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    BACTERIOLOGA

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    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LAS MICOSIS(SUPERFICIALES, SUBCUTNEAS, SISTEMICAS Y OPORTUNISTAS)

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE MICOLOGA

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    1. Las muestras de escamas de piel, uas, pelo, secreciones, exudados y otros debernacompaarse del formato nico, resumen de historia clnica y la solicitud del estudio.

    2. La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal. Se informar al usuario yeste contar con un lapso de ocho das para enviar la documentacin faltante. Elincumplimiento del usuario, ocasionar el rechazo definitivo de la muestra.

    3. Las muestras debern enviarse en cantidad suficiente, envasadas y embaladas correctamente.4. El diagnstico de las micosis, se realizar de acuerdo al algoritmo correspondiente. Los

    resultados sern emitidos siete das hbiles despus de recibida la muestra.

    Bibliografa

    1. Summerbell RC. Trichopyton, Microsporum, Epidermophyton and agents of superficialmycoses. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual ofClinical Microbiology. 8th ed. Washington, DC: asm Press, 2003. pp 1798-1819.

    2. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual deprocedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico, 2000.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO SEROLGICO PARAHISTOPLASMOSIS Y COCCIDIODOMICOSIS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE MICOLOGA

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    1. Las muestras de suero en volumen mnimo de 1 mL. debern acompaarse del Formatonico, resumen de historia clnica y la solicitud del estudio.

    2. La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal. Se informar alusuario y este contar con un lapso de ocho das para enviar la documentacin

    faltante. El incumplimiento del usuario ocasionar el rechazo definitivo de la muestra.3. La muestra no deber de estar hemolizada, contaminada o lipmica. Si esto sucede, lamuestra ser rechazada y se comunicar al usuario.

    4. Las muestras debern enviarse envasadas y embaladas correctamente, sin derrames.5. El diagnstico serolgico para histoplasmosis y coccidioidomicosis se realizar de acuerdo al

    algoritmo correspondiente. Los resultados sern emitidos siete das hbiles despus derecibida la muestra.

    Bibliografa

    1. Walsh TJ, Larone DH, Schell WA, Mitchell TG. Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides, andother dimorphic fungi causing systemic mycoses. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH,

    Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington, DC: asmPress, 2003. pp 1781-1797.

    2. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual deprocedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico, 2000.

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    ALGORITMO PARA LA IDENTIFICACIN DE CEPAS DE HONGOS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE MICOLOGADEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    1. Las cepas enviadas para su identificacin debern acompaarse del formato nico, resumende historia clnica, fuente de aislamiento y la solicitud del estudio.

    2. La falta de alguno de estos documentos causar rechazo temporal.3. Se informar al usuario y este contar con un lapso de ocho das para enviar la

    documentacin faltante. El incumplimiento del usuario ocasionar el rechazo definitivo de la

    muestra.4. Las muestras debern enviarse envasadas y embaladas correctamente. No utilizar tubos con

    tapn de rosca.5. La identificacin de cepas de hongos se realizar de acuerdo al algoritmo correspondiente.

    Los resultados sern emitidos diez das hbiles despus de recibida la muestra.

    Bibliografa

    1. Merz WG, Roberts GD. Algorthms for detection and identification of fungi. In: Murray PR,Baron EJ, Jorgensen JH, Pfaller MA, Yolken RH, eds. Manual of Clinical Microbiology. 8th ed.Washington, DC: asm Press, 2003. pp 1668-1684.

    2. Contreras PC, Shibayama HH, Gutirrez GP, Valenzuela TJ, Ros RC, Ramos BR. Manual deprocedimientos de diagnstico en micologa mdica. InDRE, Mxico,

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    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO SEROLGICO DE CLERA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE PRODUCCIN DE SUEROSDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO SEROLGICO DE CLERA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE PRODUCCIN DE SUEROS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS.

    MUESTRAS PARA LA DETERMINACION DE ANTICUERPOS VIBRIOCIDAS Y ANTITOXINACOLERICA

    1. Las muestras de suero humano para diagnstico en volumen de al menos 1 mL debern deacompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE, del resumen de historiaclnica y de la solicitud del estudio.

    2. Para la determinacin de anticuerpos vibriocidas y antitoxina colrica, debern tomarsemuestras de suero pareadas, la primera en el inicio de la enfermedad la cual se conservar enrefrigeracin y la segunda entre 15 y 20 das despus de tomada la primera, ambas sernenviadas al InDRE en el mismo paquete en condiciones de refrigeracin.

    3. La falta de alguno de los documentos o de alguna de las muestras, as como las condicionesinadecuadas de la muestra como son: sin refrigerantes, muestras de sangre completa,hemolizada, contaminada, lipmica o que los datos no sean legibles, como nombre, fecha detoma de la muestra y procedencia, causar el rechazo temporal de la misma. Se notificara alusuario por escrito dando un periodo de gracia de ocho das para enviar la documentacincompleta o la muestra faltante. De no ocurrir as se rechazar la muestra definitivamente y se

    notificar por escrito al usuario o responsable del envo.4. El diagnstico serolgico de clera cumplir los algoritmos correspondientes. Los resultadossern emitidos dos semanas despus de recibidas las muestras y la documentacinadecuadas.

