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Isolamento mediante clonaggio posizionale Isolamento mediante clonaggio posizionale Cerchiamo un gene, che abbiamo mappato nelle famiglie affette, mediante procedure dipendenti dalla sua localizzazione fisica Possiamo clonare questo gene se un RFLP o un altro marcatore cromosomico mappa in prossimità si esso

Transcript of Cerchiamo un gene, che abbiamo mappato nelle famiglie ...dbce.uniroma1.it/sites/default/files/10d-...

Isolamento mediante clonaggio posizionaleIsolamento mediante clonaggio posizionale

Cerchiamo un gene, che abbiamo mappato nelle famiglie affette, mediante procedure dipendenti dalla sua localizzazione fisica

Possiamo clonare questo gene se un RFLP o un altro marcatore cromosomico mappa in prossimità si esso

Clonaggio posizionale di un geneClonaggio posizionale di un gene

SequenziamentoMappa

Isolamento di cloni specifici mediante Isolamento di cloni specifici mediante complementazione funzionalecomplementazione funzionale

Se siamo in grado di introdurre DNA funzionale in cellule mutate, possiamo selezionare specifici cloni in una libreria mediante la capacità del DNA introdotto di complementare la mutazione

Conferma di un gene candidatoConferma di un gene candidato

• mutazioni presenti nello stesso gene di pazienti diversi affetti dalla stessa patologia

• ripristino del fenotipo normale in vitro mediante “trasfezione” del gene selvatico

• produzione di un animale modello per la malattia

• identificazione della funzione svolta dal gene candidato.

Studio della funzione dei geni clonati Studio della funzione dei geni clonati

Studio di funzione:Studio di funzione:

Guadagno di funzione- Overespressione di un gene tramite vettori di espressione- Topi transgenici

Perdita di funzione - Blocco dell’espressione mediante oligonucleotidi o RNA antisenso- Topi knock-out

Mediante inserzione mirata possiamo non solo eliminare un gene (KO, knock-out) ma anche modificarlo (knock.in, sostituzione genica tra allele wt e mutante)

I metodi per l’inattivazione di un gene specifico sono basati sulla ricombinazione omologa

Il gene è inattivato (loss of function) perché interrotto con un altro DNA

Sviluppo dello zigote fino allo stadio di blastocistiSviluppo dello zigote fino allo stadio di blastocisti

Topo (Topo (MusMus musculusmusculus))

Topi transgeniciper microiniezione dell’uovo fecondato

La GFP (Green Fluorescent Protein ) è una proteina espressa nella medusaAequorea victoria.

Per studiarne la localizzazione…

…l’espressione durante lo sviluppo….

…e in topi transgenici (imaging in vivoimaging in vivo)