, genetica, botanica e statistica. Nel miglioramento genetico per resistenze vengono seguite anche tecniche tradizionali di selezione. Nella lotta biologica vengono impiegate le più avanzate biotecnologie.

Collaborazioni (partner e committenti) UNIONE EUROPEA: Cypmed, Manchest,Ozone. MINISTERI: Ambiente, Politiche Agrarie e Forestali. PROVINCE: Livorno, Siena, Grosseto Trento. INDUSTRIE: Lofarma, Anallergo, Sariaf, Elep, Umbraflor, Vivaio il Terzo. UNIVERSITA': UniFI, UniTO, UniTUSCIA, UniNA. ISTITUTI CNR: IVALSA, IGV, IBBA, IBAF, IVV. ISTITUZIONI INTERNAZIONALI: Nagref, CNRs,Inra, Isa,Csic, Utad, Aro, Tubitak, Uni Freising, Wsl, Inrgref, Cemagref, Alice Holt Res. Sta., Usda, Forest Institute Zvolen.

201


Finalità

Obiettivi Studi su: biologia ed ecologia dei componenti dei patosistemi; valutazione degli effetti di fattori abiotici di stress sulla fisiologia di piante agroforestali;effetti di pesticidi;controllo biologico dei parassiti;messa a punto di tecniche molecolari per definire le piante sintomatiche;variazione della patogenicita dei parassiti in relazione alle condizioni ambientali ed alla variabilità dell'ospite;recupero ambientale e paesaggistico con materiale geneticamente superiore.

Risultati attesi nell'anno La Commessa opera con piante arboree, che richiedono tempi più lunghi rispetto alle specie annuali. I principali risultati attesi possono essere così indicati: -incremento delle conoscenze sui patosistemi: cipresso-cancro; olmo- grafiosi; castagno-cancro e mal dell’inchiostro; piante forestali e fattori abiotici (in questo settore la Commessa ha valenza europea); -messa a punto di modelli per definire in modo oggettivo il funzionamento delle piante sottoposte a stress abiotici. Per l’ozono, la Commessa rappresenta l’Italia in sede UNECE allo scopo di ottenere la diversificazione dei livelli critici d’ozono per le foreste italiane rispetto a quelli europei per evitare sanzioni; -selezioni di cloni resistenti di cipresso al cancro e di olmo alla grafiosi. Nel 2006 si intende brevettare 2 cloni di olmo resistenti alla grafiosi e 2 di cipresso; -applicazione su vaste aree della lotta biologica, integrata da tecniche agronomiche, per valutarne la fattibilità economica ed ecologica; -scelta di cloni resistenti alla malattia per impianti di cipresso protettivi del suolo, frangivento e barriere contro la desertificazione e gli incendi (Progetti EU: CypMed e MedCypre)

Potenziale impiego - per processi produttivi Per processi produttivi : industrie per la produzione di agrofarmaci; modelli di gestione sostenibile; utilizzo dell'ipovirulenza nella lotta biologica del cancro del castagno; industrie vivaistiche per la selezione e la produzione di cloni reistenti alle malattie, su brevetto CNR.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Per risposte a bisogni individuali e collettivi: valutazione economica del danno da fattori biotici ed abiotici per associazioni di produttori; promozione delle decisioni gestionali da parte di enti pubblici; interventi efficaci e garanti della qualità dell'ambiente e della salute della popolazione; protezione delle coltura con fasce arboree contro incendi e desertificazione.

Moduli

Modulo: Impatto economico e ambientale di fattori di stress su piante ed ecosistemi produttivi.

Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9531 395 191 0 1117 407 993 78 N.D. 1602








Altro Totale

3 0 1 2 0 0 0 0 2 8




Dati generali Progetto: Risorse biologiche e tutela dell'agroecosistema Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Sede principale svolgimento: Sezione di Torino Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: PAOLA BONFANTE Elenco dei partecipanti liv. Allione Lucia VII Balestrini Raffaella Maria III Bernardo Umberto III Bianciotto Valeria III Brandonisio Antonio IV Cantisani Anna Maria IV Cristadoro Salvatore VI Danti Roberto III De Luca Francesca III Della Valle Irene IV Di Lonardo Vincenzo IV Faccio Antonella V

liv.Fagnani Alberto V Ferrini Fabio IV Fineschi Silvia II Giorgini Massimo III Greco Nicola I Intini Marcello II Leonetti Paola III Mello Antonietta III Molinari Sergio II Monti Maurilia Maria III Nappo Anna Giulia V Panconesi Alberto II

liv.Paoletti Elena III Parrella Giuseppe III Pedata Paolo Alfonso III Raio Aida III Romagnoli Anna V Santini Alberto III Torraca Giovanni VI Troccoli Alberto III Turchetti Tullio II Veronico Pasqua III Vovlas Nicola I

203


Temi

Tematiche di ricerca Analisi della diversità genetica di funghi parassiti in cipresso,olmo e castagno e della diversità genetica e funzionale di funghi simbionti arbuscolari e endobatteri,di Tuber e di endofiti radicali in ecosistemi naturali ed agrari;flusso genico nelle querce.Identificazione di agenti di controllo biologico di insetti dannosi e di nematodi, sistematica di parassitoidi di fitofagi di interesse agrario.Caratterizzazione di antagonisti batterici e fungini come potenziali agenti di biocontrollo

Stato dell'arte Gli investimenti tecnologici per aumentare la produttività hanno portato a pratiche agronomiche basate sui fertilizzanti, pesticidi e selezione di varietà ad alta resa. Questo ha causato effetti sulla salute delle piante, sulla qualità dell'ambiente e dei prodotti alimentari influenzando la variabilità genetica degli organismi del sistema agro-forestale che ne controllano l'equilibrio. E' cruciale sviluppare una politica agraria che meglio sostenga la biodiversità.

Azioni

Attività da svolgere Principali attività previste: -Identificazione della variabilità morfologica-genetica di nematodi degli ordini Tylenchida e Longidorida. Analisi evolutive-filogenetiche di criconematidi e pratylenchidi. Studio della virulenza in Globodera in base alla reazione d’ospite e ai profili elettroforetici di isoenzimi. -Acquisizione dati molecolari, morfologici, cariologici ed embriologici in Encarsia, Pnigalio (Imenotteri Calcidoidei) e Bemisia tabaci. -Individuazione del modo di azione di batteri di biocontrollo e valutazione di miscele di antagonisti verso fitopatogeni. -Sequenziamento del genoma di isolati di TYLCSV e TYLCV; studio di 1 potyxvirus. -Caratterizzazione della biodiversità di funghi AM e di endobatteri in siti perturbati e inquinati; biodiversità fungina e batterica in tartufaie naturali della variabilità genetica-funzionale di Tuber. Sviluppo di progetti di sequenziamento in simbionti e in Glomeribacter. -Caratterizzazione e diversità genetica in specie arboree e nei loro principali patogeni con marcatori genetici; rilevazione di caratteri morfologici-anatomici; nuove strategie di adattamento della vegetazione ai cambiamenti ambientali.

Punti critici e azioni da svolgere Problemi tecnici: emergono difficoltà nel reperimento di materiale biologico; nella messa a punto di protocolli per la valutazione delle capacità di biocontrollo di antagonisti batterici; nell' applicazione della tecnica Suppressive subtractive Hybridization sul genoma di Tuber. Problemi attrezzature: grazie alla dotazione ordinaria e ai cofinanziamenti la commessa ha acquisito cospicue attrezzature (confocale, dissettore laser) ma nuovi investimenti sono richiesti per sistemi letture di microarray. Problemi economici: lo sviluppo dei progetti di sequenziamento è un punto cruciale e di impatto della commessa. Gli studi in questo senso richiedono analisi basate sulla Comparative genomics (si vedano le più recenti review su Nature Microbiology): con disponibilità finanziarie che dovrebbero essere attentamente considerate dalla Dirigenza. Si suggerisce un programma ad hoc, come in tutti gli altri paesi europei. I lavori in campo richiedono risorse finanziarie aggiuntive. Problemi di personale: la situazione del personale è critica; è vitale avere ricercatori (1 a tempo indeterminato e 1 per 5 anni) e 1 di amministrativo a tempo indeterminato.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Grazie alla varietà di competenze attualmente disponibili nell’IPP in diversi settori (piante, nematodi, insetti, funghi patogeni, simbionti, antagonisti, virus), la commessa si propone di identificare e caratterizzare gli organismi che interagiscono con le piante nei sistemi naturali e agricoli (patogeni, vettori, organismi nocivi, funghi simbionti e saprotrofi). Il riconoscimento della biodiversità genetica viene effettuato con tecniche molecolari e con lo sviluppo di tecnologie

204


innovative nel contesto dell’Environmental Microbiology e dell’Environmental Genomics. L’analisi della variabilità dell’ospite e degli organismi viene approfondita grazie a studi dei flussi genici attraverso analisi biomolecolari e filogeografiche. Parallelamente, azioni di conservazione del germoplasma sono realizzate attraverso collezioni di organismi e di ospiti. Gli studi sono complementati da analisi di diversità funzionale che richiedono competenze di GENOMICA e genomica funzionale.

Collaborazioni (partner e committenti) CRA, CFS, MIPAF (ISCI);CEBIOVEM e dip Biologia Vegetale UniTO, UniBARI, UniTuscia, UniTO, UniFI, UniNA "Federico II", UniPAVIA;ICBM (E), ICA (P), ISA (P), CSIC (E), Università di Toledo (E), INRA (F), Neiker (E), BFH (D), OFS (A), FSI (UK), WSL (CH), Ist Valenciano Investig Agr (E), Natural History Museum (UK), Univ Paul Sabatier/CNRS-Castanet-Tolosan (F); IBAF, IGV, Ist Genetica Vegetale-CNR- FI; Az Marani Lofarma, Leti (E), Rey (F), Veneto agricoltura, Umbraflor, Ist Sper tabacco-Scafati.

Finalità

Obiettivi Identificazione -attraverso una caratterizzazione morfo-fisiologica- degli organismi che interagiscono con le piante nei sistemi naturali e agricoli: patogeni, vettori, funghi simbionti e saprotrofi. Riconoscimento della biodiversità genetica con tecniche molecolari e tecnologie innovative dell'Environmental Microbiology e dell'Environmental genomics. Analisi della variabilità dell'ospite e degli organismi Studi dei flussi genici attraverso analisi biomolecolari e filogeografiche.

Risultati attesi nell'anno -Filogenesi degli insetti studiati (Encarsia, Pnigalio e B.tabaci) e degli isolati dei virus TYLCSV e TYLCV. Caratterizzazione di specie criptiche e biotipi. Sviluppo di un sistema di diagnosi molecolare per la loro identificazione e per quella degli isolati del virus AMV sottogruppo I e II. Caratterizzazione biochimica e molecolare di batteri antagonisti. -Definizione della virulenza in popolazioni di Globodera spp. Messa a punto di un metodo per la determinazione dei patotipi di Globodera spp. in base ai profili elettroforetici degli isoenzimi. -Identificazione molecolare (SSU rDNA, RFLP,analisi filogenetiche) dei funghi AM in risaie coltivate in modo convenzionale e biologico, e nei siti dell’ACNA. Identificazione di batteri endosimbionti in funghi AM e analisi della loro coevoluzione. Identificazione DGGE di comunità microbiche da tartufaia. -Definizione di marcatori genetici per la discriminazione inter-intra specifica in cipresso e olmo. Analisi delle presenza in Toscana di U. glabra e sua caratterizzazione. Relazioni filogenetiche tra cipressi di Fontegreca, di piantagioni italiane e di aree naturali. Pubblicazioni, banche dati, siti web.

Potenziale impiego - per processi produttivi Si prevede che i risultati siano di impiego nei seguenti processi: Costituzione di una rete “International Network for Barcoding Invasive and Pest Species” per individuare la più piccola sequenza del DNA ribosomiale o mitocondriale di nematodi fitoparassiti che permetta l’identificazione di specie in maniera inequivocabile. Identificazione di specie di Imenotteri parassitoidi potenzialmente utili in programmi di controllo biologico. Caratterizzazione di specie e ceppi di fitovirus per studi epidemiologici e per la selezione di fonti di resistenza da utilizzare nel miglioramento genetico. Individuazione di agenti di biocontrollo potenzialmente efficaci nei confronti di agenti fitopatogeni batterici e fungini. Identificazione di marcatori molecolari per individuare le associazioni tra il polimorfismo dell'ospite e la resistenza al patogeno, e quindi per fornire appropriato materiale da propagazione. Scoperta di marcatori molecolari in grado di rintracciare l’origine del tartufo oltre che di geni responsabili dei suoi composti volatili Costituzione

205


di una rete ( EU TRACEAM) destinata a rintracciare i funghi micorrizici con lo svilupppo di un barcode.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Gli impieghi sopra elencati sono in parte legati allo sviluppo delle ricerche in atto, in parte già in fase di applicazione. Essi rispondono ai bisogni attuali della società:. tali bisogni sono legati strettamente alle richieste dei consumatori di prodotti agro-alimentari sicuri, con un'origine controllata (rintracciabilità) e con le volute caratteristiche organolettiche. Nello stesso tempo tali prodotti devono essere ottenuti grazie a sistemi produttivi che facciano il minor uso possibile di fertilizzanti e pesticidi e che garantiscano quindi un prodotto più protettivo della salute umana.

Moduli

Modulo: Biodiversità di ospiti, patogeni, vettori, organismi nocivi e funghi simbionti della rizosfera.

Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Luogo di svolgimento attività: Sezione di Torino


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9738 206 36 0 980 83 325 108 N.D. 1171








Altro Totale

10 6 4 6 0 1 0 5 5 37



206


Interazione ospite-organismo-ambiente: biologia, epidemiologia e genomica funzionale.

Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Sede principale svolgimento: Sezione di Portici Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: EMILIO GUERRIERI Elenco dei partecipanti liv. Allione Lucia VII Balestrini Raffaella Maria III Bernardo Umberto III Bleve Teresa II Cantisani Anna Maria IV Catalano Fabio VI Cristadoro Salvatore VI Di Vito Mauro I

liv.Faccio Antonella V Giorgini Massimo III Guerrieri Emilio III Leonetti Paola III Lerario Roberto VIIIMagaldi Ettore VI Melillo Maria Teresa III

liv.Monti Maurilia Maria III Nappo Anna Giulia V Parrella Giuseppe III Pedata Paolo Alfonso III Raio Aida III Ruocco Michelina III Veronico Pasqua III

Temi

Tematiche di ricerca Lo studio delle complesse interazioni tra pianta, organismi dannosi ed organismi utili, è una preziosa fonte di informazioni da utilizzare a vantaggio delle produzioni agricole. L'esaltazione dei fenomeni di resistenza diretta ed indiretta agli organismi di danno, insieme con il miglioramento sia della "salute generale" della pianta che delle prestazioni degli antagonisti degli agenti di danno, sono infatti i pilastri fondamentali per ottenere produzioni agricole eco-sostenibili. Alla base del modulo di questa commessa vi è la caratterizzazione biologica, genetica, chimica e molecolare dei fenomeni di simbiosi mutualistica,parassitismo ed antagonismo in piante di importanza agraria (principalmente Solanacee e Leguminose) e piante forestali attraverso un approccio multidisciplinare. Tra gli obiettivi specifici della commessa vi è quello di esaltare il controllo degli organismi dannosi attraverso l'esaltazione della resistenza del vegetale e dell'attività degli antagonisti naturali insieme con la caratterizzazione degli eventi di simbiosi favorevoli alla pianta ed alle produzioni di elevato valore commerciale

Stato dell'arte Nel campo delle complesse interazioni tra le piante e gli organismi che le circondano sono stati compiuti notevoli passi. Alcuni sono stati possibili grazie alle moderne tecniche che hanno consentito in non pochi casi la individuazione dei geni che determinano specifiche reazioni della pianta verso organismi simbionti sia mutualistici che parassiti. Tuttavia ancora molto resta da studiare soprattutto nel campo della resistenza dei vegetali agli agenti di danno. La ricombinazione genica, ad esempio, fornisce un potentissimo strumento per individuare e caratterizzare i geni coinvolti nelle risposte delle piante agli organismi esterni. E ciò vale non solo per quelle interazioni "semplici", ossia pianta-organismo, ma anche per quelle più complesse nelle quali sono coinvolti diversi livelli trofici. Ad esempio, è stato recentemente dimostrato come una simbiosi micorrizica, oltr ai ben noti benefici nutrizionali, sia in grado di indurre resistenza verso gli afidi sia diretta che indiretta,ossia attraverso l'attrazione dei nemici naturali degli afidi.

207


Azioni

Attività da svolgere Attività di laboratorio e di pieno campo sarà svolta per continuare i progetti su fondi ordinari e quelli su fondi vincolati. Le attività riguarderanno: i meccanismi costitutivi ed inducibili della resistenza diretta ed indiretta vegetale agli agenti di danno in solanacee e leguminose, con ulteriore screening di fonti di resistenza da trasferire in piante e varietà coltivate e verifica dei geni costitutivi ed indotti responsabili di risposte culminanti nel controllo degli agenti di danno; caratterizzazione della simbiosi micorrizica in piante di interesse agrario e piante modello con ulteriore approfondimento dei geni coinvolti in queste interazioni;caratterizzazione di cDNA in Tuber borchii;biosaggi per valutare l'effetto di batteri simbionti sulle prestazioni e sui parametri biologici di imenotteri parassitoidi;biosaggi di laboratorio e di semicampo per verificare l'effetto di transgeni su organismi non bersaglio e trasferimento orizzontale dei transgeni attraverso il polline ed i microorganismi del suolo.

Punti critici e azioni da svolgere Il livello di attuazione degli obiettivi della commessa è funzione anche dei finanziamenti ordinari ed esterni. Si richiede al CNR una compartecipazione per 385.000 euro per acquisizione di 2 nuove grandi attrezzature (serra a contenimento, microscopio a trasmissione-vedi di seguito) e per manutenzione TEM. Si è ancora in attesa di conoscere l'esito della presentazione di progetti inerenti a questa commessa ed i cui fondi consentirebbero un ulteriore ampliamento dei risultati. Stallo nell'indagine immunocitochimica di alcuni enzimi nelle interazioni pianta-nematodi determinato dall’impossibilità di utilizzo del microscopio elettronico. La mancanza di spazi adeguati per le prove con materiale geneticamente modificato per la quale è stato richiesto un ulteriore contributo a favore di laboratori siti in regioni obietttivo 1. La ormai cronica mancanza di personale tecnico per la preparazione del materiale biologico da utilizzare nei biosaggi che determina un dispendioso impegno da parte dei singoli ricercatori.Si richiedono pertanto bandi per personale tecnico a tempo indeterminato e personale di ricerca a tempo indeterminato e determinato.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine La commessa si avvale di competenze che spaziano dall'entomologia alla botanica alla patologia alla genetica alla chimica ecologica con stretta interazione ed integrazione fra ricercatori altamente specilizzati ciascuno nel proprio campo di indagine.Accanto alle tecniche tradizionali, il modulo applica le più moderne tecniche di indagine (molecolare, proteomica, trasformazione genetica) per caratterizzare le interazioni nella zona ipogea, nella zona epigea e quelle interazioni che spaziano tra livelli trofici appartenenti a zone differenti (es. le interazioni micorrize-pianta-afidi-parassitoidi di afidi).

Collaborazioni (partner e committenti) Centro de Ciencias Medioambientales,CSIC,Madrid,Spagna;IACR- Rothamsted:Plant Insect Ecology Division,Harpenden-UK; ICARDA,Siria;INRA:UMR,Sophia Antipolis,Laboratoire de Biologie Forestiere Francia;Pennsylvania State University:Dep.of Biology University Park (USA);the Natural History Museum,Dep.of Entomology,London-UK;the Sainsbury Laboratory,John Innes Centre,Norwich-UK;UCLM:Dep.de Medio Ambiente,Toledo,Spagna;Univ.of Arizona:Dep.of Entomology,Tucson (USA);Univ.of California, Riverside:Dep.of Entomology;CNR:IGV;ENEA: Trisaia;MIPAF:ISCI,Bologna;Ist.Sperimentale Frutticoltura,Roma;Univ.della Basilicata (BIDIBAF);Univ.di Bari:Dip.di Chimica;Dip.di Biochimica e Biologia Molecolare;Dip.di Biochimica,Biologia e Fisica Medica, Policlinico di Bari;Dip.di Protezione delle Piante e Microbiologia Applicata;Univ.di Bologna:Dip.di Scienze e Tecnologie Agroambientali; Univ.di Napoli:ARBOPAVE;DISSPA;DEZA;Univ.di Padova:Dip.di Biologia; Univ.di Palermo:SENFIMIZO;Univ.di Parma:Dip.di Biochimica e Biologia Molecolare;Univ.di Pavia:Dip.di

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Biologia Animale;Univ.di Torino:CEBIOVEM; Univ.di Verona:Dip.Scientifico e Tecnologico;ArterraBioscience srl, Napoli;Idrocons srl-AL

Finalità

Obiettivi Obiettivo generale di questa commessa è la caratterizzazione biologica, genetica, chimica e molecolare dei fenomeni di parassitismo, antagonismo e simbiosi mutualistica,in piante di importanza agraria (principalmente Solanacee e Leguminose) seguendo un approccio multidisciplinare che include esperienze in biologia cellulare, genetica,caratterizzazione molecolare,chimica ecologica ed etologia, maturate nei campi dell'entomologia,della micologia e della patologia vegetale. Obiettivi specifici sono quindi un incremento del controllo degli organismi dannosi attraverso l'esaltazione della resistenza del vegetale e dell'attività degli antagonisti insieme a quello di un aumento dei livelli produttivi di sistemi agricoli associati ad un incremento della loro qualità.

Risultati attesi nell'anno Individuazione di fonti di resistenza ai principali stress biotici e caratterizzazione di semiochimici vegetali regolanti l'attività riproduttiva degli antagonisti di insetti fitofagi in germoplasma di pomodoro con identificazione dei geni coinvolti nella loro produzione; proteomica delle interazioni pianta-funghi antagonisti; identificazione di geni espressi in modo differenziale durante l'interazione con funghi simbionti in leguminose e cetriolo;ampliamento biblioteche cDNA di Tuber borchii;approfondimento delle conoscenza riguardanti la simbiosi mutualistica di piante di interesse agrario e funghi micorrizici arbuscolari; ulteriore approfondimento dell'azione di batteri simbionti sugli imenotteri parassitoidi loro ospiti; messa a punto di strategie di controllo biologico ed integrato di aleirodidi dannosi in ambiente protetto.Ulteriore avanzamento nello studio degli effetti di transgeni e linee di introgressione di pomodoro su organismi non bersaglio e sull'ambiente.L'acquisto di nuovo microscopio a trasmissione si rende indispensabile per il tipo di indagini in corso e per non disattendere impegni internazionali. Quello in dotazione è fuori uso.

Potenziale impiego - per processi produttivi Processi produttivi agricoli a basso impatto ambientale attraverso la caratterizzazione e l'uso della resistenza del vegetale, insieme con l'esaltazione dell'antagonismo naturale Rivalutazione produzioni tipiche (DOP) Aumento della produttività in produzioni di eccellenza (es. Tuber)

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Salvaguardia ambientale attraverso una riduzione di sostanze di sintesi per il controllo di organismi dannosi Maggiore produttività dei sistemi agricoli Migliore qualità delle produzioni Recupero e riqualificazione di aree abbandonate

Moduli

Modulo: Interazione ospite-organismo-ambiente: biologia, epidemiologia e genomica funzionale.

Istituto esecutore: Istituto per la protezione delle piante Luogo di svolgimento attività: Sezione di Portici

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9639 212 38 5 894 238 488 96 N.D. 1228








Altro Totale

2 2 0 0 0 1 0 3 0 8



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SERGIO MOLINARI Metaboliti secondari di piante, funghi e batteri: ricerca di antibiotici, tossine e molecole attive

ELENA PAOLETTI Definizione dei livelli critici per l'ozono in Europa per ecosistemi agrari e forestali

TERESA BLEVE Microscopia elettronica a trasmissione : applicazioni per studi di base in campo vegetale, biomedico e chimico

ROBERTO DANTI Induzione della maschio-sterilità mediata da espressione tessuto specifica di tossine in Cupressus

SILVIA FINESCHI "Caratterizzazione genetica e conservazione del Cupressus dupreziana Camus, specie relitta"

MASSIMO GIORGINI Caratterizzazione della resistenza ad insetti indotta da micorrizazione

GIUSEPPE PARRELLA Sviluppo e validazione di sistemi di diagnosi molecolare contro il virus della screziatura della Parietaria (PMoV) per applicazioni in campo agrario e medico

AURELIO CIANCIO Metaboliti secondari di piante, funghi e batteri: ricerca di antibiotici, tossine e molecole attive

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione ELEMENTI DI AUTOVALUTAZIONE ATTIVITÀ 2005 L'IPP ha come compiti istituzionali: lo studio dei meccanismi biologici che controllano le relazioni tra pianta e fattori biotici ed abiotici e lo sviluppo di modelli previsionali di controllo rispettosi dell'ambiente e della salute dei consumatori. L’attività dell’IPP, svolta completamente nel dipartimento Agroalimentare, si realizza in 4 commesse: - "Diversità genetica e funzionale degli organismi associati alle piante di interesse agroforestale", che è una risorsa strategica nella protezione e valorizzazione del patrimonio vegetale; - "Interazione pianta-organismo-ambiente", che affronta con un approccio multidisciplinare la caratterizzazione biologica, genetica, chimica e molecolare dei fenomeni di simbiosi mutualistica, parassitismo ed antagonismo in piante di interesse agro-forestale; - "Studio e sviluppo di strategie innovative di lotta per la protezione delle piante", che intende favorire il trasferimento di tecnologie in prodotti, processi e servizi; - "Impatto economico e ambientale di fattori di stress su piante ed ecosistemi produttivi", che vuole costituire un cardine tra ricerca innovativa ed utenza ed essere in grado di favorire decisioni gestionali da parte di Enti pubblici ed Imprese produttive. La valutazione delle attività svolte nel 2005 dall’IPP può essere: A. Autovalutazione basata sul confronto tra gli obiettivi indicati ed i risultati ottenuti - Pubblicazioni: su riviste (97, di cui 20 in corso di stampa); libri e capitoli di libri (11); altro (32) - Brevetti: due selezioni di olmo resistenti alla grafiosi sono in fase di brevetto; identificata l'azione nematocida di una molecola d'origine vegetale; selezione di due cloni di cipresso con polline a basso potere allergenico (in collaborazione con Lofarma, industria farmaceutica) - Isolamenti monoconidici di funghi e preparazione di nematocidi di sintesi per industrie produttrici di agrofarmaci - Banca dati: sequenze relative a geni di Meloidogyne ethiopica, M. incognita, Pochonia chlamydosporia, un set per l'amplificazione di regioni microsatelliti in Cupressus sempervirens B. Valutazione esterna da parte di Istituzioni di ricerca, Enti pubblici ed imprese a)Partecipazione a progetti Europei approvati: 9 - MedCypre - MicoSpa - Oakflow - Traceam - Cyprall Craft - Ozone - Fungymic - Manchest - LESC dell’ESF b) Presentazione di progetti Europei in corso di valutazione: 5 - Interface - Biodiversity Fungiserve - ChâtEco InterregIIIB Medocc - Genoscope (INRA, UMRI064) - ELMPOPS c)Partecipazione a progetti nazionali - FIRS su Global Change - Mipa – Fitoparassiti e biocontrollo - Miur PS9 d) PMI coinvolte nei progetti: Veneto Agricoltura, Umbraflor, Azienda vivaistica "Il Terzo", Lofarma, Anallergo, Leti(S), Sariaf, Elep, Agrifutur, Du Pont, Syngenta, Dow Agrosciences, Certis, BasfAgro, Isagro, Cassa di Risparmio di Firenze, Compagnia S. Paolo e)Istituzioni pubbliche coinvolte nei progetti: Ministero delle Infrastrutture e dei Trasporti, Mipa; Regioni Campania, Sicilia, Piemonte, Puglia, Sardegna. Toscana, Umbria; Province di Livorno, Caserta, Siena; Comunità montane (8) f)Partecipazione dell'IPP: Network Endure (European Network for Durable Exploitation of Crop Protection Strategies), SafeCrop (Centre of research and development of crop protection with low enviromental and consumer healt impact), Network Emerisk (Assessment and monitoring of emerging sanitary risks for European agriculture) g)Progetti con Paesi ex PECO, MEDA e Paesi Terzi - Repubblica Slovacca (PB); Ungheria (2 PB); Malta (EU Twinning Malta); Turchia (MedCypre); Marocco (MedCypre); Tunisia (MedCypre); Israele (MedCypre); Cuba (Short Term Mobility); India (Short Term Mobility);

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Cile (Protocollo di intesa con Servicio Agricolo y Ganadero) Valutazione complessiva L'attività svolta nel 2005 ha dato risultati considerevoli nei tempi previsti. Questi risultati hanno avuto ricadute importanti nella Comunità scientifica (pubblicazioni su riviste quotate, collaborazioni con Istituzioni di Ricerca europee, partecipazione a progetti europei e a Network) e per l'utenza (progetti con imprese, Ministeri, Enti pubblici regionali e provinciali). Il fattore di amplificazione nel 2005 si aggira su 1.25 – 1.30, inferiore al 2004 in quanto i contratti esterni pur approvati sono stati solo in parte accertati ed incassati. Giudizio: più che positivo con attività in crescita qualitativa e quantitativa.

Proposta di interventi organizzativi La strategia dell’IPP sviluppata fin dalla sua costituzione è stata quella di utilizzare al meglio le competenze e le risorse presenti negli ex organi CNR confluiti nell’IPP e di offrire una piattaforma efficiente per risolvere alcune emergenze nel settore della protezione delle piante agro-forestali. Di conseguenza l’aggregazione dell’IPP manca di certe competenze in alcune tematiche fondamentali della protezione delle piante quali la patologia e virologia vegetale, nonché la fitoiatria chimica degli antiparassitari, loro metabolismo e residui. Tali carenze potrebbero essere colmate con assunzioni mirate e con una ristrutturazione degli attuali istituti CNR (ad es. far confluire nell’IPP l’Istituto di Virologia Vegetale, essendo la virologia un settore portante della protezione delle piante) o con incentivi per la costituzione di Unità Miste di Ricerca (seguendo il modello francese) tra organi CNR, altri enti di ricerca, imprese etc. L’obiettivo principale dell’IPP è quello di “cancellare” o meglio superare la filosofia dell’ex-organo, cercando di mantenere la “realtà storica” e le competenze acquisite dagli ex-organi. Tuttavia pur dovendo possedere ogni componente della commessa un’elevata disciplinarietà per essere competitivo, la commessa deve poter contare su personale caratterizzato da diverse competenze ed essere quindi interdipliscinare. Questa condizione è possibile solo su progetti (europei, di dipartimento, finalizzati o strategici) o costituendo UMR a tempo determinato. Finora l’IPP non ha potuto muoversi in tale direzione sia perché doveva e dovrà soddisfare progetti vincolati a fondi esterni o conto terzi, sia perché è stato necessario consolidare un’aggregazione mirata tra il personale delle diverse sedi dell’IPP cercando però una stretta collaborazione con personale universitario. Lo sviluppo di una stretta collaborazione con altri enti di ricerca (università soprattutto) permette di costituire un parternariato d’élite a tempo determinato, sufficiente per risolvere particolari problemi. Certamente dopo un periodo di “assestamento”, di ricerca di temi prioritari e di sfoltimento di linee di ricerca vincolate e conto terzi, le Commesse dovranno allargare la loro base inserendo personale CNR di altri istituti a tempo pieno o part-time per favorire un’integrazione costruttiva con l’utenza, indirizzandosi verso progetti economicamente validi ed apprezzati dall’utenza e dal mercato. Indicazioni di interventi organizzativi - Effettuare la ristrutturazione degli istituti CNR prima possibile e dare a questi le direzioni stabili - Valutare le commesse in modo serio, eliminando eventuali “doppioni”, quelle con obiettivi non prioritari e quelle non rispondenti alle richieste dell’utenza - Mettere a regime quanto prima i dipartimenti con gli organi decisionali - Attivare il progetto di ricerca del dipartimento - Finanziare progetti strategici interdispliscinari su tematiche prioritarie - Snellire il più possibile le pratiche burocratiche e amministrative, perché il ricercatore deve fare anche la ricerca - Prevedere, per garantire un buon funzionamento degli istituti, l’assunzione anche di personale tecnico e amministrativo, vitale per ricerche nel settore agroalimentare - Incentivare il personale CNR a partecipare a gruppi di valutazione, di lavoro, a progetti europei e a progetti con PMI e/o in collaborazione con categorie produttive.

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ISTITUTO DI SCIENZA DELL'ALIMENTAZIONE Missione

Svolgere attività di ricerca, di valorizzazione e trasferimento tecnologico e di formazione relativamente alle seguenti tematiche: studi sulla composizione e le qualità nutrizionali degli alimenti; valutazione degli effetti dell'alimentazione sulla salute umana; caratterizzazione e valorizzazione di alimenti tipici nella dieta mediterranea; genomica, proteomica, e bioinformatica delle scienze dell'alimentazione. Direttore: Prof Arturo Leone Sede principale: Via Roma, 52 a/c - 83100 Avellino AV Campania Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.isa.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 35 0 13 2 50 2004 35 0 13 2 50 2005


Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Malorni Antonio I Giacco Rosalba II Pizzano Rosa II Pocsfalvi Gabriella Katalin II Rossi Mauro II Russo Gian Luigi II Siani Alfonso II Barba Gianvincenzo III Bergamo Paolo III Caira Simonetta III Cammarota Giancarlo III Carbone Virginia III Clemente Gennaro III D'Acierno Antonio III De Giulio Beatrice III De Prisco Pietro Paolo III Di Stasio Michele III

liv.Esposito Teresa III Facchiano Angelo III Fierro Olga III Gianfrancesco Fernando III Gianfrani Carmela III Graziani Maria Paola III Iacomino Giuseppe III Mamone Gianfranco III Maurano Francesco III Mazzarella Giuseppe III Nazzaro Filomena III Ombra Maria Neve III Pellicano Mario Paolo III Perillo Bruno III Picariello Gianluca III Russo Paola III Sada Alfonso III

liv.Siciliano Rosa Anna III Sorrentino Alida III Volpe Maria Grazia III Laurino Carmine IV Faruolo Clementina V Tedesco Idolo V Cipriano Luigi VI De Caro Salvatore VI Galdi Bruno VI Ottombrino Antonio VI Barrasso Tommasino VII Canonico Filomeno VII Maietta Roberta VII Russo Gennaro VII Russo Maria VII Caruso Domenico VIIIMeccariello Clemente VIII

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2003 10 5 2 0 16 33 2004 12 6 2 0 15 35 2005

ASSEGNISTI

Giuseppina Cacace Maria Fiorella Mazzeo Maria Cristina Medici


Antonio Carraturo Gaetano Ciarcia Vincenzo Fogliano

Giovanni Galano Giuseppe Maiani

Maurizio Minetti Rosanna Palumbo

Silvestro Volpe Alessandra Zicari

BORSISTI

Alessandra Camarca Livia Malorni Paola Saggese Rosita Stefanile


Pasqualino Calatola Sabatina De Stefano Francesca Di Marzo Capozzi Adriana Di Placido

Annarita Formisano Florinda Fratianni Marcello Gaita Giuseppe Lombardi

Marco Matarazzo Annunziata Nappo Fabio Petitto Anna Maria Romano

Marilina Russo Virgilio Saggese Luciano Sarno

DOTTORANDI

Manuela Cuccurullo Rossana D'Arienzo

Alessandra De Martino Rosaria Ferro

Daniela Guarino Diomira Luongo

Carla Manzo Annalisa Vilasi

PROFESSORI VISITATORI

Maria Antonietta Belisario Bernward Bisping Francesco Paolo Cappuccio

Bruno De Luca Gaetano Iaquinto Vittorio Krogh

Salvatore Musumeci Cosimo Pizza Giuseppe Scala

Pasquale Strazzullo Michel De Lorgeril

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Risorse finanziarie



esterne totale







anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 667 - 374 - - 2004 492 606 225 249 515 1.371 2005







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esposizione


2003 34 3 - - - - - 2004 40 7 - 3 - - - - 2005


ARTICOLI ISI

Russo M, Palumbo R, Mupo A, Tosto M, Iacomino G, Scognamiglio A, Tedesco I, Galano G, Russo GL. Flavonoid quercetin sensitizes a CD95-resistant cell line to apoptosis by activating Protein Kinase C-alpha ONCOGENE

Iacomino G, Tecce MF, Grimaldi C, Tosto M, Russo GL. Transcriptional response of a human colon adenocarcinoma cell line to sodium butyrate BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS

R.Giacco, F.Brighenti, M.Parillo, M.Capuano, A.V.Ciardullo,A.Rivieccio, A.A.Rivellese and G.Riccardi Characteristics of some wheat-based foods of the Italian Diet in relation to their influence on postprandial glucose metabolism in patients with type 2 diabetic patients. BRITISH JOURNAL OF NUTRITION

G.Clemente, R.Giacco, G.Lasorella, S.Coppola, E.Trapanese, P.Torre and L.Greco Homemade Gluten-Free Pasta is as well or better digested than Gluten-containing Pasta. JOURNAL OF PEDIATRIC GASTROENTEROLOGY AND NUTRITION

R Giacco, G Clemente, L Busiello, G Lasorella, A.M. Rivieccio, AA Rivellese and G Riccardi: Insulin senitivity is increased and fat oxidation after a high fat meal is reduced in normal weight healthy men with strong familial predisposition to overweight. INTERNATIONAL JOURNAL OF OBESITY

G. Riccardi, G.Clemente and R.Giacco Glycemic Index of local foods and diets: The mediterranean Experience. NUTRITION REVIEWS

Esposito C, Paparo F, Caputo I, Rossi M, Maglio M, Sblattero D, Not T, Porta R, Auricchio S, Marzari R, Troncone R. Anti-tissue transglutaminase antibodies from coeliac patients inhibit transglutaminase activity both in vitro and in situ. GUT

Gianfrani C, Troncone R, Mugione P, Cosentini E, De Pascale M, Faruolo C, Senger S, Terrazzano G, Southwood S, Auricchio S, Sette A.

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Celiac disease association with CD8+ T cell responses: identification of a novel gliadin-derived HLA-A2-restricted epitope. JOURNAL OF IMMUNOLOGY

Strazzullo P, Iacone R, Siani A, Cappuccio FP, Russo O, Barba G, Barbato A, D’Elia L, Trevisan M, Farinaro E Relationship of the Trp64Arg polymorphism of the beta3-adrenoceptor gene to central adiposity and high blood pressure: interaction with age. Cross-sectional and longitudinal findings of the Olivetti Prospective Heart Study JOURNAL OF HYPERTENSION

P. Strazzullo, R. Iacone, A. Siani , G. Barba, O. Russo, P. Russo, L. D’Elia, E. Farinaro, F. P. Cappuccio Altered renal sodium handling and hypertension in men carrying the glucagon receptor gene (Gly40Ser) variant JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE-JMM

A. Siani, R. Iacone, O. Russo, G. Barba, P. Russo, F. P. Cappuccio, F. Galletti, P. Strazzullo Gly40Ser Polymorphism of the Glucagon Receptor Gene Is Associated with Central Adiposity in Men OBESITY RESEARCH

Strazzullo P, Barba G, Cappuccio FP, Siani A, Trevisan M, Farinaro E, Pagano E, Barbato A, Iacone R, Galletti F. Altered renal sodium handling in men with abdominal adiposity: a link to hypertension JOURNAL OF HYPERTENSION

Ciccarone E, Di Castelnuovo A, Salcuni M, Siani A, Giacco A, Donati MB, De Gaetano G, Capani F, Iacoviello L A high-score Mediterranean dietary pattern is associated with a reduced risk of peripheral arterial disease in Italian patients with Type 2 diabetes JOURNAL OF THROMBOSIS AND HAEMOSTASIS

Barba G, Giacco R, Clemente G, Venezia A, Russo P, Grimaldi C, Siani A. The BRAVO project: screening for childhood obesity in a primary school setting NUTRITION METABOLISM AND CARDIOVASCULAR DISEASES

Russo GL, Russo M. Ins and outs of apoptosis in cardiovascular diseases. NUTRITION METABOLISM AND CARDIOVASCULAR DISEASES

Facchiano A, Russo K, Facchiano AM, De Marchis F, Facchiano F, Ribatti D, Aguzzi MS, Capogrossi MC Identification of a novel domain of fibroblast growth factor- 2 controlling its angiogenic properties. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY

Russo P., Siani A., Venezia A., Iacone R., Russo O., Barba G., D'Elia L., Cappuccio F., Strazzullo P.

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Interaction between the C(-344)T polymorphism of CYP11B2 and age in the regulation of blood pressure and plasma aldosterone levels: cross-sectional and longitudinal findings of the Olivetti Prospective Heart Study JOURNAL OF HYPERTENSION

Siani A., Cappuccio F., Barba G., Trevisan M., Farinaro E., Lacone R., Russo O., Russo P., Mancini M., Strazzullo P. The relationship of waist circumference to blood pressure: the Olivetti Heart Study AMERICAN JOURNAL OF HYPERTENSION

Miraglia N. ,Basile A., Pieri M. , Acampora A., Malorni L., De Giulio B.,Sannolo N. Ion trap mass spectrometry in the structural analysis of haemoglobin peptides modified by epichlorohydrin and diepoxybutane RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY

Andrew C.R. Martin, Angelo M. Facchiano, Alison L. Cuff, Tina Hernandez-Boussard, Magali Olivier, Pierre Hainaut, Janet M. Thornton Integrating Mutation Data and Structural Analysis of the p53 Tumour-Suppressor Protein HUMAN MUTATION

Basile A., Ferranti P., Mamone G., Manco I., Pocsfalvi G., Malorni A., Acampora A., Sannolo N. Structural analysis of styrene oxide/haemoglobin adducts by mass spectrometry: identification of suitable biomarkers for human exposure evaluation RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY

Russo K, Ragone R, Facchiano AM, Capogrossi MC, Facchiano A. Platelet-derived growth factor-BB and basic fibroblast growth factor directly interact in vitro with high affinity. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY

Solaja BA, Terzic N, Pocsfalvi G, Gerena L, Tinant B, Opsenica D, Milhous WK. Mixed steroidal 1,2,4,5-tetraoxanes: antimalarial and antimycobacterial activity JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY

Stiuso P., Libondi T., Facchiano A.M., Colicchio P., Ferranti P., Lilla S., Colonna G. Alteration in the ubiquitin structure and function in the human lens: a possible mechanism of senile cataractogenesis FEBS LETTERS

Mazzeo M.F., De Giulio B., Senger S., Rossi M., Malorni A., Siciliano R.A. Identification of transglutaminase-mediated deamidation sites in a recombinant alpha-gliadin by advanced mass-spectrometric methodologies. PROTEIN SCIENCE

Lilla, S., Caira, S., Ferranti, P, Addeo, F., Mass spectrometry characterisation of proteins in rennet and in chymosin-based milk-clotting preparations RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY

Facchiano A, Facchiano A, Facchiano F.

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(Active Sequences Collection) database: a new tool to assign functions to protein sequences. NUCLEIC ACIDS RESEARCH

Dettin, M., Ferranti, P., Scarinci, C., Picariello, G., Di Bello, C. Is the V3 loop involved in HIV binding to CD4? BIOCHEMISTRY

Mamone, G., Caira, S., Garro, G., Nicolai, A., Ferranti, P., Picariello, G., Malorni, A., Chianese, L., Addeo, F. Casein phosphoproteome: identification of phosphoproteins by combined mass spectrometry and two-dimensional gel electrophoresis ELECTROPHORESIS

Miraglia N, Pocsfalvi G, Ferranti P, Basile A, Sannolo N, Acampora A, Soleo L, Palmieri F, Caira S, De Giulio B, Malorni A. Mass spectrometric identification of a candidate biomarker peptide from the in vitro interaction of epichlorohydrin with red blood cells. JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY

Basile A, Ferranti P, Pocsfalvi G, Mamone G, Miraglia N, Caira S, Ambrosi L, Soleo L, Sannolo N, Malorni A. A novel approach for identification and measurement of hemoglobin adducts with 1,2,3,4-diepoxybutane by liquid chromatography/electrospray ionisation mass spectrometry and matrix-assisted laser desorption/ionisation tandem mass spectrometry. RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY

Schlosser G, Pocsfalvi G, Malorni A, Puerta A, de Frutos M, Vekey K. Detection of immune complexes by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY

Superti F, Siciliano R, Rega B, Giansanti F, Valenti P, Antonini G. Involvement of bovine lactoferrin metal saturation, sialic acid and protein fragments in the inhibition of rotavirus infection. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA

Carla Esposito, Francesco Paparo, Ivana Caputo, Raffaele Porta,,Virginia M. Salvati., Giuseppe Mazzarella, Salvatore Auricchio, Riccardo Troncone, Expression and Enzymatic Activity of Small Intestinal Tissue Transglutaminase in Celiac Disease AMERICAN JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY

Salvati VM, MacDonald TT, del Vecchio Blanco G, Mazzarella G, Monteleone I, Vavassori P, Auricchio S, Pallone F, Troncone R, Monteleone G. Enhanced expression of interferon regulatory factor-1 in the mucosa of children with celiac disease. PEDIATRIC RESEARCH

Mazzarella G, MacDonald TT, Salvati VM, Mulligan P, Pasquale L, Stefanile R, Lionetti P, Auricchio S, Pallone F, Troncone R, Monteleone G. Constitutive activation of the signal transducer and activator of transcription pathway in celiac disease lesions. AMERICAN JOURNAL OF PATHOLOGY

Troncone R, Franzese A, Mazzarella G, Paparo F, Auricchio R, Coto I, Mayer M, Greco L.

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Gluten sensitivity in a subset of children with insulin dependent diabetes mellitus. AMERICAN JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY

Mazzarella G, Maglio M, Paparo F, Nardone G, Stefanile R, Greco L, van de Wal Y, Kooy Y, Koning F, Auricchio S, Troncone R. An immunodominant DQ8 restricted gliadin peptide activates small intestinal immune response in in vitro cultured mucosa from HLA-DQ8 positive but not HLA-DQ8 negative coeliac patients. GUT

Salvati VM, Bajaj-Elliott M, Poulsom R, Mazzarella G, Lundin KE, Nilsen EM, Troncone R, MacDonald TT Keratinocyte growth factor and coeliac disease. GUT

Strazzullo P, Galletti F, Barba G. Altered renal handling of sodium in human hypertension: short review of the evidence HYPERTENSION

Barba G, Russo O, Siani A, Iacone R, Farinaro E, Gerardi MC, Russo P, Della Valle E, Strazzullo P. Plasma leptin and blood pressure in men: graded association independent of body mass and fat pattern OBESITY RESEARCH

Strazzullo P, Iacone R, Iacoviello L, Russo O, Barba G, Russo P, D'Orazio A, Barbato A, Cappuccio FP, Farinaro E, Siani A. Genetic variation in the renin-angiotensin system and abdominal adiposity in men: the Olivetti Prospective Heart Study ANNALS OF INTERNAL MEDICINE

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Altri Ministeri: Ministero della Salute

Enti pubblici: Regione Campania; Regione Sicilia; Centro Regionale di Competenza Agroalimentare; Reparto di Ematologia e Gastroenterologia, Ospedale Moscati (Avellino)

EPR italiane: ICTP-CNR, Sez. Catania; IBP-CNR, Napoli; ICB-CNR, Sez. Sassari; ISS, Roma; IDI-IRCCS, Roma; CNR-Istituto di Genetica Vegetale - Sezione di Portici; CNR-Istituto di Chimica Biomolecolare; CNR-Istituto di Chimica e Tecnologia dei Polimeri; CNR-Istituto di Biochimica delle Proteine; IBAF-CNR, Porano; Istituto per lo Studio dei Materiali Nano Strutturali-CNR, Bologna; Istituto Zooprofilattico-Portici (NA); Istituto Nazionale per lo Studio e la Cura dei Tumori (Milano); Istituto Nazionale di Ricerca per gli Alimenti e la Nutrizione (Roma); Istituto Biostruttura e Bioimmagini, CNR (Napoli); EPR straniere:; Laboratoire du Stress Cardiovasculaire et Pathologies Associées, UFR de Médecine et Pharmacie (La Tronche, France); Telethon Institute for gene Therapy (Milano)

MIUR: Finanziamento M.I.U.R. leggi 95/1995(5%),449/1997(progetti strategici MIUR),204/1998(FISR) e 388/2000(FIRB), ; Privati:; Hame Polytechnic,Finland; CHELAB S.r.l.; ISTA-Dompè; Bioma Srl (CH); Menarini S.r.l. Milano; Enza Zaden Spa Italia; Mayo Clinic (Rochester, MN, USA); Metapontum Agrobios, Metaponto (MT)

Università: Università degli Studi “Federico II”, Napoli; Seconda Università degli Studi di Napoli; Universita' degli Studi di Salerno; Universita' della Tuscia; Università degli Studi del Molise; University College of London Ludwig Cancer Research Institute, London; University of Brighton, UK; Hamburg University, D; Dpt. of Community Health Science, S. George's Hospital Medical School (London, UK); Università Cattolica del Sacro Cuore (Campobasso); La Jolla Institute for Allergy and Immunology (San Diego, CA); Dip Medicina Sperimentale e Patologia, Università La Sapienza (Roma); Facoltà di Agraria, Università di Foggia

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REGIONE CAMPANIA • Convenzione Regione Campania "Isolamento e caratterizzazione biochimica di nuove

battereocine" seconda rata annualità 1997 (Nota Bene) sospeso n. 315200350007883502 accertato in sostituzione del nostro regolarizzato erroneamente dal CDS 058

• Acconto 60% Progetto: Benefici e rischi di antiossidanti alimentari nella prevenzione di patologie croniche e degenerative ( GL Russo)

METAPONTUM AGROBIOS S.r.l. • Acconto Contratto Metapontum Agrobios riferimento art. 5 del contratto di convenzione del

18/05/2001 ed integrazione del 04/02/2005

CONSORZIO MARIO NEGRI SUD • Contratto IMMIDIET QLK1-CT-2000-00100 2°anno nell'ambito del V programma quadro

"Studio del rischio cardiovascolare in diversi paesi CEE (Siani)"

CHELAB S.R.L. • Contratto di Ricerca con CHELAB SRL del 15/04/2004 collaborazione su progetto MIUR dal

titolo " Nuovo Test inteso a sostituire in vivo, per la valutazione del rischio tossicologico per l'uomo di composti chimici utilizzati in vari settori commerciali"

• Anticipo del 50% su contratto Chelab sottoscritto in data 22/12/2004 Quota spettante Wokpage 20%

• Anticipo del 50% su contratto Chelab sottoscritto in data 22/12/2004 Quota spettante Wokpage 80%

WATERS S.p.a. • Erogazione Waters per Borsa di studio, per attività di ricerca nel campo della Spettrometria di

massa - post laurea.

WIND TELECOMUNICAZIONI S.P.A. • Contratto di Locazione con la WIND Telecomunicazioni SPA stipulato il 29/10/99 scadenza

29/10/2005 Sospeso CNR 315200300028617024 del 28/07/2003 Rata anno 2003 • Contratto di Locazione con la WIND Telecomunicazioni SPA stipulato il 29/10/99 scadenza

29/10/2005 Sospeso CNR 315200400027666098 del 29/07/2004 Rata anno 2004

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca • Progetto FIRB - MIUR Prof. Antonio Malorni Anticipo 30% Vedi sospesi Entrata CNR n.

315200300020402634

DIPARTIMENTO DI FISIOLOGIA GENERALE ED AMBIENTALE • Accertamento spettanze 50 % Convenzione Dipartimento di Fisiologia "progetto Spore

Probiotics (QLK5 -CT 2001 - 01729) Rossi Mauro 290/04/10

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ECOBIOTRADING S.r.l. • Contratto Soc. ECOBIOTRADING S.r.l. (Sada Alfonso) 315/03/19 Versamento alla stipula del

contratto

AGROVIS Srl • Contratto AGROVIS S.R.L. (Volpe M. G. ) 322/03/18 Primo Anticipo • Contratto AGROVIS S.R.L. (Volpe M. G. ) 322/03/18 SALDO vedi Sospeso CNR.

315200300037514519

NOVO NORDISK FARMACEUTICI SPA • Contratto Novo Nordisk Farmaceutici Spa 2^ Tranche convenzione 2002 progetto di ricerca "

Lipemia Post Prandiale" effetti di diversi approcci terapeutici Vedi sospeso di Entrata . CNR n. 3152100300027984415

Regione Campania - giunta regionale della Campania - area generale di coordinamento sviluppo attività settore primario - settore tecnico amministrativo provinciale alimentazione Avellino

• Accertamento a saldo progetto di ricerca ARCA Programma interregionale " Comunicazione ed educazione Alimentare " "Realizzazione Indagine consumi alimentari attività di confronto CNR -AV ASL n. 5 Torre del Greco "

LIQUORI ESPRESSI di Marina Parente & C. S.a.s • Saldo contratto di ricerca Liquori Espressi S.a.s (MP.Pellicano) • Seconda trance contratto di ricerca Liquori Espressi S.a.s (MP.Pellicano)

REGIONE CAMPANIA A.G.C. Bilancio Ragioneria e Tributi Settore Riscontro e Vigilanza sul servizio di tesoreria e Bilancio di Cassa

• MEDEA POR CAMPANIA 2000/2006 MIs. 6.5 "Sviluppo dell'internazionalizzazione e della Cooperazione Internazionale", Azione b/e " Cooperazione Interistituzionale nel Mediterraneo".