    5. Para estudios epidemiolgicos se puede recibir una sola muestra con la documentacin y lascondiciones antes mencionadas.

    6. En algunos casos especiales en que solo se envi una muestra para el diagnstico o las dosmuestras no son adecuadas ni la documentacin de acuerdo con lo indicado anteriormente,pero el usuario considera que la muestra es de alto valor deber hacerlo saber al laboratoriode Produccin de Sueros por escrito aceptando que el resultado no es confiable para serinterpretado con una sola muestra o con las condiciones inadecuadas

    Bibliografa

    1. Mtodos de laboratorio para el diagnstico de Vibro cholerae CDC/NCID, OPS Washington,D. C., Estados Unidos de Amrica 1994 .

    2. Norma Oficial Mexicana NOM-016-SSA2-1994, Para la vigilancia, prevencin, control, manejo ytratamiento del clera.

    3. Norma Oficial Mexicana NOM-017-SSA2-1994, Para la vigilancia epidemiolgica

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE LA BRUCELOSIS HUMANA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE BRUCELOSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE LA BRUCELOSIS HUMANA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE BRUCELOSISDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO BACTERIOLGICO

    DE BRUCELOSIS EN ALIMENTOS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE BRUCELOSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    Muestras para serologa

    1. El volumen mnimo de la muestra debe ser de 400l. de suero.2. La muestra no debe estar contaminada, lipmica o hemolizada.3. La muestra deber venir etiquetada con tinta a prueba de agua y deber venir acompaada de

    una breve historia clnica y del formato nico del InDRE.4. La muestra debe colocarse en recipientes slidos que cierren bien, a prueba de fugas,

    derrames y goteos. Las tapas se sellaran con cinta a prueba de agua, se transportaran ymantendrn previo a su procesamiento en condiciones de refrigeracin. No se congelaran. Sila muestra no viene acompaada de la documentacin sealada o le faltan datos se dar unrechazo temporal, se informara al usuario y este contar con 10 das naturales para enviar lafaltante. El incumplimiento de este punto causa rechazo definitivo.

    5. Toda muestra recibida se le realizaran pruebas presuntiva y confirmatoria.6. El tiempo para la emisin de un resultado es de 48 horas y el tiempo mximo es de 4 das.

    Muestras para bacteriologa

    1. La muestra de sangre deber tomarse preferentemente en la fase febril, antes que latemperatura llegue al mximo.

    2. Las muestras de hemocultivo y mielocultivo debern enviarse al laboratorio inmediatamentedespus de su inoculacin (Medio Ruiz-Castaeda), no requiere de refrigeracin.

    3. Las muestras de leche y derivados lcteos, cepas, ganglios debern enviarse en Tubos, Placas,Frascos o Recipientes estriles y adecuados segn se trate de la muestra, tendrn que venirbien identificada con tinta a prueba de agua y acompaadas de una breve historia clnica y delformato nico del InDRE. Si la muestra no viene acompaada de la documentacin sealada ole faltan datos se dar un rechazo temporal, se informara al usuario y este contar con 10das naturales para enviar la informacin faltante. El incumplimiento de este punto causarechazo definitivo.

    4. Las muestras de alimentos solo se procesarn en caso de brote y previa solicitud verbal parael apoyo.5. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de hemocultivo es de 6 semanas.6. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de identificacin de una cepa es de 10

    das.7. El tiempo mximo para la emisin de un resultado de aislamiento de Brucella a partir de

    alimento es de 15 das.

    Bibliografa

    1. Alton G.G., Jones L.M. y Pietz D.E. Las tcnicas de laboratorio en brucelosis, 2. Edicin.Organizacin Mundial de la Salud. 1976. Ginebra.

    2. Hernndez M.I., Pea F.G. y Betancour M.X. Manual de procedimientos de laboratorio.INDRE/SAGAR Brucelosis 19. 1996. Mxico.

    3. NOM-022-SSA-2-1994. Para la prevencin y control de la brucelosis en el hombre.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE ENTEROBACTERIAS

    A PARTIR DE MUESTRA FECAL

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS

    HISOPO RECTAL

    1. La muestra de materia fecal (hisopo rectal en medio de transporte) deber de acompaarse dela historia clnica, formato nico de envo de muestras del InDRE y de la solicitud del estudio.El tubo de Cary Blair que contiene la muestra debe rotularse con los datos del paciente enforma clara.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-BAC-47.

    2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181-234,243-250, 251-265, 569-574, 579-592.

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    ALGORITMO PARA EL CONTROL DE CALIDAD Y

    REFERENCIA DE ENTEROBACTERIAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    CEPAS BACTERIANAS

    1. Las cepas de enterobacterias para el control de calidad y referencia, deben ser enviadas enagar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse de la historia clnica,formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.

    3. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos,esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y senotifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con unperodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, serechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-BAC-47.

