Dal Nano al Bio
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Transcript of Dal Nano al Bio
Il contributo delle nanoscienze alla comprensione dei fenomeni biologiciIl contributo delle nanoscienze alla comprensione dei fenomeni biologici
Mariano VenanziMariano VenanziBio-NAST LaboratoryBio-NAST LaboratoryUniversità di Roma Tor VergataUniversità di Roma Tor [email protected]@uniroma2.it
Single Molecule DetectionSingle Molecule DetectionRivelazione ottica e manipolazione di singole molecoleRivelazione ottica e manipolazione di singole molecole
Scanning Tunneling MicroscopyScanning Tunneling Microscopy effetto tunnel elettronico
Atomic Force MicroscopyAtomic Force Microscopy interazioni elettroniche deboli
L’STM ha permesso non solo di L’STM ha permesso non solo di vedere vedere singole singole
molecole , ma anche di molecole , ma anche di toccare toccare e e spostare spostare singoli atomisingoli atomi
o di o di sentire sentire le loro vibrazioni.le loro vibrazioni.
Da questo punto di vista, l’STM può essere considerato Da questo punto di vista, l’STM può essere considerato
come gli occhi, le mani e le orecchie dei ricercatori. come gli occhi, le mani e le orecchie dei ricercatori.
Uno strumento unico capace di connettere il mondo Uno strumento unico capace di connettere il mondo
macroscopico dei nostri sensi al mondo nanometrico macroscopico dei nostri sensi al mondo nanometrico
degli atomi e delle molecole.degli atomi e delle molecole.
Saw-Wai Hla, Ohio UniversitySaw-Wai Hla, Ohio University
Immagine STM ad alta risoluzione di un DNA plasmide su micaImmagine STM ad alta risoluzione di un DNA plasmide su mica
Nella posizione della freccia il DNA ha una larghezza di 3nm e Nella posizione della freccia il DNA ha una larghezza di 3nm e una altezza di 0.65 nm.una altezza di 0.65 nm.Parametri di tunneling: -1.9V, 0.3 pA.Parametri di tunneling: -1.9V, 0.3 pA.
Citocromo c su Au(111)Citocromo c su Au(111)
Electron Transfer ProteinsElectron Transfer Proteins
26nmx26nm26nmx26nm 10nmx10nm10nmx10nm
Corral quantistici: Corral quantistici: atomi di Ferro su Cu(111) (r=7.3 nm)atomi di Ferro su Cu(111) (r=7.3 nm)
Xe su Ni(110)Xe su Ni(110) CO su Cu(110)CO su Cu(110)
Imaging di biomolecole in condizioni fisiologiche Imaging di biomolecole in condizioni fisiologiche
DNADNA Complessi DNA-proteinaComplessi DNA-proteina
100 pN 200 pN 100 pN 200 pN
Bacteriorodopsina nella membrana cellulare citoplasmaticaBacteriorodopsina nella membrana cellulare citoplasmatica
Strato cellulare protettivo di Deinococcus radioduransStrato cellulare protettivo di Deinococcus radiodurans
5 nm Cr + 50 nm Au + tioalcano funzionalizzato (X)
2 x 2
““Impara ad usare la forza”Impara ad usare la forza”
Quanta forza serve per svolgere un tratto di DNA?Quanta forza serve per svolgere un tratto di DNA?
Spettroscopia di singola molecolaSpettroscopia di singola molecola
caratterizzazione di popolazioni eterogenee di molecole- distribuzioni locali, traiettorie nel tempo
fluttuazioni in condizioni di equilibrio
cinetiche di reazione di singoli componenti in condizioni di non-equilibrio- intermedi e cammini di reazione
Studio di singole biomolecole in condizioni fisiologiche
Le dimensioni di un probe (≈0.1 nm) sono molto minori della luce emessa (≈500 nm). Lo spot di luce può essere localizzato con grande precisione (decimi di nanometro).
Funzionalizzazione di biomolecole mediante sonde Funzionalizzazione di biomolecole mediante sonde fluorescenti legate covalentemente e in maniera specificafluorescenti legate covalentemente e in maniera specifica
Fluorescenza di Fluorescenza di singole molecole di singole molecole di flavoenzima. flavoenzima. Ogni picco Ogni picco rappresenta una rappresenta una molecola del molecola del cofattore flavina cofattore flavina legata all’enzima.legata all’enzima.
La reazione enzimatica di ogni singolo addotto enzima/cofattore puo’ essere seguita in tempo reale
Lampadine molecolari: Lampadine molecolari: molecole che si accendono quando si leganomolecole che si accendono quando si legano
Biomolecole legate a sferette di polistirene o di silice (≈1Biomolecole legate a sferette di polistirene o di silice (≈1m)m)
Boyer and Walker , Nobel 1997Boyer and Walker , Nobel 1997
Un motore a scatti di 120°Un motore a scatti di 120°
Il motore F0Il motore F0Il motore F1Il motore F1
Membrana mitocondrialeMembrana mitocondriale
Nel mitocondrioNel mitocondrio
Kinesina in moto : un trasportatore al lavoroKinesina in moto : un trasportatore al lavoro
Una molecola di ATP Una molecola di ATP 8 nm 8 nm
Un esperimento a due trappole!Un esperimento a due trappole!
weak trapweak traptight traptight trap
410 s410 s
3 s3 s
NanoNanoBioBio
Biomateriali e processiBiomateriali e processi
ModelliModelli
StrumentiStrumenti
Scienza e piattaforme tecnologicheScienza e piattaforme tecnologiche