Contratti passivi

VE.RI.CO. impianti srl • Verico: Ord. 03/62 007/02/30 Manutenzione ordinaria Impianti Idraulici 01/05/2003 al

30/04/2004 • Verico : Proroga contratto manutenzione Idraulica 4 mesi 2003 ord. 03/34 007/02/30 • Verico : Manutenzione locali Stabulario 2003 ord. 03/38 007/02/30 • Verico: ord. 04/418 007/04/15 Manutenz. ord. 01-09/31-12 • Manutenzione globale ISA anno 2005 ord. 05/134 007/05/15 • Verico: Ord. 04/308 007/04/15 Manutenzione ordinaria Impianti Idraulici - Lab

Spettrometria - Stabulario dal 01/05/2004 al 31/08/2004 • VE.RI.CO impianti. Sostituzione compressore COPELAND per impianto di condizionamento

TRANE. Ordine n. 05/189 081/05/15 Workpackage Istituto

Bio-Rad Laboratories S.r.l. • Sistema Biological LP WITH MDL 2110 Fraction Collector cod 731 80303

I.N.E.A. (Istituto Nazionale di Economia Agraria) • INEA: Restituzione fondi non utilizzati progetto POM B22 ord. 03/297 070/02/30

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ISAG s.a.s. • ISAG ord. 02/007 010/02/95 • I.S.A.G. srl - Pulizia mesi di Gennaio - Febbraio - Marzo - Aprile 2003 ord. 03/21 010/03/15

COSMOPOL Srl • Cosmopol Vigilanza Gennaio - Febbraio - Marzo - Aprile 2003 • Servizio di guardiania/reception e vigilanza durata 4 anni dal 01/05/2005 al 30/04/2009

WATERS S.p.a. • Waters spa: Intervento di Riparazione e Manutenzione Spettrometri di Massa ZAB e TRIO

con sostituzione pezzi di ricambio • Waters (Micromass) ord. 02/196 245/02/10 Parti danneggiate Trasporto Spettrometro di

Massa • Waters Ord.n°02/205 081/01/12 Fatt.n°216301666 • Waters Ord.n°02/205 081/01/12 Fatt.n°216301665 • Waters: Contratto di assistenza tecnica NR. 39/03 Tipo Platinum, durata 01/03/2003 -

28/02/2004 ord. 03/001 008/02/46

AHSI SPA • AHSI : ORD. 245/03/30 ORD. 03/305 INVESTIMENTO

BIOTECNICA S.a.s. • Biotecnica Ord. 02/665 245/02/39

B.M. SCIENTIFICA s.r.l. • Arredi tecnici per la messa in sicurezza dei Laboratori di Analisi Strumentale e di Sintesi

Peptidi. Ordine n. 05/18 07/04/60. Workpackage P0000060(modulo inserito nelle spese Istituzionali e diviso sulle 4 Commesse)

DIGIMAINT SRL • DIGIMAINT :Ord. 02/577 214/02/04 SERVER Millenium G450 + accessori

THERMO ELECTRON Spa • Thermo Finnigan -. Contratto di Assistenza tecnica 01/08/2003 - 31/07/2004 per

Spettrometro di Massa Element 2 comprensivo di Chiller e sistema di raffreddamento - FULL Service ord. 03/167 245/02/30

APPLERA ITALIA • Contratto di assistenza tecnica su spettrometro di massa Voyager DE Pro periodo 10/05/2005

- 09/05/2006 ord. 05/216 08/05/29

ENEL DISTRIBUZIONE S.P.A. DIREZIONE DISTR. -CAMPANIA • Enel ordine n. 05/39 01/05/15 (Istituto) rata 988304 rata988306 (fatt. n. 06401540219718) • ENEL Mese di dicembre Fatt. 640154140219711 di Euro 19545,30 detratte del conguaglio

Euro 2268,77 fattura 640154140219712 del 04/12/2004 • Enel Fornitura di energia elettrrica per l'Istituto riferimento anno 2005

QUI! TICKET SERVICE SPA • Qui Tiket contratto per servizio sostitutivo mensa anno 2005

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X-TECHNOLOGIES SRL • X-Technologies srl Ord.n°02/574 214/02/04 Fatt.n°139

VALENTINO & C. S.R.L. • Lavori di recinzione per messa in sicurezza confini d'Istituto ord. 04/425 007/04/26

Battista Gaetano & C. S.r.l • Battista Gaetano: Ord. 03/61 007/02/30 Manutenzione impianto elettrico dal 01/05/2003 al

30/04/2004 • Battista Gaetano: Manutenzione Straordinaria Spostamento pozzetti di messa a terra ord.

03/221 007/03/23 Dg Ls. 696/94

ROMEO GESTIONI S.P.A. • Romeo Gestioni : ord. 03/59 009/03/15 Servizio di Guardiania anno 2003 decorrenza

01/05/2003 31/12/2003 • Romeo Gestioni : ord. 03/60 010/03/15 Servizio di Pulizia a canone ed extracanone anno

2003 decorrenza 01/05/2003 31/12/2003 • Romeo Gestioni: Servizio Pulizia a canone ed extracanone anno 2004 ord. 04/214 010/04/15 • Romeo Gestioni: Servizio GUARDIANIA anno 2004 ord. 04/213 009/04/15

PERI LAURA • Obbligazione Collaborazione professionale Laura Peri ord. 04/297 - 302/04/69

SCHLOSSER GITTA • Obbligazione collaborazione professionale SCHLOSSER GITTA

SZILAGYI ZOLTAN • Obbligazione collaborazione professionale ZOLTAN SZILAGYI

SOC. COOP. PROGETTO SERVIZI a.r.l. • Servizi di pulizia effettuati presso la ns. sede. Soc. Coop. progetto Servizi a.r.l. Ordine n. 05/44

010/05/15 (Istituto) • Soc. Coop. Progetto Servizi: Servizio di Pulizia periodo 11/08/2004 -31/12/2004 ord. 04/403

010/04/15

SECURLINE S.r.l. • Servizio di portierato effettuato presso il ns. istituto mese di Aprile ordine n. 05/45 09/05/15 • Servizio di portierato effettuato presso il ns. istituto mese di Marzo ordine n. 05/45 09/05/15 • Servizio di portierato effettuato presso il ns. istituto mese di gennaio ordine n. 05/45 09/05/15 • Securline: ord. 05/45 009/05/15 Vigilanza e Guardiania Mese di Febbraio 2005 • Securline: Servizio di Guardiania periodo 11/08/2004 - 31/12/2004 ord. 04/402 009/04/15

COSTANTINI SUSAN • Parcella compenso Susan Costantini ord. 04/566 21402/42 10 mesi

Sica Giovanna • "partecipazione alle attività di promozione di accordi scientifici e produttivi con paesi del

Bacino Mediterraneo per il trasferimento di professionalità e l'identificazione dei mercati

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Romano Anna Maria • Partecipazione al coordinamento delle iniziative per la realizzazione del Centro "Dieta

Mediterranea" e delle attività ad esso coordinate

Russo Marilina • Supporto tecnico informatico e telematico ai soggetti partecipanti al progetto MEDEA

Matarazzo Marco • Assistenza per lo sviluppo del sistema di ricerca e di promozione delle produzioni campane di

seconda trasformazione

REGIONE CAMPANIA A.G.C. Bilancio Ragioneria e Tributi Settore Riscontro e Vigilanza sul servizio di tesoreria e Bilancio di Cassa

• n. 21 contratti D'opera: Iovane, Russo, Musto, Anzalone, Lombardi, De Simone, De Stefano, Matarazzo, di Marzo Capozzi, Petitto, Saggese, Cipriano, Medici, Sarno, Imperato, Calabrese, Iannece, Colantuoni, Di Placido, Sica, Romano De Negri

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Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Cromatografo a bassa pressione (FPLC Pharmacia) - Cromatografo ad alte prestazione con detector UV-Vis - Cromatografo ad alte prestazione con detector diode-array - Cromatografo ad alte prestazioni completo di detector UV e spettrofluorimetrico (Beckman) - Fast system per elettroforesi monodimensionale (Pharmacia) - HPLC Integral 100Q - Irradiatore per cellule - Peptide Synthetizer (Applied Biosystem) - Real Time PCR (Applied Biosystem) - Real Time PCR (Biorad) - Sequenziatore ABI Prism 310 - Server biprocessore per applicazioni di carattere bioinformatico - Spettrometro di massa GCT, Waters - Spettrometro di massa ICP-MS ELEMENT 2 - Spettrometro di massa M@LDI-R, Waters - Spettrometro di massa MALDI-TOF VOYAGER DE-PRO - Spettrometro di massa Platform GC - Spettrometro di massa Platform II - Spettrometro di massa a sorgente elettrospray a singolo quadrupolo (modello platform) - Spettrometro di massa tandem a 4 settori ZABT - Spettrometro di massa tandem ibrido Autospec-oa-TOF - Spettrometro di massa tandem ibrido Q-STAR - Spettrometro di massa tandem ibrido Q-TOF Micro - Workstation Silicon Graphics FUEL per applicazioni di simulazioni molecolari - Workstation Silicon Graphics O2 per applicazioni di simulazioni molecolari - camera elettroforetica per analisi bidimensionale (Ettan VI - Pharmacia) Istituti con i quali si collabora



- Istituto di chimica biomolecolare

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MEDeA: MEDiterraneo ed Alimentazione

Temi


Studi per la Promozione e valorizzazione di oli aromatizzati campani e di specie aromatiche campane; Attività scientifiche per la promozione di salse e sughi pronti della trad.mediterranea e della pizza tradizionale campana; Costituzione di network internazionale nell'area mediterranea; Trasferimento tecnologico dei risultati ottenuti; Costruzione di sito web dedicato.

Stato dell'arte:

L'internazionalizzazione è la scelta strategica per il futuro delle imprese, ed il mercato attuale è caratterizzato da fenomeni di globalizzazione. Da un lato ciò favorisce l'aumento della concorrenza, dall'altro fa emergere importanti opportunità di intervento in nuove aree dove la domanda è in continuo sviluppo. Il nostro sistema imprenditoriale può cogliere le opportunità economico-produttive di zone come il bacino del Mediterraneo, dove si aprono possibilità di sviluppo produttivo

Azioni

Attività in corso:

Progetto approvato dalla Regione Campania Prot 2004.0995509 del 15/12/04. Inizio di attività: gennaio 2005.


La realizzazione degli obiettivi del progetto è legata ad un'alta interazione tra i partners.


DIFARMA - Università degli Studi di Salerno C.R.A.A.- Consorzio per la Ricerca Applicata in Agricoltura Parco Nazionale del Cilento e Vallo di Diano C.C.I.A.A. di Salerno Provincia di Salerno Comune di Pollica Comitato Tecnico Scientifico della Festa della Pizza Dieta Mediterranea SAS Consorzio C.I.T.E.B.

Finalità

Obiettivi:

L�obiettivo principale della proposta progettuale è la costituzione di un Centro per la promozione di reti di cooperazione e di scambi per la promozione delle imprese campane agro-industriali per la tutela e la valorizzazione delle risorse eno-gastronomiche e medicinali del Mediterraneo, centro di eccellenza nel campo della ricerca applicata alla Dieta Mediterranea.


A medio termine:Creazione di una rete di marchi di qualità di prodotti agro-industriali del Mediterraneo; Creazione di un data base dei prodotti della Dieta mediterranea ;Creazione di un Centro virtuale Internazionale di ricerche sulla Dieta mediterranea - A lungo termine: Trasferimento

230


dei risultati ottenuti alle PMI del settore agro-industriale; Organizzazione di momenti di confronto rivolti a tutti i soggetti interessati,in particolare aziende agro-industriali ed enti di ricerca

Potenziale impiego:


Tecnologie, Tracciabilità e Sicurezza degli Alimenti

Temi


WP 1. TECNOLOGIE INNOVATIVE DI TRASFORMAZIONE E CONSERVAZIONE PER STARTER E ALIMENTI WP.2.COMPOSIZIONE, QUALITA�, TIPICITA� E GENUINITA� DEGLI ALIMENTI WP.3.IDENTIFICAZIONE DELLE COMPONENTI TOSSICHE, CHIMICHE E MICROBIOLOGICHE NELLA FILIERA AGRO-ALIMENTARE WP.4.REALIZZAZIONE DI BANCA DATI SUI PRODOTTI ALIMENTARI WP.5.INNOVAZIONE NELLA PRODUZIONE DI PASTA ALIMENTARE (FRESCA E SECCA) MEDIANTE LA SELEZIONE E IL CONTROLLO DEI PROCESSI CHIMICO FISICI E DEI COADIUV NATURALI

Stato dell'arte:

Il mercato agro-alimentare moderno ha l�esigenza di fornire al consumatore prodotti con caratteristiche di qualità e sicurezza sempre più elevate. Il mondo scientifico e quello industriale si stanno quindi adoperando affinchè tali obiettivi vengano raggiunti attraverso tecnologie innovative. Va inoltre tenuto presente lo stretto legame alimentazione-salute per cui risulta indispensabile uno conoscenza approfondita delle varie componenti degli alimenti.

Azioni

Attività in corso:

Uso di bioconservanti naturali nell�industria alimentare;Svil.e applicaz.di nuove tecniche di conservazione di starter e alimenti; Caratterizz. biochimica di proteine per applicazioni alimentari; Biomonitoraggio di molecole xenobiotiche, molec. biologicam. attive, tossine batteriche in alimenti;Studio proteine del glutine, identificaz. di sequenze peptidiche tossiche;Progett.ed uso di sistemi innovativi di imballaggio in campo agro-alimentare.Microbiologia e tossicologia di mele bio e convenz


Punti critici: a) Risorse finanziarie non adeguate; b) Scarsa disponibilità delle aziende agro alimentari presenti sul territorio alla collaborazione con le strutture scientifiche per la valorizzazione dei prodotti alimentari; c) Difficoltà nella costituzione di filiere agroalimentari; d) Mancanza di personale. Condizioni di fattibilità: Approvazione della presente commessa Approvazione dei progetti in itinere di valutazione


Le Università di: Napoli-"Federico II" ; Molise; Bari; Salerno;Basilicata; University of Brighton, UK Hamburg University, D Hame Polytechnic,Finland CNR-Istituto di Genetica Vegetale -Sezione di Portici. CNR-Istituto di Chimica Biomolecolare CNR-Istituto di Chimica e Tecnologia dei Polimeri CNR-Istituto di Biochimica delle Proteine CHELAB S.r.l.; Istituto Zooprofilattico-Portici (NA); ISTA-Dompè; Bioma Srl (CH); Menarini S.r.l. Milano

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Finalità

Obiettivi:

a) Controllo della qualità, composizione,genuinità e sicurezza dei prodotti alimentari; b)Metodologie innovative nei processi di trasformazione,conservazione e confezionamento degli alimenti.Alla commessa afferiscono ricercatori con competenze in: Chimica,Biochimica,Microbiologia,Immunochimica,Spettrometria di massa,Biotecnologie,Tecnologie Alimentari,Informatica, Scienza dei materiali,Consumer Science.Esse verranno utilizzate anche per possibili attività di servizio a supporto di PMI


Pubblicazioni scientifiche; Brevetti; Progettazione e realizzazione di prototipi; Elaborazione di Protocolli sperimentali e metodologie analitiche; Banca dati consultabile via web;

Potenziale impiego:


Alimenti e salute dell'uomo

Temi


Per una descrizione dettagliata dell�attività da svolgere si veda: http://contab.cnr.it/ (prog. scientifica e previsione risorse 2004-06; cod. 076-ISA.02).

Stato dell'arte:

Comportamenti alimentari poco corretti possono rappresentare importanti fattori di sviluppo di alcune fra le più diffuse patologie dell�uomo. Nella presente commessa operano gruppi di ricerca impegnati nello studio delle principali patologie umane correlate all�alimentazione. I gruppi che afferiscono alla macrolinea sono i seguenti: 1.Nutrizione e Metabolismo; 2.Epidemiologia e Genetica delle Popolazioni; 3.Immunobiologia dell�Intestino; 4.Chemioprevenzione Alimentare; 5.Consumer Science.

Azioni

Attività in corso:

Di seguito sono riportate le aree di studio afferenti alla commessa. 1.Identificazione di alimenti tipici della dieta Mediterranea ad effetto favorevole sulla salute; 2.Identificazione di predittori genetici di malattie cardiovascolari; 3.Studio rapporto diabete e celiachia; probiotici ed enteropatie; 4.Studio del meccanismo d�azione di polifenoli mediante modelli in vitro, ex vivo; in vivo; 5.Applicazione dell�analisi sensoriale alla preferenza del consumatore per nuovi prodotti.


La fattibilità della commessa dipende dalla disponibilità finanziaria e di personale da dedicare agli obiettivi presentati. Nel passato, la commessa è stata in grado di autofinanziarsi utilizzando fondi pubblici e/o privati. E� auspicabile che nel triennio 2004-06, il Dipartimento agricolo-alimentare di nuova formazione sostenga il programma di ricerca presentato dalla commessa, rispondendo alle richieste di personale e fondi avanzate.

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La commessa si avvarrà di numerose collaborazioni nazionali ed internazionali. Si rimanda al sito http://contab.cnr.it/ (programmazione scientifica e previsione risorse 2004-06) relativo alla macrolinea �Alimenti e Salute dell�Uomo� (cod. 076-ISA.02), paragrafo 04 (Competenze da utilizzare, attività da svolgere ed eventuali collaborazioni). Inoltre, gli studi riguardanti gli effetti benefici di alcuni alimenti saranno effettuati in collaborazione con il dr. Dr. Bergamo dall�ISPAAM.

Finalità

Obiettivi:

1 Valutare i meccanismi dell�insulino-resistenza; 2.Studio dell�interazione tra abitudini alimentari e fattori genetici in popolazioni italiane ed europee; 3.Identificare i parametri salienti dell'infiammazione intestinale indotta dal glutine; 4.Studio del meccanismo d�azione dei flavonoidi presenti negli alimenti e potenzialmente dotate di attività chemiopreventiva. Per una descrizione dettagliata si veda:http://contab.cnr.it/(prog. scientifica e previsione risorse 2004-06; cod. 076-ISA.02)


1.Identificazione di marker metabolici precoci di predisposizione all�obesità; 2.Creazione di una banca biologica e genetica relativa a un�ampia popolazione europea 3.Meccanismo d�azione dell�intolleranza alimentare indotta dal glutine 4.Individuare i bersagli molecolari dei flavonoidi in cellule leucemiche ed in modelli animali. 5.Profilo sensoriale dei prodotti freschi e conservati. (Si veda:http://contab.cnr.it/ prog.scientifica 2004-06;cod.076-ISA.02)

Potenziale impiego:


Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell'Alimentazione

Temi


WP1:Studi proteomici di linee cellulari tumorali e di sistemi di interesse alimentare WP2:Sviluppo di tecniche di molecular profiling per identificazione di batteri e caratterizzazione di alimenti WP3:Studi metabolomici di matrici alimentari WP4:Controllo della qualità microbiologica degli alimenti utilizzando tecniche classiche e metodi basati sulla spettrometria di massa WP5:Modelling di proteine e simulazioni di eventi molecolari correlati a patologie associate all�alimentazione

Stato dell'arte:

Le innovazioni tecnologiche e strumentali degli ultimi anni hanno dato un forte impulso allo sviluppo delle discipline �omiche�, di particolare interesse nelle scienze della vita e dell�alimentazione. In particolare, la spettrometria di massa costituisce attualmente il nucleo centrale delle tecnologie per lo studio del proteoma e metaboloma, ed è affiancato dalla bioinformatica per quanto riguarda la gestione e analisi dei risultati sperimentali.

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Azioni

Attività in corso:

Sviluppo e applicazione di metodologie avanzate di spettrometria di massa in studi proteomici, metabolomici e di molecular profiling in ricerche nel campo della scienza dell'alimentazione. Studio strutturale di proteine di interesse alimentare Controllo della qualità microbiologica di prodotti alimentari per la salvaguardia delle loro caratteristiche qualitative e sensoriali e della sicurezza igienico-sanitaria. Sviluppo e applicazione di metodologie bioinformatiche


Punti critici per il raggiungimento degli degli obiettivi delineati sono il reperimento di idonee risorse finanziarie (anche per l'upgrading e la manutenzione delle sofisticate apparecchiature in uso) nonchè un non adeguato numero di unità di personale per condurre il lavoro di ricerca. Condizioni di fattibilità essenziali sono pertanto l'approvazione dei progetti in itinere di valutazione e l'assunzione di nuove unità di personale.


Università degli Studi �Federico II�, Napoli Seconda Università degli Studi di Napoli Universita' degli Studi di Salerno Universita' della Tuscia Università degli Studi del Molise ICTP-CNR, Sez. Catania IBP-CNR, Napoli ICB-CNR, Sez. Sassari ISS, Roma IDI-IRCCS, Roma University College of London Ludwig Cancer Research Institute, London

Finalità

Obiettivi:

Studio di sistemi biologici di importanza nelle scienze dell'alimentazione mediante scienze �omiche� e tecniche di molecular profiling. Controllo della qualità microbiologica degli alimenti Studio con metodi bioinformatici e computazionali delle basi molecolari di patologie associate all�alimentazione. Alla presente macrolinea afferiscono ricercatori con competenze complementari in Spettrometria di Massa, Chimica Analitica e Biochimica, Biologia Cellulare, Microbiologia e Bioinformatica.


Risultati scientifici: Pubblicazioni Scientifiche Metodologie Analitiche Protocolli Banche Dati Brevetti Sviluppo temporale: la commessa continuerà negli anni successivi in funzione del rinnovo dei finanziamenti in corso e della disponibilità di nuovi finanziamenti

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005



Nel 2005 sono stati raggiunti gli obiettivi scientifici prefissi utilizzando fondi pubblici/privati. E’ necessario, però, evidenziare che lo svolgimento futuro delle attività scientifiche in oggetto è legato ai

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seguenti punti critici: - mancanza di politiche per le grandi infrastrutture di ricerca per il finanziamento dell'aggiornamento e manutenzione delle sofisticate apparecchiature in uso; - assunzione di un numero ageguato di unità di personale a tempo indeterminato e di avanzamenti nella carriera del personale in organico per assicurare continuità sia nell’acquisizione di competenze specifiche sia nel prosieguo delle attività della commessa. In particolare, l’attività del gruppo di bioinformatica si fonda sulle competenze di un unico ricercatore dipendente e di vari contrattisti, la cui precarietà rende incerta la sopravvivenza del gruppo stesso; - disponibilità di contratti di ricerca a tempo determinato per la formazione di giovani ricercatori e possibilità di finanziare dottorati di ricerca; - disponibilità di finanziamenti da parte dell’Ente sia per ricerche di base sia per l’avvio di nuovi temi di ricerca potenzialmente idonei all’inserimento in progetti finanziabili.

Collaborazioni

Staciòn experimental del Zaidìn - CSIC Granada, Spagna (Prof. I. Garcia Romera) Hungarian Academy of Science – MTA, Ungheria, (Prof. K. Vekey, Dott. P. Fzabo)


I progetti in corso nel 2005 hanno prodotto risultati rilevanti ed essenzialmente in linea con quanto riportato nel Piano di Gestione 2005. Molti dei risultati sono stati oggetto di pubblicazione su riviste internazionali. I risultati ottenuti hanno aperto nuove prospettive di ricerca e sono quindi state presentate nuove richieste di finanziamento per il loro prosieguo. Sono anche state condotte ricerche in collaborazione con altre istituzioni nazionali e internazionali su temi non riportati nel Piano di Gestione 2005, che sono state anch’esse oggetto di pubblicazione.


In accordo con le attività programmate sono stati conseguiti i seguenti risultati: WP1: Studio proteomico su linee cellulari tumorali MCF-7 al fine di identificare proteine estrogeno-responsive. Identificate 57 proteine, di cui 10 putativamente estrogeno-regolate. WP2: Applicazione di un metodo per l’identificazione rapida di batteri mediante MALDI-TOF-MS: analizzati 50 ceppi batterici. Discriminati ceppi di E. coli O157:H7. Costruzione di una banca dati. WP3: Diverse classi di metaboliti sono state studiate mediante HPLC-MS, HPLC-MS/MS e UPLC-MS. Sono state analizzate differenti cultivar di mela e caratterizzate nel loro contenuto in polifenoli. WP4: Sviluppo di un metodo innovativo basato sulla spettrometria di massa per immuno-affinità per la ricerca delle enterotossine stafilococciche A (SEA) e B in prodotti lattiero-caseari. Limite di rilevazione di 1 fmol/ml. WP5: Studio dell’interazione tra proteina DQ2 e peptidi del glutine, per comprendere le basi molecolari della celiachia. Modelling della proteina GALT e studio del meccanismo con cui la mutazione di GALT più diffusa causa la galattosemia. L’attività scientifica è documentata dalle pubblicazioni reperibili in rete.



I punti critici rimangono quelli già descritti nel piano annuale 2005. Piccoli passi sono stati fatti per una più fattiva collaborazione con aziende agroalimentari, sia regionali che nazionali, per lo studio e la valorizzazione di prodotti agroalimentari. E’, tuttavia, risultata ancora difficile la costituzione di filiere agroalimentari sul territorio.Un punto critico fondamentale rimane la mancanza di risorse finanziarie adeguate e di personale, per cui si auspica, per l’immediato futuro, che si sostenga l’attività della commessa rispondendo anche alle richieste di personale e di fondi avanzate.

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Collaborazioni

Le collaborazioni sono quelle preventivate per il 2005, a livello nazionale (Università del Molise: Prof. Coppola, Prof.Naclerio; Università di Napoli: Prof. Addeo, Prof.Ferranti, Prof.Sansone, Prof. Picariello;Università di Bari: Prof Di Luccia; IGV-CNR sez Portici :Dr.ssa Tucci; IBP-CNR: Dr Orlando, Dr.La Cara; ICTP-CNR, Dr Fiore, Dr.Malinconico; ICB: Dr.ssa Nicolaus, Dr.De Prisco; BIOMA: Dr Bartoli; Menarini SrL: Dr Raucci; DISMA, Milano: Prof Bonomi; ISMAN-CNR: Dr Cacace; ISTA-Dompé; ISZ-Portici: Dr Sandulli; CHELAB SrL.:Dr Commissati, Dr.ssa Cattapan) ed internazionale, scaturite da partecipazioni a comuni progetti di ricerca (Università di Amburgo: Prof Bisping; Hame Polytechnic: Drssa Kautola; Università di Brighton: Dr Santin). Con alcuni degli istituti su citati sono stati presentati diversi progetti di ricerca, a livello nazionale ed internazionale, che sono in itinere di valutazione.


I risultati ottenuti non si discostano di molto da quelli preventivati. L’unico scostamento,in negativo, é legato alla mancata erogazione di un finanziamento che non ha permesso l’attuazione di tutte le attività previste. In positivo, gli scostamenti con i risultati preventivati sono legati alla collaborazione, attuata nel corso del 2005 con la CHELAB srl, per la purificazione di allergeni da diverse matrici alimentari. Nell’ambito della partecipazione della commessa al progetto MIUR sull’ ”Applicazione di tecnologie innovative per il trattamento di prodotti freschi altamente deperibili”(“PROFSICURI”) si possono registrare ulteriori risultati, non preventivati, che hanno evidenziato, per la prima volta in tartufo, la presenza di composti ad attività antimutagena in vitro. I risultati derivanti dallo studio tossicologico di ortofrutta biologica e convenzionale sono significativi: essi inducono ad una riflessione sull’uso di fitofarmaci nel settore agricolo e sul loro impatto sulla salute umana, e meritano,come gli altri precedentemente enunciati, un ulteriore approfondimento scientifico.


L’attività della Commessa é stata suddivisa, per il 2005, in diversi WP, i cui risultati sono così riassunti: WP1: Uso di alginati per intrappolam. batteri lattici.Uso di estr. naturali altern. ad additivi chimici (es.nitrati) nella preparaz. salumi: i risultati hanno consent. la present. di un prog. EU, approvato, che partirà nel 2006.WP2:Messa a punto tecniche di spettrom. di massa per analisi proteine(grano, carne, latte) e per studio loro evoluz. dopo trattam. tecnologici.Uso di biopolimeri in campo alimentare. Sviluppo metodol innovative per individ. caratt. organol., meglio preservate e più gradite,di castagne conservate in sciroppi . Studio di metaboliti in prod. freschi (mela,carciofo) o irradiati (tartufo, pesci). WP3: Allestim.met. analitici per determinaz. tossine batteriche (Staphylococcus, E. coli) e identif. di 1 allergene maggiore nel latte; Scoperta attiv. antimutagena in vitro di estr. tartufo nero. Purific.allergeni da diversi alimenti (fava, segale, etc). WP4: Studio prelimin. di fattibilità per realizzare database su prodotti alimentari. WP5: non è ancora partito, per mancata erogaz finanziam.I risultati sono stati oggetto di pubbl e comunic a convegni.



La commessa nel 2005 è stata in grado di auto-finanziarsi utilizzando fondi pubblici e/o privati, riuscendo, in tal modo, a conseguire i risultati previsti. Tuttavia, restano alcuni importanti punti critici la cui risoluzione potrà garantire la continuità dell’attività scientifica. -Supporto da parte dell’Ente per la manutenzione di apparecchiature dedicate alla ricerca; -Supporto da parte dell’Ente per finanziare per l’acquisto di apparecchiature (citofluorimetro; ELISA; freezer –80°C, impedenziometro, holter, lettore chemioluminescenza, piccole apparecchiature, obiettivo confocale,

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box per panel test) -Contratti per personale tecnico/scientifico (es. tecnico stabularista, tecnici di laboratorio bio-medico); assunzione di personale per la ricerca; passaggi di ruolo. -Supporto da parte dell’Ente per finanziare dottorati di ricerca (1-2 posti) destinati a giovani ricercatori operanti nella commessa in modo da evitare “fughe” di promettenti ricercatori verso altre istituzioni. -Coordinamento tra le Istituzioni territoriali (Provincia, Regione, Parco Scientifico e Tecnologico, ecc.) per sensibilizzare le PMI ad investire nei prodotti della ricerca prodotta dalla commes

Collaborazioni


I risultati ottenuti dalla commessa nel 2005 erano tutti stati programmati nel Programma di Programmazione e previsione Risorse 2004-06 (http://contab.cnr.it/). In particolare, nella scheda “Risultati Attesi” erano state preventivate le seguenti attività: 1.Identificazione di anomalie metaboliche del metabolismo lipidico ed energetico correlate all’insulino-resistenza; 2. Mappa delle abitudini alimentari e di geni candidati per patologie legate alla nutrizione in campioni di popolazione europea. Creazione di modelli di intervento per la realizzazione di campagne di educazione alimentare 3. Studio del meccanismo attraverso il quale il glutine della dieta opera nello sviluppo della malattia diabetica nel topo NOD. 4 Effetti immunomodulatori dell’interleuchina-10 nella celiachia. 5. Potenziale immunomodulatorio dell’ acido linoleico coniugato. 6. Purificazione ed identificazione di polifenoli presenti in alimenti selezionati e determinazione dell’attività biologica. 7 Individuazione dei fattori sensoriali intrinseci dei prodotti e dei fattori psicosociali che “guidano” la scelta del consumatore.


Selezione dei risultati conseguiti nel 2005. WP1:identificazione di anomalie metaboliche del metabolismo lipidico ed energetico correlate all’insulino-resistenza; WP2:descrizione di un’associazione inversa tra massa corporea e consumo di latte nei bambini come marcatore predittivo dell’obesità infantile (Br J Nutr. 2005; 93:15); studio di marcatori genetici del cromosoma Y in relazione a nutrizione e rischio cardiovascolare (Am J Hypertens 2005 in press). WP3:identificazione delle proprietà antitumorali di estratti di birre sulla crescita e differenziamento di cellule maligne (Nutr Cancer. 2005;52:74); WP4: risposta anticorpale (J Immunol. 2005;174:5830) ed effetto del glutine in topi diabetici (Diabetologia. 2005;48:931); potenziale immunomodulatorio dell’acido linoleico coniugato (J Cell Biochem. 2005;96:349); identificazione di epitopi gliadinici (J. Immunol. 2005 175:12); soppressione mediante interleuchina-10 della risposta immune alla gliadina in celiaci (Gut. 2005;54:46). WP5:identificazione di indicatori psico-sensoriali e salutistici della carne bufalina rispetto alla bovina.



Per motivi di ritardata erogazione del finanziamento, le attività hanno avuto inizio nel luglio 2005 e non nel gennaio 2005 come era previsto.

Collaborazioni

Le collaborazione avviate sono con i seguenti partner: 1. DIFARMA-Università degli studi di Salerno (referente Prof. Cosimo Pizza); 2. Provincia di Salerno (referente Dr. Domenico Ranesi ); 3. Regione Campania (referente Dr.ssa Tamara Linguiti ).

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Oltre ai vari settori riportati nel preventivo 2005 come oggetto di approfondimento, l’attività di promozione sarà estesa anche ai prodotti di seconda trasformazione a base di castagne, di nocciole, nonché ad alcune tipologie di prodotti da forno. Inoltre, la localizzazione delle operazioni riguarderà non solo i paesi nordafricani del bacino del Mediterraneo, ma anche i paesi del Mediterraneo Orientale, in particolare le Nazioni Balcaniche.


E’ in allestimento la creazione di una rete di marchi di qualità di prodotti agro-industriali del Mediterraneo e la creazione di un data base dei prodotti delle Dieta mediterranea, la cui attivazione è prevista per fine anno. L’attivazione del Centro per la promozione di reti di cooperazione e di scambi per la promozione delle imprese campane agro-alimentari per la tutela e la valorizzazione delle risorse eno-gastronomiche e medicinali del Mediterraneo sarà ufficializzata in occasione del convegno di presentazione del progetto MEDEA, che si terrà all’ISA il 15 e 16 dicembre 2005.

238


Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: ANTONIO MALORNI Elenco dei partecipanti liv. Barrasso Tommasino VII Caira Simonetta III Canonico Filomeno VII Carbone Virginia III Caruso Domenico VIII Cipriano Luigi VI De Caro Salvatore VI De Giulio Beatrice III Di Stasio Michele III

liv.Facchiano Angelo III Faruolo Clementina V Fierro Olga III Galdi Bruno VI Laurino Carmine IV Maietta Roberta VII Malorni Antonio I Mamone Gianfranco III Meccariello Clemente VIII

liv.Ombra Maria Neve III Ottombrino Antonio VI Perillo Bruno III Picariello Gianluca III Pocsfalvi Gabriella Katalin II Russo Gennaro VII Siciliano Rosa Anna III Sorrentino Alida III

Temi

Tematiche di ricerca WP1:Studi proteomici di linee cellulari tumorali e di sistemi di interesse nelle scienze dell'alimentazione. WP2:Sviluppo di tecniche basate sulla spettrometria di massa per identificazione rapida di batteri.WP3:Studi metabolomici di matrici alimentari. WP4:Studio delle componenti microbiche presenti negli alimenti e definizione delle attività svolte attraverso tecniche classiche e metodi basati sulla spettrometria di massa.WP5:Modelling di proteine e simulazioni di eventi molecolari correlati a patologie associate all'alimentazione.WP6:Studio e miglioramento di prodotti di acquacoltura

Stato dell'arte Le innovazioni tecno-strumentali degli ultimi anni hanno dato un forte impulso allo sviluppo di scienze “omiche”, di interesse nelle scienze della vita. La spettrometria di massa costituisce il nucleo centrale delle tecnologie per lo studio del proteoma e metaboloma, ed è affiancato dalla bioinformatica per quanto riguarda la gestione e analisi dei risultati. Grazie alla disponibilità di questa piattaforma tecnologica l’attività scientifica della commessa è incentrata su problematiche di importanza strategica nel campo della scienze dell’alimentazione. L'attività di ricerca è incentrata sulla caratterizzazione strutturale di bio(macro)molecole attraverso metodologie avanzate di spettrometria di massa, studi proteomici, studi metabolomici, studi di profili molecolari di sistemi biologici e di interesse alimentare.

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Azioni

Attività da svolgere Sviluppo e applicazione di metodologie avanzate di spettrometria di massa in proteomica e metabolomica per ricerche nel campo delle scienze dell'alimentazione. Applicazione di una metodologia basata sulla spettrometria di massa MALDI- TOF per l’identificazione rapida di batteri. Studio strutturale di proteine di interesse nel campo delle scienze dell’alimentazione. Studio delle componenti microbiche presenti negli alimenti e definizione delle attività svolte. Sviluppo e applicazione di metodologie bioinformatiche per lo studio di aspetti strutturali e funzionali di biomolecole. Studio e miglioramento di prodotti di acquacoltura

Punti critici e azioni da svolgere Mancanza di politiche per le grandi infrastrutture di ricerca per il finanziamento dell'aggiornamento e manutenzione delle apparecchiature in uso. Assunzione di un numero adeguato di unità di personale a tempo indeterminato e di avanzamenti di carriera del personale in organico per assicurare continuità nell’acquisizione di competenze specifiche e nel prosieguo delle attività della commessa. Disponibilità di contratti di ricerca a tempo determinato per la formazione di giovani ricercatori e possibilità di finanziare dottorati di ricerca. Disponibilità di finanziamenti da parte dell’Ente per ricerche di base e per l’avvio di nuovi temi di ricerca potenzialmente idonei all’inserimento in progetti finanziabili. E’ importante sottolineare che la Commessa fonda le proprie attività su risorse umane e strumentali derivate dal trasferimento presso l’ISA del Centro Internazionale di Servizi di Spettrometria di Massa, operazione per la quale il CNR ha investito un capitale cospicuo. Gli sforzi economici ed organizzativi fin qui attuati rischiano di essere vanificati senza un adeguamento delle risorse umane ed economiche, necessarie per mantenere in efficienza la struttura realizzata.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Nella presente macrolinea si integrano competenze nei seguenti settori Spettrometria di Massa, Chimica Analitica, Biochimica, Biologia Cellulare, Microbiologia e Bioinformatica. Tecniche analitiche: Tecniche cromatografiche ed elettroforetiche (mono e bidimensionale), Metodologie di spettrometria di massa (EI-MS, ICP-MS, MALDI-TOF-MS, ESI- MS e ESI-MS/MS, SELDI-MS) anche accoppiata alla cromatografia liquida e gassosa. Tecniche classiche di microbiologia per l’isolamento e la caratterizzazione fenotipica e tecnologica. Tecniche di coltura di linee cellulari e frazionamento subcellulare. Immunoprecipitazione della cromatina per lo studio della regolazione trascrizionale. Bioinformatica: creazione, gestione e interrogazione di banche dati; modellamento di proteine; analisi di dati da microarrays; sviluppo di nuovi strumenti bioinformatici.

Collaborazioni (partner e committenti) CNR: ICTP – Sez. di Catania (Dr. D. Garozzo); ISPAAM (Dr. A. Scaloni); ICB- Sez. Sassari (Dr. G. Palmieri); IGV (Prof. A. Leone, Dr. S. Grillo); IBP (Dr. S. D'Auria) Univ. di Napoli “Federico II”: Dipartimento di Scienze degli Alimenti (prof. F. Addeo); Dipartimento di Medicina Pubblica e Sicurezza Sociale (Prof. A. Acampora); Dipartimento di Medicina Sperimentale (Prof. N. Sannolo) Seconda Univ. di Napoli: CRISCEB (prof. G. Colonna); Dipartimento di Scienze della Vita (Prof. Parente); Dipartimento di Patologia Generale (prof. A. Weisz); Dipartimento di Medicina Sperimentale (Prof. P. Valenti) Univ. di Salerno: Dipartimento di Scienze Farmaceutiche (Prof. C. Pizza) Univ. di Udine Dipartimenti di Scienze degli Alimenti (Prof. G. Comi) Ist. Superiore di Sanità (Dr. F. Facchiano, Dr. F. Superti); Ist. Nazionale Tumori – Fondazione G. Pascale (Prof. G. Castello) Ist.Dermatopatico dell’Immacolata (Dr. A. Facchiano) Univ. College London, Dept.of Biochem.& Mol.Biol. (prof. ACR Martin), Ludwig Cancer Research Institute Staciòn experimental del Zaidìn - CSIC Granada, Spagna (Prof. I. Garcia Romera) Hungarian Academy of Science – MTA, Ungheria, (Prof. K. Vekey, Dott. P. Fzabo)

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Finalità

Obiettivi Studio di sistemi biologici di importanza nelle scienze dell'alimentazione attraverso scienze 'omiche' e tecniche di molecular profiling. Controllo della qualità microbiologica degli alimenti Studio con metodi bioinformatici e computazionali delle basi molecolari di patologie associate all'alimentazione. Inizio realizzazione infrastrutture per acquacoltura

Risultati attesi nell'anno Risultati scientifici: Pubblicazioni Scientifiche Metodologie Analitiche Risultati tecnologici: inizio realizzazione infrastrutture per acquacoltura Protocolli Banche Dati Brevetti

Potenziale impiego - per processi produttivi Messa a punto di protocolli di indagine rapidi e accurati da impiegare nel monitoraggio di processi produttivi e per il controllo di qualità. Valorizzazione di prodotti attraverso valutazioni quali/quantitative di molecole di particolare interesse sia in campo alimentare che farmacologico

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Messa a punto di metodologie proteomiche, metabolomiche e di molecular- profiling per la determinazione di biomarkers di patologie degenerative correlate all’alimentazione. Identificazione in matrici alimentari di molecole con particolari attività nutrizionali e con specifiche attività biologiche al fine di valorizzarne il loro utilizzo per particolari classi di consumatori.

Moduli

Modulo: Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell'Alimentazione

Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9556 546 38 0 1140 36 620 319 N.D. 1495




241






Altro Totale

0 2 2 2 0 2 2 1 2 13




Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: FILOMENA NAZZARO Elenco dei partecipanti liv. Barrasso Tommasino VII Caira Simonetta III Cammarota Giancarlo III Canonico Filomeno VII Caruso Domenico VIII Cipriano Luigi VI D'Acierno Antonio III De Prisco Pietro Paolo III

liv.Fierro Olga III Galdi Bruno VI Graziani Maria Paola III Laurino Carmine IV Maietta Roberta VII Mamone Gianfranco III Meccariello Clemente VIIINazzaro Filomena III

liv.Ottombrino Antonio VI Pellicano Mario Paolo III Picariello Gianluca III Pizzano Rosa II Russo Gennaro VII Russo Gian Luigi II Sada Alfonso III Volpe Maria Grazia III

Temi

Tematiche di ricerca Le tematiche di ricerca sviluppate all'interno della commessa possono essere così riassunte: WP 1. TECNOLOGIE INNOVATIVE DI TRASFORMAZIONE E CONSERVAZIONE PER STARTER E ALIMENTI WP.2.COMPOSIZIONE, QUALITA', TIPICITA' E GENUINITA' DEGLI ALIMENTI WP.3.IDENTIFICAZIONE DELLE SOSTANZE TOSSICHE, CHIMICHE E MICROBIOLOGICHE NELLA FILIERA AGRO-ALIMENTARE WP.4.REALIZZAZIONE DI BANCA DATI SUI PRODOTTI ALIMENTARI WP.5.INNOVAZIONE NELLA PRODUZIONE DI PASTA ALIMENTARE (FRESCA E SECCA) MEDIANTE LA SELEZIONE E IL CONTROLLO DEI PROCESSI CHIMICO-FISICI E L'USO DI COADIUVANTI NATURALI

Stato dell'arte Nel mercato agro-alimentare moderno è sempre più forte l’esigenza di fornire al consumatore prodotti con standard qualitativi e di sicurezza più elevati. Il mondo scientifico e quello industriale si stanno adoperando, spesso in sinergia, per il raggiungimento di tali obiettivi attraverso lo sviluppo di tecnologie innovative. A ciò si aggiunga che il legame sempre più stretto tra alimentazione e "well being", rende indispensabile una maggiore conoscenza delle varie componenti degli alimenti . L’attività di ricerca della commessa è finalizzata allo studio della qualità nutrizionale ed organolettica degli alimenti, allo studio e valorizzazione delle produzioni aventi vocazione territoriale, all’analisi ed al controllo della filiera agro-alimentare nonché allo sviluppo di tecnologie innovative

242


nei processi di trasformazione e conservazione degli alimenti.L’utilizzo di innovative metodologie biochimiche, microbiologiche e tecnologiche, nonché l'uso di Panel Test, consentono lo svolgimento di attività di elevato contenuto tecnico- scientifico.

Azioni

Attività da svolgere Le attività che si prevede svolgere nel corso del 2006, possono essere schematicamente suddivise nei seguenti Working Packages (WP): WP1. Studio ed applicazione di tecnologie innovative di trasformazione e conservazione di alimenti, con particolare riferimento a prodotti lattiero caseari, insaccati, ortofrutta. WP2. Composizione, qualità, tipicità, genuinità ed accettabilità degli alimenti, con particolare riferimento a prodotti di origine vegetale, prodotti carnei, prodotti lattiero caseari, prodotti a base di cereali. WP3. Identificazione delle sostanze tossiche, chimiche, di interesse microbiologico e salutistico nella filiera agro alimentare. WP4. Realizzazione di Banca Dati su prodotti alimentari.

Punti critici e azioni da svolgere La fattibilità della commessa dipende anche dalla disponibilità finanziaria e di personale da dedicare agli obiettivi presentati. E' perciò auspicabile che il Dipartimento agricolo-alimentare sostenga il programma di ricerca presentato dalla commessa, rispondendo alle richieste di personale e fondi avanzate. Altri punti critici individuati dalla Commessa sono rappresentati dalla scarsa disponibilità delle aziende agro alimentari presenti sul territorio alla collaborazione con le strutture scientifiche per la valorizzazione dei prodotti alimentari, e da una certa difficoltà riscontrata nella costituzione di filiere agroalimentari. Le Condizioni di fattibilità possono essere riconducibili, inoltre, all' Approvazione della presente commessa ed all' approvazione e finanziamento dei progetti in fase di valutazione

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Alla commessa afferiscono ricercatori e personale esterno,con competenze scientifiche e tecniche in: Chimica,Biochimica,Microbiologia,Immunochimica,Spettrometria di massa,Spettrofotometria ad Assorbimento atomico,Cromatografia ed Elettroforesi,Biotecnologie,Tecnologie Alimentari, Progettazione e sviluppo di applicazioni web; Sviluppo di sistemi innovativi di imballaggio; Analisi sensoriale e consumer science per l'individuazione degli indicatori oro-sensoriali e psico-sociali inerenti le produzioni alimentari.Esse verranno utilizzate anche per possibili attività di servizio a supporto di PMI.

Collaborazioni (partner e committenti) Le Università di: Napoli-"Federico II" (referenti Prof Addeo, Ferranti, Sansone, Picariello); Molise(referenti Prof Coppola, Prof Naclerio); Bari (ref Prof Di Luccia); Salerno(DIFARMA);University of Brighton, UK (ref Dr Santin)Hamburg University, D (ref Prof Bisping) Hame Polytechnic,Finland (ref Drssa Kautola); CNR-Istituto di Genetica Vegetale -Sezione di Portici (ref Drssa Tucci). CNR-Istituto di Chimica Biomolecolare CNR (ref Drssa Nicolaus; Dr R. De Prisco)Istituto di Chimica e Tecnologia dei Polimeri CNR (ref Dr Malinconico, dr E. Fiore)-Istituto di Biochimica delle Proteine. CNR (ref Dr La Cara, Dr Orlando)- Istituto per lo Studio dei Materiali Nanonstrutturati-CNR (ref Dr Cacace). CHELAB S.r.l.(ref Dr Commissati, Drssa Cattapan); Istituto Zooprofilattico-Portici (NA); ISTA- Dompè; Bioma Srl (ref Dr Bartoli);ISZ-Portici(ref Dr Sandulli) (CH); Menarini S.r.l. Pomezia(ref Dr Raucci)

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Finalità

Obiettivi Le attività previste in questa commessa sono mirate all’ottenimento dei seguenti obiettivi generali: • Analisi, valutazione e gestione della qualità, della composizione e della sicurezza dei prodotti alimentari • Sviluppo di metodologie innovative nei processi di trasformazione, conservazione e confezionamento degli alimenti.

Risultati attesi nell'anno Pubblicazioni scientifiche; Brevetti; Progettazione e realizzazione di prototipi; Elaborazione di Protocolli sperimentali e metodologie analitiche; Banca dati consultabile via web;

Potenziale impiego - per processi produttivi I risultati ottenuti nel corso delle ricerche contribuiscono ad una conoscenza della qualità nutrizionale ed organolettica degli alimenti, attraverso l'identificazione più puntuale delle loro specificità biochimiche a forte impatto salutistico.Lo sviluppo di tecnologie innovative e l’utilizzo di packaging innovativi,contribuiscono,inoltre, alla tutela ed alla valorizzazione delle produzioni alimentari e alla realizzazione di prodotti in possesso di migliorate caratteristiche igienico-sanitarie, nutrizionali, tecnologiche e sensoriali. Tali caratteristiche possono essere utilizzate dagli imprenditori per la realizzazione di prodotti a qualità certificata e sempre più rispettosi dei parametri di sicurezza.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Lo sviluppo del “mercato globale” impone con urgenza una normativa condivisa tra i continenti a tutela della salute del consumatore. La disponibilità sempre crescente di alimenti provenienti da ogni angolo del mondo,inoltre, non solo diversifica di fatto le tendenze di consumo degli utenti ma , necessariamente , porterà ad una loro classificazione in base alla loro “tipicità” ed alla loro valenza nutrizionale e salutistica. In questo senso si ritiene che i risultati ottenuti ed ottenibili per il futuro possano ricadere nella gestione “industriale” dei prodotti anche per le possibili ricadute sul benessere della popolazione, con prodotti che presentino maggiori garanzie di salubrità ed elevato valore nutrizionale , consentendo anche l’espressione di un valore aggiunto in termini salutistici e sensoriali, e di tipicità delle produzioni mediterranee.

Moduli

Modulo: Tecnologie, Tracciabilità e Sicurezza degli Alimenti Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9442 241 236 0 919 13 490 312 N.D. 1244


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Altro Totale

0 0 0 0 0 5 3 1 0 9




Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIAN LUIGI RUSSO Elenco dei partecipanti liv. Barba Gianvincenzo III Barrasso Tommasino VII Bergamo Paolo III Cammarota Giancarlo III Canonico Filomeno VII Caruso Domenico VIII Cipriano Luigi VI Clemente Gennaro III Esposito Teresa III Fierro Olga III

liv.Galdi Bruno VI Giacco Rosalba II Gianfrancesco Fernando III Gianfrani Carmela III Graziani Maria Paola III Iacomino Giuseppe III Maietta Roberta VII Maurano Francesco III Mazzarella Giuseppe III Meccariello Clemente VIII

liv.Ottombrino Antonio VI Pellicano Mario Paolo III Pizzano Rosa II Rossi Mauro II Russo Gennaro VII Russo Gian Luigi II Russo Maria VII Russo Paola III Siani Alfonso II Tedesco Idolo V

Temi

Tematiche di ricerca Di seguito sono riportate le tematiche di ricerca attive nella commessa: 1. effetti sulla nutrizione ed il metabolismo della Dieta Mediterranea; 2. epidemiologia e genetica delle popolazioni applicate alle cardiovascolari e metaboliche; 3. immunobiologia dell’intestino nella patologia celiaca; 4. efetti chemiopreventivi di antiossidanti (polifenoli) presenti nella dieta; 5. Consumer Science (applicazione dell’analisi sensoriale ai consumatori per verificare l’accettabilità del mercato all’inserimento di prodotti nutraceutici). Per una descrizione dettagliata dei temi di ricerca si rimanda al sito http://contab.cnr.it/ (prog. scientifica e previsione risorse 2004-06; cod. 076-ISA.02).

Stato dell'arte I fattori dietetici giocano un ruolo fondamentale nello sviluppo o nella prevenzione di alcune fra le più diffuse patologie dell’uomo. Nella macrolinea “Alimenti e Salute dell’Uomo” operano gruppi di

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ricerca che, utilizzando approcci multidisciplinari all’avanguardia, sono impegnati nello studio di alcune tra le più importanti patologie umane correlate all’alimentazione quali: le intolleranze alimentari, la prevenzione di patologie cronico-degenerative (neoplasie, malattie cardiovascolari) e del metabolismo (obesità, diabete).

Azioni

Attività da svolgere Di seguito sono riportate le aree di studio afferenti alla commessa. 1.Identificazione di alimenti tipici della dieta Mediterranea ad effetto favorevole sulla salute; 2.Identificazione di predittori genetici di malattie cardiovascolari; 3.Studio rapporto diabete e celiachia; probiotici ed enteropatie; 4.Studio del meccanismo d'azione di polifenoli mediante modelli in vitro, ex vivo; in vivo; 5.Applicazione dell'analisi sensoriale alla preferenza del consumatore per nuovi prodotti.

Punti critici e azioni da svolgere La fattibilità della commessa dipende dalla disponibilità finanziaria e di personale da dedicare agli obiettivi presentati. Nel passato, la commessa è stata in grado di autofinanziarsi utilizzando fondi pubblici e/o privati. E' auspicabile che nel triennio 2004-06, il Dipartimento agricolo-alimentare di nuova formazione sostenga il programma di ricerca presentato dalla commessa, rispondendo alle richieste di personale e fondi avanzate.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenza presenti nella commessa e relative ai diversi laboratori partecipanti sono di seguito elencate: 1. Nutrizione e Metabolismo: nutrizione clinica, metabolismo, biochimica clinica; tecniche diagnostiche non invasive (ecografiche); 2. Epidemiologia e Genetica delle Popolazioni: epidemiologia e biostatistica, epidemiologia nutrizionale; biologia molecolare, genetica di popolazione; 3. Immunobiologia dell’intestino: immunologia, biologia cellulare e molecolare, biochimica, modelli animali; 4. Chemioprevenzione alimentare: biologia cellulare e molecolare, biochimica, microbiologia; 5. Consumer science; psicologia, fisiologia.

Collaborazioni (partner e committenti) La commessa si avvale di numerose collaborazioni nazionali ed internazionali tra cui: Dipartimenti di Medicina Clinica e Sperimentale, Pediatria, Fisiologia, Scienze degli Alimenti, Scienze Biologiche, Medicina Sperimentale dell’ Università di Napoli “Federico II”; Istituto Superiore di Sanità (Roma); Dpt. of Community Health Science, S. George's Hospital Medical School (London, UK); Istituto Nazionale per lo Studio e la Cura dei Tumori (Milano); Laboratoire du Stress Cardiovasculaire et Pathologies Associées, UFR de Médecine et Pharmacie (La Tronche, France) ; Università Cattolica del Sacro Cuore (Campobasso); Mayo Clinic (Rochester, MN, USA); Telethon Institute for gene Therapy (Milano); Reparto di Ematologia e Gastroenterologia, Ospedale Moscati (Avellino); La Jolla Institute for Allergy and Immunology (San Diego, CA); Istituto Nazionale di Ricerca per gli Alimenti e la Nutrizione (Roma); Dip Medicina Sperimentale e Patologia, Università La Sapienza (Roma); Metapontum Agrobios, Metaponto (MT); Istituto Biostruttura e Bioimmagini, CNR (Napoli); Facoltà di Agraria, Università di Foggia; Stazione Zoologica "Anton Dohrn” (Napoli).

Finalità

Obiettivi La “commessa”, così come intesa nel nuovo ordinamento del CNR, prevede la definizione di una “tripletta” operativa che identifichi un metodo, un oggetto di studio ed un obiettivo. Nel caso della presente commessa, Alimenti e Salute dell’Uomo, mediante un approccio metodologico di laboratorio e clinico (metodo) s’intende studiare la relazione dieta- patologia umana (oggetto) con la

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finalità di prevenire o correggere tale patologie (obiettivo). Più in dettaglio si valuteranno: 1. i meccanismi dell’insulino- resistenza; 2. l’interazione tra abitudini alimentari e fattori genetici in popolazioni italiane ed europee; 3. i meccanismi dell'infiammazione intestinale indotta dal glutine; 4. i meccanismi d’azione dei flavonoidi presenti negli alimenti dotati di attività chemiopreventiva (Per una descrizione dettagliata si veda:http://contab.cnr.it/(prog. scientifica e previsione risorse 2004-06; cod. 076-ISA.02)

Risultati attesi nell'anno 1.Identificazione di marker metabolici precoci di predisposizione all'obesità; 2.Creazione di una banca biologica e genetica relativa a un'ampia popolazione europea 3.Meccanismo d'azione dell'intolleranza alimentare indotta dal glutine 4.Individuazione dei bersagli molecolari dei flavonoidi in cellule leucemiche ed in modelli animali. 5.Profilo sensoriale dei prodotti freschi e conservati. (Si veda:http://contab.cnr.it/ prog.scientifica 2004-06;cod.076-ISA.02)


- per risposte a bisogni individuali e collettivi Sono prevedibili ricadute applicative in due settori: sanitario ed agroalimentare. In termini di salute pubblica, a medio e lungo termine l’azione della commessa potrà contribuire a ridurre la spesa pubblica del Sistema Sanitario Nazionale relativa alla cura di patologie correlate all’alimentazione mediante interventi “preventivi” derivati dal risultato delle ricerche in atto. Le aziende del comparto agroalimentare (produzione, trasformazione, commercializzazione) potranno incrementare il proprio fatturato introducendo sul mercato (o aumentandone la produzione) prodotti che rispondono alle caratteristiche nutrizionali evidenziate in studi simili a quelli qui proposti.

