STRUTTURA DELL’RNA STRUTTURA DELL’RNA

Strutture secondarie nell’RNA

Appaiamenti di basi canonici

Appaiamenti di basi non canonici

Strutture terziarie pseudonodo

Strutture terziarie motivo A-minore

L’adenina (presente in regioni a singolo filamento) si posiziona all’interno del solco

minore di regioni a doppia elica

Strutture terziarie motivo a tetraansa

Ansa ricca in U o A e stelo ricco in G-C

Interazioni tra i gruppi 2’OH dei ribosi

di un filamento e i gruppi O2 (pur) o N3

(pir) delle basi di un’altra elica in

corrispondenza del solco minore

Motivo a cerniera lampo di ribosi

Strutture terziarie motivo a piega k

Strette curvature nell’elica con protuberanze di tre nucleotidi

fiancheggiate da coppie G-C e A-G

Struttura di un t-RNA

RIPIEGAMENTO DELL’RNA

RNP Complessi

RNA-proteina

FOOTPRINTING PER L’ANALISI DEL RIPIEGAMENTO

RNA CATALITICO RIBOZIMI

Thomas Cech scoprì che l’rRNA di Tetrahymena era in grado di catalizzare

autosplicing (eliminazione di un breve tratto di RNA nel prodotto finale)

GTP

AUTOSPLICING

RIBOZIMI

IL MONDO A RNA

Sugars Pentoses (especially ribose), hexoses, both straight and branched chain

Carboxylic Acids Formic, Acetic, Propionic, Straight and branched C4 - C10, Glycolic, Lactic, Succinic

Purine and Pyrimidine Bases Adenine, Guanine, Xanthine, Hypoxanthine, Cytosine, Uracil

Amino Acids Glycine, Alanine, 2-Aminobutryic, Valine, Leucine, Isoleucine, Proline, Aspartic, Glutamic, Serine, Threonine

Miscellaneous Formaldehyde, HCN

ESPERIENZA DI MILLER