    2.

    Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181-234,243-250, 251-265, 569-574, 579-592.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE ENTEROBACTERIAS

    EN MUESTRA DE ORINA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE ENTEROBACTERIASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    UROCULTIVO

    1. La muestra de orina (5 ml) debe ser tomada del chorro medio de la primera miccin del da,haciendo un previo aseo con agua y jabn de la zona genital, y asepsia con un antisptico(benzal) y depositada en un recipiente estril. La muestra debe rotularse con los datos del

    paciente en forma clara, deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras delInDRE y solicitud del estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.3. La muestra debe ser remitida al laboratorio en forma inmediata, de no ser posible esto, es

    necesario mantenerla en refrigeracin sin rebasar un tiempo mximo de 2 h desde la tomahasta su entrega al laboratorio, de lo contrario la muestra no se recibe, por perder su valordiagnstico.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de

    Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-103-BAC-110.2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de

    Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F.181-234.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE Salmonella

    EN MUESTRA DE SANGRE

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE ENTEROBACTERIAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    HEMOCULTIVO

    1. La muestra de sangre (5 a 8 ml) debe ser tomada en condiciones de esterilidad y depositadaen medio de Ruiz Castaeda. La muestra debe rotularse con los datos del paciente en formaclara, deber de acompaarse del formato nico de envo de muestras del InDRE y solicituddel estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.3. La muestra no debe ser refrigerada, debe mantenerse a temperatura ambiente hasta su

    llegada al laboratorio.4. El resultado se emitir en un tiempo mximo de 21 das.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-139-BAC-148

    2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de

    Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 181-234.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DE Vibrio cholerae

    EN MUESTRAS CLNICAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE CLERA

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA RECEPCIN DE MUESTRAS

    Hisopo rectal

    1. La muestra de materia fecal (hisopo rectal en medio de transporte) deber de acompaarse dela historia clnica, formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio. Eltubo de Cary Blair que contiene la muestra debe rotularse con los datos del paciente en forma

    clara.2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-BAC-47.

    2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 309-350,579-592.

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    ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA

    DE Vibrio cholerae EN CEPAS DE ORIGEN CLNICO

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE CLERA

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    CEPAS BACTERIANAS

    1. Las cepas de Vibrio cholerae para referencia y control de calidad deben ser enviadas en agarBAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse del formato nico de envode muestras del InDRE y solicitud del estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.3. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos,

    esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y senotifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con unperodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, serechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-BAC-47.

    2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 309-350,579-592.

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    ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE Vibrio

    cholerae EN CEPAS DE ORIGEN AMBIENTAL Y DE ALIMENTOS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE CLERADEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    CEPAS BACTERIANAS

    1. Las cepas de Vibrio cholerae para referencia y control de calidad deben ser enviadas en agarBAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarse del formato nico de envode muestras del InDRE y solicitud del estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.

    3. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos,esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y senotifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con unperodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, serechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-

    BAC-47.2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional deDiagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 309-350,579-592.

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    ALGORITMO PARA CONTROL DE CALIDAD Y REFERENCIA DE

    Aeromonas, Plesiomonasy Vibriosp

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE CLERA

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES PARA LA RECEPCIN DE MUESTRAS

    CEPAS BACTERIANAS

    1. Las cepas de Aeromonas, Plesiomonas y Vibrios sp. para referencia y control de calidaddeben ser enviadas en agar BAB en tubo de 13x100 mm. La muestra deber de acompaarsedel formato nico de envo de muestras del InDRE y solicitud del estudio.

    2. La muestra se procesar de acuerdo al algoritmo correspondiente.3. Si las muestras o la documentacin, no cumple con los criterios de aceptacin establecidos,

    esto es causa de rechazo definitivo o temporal segn sea el caso; se llena el formato y senotifica al usuario. En caso de tratarse de un rechazo temporal el usuario cuenta con unperodo de 7 das naturales para hacer la correccin necesaria, de no ocurrir esto, serechazar definitivamente y se notificar al usuario o responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Manual de tcnicas de laboratorio Vol. 1 Virologa y Bacteriologa Instituto Nacional de

    Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1995. Mxico, D.F. BAC-13-BAC-47.2. Diagnstico de laboratorio de infecciones gastrointestinales. Instituto Nacional de

    Diagnstico y Referencia Epidemiolgicos, Secretara de Salud, 1994. Mxico, D.F. 309-350,579-592.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO, CONTROL DE CALIDAD Y

    REFERENCIA DE Bordetella pertussisy otras especies

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Este tipo de muestra se recomienda para el diagnstico de Tos ferina y la bsqueda de contactosintradomiciliarios..

    1. Se utiliza un hisopo que NO sea de algodn se recomienda que sea de alginato de calcio,rayn o dacrn con mango flexible (alambre de aluminio o plstico) para no lastimar al

    paciente. Depositar el hisopo con la muestra en 1 ml de medio de transporte (solucin salinacon cefalexina a una concentracin de 40 g/ml) y trasladarlo lo ms pronto posible allaboratorio en red fra (sin congelar).