Moduli

Modulo: Alimenti e salute dell'uomo Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9684 276 167 0 1127 300 743 327 N.D. 1754




247






Altro Totale

3 3 2 1 0 6 2 1 9 27




Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti di sviluppo competenze Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MARIA GRAZIA VOLPE Elenco dei partecipanti liv. Barba Gianvincenzo III Barrasso Tommasino VII Bergamo Paolo III Caira Simonetta III Cammarota Giancarlo III Canonico Filomeno VII Carbone Virginia III Caruso Domenico VIII Cipriano Luigi VI Clemente Gennaro III D'Acierno Antonio III De Caro Salvatore VI De Giulio Beatrice III De Prisco Pietro Paolo III Di Stasio Michele III Esposito Teresa III Facchiano Angelo III

liv.Faruolo Clementina V Fierro Olga III Galdi Bruno VI Giacco Rosalba II Gianfrancesco Fernando III Gianfrani Carmela III Graziani Maria Paola III Iacomino Giuseppe III Laurino Carmine IV Maietta Roberta VII Malorni Antonio I Mamone Gianfranco III Maurano Francesco III Mazzarella Giuseppe III Meccariello Clemente VIIINazzaro Filomena III Ombra Maria Neve III

liv.Ottombrino Antonio VI Pellicano Mario Paolo III Perillo Bruno III Picariello Gianluca III Pizzano Rosa II Pocsfalvi Gabriella Katalin II Rossi Mauro II Russo Gennaro VII Russo Gian Luigi II Russo Maria VII Russo Paola III Sada Alfonso III Siani Alfonso II Siciliano Rosa Anna III Sorrentino Alida III Tedesco Idolo V Volpe Maria Grazia III

Temi

Tematiche di ricerca Studi per la promozione di prodotti di seconda trasformazione a base di nocciole, castagne e prodotti da forno. Valorizzazione di olii aromatizzati campani e di specie aromatiche campane.Costituzione di network internazionale nell'area mediterranea. Trasferimento tecnologico dei risultati ottenuti.Costruzione di sito web dedicato.

Stato dell'arte L'internazionalizzazione è la scelta strategica per il futuro delle imprese, ed il mercato attuale è caratterizzato da fenomeni di globalizzazione. La progettualità relativa alla razionalizzazione e modernizzazione del settore collegato alla “Dieta Mediterranea” potrà essere favorita esclusivamente se sostenuta da professionalità in grado di fornire l’assistenza necessaria a garantire un raccordo fra

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le strategie operative adottate dagli operatori locali con la politica di programmazione promossa dalle Amministrazioni locali, nazionali e sopranazionali.

Azioni

Attività da svolgere Nell'ambito del 2006 saranno effettuate le seguenti attività: un Convegno tematico di approfondimento; cerimonie ufficiali; tavole rotonde; conferenze stampa; forum di addetti culturali ed economici delle ambasciate dei Paesi euro-mediterranei ospiti; dibattiti; focus tematici dei rappresentanti delle categorie produttive campane e delle categorie del commercio dei Paesi euro-mediterranei coinvolti; focus tematici dei rappresentanti delle amministrazioni per il dialogo interistituzionale; presentazioni dei Paesi Ospiti Ufficiali e delle loro tradizioni alimentari e storico-culturali; incontri di approfondimento settoriale.

Punti critici e azioni da svolgere La realizzazione degli obiettivi del progetto è legata ad un'alta interazione tra i partners.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine L'Istituto di Scienze dell’Alimentazione (ISA- CNR) del Consiglio Nazionale delle Ricerche, in Avellino, è un istituto di ricerca multidisciplinare, che presenta competenze in diversi campi delle scienze dell’alimentazione. I suoi obiettivi sono orientati sia all'approfondimento delle conoscenze nell'ambito delle scienze dell'alimentazione, che verso il settore applicativo. L'approfondimento delle conoscenze di base trova un suo naturale sbocco nella valorizzazione sia di un modello alimentare della dieta mediterranea, che è divenuto uno dei modelli ideali per il mantenimento della salute, sia di singoli alimenti tipici, con conseguenti proposte di adeguamento allo sviluppo tecnologico delle procedure produttive dell'agricoltura e dell'industria alimentare.

Collaborazioni (partner e committenti) Partners: Dipartimento di Scienze Farmaceutiche DIFARMA - Università degli Studi di Salerno (referente prof. Cosimo Pizza) Provincia di Salerno (referente Dott. Domenico Ranesi) Committente: Regione Campania - Assessorato Rapporti con i Paesi del Mediterraneo (On. Antonio Valiante)

Finalità

Obiettivi L'obiettivo principale della proposta progettuale è la costituzione di un Centro per la promozione di reti di cooperazione e di scambi per la promozione delle imprese campane agro-industriali per la tutela e la valorizzazione delle risorse gastronomiche e cosmetiche del Mediterraneo, centro di eccellenza nel campo della ricerca applicata alla Dieta Mediterranea.

Risultati attesi nell'anno A medio termine: creazione di una rete di partenariato tra paesi mediterranei nel'ambito della Dieta mediterranea e delle essenze vegetali per uso cosmetico. Creazione di un data base delle aziende campane realativa ai prodotti oggetti di studio.Implementazione del sito web. Momenti di confronto rivolti a tutti i soggetti interessati,in particolare aziende agro-industriali ed enti di ricerca.

Potenziale impiego - per processi produttivi La proposta progettuale vuole integrare il sistema ricerca e l’industria, utilizzando standard di comunicazione elevati uniti da un network internazionale, che si completa e si allarga con il supporto

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della Pubblica Amministrazione e di tutte le Istituzioni e gli Enti operanti sul territorio e delle agenzie locali di sviluppo e promozione.


Moduli

Modulo: MEDeA: MEDiterraneo ed Alimentazione Istituto esecutore: Istituto di scienza dell'alimentazione Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9318 176 400 0 894 334 910 304 N.D. 1532








Altro Totale

0 0 0 0 0 0 0 0 0 0



250



FILOMENA NAZZARO Incidenza degli xenobiotici sui livelli di qualità della filiera agro-alimentare: Analisi comparativa in zone a diverso impatto antropico ed agro-industriale dell'Italia Meridionale

MICHELE DI STASIO EFFETTI DEL LIVELLO DEI LIPIDI SULLE PERFORMANCE NUTRIZIONALI DELLE SPECIE ITTICHE DI INTERESSE ZOOTECNICO: Rombo (Scolphtalmus Maximus, ), Spigola (Dicentrarchus Labrax), Orata (Sparus Aurata)

MARIA GRAZIA VOLPE Tecnologie sostenibili per l'ottenimento di alimenti a lunga conservazione

ANTONIO MALORNI Processi biotecnologici applicati al campo alimentare

GIANFRANCO MAMONE Identificazione, caratterizzazione e sintesi di molecole biologicamente attive presenti in matrici di origine alimentare

ANTONIO D'ACIERNO REALIZZAZIONE DI UN SISTEMA INFORMATIVO WEB BASED PER L'ARCHIVIAZIONE E L'IDENTIFICAZIONE DI SPETTRI MALDI

PIETRO PAOLO DE PRISCO Monitoraggio di alcuni minerali in adolescenti: valutazioni nutritive e salutistiche

ANGELO FACCHIANO Basi molecolari della galattosemia: studio delle mutazioni dell�enzima galattosio-1-fosfato uridililtransferasi (GALT) mediante simulazioni molecolari e strumenti bioinformatici

ROSALBA GIACCO Effetti di una dieta ricca in cereali integrali sui fattori di rischio cardiovascolare

BRUNO PERILLO Studio del meccanismo molecolare attraverso il quale gli estrogeni ed i fitoestrogeni inducono l'espressione di bcl-2 inibendo l'apoptosi in cellule di carcinoma mammario.

ROSA PIZZANO Metodologie analitiche avanzate per la definizione del potenziale allergenico delle singole componenti proteiche del sistema �latte�

GABRIELLA POCSFALVI Spettrometria di Massa di Affinità in Fase Solida per la Rivelazione Sensibile e Specifica di Biomolecole e Complessi Molecolari in Matrici Complesse

GIAN LUIGI RUSSO Biochip per la valutazione della tossicità alimentare nell�uomo

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PAOLA RUSSO IDENTIFICAZIONE DI VARIANTI GENETICHE DELLA REGIONE MSY DEL CROMOSOMA Y COINVOLTE NELLO SVILUPPO DI MALATTIE COMPLESSE A DIMORFISMO SESSUALE

ALFONSO SADA Additivi alimentari di origine vegetale

ROSA ANNA SICILIANO �Molecular profiling� di alimenti mediante spettrometria di massa MALDI-TOF

PAOLO BERGAMO Effetto dell'Acido Linoleico Coniugato (CLA) sulla risposta autoimmune di topi MRL/lpr

VIRGINIA CARBONE Definizione del profilo molecolare di composti con proprietà antiossidanti in estratti provenienti da differenti frutti di bosco tipici dell'area mediteranea mediante tecniche avanzate di spettrometria di massa.

GENNARO RUSSO Ricerca a tema libero su Processi di Combustione di gas, liquidi e solidi

ARTURO LEONE Ricerca di base ed applicata finalizzata ad arricchire le conoscenze scientifiche e metodologiche nel settore agroalimentare e biomedico

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione Le attività di ricerca dell’ISA sono state ripartite in quattro Commesse, tutte svolte interamente da personale del medesimo Istituto. In breve sono riportati gli elementi di autovalutazione dell’attività svolta nel 2005: I. Le tematiche di ricerca attive nella commessa “Alimenti e Salute dell’Uomo” (ASU-ISA) sono le seguenti: 1. effetti sulla nutrizione ed il metabolismo della Dieta Mediterranea; 2. epidemiologia e genetica delle popolazioni applicate alle cardiovascolari e metaboliche; 3. immunobiologia dell’intestino nella patologia celiaca; 4. effetti chemiopreventivi di antiossidanti (polifenoli) presenti nella dieta; 5. Consumer Science (applicazione dell’analisi sensoriale ai consumatori per verificare l’accettabilità del mercato all’inserimento di prodotti nutraceutici). L’attività dell’ASU-ISA riguarda, in generale, lo studio dei fattori dietetici che giocano un ruolo fondamentale nello sviluppo o nella prevenzione di alcune fra le più diffuse patologie dell’uomo. I gruppi di ricerca che operano in tale commessa, utilizzando approcci multidisciplinari all’avanguardia, sono impegnati nello studio di alcune tra le più importanti patologie umane correlate all’alimentazione quali: le intolleranze alimentari, la prevenzione di patologie cronico-degenerative (neoplasie, malattie cardiovascolari) e del metabolismo (obesità, diabete). I risultati ottenuti dall’ASU-ISA sono in linea con la progettazione prevista per il 2005. Come riassunto dal Responsabile di Commessa proposto, dott. Gian Luigi Russo, nell’apposita scheda consuntiva, tutti i workpackages (WPs) previsti hanno prodotto risultati pubblicati su riviste internazionali dotate di un sistema di peer review. In due casi, WP1 e WP5, i dati ottenuti sono in corso di completamente e saranno, probabilmente pubblicati nel 2006. Per motivi di spazio, sono stati selezionati e riportati nel pre-consuntivo 2005 solo i lavori eseguiti dai gruppi afferenti all’ASU-ISA che meglio rispecchiano la missione dell’Istituto Esecutore e del Dipartimento Agroalimentare. In realtà, la produzione scientifica 2005 della commessa è ulteriormente arricchita da pubblicazioni ottenute in collaborazione con altri gruppi. Tali lavori mettono in evidenza le competenze scientifiche dell’ASU-ISA nei settori dell’epidemiologia, della nutrizione, dell’immunologia e della regolazione dei processi di crescita e differenziamento cellulare. II. Le attività di ricerca della Commessa “Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell'Alimentazione” sono state articolate nell’anno 2005 nelle seguenti linee: - Sviluppo e applicazione di metodologie analitiche innovative per studi proteomici e metabolomici; - Messa a punto di metodologie basate sulla spettrometria di massa MALDI-TOF per l'identificazione rapida di batteri; - Controllo della qualità microbiologica degli alimenti attraverso il monitoraggio di tossine batteriche mediante tecniche classiche e metodi basati sulla spettrometria di massa. - Studio delle caratteristiche strutturali e funzionali di proteine attraverso metodi computazionali e bioinformatici. Nell’ambito di questi temi di ricerca sono stati ottenuti risultati di rilevante interesse, in linea con quanto previsto dal Piano di Gestione 2005, che sono stati oggetto di numerose pubblicazioni scientifiche su riviste internazionali. Altre pubblicazioni su questi risultati sono in preparazione e presumibilmente saranno pubblicati nel corso del 2006. Questi risultati sono stati raggiunti grazie alla sinergia di due fattori. Il primo attiene alla forte integrazione di competenze multidisciplinari presenti nella commessa, che spaziano dalla chimica analitica alla microbiologia, dalla biochimica alla biologia cellulare e alla bioinformatica. Il secondo è legato ai notevoli avanzamenti tecnologici registrati negli ultimi anni nel campo della spettrometria di massa che, incrociando le problematiche delle scienze “omiche”, ha prodotto sostanziali miglioramenti nei metodi di ionizzazione di biomacromolecole e disegnato nuove geometrie per la separazione e misura delle masse molecolari, permettendo il raggiungimento di sensibilità sub-femtomolari nel campo dello studio delle proteine. La Commessa può contare sulle strumentazioni più sofisticate oggi disponibili sul mercato e su competenze tecnologiche e metodologiche all’avanguardia nei campi sopraelencati. Per quanto detto, il gruppo di ricerca occupa un ruolo di primo piano nel panorama scientifico nazionale , come dimostrato anche dalle numerose collaborazioni con strutture pubbliche e private e con centri di ricerca internazionali. III. Le attività di ricerca previste nell’ambito della Commessa "Tecnologie, Tracciabilità e Sicurezza degli Alimenti" mirano all’ottenimento di due obiettivi generali: a) Controllo della qualità, della composizione,della genuinità e valutazione della sicurezza dei prodotti alimentari; b) Sviluppo di metodologie innovative nei processi di trasformazione,conservazione e confezionamento degli alimenti. L’utilizzo di metodologie biochimiche, microbiologiche e tecnologiche, nonché l’analisi sensoriale, hanno consentito, nel 2005, lo svolgimento di attività di elevato contenuto tecnico-scientifico. Tra i risultati più significativi sono da menzionare lo studio concernente l’utilizzo di estratti naturali come sostituti di additivi chimici (es. nitrati) per

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la lavorazione dei salumi, che ha costituito la premessa per la presentazione di un progetto della UE, che avrà inizio nel 2006, e l’ulteriore impulso dato alle tecnologie alimentari, con lo studio del possibile utilizzo di biopolimeri nel packaging di prodotti alimentari (mozzarella). Nel complesso dell’attività di commessa, i risultati ottenuti sono in linea con la progettazione prevista per il 2005. Le attività previste hanno prodotto risultati pubblicati su riviste nazionali ed internazionali. L’unico scostamento di rilievo è legato al WP5, che non è ancora partito per la mancata erogazione del relativo finanziamento. I punti critici rimangono quelli già descritti nel piano annuale 2005. Piccoli passi sono stati fatti per una più fattiva collaborazione con aziende agroalimentari, per lo studio e la valorizzazione di prodotti agroalimentari. Un punto critico fondamentale rimane la mancanza di risorse finanziarie adeguate e di personale, per cui si auspica che si sostenga l’attività della commessa rispondendo anche alle richieste avanzate in passato. Le collaborazioni sono quelle preventivate per il 2005, a livello nazionale, con diverse università ed istituti CNR e, a livello internazionale, con enti privati e pubblici di ricerca;esse sono scaturite da partecipazioni a comuni progetti di ricerca. IV. Le attività svolte nell’ambito della Commessa “MEDeA: MEDiterraneo ed Alimentazione” hanno avuto inizio nel Luglio 2005. L’obiettivo principale del progetto è la costituzione di un Centro per la promozione di reti di cooperazione e di scambi per la promozione delle imprese campane agro-industriali per la tutela e la valorizzazione delle risorse gastronomiche e medicinali del Mediterraneo. Nelle prime fasi si è proceduto alla creazione di una segreteria di coordinamento del centro e di un sito web, nonché all’analisi mediante la creazione di banche dati delle aziende campane operanti nell’ambito dei settori di interesse del progetto. Un primo momento di incontro è previsto in Dicembre in un Convegno di presentazione del Progetto, cui parteciperanno rappresentanti delle Aziende, degli Enti di ricerca e degli organismi di Categoria regionali (Camere di Commercio, Confartigianato, Coldiretti, Confcommercio, Associazione Industriali), nonche’ dei rappresentanti dell’Istituto del Commercio Estero presenti nei paesi del Nord Africa e Balcanici. Risulta ancora prematuro dare un giudizio qualitativo sul progetto, in quanto ancora nelle sue fasi iniziali. La maggiore, e prevedibile, difficoltà è e sarà l’organizzazione partenariale tra Enti Pubblici e privati, e le Aziende e gli organismi di Categoria nazionali ed internazionali.

Proposta di interventi organizzativi I problemi organizzativi avutisi nel corso del 2005 riguardano due aspetti: strutturali e progettuali. Strutturali: l’erogazione della quota parte dei fondi di dotazione, pari al 75%, ha provocato, specialmente nel secondo semestre dell'anno,un diffuso stato di sofferenza nella gestione dell’ISA, i cui costi sono chiaramente valutabili e superiori a quanto erogato dall’Ente. E’ da sottolineare che, nonostante il prelievo di quote (overhead) dai progetti di ricerca, il flusso finanziario non ha consentito ad esempio interventi strutturali importanti per la conservazione dell’immobile, proprietà dell’Ente (ad es. manutenzione infissi finestre, aumento capitali assicurativi, altro). Si auspica che in futuro si prevedano modalità di finanziamento che escludano il ripetersi di tali situazioni. Progettuali: l’Istituto ha mostrato buona capacità di autofinanziamento attraverso fondi pubblici (Europei e Nazionali e Regionali) e, in misura minore, privati. Tuttavia, considerando la discontinuità nell’erogazione dei finanziamenti per la ricerca scientifica nel nostro Paese, è auspicabile che il Dipartimento Agro-Alimentare assicuri la continuità scientifica delle commesse con finanziamenti ad hoc per la formazione (dottorandi), il personale a tempo determinato (assegni di ricerca), l’attività di ricerca (consumabile, piccole apparecchiature, contratti di manutenzione), allorquando se ne verificasse la momentanea esigenza. La necessità di personale a tempo indeterminato (ricercatori e tecnici), anch’essa critica, va probabilmente inquadrata in un più generale discorso nazionale di politica occupazionale dell’Ente. Inoltre è da sottolineare che alla Commessa “Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell'Alimentazione” afferisce un patrimonio strumentale, di proprietà CNR, di notevole importanza, tra cui ben tredici spettrometri di massa, compreso quello a quattro settori ZAB-T, unico in Italia. L’insieme di tali apparecchiature si configura come un patrimonio classificabile quale “Grande Infrastruttura di Ricerca” (GIR) a sostegno delle quali la Comunità Scientifica da tempo chiede la messa in essere di un’adeguata politica scientifica. La dimensione dei finanziamenti pubblici sia a livello nazionale che internazionale, non è tale, infatti, da poter consentire la gestione di un parco strumenti di questa complessità per cui, a meno di non voler perdere competitività internazionale, la questione delle GIR si pone nella sua difficile contingenza e attualità. Pertanto si auspica che, ove mai il Dipartimento Agro-Alimentare non fosse in grado di far fronte alle esigenze economiche di questa e di altre GIR, il problema venga affrontato a livello interdipartimentale oppure costituendo una Struttura di Coordinamento e Finanziamento delle GIR a livello Centrale.

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ISTITUTO DI SCIENZE DELLE PRODUZIONI ALIMENTARI Missione

Accrescere attività di ricerca finalizzate al miglioramento della qualità e della sicurezza dei prodotti agro-alimentari di origine vegetale ed animale mediante approcci multidisciplinari e innovativi con l’impiego di biotecnologie, diagnostica avanzata e sistemi di produzione ecocompatibili. Direttore: Dott Angelo Visconti Sede principale: Via Amendola, 122/O - 70126 Bari BA Puglia Superficie immobile: XX mq

Articolazione territoriale: c/o Dip. Scienze e tecnologie alimentari e microbiologiche dell'Università Via Celoria, 2 - 20133 Milano MI Lombardia

Superficie immobile: XX mq

c/o Facoltà Medicina Veterinaria dell'Università Via Leonardo da Vinci, 44 - 10126 Grugliasco TO Piemonte

Superficie immobile: XX mq c/o Via dei Mille, 48 - 7100 Sassari SS Sardegna Superficie immobile: XX mq

c/o CAMPUS UNIVERSITARIO Via Provinciale Lecce-Monteroni - 73100 Lecce LE Puglia

Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.ispa.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 70 3 30 10 113 2004 70 3 30 10 113 2005


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Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Bottalico Antonio I Visconti Angelo I Altomare Claudio II Arras Giovanni II Conti Amedeo II Lavermicocca Paola II Lodi Roberta II Logrieco Antonio Francesco II Morea Maria II Palmegiano Giovanni Battista II Schirra Mario Mauro II Solfrizzo Michele II Todesco Rosanna II Vanadia Sebastiano II Zacheo Giuseppe II Avantaggiato Giuseppina III Baruzzi Federico III Battelli Giovanna III Blando Federica III Boari Angela III Boari Francesca III Brasca Milena III Calabrese Nicola III Cantore Vito III Cappello Maria Stella III Caputo Leonardo III Cardinali Angela III Caretto Sofia Pia Anna III Cavallarin Laura III D'Hallewin Guy III De Girolamo Annalisa III De Paolis Angelo III Di Venere Donato III Dore Antonio III

liv.Giovinazzo Giovanna III Giuffrida Maria Gabriella III Gonnella Maria III Grieco Francesco III Laddomada Barbara III Leone Antonella III Minervini Fiorenza III Mita Giovanni III Molinu Maria Giovanna III Montemurro Nicola III Moretti Antonio III Mule' Giuseppina III Palma Amedeo III Parente Angelo III Pascale Michelangelo III Peiretti Pier Giorgio III Perrone Giancarlo III Pieralice Maria III Poltronieri Palmiro III Ricelli Alessandra III Santino Angelo III Sergio Lucrezia III Serio Francesco III Sisto Angelo III Spezziga D'Aquino Salvatore III Venditti Tullio Antonio Pio III Vurro Maurizio III Zonno Maria III De Palma Egidio IV Della Valle Giuseppina IV Napolitano Lorenzo IV Ricci Vincenzo IV Cavallo Marinella V Delogu Melchiorre V

liv.Linsalata Vito V Lonigro Stella Lisa V Marceddu Salvatore V Montemurro Nicola V Mura Anna Maria V Mura Domenico V Mura Mario V Paulesu Sebastiano V Petretto Antonio Aldo V Rosas Giuseppe V Antoniazzi Sara VI Careddu Marco VI Cecchini Cristina VI Cozzi Giuseppe VI D'Amico Leone VI De Marzo Francesco VI Fraghi' Vindice Giovanni Maria VI Gerardi Carmela VI Grieco Francesco VI Santona Maria Vittoria VI Serra Gavina Rita VI Stea Gaetano VI Valerio Francesca VI Carta Gabriele VII Lintas Gianluca VII Lisi Salvatore VII Martena Simonetta VII Pascali Anna Maria VII Piccolo Michele VII Speranza Edvige Maria VII Valerio Paolo VII Fara Liberato VIIIPisano Pietro VIIIRicci Giuseppe VIII

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2003 6 21 8 8 19 62 2004 5 22 13 6 27 73 2005

ASSEGNISTI

Carolina Bisson Gianluca Bleve Alessandra Cereti Nunzia Maria Cito Palmira De Bellis

Donatella Fortunato Antonia Gallo Alessandra Giannoccaro Edith Miriam Haidukowski Veronica Lattanzio

Lucia Addolorata Leo Vincenzo Lippolis Francesco Longobardi Daniela Mocellin Stefano Morandi

Bernardo Pace Antonia Susca Laura Vanoni Ilaria Verdesca


Mario Agabbio Vito Vincenzo Bianco

Gilberto Forneris Vincenzo Lattanzio Pietro Santamaria

BORSISTI

Anna Bonasia Ermelinda Botticella Isabella Marsico

Lorenza Perono Garoffo Andrea Protopapa Giovanna Recchia

Andreas Reuter Mara Scaiola

Ernesto Tabacco Stefania Torella


Rossella Agostini Vincenzo Antonio Antonacci Gianvittorio Cappiello Nicholas Anthony Cascarano Maria Cefola

Maria Grazia Cipriani Antonio Donadio Filomena Epifani Gerolmina Florio

Francesca Fornelli Gianpaolo Pacelli Giuseppe Panzarini Maria Quarto

Angelo Signore Giuditta Signorella Giusy Tocco Eustachio Tortorelli

DOTTORANDI

Cristina Barello Cristina Baro

Mara Favilla Rosa Gala

Maria Antonia Gatto Simona Marianna Sanzani

Francesco Zezza

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Risorse finanziarie



esterne totale







anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 945 - 1.503 - - 2004 645 1.007 1.312 2.143 1.339 4.489 2005







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esposizione


2003 73 3 - 2 - - 3 - 2004 100 12 3 2 - - 3 - 2005


ARTICOLI ISI

Cavaletto M.1, Giuffrida M.G.2, Fortunato D.2, Gardano L.3, Dellavalle G.2, Napolitano L.2, Giunta C.3, Bertino E.4, Fabris C.4, Conti A.2 A proteomic approach to evaluate the butyrophilin gene family expression in human milk fat globule membrane PROTEOMICS

De Angelis M.1, Mariotti L. 2, Rossi J. 2, Servili M. 3, Fox P.F. 4, Rollan G. 5, Gobbetti. M. 6 Arginine catabolism by sourdough lactic acid bacteria: Purification and characterization of the arginine deiminase pathway enzymes from Lactobacillus sanfranciscensis CB1 APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Caretto S.1, Paradiso A.2, D'amico L.1, De Gara L.2 Ascorbate and glutathione levels in two sunflower cell lines of differing alpha-tocopherol biosynthetic capability PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

Romanazzi G. 1, Nigro F.2, Ippolito A.2, Di Venere D.3, Salerno M.2 Effect of pre- and postharvest chitosan treatments to control storage grey mould of table grapes JOURNAL OF FOOD SCIENCE

Santamaria P1., Elia A.2, Serio F.2 Effect of solution nitrogen concentration on yield, leaf element content, and water and nitrogen use efficiency of three hydroponically-grown rocket salad genotypes JOURNAL OF PLANT NUTRITION

Mita G.1, Gallo A.1, Greco V.1, Zasiura C.2, Casey R.2, Zacheo G.1, Santino A.1 Molecular cloning and biochemical characterisation of a lipoxygenase in almond (Prunus dulcis) seed EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY

Santino A.1, De Paolis A.1, Gallo A.1, Quarta A.1, Casey R.2, Mita G.1 Biochemical and molecular characterization of hazelnut (Corylus avellana) seed lipoxygenase EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY

Pastorello E.A.1, Pravettoni V.1,Farioli L.2, Rivolta F.1, Conti A.3, Ispano M.4, Fortunato D.3, Bengtsson A.5, Bianchi M.1

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Hypersensitivity to mugwort (Artemisia vulgaris) in patients with peach allergy is due to a common lipid transfer protein allergen and is often without clinical expression JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY

Poltronieri P.1 Cappello MS.1 Dohmae N.2 Conti A.3 Fortunato D.3 Pastorello E A.4 Ortolani C4 Zacheo G1 Identification and Characterisation of the ige-binding proteins 2S albumin and conglutin gamma in almond seed INTERNATIONAL ARCHIVES OF ALLERGY AND IMMUNOLOGY

Gobbetti M. 1, Stepaniak L. 2, De Angelis M. 3, Corsetti A. 4, Di Cagno R. 1 Latent bioactive peptides in milk proteins: proteolytic activation and significance in dairy processing CRITICAL REVIEWS IN FOOD SCIENCE AND NUTRITION

Baruzzi F. 1, Matarante A. 1, Morea M. 1, Cocconcelli P. S. 2 Microbial Community Dynamics during the Scamorza Altamurana Cheese Natural Fermentation JOURNAL OF DAIRY SCIENCE

Gobbetti M. 1., Morea M. 2, Baruzzi F. 2, Corbo M.R. 3, Matarante A. 2, Considine T. 4, Di Cagno R. 1, Guinee T. 5, Fox P.F. 4 Microbiological, compositional, biochemical and textural characterisation of Caciocavallo Pugliese cheese during ripening INTERNATIONAL DAIRY JOURNAL

Di Cagno R. 1, De Angelis M. 2, Lavermicocca P. 3, De Vincenzi M. 4, Giovannini C. 4, Faccia M. 5, Gobbetti M. 1 Proteolysis by sourdough lactic acid bacteria: effects on wheat flour protein fractions and gliadin-peptides involved in human cereal intolerance APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Schirra M.1, Cabras P2., Angioni A.3, Brandolini V.4 Residue levels and storage decay control in 'Star Ruby' grapefruit after dip treatments with azoxystrobin JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Schirra M.1, Cabras P.2, Angioni A.3, D'Hallewin G.4, Pala M.5 Residue uptake and storage responses of blood oranges after preharvest thiabendazole spray and postharvest heat treatment JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Kroczynska B. 1, Ciesielski A. 2, Sergio L. 3 Stabilization of heat-induced changes in plant peroxidase preparations by clpx, a bacterial heat shock protein JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY

Moretti A.1, Belisario A.2, Tafuri A.3, Ritieni A.3, Corazza L.2, Logrieco A.1 Production of beauvericin by different races of Fusarium oxysporum F. sp. Melonis, the Fusarium wilt agent of muskmelon EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY

Corsetti A.1, Lavermicocca P.2, Morea M.2, Baruzzi F.2, Tosti N.3, Gobbetti M. 4

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Phenotypic and molecular identification and clustering of lactic acid bacteria and yeasts from wheat (species Triticum durum and Triticum aestivum) sourdoughs of Southern Italy INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY

Lavermicocca P. 1, Valerio F. 1, and Visconti A . 1 Antifungal Activity of Phenyllactic Acid against Molds Isolated from Bakery Products APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Di Cagno R. 1, De Angelis M. 2, Corsetti A.3; , Lavermicocca, P. 2 , Arnault P. 4, Tossut P. 4, Gallo G. 1, Gobbetti M. 1 Interactions between sourdough lactic acid bacteria and exogenous enzymes: effects on the microbial kinetics of acidification and dough textural properties FOOD MICROBIOLOGY

Fortunato D.1, Giuffrida M.G.1, Cavaletto M.2, Perono Garoffo L.1, Dellavalle G.1, Napolitano L.1, Giunta C.3, Fabris C.4, Bertino E.4, Coscia A.4, Conti A.1 Structural Proteome of Human Colostral Fat Globule Membrane Proteins PROTEOMICS

Corpillo D.1, Valetti F.2, Giuffrida M.G.3, Conti A.3, Rossi A.4, Finazzi-Agrò A.4, Giunta C.2 Induction and characterization of a novel amine oxidase from the yeast Kluyveromyces marxianus YEAST

Pastorello E.A.1, Farioli L.2, Pravettoni V.1, Ortolani C.3, Fortunato D.4, Giuffrida M.G.4, Perono Garoffo L.4, Calamari A.M.1, Brenna O.5, Conti A.4 Identification of grape and wine allergens as an Endochitinase 4, a lipid-transfer protein, and a Thaumatin. JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY

Pessione E.1, Giuffrida M.G.2, Prunotto L.1, Barello C.2, Mazzoli R.1, Fortunato D.2, Conti A.2, Giunta C.1 Functional Proteome of Acinetobacter radioresistens S13 Membranes to Detect Aromatic Processing and Transport PROTEOMICS

Pastorello E.A.1, Pompei C.2, Pravettoni V.1, Farioli L.3, Calamari AM.1, Scibilia J.4, Robino AM.1, Conti A.5, Iametti S.6, Fortunato D.5, Bonomi S.1, Ortolani C.4 Lipid-transfer protein is the major maize allergen maintaining IgE-binding activity after cooking at 100 degree C, as demonstrated in anaphylactic patients and patients with double-blind, placebo-controlled food challenge results. JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY

Castoria R. 1, Caputo L. 2, De Curtis F. 1, De Cicco V. 1 Resistance of Postharvest Biocontrol Yeasts to Oxidative Stress: a Possible New Mechanism of Action PHYTOPATHOLOGY

Gerardi C. N. 1, Blando F. N. 1, Santino A. N. 1, Zacheo G. N. 1 Purification and characterisation of a beta-glucosidase abundantly expressed in ripe sweet cherry (Prunus avium L.) fruit PLANT SCIENCE

Vurro M. (1), Zonno M.C. (1), Evidente A. (2) , Andolfi A. (2), Montemurro P. (3)

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Enhancement of efficacy of Ascochyta caulina to control Chenopodium album by use of phytotoxins and reduced rates of herbicides BIOLOGICAL CONTROL

Valente M.E.1, Borreani G.2, Caredda S.3, Cavallarin L.1, Sulas L.3 Ensiling forage garland (Chrysanthemum coronarium L.) at two stages of maturity and at different wilting levels ANIMAL FEED SCIENCE AND TECHNOLOGY

Forneris G.1, Bellardi S.1, Palmegiano G.B.2, Saroglia M.3, Sicuro B.1, Gasco L.3, Zoccarato I.3 The use of ozone in trout hatchery to reduce saprolegniasis incidence. AQUACULTURE

Santamaria P.1, Campanile G.1, Parente A.2, Elia A.3 Subirrigation vs. drip-irrigation: effects on yield and quality of soilless grown cherry tomato. JOURNAL OF HORTICULTURAL SCIENCE & BIOTECHNOLOGY

Leone A.1, Melillo M.T.2, Bleve-Zacheo T.3 Lipoxygenase in pea roots subjected to biotic stress PLANT SCIENCE

Lavermicocca P.1, Lonigro S. L.1, Valerio F. 1, Evidente A. 2, and Visconti A. 1 Reduction of Olive Knot Disease by a Bacteriocin from Pseudomonas syringae pv. ciccaronei APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Logrieco A. 1, Bottalico A. 1, Mulè G. 1, Moretti A. 1, Perrone G. 1 Epidemiology fo toxigenic fungi and their associated mycotoxins for some Mediterranean crops EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY

Logrieco A. 1, Rizzo A. 2, Ferracane R. 3, Ritieni A. 3 Occurrence of Beauvericin and Enniatins in Wheat Affected by Fusarium avenaceum head blight APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY

Lattanzio V.1, Di Venere D.2, Linsalata V.2, Bertolini P. 3, Ippolito A.4, Salerno M.4 Low Temperature Metabolism of Apple Phenolics and Quiescence of Phlyctaena vagabunda JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Ganassi S. 1; Moretti A. 2; Bonvicini Pagliai A.M. 1; Logrieco A. 2; Sabatini A.M. 1 Effects of beauvericin on Schizaphis graminum (Aphididae) JOURNAL OF INVERTEBRATE PATHOLOGY

Srobarova A. 1, Moretti A. 2, Ferracane R. 3, Ritieni A. 3, Logrieco A. 2 Toxigenic Fusarium species of Liseola section in pre-harvest maize ear rot, and associated mycotoxins in Slovakia EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY

Ganassi S.1, Moretti A.2, Stornelli C.2, Fratello B.4, Bonvicini Pagliai A.M.1, Logrieco A.2, Sabatini M.A.1

262


Effect of Fusarium, Paecilomyces and Trichoderma formulations against aphid Schizaphis graminum MYCOPATHOLOGIA

Mule' G. 1 , Susca A. 1, Stea G. 1, Moretti A. 1 Specific detection of the toxigenic species Fusarium proliferatum and F. oxysporum from asparagus plants using primers based on calmodulin gene sequences FEMS MICROBIOLOGY LETTERS

Arras G. 1, Usai M. 2 Fungitoxic Activity of Twelve Essential Oils Against Four Postharvest Citrus Pathogens: Chemical Analysis of Thymus capitatus (L.) Hofmgg Oil and Its Effect in Subatmospheric Pressure Conditions JOURNAL OF FOOD PROTECTION

SCHIRRA M. 1, DELOGU G. 2, CABRAS P.3, ANGIONI A. 4, D’HALLEWIN G. 5, VEYRAT A. 6, MARCOS J. F. 7, GONZALES CANDELAS l. 8 Complexation of Imazalil with Beta-Cyclodextrin, Residue Uptake, Persistance, and Activity against Penicillium Decay in Citrus Fruit Following Postharvest Dip Treatments JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Pascale M. 1, Haidukowski M. 1, Visconti A. 1 Determination of T-2 toxin in cereal grains by liquid chromatography with fluorescence detection after immunoaffinity column clean-up and derivatization with 1-anthroylnitrile JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A

Pascale M. 1, Visconti A.1 , Pronczuk M.2 , Wisniewska H. 3, Chelkowski J. 3 Accumulation of fumonisins, beauvericin and fusaproliferin in maize hybrids inoculated under field conditions with Fusarium proliferatum MYCOLOGICAL RESEARCH

Visconti A. 1, Pascale M. 1, Centonze G. 1 Determination of Ochratoxin A in Wine and Beer by Immunoaffinity Column Clean-up and Liquid Chromatographic Analysis with Fluorometric Detection: Collaborative Study. JOURNAL OF AOAC INTERNATIONAL

Pascale M. 1, Visconti A. 1 Rapid method for the determination of ochratoxin A in urine by immunoaffinity column clean-up and high-performance liquid chromatography MYCOPATHOLOGIA

Minervini F. 1, Dell’Aquila M.E. 2, Maritato F. 2, Minoia P. 2, Visconti A. 1 Toxic effects of mycotoxin zearalenone and its derivatives on in vitro maturation of bovine oocytes and 17 beta- estradiol level in mural granulosa cell cultures. TOXICOLOGY IN VITRO

Minervini F. 1, Montagna M.T. 2, Spilotros G. 2, Monaci L. 3, Santacroce M.P. 2, Visconti A. 1 Survey on mycoflora of cow and buffalo dairy products from Southern Italy INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY

De Girolamo A. 1, Solfrizzo M. 1, von Holst C. 2, Visconti A. 1

263


Comparison of different extraction and clean-up procedures for the determination of fumonisins in maize and maize based food products FOOD ADDITIVES AND CONTAMINANTS

De Girolamo A. 1, Solfrizzo M. 1, Visconti A. 1 Effect of processing on fumonisin concentration in corn flakes JOURNAL OF FOOD PROTECTION

Visconti A. 1, Solfrizzo M. 1, De Girolamo A. 1 Determination of fumonisin B1 and B2 in corn and corn flakes by high performance liquid chromatography and immunoaffinity column-cleanup: collaborative study JOURNAL OF AOAC INTERNATIONAL

Solfrizzo M. 1, M. R. Carratu' 2, G. Avantaggiato 1, F. Galvano 3, A. Pietri 4, A. Visconti 1 Ineffectiveness of Activated Carbon in Reducing the Alteration of Sphingolipid Metabolism in Rats Exposed to Fumonisin-Contaminated Diets FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY

Solfrizzo M. 1, A. Visconti 1, G. Avantaggiato 1, A. Torres 2, S. Chulze 2 In vitro and in vivo studies to assess the effectiveness of cholestyramine as a binding agent for fumonisins MYCOPATHOLOGIA

Montemurro N. 1, Grieco F. 1, Lacertosa G. 2, Visconti A. 1 Chlorpyrifos Decline Curves and Residue Levels from Different Commercial Formulations Applied to Oranges JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Avantaggiato G. 1, Quaranta F. 2, Desiderio E. 2, Visconti A. 1 Fumonisin contamination of maize hybrids visibly damaged by Sesamia JOURNAL OF THE SCIENCE OF FOOD AND AGRICULTURE

Avantaggiato G. 1, Havenaar R. 2, Visconti A. 1 Assessing the zearalenone-binding activity of adsorbent materials during passage through a dynamic in vitro gastrointestinal model. FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY

Avantaggiato G. 1, De La Campa R. 2, Miller J.D. 2, Visconti A. 1 Effect of muffin processing on fumonisins from 14C-labeled toxins produced in vivo in corn kernels JOURNAL OF FOOD PROTECTION

Giuffrida M.G.1, Pessione E.2, Mazzoli R.2, Dellavalle G.1, Barello C.1, Conti A.1, Giunta C.2 Media containing aromatic compounds induce peculiar proteins in Acinetobacter radioresistens as revealed by Proteome analysis ELECTROPHORESIS

Conti A.1, Fortunato D.1, Ortolani C.2, Giuffrida M.G.1, Pravettoni V.3, Napolitano L.1, Farioli L.4, Perono Garoffo L.1, Trambaioli C.3, Pastorello E.A.3 Primary structure determination of two lipid transfer proteins from apricot (Prunus armeniaca) JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B

Deiana S. 1, Gessa C. 2, Palma A. 3, Premoli A. 1, Senette C. 1

264


Influence of organic acids exuded by plants on the interaction of copper with the polysaccharidic components of the root mucilages ORGANIC GEOCHEMISTRY

D’Aquino S.1, Palma A.2 Quality of film wrapped "Miyagawa" satsumas stored at 20-22°C ITALIAN JOURNAL OF FOOD SCIENCE

LIBRI

Vurro M. 1, Gressel J. 2, Butt T. 3, Harman G.E. 4, Pilgeram A. 5, St.Leger R.J. 6, Nuss D.L. 7 Enhancing biocontrol agents and handling risks in NATO Science Series: Life and Behavioral Sciences, vol. 339, IOS Press, Amsterdam 2001.

Logrieco A.1, Moretti A.1, Ritieni A.2, Caraffa M.F.3, Macchia L.3 Beauvericin: Chemistry, Biology and Significance in Advances in Microbial Toxin Research and its Biotechnological Exploitation , Rajeev K. Kluwer Academic Publishers, New York - USA 2002.

Arras G.1, Maltoni S. L.2 Postharvest Biological and Integrated Control of Fungal Pathogens on Fruit in Diseases and Disorders of Fruit and Vegetables, R. Dris, R. Niskanen and M. Jain, Helsinki (FINLANDIA) 2003.

Flagella Z. 1, Cantore V. 2, Giuliani M.M. 3, Tarantino E. 4, De Caro A. 5 Crop salt tolerance: physiological, yield and quality aspects. in Recent Res. Devel. Plant Biol., 2., Pandalai S.G., Research Signpost, Kerala, India. 2002.

BREVETTI

Giuseppina Mulè, Gaetano Stea, Antonia Susca, Antonio Logrieco, Antonio Moretti & Antonio Bottalico Metodo di rilevazione e identificazione di ceppi tossigeni di Fusarium isolati da mais

Lavermicocca P. 1 , Lonigro S. L. 1, Visconti A. 1 , De Angelis M. 1, Valerio F. 1, Morelli L. 1 OLIVE DA MENSA CONTENENTI MICRORGANISMI PROBIOTICI

RAPPORTI

Mulè G., Logrieco A., Moretti A., Stea G., Perrone G., Bottalico A. Early detection of toxigenic Fusarium species and ochratoxigenic fungi in plant products

Borreani G., Arru R., Masoero G., Mimosi A., Peiretti P.G. Realizzazione del fieno-silo per valorizzare le risorse prative alpine: utilizzo nella produzione di latte biologico e nella caseificazione di formaggi DOP e di qualità in montagna

Borreani G., Arru R., Peiretti P.G. Il deterioramento aerobico degli insilati con particolare riferimento al silomais. Indagine sulla situazione aziendale territoriale, comprendente gli effetti sulla qualità degli insilati del latte e dei prodotti caseari e le modalità di prevenzione

Palmegiano G.B.

265


Effetto di fonti lipiche vegetali diverse sulle prestazioni produttive, caratteristiche corporee, qualità della parte edule in acipenseridi (Acipenser naccari) e/o Salmonidi (Salvelinus alpinus, Oncorhyncus mykiss)

Cavallarin L., Ruolo dei tannini nella protezione dalla proteolisi nei foraggi insilati

Morea M., Baruzzi F., Matarante A. Enterococchi negli alimenti: impiego di tecniche molecolari per l’analisi quantitativa del rischio microbiologico

Morea M., Baruzzi F., Urso G., Visconti A. Caratterizzazione molecolare di nematodi entomopatogeni e dei loro batteri simbionti

Lodi R, Brasca M., Cecchi L., Morandi S. Definizione degli standard produttivi della Formaggella della Valle Seriana

Lodi R., Brasca M., Cecchi L., Clarà P. Dossier per la domanda di registrazione della Denominazione d'Origine Protetta (DOP) del formaggio Principali collaborazioni

Altri Ministeri: MiPAF; Ministero della Salute

Enti pubblici: Comunità Europea; Regioni Piemonte; Regioni Puglia; Regioni Abruzzo,; Regioni Lombardia; Comunità Montane Valsassina, Valvarrone, Val d'Esino e Riviera

EPR italiane: ENEA; Istituto Sperimentale Lattiero-Caseario-CRA (Lodi); Istituto Sperimentale Cerealicoltura-CRA (Roma); EPR straniere:; Paul-Ehrlich-Institute (Germania), USDA (USA), INRA (Francia), TNO (Olanda), IMM-CNR (Lecce); Agricultural Biotechnology Center, Godollo (Ungheria); John Innes Center, Norwich (UK); Tyndall National Institute, Cork (Irlanda); APIBIO, Grenoble (Francia)

MIUR: MIUR

Privati: Barilla Alimentare; Syngenta Crop Protection; Bayer CropScience; Pierre Chimica (Galatina, LE); Feed Industry Service (Lodi); Co.Ri.Al (Foggia); Bioindustry Park del Canavese (TO); Centro Ricerche Bonomo (BA); Società Produttori Sementi (Bologna), Fondazione per le Biotecnologie (Torino), Ospedale Niguarda (Milano); Plant Research International, Wageningen (Olanda)

Università: Università di Piacenza; Università di Bari; Università di Foggia; Università di Parma; Università di Firenze; Università di Teramo; Università di Torino; Università di Milano; Università di Campobasso; Università di Napoli Federico II; Università di Lecce; Università di Sassari; Universidad Complutense Madrid (Spagna); Cranfield University (UK); Kansas State University (USA), Vicam L.t.d (USA); Universidad Nacional de Rio Cuarto (Argentina)

266



CREDITORI E DEBITORI DIVERSI • TEPORE - POM A23 ex Orticoltura

STAZ. SPERIM. INDUSTRIA CONSERVE ALIMENTARI • Saldo Progetto POM

IST. SUP. LATTIERO CASEARIO • Convenzione con l'Istituto Lattiero Caseario - Progetto Sisprolat

ISTITUTO SPERIMENTALE PER L'AGRUMICOLTURA • AZ 2 - Piano agrumicolo • AZ 3 - Piano agrumicolo • AZ 4 - Piano agrumicolo • Saldo contributo Piano agrumicolo I° anno di attività • saldo contributo piano agrumicolo I° anno di attività AZ4 • saldo contributo Ià anno di attività AZ3 • anticipo 60% contributo P.A.N. AZ2 2° anno di attività • anticipo 60% contributo P.A.N. AZ3 3° anno di attività • anticipo 60% contributo P.A.N. AZ4 3° anno di attività • parte contributo 2° rendiconto ° anno PAN • contributo 2° rendiconto 2° anno PAN

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • Mi.P.A.F. "Valutazione qualitativa di cultivar provenienti da seme e di nuovi cloni di carciofo

da destinare alla preparazione di surgelati e per la IV gamma". Secondo anno. • ACCONTO III ANNO PROG. CARCIOFO

CO.RI.AL. CONSORZIO RICERCHE ALIMENTARI SOCIETA CONSORTILE P • CORIAL - Formazione di ricercatori in sicurezza agro-alimentare • CO.RI.AL. - Formazione dei ricercatori collegata al progetto SINSIAF - Importo relativo al 25%

di inizio attività + il 50% del totale al 01/03/2005 • Formazione ricercatori collegato al progetto SINSIAF

SYNGENTA CROP PROTECTION S.P.A. • Convenzione per analisi di micotossine nel frumento e di ocratossina A in uva e prodotti

derivati • Syngenta Italia - Determinazione di micotossine in campioni di frumento, mais e vino • Convenzione con Syngenta Italia - Anno 2004

REGIONE PIEMONTE • REGIONE PIEMONTE -Progetto Ricerca Scientifica Applicata "Valutazione

dell'ipoallergenicità e del valore nutrizionale di alimenti a base di latte di asina"

ISTITUTO SPERIMENTALE PER LA FRUTTICOLTURA • progr. MURST Rend. ott. 2003 - aprile 2004

267


• saldo contributo progetto "Microrganismi e loro metaboliti utili per il controllo biologico nella protezione delle piante"

ISTITUTO ZOOPROFILATTICO SPERIMENTALE PIEMONTE LIGURIA E VAL D'AOSTA - TORINO • Ministero della Salute - Minervini "Trota iridea"

UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI LECCE • PROGETTO " SVILUPPO DI TECNOLOGIE INNOVATIVE E DI PROCESSI

BIOTECNOLOGICI IN CONDIZIONI CONTROLLATE NEL SETTORE DELLE COLTURE VEGETALI" MURST CLUSTER 5

• PROGETTO " SVILUPPO DI TECNOLOGIE INNOVATIVE E DI PROCESSI BIOTECNOLOGICI IN CONDIZIONI CONTROLLATE NEL SETTORE DELLE COLTURE VEGETALI" MURST CLUSTER 5

MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI (MIPAF) • contributo programma "Liste di Orientamento Varietale di Agrumi" • MIPAF Progetto di Ricerca 6C32 "Valutazione nutrizionale di lipidi alternativi agli oli di pesce

nei mangimi per specie ittiche di interesse commerciale " ( 2a trance) • CONTRIBUTO DAL MIPAF (ULTIMA TRANCE 20% RIF. AL PROGRAMMA TRIENNALE N.

5 E 87 AFFERENTE AL PROGETTO DEL V° PIANO TRIENNALE ACQUACOLTURA ANNO 2003)

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca • modellizzazione di un sistema integrato per la gestione della sicurezza alimentare della filiera

del frumento duro (SINSIAF) -Barilla • SABIPAM: "Sistemi Avanzati per la Biosicurezza delle Produzioni Alimentari del Mezzogiorno" • Progetto di Ricerca Industriale: Sistemi innovativi per la produzione di licopene da pomodoro • PON Barilla - SINSIAF Anno 2004 • PRIMA QUOTA PROG. LICOPENE • Fondi Progetto Licopene

MINISTERO DELLA SALUTE - Dipartimento della Qualità - Direzione Generale del Sistema Informativo - Uff. I

• Progetto strategico "Valutazione dei componenti tossici negli alimenti e studio dei cibi in vitro e in vivo" -Minervini

COMUNITA' EUROPEA • Unione Europea - Contratto QLK4CT2001-00301 Tranche relativa al 2003 • Progetto CEE contratto QLK4CT2001-00301 "Food allergy risk e valution based on improved

diagnosis"

PROTEZIONE DELLE PIANTE E MICROBIOLOGIA APPLICATA • Univ. di Bari - Studio dei lieviti naturali per la valorizzazione dei pani tipici del Mezzogiorno -

Anno 2003

DIPARTIMENTO DI SCIENZE DELLE PRODUZIONI VEGETALI • SORBIO - tecnologie e processi innovativi per la tracciabilità, la verifica e il controllo della

qualità nelle produzioni biologiche ortofrutticole. Anticipo 30% • INNOVALO - Innovazioni di processo e di prodotto per valorizzare la patata primaticcia in

Puglia

268


• II^ TRANCHE PROGETTO SORBIO

BIOTECNOLOGIE B.T. S.r.l. • Ricerca sui nematodi -B.T. 4 semestre attività • Commessa di ricerca "Ricerca sui nematodi vettori di batteri entomopatogeni quali agenti

biologici di controllo di insetti dannosi per l'agricoltura e/o per la salute pubblica" • B.T. Srl - Commessa di ricerca "Ricerca sui nematodi vettori di batteri entomopatogeni quali

agenti biologici di controllo di insetti dannosi per l'agricoltura e/o per la salute pubblica"

F.I.S. srl - Feed Industry Service • Convenzione con la Feed Industry Service srl (FIS) della durata di tre anni per la realizzazione

di "Attività analitica, tesa a individuare prodotti di origine naturale o di sintesi per la detossificazione delle micotossine". Prima annualità.