    2. Nota: El tiempo de viabilidad de este microorganismo en la muestra en red fra es de 48 a 72hrs.

    Cepas de Bordetella pertussisPara enviar cepas de Bordetella pertussisu otras especies de Bordetella para control de calidad oconfirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transportede AMIES modificado con carbn activado .

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo Bordet-Gengou,2. Incubar hasta 72 hrs en aerobiosis y en bolsas de plstico.3. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo

    en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm yrotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formatonico de envo de muestras al InDRE).

    4. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera5. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.6. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio

    en refrigeracin durante tres das como mximo.

    Informacinrequerida:La muestra o la cepa debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera osegunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen dela historia clnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Nennig ME. Prevalence and incidence of adult pertussis in an urban population. JAMA.1996.275:1672.

    2. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 pp. 419-424

    3. SCHAECHTER M, MEDOFF G, SCHLESSINGER D. Mechanisms of Microbial Disease. Williams &Williams, 1989. pp. 283-289.

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    ALGORITMO PARA DIAGNSTICO DETERMINACIN DEANTICUERPOS ANTI-PERTUSSIS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Se requiere de 1 a 3 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico contaminado. Se requiere de segunda muestra 15 das despus de la primera toma.

    2. Estas muestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportan en red fra,sin congelar.

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Manclarck, P. R., & Meade, B. D. 1980. Serogical response to Bordetella pertussis. In: Manualof Clinical Immunology 2a. Ed. American Society for Microbiology, Washington, D. C. E.U.A.pp. 496

    2. Nennig ME. Prevalence and incidence of adult pertussis in an urban population. JAMA.1996.275:1672.

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    ALGORITMO PARA AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE

    Corynebacterium diphtheriae Y OTRAS ESPECIESE IDENTIFICACIN DE CEPAS TOXIGENICAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Toma de exudado farngeo1. La muestra de eleccin para el diagnstico por cultivo de Corynebacterium diphtheriae es el

    exudado farngeo. Se recomienda tomar una parte de la pseudomembrana, si se encuentrapresente y depositarla en el medio de transporte.

    Toma de Biopsias1. Las muestras para cultivo de tejidos se remiten rpidamente al laboratorio en un recipiente

    estril con tapas adecuadas. Las muestras en formol no son adecuadas para su cultivo.2. Para la conservacin y transporte de estas muestras se recomienda el medio de PAI, que es un

    medio slido en tubo, inclinado.

    TransporteDepositar el hisopo con la muestra en el medio de transporte de PAI y trasladarlo a temperaturaambiente si el transporte es menor a 6 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a6 hrs, debido a que despus de este tiempo las protenas digeridas por esta bacteria, permiten el

    desarrollo de la flora acompaante dificultndose su aislamiento.

    Informacin requeridaLa muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 651-664.

    2. STEPHEN J, PIETROWSKI RA. Diphtheria toxin. In: Bacterials toxins, 2d. Edition. WashingtonDC: American Society for Microbiology, 1986. Pg. 25-30

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    ALGORITMO PARA DETERMINACIN DE ANTICUERPOSANTITOXINA TITNICA O DIFTRICA

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Se requiere de 1 a 3 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico contaminado. Las muestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportanen red fra, sin congelar.

    Informacin requeridaLa muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. FARREL IN, REID DBW, KORMENDY A. C. Disk plate assay for diphtheria antitoxin in undiluted

    horse and human serum and infants whole blood. J. Immunol. 1963, 90: 2012. 2. CHATTERJEE SC. A COMPARATIVE STUDY OF THE HAEMAGGLUTINATION AND BIOASSAYPROCEDURES FOR THE ASSAY OF GUINEA-PIG ANTI-DIPHTHERIA AND ANTI-TETANUS SERA.Ind. Jour. Med . Res.,52, 12, December, 1964, pp. 1241-1249

    3. 3.COMPARATIVE STUDY OF THE HAEMAGGLUTINATION AND BIOASSAY PROCEDURES FOR THEASSAY OF GUINEA-PIG ANTI-DIPHTHERIA AND ANTI-TETANUS SERA. Ind. Jour. Med . Res.,52,12, December, 1964, Pg. 1241-1249.

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    ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACION YSEROTIPIFICACIN DE Haemophilus influenzae Y OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Transporte y envo de cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis:Para enviar cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis para control de calidad oconfirmacin (referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transportede AMIES modificado con carbn activado.

    Procedimiento:4. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo de acuerdo al tipo de cepa

    como sigue:5. Si es Streptococcus pneumoniae en agar sangre de carnero al 5%6. Si es Haemophilus influenzae en agar chocolate enriquecido7. Si es Neisseria meningitidisen agar chocolate enriquecido agar sangre de carnero al 5%.8. Incubar de 18 a 24 horas a 35-37C en tensin parcial de CO

    2.

    9. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopoen un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm yrotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formatonico de envo de muestras al InDRE).

    10. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera

    11.

    Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.12. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medioa temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    Bibliografa

    1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual deLaboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 7-16, Apndice 4 Pg. 245-277

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    ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN Y SEROTIPIFICIACIN

    DE Streptococcus pneumoniae Y OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Transporte y envo de cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis:Para enviar cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis para control de calidad oconfirmacin (referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transportede AMIES modificado con carbn activado.

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo de acuerdo al tipo de cepa

    como sigue:2. Si es Streptococcus pneumoniae en agar sangre de carnero al 5%3. Si es Haemophilus influenzae en agar chocolate enriquecido4. Si es Neisseria meningitidisen agar chocolate enriquecido agar sangre de carnero al 5%.5. Incubar de 18 a 24 horas a 35-37C en tensin parcial de CO

    2.

    6. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopoen un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm yrotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formatonico de envo de muestras al InDRE).

    7. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera

    8.

    Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.9. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medioa temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    Bibliografa

    1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual deLaboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 49-57 Apndice 4 Pg. 245-277; Apndice 6 Pg. 275-278

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    ALGORITMO PARA AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN Y SEROTIPIFICACINDE Neisseria meningitidisY OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Transporte y envo de cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis:Para enviar cepas de S. pneumoniae, H. influenzae y N. meningitidis para control de calidad oconfirmacin (referencia) a un laboratorio de referencia se debe emplear el medio de transportede AMIES modificado con carbn activado.

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo de acuerdo al tipo de cepa

    como sigue:2. Si es Streptococcus pneumoniae en agar sangre de carnero al 5%3. Si es Haemophilus influenzae en agar chocolate enriquecido4. Si es Neisseria meningitidisen agar chocolate enriquecido agar sangre de carnero al 5%.5. Incubar de 18 a 24 horas a 35-37C en tensin parcial de CO

    2.

    6. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopoen un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES, cerrar el tubo, sellar con parafilm yrotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formatonico de envo de muestras al InDRE).

    7. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera

    8.

    Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.9. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medioa temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    Bibliografa

    1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual deLaboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. Pg. 33-42; Apndice 4 Pg. 245-277

    2. Manual para el Control de Enfermedades Transmisibles. Publicacin Cientfica No. 564. 16.edicin. 1997. Pg. 307-311. Organizacin Panamericana de la Salud. Abraham S. Benenson.

    Editor.3. Standardization and validation of serological assays for the evaluation of immune responses

    to Neisseria meningitides serogroup A/C vaccines. Departament of Vaccines and Biologicals.World Health Organization. Geneva. 1999.

    4. Thayer, JD., PF. and JE Martin. Thayer-Martin, selective medium for the cultivation ofNeisseriameningitidisfrom the nasopharymx. Am. J. Pub. Health 55: 923-927. 1965.

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    104

    ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO, IDENTIFICACIN YSEROTIPIFICACIN DE ESTREPTOCOCOS BETA-HEMOLITOS

    Y OTROS ESTREPTOCOCOS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    Exudado farngeo1. Para la bsqueda de estreptococos beta-hemolticos se puede emplear hisopos de algodn,

    rayn o dacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuarty trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte esmenor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs.

    2. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar ladilucin de los microorganismos presentes en la muestra.

    3. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementasi se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs.

    4. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs.

    Cepas de Estreptococos beta-hemolticos1. Para enviar cepas de Estreptococos beta-hemolticos y otros estreptococos para control de

    calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear elmedio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placaspetri con agar sangre de carnero al 5%.

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5%

    (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis.2. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo

    en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo,sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacinsolicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE).

    3. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera4. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.5. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio

    a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    6. Informacin requerida: La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealandosi es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo demuestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio.

    7. La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra soncausa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das,para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condicionesadecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuarioresponsable del envo.

    Bibliografa

    1. Facklam RR, Collins D. Identification of Enterococccus species isolated from human infectios

    by a conventional test scheme. J Clin Microbiol 1989, 27, Pg. 731-4.2. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. Diagnstico

    Microbiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 577-598

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    106

    ALGORITMO DE DETERMINACIN DE ANTI-ESTREPTOLISINA OEN MUESTRAS PAREADAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    SUERO1. Se requiere de 3 a 5 ml de suero para la prueba, no debe estar hemolizado, lipmico

    contaminado. Se requiere de segunda muestra 15 das despus de la primera toma. Lasmuestras se recolectan en tubo estril, sin anticoagulante y se transportan en red fra, sincongelar.

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Klein G.L. Manual of clinical inmunology, 264-273:1976

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    108

    ALGORITMO PARA AISLAMIENTO E IDENTIFICACINDE Staphylococcus aureusY OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Para la bsqueda de Staphylococcus aureusse puede emplear hisopos de algodn, rayn odacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart ytrasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte esmenor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs.

    2. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar la

    dilucin de los microorganismos presentes en la muestra.3. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementa

    si se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs.4. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs.

    Cepas de Staphylococcus aureusPara enviar cepas de Staphylococcus aureusy otras especies de Staphylococcus para control decalidad o confirmacin (Referencia)a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio detransporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placas petri con agarsangre de carnero al 5%.

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5%(ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis.