• F.I.S.: "Attività di ricerca, tesa a verificare l'efficacia di un prodotto commerciale nella detossificazione di mangimi contaminati da micotossine"

• F.I.S. - Attività di ricerca, tesa a verificare l'efficacia di un prodotto commerciale nella detossificazione di mangimi contaminati da micotossine - Saldo convenzione

COMUNITA' MONTANA VALLI DEL LUINESE • C.M. Valli del Luinese • Comunità Montana Valli del Luinese, progetto formaggio misto - saldo

COMUNITA' MONTANA VALLE SERIANA SUPERIORE • Accertamento per documenti amministrativi attivi • Convenzione con Comunità Montana Valle Seriana Superiore saldo

SYNGENTA CROP PROTECTION AG • Convenzione per analisi di ocratossina A in uva e mosto d'uva. • Syngenta Svizzera - Analisi di ocratossina A nei campioni di uva e mosto

Dipartimento di Scienze Ambientali Agrarie e di Biotecnologie Agro-Alimentari • DISAABA - "Microrganismi e agenti infettivi di interesse agroalimentare" - Quota anno 2003

REGIONE PUGLIA - ASSESSORATO AGRICOLTURA E FORESTE • PROGETTO CARCIOFO REGIONE PUGLIA (VANADIA-CALABRESE)

EUROPEAN COMMISSION -Directorate - General Information society • Progetto CE 986 Solfrizzo - "Riduzione della contaminazione fungina e di micotossine durante

la catena di produzione di ortaggi biologici: modello Carota-Alternaria" • Quota parte contratto CE - QLK1-CT1999-01380 • CE 1517 - Moretti "Sostenibilità, sicurezza dei prodotti e qualità nei cereali". • CE Lavermicocca - Sistemi naturali per la prevenzione delle contaminazioni fungine dei

prodotti da forno • CE - OTA "Valutazione del rischio e gestione integrata dell'ocratossina A (OTA) nell'uva e nel

vino" • CE 1391 - Altomare "Determinazione del rischio nell'impiego di microrganismi fungini in lotta

biologica" • Contratto CE - QLK1-CT-1999-00996 - Quota anno 2004 • Progetto "FOOD-CT-2003-001678" - Quota primo anno • Contratto CE 986 Solfrizzo - Quota anno 2004

269


• myco- globe Integration of Mycotoxin and toxigenic fungi - quota 2004 • CE QLK1-CT2001-01391 - Quota anno 2004

Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell'Umbria e delle Marche • Ministero della Salute - Logrieco "Mitili"

Istituto Oncologico - Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico • Ministero Salute - Valutazione di componenti tossici negli alimenti e studio dei cibi funzionali

in vitro e in vivo

TERRA D'OTRANTO SRL • PROGETTO PRAI-PUGLIA

COOPAS S.C. a R.L. • PIA-COOPAS - OR1-0R3 COME DA COMMESSA 1 RATA 2005 • PIA-COOPAS, ¿OR1, Protocollo a basso impatto ambientale per coltura cicoria da radice e

utilizzazione radici carciofo per la produzione di frumento duro a maturazione lattea. OR3, Studio caratteristiche qualitative dei fruttani (fruttooligosaccaridi e inulina) prodotti da diverse fonti.¿

Società Produttori sementi • produttori sementi- analisi di deossinivalenolo in campioni di frumento tenero

FONDAZIONE IRCCS OSPEDALE MAGGIORE POLICLINICO, MANGIAGALLI E REGINA ELENA • Progetto Strategico Legge 449/97: "Messa a punto di un modello metodologico per la

produzione e la valutazione di prodotti alimentari ipoallergenici"

CASEIFICIO SANGIOVANNI • Indagine processi fermentativi

Contratti passivi

FRANCESCO MARGIOTTA • Microtomo completamente automatico rm 2265+taglialama EM KMR 2 ord. 83

MARIA QUARTO • co.co.co progetto ce 2e-bcas 1786 mese di maggio 2005/aprile 2006

SPIGA FRANCO • lavori di sistemazione celle frigorifere

CENTRO REGIONALE AGRARIO SPERIMENTALE • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo

EXECUTIVE • servizio vigilanza dicembre 2002 • vigilanza nov. 2002

270


• servizio vigilanza mese di aprile • servizio vigilanza mese di maggio • servizio vigilanza mese di giugno • servizio vigilanza gennaio 2003 • servizio vigilanza febbraio 2003 • servizio vigilanza marzo 2003

LUCANA SISTEMI 2 SRL • acquisto computer 3 piano Istituto

DITTA CADONI BONARIA • Contratto di pulizia locali di Oristano

VARIAN SpA • autocampionatore-progetto PANTI (Accessorio strumento inv. 1036494)

TECNOPACK • strumentazione scientifica AZ3

ANALYTICAL CONTROL S.P.A. • frigocongelatore - 86°- oh maia

PERKIN ELMER ITALIA S.p.a. • SISTEMA FLUORIMETRICO PROGETTO SISPROLAT

CENTRO RICERCHE BONOMO • restituzione somma progetto POM • Progetto POM Centro Ricerche Bonomo Restituzione fondi

ASSING SPA • materiale laboratorio

EXTRA INFORMATICA • trasferimento delle strutture informatiche dala ex area ai locali di li punti

SYNERGIA SALE & SERVICE SRL • fornitura Pompa Isocratica e campionatore automatico per HPLC mod. HItach serie 700 AZ3

SAPIO INDUSTRIE S.R.L. - MONZA • contenitore per stoccaggio materiale biologico

Beckman Coulter S.p.A.-CENTRO DIREZIONALE LOMBARDO • Autocampionatore mod. LC 508 x APLC • periferiche per sistema HPLC • periferiche per sistema HPLC

DEMOSERVICE COOP. ARL • Pulizia - Apr/Giu 2004 • servizio pulizia 1 piano aprile • Obbligazione per documento amministrativo passivo

271


EBSCO INTERNATIONAL, INC. - USA c/o rappresentante IVA in Italia SERAM Srl • Rinnovo abb.riviste

PBINTERNATIONAL S.p.A. • CANONE NOLEGGIO IN TERNATIONAL PBI ORDINE N.168

SHIMADZU ITALIA S.R.L. • CANONE MENSILE PER NOLEGGIO SISTEMA RF-5301 ORD. 54 • compravendita

BIOSENSE s.r.l. • SISTEMA BIACORE PROGETTO BARILLA

AGILENT TECHNOLOGIES ITALIA SPA • acquisto strumentazione progetto Barilla • materiale laboratorio progetto Syngenta • Sistema HPLC completo ord. 96

APPLERA ITALIA • sistema per analisi di sequenziamento- progetto SABIPAM (Accessorio inv. 1075207) • SISTEMA DI SEQUENZIAMENTO -PROGETTO SABIBAN • SISTEMA DI SEQUENZIAMENTO -PROGETTO SIVINA

SRA INSTRUMENTS ITALIA S.R.L. • micro-gascromatografo agilent P/2000- progetto TRAIN

MIUR Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca • acquisto accessori per gas massa- progetto licopene

Arredi Tecnici CASARIN Srl • Acquisto fornitura arredi di laboratorio ord. 31 2004

QUI! TICKET SERVICE SPA • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Buoni pasto dal n. 30863219461 al 30863259056

ZWICK ROELL ITALIA SRL • Analizzatore di struttura AZ 4

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI TERAMO • acconto 30% accordo di collaborazione tra ISPA E DSA di teramo • 2 acconto accordo di collaborazione scientifica tra ispa cna- teramo

DIPARTIMENTO DI SCIENZE DELLE PRODUZIONI VEGETALI • Obbligazione per documento amministrativo passivo

272


UNIVERSITA' DI NAPOLI FEDERICO II - DIP. SCIENZA DEGLI ALIMENTI • 3 e 4 rata commessa maia

DIP. SCIENZE DEL SUOLO, DELLA PIANTA E DELL'AMBIENTE-UNIVERSITA' DI NAPOLI FEDERICO II

• III rata compenso commessa MAIA • SALDO FINALE COMMESSA MAIA -EVIDENTE

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI BARI • 1 RATA DOTTORATO DI RICERCA DR. ZEZZA

BIOTECNOLOGIE B.T. S.r.l. • Commessa di ricerca per esecuzione delle attività previste da contratto art.3 (prot.146) 40% a

conclusione del 5° semestre del Progetto • ultima rata commessa bit

DITTA FARA ANTONIO • Contratto di giardinaggio locali Oristano

TECHNOBIOCHIP S.C.a.r.l. • modellizzazione di un sistema integrato per la gestione della sicurezza alimetare della filiera

del frumeno duro (sinsiaf)

SOC. COOP. HYDRA • SERVIZIO PULIZIA ANNO 2003 HYDRA ORDINE N.11 • MANUTENZIONE AREA VERDE

SPLENDIDA di Pisano Giovanna • contratto di pulizia locali Sassari

DE MATTIA SNC • Acquisto arredi di laboratorio ord. 19 del 2004 • Acquisto arredi di laboratorio ord. 22 del 2004 • Acquisto arredi di laboratorio ord. 25 del 2004 • Acquisto arredi di laboratorio ord. 26 del 2004

SGS SARDINIA GENERAL SERVICE • Contratto di portierato con guardia non armata

PLANT RESEARCH INT. PRIBV • Obbligazione per documento amministrativo passivo

MAFF. CSL CENTRAL SCIENCE LABORATORY • Obbligazione per documento amministrativo passivo • Obbligazione per documento amministrativo passivo

NATIONAL VETERINARY INSTITUTE • Obbligazione per documento amministrativo passivo

273


Federal research centre Institute for hygiene and toxicology- Mr. Wagner • trasferimento ai parters europei progetto ce 1380

Stok augsburg fur technische • trasferimento ai partners europei contratto ce 1380

adgen ltd nellies gate auchincruive • Obbligazione per documento amministrativo passivo

CENTRO LEASING SpA • PRIMA RATA LEASING SU STRUMENTI PROGETTO SABIPAm • 2 rata canone leasing progetto SABIPAM

THE SAFE CONSORTIUM • CONTRIBUTO COME MEMBRO SAFE

università degli studi del molise • Obbligazione per documento amministrativo passivo

MICRO s.r.l. • Innovazione nei processi fermentativi

274


Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Agitatore - Aminoanalyzer Gold Nouveau Beckman - BioSys 510, Asse rotore Centrif. Allegra 21R - Bioanalyzer System Agilent 2100 - Biosensore ottico BIACORE - Camera di crescita CONVIRON PGW 36 - Centrifuga J2-21-ultracentrifuga L80 - Centrifuga J2HS - ChemiDoc - ChemiDoc Biorad - Citofluorimetro FACSCalibur (Becton Dickinson) - Cramatografo ionico DIONEX DX120 - Cromatografo ionico DIONEX DX 500 + autocamp. AS40 - DCode Universal Mutation Detection System - FPLC AKTA BASIC 10 - Fluorimetro Perkin Elmer LS55 - Frigorifero -80°C - Frigorifero -80°C Hereus - GC MS Varian CP3800 - GCMS - Gascromatografo Dani GC1000DPC - HP Agilent 1100 - HPLC BECKMAN - HPLC DIONEX GP50 + ED 40 + LC30 - HPLC HP con rivelatore a serie di diodi serie 1100 - HPLC Perkin Elmer S200 + LC 785/A + LS3 - HPLC Shimadzu - HPLC Spectraphisics - HPLC Thermo Separation Products - HPLC Varian Pro Star - HPLC ionico DIONEX + PAD - IRGA CO2/H2O Diff. Gas Analyser - Microscopio a laser confocale - Misuratore area fogliare LICOR - N. 2 Gas cromatografi Varian GC 3800 - Nessun acquisto - PCR - Palmsens - Periferiche per HPLC: Rivelatore a diode array mod. 168 - Periferiche per HPLC: Sistema di iniezione con valvola Rheodyne - Periferiche per HPLC: Sistema per eluizioni in gradiente a doppia pompa - Sequenziarore automatico di proteine Applied Biosystems - Sequenziatore automatico ABI Prism 310 - Serra ferro vetro 'Multilux' + fertirrigatore computerizzato - Sistema di purificazione per acqua Millipore RIOS 8 - Sistema di purificazione per acqua ultrapura Millipore MilliQ Synthesis - Sistema di quantificazione “in tempo reale” Applied Biosystem - Sistema per il sequenziamento di DNA completamente automatico (310 Genetic Analyzer) - Spettrofotometro CARY 50 Varian

275


- Spettrofotometro DU 640 - Spettrofotometro ad Ass. atomico - Stazione meteorologica + sensori + accessori - Termostato Binder - Thermal Cyclerr PE-Applied Biosystems 9700 Istituti con i quali si collabora


- Istituto per l'ambiente marino costiero - Istituto di metodologie chimiche - Istituto di scienze marine


276



Sistemi produttivi sostenibili per le produzioni ittiche

Temi


Studi per l�allevamento responsabile di pagelli, trote e storioni. Messa a punto di diete con migliorate caratteristiche nutrizionali e di interesse per l�alimentazione umana, con caratterizzazione delle produzioni tipiche, a basso impatto. Studio dell�uso di proteine vegetali nelle diete per pesci carnivori con identificazione di enzimi indicatori dell�efficacia di materie prime vegetali. Definizione dei quadri istochimici come indicatori di sofferenza dell�apparato digestivo.

Stato dell'arte:

L�acquacoltura risente di carenze interne ed esterne al sistema produttivo. Studi su nuove specie, linee produttive selezionate e materie prime alternative per la formulazione di diete efficaci finalizzata ad ottenere prodotti migliori, sono la via per la riqualificazione innovativa dei prodotti ittici. La sostenibilità delle tecnologie caratterizzerà i prodotti certificabili. Esiste una domanda di informazione sulla stabulazione e prevendita di crostacei garantiti per qualità e salubrità.

Azioni

Attività in corso:

Studi svolti nell'ambito di progetti MiPAF per la definizione di diete di controllo per la formulazione di mangimi integrati con alimenti semplici vegetali per pesci carnivori e onnivori. Aspetti enzimatici e istologici correlati. Presso altre unità operative sono affrontati problemi di alimentazione, stabulazione e riproduzione di organismi acquatici ed inoltre le ricerche riguarderanno gli aspetti ambientali, di tracciabilità e patologia in acquacoltura estensiva.


Gli aspetti critici riguardano la messa in fase delle varie ricerche per puntare progressivamente ad una maggiore integrazione tra i vari partner coinvolti.Condizione di fattibilità, necessaria e sufficiente, sarà la piena collaborazione del personale tutto coinvolto in questa commessa.


Queste ricerche avverranno con le sezioni di Messina e Taranto dell'IAMC e con le sezioni di Venezia e Lesina dell'ISMAR. Con le prime si affronteranno problemi di alimentazione, stabulazione e riproduzione di organismi acquatici di interesse commerciale. Con le seconde verranno trattati aspetti ambientali, di tracciabilità e patologia in acquacoltura estensiva.

Finalità

Obiettivi:

Messa a punto e/o perfezionamento di protocolli di studio per a riproduzione e l�introduzione di nuove specie. Stima della fertilità in ceppi di spigola riprodotti per ginogenesi al fine della selezione di caratteristiche produttive vantaggiose. Messa a punto di diete con migliorate caratteristiche nutrizionali e di interesse per l�alimentazione umana e a basso impatto ambientale. Studio dell�utilizzo di proteine da biomasse vegetali nelle diete di pesci carnivori.

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Prime acquisizioni su protocolli per l�allevamento responsabile di pagelli, trote e storioni (una specie all�anno). Messa a punto di diete di controllo finalizzate al miglioramento delle caratteristiche nutrizionali e a basso impatto. Prime acquisizioni sull�uso di proteine vegetali nelle diete per pesci carnivori e identificazione di enzimi indicatori dell�efficacia di prodotti vegetali per pesci. Definizione di quadri istochimici come indicatori di sofferenza dell�apparato digestivo.

Potenziale impiego:


Microbiologia delle produzioni alimentari

Temi


Prodotti panari:selezione tecnologica e funzionale del lievito naturale;uso di microrganismi e loro metaboliti per estendere la conservabilità; identificazione di microrganismi marker della qualità. Formaggi, salumi, vino: selezione ed uso di ceppi autoctoni; analisi dei parametri chimico-analitici e sensoriali; definizione di standard produttivi. Prodotti vegetali:applicazione di ceppi per il miglioramento della qualità funzionale e conservabilità; studio di popolazioni microbiche indesiderate

Stato dell'arte:

Aspetti sia quantitativi sia qualitativi delle produzioni alimentari sono influenzati pesantemente da microrganismi che possono migliorare o danneggiare la produzione stessa e che in alcuni casi (trasformazioni) sono indispensabili all�ottenimento del prodotto finale. Lo studio di tali microrganismi, la valutazione della loro azione e dei parametri ambientali che influenzano le diverse tipologie di produzione potranno permettere di ottenere significativi miglioramenti del prodotto finale.

Azioni

Attività in corso:

Sono in corso indagini sulla caratterizzazione di microrganismi coinvolti in prodotti da forno, produzioni vinicole, lattiero-casearie, carnee e vegetali. E� in corso sia lo studio di popolazioni microbiche indesiderate sia l�utilizzo di ceppi selezionati e la modulazione dei parametri tecnologici per il miglioramento della qualità igienica, organolettica e nutrizionale degli alimenti nonché per l�ottenimento di prodotti funzionali contenenti popolazioni probiotiche e sostanze prebiotiche.


Gli obiettivi riguardanti i prodotti panari e lattiero-caseari per i quali sono previsti finanziamenti esterni saranno raggiunti nei tempi indicati.Per gli altri prodotti sono in corso contatti con aziende e Istituzioni di ricerca per la realizzazione di progetti comuni finanziati.E'necessario il supporto di strutture del CNR competenti nella relazione con Aziende o Istituzioni del settore agro-alimentare per la realizzazione di progetti e cessione brevetti.Massa spendibile aumentata


UNIBA-Dip.Prot.Piante Microb.Appl; Molino Tandoi-Pellegrino, Corato (BA); Divella, Rutigliano (BA); PANSUD Lacedonia (AV); Panificio La Maggiore Altamura (BA); UNIMOL-DISTAM (CB); L�Aia

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Vecchia, Vernole (LE); UNIPC- Ist. Microbiol.; Biotecgen, Novoli (LE); Farm Computer System (Cremona) ; UNIBA- Dip. Emerg. e Trapianti Organo; MIPAF-Ist. Lattiero-caseario, Lodi (MI); CNR-IBBA (MI); UNIMI-Agraria; Agrosud Aradeo (LE); CNA Puglia, Bari; Consorzi Tutela Formaggi (Lombardia).

Finalità

Obiettivi:

Miglioramento delle caratteristiche dei pani tipici. Valorizzazione di formaggi tradizionali e definizione degli standard produttivi. Selezione e uso di ceppi microbici probiotici e non in prodotti da forno, produzioni lattiero-casearie, vinicole, carnee, vegetali e nelle conserve vegetali mediterranee. Caratterizzazione molecolare di microrganismi utili o dannosi per le produzioni alimentari. Competenze inerenti la microbiologia, l�igiene e la chimica delle produzioni alimentari.


Produzioni panarie, vinicole, lattiero-casearie, carnee: analisi e selezione di ceppi con attitudini tecnologiche e funzionali;modulazione parametri di processo (2005); applicazione di ceppi autoctoni (2006);ceppi marker; protocolli di caseificazione; standard produttivi(2007). Vegetali:microrganismi con caratteristiche di conservabilità e probioticità (2005); sopravvivenza di popolazioni probiotiche(2006); funzionalità dei prodotti; caratterizzazione molecolare di popolazioni microbiche(2007).

Potenziale impiego:


Sicurezza alimentare

Temi


Monitoraggio di funghi tossigeni, micotossine e residui di pesticidi nelle colture agrarie e nei prodotti alimentari. Collezione di funghi tossigeni. Interventi preventivi e valutazione del rischio nell�uso d�agenti di biocontrollo. Tossicità di pesticidi e xenobiotici in vitro e in vivo. Individuazione di biomarker d�esposizione a micotossine e pesticidi. Decontaminazione di mangimi, mosti e succhi di frutta. Analisi di allergeni d�alimenti vegetali e del latte bovino con tecniche proteomiche.

Stato dell'arte:

Le contaminazioni alimentari da funghi tossigeni, micotossine, pesticidi e allergeni rappresentano una problematica di stringente attualità per tutti gli operatori del comparto alimentare. Ne scaturiscono notevoli implicazioni di carattere sanitario, economico e commerciale, che investono in particolare i rapporti internazionali. L�Unione Europea sponsorizza Forum e progetti ad hoc e richiama ad una continua sorveglianza con l�emanazione di normative per la sicurezza delle produzioni alimentari.

Azioni

Attività in corso:

Acquisizione dei parametri agro-ambientali condizionanti gli attacchi di Fusarium tossigeni su Frumento. Collezione di funghi tossigeni. Selezione di preparati microbici per la lotta contro gli Aspergilli ocratossigeni dell�uva. Impiego di modelli gastrointestinali per lo sviluppo di strategie di

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decontaminazione degli alimenti. Tossicità di xenobiotici. Analisi di biomarker di esposizione alle micotossine. Caratterizzazione di allergeni vegetali e del latte con tecniche proteomiche.


Per le attività da svolgere nel 2005-2007, si utilizzeranno competenze di personale a tempo determinato con contratti esterni.Sarebbe auspicabile la disponibilità di una camera di crescita per le piante e per i relativi saggi in vivo.E� indispensabile integrare le risorse finanziarie,con una dotazione ordinaria da aggiungere al budget previsto per il triennio e che proviene da progetti finanziati da altri Enti nazionali e internazionali. Massa spendibile aumentata dopo il 21/11/04


Università di Bari, Campobasso, Lecce, Parma, Piacenza, Portici, Roma e Torino; ed estere di Argentina, Sud-Africa, Tunisia, Ungheria e USA. USDA, USA. INRA, Francia. TNO, Olanda. Safe Consortium, Brussels. Istituti e Laboratori Sperimentali dei Servizi nazionali. Fondazione Biotech, TO. Feed Industry Service, Lodi. Marini Group S.p.A.,TO. COOP, MI. PEI, Langen (D). Cantele Vini, Guagnano. Consorzio Produttori Vini Mandria, Manduria. Molini Tandoi Pellegrino, Corato.

Finalità

Obiettivi:

Strategie di lotta a basso impatto ambientale contro funghi tossigeni responsabili dell�accumulo di micotossine nei raccolti. Persistenza dei contaminanti durante le trasformazioni alimentari. Detossificazione dei mangimi, degli alimenti e delle bevande.Stima dell�esposizione dell�uomo alle micotossine. Valutazione del rischio legato a contaminanti alimentari. Sviluppo di alimenti ipoallergenici. Saranno utilizzate competenze in micologia, biologia, chimica e tossicologia.


Nel triennio 2005-2007 si prevedono i seguenti risultati. Ottenimento di modelli previsionali per le epidemie di fusariosi tossigene della spiga di frumento. Strategie di lotta biologica e integrata contro gli agenti ocratossigeni dell�uva. Metodi di decontaminazione di mangimi e bevande con interventi fisici e biologici. Sviluppo di test di tossicità e individuazione di biomarker per valutare l�esposizione a micotossine e pesticidi. Sviluppo di sostituti naturali ipoallergenici del latte bovino

Potenziale impiego:


Sistemi produttivi sostenibili di colture agrarie

Temi


Prove agronomiche: valutazione genotipi, interazioni genotipo-ambiente, irrigazione anche con acque non convenzionali, lotta biologica e metodi di difesa ecocompatibile, fertilizzazione, fertirrigazione, disciplinari di produzione. Effetti delle tecniche agronomiche sulla qualità dei prodotti. Sviluppo di modelli: Water Use Efficiency, Nitrogen Use Efficiency. Idoneità alla trasformazione di prodotti ortofrutticoli e contributo alla definizione di parametri di processo.

Stato dell'arte:

Lo sviluppo �sostenibile� del sistema agroindustriale richiede la realizzazione di prodotti/processi innovativi nel settore della produzione primaria, della trasformazione e della qualificazione dei

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prodotti alimentari ed agroindustriali. Le produzioni primarie devono essere ottenute adottando sistemi produttivi ecocompatibili in pieno campo ed in coltura protetta.

Azioni

Attività in corso:

Progetti: SORBIO: agricoltura biologica; PIA: produzione di pasta arricchita con inulina; LICOPENE: tecniche agronomiche per ottimizzarne la produzione; 2E-BCAs, finanziato dalla C.E. e coordinato da ISPA: miglioramento, produzione ed impiego di biofitofarmaci; COL.GEL e Regione Abruzzo: sostenibilità e razionalizzazione delle colture protette e/o senza suolo; CARCIOFO: MiPAF, Regione Puglia, TIRCA; INNOVALO � patata: miglioramento di processo e della qualità della patata.


Il programma di attività 2005 comprende quasi esclusivamente progetti finanziati ed avviati per i quali si può stimare elevata fattibilità nel raggiungimento degli obiettivi. Da notare un forte aumento della massa spendibile (336.000 euro - PIA) dopo il 21/11/2004 di cui parziale anticipo entrate 2005.


Collaborazioni in atto: Commessa ISPA Microbiologia: ortaggi di quarta gamma ed alimenti funzionali. Università di Bari, IAM Valenzano, CRB Andria. Besana, La Metapontina, Greeproduct, Oranfizer: produzioni biologiche e prodotti di IV gamma. Univ. VT, CT e BA, ISPAVE, INRAN, ISPORT, IGV-CNR ricerche sul carciofo. INRA, IMaGO, Weizmann, UNINA, NCRI, HRI, Prophyta, VIZR per il progetto 2E-BCAs. Università di Lecce, Pierre Chimica, Galatina (Le): pomodoro ad alto licopene.

Finalità

Obiettivi:

Miglioramento della sostenibilità delle tecniche di coltivazione (ortofrutticoltura e colture industriali) e della qualità delle produzioni in pieno campo, in coltura protetta e senza suolo: avvicendamenti, irrigazione, fertilizzazione e difesa. Sviluppo di tecniche innovative, di impiego di biomasse microbiche e vegetali per la difesa delle colture. Agronomia, fitoiatria, fitopatologia, fisiologia vegetale, metodologia statistica.


Metodologie biologiche per la produzione di ortaggi (2005). Irrigazione anche con acque non convenzionali, fertilizzazione e difesa di specie orticole ed industriali in pieno campo (pomodoro e patata 2005) ed in coltura protetta (pomodoro 2005). Protocolli per l�allevamento senza suolo di ortaggi. (2005 - 2007). Produzione e metodi di impiego di microrganismi utili e di loro metaboliti bioattivi per la protezione delle piante (2006).

Potenziale impiego:


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Diagnostica avanzata e metodi innovativi per la caratterizzazione e analisi degli alimenti

Temi


Sviluppo di (bio)sensori, saggi immunometrici e nuovi metodi cromatografici e spettroscopici per l�accertamento della qualità e sicurezza degli alimenti e dei mangimi e per l�analisi di contaminanti (micotossine, fitofarmaci, funghi tossigeni, microrganismi patogeni e allergeni) in matrici di interesse agroalimentare. Caratterizzazione di proteine di origine alimentare. Sequenziamento di geni diagnostici e analisi del genoma (AFLP, RT, RLFP) di funghi tossigeni e di microrganismi patogeni.

Stato dell'arte:

Il problema della qualità, sicurezza e salubrità alimentare e dello sviluppo di tecnologie per la loro valutazione è uno dei cluster fondamentali delle strategie di R&S a cui anche il 6° PQ della UE dedica particolare attenzione. E� necessario un approccio multidisciplinare alla problematica, basato sull�impiego di tecniche chimico-fisiche e biologiche che comprendano innovazioni nelle tecniche tradizionali e lo sviluppo di micro e nano sistemi per la caratterizzazione ed analisi degli alimenti.

Azioni

Attività in corso:

Sviluppo di nuovi metodi cromatografici, (bio)sensori, saggi immunometrici, spettrometria di massa per la rilevazione di micotossine, fitofarmaci, funghi tossigeni e allergeni nascosti in alimenti. Metodologie proteomiche per lo studio delle vie biosintetiche di sostanze nocive nel vino. Studio della variabilità genetica di microrganismi patogeni e funghi tossigeni. Analisi in real time-PCR per la determinazione di funghi tossigeni in alimenti.


Disponibilità di nuove apparecchiature per lo svolgimento del programma di ricerca, finanziamento dei progetti in corso di valutazione, continuazione del rapporto di lavoro con il personale assunto con contratto a termine anche su fondi esterni. Le competenze del personale di ruolo e non afferente a questa macrolinea e dei ricercatori delle Istituzioni coinvolte garantiscono la fattibilità delle attività previste. Massa spendibile aumentata dopo il 21/11/2004.


Dip. Scienze Alim. UNI-TE; CNR IMM-Lecce, Barilla Alimentare S.p.A.; Azienda Vinicola Càntele Lecce; Consorzio Produttori Vini e Mosti Rossi Taranto; CNR ITB-Bari; APIBIO Francia; NMRC Irlanda, IBST Cranfield University UK; Dip. Plant Pathol., Kansas State University USA; USDA USA; UNI-TO Dip. Biol. Anim. Uomo; UNI-PR Dip. Chim. Gen. Inorg.; Marini Group s.p.a; Fondazione Biotecnologie TO.

Finalità

Obiettivi:

Sviluppo di metodologie genomiche, proteomiche e metabolomiche per l�individuazione di componenti nutrizionali e nocivi. Sviluppo di (bio) sensori, immunosaggi e di metodi cromatografici per l�analisi di contaminanti (micotossine, fitofarmaci, funghi tossigeni e microrganismi patogeni) e di metodi per il rilevamento di allergeni nascosti, micotossine e fitofarmaci mediante spettrometria di massa. Metodi molecolari per la diagnosi rapida quali/quantitativa di funghi tossigeni e batteri patogeni.

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2005: sonde di DNA e biosensore SPR a DNA per Fusarium, immunosaggio FP per DON, metodo MS per la determinazione simultanea di tricoteceni. Individuazione di �signature pepdites� per ricerca di allergeni alimentari nascosti. 2006: sonde di DNA e biosensore SPR a DNA per Aspergillus, Penicillium, immunosaggio FP per OTA, biosensore SPR per micotossine. Quantificazione allergeni per MS. 2007: DNA array a bassa densità. Riduzione di amine biogene nei vini.

Potenziale impiego:


Tecnologie per la trasformazione, conservazione e confezionamento

Temi


L�azione prevede direttrici di studio inerenti gli argomenti di indagine affrontati dalla ricerca internazionale e già avviati nell�Istituto: interventi alternativi di gestione postraccolta (termoterapia, raggi UV, confezionamenti), prevenzione delle alterazioni attraverso il controllo biologico (microrganismi antagonisti, oli essenziali), valorizzazione della qualità (organolettica, nutrizionale, salutistica), film plastici, minimal processing.

Stato dell'arte:

Nell�ipotesi di preservare qualità e vita dei prodotti, la ricerca internazionale esplora aspetti significativi di fisiologia e tecnologia. In particolare vengono oggi studiati mezzi fisici alternativi di conservazione e mezzi di natura biologica che riguardano il controllo delle condizioni ambientali postraccolta (temperatura, umidità, atmosfera) e lo studio dei microrganismi patogeni. A tali settori si rende indispensabile riferire le linee di ricerca per una fattiva evoluzione del sistema.

Azioni

Attività in corso:

Nell�ambito del postraccolta viene profuso un ampio impegno verso le osservazioni di base e le innovazioni tecnologiche, con l�intento di approfondire le conoscenze nell�ambito degli aspetti fisiologici coinvolti nei processi di conservazione. Sono pertanto largamente indagati i biochimismi, l�impiego di mezzi biocompatibili alternativi all�uso di sostanze chimiche di sintesi (impiego di microrganismi antagonisti di agenti patogeni, raggi UV, prodotti GRAS), i parametri ambientali di gestione.


E� previsto un piano operativo fattibile grazie alla presenza degli operatori di ricerca. Le attività descritte prevedono un adeguato apporto finanziario per sopperire alle spese di gestione della macrolinea e all�acquisizione di alcune apparecchiature di supporto non presente nella Struttura. Questi ultimi aspetti rappresentano punti critici che in base alla disponibilità vincoleranno l�ampiezza dello spazio scientifico da affrontare. Massa spendibile aumentata dopo il 21/11/04.


Proseguiranno le collaborazioni già in atto con istituzioni di altri Paesi, dipartimenti universitari e istituti di ricerca del CNR coinvolti nei settori scientifici in argomento.

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Finalità

Obiettivi:

L�obiettivo è di pervenire ad un approfondimento delle conoscenze di base nell�ambito degli aspetti fisiologici, fitopatologici e biochimici del postraccolta, nonchè di perfezionare innovazioni tecnologiche tese all�acquisizione di metodologie di conservazione e trasformazione degli alimenti di origine vegetale. Il carattere multidisciplinare delle ricerche sollecita competenze in svariati settori (biochimica, fisiologia, tecnologia alimentare), per altro presenti all�interno dell�Istituto.


Fra le risposte attese più significative vanno menzionate: quelle inerenti gli interventi di lotta biologica per prevenire le infezioni; l�uso della termoterapia, i trattamenti con raggi ultravioletti, l�utilizzo dei prodotti GRAS che potranno consentire la sostituzione o l�impiego minimo di fungicidi convenzionali; l�approfondimento della qualità nutrizionale e salutistica e la messa a punto della tecnologia di processo dei prodotti di IV gamma. Si prevede uno sviluppo temporale di tre anni.

Potenziale impiego:


Tecnologie e biotecnologie per lo studio della qualità degli alimenti e per la produzione di molecole di importanza organolettica nutrizionale e salutistica

Temi


Produzione di antocianine, stilbeni e vitamina E da sistemi vegetali. Analisi di licopene estratto con CO2 supercritica. Identificazione di marcatori AFLP/geni vegetali. Produzione di enzimi/proteine vegetali. Caratterizzazione di acidi grassi e terpeni in prodotti caseari. Caratterizzazione della componente fenolica e attività biologica di estratti vegetali. Caratterizzazione del quadro proteico/profilo amminoacidico di fonti proteiche vegetali anche in relazione a fattori genetici/ambientali.

Stato dell'arte:

C�è una sempre maggiore attenzione da parte del consumatore nei confronti della tipicità e della qualità nutrizionale e salutistica dei prodotti alimentari. D�altro canto l�industria agroalimentare richiede sempre di più prodotti di origine naturale in sostituzione di quelli di sintesi. Ciò ha stimolato la ricerca nel settore delle tecnologie e biotecnologie per lo studio di marker di qualità e di tipicità e per la produzione di molecole di origine naturale importanti per l�industria alimentare.

Azioni

Attività in corso:

Biofabbriche (colture cellulari in vitro e piante GM) per produzione di antiossidanti. Produzione, attività biologica, stabilità del licopene. Clonaggio di geni per studio e produzione di proteine vegetali. Valutazione di marcatori biochimici di qualità in prodotti vegetali freschi, conservati, di IV gamma. Studio di proteine e lipidi per alimentazione animale, individuazione di molecole per tipizzazione prodotti caseari. Marcatori molecolari per la tipicità dei prodotti alimentari.

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Nella produzione di antiossidanti, i punti critici riguardano la resa, l�attività biologica e la stabilità delle molecole prodotte. La produzione di proteine ricombinanti presenta aspetti critici relativamente alla purificazione delle proteine prodotte. La caratterizzazione di inulina e l�individuazione di marcatori di qualità di ortofrutticoli sono subordinate al puntuale svolgimento delle attività da parte dei partner dei vari progetti. Massa spendibile aumentata dopo il 21/11/2004


Università di Lecce; Università di Bari; Università di Torino; Università di Milano, Istituto Sperimentale per la Zootecnia del MIPAF, Torino; IMM- CNR; ICM-CNR; IBBA-CNR; IGV-CNR; IBMP-CNRS; John Innes Centre, UK, ENEA, Roma; INRAN, Roma.Pierre Chimica, Galatina (Le), Lachifarma, Zollino, (Le); COOPAS, Maglie, CRB, Castel del Monte; CRAB, Avezzano, Silva Chimica s.r.l., Mondovi�, Cuneo; ERSAF-Lombardia; Consorzio per la Tutela del Formaggio Grana Padano.

Finalità

Obiettivi:

Valorizzazione dei prodotti mediante studio e caratterizzazione di componenti nutrizionali/antinutrizionali, salutistiche e altri indicatori di qualità in relazione a fattori genetici, tecniche di produzione/conservazione. Valutazione del quadro proteico in condizioni di stress. Tipizzazione di prodotti mediante marcatori biochimici e molecolari. Produzione tecnologica e biotecnologica di composti naturali per l�industria agroalimentare. Competenze:Biologia cellulare e molecolare, biochimica


Nel triennio 2005-2007 si prevedono i seguenti risultati: Produzione biotecnologica/caratterizzazione di molecole di importanza agroalimentare/bio-medica (antiossidanti naturali, enzimi, inulina). Marcatori biochimico-molecolari per valutazione di qualità di prodotti di origine animale/vegetale e per caratterizzazione di produzioni tipiche. Caratterizzazione di fonti proteiche e lipidiche vegetali per alimentazione animale. Caratterizzazione di inulina da fonti vegetali alternative

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005

Microbiologia e qualità delle produzioni alimentari


Prodotti panari: per quanto concerne la procedura oggetto di brevetto sono in corso prove per semplificare il processo di produzione e per ridurre i costi. Prodotti vegetali: in riferimento alle conserve probiotiche un punto critico è l’adeguamento degli impianti dell’azienda di trasformazione dei prodotti ortofrutticoli agli standard microbiologici necessari per la realizzazione dell’alimento. Produzioni vinicole: disponibilità di metodiche idonee alla caratterizzazione tecnologica di lieviti vinari; messa a punto di un protocollo efficiente per la produzione di biomassa di lievito. Prodotti

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lattiero-caseari: in riferimento ai microrganismi marker della qualità, si rende necessario il miglioramento dell’efficienza di estrazione degli acidi nucleici da matrici complesse. Un punto di criticità generale è costituito dall’impossibilità attuale di offrire opportunità di carriera ai ricercatori a tempo determinato (assegnisti, dottorandi, contrattisti ecc.); ciò genera un ricambio eccessivo di giovani con conseguente perdita di tutte le esperienze maturate.

Collaborazioni

La collaborazione Biotecgen (Lecce) non si è ancora realizzata in quanto il progetto è in fase di valutazione al MIUR. Nuove collaborazioni: ICRM-CNR nell’ambito di un Progetto sui salumi finanziato dalla Regione Lombardia; Azienda Agraria Duca Carlo Guarini (Scorrano, Lecce) per la selezione di lieviti autoctoni da mosti. In seguito alla cessione in licenza d’uso dei due brevetti del settore alimenti vegetali sono state attivate le collaborazioni con l’azienda COPAIM e la sua collegata La Chiavicella. Inoltre, è stata attivata la collaborazione con Alithea per le prove presso aziende che prevedono l’uso del prodotto oggetto di brevetto realizzato nel settore panario. Per la caratterizzazione della microflora autoctona ed il monitoraggio del quadro igienico-sanitario degli allevamenti del settore lattiero-caseario sono in atto collaborazioni con Aral, Crema; Associazione Regionale Produttori Latte ed Associazione Allevatori Piemonte; Istituto Sperimentale Italiano Lazzaro Spallanzani, Milano. Progetti finanziati dal MIPAF, Regione Piemonte e Fondazione CARIPLO. Il Comune di Lecce ha finanziato un progetto per il miglioramento della qualità di vini salentini.


Per i prodotti panari è stato realizzato un brevetto che prevede l’applicazione di metaboliti di un batterio lattico per la prevenzione di alterazioni microbiche nel pane e sono stati selezionati ceppi di lieviti capaci di ridurre i livelli di fitato nei lievitati da forno. Per quanto concerne i prodotti vegetali due brevetti (realizzati nel 2003-2004) riguardanti conserve ortofrutticole arricchite di batteri probiotici sono stati ceduti dal CNR ad una azienda leader in Italia per la gastronomia vegetale ed è stata avviata la fase di sperimentazione su scala semi-industriale per la realizzazione del prodotto commerciale. Inoltre, sono stati selezionati ed applicati batteri probiotici in mangimi destinati all’alimentazione di suini in svezzamento. Per quanto riguarda le produzioni vinicole sono state avviate prove per l'utilizzo di ceppi microbici autoctoni per il miglioramento della qualità dei vini tipici.


Sono stati conseguiti tutti i risultati previsti per il 2005 per tutte le produzioni oggetto di studio in questa commessa. Per i prodotti panari è stato realizzato un brevetto che prevede l'uso dei metaboliti di un batterio lattico per la prevenzione di alterazioni microbiche nei lievitati da forno. Sono stati selezionati ceppi di lieviti che riducono i livelli di fitato nel pane. Produzioni vinicole e carnee: Sono stati selezionati ceppi autoctoni per il miglioramento dei prodotti. Prodotti lattiero-caseari: Registrazione DOP della ‘Formaggella del Luinese’. Monitoraggio molecolare di Staphylococcus aureus nel latte e di lattobacilli proteolitici in formaggi a pasta filata. Analisi comparativa tra enterococchi di origine alimentare e clinica. Validazione di sonde genetiche per “DNA array” per l’identificazione di specie di lattobacilli. Prodotti vegetali: uso di microrganismi probiotici per la realizzazione di conserve vegetali ed avvio della sperimentazione su scala semi-industriale.

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-La maggiore criticità è costituita dalla mancanza di personale, principalmente tecnico. A questa carenza si è supplito finora con l’impegno dei ricercatori e, laddove possibile, con la fattiva collaborazione di personale universitario. -Per quanto riguarda le ricerche sulle attività enzimatiche, condotte presso la sede ISPA di Torino, per poter competere al massimo livello, sarebbe necessario acquisire una PCR RT per la quale non è facile avere le risorse finanziarie, ma soprattutto presuppone l’acquisizione di personale specializzato con contratti di almeno triennali. -Un’ultima criticità è rappresentata dalla distanza tra i centri di ricerca della commessa, cui si può ovviare sia con missioni dei responsabili di modulo o di commessa sia con mezzi informatici; resta comunque difficile presentare proposte di ricerca congiunta, e gli sforzi fatti hanno permesso di ottenere i primi, anche se parziali, risultati significativi.

Collaborazioni

· Come previsto sono state attivate collaborazioni con strutture di ricerca e produttive per poter calibrare le attività di ricerca della commessa. · Oltre a quelle preventivate sono state attivate nel corso dell’anno due nuove collaborazioni con - Nutralleva, primaria azienda mangimistica, con cui si è avviato un percorso di verifica dei problemi della produzione cui la ricerca applicata può dare risposta; - la Facoltà di Veterinaria - UniMessina - per le competenze necessarie allo sviluppo delle tematiche del benessere animale. · Sono state confermate le collaborazioni con l’Associazione Piscicoltori italiani, con le aziende Itticomp e Regionale Veneto, con la Stazione Zoologica di Napoli, con il CRIAQ – UniNa, con l’Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle tre Venezie e del Piemonte, Liguria e Valle d’Aosta, con l’ICRAM, con le Università di Messina – Dip. di Chimica Organica – e di Napoli - Scienze Biologiche. · Inoltre, continuano le collaborazioni con istituzioni estere: Laboratorio de Biologia Marina dell’Universidade de Bahia (Brasile) e con gli istituti afferenti al progetto dell’UE Q5RS 01701.


Non sono emersi apprezzabili scostamenti da quanto preventivato. - La sede di Lesina (ISMAR) ha registrato alcuni ritardi nel programma di riproduzione di invertebrati marini dovuti ai lavori di ristrutturazione dei laboratori e al mancato reperimento di esemplari maturi di una delle specie di bivalvi in studio. - Il monitoraggio ambientale svolto durante la conduzione dell’allevamento pilota di vongola verace è stato avviato solo in ottobre per un ritardo nella messa in funzione di un correntometro


Nel complesso i risultati conseguiti corrispondono a quelli attesi con alcuni scostamenti marginali. -Proteine vegetali per pesci carnivori: come preventivato sono state determinate le attività enzimatiche di trota e storione e con definizione dei primi quadri istochimici di pesci alimentati con vegetali. Non prevista, in corso la messa a punto di una metodica di digeribilità in vitro con una metodologia innovativa. -Rovello: come preventivato, messa a punto di un protocollo per la riproduzione con caratterizzazione della morfologia ultrastrutturale degli spermatozoi. -Riccio di mare: come preventivato, è stato studiato l’effetto di parametri ambientali e della dieta; -Vongole: iniziato solo in autunno il ripopolamento della vongola comune lungo le coste della Puglia ed è proseguito l’allevamento pilota di vongola verace. -Crostacei: come previsto sono stati raccolti i dati di pesca e quelli analitici, sanitari e organolettici sulle carni; attualmente sono in corso le elaborazioni statistiche. -Spigola: come preventivato è stata fatta una prima stima del rapporto sessi in ceppi da ginogenesi e una valutazione della “fluenza” in maschi ginogenetici.

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Era previsto un piano operativo fattibile grazie alla presenza degli operatori di ricerca. Le attività programmate facevano rilevare la necessità di un adeguato apporto finanziario per sopperire alle spese di gestione della macrolinea postraccolta e all’acquisizione di alcune apparecchiature di supporto non presenti nella Struttura. Questi ultimi aspetti hanno rappresentato punti critici che hanno condizionato lo sviluppo dello spazio scientifico affrontato. Nella fase finale dell’anno in corso si sta provvedendo ad ampliare le attrezzature scientifiche con disponibilità finanziarie già presenti, il che favorirà certamente un salto qualitativo delle ricerche in atto. Permane purtroppo la difficoltà di un facile accesso alle fonti di finanziamento che limitano evidentemente le potenzialità di completa eccellenza della commessa postraccolta.

Collaborazioni

Proseguono le collaborazioni con istituzioni di altri Paesi (USA, Israele, Belgio), dipartimenti universitari e istituti di ricerca del CNR coinvolti nei settori scientifici inerenti la commessa postraccolta. Nel corso dell’attività i ricercatori hanno avuto modo di effettuare stage di studio che hanno consentito scambi e approfondimenti scientifici coi ricercatori di istituzioni di ricerca straniere (Department of Plant Sciences, University of California, Davis USA; Institute for Technology and Storage of Agricultural Products, Bet-Dagan Israele; Department of Life Sciences, Flanders Centre Laboratory of Postharvest Technology, Katholieke Universiteit Leuven de Croylaan, Heverlee Belgio, International Committee nn Intense Light Application on Postharvest Crops).


Si ritiene di essere in linea con quanto prospettato in fase di programmazione


Fra le risposte attese più significative erano menzionate quelle inerenti: gli interventi di lotta biologica (microrganismi antagonisti, sostanze naturali) per il controllo dei patogeni; l’uso di mezzi fisici per trattamenti alternativi di difesa (termoterapia, trattamenti con raggi ultravioletti); l’utilizzo di prodotti GRAS (Generally Recognized As Safe compounds) e di nuovi formulati fungicidi per consentire la sostituzione o l’impiego ridotto degli anticrittogamici convenzionali; l’approfondimento della qualità nutrizionale e salutistica; la messa a punto di nuove tecnologie di preparazione del prodotto inerenti in particolare gli alimenti di IV gamma. Nel corso del 2005 i traguardi dianzi menzionati sono stati di fatto raggiunti e documentati dalle pubblicazioni a livello nazionale e internazionale, nonché dall’attività costantemente svolta che condurrà ad ulteriori resoconti scientifici. Vanno menzionati in particolare i risultati ottenuti nell’ambito dei progetti in corso (Liste di orientamento varietale, Piano Agrumicolo Nazionale, fase conclusiva del Biofrum) che hanno visto una adeguata divulgazione in diversi incontri scientifici.

Biotecnologie per la qualità e sicurezza degli alimenti


L'aggiornamento dei fattori di criticità riguarda la carenza di personale tecnico necessario per lo svolgimento di alcune attività. E' inoltre emersa la necessità di provvedere all'acquisizione di alcune apparecchiature necessarie per l'ottimizzazione del processo di produzione e purificazione di enzimi ricombinanti. Permangono infine come fattori critici la resa e la stabilità di alcune delle molecole prodotte. Per tale aspetto occorrerà sviluppare nuovi protocolli sperimentali

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Collaborazioni

Università di Lecce; Università di Bari; Università di Torino; Università di Milano, Istituto Sperimentale per la Zootecnia del MIPAF, Torino; IMM- CNR; ICM-CNR; IBBA-CNR; IGV-CNR; IBMP-CNRS; John Innes Centre, UK, ENEA, Roma; INRAN, Roma.Pierre Chimica, Galatina (Le), Lachifarma, Zollino, (Le); COOPAS, Maglie, CRB, Castel del Monte; CRAB, Avezzano, Silva Chimica s.r.l., Mondovì, Cuneo; ERSAF-Lombardia; Consorzio per la Tutela del Formaggio Grana Padano. Sono state attivate nuove collaborazioni con le seguenti istituzioni: Università del Molise, Università di Pisa, Università degli Studi di Foggia, Università S. Paolo, Brasile, Ospedale Regina Margherita, Istituto sperimentale per colture foraggere, Associazione Regionale Produttori Latte Piemonte, Università degli Studi di Bari, COOPAS (Maglie), CRAB (Avezzano), INRAN (Roma), Istituto Regina Elena (Roma), CRB (Andria).


In aggiunta ai risultati previsti è stato portato a termine uno studio sulla variabilità molecolare mediante analisi AFLP di varietà Pugliesi di Fico.


I principali risultati attesi sono stati raggiunti.Individuazione di molecole per tipizzazione di prodotti caseari;caratterizzazione di fonti lipidiche vegetali per alimentazione animale;definizione del quadro fermentativo e proteico/aminoacidico di insilati d’erba medica; produzione di vitamina E ed antocianine da colture di cellule vegetali; produzione di piante di pomodoro con aumentata sintesi di antiossidanti; caratterizzazione di enzimi coinvolti in degradazione di carotenoidi e produzione di aromi; analisi di oleoresine ad alto contenuto di licopene e loro attività biologica; identificazione di marcatori molecolari per caratterizzazione di cultivar Pugliesi di olivo; individuazione di sonde di DNA specifiche per Fusarium culmorum, Penicillium expansum e Aspergillus carbonarius e A. japonicus; sviluppo di un metodo molecolare real time-PCR per la diagnosi quantitativa di A. carbonarius su uva. Caratterizzazione molecolare e valorizzazione di lieviti autoctoni.

Sistemi produttivi sostenibili e qualità dei prodotti vegetali


Il programma di attività 2005 comprendeva quasi esclusivamente progetti finanziati ed avviati per i quali si poteva stimare elevata fattibilità nel raggiungimento degli obiettivi. Unico problema è stata la firma del contratto del progetto 297 - COL-GEL, prevista ad inizio anno, che è stata rinviata alla fine del 2005; dopo la firma del contratto sarà possibile avviare le attività utilizzando un materiale fornito da uno dei partner del progetto.

Collaborazioni

Ai committenti U.E., MiUR, MiPAF, MAP, Regione Puglia, Regione Abruzzo, UNIBA-DSPV si è aggiunto il Consorzio Train per il Progetto AGHROLOGIS. Sono attive tutte le collaborazioni previste: Commessa ISPA Microbiologia: ortaggi di quarta gamma ed alimenti funzionali. Università di Bari, IAM Valenzano, CRB Andria. Besana, La Metapontina, Greenproduct, Oranfizer: produzioni biologiche e prodotti di IV gamma. Univ. VT, CT e BA, ISPAVE, INRAN, ISPORT, IGV-CNR ricerche sul carciofo. INRA, IMaGO, Weizmann, UNINA, NCRI, HRI, Prophyta, VIZR per il progetto 2E-BCAs. Università di Lecce, Pierre Chimica, Galatina (Le): pomodoro ad alto licopene.

289



Sono stati ottenuti tutti i risultati previsti per il 2005. Non è stato avviato il progetto 297 -COL-GEL per il quale non erano previsti risultati nel 2005, i ritardi sono recuperabili. Sono stati ottenuti nel 2005 prodotti previsti per il 2006: applicazione di microrganismi per la difesa di colture orticole (progetto europeo CROPS). In collaborazione con la commessa di microbiologia è stata condotta una sperimentazione per la produzione su scala semi-industriale di carciofo probiotico. E' stato ottenuto un nuovo prodotto di IV gamma di fiori di zucchino.


Sono state condotte le attività ed ottenuti i risultati attesi per quanto riguarda: - metodologie biologiche per la produzione di ortaggi: produzione di scarola e ruchetta; - irrigazione anche con acque non convenzionali, fertilizzazione e difesa di specie orticole ed industriali in pieno campo ed in serra: protocollo per produrre pomodoro da industria ad alto contenuto in licopene e valutazione di cultivar di patata primaticcia; protocollo per migliorare la qualità del pomodoro da mensa. - protocolli per l’allevamento senza suolo di ortaggi: protocollo a basso impatto ambientale per la coltura fuori suolo del pomodoro. - Si è concluso il progetto triennale MIPAF riguardante la valutazione di nuovi ibridi di carciofo propagati per seme. - Si è concluso il primo anno di attività del progetto regionale " Interventi urgenti sul carciofo". - E' stata valutata l'idoneità alla trasformazione di nuove cultivar di zucchino e melanzana (i risultati hanno consentito la preparazione di un Progetto Strategico della Regione Puglia).

Sicurezza alimentare e metodi innovativi per la caratterizzazione degli alimenti


Non vi sono particolari aggiornamenti sui punti critici già evidenziati nel piano annuale 2005. Si sottolinea il ritardo nell’ottenimento di fondi ministeriali di alcuni progetti in corso e di un progetto MIUR approvato, ma non ancora finanziato, e la necessità di continuare il rapporto di lavoro con il personale assunto con contratto a termine su fondi esterni.

Collaborazioni

Si confermano le collaborazioni previste nel preventivo:Co.Ri.Al (Foggia); Syngenta Crop Protection; Bayer CropScience; Min.Salute; Regioni Piemonte, Puglia, Abruzzo, Lombardia; ISLC-CRA (Lodi); Bioindustry Park Canavese (TO); Vicam Ltd(USA); Università di Bari (DPPMA), Foggia (D.Sc.AgAmbChimDifVeg), Campobasso (DiSAABA), Napoli Federico II (Dip.Sc.Al.), Milano (Dip.STVSA), Lecce (DiSTeBA), Parma (DIPABQSA), Teramo (DSA), Torino (Dip.Biol.An.U.) ed estere Universidad Rio Cuarto (Argentina), Innsbruck Uni(Austria), Cranfield Uni(UK), Kansas State Uni(USA), PROMEC (SudAfrica); CNR IMM-Lecce, CNR ICTP, CNR ISA, CNR ISMAR; Barilla Alimentare; Az. Vinicola Càntele (Guagnano-LE); Cons. Prod. Vini Mosti Rossi (Manduria-TA); CNR ITB-Bari; APIBIO (Francia); NMRC (Irlanda), IBST, USDA (USA); Marini Group s.p.a; Fondazione Biotecnologie (TO), Soc.Prod.Sementi(BO), ISC-CRA (Roma), Com. Montane Valsassina, Valvarrone, Val d'Esino e Riviera; ENEA; INRA (Francia), TNO (Olanda), Safe Consortium (Brussels), Feed Ind.Serv.(Lodi), COOP (MI); PEI, Langen (D), Molini Tandoi Pellegrino (Corato-BA),ISNP, Ist.Ferment.Ind.-CSIC(Madrid).


I risultati ottenuti, in aggiunta a quelli indicati nel piano annuale 2005, derivano dalle attività di ricerca previste nell’ambito dei numerosi progetti relativi alla Commessa.

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Sono stati ottenuti tutti i risultati previsti nel piano annuale 2005. Inoltre, sono state condotte attività che hanno portato ai seguenti risultati: determinazione di fosfina in campioni di frumento mediante sensori QCM; sintesi di un polimero con affinità per il deossinivalenolo; valutazione di chemotipi di Fusarium culmorum produttori di tricoteceni; “DNA arrays” per l’identificazione di batteri lattici; caratterizzazione della tipologia di latte sulla base del differenziamento del DNA; metodo LC-IMA/FLD per ocratossina in uva, vinacce e fecce; metodo HPLC per aflatossine in insilati di mais, foraggi e mangimi e per aflatossina M1 in latte ovino e caprino; selezione biochimica di ceppi di lievito apiculati da mosti di uve; caratterizzazione dell’olio di oliva in termini di origine geografica, cultivar, qualità, genuinità e shelf life mediante NMR; sviluppo di metodologie cromatografiche ed elettroforetiche per il riconoscimento di specifiche sostanze e molecole chirali in matrici agroalimentari da utilizzare come indici molecolari di processo e/o di prodotto.



Non ci sono particolari aggiornamenti sui punti critici già evidenziati nel piano annuale 2005, mentre si sottolinea il ritardo nell'ottenimento di fondi ministeriali su di un progetto MIUR (legge 297 -SIVINA)approvato nel 2004 dovuto a cause tecnico-burocratiche.