    2. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopoen un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo,sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacinsolicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE).

    3. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera4. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.5. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio

    a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 527-551

    2. 2. Topley and Wilson`s. Microbiology and Microbial Infections. Novena edicin. Volmen3.Pg. 231- 256

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    ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO E IDENTIFICACINDE Bacillus anthracisY OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Para la bsqueda de Bacillus anthracis a partir de Las muestras nasales se puede emplearhisopos de algodn, rayn o dacrn. El cultivo de fosas nasales slo se deben usar paraapoyar una exposicin confirmada de B. anthracis o durante una investigacinepidemiolgica activa.

    2. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte .3. Etiquete el contenedor con el hisopo con la informacin del paciente e indique si es posible,

    el grado o probabilidad de exposicin y trasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, atemperatura ambiente, si el transporte es menor a 24 horas, o en red fra si el tiempo detransporte es mayor a 24 hrs.

    4. Otras muestras que se solicitan para el diagnstico de ntrax son:5. lquido cefalorraqudeo [LCR], biopsia de ndulo linftico). aspticamente fluido vesicular,

    escaras o costras, Cultivos de sangre, Heces, Hisopo rectal, Esputo:

    Transporte y almacenamiento de muestras:1. Hisopos: Transprtese directamente al laboratorio a temperatura ambiente. Para tiempos de

    transportacin mayores de 1 hora; mantenga de 2-8 C.2. Heces: Transporte al laboratorio las heces sin conservar dentro de una lapso de 1 hora. Para

    tiempos de transportacin mayores de 1 hora, consrvese de 2-8 C. El medio Cary-Blair u

    otro medio de trasporte equivalente es aceptable.3. Esputo: Transprtese en un contenedor estril con tapa de rosca, a temperatura ambiente

    para tiempos menores de 1 hora y de 2-8 C para tiempos mayores de 1 hora.4. Cultivo de sangre: Transporte directamente al laboratorio a temperatura ambiente.

    Cepas de Bacillus anthracisPara enviar cepas de Bacillus anthracisy otras especies de Bacillus sp para control de calidad oconfirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear el medio detransporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados o placas petri conagar sangre de carnero al 5%.

    Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5%

    (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis.2. Cosechar el desarrollo con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo en un tubo que

    contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo, sellar con parafilmy rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacin solicitada (formatonico de envo de muestras al InDRE).

    3. Estos procedimientos se deben realizar en laboratorios de microbiologa en los que seimplementan prcticas de Nivel 2 de Seguridad Biolgica (SBN-2).

    4. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera y el paquete debe estar bienidentificado y con el smbolo de material biolgico infectocontagioso.

    5. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.

    6.

    En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medioa temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

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    112

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurrir

    as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 636-644International Protocol. Draft October 20,2001

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    ALGORITMO PARA EL AISLAMIENTO E IDENTIFICACINDE Listeria monocytogenesY OTRAS ESPECIES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Para la bsqueda de Listeria monocytogenesse puede emplear hisopos de algodn, rayn odacrn. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart ytrasladarlo lo ms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte esmenor a 24 horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs.

    2. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar ladilucin de los microorganismos presentes en la muestra.

    3. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementasi se utiliza medio de transporte de AMIES entre 48 a 96 hrs.

    4. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs.

    Cepas de Listeria monocytogenes1. Para enviar cepas de Listeria monocytogenes y otras especies de Listeria para control de

    calidad o confirmacin (Referencia) a un laboratorio de referencia se puede emplear elmedio de transporte de AMIES modificado con carbn activado o en tubos inclinados placaspetri con agar sangre de carnero al 5%.

    2. Procedimiento:3. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo agar sangre de carnero al 5%

    (ASC) e incubar hasta 24 hrs en aerobiosis.4. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo

    en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo,sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacinsolicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE).

    5. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera6. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.7. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio

    a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.8. Informacin requerida: La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando

    si es primera o segunda toma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo demuestras, resumen de la historia clnica y oficio de solicitud de estudio.

    9.

    La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra soncausa de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das,para enviar la documentacin complementaria o la nueva muestra en las condicionesadecuadas, de no ocurrir as, se rechazar definitivamente y se notificar al usuarioresponsable del envo.

    Bibliografa

    1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 Pg. 644-649

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    ALGORITMO PARA LA IDENTIFICACIN DEMICROORGANISMOS NO FERMENTADORES

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANAS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Para la bsqueda de Microorganismos no fermentadores a partir de exudados farngeos, sepueden emplear hisopos de algodn, rayn o dacrn.

    2. Depositar el hisopo con la muestra en medio de transporte de AMIES o Stuart y trasladarlo loms pronto posible al laboratorio, a temperatura ambiente si el transporte es menor a 24horas, o en red fra si el tiempo de transporte es mayor a 24 hrs.

    3. Se recomienda que el volumen del medio de transporte no sea mayor de 3 ml para evitar ladilucin de los microorganismos presentes en la muestra.