Collaborazioni

Si confermano le collaborazioni previste nel preventivo: Syngenta Crop Protection; Bayer CropScience; Società Produttori Sementi (Bologna), Istituto Sperimentale di Cerealicoltura-CRA (Roma), Comunità Montane Valsassina, Valvarrone, Val d'Esino e Riviera; ENEA; Università di Bari (DPPMA), Foggia (Dip. Sc Ag-Amb. Chim. e Dif Veg.), Campobasso (Dip. Sc. An.Veg. e Amb.Pat.), Lecce, Parma, Un. Catt. Piacenza (Is. Ent e Pat. Veg.), Napoli Federico II (Dip Sc. Al.), Milano (Dip.STVSA), Lecce (Dip. Sc. Tec Biol. Amb.), Torino (Dip.Biol.An.Uomo); University of Rio Cuarto (Argentina), Kansas State Univesity (USA), Medical Research Council (Sud-Africa), Agric. Biotechnology Center, Gödöllo (Ungheria) USDA-USA; INRA, Francia; TNO, Olanda; Safe Consortium, Brussels; Istituti e Laboratori Sperimentali dei Servizi nazionali; Fondazione Biotech, (TO); Feed Industry Service, Lodi; COOP, (MI); PEI, Langen (D); Cantele Vini, Guagnano,(LE); Consorzio Produttori Vini, Manduria (TA); Molini Tandoi Pellegrino, Corato (BA); Ospedale Infantile Regina Margherita Torino; Ospedale S. Anna Torino.


Si includono alcuni risultati aggiuntivi rispetto a quelli previsti: determinato il livello di contaminazione da ocratossina A in alimenti e sangue di polli da carne e galline ovaiole provenienti da allevamenti convenzionali e biologici nel territorio piemontese; determinato il livello di contaminazione da zearalenone in insilati di mais aziendali in relazione al livello di deterioramento aerobico; valutazione clinica e immunologica dell'utilizzo del latte di asina in soggetti gravemente allergici al latte bovino; studio degli effetti della somministrazione di aflatossina B1 e delle cinetiche di escrezione dell'aflatossina M1 nel latte di pecora; studio dell'azione di metaboliti prodotti da alcuni funghi eduli con proprietà medicinali sulla sintesi di aflatossine; indagini sulle risposte fisiologiche del tubero di patata allo stress ossidativo abiotico provocato da ferite da taglio.


Rispetto ai risultati attesi non sono da evidenziare particolari scostamenti per l'anno 2005. In particolare si sono ottenuti i seguenti risultati: sviluppo di un modello previsionale per la fusariosi del

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grano; identificazione di fattori biotici e abiotici di rischio per l'accumulo di ocratossina A nei vigneti di Negroamaro e Primitivo; caratterizzazione di lieviti utili per il controllo di Aspergilli ocratossigeni; determinazione della distribuzione di ocratossina A nei prodotti della vinificazione di uve Primitivo e Negroamaro; valutazione di alcuni metodi abiotici e biotici di decontaminazione di ocratossina A nel vino; valutazione dell¡¯effetto dello zearalenone e dei suoi derivati (alfa e ¦Â-zearalenolo) sulla motilit¨¤ e sul DNA degli spermatozoi suini e induzione di atresia dei follicoli ovarici di cavalla; sviluppo di un nuovo metodo LC-MS/MS per la determinazione del biomarker urinario di esposizione al deossinivalenolo; individuazione e caratterizzazione di allergeni del pomodoro e della ciliegia e di allergeni naturali e ricombinanti di soia e nocciola; valutazione dell¡¯efficacia di trattamenti (fungicidi e pesticidi) su mais e frumento nel contenuto in micotossine.

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Commesse 2006:

Microbiologia e qualità delle produzioni alimentari

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MARIA MOREA Elenco dei partecipanti liv. Baruzzi Federico III Battelli Giovanna III Brasca Milena III Caputo Leonardo III Cavallo Marinella V Cecchini Cristina VI Grieco Francesco III

liv.Lavermicocca Paola II Lodi Roberta II Lonigro Stella Lisa V Martena Simonetta VII Morea Maria II Piccolo Michele VII

liv. Poltronieri Palmiro III Ricci Giuseppe VIIISisto Angelo III Todesco Rosanna II Valerio Francesca VI Valerio Paolo VII

Temi

Tematiche di ricerca Prodotti vegetali: applicazione di ceppi microbici (probiotici e/o starter e non-starter) per il miglioramento della qualità funzionale e conservabilità; studio di popolazioni microbiche indesiderate. Prodotti panari e pasta: prolungamento della conservabilità; selezione tecnologica del lievito naturale e delle semole. Prodotti lattiero-caseari: definizione di standard produttivi; identificazione di marker della qualità; prolungamento della conservabilità. Prodotti carnei: selezione ed uso di ceppi autoctoni per la valorizzazione dei salumi; valutazione della presenza di microrganismi indesiderati. Produzioni ittiche: applicazione di ceppi microbici probiotici e non per il miglioramento della qualità e della conservabilità.

Stato dell'arte La Commessa si occupa dell’area della produzione degli alimenti con studi finalizzati al miglioramento della qualità attraverso 1) selezione, caratterizzazione ed uso di popolazioni di microrganismi responsabili della trasformazione degli alimenti e di microrganismi probiotici per la realizzazione di alimenti funzionali; 2) valutazione dei trattamenti tecnologici e messa a punto di tecniche innovative per il miglioramento dei processi produttivi.

Azioni

Attività da svolgere Prodotti panari e pasta: uso di metaboliti antimicrobici da batteri lattici per aumentare la conservabilità dei pani tipici in prove di laboratorio ed in azienda. Caratterizzazione tecnologica e molecolare di microrganismi da semole ed impasti acidi. Miglioramento del protocollo di produzione di un prodotto antimicrobico brevettato. Prodotti vegetali: prove di produzione su scala industriale di conserve arricchite di batteri probiotici. Selezione di microrganismi probiotici. Produzione ed uso di alimenti probiotici per la modulazione della microflora intestinale. Studio di microrganismi vantaggiosi e/o indesiderati. Prodotti lattiero-caseari: identificazione di marker di qualità; tecniche

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innovative per il controllo delle produzioni a denominazione e per il sostegno dei marchi di origine; selezione di microrganismi probiotici filocaseari; valutazione dell’effetto dei processi produttivi e dei trattamenti tecnologici sulle caratteristiche di qualità e tipicità; studi per il prolungamento della conservabilità. Prodotti carnei: selezione tecnologica ed uso di microrganismi per il miglioramento della qualità dei prodotti ed il controllo di microrganismi patogeni.

Punti critici e azioni da svolgere Prodotti panari e pasta: miglioramento del protocollo di produzione di metaboliti antimicrobici finalizzato anche alla riduzione dei costi. Produzione su scala semi-industriale di un prodotto antimicrobico e sua applicazione in azienda panaria. Selezione di ceppi microbici e semole con rilevanti proprietà tecnologiche. Prodotti vegetali: adeguamento di impianti aziendali per l’ottenimento di standard microbiologici necessari per la realizzazione della conserva probiotica. Problematiche di confezionamento ed etichettatura. Selezione di batteri probiotici con attività inibente patogeni intestinali (anche ammoniogeni). In riferimento all'utilizzo di microrganismi probiotici è prevista la loro applicazione ad altri prodotti vegetali e a prodotti ittici nell'ambito della collaborazione con l'azienda COPAIM. Prodotti lattiero-caseari: in riferimento ai microrganismi marker della qualità si rende necessario il miglioramento dell’efficienza di estrazione degli acidi nucleici da matrici complesse. Prodotti carnei: variabilità e complessità delle popolazioni microbiche naturali. Applicazione in produzioni industriali di ceppi selezionati.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine La presenza nella Commessa di competenze nel campo della microbiologia, biologia molecolare, bioinformatica, proteomica e chimica consente l’utilizzo di metodologie di studio e di analisi per lo sviluppo di prodotti di interesse agro-alimentare. In particolare, la caratterizzazione delle proprietà tecnologiche e funzionali dei microrganismi ed il loro utilizzo, la valutazione dei trattamenti tecnologici nonché la messa a punto di tecniche innovative per il miglioramento dei processi produttivi consentono la formulazione e produzione di alimenti di qualità e con innovative e/o supplementari caratteristiche nutrizionali. Le principali strumentazioni utilizzate per lo svolgimento di analisi microbiologiche, biochimiche e molecolari sono: sistemi elettroforetici per la separazione e l’analisi di proteine ed acidi nucleici, sistemi HPLC e sistemi per il sequenziamento di acidi nucleici.

Collaborazioni (partner e committenti) Dipartimento Protezione Piante e Microbiologia Applicata-UNIBA (Progetto PANTI); Sezione Gastroenterologia e Endoscopia Digestiva – UNIBA (Progetto Fegato e alimenti funzionali); Università Cattolica, Istituto di Microbiologia - UNIPIACENZA (Prog. Vegetali probiotici); Università di Torino (Prog. Regione Piemonte); CNR-IBBA (Prog. FILTRASAL, LATCRU, Cariplo); CNR- ICRM (Progetto Metadistretto); MIPAF (Prog. Microflora autoctona, IDENTILAT); MIUR (Prog. PANTI); Regione Lombardia (Prog. Metadistretto, LATCRU, FILTRASAL); ARAL, Crema (CR) (Prog. LATCRU); Comunità Montane Lombardia (Prog. Caratterizzazione produzioni casearie); ILC, Lodi (Prog. Microflora autoctona); Ist. Sper. It. Lazzaro Spallanzani- Milano (Prog. IDENTILAT); Ass. Allev. Piemonte (Prog. Regione Piemonte); Fondazione Caripuglia, Bari (Prog. Fegato e alimenti funzionali); CNA Puglia, Bari (Prog. RIDITT-AGRIBIT); Molino Tandoi-Pellegrino - Corato (BA), Divella - Rutigliano (BA), PANSUD - Lacedonia (AV), Panificio La Maggiore - Altamura (BA)(Progetto PANTI); Caseificio dei Colli Pugliesi, Santeramo in Colle (BA)(Prog.RIDITT); Agrosud Aradeo (LE); COPAIM spa, Albinia (GR); La Chiavicella, Trinitapoli (FG).

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Finalità

Obiettivi Miglioramento delle caratteristiche dei pani tipici. Valorizzazione di formaggi tradizionali e definizione degli standard produttivi. Selezione ed uso di ceppi microbici probiotici e non e loro metaboliti e caratterizzazione molecolare di microrganismi utili e/o dannosi per il miglioramento della qualità delle produzioni alimentari.

Risultati attesi nell'anno Prodotti panari e pasta: miglioramento della procedura di produzione di metaboliti antimicrobici ed applicazione dell’antimicrobico in produzioni aziendali per il miglioramento della conservabilità del pane. Selezione di ceppi microbici con rilevanti caratteristiche tecnologiche. Selezione di semole con rilevanti caratteristiche tecnologiche. Prodotti vegetali: produzione a livello semi-industriale di conserve probiotiche. Selezione di almeno un ceppo batterico attivo contro batteri enteropatogeni. Uso di conserve probiotiche per la modulazione della microflora intestinale. Prodotti lattiero-caseari: caratterizzazione delle componenti che contribuiscono a definire la tipicità, la provenienza geografica e la qualità sensoriale dei formaggi; identificazione di marker di qualità; selezione di ceppi probiotici da formaggi; valutazione dell’effetto dei processi produttivi sulle caratteristiche di qualità e tipicità dei formaggi. Prodotti carnei: selezione ed uso di microrganismi autoctoni dotati di rilevanti caratteristiche tecnologiche per il miglioramento della qualità dei salumi.

Potenziale impiego - per processi produttivi Innovazione e miglioramento di prodotti agro-industriali. L'utilizzo di microrganismi selezionati per rilevanti caratteristiche tecnologiche e funzionali consentirà la formulazione e produzione di alimenti con innovative e/o supplementari caratteristiche nutrizionali. Il ruolo svolto da questi microrganismi è fondamentale per le caratteristiche organolettiche, reologiche e per la salubrità degli alimenti. La selezione, la salvaguardia e l’utilizzo di ceppi e loro metaboliti in grado di apportare vantaggi in termini di qualità nutrizionale e di conservabilità dei prodotti, rappresentano uno strumento che contribuisce al miglioramento delle tecnologie delle produzioni agro-alimentari tradizionali. Monitoraggio e controllo di microrganismi vantaggiosi ed alterativi. La comprensione dei meccanismi di patogenesi e sopravvivenza dei microrganismi presenti negli alimenti permetterà di fornire agli imprenditori i più appropriati protocolli per la realizzazione di cibi sicuri e di qualità e agli organismi preposti gli idonei strumenti per il controllo della presenza di microrganismi lungo la filiera agroalimentare.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Definizione degli standard produttivi ai fini dell’ottenimento di un marchio di riconoscimento. La realizzazione di protocolli operativi, applicabili a diversi prodotti alimentari, attraverso la scelta di un numero sufficientemente rappresentativo di aziende presenti sul territorio, il rilievo delle tecnologie applicate dalle singole aziende, la registrazione dei dati analitici (chimico-fisici e microbiologici) della materia prima e dei prodotti, nonchè la messa a punto di metodiche molecolari rapide e sensibili per riconoscere la presenza nel prodotto finito della microflora caratterizzante consente la predisposizione di disciplinari di produzione e lo studio del marchio identificativo del prodotto per il suo riconoscimento, valorizzazione e difesa da prodotti simili. Ciò permette di soddisfare i bisogni individuali dei consumatori che riconoscono con il il marchio un alimento dalle caratteristiche organolettiche ben definite ed inoltre soddisfa l'esigenza di protezione dell'alimento richiesta dai produttori.

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Moduli

Modulo: Microbiologia e qualità delle produzioni alimentari Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9656 161 598 65 1480 25 784 166 N.D. 1671








0 1 0 4 0 0 0 0 0 5




Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sezione di Torino Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIOVANNI BATTISTA PALMEGIANO

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Elenco dei partecipanti liv. Acri Francesco III Armato Vincenzo VII Badalucco Cinzia Vita VI Bastianini Mauro III Bellucci Romano IV Bianchi Franco III Boldrin Alfredo III Bono Gioacchino III Breber Paolo II Campanella Nicola V Caruso Gabriella III Casolino Giovanni IV Ciurlia Giuseppina VI Corseri Giuseppe VIII Cosenza Alessandro VI Cusumano Salvatore VI D'Adamo Raffaele III

liv.D'Adduzio Marco VI De Francesco Paolo VIIIDeolo Antonietta V Fabbrocini Adele III Frisone Giovanni IV Gancitano Salvatore VI Genovese Lucrezia II Giacalone Giacoma Rita V Giagnorio Nicola IV Giusto Giovan Battista VI Grassini Roberta V Ignazzi Giacobbe IX Ingrande Giovanna VI Lo Voi Maria Luisa IV Longari Lucia Lidia IV Maselli Maddalena VII Micale Valeria III

liv.Norrito Giacomo VI Palmegiano Giovanni Battista II Peiretti Pier Giorgio III Pelosi Sergio III Pipitone Vito III Pugnetti Alessandra III Rizzo Francesco VI Rizzo Pietro V Schiavone Primiano VI Scovacricchi Tiziano III Sinacori Giuseppe VI Speranza Edvige Maria VII Termine Giuseppa V Trotta Pasquale II Vianello Maddalena IV Zaccone Renata II

Temi

Tematiche di ricerca Studi per l'allevamento responsabile di pagelli, trote e storioni. Messa a punto di diete con migliorate caratteristiche nutrizionali e di interesse per l'alimentazione umana, con caratterizzazione delle produzioni tipiche, a basso impatto. Studio dell'uso di proteine vegetali nelle diete per pesci carnivori con identificazione di enzimi indicatori dell'efficacia di materie prime vegetali. Definizione dei quadri istochimici come indicatori di sofferenza dell'apparato digestivo.

Stato dell'arte L'acquacoltura risente di carenze interne ed esterne al sistema produttivo. Studi su nuove specie, linee produttive selezionate e materie prime alternative per la formulazione di diete efficaci finalizzata ad ottenere prodotti migliori, sono la via per la riqualificazione innovativa dei prodotti ittici. La sostenibilità delle tecnologie caratterizzerà i prodotti certificabili. Esiste una domanda di informazione sulla stabulazione e prevendita di crostacei garantiti per qualità e salubrità.

Azioni

Attività da svolgere Studi di protocolli per l'allevamento responsabile di pesci marini e d’acqua dolce. Studi per la messa a punto di diete, a base di nutrienti vegetali, con migliorate caratteristiche nutrizionali e a basso impatto ambientale. Studi sui metodi per l'identificazione di enzimi indicatori dell'efficienza digestiva di pesci. Messa a punto di protocolli di gestione del parco riproduttori e comparazione riproduttiva dei pesci allevati e selvatici. Etichettatura a bordo del pescato e verifica dell’efficacia di metodi alternativi al bisolfito per contrastare l’annerimento dei crostacei. Costruzione della rete ad alta velocità presso la sede ISMAR di Lesina; Ripopolamento con la vongola comune lungo la costa nord della Puglia, Produzione di gameti ed embrioni per saggi ecotossicologici con uso di gameti d embrioni appositamente prodotti; Elaborazione dei dati di pesca e analitici, sia sanitari che organolettici.

Punti critici e azioni da svolgere Gli aspetti critici riguardano la messa in fase delle varie ricerche per puntare progressivamente ad una maggiore integrazione tra i ricercatori delle varie sedi coinvolti. Condizione di fattibilità,

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necessaria e sufficiente, sarà la piena collaborazione del personale tutto coinvolto in questa commessa.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine

Collaborazioni (partner e committenti) Queste ricerche avverranno con le sezioni di Messina e Taranto dell'IAMC e con le sezioni di Venezia e Lesina dell'ISMAR. Con le prime si affronteranno problemi di alimentazione, stabulazione e riproduzione di organismi acquatici di interesse commerciale. Con le seconde verranno trattati aspetti ambientali, di tracciabilità e patologia in acquacoltura estensiva.

Finalità

Obiettivi Messa a punto e/o perfezionamento di protocolli di studio per a riproduzione e l'introduzione di nuove specie. Stima della fertilità in ceppi di spigola riprodotti per ginogenesi al fine della selezione di caratteristiche produttive vantaggiose. Messa a punto di diete con migliorate caratteristiche nutrizionali e di interesse per l'alimentazione umana e a basso impatto ambientale. Studio dell'utilizzo di proteine da biomasse vegetali nelle diete di pesci carnivori.

Risultati attesi nell'anno Prime acquisizioni su protocolli per l'allevamento responsabile di pesci marini e d’acqua dolce. Messa a punto di diete di controllo finalizzate al miglioramento di caratteristiche nutrizionali e a basso impatto. Prime applicazioni di diete con proteine vegetali nelle diete per pesci carnivori; avanzamento sui metodi per l'identificazione di enzimi indicatori dell'efficienza digestiva di pesci. Avanzamenti e miglioramenti dei protocolli di gestione del parco riproduttori e comparazione riproduttiva dei pesci allevati e selvatici; Verifica applicativa dell’etichettatura a bordo del pescato e dell’efficacia di metodi alternativi al bisolfito per contrastare l’annerimento dei crostacei; Completamento della rete ad alta velocità presso la sede ISMAR di Lesina; Avanzamenti sul ripopolamento della vongola comune lungo la costa nord della Puglia, Primi saggi ecoltossicologici con uso di gameti d embrioni appositamente prodotti; Completamento dell'elaborazione dei dati di pesca e analitici, sia sanitari che organolettici.



Moduli

Modulo: Sistemi produttivi sostenibili per le produzioni ittiche Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina Modulo: Sistemi produttivi sostenibili per le produzioni per le produzioni di organismi

marini Istituto esecutore: Istituto per l'ambiente marino costiero Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina

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Modulo: TRACCIABILITA' E NUUOVE TECNOLOGIE DI CONDIZIONAMENTO

DELLE RISORSE PESCABILI Istituto esecutore: Istituto per l'ambiente marino costiero Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina Modulo: SISTEMI PRODUTTIVI SOSTENIBILI PER LE PRODUZIONI DI

ORGANISMI MARINI Istituto esecutore: Istituto per l'ambiente marino costiero Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina Modulo: Sistemi produttivi sostenibili per le produzioni ittiche Istituto esecutore: Istituto per l'ambiente marino costiero Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina Modulo: Sistemi produttivi sostenibili per le produzioni ittiche Istituto esecutore: Istituto di scienze marine Luogo di svolgimento attività: Sezione Ecosistemi Costieri di Lesina


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9850 151 437 16 1454 403 991 133 N.D. 1990








1 0 0 0 0 1 0 3 2 7




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Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MARIO AGABBIO Elenco dei partecipanti liv. Arras Giovanni II Careddu Marco VI Carta Gabriele VII D'Hallewin Guy III Delogu Melchiorre V Dore Antonio III Fara Liberato VIII Fraghi' Vindice Giovanni Maria VI

liv.Lintas Gianluca VII Marceddu Salvatore V Molinu Maria Giovanna III Mura Anna Maria V Mura Domenico V Mura Mario V Palma Amedeo III Paulesu Sebastiano V

liv.Petretto Antonio Aldo V Pisano Pietro VIIIRosas Giuseppe V Santona Maria Vittoria VI Schirra Mario Mauro II Serra Gavina Rita VI Spezziga D'Aquino Salvatore III Venditti Tullio Antonio Pio III

Temi

Tematiche di ricerca L’azione prevede lo studio di argomenti di base e applicativi affrontati sul postraccolta dalla ricerca internazionale. Tra i campi di indagine vanno menzionati gli interventi inerenti la conservazione dei prodotti freschi e minimamente trasformati, con tematiche che spaziano dai sistemi alternativi di gestione dei vegetali in conservazione (termoterapia, raggi UV), alla prevenzione delle alterazioni attraverso il controllo biologico (microrganismi antagonisti), alle atmosfere modificate con l’impiego di particolari film plastici per i confezionamenti. Le ricerche riguardano altresì lo studio di formulati a basso impatto ambientale e non dannosi alla salute umana (molecole di nuova generazione e sostanze Generally Recognized As Safe). Il quadro delle diverse sperimentazioni verrà completato con osservazioni riguardanti la valorizzazione della qualità organolettica, nutrizionale e salutistica.

Stato dell'arte Nell’ipotesi di preservare qualità e vita dei prodotti, la ricerca internazionale esplora aspetti significativi di fisiologia e tecnologia. In particolare vengono oggi studiati mezzi fisici alternativi di conservazione e mezzi di natura biologica, col fine di ridurre l’impiego dei pesticidi, comunque indispensabili al controllo degli attacchi patologici dell’ortofrutta in postraccolta. Fra questi sono oggi ampiamente indagati i trattamenti con raggi ultravioletti, microonde, condizionamenti termici, impiego di microrganismi antagonisti. Questi interventi, sebbene non ancora risolutivi, possono essere impiegati come sistemi integrativi per consentire la limitazione dell’uso indiscriminato di pesticidi. In questo senso vanno anche menzionati gli studi su prodotti a basso impatto e bassa tossicità per l’uomo, quali i formulati di nuova generazione (in primo luogo analoghi delle strobilurine). Un altro campo di indagine di interesse globale riguarda il controllo delle condizioni ambientali durante la frigoconservazione (temperatura, umidità, atmosfera) oggi di particolare attualità per le specie e le nuove accessioni genetiche che compaiono con insistenza su tutti i mercati.

Azioni

Attività da svolgere Gli obiettivi che caratterizzano la commessa mireranno all’allungamento della vita dei prodotti vegetali in conservazione, al mantenimento della loro qualità e alla limitazione delle perdite nella catena distributiva. Sugli ortofrutticoli, freschi e minimamente trasformati (IV gamma), l’azione sperimentale punterà a fornire al mondo imprenditoriale i parametri di processo (temperatura,

300


umidità relativa, ricambi d’aria, atmosfera) per una razionale frigoconservazione. Ampia attenzione verrà conferita al controllo dei parassiti, con l’intento di salvaguardare la salubrità degli alimenti e limitare nel contempo l’inquinamento ambientale. Uno specifico approccio di ricerca riguarderà lo screening di nuovi formulati per la prevenzione delle alterazioni funginee. Il campo di indagine verrà completato con un ampio studio dei sistemi alternativi: fisici (termoterapia, raggi UV), di lotta biologica (microrganismi antagonisti) e dei prodotti GRAS (Generally Recognized As Safe compounds) innocui per il consumatore. Molte indagini rappresenteranno ricerche di base condotte al fine di osservare i fenomeni fisiologici coinvolti nella maturazione e senescenza del frutto.

Punti critici e azioni da svolgere E’ previsto un piano operativo correlato alla presenza degli operatori di ricerca inseriti nella commessa (ricercatori, tecnici), ma si auspica che nel corso del triennio 2006-2008 venga completato l’iter concorsuale per due nuovi ricercatori che consentiranno un approfondimento delle linee di ricerca. Le attività descritte prevedono un adeguato apporto finanziario per sopperire alle spese di gestione del programma proposto e all’acquisizione di alcune apparecchiature di supporto. L’accesso ai finanziamenti e la disponibilità degli strumenti rappresenteranno comunque i punti critici che vincoleranno l’ampiezza dello spazio scientifico da affrontare nel corso del triennio. Nell’ambito dell’accordo di programma CNR/MISM è prevista l’acquisizione di apparecchiature scientifiche che arricchiranno l’apparato dedicato alla ricerca nel settore in argomento, alleviando eventuali difficoltà logistiche. Ne consegue che per il periodo menzionato il vero punto critico è rappresentato dalle future possibilità di finanziamento che, al momento, appaiono piuttosto limitate. Le azioni da intraprendere riguarderanno evidentemente la presentazione di progetti che si spera trovino adeguato consenso.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Nell’ambito dell’equipe che opera nella commessa “Tecnologie per la trasformazione, conservazione e il confezionamento”, sono presenti competenze tecnico-scientifiche nei settori della chimica, biochimica, fisica, biologia, fisiopatologia. Le indagini condotte hanno consentito l’acquisizione di diverse tecnologie nel settore del postraccolta inerenti in particolare i parametri di processo per la conservazione dei prodotti (temperatura, umidità relativa, atmosfere) i trattamenti antiparassitari più consoni, le tecnologie di lavorazione dei prodotti. I risultati ottenuti sono stati raggiunti attraverso tecniche di indagine che riguardano: analisi chimico-fisiche con l’impiego di HPLC, gascromatografi, spettrofotometri, gasmassa; analisi di tipo biologico con osservazioni della flora microbica (microscopio elettronico); impiego di raggi ultravioletti, termoterapia, prodotti GRAS, formulati chimici ecocompatibili.

Collaborazioni (partner e committenti) Proseguiranno le collaborazioni già in atto con istituzioni di altri Paesi (USA, Israele, Belgio), dipartimenti universitari e istituti di ricerca del CNR coinvolti nei settori scientifici inerenti la commessa postraccolta. Nel corso dell’attività i ricercatori hanno avuto modo di effettuare stage di studio che hanno consentito scambi e approfondimenti scientifici coi ricercatori di istituzioni di ricerca straniere (Department of Plant Sciences, University of California, Davis USA; Institute for Technology and Storage of Agricultural Products, Bet-Dagan Israele; Department of Life Sciences, Flanders Centre Laboratory of Postharvest Technology, Katholieke Universiteit Leuven de Croylaan, Heverlee Belgio, International Committee nn Intense Light Application on Postharvest Crops).

301


Finalità

Obiettivi L’obiettivo della commessa è stato focalizzato sullo studio delle problematiche che investono i prodotti vegetali dopo la raccolta. Ampia attenzione è rivolta alle osservazioni di base con l’intento di fornire un valido contributo nell’ambito degli aspetti fisiologici coinvolti nei processi di conservazione. In questo senso verranno largamente indagati i biochimismi che conseguono l’impiego delle tecnologie di indagine adottate (termoterapia, raggi UV, prodotti GRAS, nuovi formulati di sintesi a basso impatto ambientale). Non meno rilevanti i traguardi prefissati con l’impiego di microrganismi antagonisti di agenti patogeni e i loro meccanismi di azione nei confronti delle entità patologiche che arrecano gravi danni agli alimenti vegetali. Le ricerche puntano altresì al trasferimento tecnologico delle risultanze sperimentali conseguite con l’intento di promuovere l’utilizzo in campo applicativo delle acquisizioni scientifiche di rilievo raggiunte nei diversi settori inerenti i parametri di processo, i trattamenti alternativi, le tecniche di confezionamento e di trasformazione dei prodotti di IV gamma.

Risultati attesi nell'anno Si attendono risposte significative dalle ricerche inerenti: gli interventi di lotta biologica effettuati allo scopo di prevenire le infezioni fungine dei prodotti vegetali in postraccolta; l’uso di mezzi fisici alternativi, quali la termoterapia e i trattamenti con raggi ultravioletti, impiegati per limitare l’uso dei pesticidi di sintesi; l’utilizzo di prodotti GRAS e di nuovi formulati fungicidi che potranno consentire la sostituzione o l’impiego ridotto di fungicidi convenzionali. Ulteriori risultati potranno scaturire dall’approfondimento degli aspetti qualitativi (nutrizionali e salutistici) e dalla messa a punto dei parametri di processo utilizzati per la conservazione dei prodotti freschi e minimamente trasformati, di IV gamma. I risultati, come di consueto, saranno documentati dalle pubblicazioni a livello nazionale e internazionale.

Potenziale impiego - per processi produttivi Le ricerche mirano all’innovazione tecnologica dei sistemi di conservazione postraccolta e di nuove metodologie per l’ottenimento di prodotti minimamente trasformati. Le nuove acquisizioni, opportunamente verificate in campo operativo, potranno essere trasferite alle centrali ortofrutticole e agli stabilimenti di produzione dei prodotti minimamente trasformati.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi L’attività scientifica si completa nelle diverse linee con l’osservazione dell’aspetto qualitativo (organolettico, nutrizionale e salutistico) che rappresenta oggi una forte esigenza del consumatore. Di particolare importanza i risultati sulle tecnologie alternative di conservazione che possono consentire una riduzione dell’uso dei pesticidi di sintesi con ricaduta positiva sulla salute umana e sull’ambiente.

Moduli

Modulo: Tecnologie per la trasformazione, conservazione e confezionamento Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9936 150 53 90 1229 173 376 76 N.D. 1478








Altro Totale

1 0 0 0 0 0 0 0 0 1



Biotecnologie per la qualità e sicurezza degli alimenti

Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sezione di Lecce Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: ANTONIO FRANCESCO LOGRIECO Elenco dei partecipanti liv. Antoniazzi Sara VI Blando Federica III Cappello Maria Stella III Caretto Sofia Pia Anna III D'Amico Leone VI De Palma Egidio IV De Paolis Angelo III Gerardi Carmela VI

liv.Giovinazzo Giovanna III Grieco Francesco III Laddomada Barbara III Leone Antonella III Lisi Salvatore VII Logrieco Antonio Francesco II Mita Giovanni III

liv.Moretti Antonio III Mule' Giuseppina III Pascali Anna Maria VII Peiretti Pier Giorgio III Perrone Giancarlo III Santino Angelo III Zacheo Giuseppe II

Temi

Tematiche di ricerca Produzione di antocianine, stilbeni e vitamina E da sistemi vegetali. Analisi di licopene estratto con CO2 supercritica. Identificazione di marcatori molecolari (AFLP/geni) diagnostici e qualitativi per vegetali e contaminanti microbici . Produzione di enzimi/proteine vegetali. Caratterizzazione di acidi

303


grassi e terpeni in prodotti caseari. Caratterizzazione della componente fenolica e attività biologica di estratti vegetali. Caratterizzazione del quadro proteico/profilo amminoacidico di fonti proteiche vegetali anche in relazione a fattori genetici/ambientali. Isolamento, caratterizzazione molecolare e valorizzazione di lieviti nei processi fermentativi vinari.

Stato dell'arte C'è una sempre maggiore attenzione da parte del consumatore nei confronti della tipicità e della qualità nutrizionale e salutistica dei prodotti alimentari. D'altro canto l'industria agroalimentare richiede sempre di più prodotti di origine naturale in sostituzione di quelli di sintesi. Ciò ha stimolato la ricerca nel settore delle tecnologie e biotecnologie per lo studio di marker di qualità e di tipicità e per la produzione di molecole di origine naturale importanti per l'industria alimentare.

Azioni

Attività da svolgere Biofabbriche (colture cellulari in vitro e piante GM) per produzione di antiossidanti. Produzione, attività biologica, stabilità del licopene. Clonaggio di geni per studio e produzione di proteine vegetali da semi oleaginosi. Valutazione di marcatori biochimici di qualità in prodotti vegetali. Studio di proteine e lipidi per alimentazione e individuazione di molecole e marcatori molecolari per la tipicità dei prodotti alimentari.Studio sulla genetica e diversità di alcuni contaminanti microbici e sviluppo di metodi molecolari per una loro diagnosi rapida lungo le filiere agro-alimentari. Ottimizzazione "in vitro" di sonde di DNA in reazioni di real time multiplex PCR e realizzazione di array a bassa densità e biosensori. Applicazione su matrici alimentari. Selezione biochimica e biomolecolare di ceppi di lievito apiculati e batteri malolattici da mosto di uve autoctone.

Punti critici e azioni da svolgere Nella produzione di antiossidanti, i punti critici riguardano la resa, l'attività biologica e la stabilità delle molecole prodotte. La produzione di proteine ricombinanti presenta aspetti critici relativamente alla purificazione delle proteine prodotte. Per i marcatori molecolari specifici dei contaminati microbici è necessario estendere lo studio a popolazioni numerose e preferibilmente da diverse aree geografiche.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Il personale afferente alla commessa possiede esperienza specifica nelle seguenti aree: chimica, biochimica, biologia, microbiologia, biologia molecolare, agronomia, patologia vegetale, proteomica. Sono utilizzate tecniche d’indagine microbiologiche, chimiche, enzimatiche e proteomiche. In particolare: tecniche microscopiche (microscopio ottico e confocale; cromatografiche (HPLC analitica, GC, elettrocromatografia capillare), elettroforetiche (elettroforesi capillare), applicazioni (bio) sensoristiche con acidi nucleici, tecniche di elettroforesi monodimensionale e di blotting mono- e bi-dimensionale, tecniche di fermentazione.

Collaborazioni (partner e committenti) Università di Lecce; Università di Bari; Università di Torino; Università di Milano, Istituto Sperimentale per la Zootecnia del MIPAF, Torino; IMM- CNR; ICM-CNR; IBBA-CNR; IGV-CNR; IBMP-CNRS; John Innes Centre, UK, ENEA, Roma; INRAN, Roma.Pierre Chimica, Galatina (Le), Lachifarma, Zollino, (Le); COOPAS, Maglie, CRB, Castel del Monte; CRAB, Avezzano, Silva Chimica s.r.l., Mondovi', Cuneo; ERSAF-Lombardia; Consorzio per la Tutela del Formaggio Grana Padano.

304


Finalità

Obiettivi Valorizzazione dei prodotti mediante studio e caratterizzazione di componenti nutrizionali/antinutrizionali, salutistiche e altri indicatori di qualità in relazione a fattori genetici, tecniche di produzione/conservazione. Valutazione del quadro proteico in condizioni di stress. Tipizzazione di prodotti mediante marcatori biochimici e molecolari. Produzione tecnologica e biotecnologica di composti naturali per l'industria agroalimentare. Competenze:Biologia cellulare e molecolare, biochimica

Risultati attesi nell'anno Nel 2006 si prevedono i seguenti risultati: Produzione biotecnologica/caratterizzazione di molecole di importanza agroalimentare/bio-medica (antiossidanti naturali, enzimi). Marcatori biochimico-molecolari per valutazione di qualità di prodotti di origine animale/vegetale e per caratterizzazione di produzioni tipiche. Marcatori molecolari specifici per alcuni contaminanti microbici e sviluppo di metodi rapidi di diagnosi, real time PCR multiplex per Fusarium e Aspergillus. Sviluppo di array a bassa densità. Selezione e valorizzazione di lieviti autoctoni da uve var. Negroamaro e Primitivo.

Potenziale impiego - per processi produttivi Le attività svolte nell’ambito della commessa consentiranno la produzione di prodotti agroalimentari con proprietà salutistiche ed organolettiche migliorate, lo sviluppo di processi fermentativi al fine di ottenere starter microbici, colture cellulari vegetali e metaboliti di interesse agroalimentare (enzimi, proteine etc.). Prevenzione e controllo di contaminanti microbici e nelle filiere cerealicole e viti-vinicole.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Le attività di ricerca svolte nell’ambito della commessa contribuiranno al miglioramento della qualità, conservabilità e salubrità degli alimenti,alla prevenzione e diagnosi di contaminazioni microbiche lungo la filiera cerealicola, vitivinicola, alla tracciabilità e rintracciabilità degli alimenti, al riconoscimento di frodi,

Moduli

Modulo: Biotecnologie per la qualità e sicurezza degli alimenti Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9715 87 473 0 1275 105 665 170 N.D. 1550


305








Altro Totale

1 2 1 2 0 1 0 3 0 10



Sistemi produttivi sostenibili e qualità dei prodotti vegetali

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: SEBASTIANO VANADIA Elenco dei partecipanti liv. Altomare Claudio II Boari Angela III Boari Francesca III Calabrese Nicola III Cantore Vito III Cardinali Angela III Cavallo Marinella V Cecchini Cristina VI

liv.Di Venere Donato III Gonnella Maria III Linsalata Vito V Martena Simonetta VII Montemurro Nicola V Parente Angelo III Piccolo Michele VII Pieralice Maria III

liv. Ricci Giuseppe VIIISergio Lucrezia III Serio Francesco III Valerio Paolo VII Vanadia Sebastiano II Vurro Maurizio III Zonno Maria III

Temi

Tematiche di ricerca Prove agronomiche: valutazione genotipi, interazioni genotipo-ambiente, irrigazione anche con acque non convenzionali, lotta biologica e metodi di difesa ecocompatibile, fertilizzazione, fertirrigazione, disciplinari di produzione. Effetti delle tecniche agronomiche sulla qualità dei prodotti. Sviluppo di modelli: Water Use Efficiency, Nitrogen Use Efficiency. Idoneità alla trasformazione di prodotti ortofrutticoli e contributo alla definizione di parametri di processo.

Stato dell'arte Lo sviluppo 'sostenibile' del sistema agroindustriale richiede la realizzazione di prodotti/processi innovativi nel settore della produzione primaria, della trasformazione e della qualificazione dei prodotti alimentari ed agroindustriali. Le produzioni primarie devono essere ottenute adottando sistemi produttivi ecocompatibili in pieno campo ed in coltura protetta.

306


Azioni

Attività da svolgere Sono in corso complessivamente 15 progetti. Si concludono nel 2006 i progetti: SORBIO: agricoltura biologica, PIA: produzione di pasta arricchita con inulina, LICOPENE: tecniche agronomiche per ottimizzare la produzione di pomodoro da industria ad alto contenuto di licopene. Si concludono inoltre un progetto per il miglioramento della produzione e della qualità della patata primaticcia ed un progetto per valutare gli effetti di un innovativo sistema di trasporto sulla qualità di pesche, uva da tavola e pomodorino. Proseguono le attività del progetto C2E-BCAs, finanziato dalla C.E. e coordinato da ISPA sulla produzione ed impiego di biofitofarmaci e del progetto BIO e Tipico finanziato dalla Regione Puglia. Iniziano, con un anno di ritardo, le attività del progetto COL.GEL: impiego di polimeri super-assorbenti per substrati a basso costo destinati alle colture protette senza suolo. Sul carciofo proseguono le attività in due progetti finanziati dalla Regione Puglia.

Punti critici e azioni da svolgere Il programma di attività 2006 comprende esclusivamente progetti finanziati ed avviati o in fase di conclusione per i quali si può anche stimare elevata la fattibilità del raggiungimento degli obiettivi.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Agronomia, orticoltura, frutticoltura, fitoiatria, fitopatologia, fisiologia vegetale, chimica agraria, biochimica, metodologia statistica. Gestione di stazione agrometeorologica, gestione di un campo lisimetrico attrezzato con lisimetri a pesata, gestione di campi sperimentali con buone pratiche agricole per agricoltura convenzionale e biologica, gestione di un complesso di serre con coltura in piena terra e senza suolo. Frigoconservazione di ortofrutticoli. Analisi qualitative fisiche di prodotti ortofrutticoli freschi e trasformati: colore analisi fisico- meccanica. Determinazione della respirazione dei prodotti vegetali. Analisi chimiche e biologiche: zuccheri semplici e complessi, vitamine, carotenoidi, antiossidanti, prodotti volatili, attività enzimatiche.

Collaborazioni (partner e committenti) Collaborazioni in atto: Commessa ISPA Microbiologia: ortaggi di quarta gamma ed alimenti funzionali. Università di Bari, IAM Valenzano, CRB Andria. Besana, La Metapontina, Greeproduct, Oranfrizer: produzioni biologiche e prodotti di IV gamma. Univ. VT, CT e BA, ISPAVE, INRAN, ISPORT, IGV-CNR ricerche sul carciofo. INRA, IMaGO, Weizmann, UNINA, NCRI, HRI, Prophyta, VIZR per il progetto 2E-BCAs. Università di Lecce, Pierre Chimica, Galatina (Le): pomodoro ad alto licopene.

Finalità

Obiettivi Miglioramento della sostenibilità delle tecniche di coltivazione (ortofrutticoltura e colture industriali) e della qualità delle produzioni in pieno campo, in coltura protetta e senza suolo: avvicendamenti, irrigazione, fertilizzazione e difesa. Sviluppo di tecniche innovative di impiego di biomasse microbiche e vegetali per la difesa delle colture.

Risultati attesi nell'anno Metodologie biologiche per la produzione di ortaggi adatti destinati a lla trasformazione in prodotti di IV gamma; effetti delle tecniche colturali(scelta varietale, irrigazione, fertilizzazione, densità epoche di impianto) sulla qualità del prodotto fresco e trasformato. Protocollo per la produzione del pomodoro da industria ad alto licopene (scelta varietale, irrigazione, fertilizzazione, difesa, protezione dalle alte temperature con trattamenti sbiancanti): aumento significativo della resa in licopene. Protocolli a basso impatto ambientale per l'allevamento senza suolo di ortaggi. Produzione

307


e metodi di impiego di microrganismi utili e di loro metaboliti bioattivi per la protezione delle piante. Tecnica vivaistica del carciofo per la produzione di piante risanate da virus ed esenti da Verticillium dahliae.

Potenziale impiego - per processi produttivi Disciplinari di produzione biologica ed integrata. Protocolli per orticoltura protetta in piena terra e senza suolo: pomodoro, cetriolo, ortaggi da foglia. Protocolli per orticoltura industriale: pomodoro, melanzana, zucchine, carciofo, patata. Protocolli di orticoltura biologica: scarola, ruchetta, cavolo broccolo. Tecniche vivaistiche: carciofo. Valorizzazione e sviluppo di prodotti ortofrutticoli freschi e trasformati. Metodi innovativi per il controllo delle malerbe e la difesa delle colture.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Valutazione della sostenibilità ambientale dei sistemi produttivi

Moduli

Modulo: Sistemi produttivi sostenibili e qualità dei prodotti vegetali Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9708 144 501 86 1439 374 1019 169 N.D. 1982








2 0 1 1 0 1 0 7 6 18



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Sicurezza alimentare e metodi innovativi per la caratterizzazione degli alimenti

Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MICHELANGELO PASCALE Elenco dei partecipanti liv. Altomare Claudio II Angelini Giancarlo I Aturki Zeineb III Avantaggiato Giuseppina III Bottalico Antonio I Cannarella Carmelo III Capitani Donatella III Caputo Leonardo III Cavallarin Laura III Cavallo Marinella V Cecchini Cristina VI Conti Amedeo II Corradini Danilo II Cozzi Giuseppe VI De Girolamo Annalisa III

liv.De Marzo Francesco VI De Mico Pierluigi V De Palma Egidio IV Della Valle Giuseppina IV Di Felice Filippo V Fanali Salvatore I Giuffrida Maria Gabriella III Grieco Francesco VI Logrieco Antonio Francesco II Martena Simonetta VII Minervini Fiorenza III Montemurro Nicola III Moretti Antonio III Mule' Giuseppina III Napolitano Lorenzo IV

liv.Nicoletti Isabella III Pascale Michelangelo III Perrone Giancarlo III Piccioni Valeria III Piccolo Michele VII Ragni Pietro III Ricci Giuseppe VIIIRicci Vincenzo IV Ricelli Alessandra III Solfrizzo Michele II Speranza Edvige Maria VII Stea Gaetano VI Valerio Paolo VII Vanadia Sebastiano II Visconti Angelo I

Temi

Tematiche di ricerca Monitoraggio di micotossine e residui di pesticidi nelle colture agrarie e nei prodotti alimentari. Strategie di controllo di funghi tossigeni. Tossicità di pesticidi e xenobiotici in vitro e in vivo. Individuazione di biomarker d’esposizione a micotossine. Decontaminazione di mangimi, mosti e succhi di frutta. Analisi di allergeni d’alimenti vegetali e del latte bovino con tecniche proteomiche. Sviluppo di (bio)sensori, saggi immunometrici e nuovi metodi analitici basati su metodologie separative (cromatografia, elettroforesi capillare, elettrocromatografia capillare) e spettroscopiche (NMR) per valutare la qualità, tipicità, tracciabilità e sicurezza d’uso degli alimenti e dei mangimi e per l’analisi di contaminanti (micotossine, fitofarmaci, funghi tossigeni, microrganismi patogeni ed allergeni) in matrici di interesse agroalimentare. Caratterizzazione di proteine di origine alimentare.

Stato dell'arte Il problema della qualità, sicurezza e salubrità alimentare e dello sviluppo di nuove tecnologie per la loro valutazione è uno dei cluster fondamentali delle strategie di R&S a cui anche il 6° e 7° PQ della UE dedica particolare attenzione. Le contaminazioni alimentari micotossine, pesticidi e allergeni rappresentano una problematica di stringente attualità per tutti gli operatori del comparto alimentare. L’Unione Europea sponsorizza Forum e progetti ad hoc e richiama ad una continua sorveglianza con l’emanazione di normative per la sicurezza delle produzioni alimentari E’ necessario un approccio multidisciplinare alle varie problematiche inerenti, basato sulle esperienze pregresse, sul confronto con la comunità internazionale e sui reali fabbisogni del tessuto produttivo. L’impiego di tecniche chimico- fisiche e biologiche che comprendano innovazioni nelle tecniche tradizionali e lo sviluppo di micro e nano sistemi per la caratterizzazione ed analisi degli alimenti potrà consentire significativi progressi nel settore agroalimentare.

309


Azioni

Attività da svolgere Sviluppo di nuovi metodi cromatografici, (bio)sensori, saggi immunometrici, spettrometria di massa per la rilevazione di micotossine, fitofarmaci, allergeni nascosti in alimenti. Studio della contaminazione di micotossine, funghi tossigeni, xenobiotici e allergeni in prodotti vegetali e alimenti. Selezione di preparati microbici per la lotta contro gli Aspergilli ocratossigeni dell’uva. Studio dell’efficacia di sistemi biologici e chimici per la decontaminazione del vino da ocratossina A. Analisi di biomarker di esposizione alle micotossine. Sviluppo di alimenti ipoallergenici. Tracciabilità e salubrità di prodotti di origine animale. Studio degli effetti delle radiazioni ionizzanti su alimenti e packaging alimentare. Caratterizzazione di alimenti con tecniche NMR. Sviluppo di metodi nano-LC per l’analisi di amminoacidi chirali allo scopo di verificarne origine e genuinità degli alimenti.

Punti critici e azioni da svolgere Nella commessa (modulo)nel 2006 confluiscono, per motivi di convenienza gestionale-amministrativa, gran parte delle attività delle ex commesse "Diagnosi avanzata e metodi innovativi" e "Sicurezza alimentare" del 2005. Essa ha un nuovo responsabile ed ha ancora bisogno di ulteriori aggiustamenti (possibile creazione di nuovi moduli)per una migliore ridistribuzione del personale tra i numerosi progetti esterni afferenti alla commessa. Punti critici potrebbero essere ulteriori ritardi nel finanziamento dei progetti già approvati e l'appprovazione di altri in corso di valutazione, la continuazione del rapporto di lavoro con il personale assunto con contratto a termine anche su fondi esterni e la disponibilità di nuova strumentazione per lo svolgimento dei programmi di ricerca. Il collegamento con le imprese sul territorio dovrebbe essere rafforzato anche attraverso il progetto di trasferimento biotecnologico RIDITT-AgriBIT.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Il personale afferente alla commessa possiede esperienza specifica nelle seguenti aree: chimica, biochimica, biologia, microbiologia, biologia molecolare, agronomia, patologia vegetale, proteomica, veterinaria. Sono utilizzate tecniche d’indagine microbiologiche, chimiche, immunoenzimatiche, tossicologiche, enzimatiche e proteomiche. In particolare: tecniche cromatografiche (HPLC analitica, GC, micro e nano HPLC, elettrocromatografia capillare), elettroforetiche (elettroforesi capillare), spettroscopiche (MNR, UV, fluorescenza, polarizzazione di fluorescenza), spettrofotometria di massa (MS), applicazioni (bio) sensoristiche (biosensore elettrochimico, ottico e microbilancia al quarzo), nucleici; sistemi per valutare la tossicità e l’esposizione a sostanze tossiche (citofluorimetro), sistemi per valutare proteine ed allergeni (sequenziatore automatico di proteine e peptidi, spettrometro di massa) e tecniche di elettroforesi monodimensionale e di immunoblotting mono- e bi-dimensionale.

Collaborazioni (partner e committenti) Com. Europea; MIUR; MiPAF; FAO; Co.Ri.Al (Foggia); Syngenta Crop Protection; Bayer CropScience; Min. della Salute; Regioni Piemonte, Puglia, Abruzzo, Lombardia; ISLC-CRA (Lodi); Bioindustry Park del Canavese (TO); Vicam L.t.d (USA); Università di Bari (DPPMA), Foggia (DScAg-AmbChimDifVeg), Campobasso (D.Sc.AnVegAmbPat), Napoli Federico II (Dip Sc. Al.), Milano (Dip.STVSA), Lecce (Dip. Sc. Tec Biol. Amb.), Parma (DIPABQSA), Teramo (DSA), Torino (Dip.Biol.An.U.) ed estere University of Rio Cuarto (Argentina), Innsbruck (Austria), Cranfield (UK), Kansas State (USA), PROMEC (Sud-Africa); CNR IMM- Lecce, CNR ICTP, CNR ISA, CNR ISMAR; Barilla Alimentare S.p.A.; Az. Vinicola Càntele (LE); Cons. Prod. Vini Mosti Rossi (TA); CNR ITB-Bari; APIBIO (Francia); NMRC (Irlanda), IBST, USDA (USA); Marini Group s.p.a; Fondazione Biotecnologie (TO), Società Produttori Sementi (BO), Ist. Sp. di Cer.-CRA (Roma), Com. Montane Valsassina, Valvarrone, Val d'Esino e Riviera; ENEA; INRA (Francia), TNO (Olanda), Safe Consortium (Brussels), Feed Industry Service (Lodi), COOP (MI); PEI, Langen (D), Molini Tandoi Pellegrino (Corato), , ISNP, Ist. de Ferment. Indust.-CSIC (Madrid), Dept. Agr. Gov. (USA)

310


Finalità

Obiettivi Metodi per il rilevamento di fitofarmaci, allergeni nascosti, micotossine e fitofarmaci mediante spettrometria di massa. Sviluppo di metodologie genomiche, proteomiche e metabolomiche per l’individuazione di componenti nutrizionali e nocivi. Caratterizzazione e tracciabilità di prodotti alimentari. Individuazione di frodi. Individuazione di marcatori di qualità e origine. Strategie di lotta a basso impatto ambientale contro funghi tossigeni responsabili dell’accumulo di micotossine nei raccolti. Studio della persistenza di contaminanti naturali durante i processi di trasformazione alimentare. Detossificazione dei mangimi, degli alimenti e delle bevande. Stima dell’esposizione dell’uomo alle micotossine. Valutazione del rischio legato a contaminanti alimentari. Sviluppo di alimenti ipoallergenici.

Risultati attesi nell'anno Sviluppo di un sensore ottico SPR per Aspergillus; sviluppo di un immunosaggio FP per ocratossina A; determinazione di fosfina in frumento mediante GC portatile e sensori QCM; sviluppo di un metodo LC-MS/MS per la determinazione simultanea di micotossine in mais. Metodi non immunologici per il rilevamento di proteine del latte, delle arachidi e delle nocciole in matrici complesse. Caratterizzazione di nuovi allergeni alimentari vegetali. Strategie per contenere le contaminazioni da micotossine nella filiera lattiero-casearia e per migliorare il contenuto di acidi grassi essenziali nei prodotti di origine animale. Studio dell’effetto delle radiazioni ionizzanti su alimenti e caratterizzazione NMR. Metodica analitica per la determinazione di enantiomeri di aminoacidi in aceto balsamico. Contaminazione da micotossine e funghi tossigeni nei prodotti vegetali. Strategie di lotta biologica e integrata contro gli agenti ocratossigeni dell’uva. Metodi innovativi per la decontaminazione di ocratossina A nel vino. Test di tossicità ed validazione del biomarker di esposizione al deossinivalenolo.

Potenziale impiego - per processi produttivi Le attività svolte nell’ambito della commessa consentiranno di individuare con precisione tipicità, origine, composizione e salubrità dei prodotti lungo le diverse filiere alimentari ed in particolare favoriranno la prevenzione e il controllo di contaminanti microbici e chimici nelle filiere cerealicole e viti-vinicole.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Le attività di ricerca svolte nell’ambito della commessa contribuiranno alla prevenzione del rischio di malattie di origine alimentare (in particolare alla diagnosi allergene-specifiche di allergia alimentare), alla riduzione delle perdite di derrate alimentari, alla tracciabilità degli alimenti, al riconoscimento di frodi, alla valutazione della qualità e salubrità degli alimenti, alla valutazione del rischio da esposizione alle micotossine.

Moduli

Modulo: Sicurezza alimentare e metodi innovativi per la caratterizzazione degli alimenti

Istituto esecutore: Istituto di metodologie chimiche Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto Modulo: Sicurezza alimentare e metodi innovativi per la caratterizzazione degli

alimenti Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+91329 404 1389 120 3242 356 2149 236 N.D. 3834








1 3 7 13 0 0 0 2 1 27




Dati generali Progetto: Sicurezza, qualità alimentare e salute Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: ANTONIO BOTTALICO Elenco dei partecipanti

Temi

Tematiche di ricerca Monitoraggio di funghi tossigeni, micotossine e residui di pesticidi nelle colture agrarie e nei prodotti alimentari. Collezione di funghi tossigeni. Interventi preventivi e valutazione del rischio nell’uso d’agenti di biocontrollo. Tossicità di pesticidi e xenobiotici in vitro e in vivo. Individuazione di biomarker d’esposizione a micotossine. Decontaminazione di mangimi, mosti e succhi di frutta. Analisi di allergeni d’alimenti vegetali e del latte bovino con tecniche proteomiche.

Stato dell'arte Le contaminazioni alimentari da funghi tossigeni, micotossine, pesticidi e allergeni rappresentano una problematica di stringente attualità per tutti gli operatori del comparto alimentare. Ne

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scaturiscono notevoli implicazioni di carattere sanitario, economico e commerciale, che investono in particolare i rapporti internazionali. L’Unione Europea sponsorizza Forum e progetti ad hoc e richiama ad una continua sorveglianza con l’emanazione di normative per la sicurezza delle produzioni alimentari.

Azioni

Attività da svolgere

Punti critici e azioni da svolgere

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Il personale afferente alla commessa possiede esperienza specifica nelle seguenti aree: chimica, biochimica, biologia, microbiologia fungina, biologia molecolare, agronomia, patologia vegetale, proteomica, veterinaria. Le diverse tecniche d’indagine (microbiologiche, chimiche, molecolari, immunoenzimatiche, tossicologiche, enzimatiche, proteomiche) si basano sull’utilizzo di sistemi sviluppati per matrici vegetali e agroalimentari, quali: tecniche cromatografiche (HPLC analitica, GC, micro e nano HPLC), elettroforetiche (elettroforesi capillare, spettroscopiche (UV, fluorescenza, polarizzazione di fluorescenza), sistemi per valutare la tossicità tossiche (citofluorimetro), sistemi per valutare proteine ed allergeni (sequenziatore automatico di proteine e peptidi, spettrometro di massa).

Collaborazioni (partner e committenti) Comunità Europea; MIUR; MiPAF; FAO; Ministero della Salute; Regioni Piemonte, Puglia, Abruzzo, Lombardia; Syngenta Crop Protection; Bayer CropScience; Società Produttori Sementi (Bologna), Istituto Sperimentale di Cerealicoltura-CRA (Roma), Comunità Montane Valsassina, Valvarrone, Val d'Esino e Riviera; ENEA; Università di Bari (DPPMA), Foggia (Dip. Sc Ag-Amb. Chim. e Dif Veg.), Campobasso (Dip. Sc. An.Veg. e Amb.Pat.), Un. Catt. Piacenza (Is. Ent e Pat. Veg.), Napoli Federico II (Dip Sc. Al.), Milano (Dip.STVSA), Lecce (Dip. Sc. Tec Biol. Amb.), Torino (Dip.Biol.An.Uomo); University of Rio Cuarto (Argentina), Kansas State Univesity (USA), Medical Research Council (Sud-Africa), Agric. Biotechnology Center, Gödöllo (Ungheria) USDA-USA; INRA, Francia; TNO, Olanda; Safe Consortium, Brussels; Istituti e Laboratori Sperimentali dei Servizi nazionali; Fondazione Biotech, (TO); Feed Industry Service, Lodi; COOP, (MI); PEI, Langen (D); Cantele Vini, Guagnano,(LE); Consorzio Produttori Vini, Manduria (TA); Molini Tandoi Pellegrino, Corato (BA); Ospedale Infantile Regina Margherita Torino; Ospedale S. Anna Torino.

Finalità

Obiettivi Strategie di lotta a basso impatto ambientale contro funghi tossigeni responsabili dell’accumulo di micotossine nei raccolti. Persistenza dei contaminanti durante le trasformazioni alimentari. Detossificazione dei mangimi, degli alimenti e delle bevande. Stima dell’esposizione dell’uomo alle micotossine. Valutazione del rischio legato a contaminanti alimentari. Sviluppo di alimenti ipoallergenici. Saranno utilizzate competenze in micologia, biologia, chimica e tossicologia.

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Risultati attesi nell'anno

Potenziale impiego - per processi produttivi Prevenzione e controllo di contaminanti microbici e chimici nelle filiere cerealicole e viti-vinicole. Sviluppo di sostituti naturali ipoallergenici del latte.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Valutazione del rischio da esposizione alle micotossine. Diagnosi allergene-specifiche di allergia alimentare

Moduli

Modulo: Sicurezza alimentare Istituto esecutore: Istituto di scienze delle produzioni alimentari Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

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Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+90 0 0 0 0 0 0 0 N.D. 0








0 1 2 4 0 2 0 7 0 16



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GIOVANNI ARRAS Caratterizzazione chimica ed attività biotossica dell'olio essenziale di Thymus capitatus L.

LAURA CAVALLARIN Attività proteolitiche e degradazione della ribulosio bifosfato carbolissasi (RuBisCO) in insilati di erba medica

ANGELO SANTINO Ossilipine vegetali nella qualità e difesa dei prodotti agro-alimentari

NICOLA CALABRESE Sistemi ecosostenibili per la filiera dei prodotti orticoli trasformati: surgelati, IV e V gamma

GUY D'HALLEWIN Tecniche non distruttive per la valutazione della qualità degli alimenti freschi: Impiego della Risonanza Magnetica Nucleare Imaging (RNMI)

DONATO DI VENERE Studi sull�attività biologica di sostanze fenoliche di origine vegetale contro patogeni di ortofrutticoli freschi in post-raccolta.

ANTONIO DORE Tecnologie "low cost" a minimo impatto ambientale per il controllo dei marciumi nel postraccolta di prodotti ortofrutticoli

MARIA GABRIELLA GIUFFRIDA IDENTIFICAZIONE DI MARCATORI IMMUNOSTIMOLANTI ATTRAVERSO STUDI DI CARATTERE PROTEOMICO

PIER GIORGIO PEIRETTI Effetto dell'integrazione con spirulina sulla qualità nutrizionale della carne di coniglio

ANGELO SISTO Studi molecolari e fisiologici sulle interazioni microrganismi-pianta.

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione L’Istituto di Scienze delle Produzioni Alimentari (ISPA), con sede principale a Bari e 4 unità operative distaccate rispettivamente a Lecce, Sassari, Torino e Milano, svolge prevalentemente attività di ricerca e innovazione mirate al miglioramento della qualità e sicurezza delle produzioni agroalimentari attraverso un approccio multidisciplinare basato sia sulle competenze interne in settori diversi (chimica, tossicologia, microbiologia, biotecnologie, veterinaria, agronomia, biologia e patologia vegetale), sia su una fitta rete di collaborazioni con istituzioni pubbliche e private. Il personale dell’ISPA è prevalentemente concentrato nelle sedi pugliesi di Bari e Lecce ed ammonta a 102 unità di ruolo (di cui 63 ricercatori) più 69 unità di altro personale (associati, assegnisti di ricerca, dottorandi, borsisti, contrattisti). Esso è rappresentativo sia di gruppi di ricerca che hanno un ruolo nel produrre e trasferire al sistema produttivo locale e nazionale innovazioni nel campo agroalimentare, sia di gruppi di ricerca molto ben inseriti a livello comunitario ed internazionale con partecipazione e/o coordinamento di progetti europei. Nella conformazione attuale del CNR, l’ISPA afferisce interamente al Dipartimento Agroalimentare con 7 commesse a carattere strategico e una commessa di ricerca a tema libero, operando in maniera determinante nell’ambito dei Progetti AG-P04 “Sviluppo sostenibile del sistema agro-industriale” e AG-P05 “Qualità, sicurezza alimentare e salute”. In particolare le seguenti commesse a carattere strategico sono state attivate nel 2005: AG-P04-694 – Sistemi produttivi sostenibili delle colture agrarie; AG-P04-695 - Sistemi produttivi sostenibili delle produzioni ittiche; AG-P04-696 - Microbiologia delle produzioni alimentari; AG-P04-697 - Tecnologie per la trasformazione, conservazione e confezionamento; AG-P05-691 – Sicurezza alimentare; AG-P05-692 - Tecnologie e biotecnologie per lo studio della qualità degli alimenti e per la produzione di molecole di importanza organolettica nutrizionale e salutistica; AG-P05-693 - Diagnostica avanzata e metodi innovativi per la caratterizzazione e analisi degli alimenti. I risultati delle ricerche sono riportati a parte nella descrizione delle singole commesse e consentono di mantenere gli standard di produzione scientifica del 2004 con un possibile aumento delle pubblicazioni su riviste internazionali di buon impact factor. In linea con gli orientamenti della politica della ricerca comunitaria e nazionale, l’Istituto è sempre stato fortemente orientato alla collaborazione con le imprese, riscontrando un sostanziale successo e mantenendo al tempo stesso un elevato livello di internazionalizzazione con una buona partecipazione a progetti anche nel VI Programma Quadro. I progetti attivi presso l’ISPA dalla sua costituzione ad oggi (considerando anche quelli già in corso nel 2002 e quelli avviati nel 2005) sono stati circa 90, di diversa natura e dimensioni, per un ammontare complessivo di finanziamenti esterni al CNR di circa 13 milioni di euro. Di particolare rilevanza sono i diversi progetti ministeriali compartecipati con le imprese (PON, Legge 297, PIA, RIDITT), che rivestono il 38% delle entrate, seguiti dal 34% degli altri progetti ministeriali e dal 18% dei progetti europei, mentre i progetti finanziati da Regioni o altri enti locali e direttamente dalle imprese ricoprono rispettivamente il 7% e 3% del totale delle entrate. La quota di partecipazione dell’ISPA ai diversi progetti con finanziamenti esterni è generalmente di buon livello e la distribuzione per sede degli stessi fa registrare una quota preponderante per la sede di Bari (73%), seguita da Lecce (11%) con cui condivide alcuni progetti. Nel 2005 circa la metà delle nuove entrate accertate (circa 2,3 milioni di euro, provenienti da oltre 50 progetti attivi) sono attribuibili a progetti svolti in compartecipazione con imprese. A questo riguardo particolarmente rilevanti sono alcuni progetti del MIUR legge 297, quali SIVINA per la filiera vitivinicola, SINSIAF e PANTI rispettivamente per le filiere grano duro e prodotti da forno, LICOPENE per il pomodoro, e del MAP (PIA su pasta arricchita di fibre e inulina), oltre a diversi progetti finanziati direttamente da imprese (Syngenta, Bayer, Feed Industry Service, Barilla, VICAM Ltd.). E’ previsto per il 2006 l’avvio di nuovi progetti rilevanti in stretta collaborazione con le imprese che sono già in avanzato stato di approvazione, tra cui la partecipazione a due iniziative di laboratori pubblico-privati rispettivamente su bioinformatica (capofila IBM) e genomica del frumento (capofila CRA-MiPAF) e ad un progetto di filiera sul frumento (capofila Barilla). E’ inoltre atteso un riscontro positivo su alcune delle numerose proposte di progetti di ricerca industriale avanzate dall’ISPA a livello sia nazionale (MIUR, MiPAF, MAP) che regionale (progetti strategici, esplorativi, ecc.) con particolare riferimento alle regioni in cui hanno sede unità dell’ISPA. I rapporti con Regioni e altri enti locali sono stati attivi a diverso livello, con oltre 20 iniziative/progetti svolti presso le rispettive unità territoriali dell’ISPA, particolarmente in Lombardia, Puglia e Piemonte, e con una tendenza ad aumentare, anche in virtù della sempre crescente collaborazione con imprese ed organizzazioni locali varie. Degna di particolare nota per il 2005 è l’aggiudicazione del progetto AGRIBIT del MAP (RIDITT), un progetto puramente di trasferimento tecnologico della ricerca alle imprese (pugliesi in particolare e nazionali in generale) nel settore delle biotecnologie agroalimentari, che coinvolge trasversalmente tutti i settori di intervento dell’ISPA (lattiero-caseario, oleario, viti-vinicolo, sicurezza

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alimentare, prodotti da forno, vegetali probiotici) e relative competenze nelle diverse commesse. Sono da segnalare al riguardo la realizzazione di un brevetto per la prevenzione di alterazioni microbiche nel pane mediante l’uso di metaboliti di un batterio lattico e l’estensione all’estero e trasferimento con licenza d’uso di due brevetti (olive e carciofi probiotici) alla COPAIM s.p.a., leader nazionale e principale esportatore di prodotti gastronomici freschi, con cui è stato attivato un progetto di ricerca e sviluppo industriale. In campo internazionale nel 2005 l’ISPA ha partecipato a 5 progetti europei, coordinandone due nell’ambito del VI P.Q., uno STREP sul controllo biologico delle malerbe e una SSA per l’integrazione a livello globale della ricerca europea su micotossine e funghi tossigeni. Ha inoltre partecipato a progetti bilaterali con Russia, Francia, Argentina, Brasile, USA, e ad un progetto di cooperazione internazionale con la FAO. L’ISPA ha partecipato per il CNR al “SAFE Consortium”, che raggruppa le più importanti Istituzioni pubbliche di ricerca indipendente (non strumentale) che operano nel settore della sicurezza alimentare, tra cui INRA, WUR, TNO, IFR e VTT. Le valutazioni sulla opportunità di continuare e/o potenziare l’impegno del CNR nel Consorzio dovrebbero essere fatte dal Dipartimento Agroalimentare nel suo complesso. Nell’ambito della formazione, l’ISPA ha partecipato a corsi di dottorato di ricerca con le Università di Bari, Lecce, Teramo, Foggia e del Molise, e a programmi di formazione con imprese nell’ambito di progetti PON, tra cui degno di particolare rilievo il progetto SINSIAF (con Barilla) che ha visto a fine corso l’assunzione da parte delle imprese di 2 dei 5 stagisti presso l’ISPA. Da segnalare inoltre la partecipazione di ricercatori ISPA a commissioni/comitati/gruppi di lavoro nell’ambito di organizzazioni internazionali (CEN, IDF, AOAC International, INC, FAO), a panel di esperti per la valutazione di progetti europei per il VI P.Q., a editorial board di riviste internazionali (European Food Research Technology, Food Chemical Toxicology, Mycotoxin Research), e l’organizzazione di un workshop bilaterale Europa-USA e di due conferenze internazionali.

Proposta di interventi organizzativi La politica di integrazione dei 6 ex-Organi CNR confluiti nell’ISPA, che ha caratterizzato l’Istituto nella sua fase di avviamento, con un approccio multidisciplinare nella partecipazione ai progetti esterni con il massimo coinvolgimento delle competenze già disponibili nelle diverse sedi territoriali, ha portato in un primo tempo all’identificazione delle seguenti aree di sviluppo trasversali alle diverse ex-sezioni dell’Istituto: micotossine, funghi tossigeni e sicurezza alimentare; microbiologia e tecnologia alimentare e qualità dei prodotti fermentati; bioprodotti microbici per un’agricoltura a basso impatto ambientale; produzioni vegetali e postraccolta nel settore ortofrutticolo; produzioni animali e qualità dei prodotti; biotecnologie vegetali e proteomica. L’effettivo sviluppo di tali aree è apparso fortemente legato alla partecipazione a progetti comuni ed ha avuto come fattore limitante la mancanza di fondi ad hoc per favorire le interazioni dirette tra i ricercatori, in particolare per le sedi lontane da Bari e con limitate risorse finanziarie da fonti esterne. Una vera e propria integrazione è di fatto avvenuta tra le sezioni di Bari e Lecce, facilitata anche dalla vicinanza geografica, oltre che da interessi dei ricercatori a sviluppare progetti comuni. L’interazione diretta delle sedi pugliesi (Bari in particolare) con l’unità di Sassari nei settori del postraccolta, biodiversità e qualità dei prodotti ortofrutticoli, inizialmente presente grazie anche alla partecipazione congiunta in alcuni progetti avviati in precedenza, è andata via via scomparendo con la conclusione di tali progetti, anche a causa delle difficoltà logistiche di partecipazione a progetti sviluppabili solo su scala regionale. E’ da rilevare che, con la conclusione di 4 progetti MiPAF nel 2005, le previsioni di finanziamenti esterni per il 2006 per la commessa di Sassari sono alquanto limitate, mentre c’è la necessità reale di fondi per il mantenimento delle strutture già esistenti, distribuite su due sedi (Sassari e Oristano), che sono di indubbio valore e con un buon potenziale di sviluppo a livello regionale e nazionale. Vi è inoltre per la sede di Sassari la necessità di fare chiarezza sulla suddivisione delle spese di gestione di servizi (pulizie, guardiania, giardinaggio) nella nuova sede condivisa con l’unità dell’IMC. Per quanto riguarda le unità di Torino e Milano, è da registrare un reale avvicinamento tra le stesse, in termini sia di attività in corso che di proposte progettuali, e l’apparente tendenza in quest’ultimo periodo al superamento delle perduranti difficoltà amministrative della sede di Milano. Nonostante la limitatezza di personale di ruolo, le due unità hanno dimostrato un notevole dinamismo e buone capacità di reperire progetti a livello regionale e nazionale e di produrre buoni risultati in termini di pubblicazioni e/o di trasferimento tecnologico. Tuttavia, a causa della dispersione delle competenze su vari fronti, le due unità non dispongono della massa critica su argomenti comuni che possa giustificare la creazione di una nuova commessa, e si sta attualmente operando per una migliore integrazione con i ricercatori di Bari senza escludere la possibilità di nuovi moduli. In merito alle infrastrutture di ricerca è da segnalare la piena funzionalità della nuova sede di Bari nell’Area della Ricerca che, pur comportando un consistente aumento dei costi di gestione, offre al personale condizioni lavorative ottimali sotto il profilo dell’efficienza e dell’organizzazione del lavoro. Anche il trasferimento dell’unità organizzativa di Lecce presso i nuovi laboratori e uffici all’interno del Campus universitario ha decisamente migliorato le condizioni di lavoro ed il rendimento della stessa unità, anche se per la piena

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funzionalità della nuova struttura sono ancora necessari alcuni interventi straordinari. Inoltre, con un nuovo progetto MIUR (SABIPAM) ad hoc per il potenziamento della strumentazione scientifica, sono stati acquistati e sono in piena attività nelle sedi di Bari e Lecce rispettivamente un LC/MS/MS per ricerche su micotossine, fitofarmaci e metaboliti microbici bioattivi ed un sequenziatore di DNA per studi di genomica microbica e vegetale. Rimane ancora il problema del rinnovamento delle apparecchiature scientifiche di uso corrente (chimico-analitiche, spettroscopiche, ecc.) particolarmente sentito dalle unità di ricerca di Torino e Milano che hanno minori possibilità di accesso a fondi esterni espressamente dedicati al potenziamento delle attrezzature e, anche a causa delle loro piccole dimensioni, risentono fortemente della continua diminuzione della quota di finanziamento ordinario. Uno dei problemi più rilevanti incontrato dall’Istituto in più circostanze è rappresentato dalle lungaggini burocratiche e amministrative (talvolta insostenibili) nell’erogazione dei finanziamenti pubblici per diversi progetti di grossa portata che sembrano ormai essere un fenomeno generalizzato che si verifica sia nella fase di contrattazione e quindi erogazione degli anticipi (possono passare anni dal momento dell’approvazione ed inizio delle attività del progetto alla sua contrattazione), sia per i pagamenti a fronte di rendicontazioni intermedie o finali andate a buon fine, sia per pagamenti di commesse di ricerca da parte committenti pubblici o privati intermedi che risentono dei ritardi dell’Ente finanziatore. Per poter collocare adeguatamente le competenze dell'Istituto all'interno dei progetti del Dipartimento Agroalimentare si è dovuto operare una ridistribuzione del personale in maniera differente (più circoscritta)rispetto alle precedenti aree di sviluppo e si sono riscontrate non poche difficoltà amministrative nel suddividere alcuni dei già numerosi progetti in ulteriori linee di attività tra commesse, al punto che la complessità del sistema ha portato alle dimissioni dall’incarico da parte del responsabile amministrativo dell'Istituto. Si è quindi ritenuto opportuno accorpare le due principali commesse, AG-P05-691 e AG-P05-693, che presentavano un maggior numero di progetti esterni condivisi e che erano guidate nella fase di avviamento rispettivamente dal direttore dell’Istituto e da un dirigente di ricerca che andrà in quiescenza nel 2006. Detto accorpamento ha avuto luogo anche a seguito delle difficoltà incontrate in questa fase per raggiungere il consenso dei ricercatori interessati ad una eventuale rimodulazione delle due singole commesse. Considerato il notevole livello di modificazioni critiche in atto relative a commesse, progetti, istituti e dipartimenti e che l’intero processo è tuttora in fase evolutiva (anche internamente all'ISPA), al fine di consentire una razionale stabilizzazione organizzativa del sistema, si è ritenuto di non introdurre per il momento moduli aggiuntivi all’interno delle commesse afferenti all’ISPA. Si prevede comunque, una volta razionalizzato e stabilizzato il sistema organizzativo anche in funzione dell’approvazione di nuovi progetti esterni, di considerare l'attivazione di nuovi moduli con possibilità di afferenza anche a commesse di altri istituti. Complessivamente non si rilevano grossi problemi a lungo termine per la stabilità e il progresso dell’Istituto, il quale poggia su basi solide garantite sia dall’adeguatezza delle dimensioni e dalle competenze multidisciplinari di cui dispone, sia dalla consolidata rete di collaborazioni con Università, organismi internazionali ed imprese, nonchè dalla notevole mole di fondi esterni provenienti da una diversificata tipologia di progetti già in essere o previsti per i prossimi anni. Tuttavia rimane ancora da razionalizzare la distribuzione di risorse nelle diverse commesse che dovrà essere fatta a livello di Dipartimento tenendo presente le possibili sinergie con altre commesse di altri Istituti evitando possibili sovrapposizioni. E’ già possibile prevedere una certa interazione positiva con alcuni Istituti del Dipartimento, quali l’ISA di Avellino e l’ISPAAM di Napoli che si trovano tra l’altro in una posizione geograficamente favorevole, su diversi aspetti riguardanti la relazione tra alimenti e salute e la proteomica e sostenibilità delle produzioni. Il ruolo dei collaboratori a tempo determinato in senso lato è di estrema importanza per l’espletamento dei progetti esterni, ma sarebbe auspicabile che vengano portati a termine gli impegni già presi per l’espletamento dei concorsi per il Mezzogiorno nell’ambito dell’accordo di programma CNR-MIUR. E’ inoltre necessario dare la possibilità di potenziamento strutturale anche alle unità del Centro-Nord e prevedere assunzioni anche di personale tecnico per garantire continuità al supporto di laboratorio o di campo, ciò anche in considerazione del fatto che i ricercatori sono sempre più impegnati in pratiche burocratiche per la pianificazione e rendicontazione delle ricerche disponendo quindi di sempre minore tempo per attività di laboratorio. Pur riconoscendo i vantaggi che la riorganizzazione in corso nel CNR potrà portare a regime, la complessità della problematica e i notevoli sforzi che la stessa richiede, ci si auspica di superare in tempi brevi questo stato di continue riorganizzazioni e rimodulazioni, che sono anche e soprattutto di natura amministrativa e burocratica e gravano pesantemente sulle condizioni lavorative dei dipendenti con conseguenti effetti negativi su rendimento e produttività dei ricercatori e delle strutture in cui essi operano.

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ISTITUTO PER IL SISTEMA PRODUZIONE ANIMALE IN AMBIENTE MEDITERRANEO Missione

Migliorare l’efficienza del Sistema Produzione Animale (SPA) nelle diverse condizioni ambientali e socio economiche delle realtà nazionali e del Mediterraneo oltre che razionalizzare l’uso delle risorse destinate all’animale sviluppando sistemi produttivi sostenibili non dannosi per l’uomo e per l’ambiente. Direttore: Dott Lino Ferrara Sede principale: Via Argine, 1085 - 80147 Ponticelli NA Campania Superficie immobile: XX mq Articolazione territoriale: c/o Via De Nicola, 1 - 7100 Sassari SS Sardegna Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.iabbam.na.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 21 1 19 5 46 2004 21 1 19 5 46 2005


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Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Crisafi Ermanno I Marsella Ennio I Mazzola Salvatore I Vallerga Silvana I Badalamenti Fabio II Cardellicchio Nicola II Di Bitetto Massimiliano II Domenici Paolo II Genovese Lucrezia II La Ferla Rosabruna II Pastore Michele II Pernice Giuseppe II Ragonese Sergio II Rinelli Paola II Zaccone Renata II Aiello Gemma III Alabiso Giorgio III Azzaro Filippo III Bergamasco Alessandro III Bonanno Angelo III Bono Gioacchino III Budillon Francesca III Buonocunto Francesco Paolo III Cannizzaro Leonardo III Caroppo Carmela III Caruso Gabriella III Cavallo Rosa Anna III Cecere Ester III Cucco Andrea III D'Anna Giovanni III De Alteriis Giovanni III Decembrini Franco III Di Leo Antonella III Esposito Eliana III Fanelli Giovanni III Ferraro Luciana III Fiorentino Fabio III Garofalo Germana III

liv.Giacobbe Maria III Giordano Daniela III Giuliano Laura III Gristina Michele III Iakimov Mikhail III Iorio Marina III Leonardi Marcella III Lirer Fabrizio III Micale Valeria III Milia Alfonsa III Molisso Flavia III Monticelli Luis Salvador III Narracci Marcella III Patti Bernardo III Pelosi Nicola III Perilli Angelo III Petrocelli Antonella III Pipitone Carlo III Pipitone Vito III Porfido Sabina III Prato Ermelinda III Raspini Arturo III Rubino Fernando III Sacchi Marco III Saracino Orestina III Stabili Loredana III Tonielli Renato III Violante Crescenzo III Zappala' Giuseppe III Frisone Giovanni IV Milillo Matteo IV Montanaro Pasquale IV Balestrieri Filippo V Campanella Nicola V Filippi Maria Iolanda V Giacalone Giacoma Rita V Irrera Gaetana V Maimone Giovanna V

liv.Perdichizzi Francesco V Rizzo Pietro V Termine Giuseppa V Acquaviva Maria Immacolata VI Angelino Antimo VI Azzaro Maurizio VI Badalucco Cinzia Vita VI Cosenza Alessandro VI Cusumano Salvatore VI Di Stefano Giuseppe VI Furnari Michele VI Gancitano Salvatore VI Giacovazzo Giuseppe VI Giandomenico Santina VI Giusto Giovan Battista VI Ingrande Giovanna VI Macripo' Cosimo Damiano VI Milazzo Antonino VI Norrito Giacomo VI Pietropaolo Aniello VI Rizzo Francesco VI Sclafani Patricia VI Scotto Di Vettimo Paolo VI Sinacori Giuseppe VI Annicchiarico Cristina VII Armato Vincenzo VII Coppola Marilena VII De Martino Rosaria VII Pinna Monica VII Corseri Giuseppe VIIIDe Francesco Paolo VIIIFama' Marcella VIIIIavarone Michele VIIIMusella Stefania VIIIPalmisano Maurizio VIIISoraci Francesco VIIIDe Palmis Vincenzo IX

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2003 4 3 - 3 3 13 2004 4 2 - 3 3 12 2005

ASSEGNISTI

Sara Lucia Maltoni Anna Maria Salzano


Paolo Abrescia

BORSISTI

Chiara D'Ambrosio Giovanni Renzone Maria Stefania Spagnuolo


DOTTORANDI

Simona Arena Linda Bianco

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Risorse finanziarie



esterne totale







anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 179 - 53 - - 2004 141 191 368 178 414 783 2005







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esposizione


2003 38 6 - - - - - - 2004 44 5 - - - - 2 - 2005


ARTICOLI ISI

Di Meo GP1, Perucatti A1, Gautier M2, Hayes H2, Incarnato D1, Eggen A2, Iannuzzi L1 Chromosome localization of the 31 type I Texas bovine markers in sheep and goat chromosomes by comparative FISH-mapping and R-banding ANIMAL GENETICS

Iannuzzi L1, Di Meo GP1, Perucatti A1, Incarnato D1, Peretti V2, Ciotola F2, Barbieri V2 An improved characterization of horse (Equus caballus, 2n = 64) chromosomes by using replicating G and R banding patterns CARYOLOGIA

Iannuzzi L1, Di Meo GP1, Perucatti A1, Rullo R1, Incarnato D1, Longevi M2, Bongioni A3, Molteni L4, Galli A3, Zanotti M2, Eggen A5 Comparative FISH-mapping of the survival of motor neuron gene (SMN) in domestic bovids CYTOGENETICS AND CELL GENETICS

Iannuzzi L1, Di Meo GP1, Perucatti A1, Schibler L2, Incarnato D1, Gallagher D, Eggen A2, Ferretti L3, Cribiu EP2, Womack J4 The river buffalo (Bubalus bubalis, 2n=50) cytogenetic map: assignment of 64 loci by fluorescence in situ hybridisation and R-banding CYTOGENETICS AND CELL GENETICS

Kierstein G1, Iannuzzi L2, Silva A3, Schneider MP3, Baumgartner BG4, Brenig B4 Assignment of solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2 (SLC26a2) to river buffalo (Bubalus bubalis, 2n=50) chromosome 9q26 (BBU9q26) by fluorescence in situ hybridisation and R-banding CYTOGENETICS AND CELL GENETICS

1Iannuzzi L, 1Perucatti A, 1Di Meo GP, 2Schibler L, 1Incarnato D, 2Cribiu EP Chromosomal localization of sixty autosomal loci in sheep (Ovis aries, 2n=54) by fluorescence in situ hybridization and R-banding CYTOGENETICS AND CELL GENETICS

Talamo F. 1, D'Ambrosio C., Arena S., Del Vecchio P., Ledda L. 1, Zehender G. 1, Ferrara L. 1 and Scaloni A. 1

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Proteins from bovine tissues and biological fluids: defining a reference electrophoresis map for liver, kidney, skeletal muscle, plasma and red blood cells PROTEOMICS

D'Ambrosio C. 1, Talamo F. 1, Vitale M.R. 1, Amodeo P. 1, Tell G. 1, Ferrara L. 1and Scaloni A. 1 Probing the dimeric structure of porcine aminoacylase 1 by mass spectrometric and modeling procedures BIOCHEMISTRY

Scaloni A. 1, Paolini S., Brandazza A., Fantacci M., Bottiglieri C. 1, Marchese S. 1, Navarrini A., Fini C., Ferrara L. 1 and Pelosi P. Purification, cloning and characterisation of odorant -and pheromone-binding proteins from pig nasal epithelium CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES

Allegrini S., Scaloni A. 1, Ferrara L. 1, Pesi R., Pinna P., Camici M., Eriksson S. and Tozzi M.G. Bovine cytosolic 5'-nucleotidase acts trough the formation of an aspartate 52-phosphate intermediateBovine cytosolic 5'-nucleotidase acts trough the formation of an aspartate 52-phosphate intermediateBovine cytosolic 5'-nucleotidase acts trough the format JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY

Spagnuolo M.S. 1, Cigliano L. 1, Sarubbi F. 2, Polimeno F. 2, Ferrara L. 2, Bertoni G. 3, Abrescia P. 1 The accumulation of a-Tocopherol and Retinol in the milk of water buffalo is correlated with the plasma levels of triiodothyronine BIOFACTORS

Di Meo GP1, Perucatti A1, Incarnato D1, Ferretti L2, Di Berardino D3, Caputi Jambrenghi A4, Vonghia G4, Iannuzzi L1 Comparative mapping of twenty-eight bovine loci in sheep (Ovis aries, 2n=54) and river buffalo (Bubalus bubalis, 2n=50) by FISH CYTOGENETICS AND CELL GENETICS

Borreani G.1, Roggero P.P.2, Sulas L.3, Valente M.E.4 Quantifying morphological stage to predict the nutritive value in sulla (Hedysarum coronarium L.) AGRONOMY JOURNAL

Valente M.E1., Borreani G.2, Caredda S.3, Cavallarin L.4, and Sulas L.5 Ensiling forage garland (Chrysanthemum coronarium L.) at two stages of maturity and at different wilting levels ANIMAL FEED SCIENCE AND TECHNOLOGY

Ding SY 1, Rincon MT 1, Lamed R 1, Martin JC 1, McCrae SI 1, Aurilia V 2, Shoham Y 1, Bayer EA 1, Flint HJ 1. Cellulosomal scaffoldin-like proteins from Ruminococcus flavefaciens JOURNAL OF BACTERIOLOGY

Scaloni A., Perillo V., Franco P., Fedele E., F., Froio R., Ferrara L. and Bergamo P. Characterization of heat-induced lactosylation products in caseins by immunoenzymatic and mass spectrometric procedures BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA

Palmieri G. 1, Di Liberto D. 2, Ferrara L. 1, Flint H.J. 3 and Aurilia V. 1

324


Pectinases in the rumen bacteria Ruminococcus flavefaciens REPRODUCTION NUTRITION DEVELOPMENT

Carbonaro M., Mattera M., Nicoli S., Bergamo P. 1 and Cappelloni, M. Modulation of antioxidant compounds in organic vs conventional fruit (Peach, Prunus persica, L. and Pear, Pyrus communis L.) JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Balestrieri M. 1, Spagnuolo S. 2, Cigliano L. 2, Storti G. 1, Ferrara L. 1, Abrescia P. 2 and Fedele E. 1 Evaluation of oxidative damage in mozzarella cheese produced from bovine or water buffalo milk. FOOD CHEMISTRY

Muresu R, Sini MC, Cossu A, Tore S, Baldinu P, Manca A, Pisano M, Loddo C, Dessole S, Pintus A, Tanda F, Palmieri G. Chromosomal abnormalities and microsatellite instability in sporadic endometrial cancer. EUROPEAN JOURNAL OF CANCER

Robledo R, Orru S, Sidoti A, Muresu R, Esposito D, Grimaldi MC, Carcassi C, Rinaldi A, Bernini L, Contu L, Romani M, Roe B, Siniscalco M. A 9.1-kb Gap in the Genome Reference Map Is Shown to Be a Stable Deletion/Insertion Polymorphism of Ancestral Origin. GENOMICS

ARTICOLI NON ISI

Porqueddu, C., Caredda, S., Sulas, L., Farina, R., Fara, G. Impatto dell'intensificazione colturale dei sistemi cerealicolo-zootecnici sui fenomeni erosivi in aree collinari della Sardegna. Riv. di Agronomia

LIBRI

Iannuzzi Leopoldo Methodologies applied on domestic animal chromosomes. From Methods in Molecular Biology, vol. 240: Artificial mammalian chromosomes, V. Sgaramella, S. Eridani (eds) Humana Press, Totowa, NJ, USA 2003.

Porqueddu Claudio Potential of grassland in Optimal forage systems for animal production and the environment., Kirilov A., Todorov N., Katerov I., Pleven 2003.

Pagnotta M. 4, Bennett S. 3, Cocks P. 3, Ewing M. 3, Howieson, J. 6, Moore, G. 6, Norman 5, H., Nutt, B. 6, Porqueddu, C. 1, Russi, L. 2, Snowball, R 6 Evaluation of perennial legumes collected in Italy, first year data. in New perennial legumes for sustainable agriculture, Bennet S., Perth (Australia) 2003.

Russi, L. 2, Bennett S. 3, Pagnotta M. 4, Norman, H. 5, Nutt, B. 6, Porqueddu, C. 1, Cagiotti, M.R. 2, Snowball, R. 6 and Moore G. 6

325


Ecogeography of perennial legume. Collecting mission in Italy in New perennial legumes for sustainable agriculture, Bennet S., Perth (Australia) 2003.

Vari The future of the green mediterranean Arti Grafiche, Cagliari 2003.

Basso A.L. 1, Maglione G. 1, Balzarano D. 1, Campanile C. 1, Rullo R. 1, Ferrara L. 1 Caratterizzazione e valorizzazione di samed (Cap. VII) Rubbettino, 2003.

ARTICOLI IN ATTI DI CONV.

Porqueddu c. Screening germplasm and varieties for forage quality: Constraints and potentials in annual medics. "“Quality in lucerne and medics for animal production”", Zaragoza 2001. Principali collaborazioni

Enti pubblici: Regione Autonoma della Sardegna; Regione Campania; Comune di Acerra

MIUR: Finanziamento M.I.U.R. leggi 95/1995 (5%), 449/1997 (progetti strategici MIUR), 204/1998(FISR) e 388/2000 (FIRB)

Privati: Fondazione Banco di Sardegna

UE: PQ Ricerca UE: Native perennial forage plantes for sustainibility of farming systems in the western mediterranean (PERMED),

326



MINISTERO POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI (MIPAF) • ANFIT SECONDA TRANCE - ACCERTAMENTO PER LA SEZIONE DI SASSARI E NAPOLI • Qualità dei foraggi e benessere animale: componenti antinutrizionali e principi bioattivi di

specie spontanee dei pascoli e rivalutazione della fitoterapia animale.(Anfit)

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • CONTRATTO MIPAF (SOMMA ANTICIPATA DALLA SEDE CENTRALE DEL CNR)

Unione Europea • PROGETTO PERMED

Comitato Convegno rete FAO - CIHEAM a • attività di ricerca inerenti gli aspetti agronomici ed il multiuso delle leguminose annuali

Fondazione Banco di Sardegna • CONTRIBUTO FONDAZIONE BANCO DI SARDEGNA PER INDAGINE DI ETNOBOTANICA

VETERINARIA

COMUNE DI ACERRA • Contributo ricerca prima annualità progetto "MONITORAGGIO AMBIENTALE MEDIANTE

TEST CITOGENETICA APPLICATI ALLE POPOLAZIONI ZOOTECNICHE ALLEVATE NEL COMUNE DI ACERRA" responsabilità scientifica dr. Leopoldo Iannuzzi

Contratti passivi

AZIENDA AGRICOLA GAETANO IEMMA • FORNITURA ALIMENTI PER BUFALI IN ACCRESCIMENTO ORDINE N.2001/0601

APPLERA ITALIA • contratto assistenza Voyager DE Pro-Procise Sequencer tecnica II semestre 2004 • Contratto di assistenza tecnica 01/01/03 - 30/06/03 • Obbligazione per documento amministrativo passivo CONTRATTO ASSISTENZA TECNICA I

SEMESTRE 2004 • Contratto di assistenza tecnica 01/07/03 - 31/12/03 • CONTRATTO ASSISTENZA TECNICA PERIODO 01/01/2005-31/12/2006 VOYAGER DE

PRO E PROCISE SEQUENCER

QUI! TICKET SERVICE SPA • Buoni Pasto per servizio sostitutivo mensa • BUONI PASTO ORD. N. 02/2003

MICROTECH s.r.l. • PIPETTA NUCLEOSPIN SEPHADEX

327


Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Biospettrometro di massa MALDI TOF modello Voyager-de PRO - Cappa per anaerobiosi - Elisa - Fermentatore - Gascromatrografo Dani - Sequenziatore automatico di DNA - Sequenziatore di proteine Procise 491 - Sistema Fibertec - Sistema Kjeltec - Sistema integrato LC MS MS DECA XP - Sistema per determinazione del profilo metabolico Istituti con i quali si collabora



328



Basi biologiche per il miglioramento produttivo di animali in produzione zootecnica

Temi


Estensione mappe citogenetiche ;studio anomalie cromosomiche e loro effetti fenotipici sui riproduttori;monitoraggio ambientale con test citogenetici;individuazione marcatori genetici e biochimici di stress metabolico e ossidativo;identificazione marcatori molecolari tracciabilità prodotti bufalini;catterizzazione complessi macromolecolari proteina- proteina e proteina-acidi nucleici essenziali per comprensione fisiologia animale; mappe proteomiche di riferimento e qualità prodotti

Stato dell'arte:

Il miglioramento genetico animale, per gli aspetti produttivi, la qualità dei prodotti e la resistenza agli stressori ambientali, viene affrontato con studi di selezione citogenetica dei riproduttori, di mappe citogenetiche, del genoma e del proteoma degli animali, dell'espressione spazio-temporale dei trascritti genici, della struttura delle proteine sintetizzate, di fisiologia e della risposta adattiva

Azioni

Attività in corso:

Selezione citogenetica dei riproduttori bovini e bufalini; monitoraggio ambientale mediante test citogenetici su popolazioni animali allevate in zone a rischio diossine; costruzione mappe proteomiche di riferimento di tessuti/fluidi biologici; caratterizzazione strutturale di proteine animali; caratterizzazione di geni coinvolti in processi di sviluppo del tessuto muscolare e dell'accumulo di grassi; realizzazione genoteca rappresentativa del genoma di bufalo in BAC


Disponibilità risorse umane previste Accordo CNR-MURST; difficoltà a mantenere assegnisti, tesisti e borsisti dopo il periodo di loro formazione; gestione manutenzione grosse apparecchiature centralizzata; scostamento massa residui


Dpt. Vet. Pathobiology,Texas; Dpt. Gen. Anim. Lab. Gen. Bioc. et Cytogènètique, France; Dpt. Anim Breed. and Genetics,Uppsala,Sweden; Inst. Med.Rech. en Nutrition, UNI MARSIGLIA, France; A. Enstein Coll. Med. NY, USA; Nat. Inst. on Aging, Baltimora, USA; Dpt. Prod. Anim., UNI NA; Ist. Prod. Anim., UNI MI; Dpt. Gen. e Microb. UNI PAVIA; Dpt. Fis. Bio. UNI PISA; Dpt.Fisiologia Gen. e Amb. UNI NA e UNI TORVERGATA; CNR IGB NA, CNR IAC NA

Finalità

Obiettivi:

Miglioramento genetico popolazioni zootecniche dell'area mediterranea; comprensione basi genetiche e metaboliche essenziali per processi fisiologici e benessere animale; monitoraggio ambientale mediante test citogenetici; caratterizzazione profilo proteomico e struttura di proteine animali; regolazione dell�espressione genica e della risposta antiossidante nella infiammazione e

329


nella resistenza a patogeni. Competenze:biochimica,biologia molecolare, citogenetica,fisiologia,genetica


Selezione riproduttori bovini e bufalini e di bufale con problemi riproduttivi; monitoraggio ambientale mediante test citogenetici; estensione mappe citogenetiche di animali domestici;riconoscimento di possibili marcatori molecolari e biochimici da associare alla risposta fisiologica e patologica; identificazione di geni coinvolti nel differenziamento muscolare nel bufalo;mappe proteomiche di organi e tessuti di animali in condizioni fisilogiche e patologiche

Potenziale impiego:


Basi genetiche e fisiologiche per lo sviluppo sostenibile dei sistemi produttivi e qualità dei prodotti

Temi


Prosecuzione attività in corso; messa a punto modelli gestione multiuso territorio agrosilvopastorale; resistenza stress abiotici in specie vegetali e batteri simbionti; cinetica degradazione alimenti uso zootecnico; risposta fisiologica a stress e condizioni ambientali; quadro espressione proteico in estratti di tessuto animale o microrganismi di interesse agroalimentare; fisiologia accrescimento e qualità prodotti; attività probiotiche di alcuni ceppi microbici verso sostanze contaminanti

Stato dell'arte:

Ambiente e pascoli mediterranei costituiscono patrimonio di interesse rilevante alla cui gestione vanno riservati interesse e attenzione. La ricerca tende a valorizzare risorse e potenzialità: miglioramento pascoli in funzione delle specie animali allevate e degli usi multipli dell�ambiente; innovazione tecnologica per esaltare caratteristiche genetiche e produttive animali e vegetali; qualificazione dei prodotti tipici del territorio per sicurezza, unicità, sapori; vivificazione economie locali

Azioni

Attività in corso:

Valutazione di specie e miscugli per usi multifunzionali; caratterizzazione bioagronomica e genetica di germoplasma vegetale; valutazione impatto ambientale (rilascio nutruenti, rischio erosivo e incendio); effetti biologici dei TC sugli animali (interazione con microrgansmi ruminali) e sullo stato redox; caratterizzazione chimico- nutrizionale alimenti uso zootecnico; caratterizzazione ceppi con attività detossificante e/o antinutrizionale; proteoma microrganismi probiotici


Disponibilità risorse umane previste Accordo CNR-MURST; difficoltà a mantenere assegnisti, tesisti e borsisti dopo il periodo di loro formazione; dislocazione della sperimentazione; scostamento massa residui operatori professionali per i campi sperimentali


Dpt Sc. Agronomiche UNISS; UNITO, UNIPD, UNIF, UNIPG, UNIPA, INRA FR, INRA MAROCCO, Dpt Agricoltura Perth CLIMA Perth; Dpt.Microbiology,UNI Cornell; Dpt. Agr. READING, UK; Dpt.

330


Gen. e Amb. UNI NA; Dpt. Neuroscienze UNI TORVERGATA, RM; Dpt. Biol. Mol. UNI Siena; Dpt. Nutrizione Animale, UNI PC; CNR IBP NA; CNR IGB NA;CNR IAC NA; Stazione Zoologica, NA; Enti locali, M.R. Elevafe, Odarc, Franca, Francia, Russian R. Ist. Agr. Microb., MiPAF Lodi

Finalità

Obiettivi:

Valorizzazione di specie erbacee e di batteri simbionti per impieghi multifunzionali; tecniche innovative in foraggicoltura e per recupero di suoli degradati e/o depauperati; studio risposta metabolica dell'animale: nutrizione, benessere animale, qualità dei prodotti e sostenibilità ambientale; caratterizzazione profilo proteomico di microrganismi di interesse veterinario e agroalimentare; competenze agronomiche, biochimiche, biologiche, fisiologiche, genetiche, fisico/matematiche


Modelli di gestione aziendale e successivamente territoriale; individuazione materiale vegetale per costituzione varietale e isolamento di batteri simbionti a alta efficienza; tecniche agronomiche ecocompatibili; sistema valutazione in vivo qualità carcassa; definizione di marcatori di qualità carcassa; variazione del profilo proteomico di microrganismi coinvolti in processi tecnologici e di microrganismi patogeni; sistema valutazione morfologica computerizzata di specie animali

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005



L’incertezza del finanziamento annuale dalla sede centrale ha creato seri problemi nella pianificazione di attività di campo e laboratorio. Carenza di bassi livelli professionali per le operazioni di campo (es. conduttori di macchine agricole). Ritardo nella chiusura degli iter concorsuali che dovevano assicurare nuove risorse umane. Completamento e mantenimento in efficienza della strumentazione di laboratorio e di campo. Inoltre alcuni contratti di ricerca presentano problemi nella gestione amministrativa legati al trasferimento dei fondi per cui è necessario un volano finanziario per anticipazioni che consentano una più puntuale rendicontazione agli enti erogatori

Collaborazioni

Dpt Sc. Agronomiche UNISS;UNITO,UNIPD,UNIF,UNIPG,UNIPA,INRA FR,INRA MAROCCO,Dpt Agricoltura Perth CLIMA Perth;Dpt.Microbiology,UNI Cornell;Dpt. Agr. READING,UK;Dpt. Gen. e Amb. UNI NA;Dpt. Neuroscienze UNI TORVERGATA, RM;Dpt. Biol. Mol. UNI Siena;Dpt. Nutrizione Animale,UNI PC; CNR NA IBP,IGB,IAC;Stazione Zoologica,NA;Enti locali,M.R. Elevafe,Odarc,Francia,Russian R. Ist. Agr. Microb.,MiPAF Lodi. Nuove collaborazioni: Ane Prle Livorno,Maison Rég. de l’Elevage,Inst. Elevage,Inst. Nat. Rech. Agricole et de la Pêche,Dir. Rég.

331


d’Agriculture Entre Douro et Minho,Patronato Rodríguez Penalva,Ass. Nacional de Criadores de Ovino Segureño,Ass. Nacional de Criadores de Ganado Caprino de Raza Murciano-Granadina,Ass. Española de Criadores de Cabra Malagueña,Consejo Superior de Investigaciones Científicas,Ass. Grupo de Desarrollo Rural del Altiplano de Granada,Ag. Reg. Servizi Sviluppo Agricolo-Abruzzo,UNI Perugia-Dip.to Sc.Economiche Estimative,A.R.A. Sardegna,Ane Prle Nuoro,UNI Aristote de Thessalonique-Faculté d’Agronomie-Dpt Production Animale,Service Interchambres d’Agriculture Montagne Elevage Languedoc-Roussillon,Chambre Dpt d’Agriculture de la Lozère,Ass. Languedoc-Roussillon Elevage


I risultati dell’attività del 2005 rispondono agli obiettivi previsti, fatta eccezione per alcuni progetti esterni non approvati o per cofinanziamenti accreditati a fine annata. Alcuni obiettivi non raggiunti sono da ascrivere al ritardo dell’accredito di finanziamenti esterni (progetto Interreg IIIA, Vegetatio) o alla mancata chiusura dell’iter di valutazione (alcuni POR regionali). I risultati relativi alla valutazione morfologica computerizzata di specie animali sono in fase di completamento


Individuati miscugli foraggeri adatti per sistemi agropastorali mediterranei;caratterizzazioni bioagronomiche di specie native per recupero ambientale;determinate perdite di nutrienti per lisciviazione da miscugli basati su leguminose;messe a punto tecniche di raccolta meccanica di seme di specie native per inerbimenti a uso multiplo;quantificata azotofissazione in favino e rilasci di azoto al terreno dopo il sovescio;definizione tassonomica di batteri endofiti isolati da noduli di leguminose spontanee;caratterizzati ceppi di rizobi simbionti di serradella;caratterizzate,per il contenuto in tannini condensati,diverse leguminose spontanee dei pascoli mediterranei;messa a punto modello per valutazione in vivo qualità carcassa bufalo da carne;individuati microrganismi e meccanismi di disintossicazione di antinutrizionali; definite mappe proteomiche di riferimento dello S. thermophilus e loro variazione in funzione delle condizioni sperimentali di crescita; presentati risultati progetto Anfit/Mipaf del gruppo nazionale e pubblicazione atti Convegno;collezionate numerose accessioni specie native di interesse foraggero o per il multiuso;organizzato Convegno EUCARPIA



Punto critico resta la disponibilità di risorse umane e finanziarie. Inoltre, determinante è la possibilità di aggiornare apparecchiature scientifiche la cui evoluzione tecnologica è rapidissima e assicurarne la loro manutenzione. Non solo per la attività di ricerca ma anche come patrimonio culturale e scientifico dell’Ente. Si tratta di apparecchiature che costituiscono il vanto del CNR per essersi posti, gli Istituti, come punti di eccellenza in settori avanzati

Collaborazioni

Dpt. Vet. Pathobiology,Texas; Dpt. Gen. Anim. Lab. Gen. Bioc. et Cytogènètique, France; Dpt. Anim Breed. and Genetics,Uppsala,Sweden; Inst. Med.Rech. en Nutrition, UNI MARSIGLIA, France; A. Enstein Coll. Med. NY, USA; Nat. Inst. on Aging, Baltimora, USA; Dpt. Prod. Anim., UNI NA; Ist. Prod. Anim., UNI MI; Dpt. Gen. e Microb. UNI PAVIA; Dpt. Fis. Bio. UNI PISA; Dpt.Fisiologia Gen. e Amb. UNI NA e UNI TORVERGATA; CNR IGB NA, CNR IAC NA

332



La disponibilità temporale di fondi non ha consentito di completare l’attività relativa alla selezione di riproduttori bovini e bufalini e di bufale con problemi riproduttivi


Rilevata spiccata fragilità cromosomica in pecore con dosi elevate di diossine nel latte e stabilità del genoma bovino Agerolese, razza in via di estinzione, rispetto a altre razze e specie;definite nuove varianti globiniche in animali autoctoni;evidenziata progressiva degradazione actina,miosina,tropomiosina e altre specie proteiche della componente miofibrillare e sarcoplasmatica del muscolo durante processo di stagionatura prosciutti italiani;definite mappe proteomiche riferimento di tessuti e fluidi biologici di bovino;definite proteine bersaglio principale dell'insulto ossidoriduttivo associato insorgenza alcune patologie dell'animale;individuazione marker proteici bersaglio reazione ossidazione in vari tessuti e fluidi biologici animali;caratterizzazione molecolare di un nuovo antibiotico dalla pelle della rana Phyllomeduda distincta e definite sue proprietà biologiche e strutturali;nel bufalo:isolati e sequenziati i geni della miostatina e miogenina,definita influenza temperatura ambientale e livelli ormoni tiroidei su trasporto transepiteliale di retinolo e tocoferolo dal plasma al latte e livello di leptina quale marcatore sviluppo del tessuto adiposo in accrescimento

333


Commesse 2006:


Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Sede principale svolgimento: Sezione di Sassari Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: SALVATORE CAREDDA Elenco dei partecipanti liv. Bullitta Simonetta Maria II Dettori Daniele VI Franca Antonio III Muresu Rosella III

liv.Nieddu Salvatore V Ortu Alessandro VII Porqueddu Claudio Antonio II Saba Piero VII

liv.Sassu Maria Maddalena VI Serra Franca VI Stangoni Anton Pietro VI Sulas Leonardo III

Temi

Tematiche di ricerca Caratterizzazione di sistemi agrosilvopastorali sostenibili Valutazione di specie foraggere in purezza e in miscuglio Raccolta, conservazione , caratterizzazione e valorizzazione di specie erbacee native di interesse foraggero e/o uso multiplo Caratterizzazione di batteri endofiti di leguminose Quantificazione azotofissazione simbiotica Caratterizzazione di associazioni di leguminose, batteri azotofissatori e rizobatteri promotori di crescita (PGPR) finalizzata ad utilizzi per bioremediation. Meccanismi di aridoresistenza e della dormienza in specie perenni Tecniche di produzione e raccolta sementi Pastoralismo in paesi del mediterraneo

Stato dell'arte - La tendenza verso un'agricoltura ecocompatibile e sistemi colturali biologici, contribuisce a valorizzare le specie leguminose ed i loro endofiti anche nei sistemi colturali e foraggero zootecnici mediterranei. Inoltre, è accresciuta la richiesta di proteine non OGM ed è dimostrato che l'impiego di rizobatteri aumenta la tolleranza agli stress abiotici delle specie inoculate. Tali presupposti giustificano il rinnovato interesse verso le leguminose non solo per fini produttivi ma anche per accrescere l'efficienza e la sostenibilità del sistema produttivo - La scarsa disponibilità nel mercato sementiero internazionale di varietà di specie da pascolo adatte al clima semi-arido mediterraneo ed ai sistemi di gestione agropastorali, stimola la ricerca di nuove varietà isolate dalla flora spontanea, anche per usi non convenzionali, quali il recupero ambientale e la riduzione dei rischi ambientali, nelle aree semi- aride - Per la proposizione di un vasto piano di intervento euromediterraneo a salvaguardia ed a potenziamento del comparto agropastorale, si rende necessaria una vasta indagine conoscitiva sul ruolo del pastoralismo fra tradizione e modernità

Azioni

Attività da svolgere 1.Individuazione di specie o varietà da inserire nei sistemi foraggero-zootecnici sostenibili al fine di aumentare l'efficienza economica e ambientale. 2.Messa a punto di tecniche di coltivazione e di raccolta (foraggi e sementi) convenzionali e biologiche. 3.Individuazione di accessioni di specie

334


autoctone e dei loro endofiti per impiego foraggero e/o per il multiuso utili per la costituzione di nuove varietà commerciali. 4.Individuazione di batteri simbionti con elevata efficienza nella fissazione dell'N e di associazioni pianta/microrganismi utili per interventi di bioremediation. 5.Individuazione di meccanismi di aridoresistenza in annue e perenni e di dormienza estiva nelle perenni 6.Messa a punto di tecniche di gestione pastorale e non per la riduzione del rischi ambientali 7.Analisi comparata del ruolo del pastoralismo in diversi paesi del mediterraneo