    4. Nota: El tiempo de viabilidad de los microorganismos presentes en la muestra se incrementasi se utiliza medio de transporte de AMIES sin carbn activado entre 48 a 96 hrs.

    5. Si se utiliza medio de transporte de Stuart, la viabilidad disminuye entre 24 y 48 hrs.

    Cepas de Microorganismos no fermentadores1. Para enviar cepas de Microorganismos no fermentadores para control de calidad o

    Referenciaa un laboratorio de referencia se puede emplear el medio de transporte de AMIESsin carbn activado o en tubos inclinados con base de agar sangre (BAS) o agar soyatripticasena (TSA).

    2.Procedimiento:1. Realizar una siembra masiva de la cepa en el medio de cultivo base BAS o TSA e incubar

    hasta 24 hrs en aerobiosis.2. Cosechar el desarrollo con asa estril o con hisopo de dacrn o rayn e introducir el hisopo

    en un tubo que contiene el medio de transporte de AMIES o el tubo con ASC cerrar el tubo,sellar con parafilm y rotular el tubo con la clave de microorganismo, anexar la informacinsolicitada (formato nico de envo de muestras al InDRE).

    3. Enviar inmediatamente por un medio confiable de mensajera4. Avisar por va telefnica al laboratorio de referencia del envo de las cepas.5. En caso de que no sea posible el envo inmediato, se puede mantener la cepa en este medio

    a temperatura ambiente durante cinco das como mximo.

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. KONEMAN EW, ALLEN SD, JANDA WM, SCHRECKENBERGER PC, WINN WC. DiagnsticoMicrobiolgico, Texto y Atlas color. 5a ed. Editorial Panamericana . 2003 pp. 527-551

    2. Topley and Wilson`s. Microbiology and Microbial Infections. Novena edicin.3. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual de

    Laboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. pags 16-21,57-63. Apndice 7, pginas 279-282

    4. Clinical and Laboratory Standards Institute/NCCLS. Performance Standards for AntimicrobialSusceptibility Testing; Fifteenth Informational Supplement. CLSI/NCCLS document M100-S15(ISBN 1-56238-556-9). Clinical and Laboratory Standards Institute, 940 West Valley Road,

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    Suite 1400, Wayne, Pennsylnania 19087-1898, USA., 2005.). Methods for DilutionAntimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Approved Standard-SixthEdition.Document M7A6.

    5. Clinical and Laboratory Standards Institute/NCCLS. Performance Standards for AntimicrobialSusceptibility Testing; Fifteenth Informational Supplement. CLSI/NCCLS document M100-S15(ISBN 1-56238-556-9). Clinical and Laboratory Standards Institute, 940 West Valley Road,Suite 1400, Wayne, Pennsylnania 19087-1898, USA., 2005.) . Performance Standards forAntimicrobial Disk Susceptibility Tests Approved Standar-Eighth Edition Document M2-A8.

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    ALGORITMO PARA EL ESTUDIO BACTERIOLGICO YDIAGNSTICO RPIDO EN LCR

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. El lquido cefalorraqudeo (LCR) es la muestra ms comn en infecciones del sistemanervioso central y debe tomarse preferentemente antes del tratamiento con antibiticos paraaumentar las posibilidades de aislamiento.

    Toma de (LCR)El lquido cefalorraqudeo obtenido en condiciones estriles es separado en tres tubos estrilespara las siguientes determinaciones:1. Tubo 1: Examen citolgico (recuento de clulas y tipo de clulas que lo constituyen)2. Tubo 2: Examen bioqumico: (anlisis de protenas, glucosa...)3. Tubo 3: Examen microbiolgico: Cultivo, tincin de Gram y aglutinacin en ltex

    Transporte:El volumen requerido es de 2 a 5 mL El tubo 3 debe ser llevado rpidamente a temperaturaambiente al laboratorio y procesarlo de inmediato para evitar prdida de viabilidad de losmicroorganismos sensibles a los cambios bruscos de temperatura.Si no se cuenta con recursos para procesar la muestra podr separar una parte para la deteccin

    directa de antgeno capsular y almacenar por un mximo de 8 horas entre 2 y 8C y s i no esposible enviarla, entonces congelar a 20 C por un mximo de 2 das y enviarla en red fra. Laotra parte del lquido cefalorraqudeo se puede inocular en un frasco para hemocultivo chico o en1 ml de caldo infusin cerebro corazn enriquecido y transportarla al laboratorio a temperaturaambiente. Preferentemente no utilizar hemocultivos para adultos, ya que se corre el riesgo dediluir la muestra y perder la oportunidad de aislamiento del agente etiolgico.

    Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causa

    de rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    4. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual deLaboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. Apndice 4, Pg. 262-265.

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    ALGORITMO PARA EL ESTUDIO BACTERIOLGICO DEDIVERSAS MUESTRAS CLNICAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE IRAS BACTERIANASDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    CONDICIONES DE CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

    1. Evitar la extraccin en catteres intraarteriales o intravenosos permanentes de muestras desangre humana para hemocultivo,. Se recomienda hacer cambio de aguja antes de inocularla botella para hemocultivo o de medio bifsico tipo Ruiz Castaeda y se transportan allaboratorio a temperatura ambiente.