Punti critici e azioni da svolgere 1.Quota finanziamento da fondi interni della commessa: entità e certezza di erogazione complessiva. Gestione amministrativa di progetti comunitari che richiedono anticipi finanziari per l'avvio e la tempestiva rendicontazione. 2.Disponibilità di nuove risorse umane condizionata anche dall'espletamento degli iter concorsuali dei posti CNR-MISM; difficoltà di sostituzione di personale tecnico assente per mandato amministrativo; necessità di acquisire operatori professionali per la gestione di macchine agricole o come posti in organico o come stagionali. 3.Nel corso del 2006 è previsto il trasferimento nei nuovi locali della ricostituenda Area di SS per cui diventa improcrastinabile il completamento delle strumentazioni di laboratorio, venendo a mancare alcune sinergie con l’Università di Sassari

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Agronomiche e ambientali, genetiche, fisiologiche, microbiologiche, chimiche, Le principali tecniche utilizzate sono: - Metodi distruttivi e non per la stima della produzione di biomassa e della dinamica vegetazionale - Lisimetria e utilizzo di sonde per il monitoraggio dell'umidità del suolo - HPLC, ELISA, CIRAS gas analyser - Diluizione isotopica 15N - Analisi ARDRA del DNA, Fingerprinting di tipo RAPD e Sequenziamento DNA Ribosomico - GIS

Collaborazioni (partner e committenti) Committenti:UE, Regione Autonoma della Sardegna, MiPAF, Enti di Assistenza Tecnica. Partner: Dpt Sc. Agr. UNISS; UNITO, UNIPD, UNIF, UNIPG, UNIPA; INRA FR; INRA MAROCCO; IRA e INRA TunIsia, INAP Portogallo, UIB Spagna, Dpt Agricoltura Perth; CLIMA AUSTRALIA; Dpt. Microbiology, UNI Cornell USA; Dpt. Agr. READING, UK; Dpt. Gen. e Amb. UNI NA; Dpt. Neuroscienze UNI TORVERGATA, RM; Dpt. Biol. Mol. UNI Siena; Dpt. Nutrizione Animale, UNI PC; CNR IBP NA; CNR IGB NA;CNR IAC NA; Stazione Zoologica, NA; Enti locali; ODARC; ICALPE; Russian Res. Inst. Agr. Microb. San Pietroburgo RUSSIA; Univ. di Kassel, Germania; CRA Lodi; Amm. Prov. Livorno; MRE, IE; INRAP, Entre Douro et Minho; Patronato Rodríguez Penalva; ANCOS Spagna, ANCGC Raza Murciano-Granadina, Spagna; AEC Cabra Malagueña, Spagna; CSIC Spagna, AGR Altiplano de Granada; ARSSA-Abruzzo; Dip. Sc. Ec. ed Est. UBNIPG; ARA Sardegna; Amm. Prov.Nuoro; Univ. Aristotele de Thessalonique- Dip. Prod. Anim.; SIAME Languedoc-Roussillon, Francia; CD d'Agriculture de la Lozère, Francia; Ass. Languedoc-Roussillon Elevage, Francia

Finalità

Obiettivi 1.Individuazione di specie o varietà da inserire nei sistemi foraggero-zootecnici sostenibili al fine di aumentare l'efficienza economica e ambientale. 2.Messa a punto di tecniche di coltivazione e di raccolta (foraggi e sementi) convenzionali e biologiche. 3.Individuazione di accessioni di specie autoctone e dei loro endofiti per impiego foraggero e/o per il multiuso utili per la costituzione di nuove varietà commerciali. 4.Individuazione di batteri simbionti con elevata efficienza nella fissazione dell'N e di associazioni pianta/microrganismi utili per interventi di bioremediation. 5.Individuazione di meccanismi di aridoresistenza in annue e perenni e di dormienza estiva nelle perenni 6.Messa a punto di tecniche di gestione pastorale e non per la riduzione del rischi ambientali 7.Analisi comparata del ruolo del pastoralismo in diversi paesi del mediterraneo

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Risultati attesi nell'anno Individuazione di specie da pascolo e di batteri endofiti con potenzialità agronomiche per il settore foraggero e per il recupero ambientale Individuazione delle tecniche più idonee per la produzione in sistemi biologici e convenzionali Soluzioni tecniche innovative mediante la valorizzazione del germoplasma e la definizione di pacchetti gestionali aziendali per migliorare l'alimentazione del bestiame e la gestione sostenibile delle risorse naturali Messa a punto di itinerari tecnici di raccolta meccanica di sementi di specie foraggere e per usi multipli Quantificazione dell'N fissazione simbiotica ed effetto del sovescio sulla coltura in successione alla leguminosa. Indagine conoscitiva di settore sul pastoralismo in Sardegna: aspetti socio-economici e potiliche a sostegno. Identificazione, moltiplicazione e impiego su scala territoriale di specie vegetali di interesse per la prevenzione degli incendi e per usi multipli

Potenziale impiego - per processi produttivi a- Ottimizzazione sistemi colturali Implementazione di sistemi foraggeri sostenibili per aziende agrozotecniche in ambiente mediterraneo Imprese sementiere b- Recupero ambientale (aree manomesse, aree inquinate, etc.) Prevenzione incendi e protezione del suolo Pianificazione aziendale e territoriale


Moduli

Modulo: Basi genetiche e fisiologiche per lo sviluppo sostenibile dei sistemi produttivi e qualità dei prodotti

Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Luogo di svolgimento attività: Sezione di Sassari


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9442 105 289 0 836 29 423 64 N.D. 929




336






Altro Totale

0 2 3 0 0 0 0 0 0 5




Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: PAOLO ABRESCIA Elenco dei partecipanti liv. Auriemma Giuseppe VI Bonamassa Raffaele V Campanile Ciro VI Di Meo Giulia Pia II Ferrara Lino I Froio Raffaele V Grazioli Giuseppe VI Iannuzzi Leopoldo I

liv.Incarnato Domenico VII Ledda Luigi IV Marrazzo Antonio VII Navarro Agostino VIIINeiviller Carmen V Novi Gianfranco VIIIOrsini Ciro VII Palomba Raffaele III

liv.Pappalardo Raffaele VII Peluso Maria VII Perucatti Angela III Sarubbi Fiorella III Scaloni Andrea II Varonesi Anna VIIIVitale Vito VII

Temi

Tematiche di ricerca - Citogenetica clinica, evolutiva, molecolare e ambientale - Biochimica delle proteine e proteomica - Biologia e genetica molecolare - Fisiologia della risposta adattativa

Stato dell'arte Il miglioramento genetico animale per la riproduzione, resistenza alle malattie e qualità dei prodotti è stato possibile grazie al passaggio dai marcatori biochimici e immunologici ai marcatori genetici evidenziati mediante tecniche di RFLP, QTL, SNP e Microarray. Attenzione è dedicata allo studio del genoma degli animali di interesse zootecnico, per i quali è in fase avanzata la costruzione di mappe citogenetiche. Il completamento del sequenziamento del genoma prevede la caratterizzazione di brevi sequenze di cDNA che rappresentano l’attività trascrizionale dei geni nei diversi tessuti (EST). I risultati consentono lo studio del repertorio proteomico di animali e microrganismi di interesse veterinario e agroalimentare con indagini volte all’isolamento, identificazione, caratterizzazione della struttura primaria e delle modifiche post traduzionali di specie proteiche animali e allo studio delle loro interazioni molecolari. La comprensione delle basi genetiche e funzionali essenziali per processi fisiologici e il benessere degli animali in produzione zootecnica si basano sull’analisi di marcatori molecolari del metabolismo e lo studio dello stato redox plasmatici

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Azioni

Attività da svolgere Studio di anomalie cromosomiche nel bovino e nel bufalo e loro effetti sulla fertilità;studio popolazioni animali allevate in aree contaminate da diossine;estensione mappe citogenetiche nei bovidi domestici;studio linee cellulari tumorali di bovine affette da cancro alla vescica;analisi mappe proteomiche tessuti e fluidi biologici animali durante differenziazione cellulare o insorgenza patologie;analisi mappe proteomiche plasma da bovini trattati con anabolizzanti; studio effetto danni ossidativi e definizione marker molecolari di ossidazione in vari tessuti e fluidi biologici animali; analisi struttura leucina aminopeptidasi da cristallino bovino;caratterizzazione strutturale e funzionale di proteine di cavallo coinvolte percezione feromoni e odori;caratterizzazione molecolare e biologica nuovo antibiotico da pelle di rana Phyllomeduda distinta;caratterizzazione geni coinvolti in processi sviluppo tessuto muscolare e accumulo grassi;studio meccanismi genetici e epigenetici nel differenziamento tissutale, risposta fisiologica allo stress in animali in allevamento, risposta immunitaria nel bufalo alla infezione da brucella e dei danni ossidativi responsabili modificazioni proteoma

Punti critici e azioni da svolgere Alcune delle proposte verranno condotte in collaborazione con gruppi sia italiani che stranieri che, oltre a fornire il materiale biologico per le analisi cliniche, in parte finanziano le ricerche. Disponibilità temporale delle risorse previste dai progetti FIRB2001; disponibilità risorse progetto PRIN; disponibilità risorse umane; implementazione delle strumentazioni per il completamento dell'attività avviata; assicurare la gestione centralizzata per manutenzione grosse apparecchiature; difficoltà a mantenere assegnisti, tesisti e borsisti dopo il periodo di loro formazione

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze nei settori della biochimica, citogenetica, analisi molecolare del DNA, proteomica, fisiologia delle produzioni, immunogenetica, zootecnia e veterinaria. Le tecniche: coltura cellule sangue e fibroblasti per lo studio dei cromosomi (bande CBA ed RBA ad alta risoluzione, Ag-NORs, SCE, FISH su bande R ad alta risoluzione, fiber- FISH, Zoo-FISH, dual-color FISH); coltura cellule primarie; sviluppo e impiego di metodologie analitiche avanzate per determinazione profilo proteomico di tessuti e/o fluidi biologici animali o di lisati cellulari di microrganismi di interesse veterinario e agroalimentare e definizione stato redox e risposta immunitaria umorale e cellulo-mediata nelle infezioni (HPLC, ELISA,RIA, western blotting, micro-cromatografia, tecniche di elettroforesi mono- e bi-dimensionale, spettrometria di massa tandem nano- e micro-ESI-IT, nano- e micro-cromatografia mediante scambio ionico o fase inversa, analisi computerizzata di banche dati); tecniche per la produzione di librerie genomiche cromosoma-specifiche; tecniche sviluppo librerie di cDNA da tessuti di bufalo (SNP, microarray, DOP-PCR, EST, screening di cloni ricombinanti, isolamento DNA)

Collaborazioni (partner e committenti) Dpt. Vet. Pathobiology,Texas; Dpt. Gen. Anim. Lab. Gen. Bioc. et Cytogènètique, France; Dpt. Anim Breed. and Genetics,Uppsala,Sweden; Dip. Scienze Biochimiche UNI Roma; A. Enstein Coll. Med. NY, USA; Nat. Inst. on Aging, Baltimora, USA; Babraham Institute Cambridge, UK; Dpt. Prod. Anim., UNI NA; Ist. Prod. Anim., UNI MI; Dpt. Gen. e Microb. UNI PAVIA; Dpt. Fis. Bio. UNI PISA; Dip. Scienze biologiche UNI NA; Dip. Fisiologia dei Distretti Corporei UNI Roma 2; CNR IGB NA, CNR IAC NA

338


Finalità

Obiettivi Selezione dei riproduttori bovini e bufalini ed incremento delle produzioni animali; capire il percorso evolutivo e, quindi, adattativo di alcuni riarrangiamenti cromosomici; incrementare il numero dei loci da mappare nelle specie di interesse zootecnico; stimare il danno genetico in popolazioni animali esposte a mutageni presenti nell’ambiente di allevamento; formulare ipotesi a livello molecolare per alcune delle più diffuse malattie presenti nel settore dell’allevamento sulla base della conoscenza dei meccanismi preposti alla resistenza e/o suscettibilità alla infezioni e sulla disponibilità di possibili marcatori molecolari da associare a singole patologie; produrre librerie di cDNA per identificare geni coinvolti nel differenziamento muscolare di B.Bubalis; produrre librerie genomiche specifiche di singole regioni cromosomiche di interesse zootecnico e ricerca sia di geni candidati che di marker di tipo II (microsatelliti, SNP) ad essi legati; comprendere i meccanismi fisiologici fondamentali coinvolti nei processi produttivi e di adattamento; definire meccanismi di controllo genetici e epigenetici nel differenziamento tissutale di Bufalo

Risultati attesi nell'anno Dati citogenetici nel bufalo e nella pecora anche associati a condizioni patologiche; costruzione di genoteche di cDNA da tessuti bufalini e di mappe proteomiche tessuti e fluidi biologici animali durante differenziazione cellulare o insorgenza patologie e relativa banca dati; analisi mappe proteomiche di plasma da bovini trattati con anabolizzanti; effetto insulto ossidoriduttivo e definizione marker proteici bersaglio della reazione di ossidazione in vari tessuti e fluidi biologici animali; modelli interazione leucina aminopeptidasi e metaboliti glutatione; caratterizzazione strutturale e funzionale proteine di cavallo coinvolte percezione feromoni e odori; caratterizzazione strutturale e delle interazioni macromolecolari di peptidi amiloidogenici e delle proteine Erp57, banda 3 e JIP1; caratterizzazione molecolare e biologica nuovo antibiotico da pelle di rana Phyllomeduda distinta; dati sui meccanismi regolazione genetica e epigenetica nel bufalo; pattern risposta fisiologica a stressori ambientali in bufali in lattazione e in accrescimento; effetti dei danni ossidativi

Potenziale impiego - per processi produttivi miglioramento genetico del patrimonio zootecnico; selezione di animali per gli aspetti produttivi e di resistenza agli stressori ambientali; produzione di nuovi farmaci

- per risposte a bisogni individuali e collettivi miglioramento delle condizioni di vita degli animali e dell’uomo; selezionare animali per la loro minore suscettibilità a infezioni ne evita l’abbattimento con grossi vantaggi economici per l’allevatore e per il consumatore a livello di sicurezza degli alimenti

Moduli

Modulo: Basi biologiche per il miglioramento produttivo di animali in produzione zootecnica

Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto

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Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9522 315 36 19 892 15 366 102 N.D. 1009








Altro Totale

0 2 3 1 0 0 0 0 0 6



Innovazione tecnologica nel sistema Allevamento del bufalo ai fini del miglioramento produttivo, della sostenibilità del sistema e della tracciabilità delle produzioni

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIUSEPPE CAMPANILE Elenco dei partecipanti liv. Auriemma Giuseppe VI Baculo Rodolfo VIII Balzarano Domenico VI Bonamassa Raffaele V Campanile Ciro VI Ferrara Lino I Froio Raffaele V Grazioli Giuseppe VI

liv.Ledda Luigi IV Maglione Giuseppe III Marrazzo Antonio VII Neiviller Carmen V Novi Gianfranco VIIIOrsini Ciro VII Palomba Raffaele III Pappalardo Raffaele VII

liv.Peluso Maria VII Polimeno Franca III Sarubbi Fiorella III Scaloni Andrea II Varonesi Anna VIIIVitale Vito VII Zehender Goffredo II

340


Temi

Tematiche di ricerca - tecniche di coltivazione, di conservazione e di utilizzazione delle produzioni vegetali in sistemi estensivi - le funzioni produttive e riproduttive nel bufalo allevato in sistemi estensivi - aspetti fisiologici e metabolici in bufali in produzione - qualità dei prodotti di origine animale e dei derivati - la sostenibilità del sistema allevamento del bufalo

Stato dell'arte Il considerevole sviluppo dell’allevamento del bufalo è legato specialmente alla produzione della mozzarella, resa possibile in gran parte dalla introduzione di tecniche di allevamento e di piani alimentari propri di un allevamento di tipo intensivo con un innegabile effetto sulle condizioni di benessere dell’animale, sulla qualità delle produzioni e sulla fisiologia dell’animale specie per quanto attiene alla sfera riproduttiva. L’eccessivo ricorso ai mangimi concentrati, cui si accompagnano alte concentrazioni di proteine e/o di amido, è indicato tra le principali cause dell’insorgenza di dismetabolie legate alle modificazioni dell’ambiente ruminale, che determinano cali produttivi persistenti, alterazioni del ritmo riproduttivo, aumento delle patologie a carico di alcuni organi e apparati. Gli eccessi proteici possono alterare la composizione del liquido tubarico, modificare l’ambiente in cui gli embrioni risiedono nelle prime fasi dello sviluppo e ridurre l’efficienza riproduttiva. Per tali motivi la ricerca tende a individuare in zone collinari fonti alimentari alternative, quali leguminose e graminacee da foraggio, con elevato valore nutritivo e dal modesto impatto ambientale

Azioni

Attività da svolgere Indagini su foraggi e concentrati alternativi per formulare diete e razioni per l’allevamento del bufalo e valutazione loro caratteristiche chimico-nutrizionali;sviluppo colture foraggere in aree collinari; valutare effetto dieta e disponibilità spazio su prestazioni produttive, efficienza riproduttiva e qualità chimico- nutrizionali e tecnologiche latte e derivati;definire mappe proteomiche microrganismi patogeni o coivolti in processi di trasformazione;isolamento e caratterizzazione metabolica di ceppi di lievito D. hansenii;calcolo incidenza mortalità embrionale precoce nella specie bufalina nei diversi mesi dell’anno;caratterizzazione biochimica microambiente tubarico nell’embriogenesi precoce;valutare influenza di diversi sistemi di razionamento sull’efficienza riproduttiva;analisi livelli plasmatici di leptina e di marcatori metabolici ed ormonali durante la riproduzione nel bufalo;analisi marcatori danno ossidativo o di antiossidanti nei fluidi bufalini;analisi proteomica plasma seminale di bufalo;mappe genetiche ed epigenetiche nella specie bufalina e loro uso nel miglioramento delle tecniche di fertilizzazione in vitro

Punti critici e azioni da svolgere Disponibilità temporale risorse previste dai progetti FIRB2001;disponibilità risorse umane;definizione accordi con partner per uso fondi messi a disposizione;implementazione delle strumentazioni scientifiche operanti in Isituto (spettrometro di massa);definizione gestione manutenzione grosse apparecchiature (se possibile centralizzata);difficoltà a mantenere assegnisti, tesisti e borsisti dopo il periodo di loro formazione;aggiornamento di apparecchiature per il Servizio “analisi dei foraggi e qualità”;risposta produttiva dal punto di vista agronomico delle zone interne;numerosità animali controllati, dei parametri ematochimici, ematologici e ormonali presi in considerazione e dei prelievi:tutti funzione della disponibilità economica

341


Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Le competenze impegnate nelle attività previste si riconducono a quelle agronomiche, zootecniche, veterinarie, di nutrizione animale, di microbiologia, di fisiologia delle produzioni, di tecnologie della riproduzione, di biologia cellulare e molecolare, di proteomica, di matematica statistica e di modellistica. Le tecniche: sistema Weende e Van Soest, tecnica della Gas Production-RPT, tecnica enzimatica; determinazione della composizione chimica, acidità titolabile, cellule somatiche, contenuti in PUFA e CLA, caratterizzazione chimico- nutrizionale dei prodotti, uso tecniche RFLP del DNA mitocondriale e analisi RAPD-PCR; metodo Ovrinch e tecnica OPU, tecniche di fertilizzazione in vitro nel bufalo; analisi stato redox (HPLC, ELISA, western blotting); analisi peptide mass fingerprint, spettrometria di massa tandem e degradazione di Edman, tecniche di elettroforesi mono- e bi-dimensionale, isoelettrofocusing, digestione enzimatica, spettrometria di massa MALDI-TOF, spettrometria di massa tandem nano- e micro-ESI-IT, cromatografia, analisi computerizzata di banche dati; tecnica della BIA; tecniche di biologia cellulare e molecolare; metiloma e immunoprecipitazione cromatina

Collaborazioni (partner e committenti) UNINA Federico II,CRA,IGB-ICB-IBB CNR,Aziende,Industrie mangimistiche,ANASB,CIPAB,Centro Tori sas PG,Consorzio tutela mozzarella bufala CE,ICE NA,Cosvitec,CRdC Agroalimentare Regione Campania,Dip. Scienze Cliniche Veterinarie-UNINA, Dip. Scienze e Biotecnologie Biomediche UNI Udine, Dip. Chimica e Biotecnologie Agrarie,Dip. Fisiologia e Biochimica-UNI Pisa,Dip. Scienze Biochimiche-UNI La Sapienza Roma,Dip. Pediatria-SUN Napoli,Dip. Medicina Clinica e Scienze Immunologiche-UNI Siena,Istituto Malattie Infettive e Salute Pubblica-UNI Marche, Inbios Srl-Pozzuoli Napoli, Dip. Microbiologia-UNI Lecce,MIUR, Biochemistry & Medicine Dpt Boston, Immunology & Microbiology Dpts A. Einstein School of Medicine New York, School of Agricolture Policy and Development University of Reading, Dpt Biology IV University of Technology Aachen Germany, Faculty of Biology and Molecular Ecology Dpt University of Sofia Bulgaria, Institute Molecular Genetics CNRS Montpellier France, Facultade de Medicina Veterinaria e Zootecnica UNI Sao Paulo Brasile, Ass. Bras. Criadores Bubalos Sao Paulo Brasile, Tecnopec Sao Paulo Brasile

Finalità

Obiettivi Individuare e definire le migliori condizioni per l’allevamento estensivo del bufalo insieme a linee guida e a disciplinari per la certificazione dei prodotti. Verificare le condizioni di sostenibilità del sistema produttivo Allevamento del bufalo; ottenere prodotti di origine animale sicuri e dalle proprietà organolettiche e nutrizionali non presenti sul mercato; valutare l'effetto delle metodiche di fertilizzazione in vitro sui meccanismi di controllo genetici ed epigenetici dell'espressione genica (imprinting genomico)

Risultati attesi nell'anno Definire fonti alimentari alternative;realizzare sistemi produttivi vegetali agro-ecosostenibili;ottimizzare tecniche coltivazione e conservazione produzioni vegetali in sistemi estensivi;formulare razioni con l’impiego di foraggi conservati con tecniche innovative;migliorare ambiente ruminale e stato benessere animale; monitorare principali parametri ematici indicatori di stress;stimare efficienza produttiva e riproduttiva;valutare caratteristiche chimiche, nutritive ed organolettiche derrate alimentari ottenute;definizione mappe proteomiche R.albus,S.thermophilus e H.pylori;caratterizzazione metabolica di ceppi di D hansenii;nel bufalo:definire terreni ottimali per coltura embrionale in vitro, mappe genetiche ed epigenetiche e loro uso nel miglioramento delle tecniche di fertilizzazione in vitro, analisi elettroforetica proteine liquido seminale e tubarico, determinare i livelli plasmatici di leptina e di marcatori metabolici ed ormonali;analisi di marcatori di

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danno ossidativo o di antiossidanti nei fluidi bufalini. Messa a punto linee guida e disciplinari produzione per certificazione di prodotto per le aziende della filiera agro-alimentare

Potenziale impiego - per processi produttivi Recupero alla produttività di territori poco o non utilizzati; messa a punto di diete e razioni per migliorare le produzioni e la riproduzione in bufale allevate a sistema intensivo; ottenere prodotti nuovi e sicuri

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Verranno fornite indicazioni agli allevatori per gli aspetti produttivi e riproduttivi, per la sostenibilità dell’allevamento, per la qualità dei prodotti con benefici economici e sociali e per i consumatori per la qualità e sicurezza dei prodotti

Moduli

Modulo: Innovazione tecnologica nel sistema Allevamento del bufalo ai fini del miglioramento produttivo, della sostenibilità del sistema e della tracciabilità delle produzioni

Istituto esecutore: Istituto per il Sistema Produzione Animale in Ambiente Mediterraneo Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9644 340 18 19 1021 0 358 110 N.D. 1131








Altro Totale




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LEOPOLDO IANNUZZI Studi di citogenetica clinica e molecolare nel bufalo e nella pecora

LINO FERRARA Inquinamento da diossine e risposta fisiologica del sistema animale: modelli e risoluzione numerica

ANDREA SCALONI Un approccio integrato per lo studio del genoma e del proteoma di bufalo

SIMONETTA BULLITTA "Sviluppo di sistemi simbiotici tra leguminose da pascolo e microrganismi del suolo per utilizzi in programmi di phytoremediation�.

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Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione L’attività dell’Istituto, inquadrata nelle quattro macrolinee: - miglioramento genetico di animali in produzione zootecnica; nutrizione e alimentazione animale e qualità dei prodotti; sistemi foraggeri sostenibili in ambiente mediterraneo; modellistica zootecnica e informatica - è stata organizzata nelle due Commesse: - Basi biologiche per il miglioramento produttivo di animali in produzione zootecnica e Basi genetiche e fisiologiche per lo sviluppo sostenibile dei sistemi produttivi e qualità dei prodotti-, nelle quali hanno trovato giusta collocazione le competenze scientifiche e tecniche formate nell’Istituto e che vi operano. L’attività svolta si inquadra negli obiettivi generali del Dipartimento. Specificatamente, per lo sviluppo di analisi, anche con approcci di genomica funzionale e proteomica, per la caratterizzazione metabolica e genetica dei profili di biodiversità di animali e microrganismi di interesse agroalimentare e per l’analisi di determinanti fisiologici e genetici per lo sviluppo di tecniche ecocompatibili per migliorare le produzioni e la loro sostenibilità. L’attività di ricerca ha riguardato lo studio di due allevamenti di pecore sotto sequestro giudiziario per dosi elevate di diossine nel latte. I risultati, ottenuti con due test citogenetici incrociati (anomalie cromosomiche e SCE), hanno rivelato una spiccata fragilità cromosomica nei soggetti esposti alle diossine (67 pecore) sia rispetto al controllo (20 pecore) che a pecore precedentemente studiate ed esposte a bassi livelli di diossine (27 soggetti). Su bovini di razza Agerolese, razza in via di estinzione, è stato applicato il test dell’SCE per avere informazioni sulla stabilità del genoma. I risultati hanno rivelato un genoma molto stabile in tale razza-popolazione se confrontato con quello di altre razze e specie. Si è proceduto allo studio del polimorfismo dell’emoglobina in razze autoctone di capra che ha consentito la definizione di nuove varianti globiniche e, quindi, una migliore caratterizzare del patrimonio genetico degli animali presenti sul territorio Nazionale. Lo studio della variazione del profilo proteomico della componente solubile e miofibrillare del muscolo di maiale durante il processo di stagionatura di prosciutti italiani del tipo Parma e S. Daniele, ha evidenziato la progressiva degradazione dell'actina, della miosina, della tropomiosina e di altre specie proteiche nella componente miofibrillare e sarcoplasmatica del muscolo. La definizione delle mappe proteomiche di riferimento di tessuti e fluidi biologici (fegato, rene, muscolo, plasma ed eritrociti) di bovino di razza Frisona, ha portato alla caratterizzazione delle proteine più abbondanti in ciascun tessuto; mentre la definizione di alcune proteine bersaglio principale dell'insulto ossidoriduttivo associato all'insorgere di alcune patologie dell'animale, è stata resa possibile mediante lo studio dell'effetto dell'insulto ossidoriduttivo e la individuazione di markers proteici bersaglio della reazione di ossidazione in vari tessuti e fluidi biologici animali. La caratterizzazione molecolare di un nuovo antibiotico dalla pelle della rana Phyllomeduda distincta, ha permesso di definire le proprietà biologiche e strutturali di una nuova molecola dalle potenziali applicazioni farmacologiche, la distintina. I risultati ottenuti hanno trovato un ampio eco in quotidiani e riviste ad ampia diffusione sia nazionale che internazionale. Sono state definite le mappe proteomiche di riferimento dello Streptococcus thermophilus e loro variazione per la definizione della risposta adattativa del batterio al variare delle condizioni sperimentali di crescita (temperatura, pH, stress ossidoriduttivo, stress da carenza di nutrienti), con particolare riguardo a parametri chimico-fisici simili a quelli usati per la produzione industriale di yogurt. Questo studio ha consentito di definire, per la prima volta, il quadro di riferimento dell'espressione proteica di un batterio dalle diffuse applicazioni industriali (trasformazione del latte). Le ricerche di Genetica Molecolare hanno mirato alla individuazione e allo studio, a livello di espressione genica, di quei tratti direttamente correlati al differenziamento muscolare e quindi alla qualità della carne nel Bufalo allevato nella regione Campania, al fine di ottenere uno strumento che faciliti l’analisi estesa di soggetti in allevamento per la produzione di carne, attraverso la costruzione di un microchip derivato da tessuto muscolare. Si è proceduto all’isolamento e allo studio di alcuni geni fondamentali nelle fasi del differenziamento muscolare da trascritti di tessuto muscolare scheletrico. Sono stati isolati e sequenziati i geni della miostatina e della miogenina. L’isolamento di marker molecolari, pure nell’ottica di messa a punto delle metodologie per la costruzione della genoteca e per testare la rappresentatività dei trascritti di RNA, costituisce un primo metodo di indagine da ampliare e approfondire nel prosieguo della ricerca. Il metabolismo bufalino, durante l’accrescimento di animali maschi e la lattazione di primipare e pluripare, è stato valutato mediante l’analisi di specifici marcatori delle funzioni epatica e renale; inoltre, sono stati raccolti dati sul metabolismo glicidico, lipidico e proteico, anche in risposta a diete diverse. I profili metabolici sono

345


stati considerati alla luce dei livelli di specifici ormoni (insulina, glucagone, ormoni tiroidei e leptina) e dello stato redox plasmatico. In particolare, è stato dimostrato che la temperatura ambientale ed i livelli di ormoni tiroidei influenzano marcatamente il trasporto transepiteliale di retinolo e tocoferolo dal plasma al latte. Un accumulo di antiossidanti è stato trovato anche nel latte di capre a cui è stata somministrata Silimarina. Inoltre, l’analisi del livello della leptina, durante l’accrescimento bufalino, ha evidenziato una correlazione con la massa grassa, rilevata attraverso misure di bioimpedenza: dati di valutazione della carcassa hanno confermato che il livello di leptina è associato alla massa grassa e può, quindi, essere utilizzato come marcatore dello sviluppo del tessuto adiposo. E’ stato sviluppato, utilizzando la tecnologia dell’impedenza bioelettrica, un modello che consente la valutazione in vivo della qualità della carcassa di bufali allevati per la produzione della carne. Le ricerche svolte nell’ambito del Progetto ANFIT “Qualità dei foraggi e benessere animale: componenti e principi bioattivi di specie spontanee dei pascoli e rivalutazione della fitoterapia animale”, del quale la Sezione di Sassari ha curato il coordinamento nazionale, hanno riguardato la valorizzazione delle produzioni animali, il benessere animale e la qualità delle produzioni animali oltre che la sostenibilità del sistema agro-zootecnico e alimentare. Indicazioni si sono avute sulla utilizzazione di prodotti fitoterapici in sostituzione di prodotti chimici di sintesi per trattamenti medici agli animali, con la conseguente riduzione di residui nei prodotti di origine animale. Lo studio di antinutrizionali ha, tra l’altro, consentito di valutare e ridurre il rischio di intossicazioni per l’animale con la individuazione di microrganismi e meccanismi di disintossicazione che oltre a assicurare benessere all’animale, riducono l’impatto ambientale degli allevamenti e garantiscono sicurezza al consumatore. E’ stato avviato un nuovo progetto dal titolo “Improvement of native perennial forage plants for sustainability of Mediterranean farming systems” acronimo PERMED nell’ambito dell’FP6 comunitario che vede coinvolte unità di ricerca dei paesi europei e nord africani della parte occidentale del bacino del mediterraneo. L’attività mira all’identificazione di materiali foraggeri resistenti all’aridità estiva e allo studio delle basi genetiche e fisiologiche della dormienza estiva nonché alla valutazione di miscugli e pascoli migliorati a base di graminacee perenni e leguminose annuali. Nell’ambito della COST Action 852 “Quality Legume-Based Forage Systems for Contrasting Environments”, basata su un’infrastruttura sperimentale di 40 siti che coprono un ampissimo range di condizioni ambientali all’interno dell’Europa usando un disegno sperimentale ed un protocollo comune, si è applicato un nuovo approccio modellistico allo studio dei miscugli foraggeri. Sono stati individuati miscugli costituiti da gruppi funzionali diversi in grado di incrementare la produzione foraggera, ampliarne la disponibilità stagionale e migliorare le caratteristiche bromatologiche. E’ stata quantificata l’azotofissazione in favino e i rilasci a seguito di sovescio, oltre alla definizione tassonomica di batteri endofiti e la caratterizzazione per la resistenza a metalli pesanti di rizobi simbionti di leguminose spontanee. Sono state messe a punto tecniche di raccolta meccanica di sementi di specie erbacee spontanee da destinare a inerbimenti ad uso multiplo. Conoscenze sono state acquisite, nel contesto regionale sardo, sulle attività pastorali e sulle attuali evoluzioni dei sistemi agro-silvo-pastorali con particolare riferimento al ruolo da essi svolto nello sviluppo sostenibile (progetti Pastomed e Vegetatio)

Proposta di interventi organizzativi Si segnala la opportunità di favorire a) lo sviluppo delle attività nell’azienda sperimentale di Eboli che consente un contatto quotidiano con i problemi e gli operatori del settore, assicura una visibilità del CNR sul territorio e rappresenta una preesistenza qualificata per gli sviluppi che nel settore agroalimentare sono previsti nella zona: la creazione del Polo Agroalimentare e b) la realizzazione dell’Area della ricerca a Sassari con l’assegnazione di almeno le apparecchiature scientifiche assegnate all’Istituto su fondi speciali. Va proseguito il lavoro di razionalizzazione delle commesse così da trovare le giuste sinergie con l’Università, altri Enti di ricerca pubblici e privati e altri Istituti CNR. Tale lavoro è fatto anche nella ottica di assicurare condizioni ottimali per ottenere una sufficiente autonomia finanziaria. In tale direzione vanno gli sforzi per la presentazione delle nuove commesse.

346


ISTITUTO DI VIROLOGIA VEGETALE Missione

L'attività istituzionale dell'IVV comprende lo sviluppo di attività di ricerca sui diversi aspetti legati ad agenti fitopatogeni virali e virus-simili (viroidi e fitoplasmi): • Identificazione e caratterizzazione biologica e molecolare di virus, viroidi e fitoplasmi di

particolare rilievo a livello nazionale, anche attraverso lo studio delle interazioni patogeno/pianta e patogeno/vettore;

• Sviluppo e perfezionamento di sistemi di rilevamento e di diagnosi su base immunoenzimatica (ELISA, immuno-microscopia elettronica, lateral flow, etc.) o molecolare (PCR, ibridazione, etc.);

• Reperimento di caratteri di resistenza all'infezione e loro introduzione in specie coltivate con metodologie convenzionali e non convenzionali (ingegneria genetica);

• Miglioramento dello stato sanitario del materiale vivaistico di specie arbustive, legnose (vite, fruttiferi) ed erbacee (ortive ed ornamentali) tramite: selezione clonale e sanitaria, risanamento di cloni infetti, controllo sanitario del materiale da riproduzione.

Direttore: Prof. Maurizio Conti Sede principale: Strada delle Cacce, 73 - 10135 Torino TO Piemonte Superficie immobile: XX mq Articolazione territoriale:

c/o Dip.to Protez. Piante e Microbiol. UniBa Via Amendola, 165/A - 70126 Bari BA Puglia

Superficie immobile: XX mq

c/o Istituto di Patologia Vegetale - Università di Milano Via Celoria, 2 - 20133 Milano MI Lombardia

Superficie immobile: XX mq Sito web dell'Istituto: http://www.ivv.cnr.it Risorse umane


A B C D E=A+B+C+D 2003 28 0 17 6 51 2004 28 0 17 6 51 2005


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Elenco del Personale (dati al 31/12/2005): liv. Conti Maurizio I Russo Marcello I Accotto Gian Paolo II Boscia Donato II Caciagli Piero II Mannini Franco II Minafra Angelantonio II Rubino Luisa II Vallania Rosalina II Barbarossa Loredana III Cillo Fabrizio III De Stradis Angelo III Di Serio Francesco III Faoro Franco III Gribaudo Ivana III La Notte Pierfederico III

liv.Marzachi' Cristina III Masenga Vera III Noris Emanuela III Palmano Sabrina III Pantaleo Vitantonio III Saldarelli Pasquale III Saponari Maria III Schneider Anna III Stavolone Livia III Turina Massimo III Vaira Anna Maria III Cinquanta Sergio Mario IV D'Agostino Giovanni IV D'Aquilio Mariangela IV Longoni Cesare Enea IV Masenga Bruna Teresa IV

liv.Piccolini Elso IV Vecchiati Manuela IV Lenzi Riccardo V Stabile Maria V Veratti Flavio V Antonacci Antonia VI Cerro Daniela VI Marian Daniele VI Mottura Concetta VI Rocco Franca VI Campanale Antonia VII Patano Giovanni VII Perrone Caterina VII Zanchetta Celestina VII Carpignano Maria Teresa VIII





2003 11 12 9 2 23 56 2004 11 13 14 3 13 54 2005

ASSEGNISTI

Nicola Argamante Alessandra Bazzoni Dario Cantu'

Marina Ciuffo Giorgio Gambino

Giuliana Loconsole Giovanna Mason

Stefano Raimondi Daniela Torello Marinoni


Giuseppe Belli Piero Attilio Bianco Roberto Botta

Mariantonietta Castellano Alessandra Di Franco Donato Gallitelli

Giovanni Martelli Vittorino Novello Vito Nicola Savino

Andrea Schubert Crisostomo Vovlas

BORSISTI

Mariangela Dell'Orco Massimiliano Gullusci

Paolo Margaria Davide Pacifico Anna Sciancalepore

DOTTORANDI

Alessio Attolico Vincenzo Crescente Luciana Galetto

Samer Jarrar Slavica Matic

Giacomina Mondelli Marco Pasciuto

Alice Carla Poli Maria Elena Rodio

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Risorse finanziarie



esterne totale







anno

A B C D E F=B+D+E 2003 - 494 - 295 - - 2004 429 444 300 291 506 1.242 2005







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esposizione


2003 78 4 0 1 3 0 0 0 2004 58 7 0 1 3 0 0 2 2005


ARTICOLI ISI

Siefritz F. 1, Tyree M.T. 2, Lovisolo C. 3, Schubert A. 4, Kaldenhoff R. 1 PIP1 plasma membrane aquaporins in tobacco: from cellular effects to function in plants. PLANT CELL

Noris E. 1, Zanetti C. 2, Demurtas A. 3, Sinclair J. 4, De Andrea M. 5, Gariglio M. 6, Landolfo S. 7 Cell cycle arrest by human cytomegalovirus 86-kda IE2 protein resembles premature senescence JOURNAL OF VIROLOGY

Canto T. 1,Cillo F. 2, Palukaitis P.3 Generation of siRNAs by T-DNA sequences does not require active transcription of homology to sequences in the plant MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS

Cillo F.1, Roberts I.M. 2, Palukaitis P. 3 In situ localization and tissue distribution of the replication-associated proteins of Cucumber mosaic virus in tobacco and cucumber JOURNAL OF VIROLOGY

Weber-Lotfi F. 1, Dietrich A. 2, Russo M. 3, Rubino L. 4. Mitochondrial targeting and membrane anchoring of a viral replicase in plant and yeast cells JOURNAL OF VIROLOGY

Kobayashi K. 1, Tsuge S. 2, Stavolone L. 3, Hohn T. 4 The cauliflower mosaic virion-associated protein is dispensable for viral replication in single cells JOURNAL OF VIROLOGY

Caciagli P. 1, Verderio A. 2. Experimental layout, data analisys, and thresholds in ELISA testing of maize for aphid-borne viruses. JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS

Lucioli A.1, Noris E.2, Brunetti A.3, Tavazza R.4, Ruzza V.5, Castillo A.G. 6, Bejarano E.R. 7, Accotto G.P. 8,Tavazza M. 9.

350


Tomato yellow leaf curl Sardinia virus rep-derived resistance to homologous and heterologous geminiviruses occurs by different mechanisms and is overcome if virus-mediated transgene silencing is activated. JOURNAL OF VIROLOGY

Stavolone L.1, Kononova M.2, Pauli S.3, Ragozzino A.4, de Haan P.5, Milligan S.6, Hohn T.7 Cestrum yellow leaf curling virus (CmYLCV) promoter: a new strong constitutive promoter for heterologous gene expression in a wide variety of crops. PLANT MOLECULAR BIOLOGY

Pantaleo V., Rubino L., Russo M. Replication of carnation Italian ringspot virus defective interfering RNA in Saccharomyces cerevisiae. JOURNAL OF VIROLOGY

Malfitano M.1, Di Serio F. 2, Covelli L., 3, Ragozzino A. 4, Hernandez C. 5, Flores R. 6. Peach latent mosaic viroid variants inducing peach calico (extreme chlorosis) contain a characteristic insertion that is responsable for this symptomatology. VIROLOGY

Iriti M.1, Rabotti G.2, De Ascensao A R.3, Faoro F4. Benzothiadiazole-induced resistance modulates ozone tolerance. JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY

Rubino L. 1, Weber-Lotfi F. 2, Dietrich A. 3, Stussi-Garaud C. 4, Russo M. 5. The open reading frame 1-encoded protein (36K) of carnation Italian ringspot virus localized to mitochondria. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY

Stavolone L. 1, Herzog E. 2, Leclerc D. 3, Hohn T. 4. Tetramerization is a conserved feature of the virion-associated protein in plant pararetroviruses JOURNAL OF VIROLOGY

Di Serio F. 1, Schob H. 2, Iglesias A. 3, Tarina C. 4, Bouldoires E. 5, Meins F. 6. Sense- and antisense-mediated gene silencing in tobacco is inhibited by the same viral suppressors and is associated with accumulation of small RNAs PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA

Sabanadzovic S. 1, Abou Ghanem-Sabanadzovic N. 2, Saldarelli P. 3, Martelli G P. 4. Complete nucleotide sequence and genome organization of grapevine fleck virus. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY

Finetti-Sialer M. 1, Gallitelli D. 2. The complete nucleotide sequence of Pelargonium zonate spot virus and its relationship with the family Bromoviridae JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY

Brunetti A.1, Tavazza R. 2, Noris E. 3, Lucioli A. 4, Accotto G P. 5, Tavazza M. 6

351


Transgenically expressed T-Rep of tomato yellow leaf curl Sardinia virus acts as a trans-dominant-negative mutant, inhibiting viral transcription and replication JOURNAL OF VIROLOGY

Bucher G.L.1, Tarina C.2, Heinlein M.3, Di Serio F.4, Meins F. Jr 5, Iglesias V.A.6 Local expression of enzymatically active class I beta-1, 3-glucanase enhances symptoms of TMV infection in tobacco. PLANT JOURNAL

Turina M. 1, Prodi A. 2, Van Alfen N.K. 3. Role of the Mf1-1 pheromone precursor gene of the filamentous ascomycete Cryphonectria parasitica FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY

Vaira A.M. 1, Accotto G.P. 2, Costantini A. 3, Milne R.G. 4. The partial sequence of RNA 1 of the ophiovirus ranunculus white mottle virus indicates its relationship to rhabdoviruses and provides candidate primers for an ophiovirus-specificRT+PCR test. ARCHIVES OF VIROLOGY

LIBRI

Di Serio F.1, Malfitano M.2, Ragozzino A.3, Flores R.4 Apple Dimple Fruit Viroid pp.146-149 in Viroids, CSIRO Publishing, Colligwood, Australia 2003.

Rubino L. 1, Di Serio F. 2, Martelli G.P. 3 Viroid-like satellite RNAs, p. 76-84 in Viroids, CSIRO Publishing, Australia 2002.

Caciagli P. 1. Whitefly-Borne Viruses in Continental Europe , p. 279-292 in In: Virus-Insect-Plant Interactions, Academic Press, Londra, UK 2001.

Martinelli L. 1, Gribaudo I. 2. Somatic embryogenesis in grapevine. in In: Molecular biology and biotechnology of grapevine, Kluwer Acad. publ., Dordrecht, NL 2001.

Faoro F. 1, Sant S. 2, Iriti M. 3, Maffi D. 4, Appiano A. 5 Chitosan-elicited resistance to plant viruses: a histochemical and cytochemical study. P. 57-62 in In: Chitin enzymology , Muzzarelli RAA, Italia 2001.

BREVETTI

Tavazza M. 1, Noris E. 2, Lucioli A. 3, Accotto G.P. 4, Tavazza R, 5, Brunetti A. 6 Metodo per la preparazione di piante transgeniche resistenti in maniera duratura ai geminivirus

Hohn T. 1, Stavolone L. 2, de Haan P.T. 3, Ligon H.T. 4, Kononova M. 5. Cestrum yellow leaf curling virus promoters

Paradies F. 1, Finetti Sialer M.M. 2, Cillo F. 3, Gallitelli D. 4.

352


Metodo per la rilevazione di fitovirus in piante mediante RNA antisenso e piante trasformate

Russo M. 1, Rubino L. 2. Proteina 36K del virus italiano della maculatura anulare del garofano (CIRV)

RAPPORTI

Lisa L., Parena S., Lisa L., Mannini F., Bovio M. Confronto tra cultivar, cloni e portinnesti nel Monferrato settentrionale.

Mannini F. Nuove selezioni di vitigni ad uva da vino per il Piemonte.

Cristina Marzachì Studi sulla flavescenza dorata della Vite: epidemiologia, diagnostica, contenimento

Mannini Franco Documentazione per iscrizione al Catalogo Nazionale Varietà di Vite dei cloni Nebbiolo CVT 141, CVT 180 e CVT 185

Mannini Franco Documentazione per iscrizione al Catalogo Nazionale Varietà di Vite dei cloni Pelaverga CVT 3 e CVT 40

Mannini Franco, Schneider Anna Biodiversità in viticoltura: miglioramento genetico e recupero patrimonio varietale viticolo ligure - Consuntivo 2002

Mannini Franco Documentazione per iscrizione al Catalogo Nazionale Varietà di Vite del clone Rossese CVT 37

Mannini Franco Selezione clonale dei vitigni piemontesi - Consuntivo 2002

Mannini Franco, Schneider Anna Prove di coltivazione per l'esame dell'attitudine alla coltura di vitigni da vino - Consuntivo 2002

Schneider Anna Campo collezione per la salvaguardia e la valorizzazione dei vitigni minori del Piemonte - Consuntivo 2002

Schneider Anna, Torello Marinoni Daniela Indagine sui vitigni minori e rari del Reggiano: analisi con marcatori molecolari

Dettweiler Erika et al. European network for grape germplasm conservation and characterization

Quaroni S, Saracchi M., Faoro F., Iriti M.

353


Danni da ozono troposferico sulle colture estensive


MANNINI Franco Cloni selezionati di vite Nebbiolo CVT 141, CVT 180, CVT 185, Rossese CVT 37, Pelaverga CVT 3 e CVT 40 omologati dal MIPAF

Massimo Turina 1 , Alberto Salomone 2, Marina Ciuffo 3 Test Lateral Flow (LF) per la diagnosi in pieno campo di malattie delle piante Principali collaborazioni

Enti pubblici: ERSAF; Regione Lombardia; Regione Puglia; Regione Piemonte; Regione Liguria; Regione Valle d’Aosta

EPR italiane: Istituto per la Viticoltura, Conegliano Veneto; Istituto Sperimentale per la Zoologia Agraria; Istituto Agrario di San Michele all’Adige (TN); Istituto Sperimentale per la Patologia Vegetale; Istituto Elettrotecnico Nazionale; Istituto di Metrologia G. Colonnetti; ENEA

EPR straniere: Friedrich Miescher Institut (Svizzera); ARO The Volcani Center (Israele); Instituto Biologico San Paolo (Brasile); CNRS (Francia); CSIC (Spagna); Biotechnical Institute (Serbia Montenegro); CSIC-UPV (Spagna); Agricultural Biotechnology Center (Ungheria); John Innes Center, (Gran Bretagna); Biolog. Bundesanstalt f. Land (Germania); ICTV, International Committee on the Taxonomy of Viruses

MIUR: MIUR-MiPAF

Privati: C.R.A; Florilab; Phytolab; Olter; Fondazione per le Biotecnologie, Torino; Centro Ricerche e Sperimentazioni in Agricoltura ‘Basile Caramia’ (Locorotondo - BA); Nunhems Spa; Ortofrutticola di Alberga; ERSAT (Cagliari); Seminis Vegetable Seeds; Eugen Seed; AGRITEST S.p.A.,Valenzano (BA); AGDIA (Usa); DSMZ (Germania); International Whitefly Studies Network (Gran Bretagna); Equipe de Virologie - INRA (Francia); RWTH Plant Molecular Biology (Germania); USDA-ARS (Usa)

Università: Università di Milano; Università di Insubria; Università di Napoli II; Università di Torino; Università di Udine; Università di Catania; Università di Bologna; Università di Piemonte Orientale; Università di Bari; Università di Foggia; Università di Basilicata; Università di Potenza; Univ. de Santiago de Compostela (Spagna); Oklahoma State University (USA); University of California (USA); Università della Repubblica Ceca, (Repubblica Ceca ); Università di Leida (Spagna); Università di Stuttgard (Germania)

354



REGIONE LIGURIA • Biodiversità in viticoltura:miglioramento genetico e recupero del patrimonio varietale viticolo

ligure (resp. Dr. Mannini) Regione Liguria 100% 2003 • Regione Liguria anno 2004 "Biodiversità in viticoltura" • REGIONE LIGURIA - Programma"Sviluppo e qualità della viticoltura ligure-Biodiversità

Vitivinicola" anno 2005

REGIONE PIEMONTE • Studi sulla flaavescenza dorata della vite:epidemiologia, diagnostica,contenimento. (contratto

7227 del 20.08.02) Resp. Dr.ssa Marzachì • Selezione clonale dei vitigni piemontesi (contratto 7227 del 20.08.02) Resp. Dr. Mannini • Campo collezione per la salvaguardia e la valorizzazione dei vitigni minori del Piemonte

(Resp. Dr.ssa Schneider) • Prove di coltivazione ai fini dell'esame alla coltura di vitigni da vino (Resp. Dr. Mannini e

Dr.ssa Schneider) • Verifiche e collaudo di tecniche diagnostiche rapide di campo per le virosi vegetali di

maggiore interesse per il Piemonte (contratto 7227 del 20.08.02) Resp. Dr. Roggero • Campo collezione per la salvaguardia e la valorizzazione dei vitigni minori del Piemonte

(Resp. Dr.ssa Schneider) SALDO 50% REG.PIEMONTE 2001 • Selezione clonale dei vitigni piemontesi (Resp. Dr. Mannini) SALDO 50% REGIONE

PIEMONTE 2001 • REGIONE PIEMONTE progetto di ricerca "Studi sulla flavescenza dorata della vite:

epidemiologia, diagnostica, contenimento" conv. rep. 8357 del 17.09.03 (resp. Dr.ssa Marzachì)

• REGIONE PIEMONTE progetto di ricerca "Selezione clonale dei vitigni piemontesi", conv. rep. 8357 del 17.09.03 (resp. Dr.Franco MANNINI)

• REGIONE PIEMONTE progetto di ricerca "Campo collezione per la salvaguardia e la valorizzazione dei vitigni minori del Piemonte", conv. rep. 8357 del 17.09.03 (resp. Dr.ssa Schneider)

• REGIONE PIEMONTE progetto di ricerca "Prove di coltivazione ai fini dell'esame alla coltura di vitigni da vino", conv. rep. 8357 del 17.09.03 (resp. Dr. Mannini e Dr.ssa Schneider)

• REGIONE PIEMONTE progetto di ricerca "Verifica e collaudo di tecniche diagnostiche rapide di campo per le virosi vegetali di maggiore interesse per il Piemonte", conv. rep. 8357 del 17.09.03 (resp. Dr. Turina)

• Selezione di varietà di vite da vino del Piemonte (resp. Dr. Mannini) • Studi sulla flavescenza dorata della vite e del suo vettore Scaphoideus

Titanus:epidemiologia,diagnostica,prevenzione,contenimento - sottoprogetto 1-supporto dei sottoprogetti 2-3-4-5 (resp. Dr.ssa Marzachì)

• Regione Piemonte progetto "Produzione di vaccini edibili per la prevenzione delle infezioni da papillomavirus umano" - bando 2003 - 100% quota per Personale (resp.Dr.ssa Noris)

• Interventi per la conservazione e caratterizzazione dei vitigni di interesse locale del Piemonte (Resp. Dr.ssa Schneider)

• Studi sulla flavescenza dorata della vite e del suo vettore Scaphoideus Titanus:epidemiologia,diagnostica,prevenzione,contenimento - sottoprogetto 3 (Dr. Mannini)

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• Diagnostica di laboratorio sulla presenza delle virosi del mirtillo e approfondimenti diagnostici sule virosi e fitoplasmosi di piante cerealicole, orticole, ornamentali e frutticole di particolare importanza per il Piemonte (Dr.Turina)

• Studi sulla flavescenza dorata della vite e del suo vettore Scaphoideus Titanus:epidemiologia,diagnostica,prevenzione,contenimento - sottoprogetto 2-predisposizione di antisieri per il rilevamento di FDP (resp. Dr.ssa Palmano)

ERSAT - ENTE REGIONALE DI SVILUPPO E ASSISTENZA TECNICA • Analisi di laboratorio per la ricerca e determinazione di fitopatologie virotiche,da fitoplasmi e

viroidi (Resp. Conti) ACCONTO 60% • ERSAT:analisi di laboratorio per la ricerca e determinaz. di fitopatologie virotiche da

fitoplasmi e viroidi" Rep. 15508 del 02.01.03 saldo 40% (Resp. Prof. Conti)

NUNHEMS ITALY S.R.L. • Sementi Nunhems srl :Test su 191 genotipi di peperone per la resistenza a TSWV e

consulenza per la valutazione dei risultati (resp. Dr. Turina)

ISTITUTO SPERIMENTALE PER LA PATOLOGIA VEGETALE - ROMA • Istituto Sperimentale per la Patologia Vegetale:ANTICIPO 50% programma triennale di

ricerca "I giallumi della vite:un fattore limitante le produzioni vitivinicole (GIAVI)" durata 19.12.03-30.06.2007

ENTE REG. SERVIZI ALL'AGRICOLTURA E ALLE FORESTE • Progetto "INFOGESO" - ERSAF

ISMEA - ISTITUTO DI SERVIZI PER IL MERCATO AGRICOLO ALIMENTARE • Progetto Twinning MALTA MT: 2002/IB/AG/02(fitosanitario) -Consulenza Dott. Boscia, Dott.

Saldarelli (1° Acconto 50%) • Progetto Twinning MALTA MT: 2002/IB/AG/04(Viticolo) -Consulenza Prof. Conti, Dott.