    2. El volumen de la muestra es crtico ya que la cantidad de microorganismos en la mayora de

    las bacteriemias es baja, especialmente si el paciente esta bajo tratamiento antimicrobiano. Elvolumen recomendado de sangre venosa es:

    Nios: 1 mL como mnimo, de 2 a 5 mL si es posible.Adultos: 5 a 10 mL (algunos autores recomiendan de 10 a 20 mL)

    3. Es muy importante considerar el volumen del medio de cultivo que se va a utilizar, procurarque se guarde una proporcin 1:10 de la sangre con el volumen final del medio de cultivo.Para incrementar la posibilidad de aislamiento de la bacteria es conveniente tomar variasmuestras en casos de neumona, meningitis y sepsis.

    4. En pacientes sin tratamiento: Tomar dos muestras de sangre de sitios distintos antes deempezar el tratamiento.

    5. En pacientes con tratamiento: Tomar seis muestras en un intervalo de 48 horas, previo almomento de la siguiente dosificacin del antibitico.

    6. Informacin requerida:La muestra debe de venir perfectamente bien etiquetada, sealando si es primera o segundatoma y diagnstico solicitado, con el formato nico de envo de muestras, resumen de la historiaclnica y oficio de solicitud de estudio.La falta de alguno de estos documentos o las condiciones inadecuadas de la muestra son causade rechazo temporal. Se notificar al usuario y contar con un periodo de siete das, para enviar ladocumentacin complementaria o la nueva muestra en las condiciones adecuadas, de no ocurriras, se rechazar definitivamente y se notificar al usuario responsable del envo.

    Bibliografa

    1. Ajello G., Bopp C., Elliott J., Facklam R., Knapp J., Popovic T., Wells J., Dowell S.; Manual deLaboratorio para la Identificacin y Prueba de Susceptibilidad a los Antimicrobianos dePatgenos Bacterianos de Importancia para la Salud Pblica en el Mundo en Desarrollo.USAID, OMS, CDC. 2004. Apndice 3, pginas 237-244, 245-268, Apndice 5, 269-273

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    Recepcin de:2 muestra de suerorespuesta a causa derechazo

    a

    SueroSuero

    Cultivo

    En caso de sernecesario solicitarnueva muestra

    PCR

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISRECEPCION DE MUESTRAS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    *Cuando se observa reactividadde acuerdo a los criteriosestablecidos por el fabricante yverificados por el InDRE.Tiempo de emisin D-LEP-07

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISPOR DETERMINACION DE IgM anti-leptospira

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE LEPTOSPIROSISDEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    *Aislamiento de cualquierserovariedad de seinforma positivo indicandoespecie, serovariedad y cepa.Tiempo de emisin D-LEP-07

    Norma oficial mexicana NOM-029-SSA2-1999,para la vigilancia epidemiolgica, prevencin ycontrol de la leptospirosis en el humano.S. Faine (1982). Guidelines for the control ofleptospirosis. Geneva, world health organization(WHO Offset Publication No. 67).S. Faine, B. Alder, C. Bolin, P. Perolat (1999).Leptospira and leptospirosis. 2nd ed. Melbourne, MedSci.P.H. Levett (2001). Leptospirosis. Clinical MicrobiologyReviews, 14:296-326.WHO and World Health Organization. Human leptospirosis:Guidace for diagnosis, surveillance and control. 2003

    Leptospira

    Tipo demuestra

    Cantidad Observaciones

    Sangre 3 a 5 mL

    LCR 1mL

    tejido 1mm

    Orina

    Aguas,lodos etc.

    3

    20 a 30 mL

    250 a 500 mL

    Se requiere muestra estril no lipmica. Depreferencia sin anticoagulante, en el caso derequerirlo utilizar heparina.Transportar en refrigeracin.

    Se requiere estril. Transportar a temperaturaambiente.

    Transportar en refrigeracin, colocar lamuestra de preferencia en solucin reguladorade fosfatos estril.

    Realizar la toma del chorro medio, de laprimera miccin del da. Transportar atemperatura ambiente no ms de 4 horas.

    Realizar la toma del rea apacible.

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISPOR AISLAMIENTO DE Leptospira

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    *Deteccin de DNA leptospiralel resultado emite solo positivoal genero Leptospira

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISPOR PCR

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA

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    La toma se deberealizar a 7 das

    de haber iniciado la

    >2 muestra de suerorespuesta a causa

    de rechazo

    a

    Condiciones de envoCantidadDocumentacin

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISPOR MICROAGLUTINACION

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    Recepcin de 2

    muestra de suero

    a

    ALGORITMOS PARA EL DIAGNSTICO DE LEPTOSPIROSISINTERPRETACION DE RESULTADOS

    INSTITUTO DE DIAGNSTICO Y REFERENCIA EPIDEMIOLGICOS

    LABORATORIO DE LEPTOSPIROSIS

    DEPARTAMENTO DE BACTERIOLOGA