Mannini, Prof. Martelli - (1° Acconto 50%)

MINISTERO DELLE POLITICHE AGRICOLE E FORESTALI • Progetto FLORICOLTURA saldo 3 anno "Prodotti e tecnologie innovative su piante

ornamentali con particolare riguardo alle aree del Meridione" Resp. Dr. Accotto

LA CROTTA DI VEGNERON S.R.L. • Programma comunitario CRAFT, progetto "Eagle Wine" - Resp. D.ssa Schneider • Progetto CRAFT "Eagle Wines" - 2 anno periodo 01-03.04-28.02.05 - Resp. Dr.ssa Anna

Schneider Contratti passivi

LICOSA - Libreria Commissionaria Sansoni S.p.A. • LICOSA ordine aperto n. 307 DEL 6.12.2002 • LICOSA LIBRARIA SANSONI ORD. 224 DEL 22.12.2003 (Rinnovo abbonamenti 2004) • LICOSA ord. 209 del 13/12/2004- RINNOVO ABBONAMENTI 2005

356


ANALYTICAL CONTROL S.P.A. • Obbligazione per documento amministrativo passivo ANALYTICAL CONTROL ord. aperto

272 del 12:11:2002

GIACOSA ELIO SNC • GIACOSA ELIO ordine aperto n. 310 del 09.12.2002

Elenco delle principali attrezzature scientifiche - Apparecchiatura per Filtrazione-Ultrafiltrazione acqua - Armadi climatizzati - Camere climatizzate per piante - Complesso serre per virologia - Fitotrone - Fluorimetro per DNA - Microscopi Elettronici (Philips EM 201, Philips CM10, Jeol) - Microscopio Elettronico (EM 201) - Termociclatori PCR - Ultracentrifughe Beckman - iCycler PCR quantitative - metallizzatore - microtomi e ultramicrotomo - spettrofotometri UV.VIS Istituti con i quali si collabora



357



Agenti patogeni intracellulari e miglioramento genetico e sanitario della vite

Temi


1)Genoma e proteoma (2-DE) della vite; 2)Effetti delle infezioni virali su fisiologia e attitudini colturali della pianta, ricadute sulla qualità del vino; 3)Verifica delle modalità di reinfezione da Nepo- e Ampelovirus in piante risanate; 4)Trasferimento in vite di geni induttori di resistenza alle malattie; 5)Ricerca di marcatori molecolari associati alla resistenza a nematodi; 6)Crioconservazione di apici vegetativi e/o embrioni somatici; 7)Diagnosi di agenti virali e fitoplasmi

Stato dell'arte:

La superficie coltivata a vite (circa 750.000 ha) e l'entità della produzione enologica nazionale (circa 70.000.000 hl)sottolineano il ruolo trainante del settore vitivinicolo per l'economia nazionale. Più di altre specie coltivate, la vite è suscettibile a infezioni da virus e fitoplasmi che ne minacciano gravemente la coltivazione. Ciò impone lo studio approfondito dei patogeni, collegato alle attività di selezione clonale e sanitaria, miglioramento genetico e salvaguardia della biodiversità.

Azioni

Attività in corso:

1) Interazione vite -infezioni virali con particolare riguardo agli effetti sulla produzione a frutto ed enologica; 2) miglioramento genetico e sanitario del germoplasma viticolo; 3) caratterizzazione di nuovi isolati virali e loro varianti; 4)diagnostica sierologica e molecolare avanzata, produzione di kits diagnostici; 5) trasformazione di vite ai fini della resistenza; 6) risanamento di cultivar pregiate con termoterapia e colture in vitro; 7) reperimento di vitigni autoctoni e conservazione.


Difficoltà per saggi molecolari direttamente su vite. Tempi richiesti per la realizzazione di obiettivi quali: risanamento di cloni e verifica, selezione sanitaria e clonale, diagnosi multivirale su campioni singoli (microarray), effetti di infezioni virali sulla produzione enologica. Trasformazione genetica e caratterizzazione di piante ottenute. Difficoltà nella sperimentazione in pieno campo di metodi di lotta contro virus e fitoplasmi. Costi di manutenzione elevati.


Università ed altri istituzioni pubbliche e private di ricerca nazionali e straniere (altri Paesi membri UE;USA); Amministrazioni delle Regioni e delle Province italiane; Servizi fitosanitari regionali; Associazioni di viticoltori; ACOVIT (Ass. Costitutori Cloni) Piccole e Medie industrie del settore vitivinicolo.

Finalità

Obiettivi:

1)Isolamento e caratterizzazione biologica e molecolare di virus, viroidi e fitoplasmi della vite; 2)diagnosi sierologica e molecolare; 3) effetti delle infezioni virali sulla produzione; 4) eziologia di

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ampelopatie virus-simili; 5) salvaguardia della biodiversità viticola; 6) risanamento di cultivar pregiate; 7) induzione di resistenza alle infezioni anche mediante ingegneria genetica. Competenze: viticoltura, virologia, genetica vegetale, biologia molecolare, sierologia.


1°e2°a.: miglioramento diagnosi dei virus; reperimento e conservazione di vitigni in estinzione; individuazione di nuovi cloni, controllo sanitario e verifica della produttività; biodiversità di popolazioni virali; 3°a.: effetti delle infezioni virali su piante e produzione vinicola; prevenzione delle infezioni fitoplasmiche; protocolli per la certificazione; miglioramento diagnosi dei fitoplasmi; efficacia e rischio di impiego di transgeni virali. Pubblicazioni.

Potenziale impiego:


Interazioni biologiche e molecolari delle piante con virus e agenti patogeni virus-simili

Temi


Interazioni pianta/patogeno in riferimento ai processi di infezione, patogenesi e risposte di difesa dell'ospite; siti intracellulari, meccanismi di replicazione e movimento dei virus e viroidi; silenziamento genico post-trascrizionale in sistemi virus o viroide/pianta. Trasformazione di piante ai fini di resistenza alle virosi. Interazioni molecolari insetto-vettore-patogeno. Espressione in pianta di proteine eterologhe di interesse biomedico mediante vettori virali e sistemi transienti.

Stato dell'arte:

Virus, viroidi e fitoplasmi sono patogeni intracellulari che inducono malattie gravi alterando le normali funzioni metaboliche dell�ospite. I virus costituiscono anche modelli ideali per lo studio dei meccanismi molecolari nei processi infettivi e in quelli biologici legati al funzionamento cellulare. La patogenesi, i meccanismi molecolari che presiedono ai rapporti ospite/patogeno/vettore, lo sviluppo di mezzi diagnostici e di mezzi di lotta sono i punti di studio di maggiore interesse.

Azioni

Attività in corso:

Caratterizzazione biologica e molecolare dei patogeni citati e dell'interazione ospite-patogeno; genomica e proteomica virale e viroidale; biodiversità e dinamica delle popolazioni di patogeni; citopatologia; epidemiologia e vettori; uso del DNA ricombinante per la trasformazione di piante ai fini della resistenza; diagnostica sierologica e molecolare avanzata, produzione di kits diagnostici; prevenzione dalle infezioni e risanamento di cultivar pregiate.


Punti critici: acquisizione e sviluppo di nuove metodologie di laboratorio più sofisticate ed innovative. Elevati costi di manutenzione del complesso serre e manodopera avventizia. Condizioni di fattibilità: il patrimonio delle conoscenze scientifiche e strumentazione dell'Istituto andrà potenziato con riferimento ai settori della genomica, post-genomica e proteomica e all'analisi dell'espressione genica (es. Micro-array)

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Università ed altri istituzioni private e pubbliche di ricerca nazionali ed estere (altri Paesi membri UE; UK; USA); Amministrazioni delle Regioni e delle Province italiane; Comunità montane; Servizi fitosanitari regionali; Fondazioni aventi fini di promozione della ricerca scientifica; Piccole e Medie industrie del settore agroalimentare.

Finalità

Obiettivi:

Obiettivi:1) Analisi del patogeno caratterizzata da studi di isolamento, caratterizzazione biologica e molecolare, diagnosi; 2) Analisi dell'interazione patogeno-pianta ospite-insetto vettore rivolte alla comprensione dei processi di patogenesi/resistenza, dell'epidemiologia e all'impostazione della lotta. Competenze: biologia molecolare, biochimica, genetica vegetale, entomologia, microscopia elettronica e ottica, sierologia, bioinformatica e biostatistica, ingegneria genetica.


1° e 2° anno:Protocolli diagnostici innovativi e di migliorata sensibilità; meccanismi di replicazione e movimento dei virus nella pianta; processi di trasmissione di virus e fitoplasmi con insetti vettori; meccanismi di patogenesi virale e viroidale; meccanismi di resistenza ai virus in piante ingegnerizzate; selezioni risanate di cultivar pregiate di specie fruttifere. Biodiversità di popolazioni virali. 3°anno: metodi di prevenzione e lotta ecocompatibile innovativi. Pubblicazioni

Potenziale impiego:


Preconsuntivo 2005 Agenti patogeni intracellulari e miglioramento genetico e sanitario della vite


Come per le altre Commesse, punti critici prioritari sono la scarsità dei finanziamenti ottenuti dal CNR per l’anno in corso e la mancata possibilità di nuove assunzioni, soprattutto di posti da ricercatore per personale che da anni opera in condizioni di precariato. Dal punto di vista tecnico-scientifico, permangono le note difficoltà nelle ricerche su ampelopatie non trasmissibili meccanicamente, nella diagnosi diretta di virus e fitoplasmi che nella Vite presentano bassa concentrazione e distribuzione erratica, e nell'applicare alla vite tecniche di trasferimento genico messe a punto su specie modello.

Collaborazioni

Hanno riguardato: miglioramento genetico, selezione e risanamento di vitigni affetti da virosi (Università di Torino, Bologna, Bari; CRA - Istituto di Viticoltura- Conegliano Veneto; Istituto Agrario S. Michele all'Adige (TN); Regioni: Puglia, Piemonte, Liguria, Valle d'Aosta; CRS Agr. Basile Caramia - Locorotondo). Epidemiologia e diagnosi di fitoplasmi (Università di Milano, Catania, Udine; CRA - Istituto Patologia Vegetale -Roma; Florilab (PG); Phitolab; ERSAF - Regione Lombardia). Caratterizzazione Biologica e Molecolare di virus della vite (Int.Committee Taxonomy of Viruses-USA; BBA - Germania; Università di Leida-E; CNRS-Francia). Biodiversità, colture in vitro e genomica della

360


vite (Università di Vienna BOKU; ENSAM-INRA Montpellier - FR; Equipe Genetique de la Vigne-INRA-FR; Grapevine Breeding Institute-Geilweilerhof-D; Institut Agricul Regional-Aosta; Vignaioli Piemontesi-Castagnito-Cuneo).


Relativamente al punto (1) succitato: l'accertamento della variabilità molecolare dei geni delle proteine capsidiche ha confermato le differenze tra i due virus studiati a livello sierologico. Circa il punto (2) succitato, pare opportuno che le ricerche siano proseguite con particolare attenzione - perché, interesse scientifico-conoscitivo a parte - la comprensione dell’eziologia di dette ampelopatie costituisce il punto di partenza per la lotta e il loro contenimento. Di particolare gravità è, tra tutte, l’incompatibilità di innesto che affligge interi cloni di vitigni da vino pregiati. Circa il punto (3) si sottolinea che le mappe proteomiche ottenute hanno aperto nuove vie per lo studio e la comprensione della fisiologia della vite, con evidenti ricadute vantaggiose sulle produzioni di vino di pregio e tipicità particolari.


I risultati conseguiti corrispondono a quelli attesi in tutti i campi e cioè: miglioramento diagnosi virale, salvaguardia di vitigni in estinzione, individuazione di nuovi cloni, controllo sanitario e verifica della produttività, biodiversità di popolazioni virali. Tre punti sono da citare per risultati superiori al previsto:(1)la definizione della variabilità molecolare dei geni delle proteine capsidiche dei virus A e B della vite (GVA e GVB), accertata su oltre 70 accessioni di diversa provenienza geografica; (2) i primi indizi ottenuti da studi sull’eziologia di gravi malattie della vite di ‘sospetta’ natura virale, in particolare: l’incompatibilità di innesto, il rachitismo cespuglioso, la picchiettatura del legno di V. rupestris, la necrosi delle nervature e la decolorazione fogliare di Roditis; (3) sviluppi nelle metodologie per l'ottenimento di mappe proteomiche per lo studio di fondamentali processi fisiologici nella vite. Interazioni biologiche e molecolari delle piante con virus e agenti patogeni virus-simili


I punti critici riguardano: (1) l’ulteriore taglio di finanziamento che l’ Istituto ha dovuto subire nel 2005 con ricadute dannose, ad esempio sulle missioni del personale per aggiornamenti scientifici, contatti diretti con colleghi dell’Istituto stesso e di altre istituzioni di ricerca, nazionali ed estere, riduzione drastica della partecipazione a congressi; (2) la mancata acquisizione di nuovo personale, con particolare riferimento a laureati che operano da anni in Istituto come ricercatori, in situazione di precariato.

Collaborazioni

Hanno riguardato: Virus e fitoplasmi della vite (Università di Milano, Udine, Bologna, Bari; CRA: Istituti di Viticoltura - Conegliano Veneto, di Patologia Vegetale - Roma; Regioni: Lombardia, Puglia, Piemonte, Liguria, Valle d'Aosta; Università USA di Oklahoma e Davis). Caratterizzazione e diagnosi(Università di Napoli, Torino, Catania; Florilab - PG, Phytolab; INRA-Equipe de Virologie - FR; CSIC-UPV-E; RWTH Plant Molecula Biology - D; Università di Leida-E; Università Stoccarda-D; Jhon Innes Center-UK). Selezione vite e fruttifere (CRS Basile Caramia - Locorotondo,Agric.Biotecn.Center -Ungheria). Diagnosi virologica su sementi e resistenza a virus (Ditta Olter-Asti; Nunhems-NL; Ortofrutticola di Albenga; ERSAT-Cagliari; Seminis Veg Seeds-USA; Eugen Seed).

361



Punto 1 (sopra):l’occasione è nata dal fatto che ad una ricercatrice dell’Istituto in attività - su invito - presso l’Università di Davis (Cal, USA) è stato offerto di prolungare il periodo di soggiorno per ulteriori sei mesi.Ciò ha consentito di avviare nuove ricerche su fitoplasma/insetto vettore utilizzando un nuovo binomio (BLTVA/ Neoaliturus tenellus) al fine di studiare i meccanismi molecolari del processo di trasmissione. L’iniziativa è stata accolta perché ben si abbina al filone di ricerche già in atto su questo tema, in collaborazione con l’ Oklahoma University, USA. Punto 2 (sopra):si è ritenuto opportuno e impellente dedicare il massimo impegno per allestire una procedura diagnostica rapida e affidabile per CTV in quanto questo virus - giudicato il patogeno più grave degli agrumi in assoluto e, più in generale, uno dei ‘top ten’ , i dieci virus più dannosi alle colture agrarie - è comparso in Italia ,come già in precedenti occasioni, ma questa volta ha iniziato a diffondersi in Calabria. Era necessario acquisire rapidamente un mezzo/procedimento diagnostico valido per controllare il materiale vivaistico ed iniziare la lotta al virus.


I risultati conseguiti corrispondono a quelli attesi in tutti i campi, e cioè relativamente a: protocolli diagnostici innovativi; replicazione e movimento dei virus nella pianta; trasmissione di virus con insetti e relative interazioni molecolari; meccanismi di patogenesi e di resistenza a virus in piante ingegnerizzate; risanamento di cultivar fruttifere pregiate. Due punti hanno aggiunto risultati che non erano in previsione: 1 - Il filone di ricerca sulle relazioni fitoplasma/insetto vettore interessanti il processo di trasmissione è stato ampliato con una collaborazione con la Università di Davis, Cal, USA. 2 - E' stato perfezionato un procedimento di diagnosi valido e affidabile per il virus della ‘Tristeza’ degli agrumi (CTV), di urgente necessità causa la pericolosità del virus che si sta diffondendo in Italia.

362


Commesse 2006:

Agenti patogeni intracellulari e miglioramento genetico e sanitario della vite

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MAURIZIO CONTI Elenco dei partecipanti liv. Boscia Donato II Campanale Antonia VII Carpignano Maria Teresa VIII Cerro Daniela VI D'Aquilio Mariangela IV De Stradis Angelo III Gribaudo Ivana III La Notte Pierfederico III Mannini Franco II

liv.Marzachi' Cristina III Masenga Bruna Teresa IV Minafra Angelantonio II Mottura Concetta VI Palmano Sabrina III Patano Giovanni VII Perrone Caterina VII Piccolini Elso IV

liv.Rocco Franca VI Saldarelli Pasquale III Schneider Anna III Stabile Maria V Turina Massimo III Vallania Rosalina II Veratti Flavio V Zanchetta Celestina VII

Temi

Tematiche di ricerca 1)Genomica e proteomica della vite; 2)Recupero e conservazione di germoplasma di vite; 3)Diagnosi di agenti virali e virus-simili; 4) Eziologia e caratterizzazione di malattie virus-simili della vite; 5) Effetti delle infezioni virali su fisiologia e attitudini colturali della pianta, ricadute sulla qualità del vino; 6)Miglioramento genetico e sanitario tramite selezione clonale di cultivar ad uva da vino e ad uva da tavola; 7)Reinfezione da nepo e ampelovirus in pieno campo; 8) Trasformazione genetica di vite ai fini della resistenza a patogeni.

Stato dell'arte La superficie coltivata a vite (~700.000 ha) e l'entità della produzione enologica (~70.000.000 hl) e di uva da tavola (~15.000.000 q) sottolineano il ruolo trainante del settore vitivinicolo per l'economia nazionale. Più di altre specie coltivate, la vite è suscettibile a infezioni da virus e fitoplasmi che ne minacciano gravemente la coltivazione. Ciò impone lo studio approfondito dei patogeni, collegato alle attività di selezione clonale e sanitaria e più in generale al miglioramento genetico. Per quanto riguarda le fitoplasmosi, anche i protocolli diagnostici subiscono continui aggiornamenti. Per l’elevatissimo numero di cultivar di vite presenti, cui si associano spesso problemi di denominazione e d’identificazione, è fondamentale la caratterizzazione molecolare e lo sviluppo di sistemi per l’identificazione di genotipi anche ai fini di un’eventuale certificazione vivaistica. L’identificazione e l’utilizzo della variabilità genetica intravarietale a fini produttivi non può prescindere però dalle sue interazioni con l’ambiente di coltivazione che devono essere indagate a fondo.

363


Azioni

Attività da svolgere Reperimento,identificazione,risanamento,conservazione e valorizzazione di risorse genetiche della vite; caratterizzazione genetica di popolazioni selvatiche e coltivate; gestione di collezioni in vivo e in vitro di germoplasma e sotto screen-house di cloni omologati; mappe proteomiche per lo studio di processi fisiologici;diagnostica sierologica e molecolare avanzata; studio dell’interazione vite-virus; studio dell’interazione biotipo-ambiente di coltura; selezione genetica e sanitaria di germoplasma; affinamento tecniche di risanamento e studio di metodiche alternative;interventi di ottimizzazione della tecnica vivaistica per produzione in sanità di materiale di moltiplicazione; studio di modalità e tempi di reinfezione da nepo e ampelovirus in pieno campo;trasferimento di geni di resistenza a stress biotici e studio di sistemi marker-free; costruzione di parziale library genomica di FD; caratterizzazione di isolati di FD e LN su vite e specie spontanee; saggi biologici per la caratterizzazione di Nanismo cespuglioso, incompatibilità d’innesto, Rupestris stem pitting; sequenziamento e analisi filogenetica di isolati di GLRaV-2 e GRSPaV

Punti critici e azioni da svolgere 1)Essendo la vite coltura poliennale sono necessari più anni di attività per conseguire obiettivi quali risanamento di cloni, selezione sanitaria e clonale, studio degli effetti di infezioni virali e delle condizioni ambientali di coltura sulla produzione enologica; 2) costi elevati per l’istituzione e la gestione di campi collezione e sperimentali e di serre, celle climatiche e screen-houses; 3) difficoltà nello sviluppo di metodi molecolari per l’identificazione di variabilità intravarietale su vite; 4) difficoltà nell’applicare alla vite tecniche di trasferimento genico messe a punto su specie modello. Per il completo svolgimento del programma previsto e il superamento, per quanto possibile, dei punti critici sopra citati si richiede la conferma delle unità di personale non di ruolo già in attività(assegnisti,ecc.), il passaggio di una unità di personale amministrativo dal tempo determinato ad indeterminato,l'assegnazione di 1 posto di ricercatore di ruolo a tempo indeterminato e di una unità di personale non di ruolo (borsista). La strumentazione per l’attività di diagnosi e caratterizzazione molecolare andrà potenziata così come la spesa per materiale di consumo

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze in viticoltura, enologia, virologia, genetica vegetale, biologia molecolare, sierologia. Tecnologie e tecniche di indagine: diagnosi biologica, sierologica e molecolare; analisi di acidi nucleici e di proteine; analisi di base di mosti e vini; analisi cromatografiche; colture in vitro; tecniche di risanamento; tecniche di trasferimento genico; ampelografia e ampelometria; microscopia elettronica; epidemiologia.

Collaborazioni (partner e committenti) Università ed altri istituzioni pubbliche e private di ricerca nazionali e straniere (altri Paesi membri UE; AUS; USA); Amministrazioni delle Regioni, delle Province e dei Comuni Italiani; Servizi fitosanitari regionali; Ministero Politiche Agricole e Forestali, Associazioni di viticoltori e Consorzi di tutela; ACOVIT (Ass. Costitutori Viticoli Italiani); Ditte vivaistiche; Piccole e medie imprese del settore vitivinicolo.

Finalità

Obiettivi 1) salvaguardia e caratterizzazione genetica della biodiversità viticola; 2) perfezionamento diagnosi sierologiche e molecolari; 3) selezione ed omologazione di cloni di cultivar ad uva da vino e da tavola e loro inserimento nel Registro Nazionale; 4) conservazione di fonti primarie di cloni selezionati e produzione dei “materiali iniziali” da destinare alla vivaistica (premoltiplicazione); 5) valutazione

364


degli effetti delle infezioni virali sulla produzione e sulla qualità dei prodotti di trasformazione; 6) risanamento da virus di cloni da destinare alla selezione di cultivar di interesse economico; 7) messa a punto di nuove tecniche per l’eliminazione di virus e fitoplasmi dal materiale di propagazione viticolo; 8) induzione di resistenza alle infezioni mediante ingegneria genetica; 9) caratterizzazione e identificazione degli agenti causali di malattie virus-simili.

Risultati attesi nell'anno Omologazione ed iscrizione nel Registro Nazionale di cloni di cultivar ad uva da vino e da tavola; mantenimento e implementazione di collezioni di germoplasma e di fonti primarie dei cloni IVV; materiali iniziali di cloni selezionati per la vivaistica; risanamento da virus di materiale infetto; informazioni sugli effetti del risanamento sui caratteri attitudinali delle piante e riflessi economici; tecniche di termoterapia per prevenire la diffusione di malattie da fitoplasmi; informazioni su stabilità ambientale dei caratteri di biotipi selezionati; sistema di diagnosi virale multipla tramite PCR; reperimento, conservazione e caratterizzazione di vite selvatica e di cultivar autoctone minori; piante trasformate e informazioni sull’efficacia di sistemi marker-free; kit per diagnosi di fitoplasmi (real time e RT-PCR); espressione di antigeni di fusione per FD; definizione agente causale dell’incompatibilità d’innesto e determinazione scala di suscettibilità/tolleranza di vari portinnesti; identificazione di accessione di V. rupestris sana; acquisizione di dati sulla caratterizzazione del nanismo cespuglioso. Pubblicazioni. Organizzazione Convegno

Potenziale impiego - per processi produttivi Disponibilità di materiale vivaistico di elevata qualità genetica ed esente da malattie virali e virus-simili; identificazione e corretta denominazione dei vitigni; tecniche idonee alla produzione di materiale di moltiplicazione esente da virus e fitoplasmi; ricadute su protocolli di selezione e certificazione adottati a livello nazionale; biotipi di vite con geni di resistenza a gravi malattie virali

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Salvaguardia e caratterizzazione di biodiversità, anche in funzione dell’individuazione di eventuali resistenze e di una riduzione nell’uso di fitofarmaci in viticoltura; razionalizzazione e ottimizzazione dei metodi di controllo e prevenzione di virosi e fitoplasmosi con conseguente riduzione dei danni ad esse correlate; maggiori conoscenze sui virus e sui loro effetti per permettere adeguamento delle tecniche di coltivazione e di produzione

Moduli

Modulo: Agenti patogeni intracellulari e miglioramento genetico e sanitario della vite Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9564 195 224 0 983 15 434 80 N.D. 1078


365








Altro Totale

6 1 2 4 0 0 0 0 10 23



Interazioni biologiche e molecolari delle piante con virus e agenti patogeni virus-simili

Dati generali Progetto: Sviluppo di biotecnologie avanzate per il sistema agroalimentare Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: MAURIZIO CONTI Elenco dei partecipanti liv. Accotto Gian Paolo II Antonacci Antonia VI Barbarossa Loredana III Boscia Donato II Caciagli Piero II Campanale Antonia VII Carpignano Maria Teresa VIII Cerro Daniela VI Cillo Fabrizio III Cinquanta Sergio Mario IV D'Agostino Giovanni IV D'Aquilio Mariangela IV De Stradis Angelo III Di Serio Francesco III

liv.Faoro Franco III La Notte Pierfederico III Lenzi Riccardo V Longoni Cesare Enea IV Marian Daniele VI Marzachi' Cristina III Masenga Bruna Teresa IV Masenga Vera III Minafra Angelantonio II Mottura Concetta VI Noris Emanuela III Palmano Sabrina III Pantaleo Vitantonio III Patano Giovanni VII

liv.Perrone Caterina VII Piccolini Elso IV Rocco Franca VI Rubino Luisa II Russo Marcello I Saldarelli Pasquale III Saponari Maria III Stabile Maria V Stavolone Livia III Turina Massimo III Vaira Anna Maria III Vecchiati Manuela IV Veratti Flavio V

Temi

Tematiche di ricerca Caratterizzazione di virus e viroidi e messa a punto di sistemi diagnostici avanzati. Interazioni pianta/patogeno in riferimento ai processi di infezione, patogenesi e risposte di difesa dell'ospite; siti intracellulari, meccanismi di replicazione e movimento di virus e viroidi; silenziamento genico post-trascrizionale in sistemi virus o viroide/pianta. Interazioni molecolari insetto-vettore-patogeno. Espressione in pianta di proteine eterologhe mediante vettori virali e sistemi transienti.

Stato dell'arte

366


Importanti fitopatie sono dovute a virus,viroidi e fitoplasmi. Le conoscenze attuali della genetica molecolare permettono di assegnare ai diversi geni dei patogeni un ruolo specifico nella replicazione e nella patogenesi e hanno fornito dati utili sul funzionamento normale delle cellule.La caratterizzazione dei patogeni, la conoscenza della patogenesi e dei meccanismi molecolari alla base dei rapporti ospite/patogeno/vettore hanno portato allo sviluppo di adeguati mezzi diagnostici e di lotta.

Azioni

Attività da svolgere Clonaggio molecolare e sequenziamento dei genomi dei nuovi patogeni; identificazione dei domini strutturali dei genomi coinvolti nella patogenesi mediante l’uso di mutanti ottenuti in laboratorio; identificazione dei geni dell’ospite e degli organelli cellulari coinvolti nella patogenesi e nel silenziamento posttrascrizionale; valutazione di protocolli diagnostici; valutazione della biodiversità e della dinamica delle popolazioni di patogeni e loro vettori; risanamento di cultivars pregiate.

Punti critici e azioni da svolgere Punti critici: acquisizione e sviluppo di nuove metodologie di laboratorio più sofisticate ed innovative. Elevati costi di manutenzione del complesso serre e manodopera avventizia. Condizioni di fattibilità: il patrimonio delle conoscenze scientifiche e strumentazione dell'Istituto andrà potenziato con riferimento ai settori della genomica, post-genomica e proteomica e all'analisi dell'espressione genica (es. Micro-array)

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Virologia vegetale, tassonomia, biologia molecolare, biochimica, genetica vegetale, epidemiologia, diagnostica, entomologia. Analisi di acidi nucleici e proteine, microscopia elettronica e ottica, immunofluorescenza, immunocitochimica, sierologia, bioinformatica e biostatistica, ingegneria genetica, colture cellulari in vitro, allevamento di insetti vettori in condizioni di isolamento.

Collaborazioni (partner e committenti) Università ed altri istituzioni private e pubbliche di ricerca nazionali ed estere (altri Paesi membri UE; UK; USA); Amministrazioni delle Regioni e delle Province italiane; Comunità montane; Servizi fitosanitari regionali; Fondazioni aventi fini di promozione della ricerca scientifica; Piccole e Medie industrie del settore agroalimentare.

Finalità

Obiettivi Caratterizzazione biologica e molecolare dei patogeni; preparazione di protocolli e kit diagnostici; identificazione dei meccanismi di interazione di virus e viroidi e/o i loro prodotti con le cellule ospiti; identificazione dell'interazione patogeno-pianta ospite-insetto vettore; definizione del ruolo del silenziamento genico nella patogenesi di virus e viroidi; definizione dei fattori epidemiologici importanti per la prevenzione.

Risultati attesi nell'anno Protocolli diagnostici innovativi e di migliorata sensibilità. Identificazione dei meccanismi di replicazione e movimento di virus e viroidi nella pianta. Dati su processi di trasmissione di virus e fitoplasmi con insetti vettori e su meccanismi di patogenesi virale e viroidale. Selezioni risanate di cultivar pregiate di specie fruttifere. Dati su biodiversità di popolazioni virali. Innovativi metodi di prevenzione e lotta ecocompatibile. Pubblicazioni scientifiche.

367


Potenziale impiego - per processi produttivi Messa a punto di metodi diagnostici rapidi ed efficaci; controllo fitosanitario e certificazione del materiale di propagazione; identificazione e caratterizzazione di nuove fitopatie; messa a punto di strategie antivirali; aumento della produttività agricola.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Aumento delle conoscenze sulla biologia molecolare e cellulare; disponibilità di cloni virali infettivi e di cloni di geni specifici. Ceppi mutanti di lieviti. Pubblicazioni scientifiche.

Moduli

Modulo: Interazioni biologiche e molecolari delle piante con virus e agenti patogeni virus-simili

Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9906 496 8 0 1410 75 579 148 N.D. 1633








6 4 1 4 0 0 0 0 4 19



368


Resistenze convenzionali e non-convenzionali a importanti virosi e fitoplasmosi di specie coltivate

Dati generali Progetto: Sviluppo sostenibile del sistema agroindustriale Tipologia di ricerca: Progetti relativi a linee tematiche a carattere strategico Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Sede principale svolgimento: Sede principale Istituto Dip. di prevista afferenza: Agroalimentare Responsabile indicato: GIAN PAOLO ACCOTTO Elenco dei partecipanti liv. Accotto Gian Paolo II Carpignano Maria Teresa VIII Cerro Daniela VI Cillo Fabrizio III Conti Maurizio I D'Agostino Giovanni IV D'Aquilio Mariangela IV Lenzi Riccardo V Marzachi' Cristina III

liv.Masenga Bruna Teresa IV Masenga Vera III Minafra Angelantonio II Mottura Concetta VI Noris Emanuela III Palmano Sabrina III Pantaleo Vitantonio III Patano Giovanni VII Piccolini Elso IV

liv.Rocco Franca VI Rubino Luisa II Saldarelli Pasquale III Stabile Maria V Turina Massimo III Vaira Anna Maria III Vecchiati Manuela IV Veratti Flavio V

Temi

Tematiche di ricerca le ricerche saranno sviluppate intorno alle seguenti tematiche: a) resistenza non-convenzionale: Analisi dei meccanismi della resistenza a TSWV rilevata in linee di pomodoro trasformate con il gene virale N. Analisi della resistenza a TYLCSV in linee di pomodoro e N. benthamiana esprimenti versioni modificate delle proteine Rep e CP. Sviluppo di piante transgeniche esprimenti anticorpi (single chain Fragment variable) specifici per GLRaV-3, virus associato all’accartocciamento fogliare della vite valutazione della dinamica di popolazioni dei virus GVA e GVB in piante transgeniche di vite che esprimono le rispettive proteine del capside. trasformazione di peperone con il gene Sw-5 per resistenza a TSWV b) resistenza convenzionale: c) studio delle alterazioni dell’espressione genica a seguito di infezioni. I sistemi sperimentali da utilizzare saranno per i virus la combinazione pomodoro/TYLCSV e per i fitoplasmi quella crisantemo/fitoplasma CY, anche in presenza di infezione indotta dagli insetti vettori naturali

Stato dell'arte Numerosi virus e fitoplasmi colpiscono colture di forte importanza per l’Italia, quali ortive e vite. Le resistenze possono essere ottenute in modo convenzionale (introgressione di geni da specie selvatiche) o non- convenzionale (biotecnologico). L’utilizzo di tecniche convenzionali è limitato dalla scarsa disponibilità di geni utilizzabili e dalla rapida evoluzione dei patogeni (sviluppo di ceppi RB, “resistance breaking”) Parallelamente all’introduzione di resistenze con i due approcci sopra menzionati, la ricerca scientifica è impegnata fortemente nella comprensione degli eventi molecolari che, nel momento del contatto tra pianta e microrganismi, determinano instaurarsi di relazioni parassitiche o simbiontiche. L’avvento negli anni più recenti delle nuove tecnologie per l’analisi di espressione genica, quali cDNA-AFLP, SAGE, MSAP, microarrays, ecc. sta fornendo un forte impulso allo studio delle interazioni pianta-patogeno, aprendo grandi opportunità riguardo alla comprensione dei fenomeni di risposta della pianta sottoposta a stress biotico e fornendo informazioni sui geni e sulle vie metaboliche coinvolte nell’interazione.

369


Azioni

Attività da svolgere Resistenze convenzionali: utilizzo di ceppi RB per ricerca di nuove fonti di resistenza naturali in specie selvatiche dei generi Capsicum e Lycopersicon. Sperimentazione dell’utilizzo del gene Sw5 nella trasformazione del peperone. Resistenze non-convenzionali: TYLCSV: espressione di una proteina capsidica difettiva e saggi di resistenza; b) espressione di versioni variamente modificate della proteina virale T-Rep, e ricerca dei domini proteici responsabili della localizzazione subcellulare e resistenza. TSWV: studio dei meccanismi di resistenza in linee GM; ricerca di siRNA coinvolti in PTGS; valutazione della resistenza ad altre specie di tospovirus. Caratterizzazione di una scFv specifica per la CP di GLRaV-3, sua espressione transiente e stabile in piante, e saggi di inoculazione mediante innesto. Inoculazione con GVA e GVB di piante esprimenti le CP dei due virus e analisi delle popolazioni virali per ricerca di eventuali virus chimerici. Fitoplasmi: Identificazione di geni fitoplasmali coinvolti nelle relazioni con la pianta e l’insetto vettore nei sistemi BLTVA e CY. Ricerca di recettori fitoplasma-specifici sulle membrana cellulare del vettore nel modello CY/Macrosteles qu

Punti critici e azioni da svolgere I possibili punti critici: Stabilità genetica delle resistenze ottenute. Comparsa di isolati virali che superano le resistenze. Accettabilità di varietà ottenute mediante introduzione di nuovi geni con trasformazione genetica.Difficoltà nell'isolamento di DNA purificato di fitoplasma per la costruzione della library; titolo, specificità e sensibilità degli anticorpi prodotti; Condizioni di fattibilità: per il completo svolgimento del programma previsto sono necessari fondi per la manutenzione delle attrezzature già presenti in Istituto, per il rinnovamento della strumentazione scientifica, e fondi di mobilità per mantenere gli indispensabili contatti internazionali.

Competenze, tecnologie e tecniche di indagine Competenze in virologia, biologia molecolare, allevamento piante, saggi di infettività, sierologia, biochimica, entomologia, bioinformatica e ingegneria genetica. Tecnologie e tecniche di indagine: clonaggio e analisi dell’organizzazione genomica, tecniche di mantenimento colonie di vettori, esperimenti di trasmissione, tecniche di nutrizione su substrati artificiali, microdissezioni di insetti, microiniezioni, microscopia ottica, estrazione di acidi nucleici, amplificazione mediante PCR standard e real time e reverse transcriptase-PCR, ibridazioni molecolari, elettroforesi di acidi nucleici e proteine, produzione di anticorpi policlonali, analisi di sequenze e utilizzo di software bioinformatici

Collaborazioni (partner e committenti) Dip. Biologia Vegetale - Università di Torino; Università di Bari; Istituto di genetica vegetale del CNR – Sezione di Palermo; Università di Catania; Università Insubria (Varese); Università di Udine; Università di Milano; Università di Bologna; Università di Firenze; ENEA-Casaccia; CRA- Orticoltura (Montanaso Lombardo); CRA-Patologia Vegetale; Università di Stuttgart, Germania; INRA-Bordeaux e Dijon; Rheinisch- Westfaelische Technische Hochschule Aachen – Germania; Staatliche Lehr-und Forschungsanstalt Weinbau und Gartenbau – Germania; Viveiros Jorge Boehem (Plansel) Lda Montemor o Novo – Portogallo; INRA-Bordeaux e Dijon; Unitè mixte de Recherche Universitè L. Pasteur/INRA Vigne et vins d’Alsace, Colmar, Francia; IBMP- CNRS Strasbourg, Francia; BBLF Institut fur Pflanzenschutz im Obstbau;Dossenheim, Germania; IVIA, Department of Virology, Valencia , Spagna; NIB Department of Plant Physiology and Biotechnology; Ljubljana, Slovenia;UCDavis California USA; Oklahoma State University; CRAS-Sardegna; Società sementiere; Servizi fitosanitari regionali;Fondazioni con fini di promozione della ricerca scientifica.

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Finalità

Obiettivi a) resistenza non-convenzionale: Comprensione dei meccanismi della resistenza a TSWV e TYLCSV in pomodoro geneticamente modificato mediante inserzione di geni virali modificati Sviluppo di piante transgeniche esprimenti anticorpi (single chain Fragment variable) specifici per GLRaV-3, virus associato all’accartocciamento fogliare della vite Comprensione della dinamica di popolazioni dei virus GVA e GVB in piante transgeniche di vite che esprimono le rispettive proteine del capside. Sviluppo di linee di peperone trasformate con il gene Sw-5 per resistenza a TSWV b) resistenza convenzionale: identificazione di di genotipi selvatici di pomodoro e peperone con caratteristiche di resistenza a TSWV. valutazione del livello di suscettibilità/tolleranza all’infezione naturale da TYLCV/TYLCSV in cv di pomodoro.

Risultati attesi nell'anno Linee di pomodoro resistenti a TYLCSV e/o TYLCV. Linee di pomodoro resistenti a TSWV ed altri tospovirus. Selezione e caratterizzazione di una scFv a GLRaV-3, produzione di piante transgeniche di N. benthamiana esprimenti la scFv ed inoculazione di piante transgeniche di N. benthamiana con vettori PVX ingegnerizzati. Inoculazione di piante transgeniche di vite con GVA e GVB, analisi della dinamica di popolazioni virali ed eventuale genesi di virus ricombinanti. Identificazione di nuovi geni di resistenza, o resistenza di tipo orizzontale; Identificazione di geni della pianta coinvolti nella risposta all'infezione virale. Definizione dei tempi di acquisizione e latenza nella trasmissione di CY per diverse specie; library parzialmente annotata e studi di bioinformatica per la produzione di primers, sonde ed antigeni di fusione; quantificazione di fitoplasmi in diversi ospiti; produzione di antigeni di fusione, sieri mono e policlonali, nuovi primers e sonde per la diagnosi specifica. Pubblicazioni scientifiche.

Potenziale impiego - per processi produttivi l’ottenimento di varietà vegetali con caratteri di resistenza è un risultato di interesse per i costitutori di nuove varietà e per società sementiere. Una strategia innovativa può essere oggetto di brevetto o altra forma di protezione. Le informazioni relative all’espressione genica durante l’infezione possono essere sviluppate successivamente in nuove strategie di controllo di virus e fitoplasmi, quali alternative alla rimozione delle piante infette ed all’utilizzo intensivo di insetticidi per il controllo dei vettori. Gli studi sulla replicazione di virus in piante transgeniche forniranno informazioni utili alla valutazione del rischio ambientale e per un eventuale futuro impiego regolamentato di piante transgeniche per la resistenza a virosi.

- per risposte a bisogni individuali e collettivi Per gli operatori del settore agricolo le varietà resistenti sono di notevole interesse, anche perchè permettono di ridurre notevolmente i trattamenti insetticidi contro i vettori di virus e fitoplasmi. Anche per la collettività e l’ambiente la diminuzione dei trattamenti ha una evidente utilità, riducendo l’inquinamento ambientale. Lo studio si inserisce in un filone di ricerca attuale che riguarda valutazione del rischio ambientale (vantaggi e rischi) nell’impiego di organismi geneticamente modificati in agricoltura. Pertanto, risponde pienamente al bisogno di dati sulla sicurezza e di innovazione tecnologica in agricoltura.

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Moduli

Modulo: Resistenze convenzionali e non-convenzionali a importanti virosi e fitoplasmosi di specie coltivate

Istituto esecutore: Istituto di virologia vegetale Luogo di svolgimento attività: Sede principale Istituto


Pers. tempo ind/det

Funz. +

Invest.

Spese da

Fonti Esterne



Totale Risorse da

esercizi precedenti

Massa Spendibile

Costi figurativi

Spese generali

accentrate

Valore Effettivo

1 2 3 4 5=1+2+3+4 6 7=2+3+6 8 9 10=5+6+8+9428 562 72 0 1062 0 634 118 N.D. 1180








Altro Totale




372



FRANCESCO DI SERIO Localizzazione intracellulare e replicazione di RNA viroidali nel sistema eterologo lievito

ANNA MARIA VAIRA L'impatto degli Ophiovirus, trasmessi da funghi del suolo, in una floricoltura sostenibile

MASSIMO TURINA Costituzione di un sistema per lo studio dei determinati per il superamento della resistenza di Tomato spotted wilt virus (Tospovirus, Bunyaviridae) che si basi su un approccio a genetica inversa.

CRISTINA MARZACHI' Analisi comparativa delle popolazioni del fitoplasma chrysanthemum yellows (CY) ottenute per innesto e per trasmissione mediante insetto vettore

GIANPAOLO ACCOTTO Resistenze non-convenzionali a due importanti virosi del pomodoro

EMANUELA NORIS Biotecnologie Vegetali per la Salute Umana

FABRIZIO CILLO Diagnostica avanzata e genomica dell?interazione virus-ospite

FRANCO FAORO Induzione di resistenza a virus, fitoplasmi e loro insetti vettori mediante sostanze naturali

373


Scheda di autovalutazione (attività 2005) Elementi di autovalutazione L’Istituto svolge ricerca nel campo della virologia vegetale ed orienta la propria attività seguendo l’evoluzione di questa disciplina che è andata sempre più estendendo i propri interessi anche ai cosiddetti ‘agenti fitopatogeni virus-simili’ (viroidi e fitoplasmi) ed è confluita con la virologia medica in ricerche quali, ad esempio, la produzione in planta di vaccini contro virus dell’uomo. Parte dell’attività dell’Istituto è dedicata in particolare alla Vite per la quale sono studiati gli effetti delle infezioni da virus e da agenti virus-simili sui vitigni e sulla qualità del vino prodotto e si svolgono ricerche su biodiversità, selezione clonale e salvaguardia di germoplasma. I principali parametri presi in considerazione per l’autovalutazione sono stati i seguenti: risultati delle ricerche; qualità delle pubblicazioni scientifiche, delle comunicazioni a congressi e dei capitoli di libri nazionali e internazionali; brevetti; numero e qualità delle collaborazioni scientifiche; incarichi redazionali o come revisori di articoli per conto di Riviste scientifiche; partecipazione all’organizzazione di congressi, seminari, ecc.; attività didattica universitaria, e divulgativa; partecipazione a Commissioni concorsuali, di esame, di tesi di Laurea; attività di formazione svolta nell’Istituto a favore di laureandi, dottorandi, borsisti, assegnisti e stagisti; incarichi come ‘tutors’ di tesi di laurea svolte interamente nell’Istituto; richieste di visite all’Istituto e qualificazione scientifica dei visitatori; richieste di estratti delle pubblicazioni dell’Istituto; richieste di consulenza scientifica e tecnica in campo fitovirologico. Tra tutti gli elementi di valutazione su elencati il maggior valore è stato attribuito ai risultati delle ricerche e di questi sono citati qui di seguito i più rilevanti, non necessariamente in ordine di importanza: - Lo studio della replicazione di molecole subvirali di Tombusvirus in pianta e nel lievito Saccharomyces cerevisiae ha consentito di localizzare intracellularmente i componenti del complesso replicativi del virus della maculatura anulare del Cymbidium (CymRSV) e dell’elica del suo RNA che si genera sui perossisomi. - Si è chiarito a livello molecolare il meccanismo all’origine del ‘calico’ (maculatura fogliare bianca) del pesco accertando che è indotto da varianti atipiche del viroide agente eziologico. - E’ stato scoperto un nuovo fattore coinvolto nel trasporto intercellulare del virus del mosaico del cavolfiore (CfMV). Si tratta di una proteina associata al virione che agisce come ‘ponte’ (legame coiled-coil) tra questo e la proteina di movimento. - Un nuovo metodo diagnostico per il virus della ‘Tristeza’ degli agrumi (CTV) è stato messo a punto migliorandone il rilevamento. - Si è dimostrato che la proteina 10k (ORF5) del virus A della vite (GVA) svolge attività di soppressione del silenziamento del RNA e determinante dei sintomi. - Il sequenziamento della ‘library’ gnomica del virus del nanismo ruvido del mais (MRDV) è proseguito, coprendo le fallanze ancora presenti nei vari cloni. - Tre nuovi potyvirus ed una macluravirus del ranuncolo rinvenuti in Liguria sono stati identificati e caratterizzati a livello molecolare. - Gli studi sulle relazioni di un begomovirus ed un ipomoviurs con l’aleurodide vettore sono proseguiti. - Ceppi del virus della bronzatura del pomodoro (TSWV) resistance breaking , in grado di infettare peperoni resistenti grazie al gene Tsw sono stati caratterizzati individuando il gene che induce il superamento della resistenza (quello codificante la proteina NSs). - E’ proseguita la caratterizzazione delle proteine MAPKK di Cryphonectria parasitica anche mediante silenziamento genico post-trascrizionale. - La caratterizzazione biologico-molecolare del virus del disseccamento del mirtillo (BlScV), nuovo per l’Europa è stata perfezionata. - Gli studi molecolari sulla trasmissione con cicaline di un fitoplasma americano agente di virescenza (BLTVA) hanno originato l’ipotesi di un coinvolgimento di diversi geni nelle relazioni del patogeno con pianta ospite e insetto vettore. - Si sono raccolti nuovi dati di rilevante interesse su aspetti citopatologici delle infezioni virali e viroidali in quattro specie vegetali (mais, fico, vite e pesco). - E’ stata accertata la diversa efficienza vettrice di due specie di cicaline per il fitoplasma agente del giallume del crisantemo (CY). - Sono stati caratterizzati a livello molecolare diversi isolati del fitoplasma agente del Legno nero della vite (Bois noir) provenienti da diverse Regioni italiane, riscontrando differenze che rivelano l’esistenza di diversi ‘patotipi’ o ceppi. - Sono stati isolati anticorpi ricombinanti (scFv) alle proteine del capside diel virus B della vite (GVB) e

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del virus-3 associato all’accartocciamento fogliare della vite (GLRaV-3). Quest’ultima scFv è stat espressa in Nicotina benthamiana per valutarne la funzionalità. - La variabilità molecolare dei geni delle CP dei virus A e B della vite (GVA e GVB) è stata studiata in settanta accessioni di varia provenienza geografica, a singola o doppia (mista) infezione, mediante RT-PCR e sequenziamento di cloni. La distanza genetica delle varianti studiate è risultata di livello ricadente nella media dei virus con menoma a RNA. - Interessanti risultati preliminari (non divulgabili) sono stati ottenuti nello studio di nuove e importanti ampelopatie virus-simili, quali: Rupestris stem-pitting, Graft incompatibility, Grapevine bushy stunt, Roditis leaf discoloration e Grapevine vein necrosis. - I rilievi viticoli e tecnologici relativi a 28 candidati cloni di vitigni ad uva da tavola (14 cultivar) e a 26 ad uva da vino ( 9 cv) sono stati completati. Un brevetto per un “Metodo per la preparazione di piante transgeniche” resistenti al virus dell’arricciamento apicale del pomodoro (TYLCV), in collaborazione con l’ENEA-CRC, è stato realizzato in Italia ed è in corso di ufficializzazione in diversi Paesi in via di sviluppo. Le pubblicazioni prodotte dall’Istituto hanno mantenuto mediamente un livello scientificamente elevato, anche i risultati applicati delle ricerche sono stati soddisfacenti, come la produzione di nuovi kit diagnostici e di nuovi protocolli per diagnosi. L’attività didattica universitaria ha coinvolto una decina di ricercatori di tutte le componenti territoriali dell’Istituto, cinque dei quali come titolari ufficiali di Corsi di insegnamento universitari. L’attività svolta sia nelle redazioni che come ‘referees’ per conto di Riviste scientifiche nazionali e internazionali (Informatore Fitopatologico, J. Plant Pathology, European J. Plant Pathology, Plant Diseases, ecc.) è stata consistente. Altrettanto dicasi di quella dedita alla formazione di giovani ricercatori e studiosi della virologia vegetale, con la produzione di cinque tesi di laurea svolte interamente presso le varie sedi dell’Istituto, con il coordinamento scientifico dei nostri ricercatori. Nel 2005 l’Istituto ha anche contribuito all’organizzazione di diversi convegni scientifici collaborando, in particolare, con il Dipartimento per la Protezione delle piante e Microbiologia dell’Università a Bari, e con la Fondazione per le Biotecnologie a Torino.

Proposta di interventi organizzativi L’Istituto di Virologia vegetale (IVV) consta attualmente di quattro componenti: - La sede di Direzione e Amministrazione, a Torino (8 ricercatori, 9 tecnici, 5 amministrativi); - Una ex-Sezione presso il Dipartimento per la Protezione delle Piante e Microbiologia della Facoltà di Agraria dell’Università di Bari (13 ricercatori, 2 tecnici, 1 amministrativo e 6 associati universitari), a Bari; - Una ex-Sezione presso l’Istituto di Patologia Vegetale dell’Università di Milano (1 ricercatore, 2 tecnici e 2 associati universitari), a Milano; - Una Unità Staccata (ex Centro di Studio per il Miglioramento genetico e la Biologia della Vite) presso la Facoltà di Agraria dell’Università di Torino, a Grugliasco, Torino (4 ricercatori, 1 amministrativo e 3 associati universitari). L’oggettiva distanza tra le diverse sedi geografiche è stata di ostacolo alla diretta collaborazione tra dipendenti che operano in località distinte, tuttavia tentativi di avviare ricerche in collaborazione a distanza sono stati avviati dai ricercatori con maggior iniziativa, e in qualche caso hanno anche fruttato pubblicazioni congiunte di ottimo livello scientifico (v. elenco pubblicazioni). Alla luce di quanto sopra, una prima azione migliorativa dell’organizzazione interna dell’attività di ricerca consisterebbe nella disponibilità di fondi più consistenti mirati specificamente a garantire una maggior mobilità dei dipendenti tra le varie sedi dell’Istituto e, in particolare, almeno un paio di riunioni plenarie dell’Istituto all’anno. L’esigenza di ciò è fortemente sentita dalla grande maggioranza del personale ed è stata esplicitata apertamente a questa Direzione in più occasioni. La progressiva riduzione numerica del personale di ruolo, negli ultimi anni, ha fatto sì che nella sede di Torino dell’Istituto si siano liberati alcuni locali corrispondenti, nel complesso, all’intero piano seminterrato (che beneficia di deroga per l’abitabilità ed ospita alcuni studi e laboratori). Si ritiene che sarebbe vantaggioso destinare alcuni locali agli usi seguenti: 1) Uno studio per i ricercatori appartenenti all’US di Grugliasco che già utilizzano una piccola parte delle serre in dotazione alla sede di Torino dove molto di rado sono presenti. Ciò potrebbe, da un lato consentire loro di utilizzare le apparecchiature in loco più agevolmente, dall’altro facilitare una collaborazione più fattiva su tematiche prettamente fitovirologiche quali, ad esempio, gli studi epidemiologici sulla Flavescenza dorata della vite (FD) o il controllo sanitario dei presunti cloni di vitigni (che originariamente era già svolto in questa sede ed è stato da poco trasferito presso l’US di Grugliasco).

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2) Un locale “di appoggio” da destinare ai dipendenti del Servizio Fitosanitario della Regione Piemonte, istituzione che collabora strettamente con questo Istituto per diverse attività, quali: il monitoraggio delle infezioni da fitoplasmi della vite in Piemonte (i campioni sono prelevati dal Servizio e portati all’Istituto ove si eseguono le diagnosi ogni anno, da giugno a settembre, per centinaia di piante); lo studio di un nuovo virus del mirtillo (BlScV) da poco introdotto in Europa ed alquanto dannoso per questa specie; indagini su nuove malattie da virus e fitoplasmi ad alto impatto economico. Creare in Istituto un punto fisso di riferimento per gli ispettori del Servizio Fitosanitario regionale consentirebbe di conferire maggiore visibilità ai legami con la Regione, in particolare conl’Assessorato all’Agricoltura, e di formarne il personale all’uso di apparecchiature e metodologie diagnostiche, cosa che aprirebbe anche la possibilità di fruire del loro supporto nei periodi di eventuale necessità. In Torino, l’Istituto annovera tra i suoi più attivit collaboratori alcuni docenti e ricercatori del DIVAPRA-Entomologia dell’Università di Torino, coinvolti nelle ricerche su insetti vettori di virus e di fitoplasmi. Il Comitato di Istituto ha espresso parere favorevole alla loro ‘associatura’ e le proposte per tre di essi (Prof. Alberto Alma, Dr. Domenico Bosco e Dr.ssa Luciana Tavella) sono state inoltrate al CNR ma respinte perché formulate secondo i ‘vecchi’ Regolamenti mentre non ancora operativi sono i nuovi. Sarebbe opportuno che tali associature fossero rese possibili dal CNR per ufficializzare e regolarizzare una annosa situazione di fatto. Altri stretti rapporti di collaborazione sussistono con una ex-Sezione dell’ attuale Istituto per la Protezione delle Piante (IPP) del CNR, già Centro di Studio per la Micologia del Terreno del CNR – ubicata presso il Dipartimento di Biologia vegetale dell’Università di Torino - diretta dalla Prof. Paola Bonfante. Tali rapporti includono: l’associatura di uno dei ricercatori di questo Istituto al citato Dipartimento di Biologia vegetale; l’affidamento a ricercatori dell’IVV di Corsi di docenza e di tesi di Laurea di studenti del Dipartimento, avendo come ‘tutor’ ricercatori di questo Istituto; il reciproco scambio d’uso di strumentazioni di laboratorio,ed altre varie forme di collaborazione. Data la situazione descritta, sarebbe logico che le due istituzioni – IVV e sezione-IPP – entrambe situate a Torino, entrambe afferenti al Dipartimento Agroalimentare ed entrambe operanti nel campo della patologia vegetale/microbiologia, occupandosi l’uno di virus, viroidi e fitoplasmi, l’altra di funghi simbionti delle piante confluissero in un’unica struttura del CNR. Ciò era del resto già emerso durante l’ultima riorganizzazione della rete di ricerca dell’Ente non trovando poi realizzazione per questioni di forma oggi superabili.

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